cluster # 10356

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Schistosoma mansoni
cluster # 10356 cluster # 10356 Sequences # 15 consensus # 2

see consensus multiple alignment with clustalw

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consensus_10356#0 length = 320 sequences # 14

consensus_10356#1 length = 284 sequences # 1

consensusID : consensus_10356#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 14
consensus length = 320
fasta sequence

                              [AATAACCCGTGAGCCATCGAATCAACCTGGATGTGGCTTGCGCACATGATCAACCCGCCTTGGCTCGTTTTGCATGAGGCAGCTATTGGATGGGGCACCGCGGTGTTACGGGCCGGGACGACGGATCAGCAGATCTGCCAGCCCAACATGCTGTCTGCAGGCGAGCGGGTGAGTCGCATCGGGTAAGCGCCGTTTCCTGGATGATGGAATGGTGCGCCGGCGCTGTGCTGCCCTCGGGGTAGAGGTCCCTGCCTATATGAATTAAGGAGCCAAGGATGATG-CTTTCAAGGTTGCTTGCCTGCCTGGCCTTGCCCGGTGAT]

[+] EMBL CD069891             [AATAACCCGTGAGCCATCGAATCAACCTGGAT TTGCTTGCGCACATGATCAACCCGCCTTGGCTCGTTTTGCATGAGGCAGCTGTTGGATGGGGCACCGCGGTGTTACGGGCCGGGACGACGGATCAGCAGATCTGCCAGCCCAACATGCTGTCTGCAGGCGAGCGGGTGAGTCGCATCGGGTAAGCGCCGTTTCCTGGATGATGGAATGGTGCGCCGGCGCTGTGCTGCCCTCGGGGTAGAGGTCCCTGCCTATATGAATTAAGGAGCCAAGGATGATG CTTTCAAGGTTGCTTGCCTGCCTGGC             ]
[+] EMBL CD069867             [    tCCGGTGAGCC TCG ATNAACCTGTA GTGGCTTGCGCACATGATCAACCCGCCTTGGCTCGTTTTGCATGAGGCAGCTATTGGATGGGGCACCGCGGTGTTACGGGCCGGGACGACGGATCAGCAGATCTGCCAGCCCAACATGCTGTCTGCAGGCGAGCGGGTGAGTCGCATCGGGCAAGCGCCGTTTCCTGGATGATGGAATGGTGCGCCGGCGCTGTGCTGCCCTCGGGGTAGAGGTCCCTGCCTATATGAATTAAGGAGCCAAGGATGATG CTTTCAAGGTTGCTTGCCTGCCTGGC             ]
[+] EMBL CD069792             [                           TGTATGTGGCTTGCGCACATGATCAACCCGCCTTGGCTCGTTTTGCATGAGGCAGCTATTGGATGGGGCACCGCGGTGTTACGGGCCGGGACGACGGATCAGCAGATCTGCCAGCCCAACATGCTGTCTGCAGGCGAGCGGGTGAGTCGCATCGGGTAAGCGCCGTTTCCTGGATGATGGAATGGTGCGCCGGCGCTGTGCTGCCCTCGGGGTAGAGGTCCCTGCCTATATGAATTAAGGAGCCAAGGATGATG CTTTCAAGGTTGCTTGCCTGCCTGGC             ]
