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Schistosoma mansoni
cluster # 10367 cluster # 10367       Sequences # 15       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_10367#0 length = 1213 sequences # 15  

consensusID : consensus_10367#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 15
consensus length = 1213
fasta sequence
                              [ATACTGTATTCTATTCATTGTACCATACGATCCCGATATATTGGTTGGAGTTGTAGATCTTTGTCTTAAACGATCATATTCATACTGTAACGCACGATGTTCATCTTCAAGTGACCGAACAGTCTG-TGCA-TTTGTCCATAGGG-TGT-TGTTGTAGTTGTTGGATTGGGTAGTTTGTAAGATAGGTTGGGGGACGAGAAAGTATATTTGTGCTACCGTTATGTTTCCACATTGTTTCCTGGATCTCTGGTGGAGGTTGTGATCTAGCTCTTAGTGAAAATGTACGTTGAATATGACGTGCATAAATATCTGGAATAACTTCTTGACCCATAGAAGTTTGATAAGATGTTTGAGCTAAATGACCTGTTGGGCCAAATTGATTGTCAACACGTAAAGTACCATTTAAAGCACGTGGTGTCCATCCGGAAAAAGAACCACGTAGTGCAGGATTTCCAAAACCTAATGATGGGAAAGCTACTCCTCGATCAATTTGACGTCGGTCCAAACTAAGATGTCCACTAATAAACGGTTGTGTTTGTTCAACATCCATACCTGGAACATTCGTTGAAATACCATCTGATATGGTAGATCTTTCCATGATCATCGGACCAGTGGAACAAGACATTGATTGAAGTACTGATGTTTGTTGCAAATGAGGCAATTCAGGTTCGCTATATTGTCTTAATTCTTGACTATAACGTGCAATCAATTTATGTTCTTCATTATCACCATGATATTGTTGATTATTTACACGTTCATCAGTTGGCTTGTAACTACGATCAATGTCAGCTTTTAATCTTGAGTTCAACTGTATAGTTTGCGGT-GACGGAGTTGTT-GTTAACGGTGGTGGTGGTGTTGTAAATAAATTTGCATTTACATTTTTCTGTCTAGCCATTGATGATTGAGTATCAGATGATGCACGCGGCGGCATTGAATATTGATTTGAAGGCATAGCTACATTTGATAATGGTCTACAACTTGGAGTAGGACGCCGATTACTATCATCATTATTGTTGTAATTATTACTTGTCTCGTTTAGAAAATAATGTTGAGGTGATTGTGTATTTGATATTGAATTTCGATATGGACATTTCTGATCATTAACGAACGGAGTGTCTAAATTTTGATATTCTGCAAAATCAGAGAATGGATCTTGACTGTAAGTCGGCGCTGGACGAGGTTTATCTTCATCAAAACTATTCAAACTATTACGTTT]

[-] EMBL CD125307             [ATACTGTATTCTATTCATTGTACCATACGATCCCGATATATTGGTTGGAGTTGTAGATCTTTGTCTTAAACGATCATATTCATACTGTAACGCACGATGTTCATCTTCAAGTGACCGAACAGTCTGTTGCA TTTGTCCATAGGGTTGT TGTTGTAGTTGTTGGATTGGGTAGTTTGTAAGATAGGTTGGGGGACGAGAAAGTATATTTGTGCTACCGTTATGTTTCCACATTGTTTCCTGGATCTCTGGTGGAGGTTGTGATCTAG                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       ]
[-] EMBL CD125347             [ATACTGTATTCTATTCATTGTACCATACGATCCCGATATATTGGTTGGAGTTGTAGATCTTTGTCTTAAACGATCATATTCATACTGTAACGCACGATGTTCATCTTCAAGTGACCGAACAGTCTGTTGCA TTTGTCCATAGGGTTGT TGTTGTAGTTGTTGGATTGGGTAGTTTGTAAGATAGGTTGGGGGACGAGAAAGTATATTTGTGCTACCGTTATGTTTCCACATTGTTTCCTGGATCTCTGGTGGAGGTTGTGATCTAG                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       ]
[-] EMBL CD191687             [                                                                                                           CAAGTGACNGAACAGTCTG TGCATTTTGTCCATAGGG TGTGNNNTGTAGTGTTTGGATTGGGTAGTTTGTAAGATAGGTTGGGGGACGAGAAAGTATATNTGTGCTACCGTTATGTTTCCACATTGTTTCCTGGATCTCTGGTGGAGGTTGTGATCTAGCTCTTAGTGAAAATGTACGTTGAATATGACGTGCATAAATATCTGGAATAACTTCTTGACCCATAGAAGTTTGATAAGATGTTTGAGCTAAATGACCTGTTGGGCCAAATTGATTGTCAACACGTAAAGTACCATTTAAAGCACGTGGTGTCCATCCGGAAAAAGAACCACGTAGTGCAGGATTTCCAAAACCTAATGATGGGAAAGCTACTCCTCGATCAATTTGACGTCGGTCCAAACTAAGATGTCCACTAATAAACGGTTGTGTTTGTTCAACATCCATACCTGGAACATTCGTTGAAATACCATCTGATATGGTAGATCTTTCCATGATCATCGGACCAGTGGAACAAGACATTGATTGAAGTACTGATGTTTGTTGCAAATGAGGCAATTCAGGTTCGCTATATTGTCTTAATT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   ]