[+] EMBL CD069850             [                           TGGTTGTGGCTTGCGCACATGATCAACCCGCCTTGGCTCGTTTTGCATGAGGCAGCTATTGGATGGGGCACCGCGGTGTTACGGGCCGGGACGACGGATCAGCAGATCTGCCAGCCCAACATGCTGTCTGCAGGCGAGCGGGTGAGTCGCATCGGGTAAGCGCCGTTTCCTGGATGATGGAATGGTGCGCCGGCGCTGTGCTGCCCTCGGGGTAGAGGTCCCTGCCTATATGAATTAAGGAGCCAAGGATGATG CTTTCAAGGTTGCTTGCCTGCCTGGC             ]
[+] EMBL CD069872             [                           TGTATGTGGCTTGCGCACATGATCAACCCGCCTTGGCTCGTTTTGCATGAGGCAGCTATTGGATGGGGCACCGCGGTGTTACGGGCCGGGACGACGGATCAGCAGATCTGCCAGCCCAACATGCTGTCTGCAGGCGAGCGGGTGAGTCGCATCGGGTAAGCGCCGTTTCCTGGATGATGGAATGGTGCGCCGGCGCTGTGCTGCCCTCGGGGTAGAGGTCCCTGCCTATATGAATTAAGGAGCCAAGGATGATG CTTTCAAGGTGGCTTGCCTGCCTGGC             ]
[-] EMBL CD069888             [                            GGATGTGGCTTGCGCACATGATCAACCCGCCTTGGCTCGTTTTGCATGAGGCAGCTATTGGATGGGGCACCGCGGTGTTACGGGCCGGGACGACGGATCAGCAGATCTGCCAGCCCAACATGCTGTCTGCAGGCGAGCGGGTGAGTCGCATCGGGTAAGCGCCGTTTCCTGGATGATGGAATGGTGCGCCGGCGCTGTGCTGCCCTCGGGGTAGAGGTCCCTGCCTATATGAATTAAGGAGCCAAGGATG GG CTTTCAAGGTTGCTTGCCTGCCAAACCTTGCCCGGTGAT]
[-] EMBL CD069819             [                            GGATGTGGCTTGCGCACATGATCAACCCGCCTTGGCTCGTTTTGCATGAGGCAGCTATTGGATGGGGCACCGCGGTGTTACGGGCCGGGACGACGGATCAGCAGATCTGCCAGCCCAACATGCTGTCTGCAGGCGAGCGGGTGAGTCGCATCGGGTAAGCGCCGTTTCCTGGATGATGGAATGGTGCGCCGGCGCTGTGCTGCCCTCGGGGTAGAGGTCCCTGCCTATATGAATTAAGGAGCCAAGGATGATG CTTTCAAGGTTGCTTGCCTGCCTaacc            ]
[-] EMBL CD069921             [                            GGATGTGGCTTGCGCACATGATCAACCCGCCTTGGCTCGTTTTGCATGAGGCAGCTATTGGATGGGGCACCGCGGTGTTACGGGCCGGGACGACGGATCAGCAGATCTGCCAGCCCAACATGCTGTCTGCAGGCGAGCGGGTGAGTCGCATCGGGTAAGCGCCGTTTCCTGGATGATGGAATGGTGCGCCGGCGCTGTGCTGCCCTCGGGGTAGAGGTCCCTGCCTATATGAATTAAGGAGCCAAGGAGGATG CTTTCAAGGTTGCTTGCCTGCAAGGCC            ]
[-] EMBL CD069881             [                            GGATGTGGCTTGCGCACATGATCAACCCGCCTTGGCTCGTTTTGCATGAGGCAGCTATTGGATGGGGCACCGCGGTGTTACGGGCCGGGACGACGGATCAGCAGATCTGCCAGCCCAACATGCTGTCTGCAGGCGAGCGGGTGAGTCGCATCGGGTAAGCGCCGTTTCCTGGATGATGGAATGGTGCGCCGGCGCTGTGCTGCCCTCGGGGTAGAGGTCCCTGCCTATATGAATTAAGGAGCCAAGGAGGATG CTTTCAAGGTTGCTTGCCTGCCAGGCC            ]
[-] EMBL CD069841             [                            GGATGTGGCTTGCGCACATGATCAACCCGCCTTGGCTCGTTTTGCATGAGGCAGCTATTGGATGGGGCACCGCGGTGTTACGGGCCGGGACGACGGATCAGCAGATCTGCCAGCCCAACATGCTGTCTGCAGGCGAGCGGGTGAGTCGCATCGGGTAAGCGCCGTTTCCTGGATGATGGAATGGTGCGCCGGCGCTGTGCTGCCCTCGGGGTAGAGGTCCCTGCCTATATGAATTAAGGAGCCAAGGATG GG CTTTCAAGGTTGCTTGCCTGCCAGGCC            ]
[-] EMBL CD069844             [                            GGATGTGGCTTGCGCACATGATCAACCCGCCTTGGCTCGTTTTGCATGAGGCAGCTATTGGATGGGGCACCGCGGTGTTACGGGCCGGGACGACGGATCAGCAGATCTGCCAGCCCAACATGCTGTCTGCAGGCGAGCGGGTGAGTCGCATCGGGTAAGCGCCGTTTCCTGGATGATGGAATGGTGCGCCGGCGCTGTGCTGCCCTCGGGGTAGAGGTCCCTGCCTATATGAATTAAGGAGCCAAGGATGA G CTTTCAAGGTTGCTTGCCTGCCTaacc            ]
[-] EMBL CD069858             [                            GGATGTGGCTTGCGCACATGATCAACCCGCCTTGGCTCGTTTTGCATGAGGCAGCTATTGGATGGGGCACCGCGGTGTTACGGGCCGGGACGACGGATCAGCAGATCTGCCAGCCCAACATGCTGTCTGCAGGCGAGCGGGTGAGTCGCATCGGGTAAGCGCCGTTTCCTGGATGATGGAATGGTGCGCCGGCGCTGTGCTGCCCTCGGGGTAGAGGTCCCTGCCTATATGAATTAAGGAGCCAAGGATGATGTCTTTCAAGGTgcaggc                       ]
[-] EMBL CD069925             [                            GGATGTGGCTTGCGCACATGATCAACCCGCCTTGGCTCGTTTTGCATGAGGCAGCTATTGGATGGGGCACCGCGGTGTTACGGGCCGGGACGACGGATCAGCAGATCTGCCAGCCCAACATGCTGTCTGCAGGCGAGCGGGTGAGTCGCATCGGGTAAGCGCCGTTTCCTGGATGATGGAATGGTGCGCCGGCGCTGTGCTGCCCTCGGGGTAGAGGTCCCTGCCTATATGAATTAAGGAGCCAAGGATG GG CTTTCAAGGTT                            ]
[+] EMBL CD069803             [                           tgttTGTGGCTTGCGCACATGATCAACCCGCCTTGGCTCGTTTTGCATGAGGCAGCTATTGGATGGGGCACCGCGGTGTTACGGGCCGGGACGACGGATCAGCAGATCTGCCAGCCCAACATGCTGTCTGCAGGCGAGCGGGTGAGTCGCATCGGGTAAGCGCCGTTTCCTGGATGATGGAATGGTGCGCCGGCGCTGTGCTGCCCTCGGGGTAGAGGTCCCTGCCTATATGAATTAAGGAGCCAAGGATGACG CTTTCAAGGTTGCTTGCCTGCCTGGC             ]