[-] EMBL CD154554             [                                                                                                                                                        TTGTAGTTGTTGGATTGGGTAGTTTGTAAGATAGGTTGGGGGACGAGAAAGTATATTTGTGCTACCGTTATGTTTCCACATTGTTTCCTGGATCTCTGGTGGAGGTTGTGATCTAGCTCTTAGTGAAAATGTACGTTGAATATGACGTGCATAAATATCTGGAATAACTTCTTGACCCATAGAAGTTTGATAAGATGTTTGAGCTAAATGACCTGTTGGGCCAAATTGATTGTCAACACGTAAAGTACCATTTAAAGCACGTGGTGTCCATCCGGAAAAAGAACCACGTAGTGCAGGATTTCCAAAACCTAATGATGGGAAAGCTACTCCTCGATCAATTTGACGTCGGTC                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            ]
[-] EMBL CD154604             [                                                                                                                                                        TTGTAGTTGTTGGATTGGGTAGTTTGTAAGATAGGTTGGGGGACGAGAAAGTATATTTGTGCTACCGTTATGTTTCCACATTGTTTCCTGGATCTCTGGTGGAGGTTGTGATCTAGCTCTTAGTGAAAATGTACGTTGAATATGACGTGCATAAATATCTGGAATAACTTCTTGACCCATAGAAGTTTGATAAGATGTTTGAGCTAAATGACCTGTTGGGCCAAATTGATTGTCAACACGTAAAGTACCATTTAAAGCACGTGGTGTCCATCCGGAAAAAGAACCACGTAGTGCAGGATTTCCAAAACCTAATGATGGGAAAGCTACTCCTCGATCAATTTGACGTCGGTC                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            ]
[-] EMBL CD068179             [                                                                                                                                                                                TGTAAGATAGGTTGGGGGACGAGAAAGTATATTTGTGCTACCGTTATGTTTCCACATTGTTTCCTGGATCTCTGGTGGAGGTTGTGATCTAGCTCTTAGTGAAAATGTACGTTGAATATGACGTGCATAAATATCTGGAATAACTTCTTGACCCATAGAAGTTTGATAAGATGTTTGAGCTAAATGACCTGTTGGGCCAAATTGATTGTCAACACGTAAAGTACCATTTAAAGCACGTGGTGTCCATCCGGAAAAAGAACCACGTAGTGCAGGATTTCCAAAACCTAATGATGGGAAAGCTACTCCTCGATCAATTTGACGTCGGTCCAAACTAAGATGTCCACTAATAAACGGTTGTGTTTGTTCAACATCCATACCTGGAACATTCGTTGAAATACCATCTGATATGGTAGATCTTTCCATGATCATCGGACCA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               ]
[-] EMBL CD181909             [                                                                                                                                                                                 GTAAGATAGGTTGGGGGACGAGAAAGTATATTTGTGCTACCGTTATGTTTCCACATTGTTTCCTGGATCTCTGGTGGAGGTTGTGATCTAGCTCTTAGTGAAAATGTACGTTGAATATGACGTGCATAAATATCTGGAATAACTTCTTGACCCATAGAAGTTTGATAAGATGTTTGAGCTAAATGACCTGTTGGGCCAAATTGATTGTCAACACGTAAAGTACCATTTAAAGCAC                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       ]
[+] EMBL CD127877             [                                                                                                                                                                             aagcaatAGGTAGGTTGGGGGACGATCTTGTATATTTGTGCTACCGTTATG TTCCCCATTGTTTCCTGGATCTCTGGTGGAGGTTGTGATCTAGCTCTTAGTGAAAATGTACGTTGAATATGACGTGCATAAATATCTGGAATAACTTCTTGACCCATAGAAGTTTGATAAGATGTTTGAGCTAAATGACCTGTTGGGCCAAATTGATTGTCAACACGTAAAGTACCATTTAAAGCACGTGGTGTCCATCCGGAAAAAGAACCACGTAGTGCAGGATTTCCAAAACCTAATGATGGGAAAGCTACTCCTCGATCAATTTGACGTCGGTCCAAACTAAGATGTCCACTAATAAACGGTTGTGTTTGTTCAACATCCATACCTGGAACATTCGTTGAAATACCATCTGATATGGTAGATCTTTCCATGATCATCGGACCAGTGGAACAAGACATTGATTGAAGTACTGATGTTTGTTGCAAATGAGGCAATTCAGGTTCGCTATATTGTCTTAATTCTTGACTATAACGTGCAATCAATTTATGTTCTTCATTATCACCATGATATTGTTGATTATTTACACGTTCATCAGTTGGCTTGTAACTACGAT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      ]
[-] EMBL CD200537             [                                                                                                                                                                                                           TATATTTGTGCTACCGTTATGTTCCCACATTGTTTCCTGGATCTCTGGTGGAGGTTGTGATCTAGCTCTTAGTGAAAGTGTACGTTGAATATGACGTGCATAAATATCTGGAATAACTTCTTGACCCATAGAAGTTTGATAAGATGTTTGAGCTAAATGACCTGTTGGGCCAAATTGATTGTCAACACGTAAAGTACCATTTAAAGCACGTGGTGTCCATCCGGAAAAAGAACCACGTAGTGCAGGATTTCCAAAACCTAATGATGGGAAAGCTACTCCTCGATCAATTTGACGTCGGTCCAAACTAAGATGTCCACTAATAAACGGTTGTGTTTGTTCAACATCCATACCTGGAACATTCGTTGAAATACCATCTGATATGGTAGATCTTTCCATGATCATCGGACCAGTGGAACAAGACATTGATTGAAGTACTGATGTTTGTTGCAAATGAGGCAATTCAGGTTCGCTATATTGTCTTAATTCTTGACTATAACGTGCAATCAATTTATGTTCTTCATTATCACC                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        ]
[-] EMBL CD190156             [                                                                                                                                                                                                                                                      TCTGGTGGAGGTTGTGATCTAGCTCTTAGTGAAAATGTACGTTGAATATGACGTGCATAAATATCTGGAATAACTTCTTGACCCATAGAAGTTTGATAAGATGTTTGAGCTAAATGACCTGTTGGGCCAAATTGATTGTCAACACGTAAAGTACCATTTAAAGCACGTGGTGTCCATCCGGAAAAAGAACCACGTAGTGCAGGATTTCCAAAACCTAATGATGGGAAAGCTACTCCTCGATCAATTTGACGTCGGTCCAAACTAAGATGTCCACTAATAAACGGTTGTGTTTGTTCAACATCCA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             ]
[+] EMBL CD163317             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          TTTGACGTCGGTCCAAACTAAGATGTCCACTAATAAACGGTTGTGTTTGTTCAACATCCATACCTGGAACATTCGTTGAAATACCATCTGATATGGTAGATCTTTCCATGATCATCGGACCAGTGGAACAAGACATTGATTGAAGTACTGATGTTTGTTGCAAATGAGGCAATTCAGGTTCGCTATATTGTCTTAATTCTTGACTATAACGTGCAATCAATTTATGTTCTTCATTATCACCATGATATTGTTGATTATTTACACGTTCATCAGTTGGCTTGTAACTACGATCAATGTCAGCTTTTAATCTTGAGTTCAACTGTATAGTTTGCGGTGGACGGAGTTGTTGGTTAACGGTGGTG                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               ]