>consensus_10356#0
AATAACCCGTGAGCCATCGAATCAACCTGGATGTGGCTTGCGCACATGATCAACCCGCCT
TGGCTCGTTTTGCATGAGGCAGCTATTGGATGGGGCACCGCGGTGTTACGGGCCGGGACG
ACGGATCAGCAGATCTGCCAGCCCAACATGCTGTCTGCAGGCGAGCGGGTGAGTCGCATC
GGGTAAGCGCCGTTTCCTGGATGATGGAATGGTGCGCCGGCGCTGTGCTGCCCTCGGGGT
AGAGGTCCCTGCCTATATGAATTAAGGAGCCAAGGATGATGCTTTCAAGGTTGCTTGCCT
GCCTGGCCTTGCCCGGTGAT

consensusID : consensus_10356#1
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 1
consensus length = 284
fasta sequence

                              [TTTTTGTGGCTTGCGCACATGATCAACCCGCCTTGGCTCGTTTTGCATGAGGCAGCTATTGGATGGGGCACCGCGGTGTTACGGGCCGGGACGACGGATCAGCAGATCTGCCAGCCCAAATTGCTTTTGCGGCACAGCCGGGGAACCCTCTGTGGGTTACCCCCTTTTTTCCTGAATGATGGGATGGGCCGCGCCGGCGCTGTGCTGNCCCTCGGGGTAGAGGTCCCTGCCTATATGAATTAAGGAGCCAAGGATGATGCTTTCAAAGTTGCTTGCCTGCCTGC]

[+] EMBL CD069847             [TTTTTGTGGCTTGCGCACATGATCAACCCGCCTTGGCTCGTTTTGCATGAGGCAGCTATTGGATGGGGCACCGCGGTGTTACGGGCCGGGACGACGGATCAGCAGATCTGCCAGCCCAAATTGCTTTTGCGGCACAGCCGGGGAACCCTCTGTGGGTTACCCCCTTTTTTCCTGAATGATGGGATGGGCCGCGCCGGCGCTGTGCTGNCCCTCGGGGTAGAGGTCCCTGCCTATATGAATTAAGGAGCCAAGGATGATGCTTTCAAAGTTGCTTGCCTGCCTGC]




>consensus_10356#1
TTTTTGTGGCTTGCGCACATGATCAACCCGCCTTGGCTCGTTTTGCATGAGGCAGCTATT
GGATGGGGCACCGCGGTGTTACGGGCCGGGACGACGGATCAGCAGATCTGCCAGCCCAAA
TTGCTTTTGCGGCACAGCCGGGGAACCCTCTGTGGGTTACCCCCTTTTTTCCTGAATGAT
GGGATGGGCCGCGCCGGCGCTGTGCTGNCCCTCGGGGTAGAGGTCCCTGCCTATATGAAT
TAAGGAGCCAAGGATGATGCTTTCAAAGTTGCTTGCCTGCCTGC

consensus multiple alignement with clustalw

CLUSTAL W (1.82) multiple sequence alignment


consensus_10356#0      AATAACCCGTGAGCCATCGAATCAACCTGGATGTGGCTTGCGCACATGATCAACCCGCCT 60
consensus_10356#1      ---------------------------TTTTTGTGGCTTGCGCACATGATCAACCCGCCT 33
                                                  *   *****************************

consensus_10356#0      TGGCTCGTTTTGCATGAGGCAGCTATTGGATGGGGCACCGCGGTGTTACGGGCCGGGACG 120
consensus_10356#1      TGGCTCGTTTTGCATGAGGCAGCTATTGGATGGGGCACCGCGGTGTTACGGGCCGGGACG 93
                       ************************************************************

consensus_10356#0      ACGGATCAGCAGATCTGCCAGCCCAACATGCTGTCTGCAGGCGAGCGGGTGAGTCGCAT- 179
consensus_10356#1      ACGGATCAGCAGATCTGCCAGCCCAAATTGCT-TTTGCGGCACAGCCGGGGAACCCTCTG 152
                       **************************  **** * *** *   *** ** **  *   * 

consensus_10356#0      CGGGTAAGCGCCGTTT--CCTGGATGATGGAATGG--TGCGCCGGCGCTGTGCTGCCC-T 234
consensus_10356#1      TGGGTTACCCCCTTTTTTCCTGAATGATGGGATGGGCCGCGCCGGCGCTGTGCTGNCCCT 212
                        **** * * ** ***  **** ******* ****   ***************** ** *

consensus_10356#0      CGGGGTAGAGGTCCCTGCCTATATGAATTAAGGAGCCAAGGATGATGCTTTCAAGGTTGC 294
consensus_10356#1      CGGGGTAGAGGTCCCTGCCTATATGAATTAAGGAGCCAAGGATGATGCTTTCAAAGTTGC 272
                       ****************************************************** *****

consensus_10356#0      TTGCCTGCCTGGCCTTGCCCGGTGAT 320
consensus_10356#1      TTGCCTGCCTGC-------------- 284
                       ***********