[-] EMBL CD163500             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           TTGACGTCGGTCCAAACTAAGATGTCCACTAATAAACGGTTGTGTTTGTTCAACATCCATACCTGGAACATTCGTTGAAATACCATCTGATATGGTAGATCTTTCCATGATCATCGGACCAGTGGAACAAGACATTGATTGAAGTACTGATGTTTGTTGCAAATGAGGCAATTCAGGTTCGCTATATTGTCTTAATTCTTGACTATAACGTGCAATCAATTTATGTTCTTCATTATCACCATGATATTGTTGATTATTTACACGTTCATCAGTTGGCTTGTAACTACGATCAATGTCAGCTTTTAATCTTGAGTTCAACTGTATAGTTTGCGGT GACGGAGTTGTT GTTAAC                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      ]
[+] EMBL CD193401             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               CATTGATTGAAGTACTGATGTTTGTTGCAAATGAGGCAATTCACGTTCGCTATATTGTCTTAATTCTTGACTATAACGTGCA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  ]
[+] EMBL CD065862             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        CAGGTTCGCTATATTGTCTTAATTCTTGACTATAACGTGCAATCAATTTATGTTCTTCATTATCACCATGATATTGTTGATTATTTACACGTTCATCAGTTGGCTTGTAACTACGATCAATGTCAGCTTTTAATCTTGAGTTCAACTGTATAGTTTGCGGT GACGGAGTTGTT GTTAACGGTGGTGGTGGTGTTGTAAATAAATTTGCATTTACATTTTTCTGTCTAGCCATTGATGATTGAGTATCAGATGATGCACGCGGCGGCATTGAATATTGATTTGAAGGCATAGCTACATTTGATAATGGTCTACAACTTGGAGTAGGACGCCGATTACTATCATCATTATTGTTGTAATTATTACTTGTCTCGTTTAGAAAATAATGTTGAGGTGATTGTGTATTTGATATTGAATTTCGATATGGACATTTCTGATCATTAACGAACGGAGTGTCTAAATTTTGATATTCTGCAAAATCAGAGAATGGATCTTGACTGTAAGTCGGCGCTGGACGAGGTTTATCTTCATCAAAACTATTCAAACTATTACGTTT]
[-] EMBL CD068961             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              GATTTGAAGGCATAGCTACATTTGATAATGGTCTACAACTTGGAGTAGGACGCTGATTACTATCATCATTATTGTTGTAATTATTACTTGTCTCGTTTAGAAAATAATGTTGAGGTGATTGTGTATTTGATATTGAATTTCGATATGGACATTTCTGATCATTAACGAACGGAGTGTCTAAATTTTGATATTCTGCAAAATCAGAGAATGGATCTTGACTG                                                        ]


>consensus_10367#0 ATACTGTATTCTATTCATTGTACCATACGATCCCGATATATTGGTTGGAGTTGTAGATCT TTGTCTTAAACGATCATATTCATACTGTAACGCACGATGTTCATCTTCAAGTGACCGAAC AGTCTGTGCATTTGTCCATAGGGTGTTGTTGTAGTTGTTGGATTGGGTAGTTTGTAAGAT AGGTTGGGGGACGAGAAAGTATATTTGTGCTACCGTTATGTTTCCACATTGTTTCCTGGA TCTCTGGTGGAGGTTGTGATCTAGCTCTTAGTGAAAATGTACGTTGAATATGACGTGCAT AAATATCTGGAATAACTTCTTGACCCATAGAAGTTTGATAAGATGTTTGAGCTAAATGAC CTGTTGGGCCAAATTGATTGTCAACACGTAAAGTACCATTTAAAGCACGTGGTGTCCATC CGGAAAAAGAACCACGTAGTGCAGGATTTCCAAAACCTAATGATGGGAAAGCTACTCCTC GATCAATTTGACGTCGGTCCAAACTAAGATGTCCACTAATAAACGGTTGTGTTTGTTCAA CATCCATACCTGGAACATTCGTTGAAATACCATCTGATATGGTAGATCTTTCCATGATCA TCGGACCAGTGGAACAAGACATTGATTGAAGTACTGATGTTTGTTGCAAATGAGGCAATT CAGGTTCGCTATATTGTCTTAATTCTTGACTATAACGTGCAATCAATTTATGTTCTTCAT TATCACCATGATATTGTTGATTATTTACACGTTCATCAGTTGGCTTGTAACTACGATCAA TGTCAGCTTTTAATCTTGAGTTCAACTGTATAGTTTGCGGTGACGGAGTTGTTGTTAACG GTGGTGGTGGTGTTGTAAATAAATTTGCATTTACATTTTTCTGTCTAGCCATTGATGATT GAGTATCAGATGATGCACGCGGCGGCATTGAATATTGATTTGAAGGCATAGCTACATTTG ATAATGGTCTACAACTTGGAGTAGGACGCCGATTACTATCATCATTATTGTTGTAATTAT TACTTGTCTCGTTTAGAAAATAATGTTGAGGTGATTGTGTATTTGATATTGAATTTCGAT ATGGACATTTCTGATCATTAACGAACGGAGTGTCTAAATTTTGATATTCTGCAAAATCAG AGAATGGATCTTGACTGTAAGTCGGCGCTGGACGAGGTTTATCTTCATCAAAACTATTCA AACTATTACGTTT



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)