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These datas are free for academic use only, please contact me for any other use. Schistosoma mansoni see consensus multiple alignment with clustalw Direct access to contigs :
consensusID : consensus_10367#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 15 consensus length = 1213 fasta sequence
[ATACTGTATTCTATTCATTGTACCATACGATCCCGATATATTGGTTGGAGTTGTAGATCTTTGTCTTAAACGATCATATTCATACTGTAACGCACGATGTTCATCTTCAAGTGACCGAACAGTCTG-TGCA-TTTGTCCATAGGG-TGT-TGTTGTAGTTGTTGGATTGGGTAGTTTGTAAGATAGGTTGGGGGACGAGAAAGTATATTTGTGCTACCGTTATGTTTCCACATTGTTTCCTGGATCTCTGGTGGAGGTTGTGATCTAGCTCTTAGTGAAAATGTACGTTGAATATGACGTGCATAAATATCTGGAATAACTTCTTGACCCATAGAAGTTTGATAAGATGTTTGAGCTAAATGACCTGTTGGGCCAAATTGATTGTCAACACGTAAAGTACCATTTAAAGCACGTGGTGTCCATCCGGAAAAAGAACCACGTAGTGCAGGATTTCCAAAACCTAATGATGGGAAAGCTACTCCTCGATCAATTTGACGTCGGTCCAAACTAAGATGTCCACTAATAAACGGTTGTGTTTGTTCAACATCCATACCTGGAACATTCGTTGAAATACCATCTGATATGGTAGATCTTTCCATGATCATCGGACCAGTGGAACAAGACATTGATTGAAGTACTGATGTTTGTTGCAAATGAGGCAATTCAGGTTCGCTATATTGTCTTAATTCTTGACTATAACGTGCAATCAATTTATGTTCTTCATTATCACCATGATATTGTTGATTATTTACACGTTCATCAGTTGGCTTGTAACTACGATCAATGTCAGCTTTTAATCTTGAGTTCAACTGTATAGTTTGCGGT-GACGGAGTTGTT-GTTAACGGTGGTGGTGGTGTTGTAAATAAATTTGCATTTACATTTTTCTGTCTAGCCATTGATGATTGAGTATCAGATGATGCACGCGGCGGCATTGAATATTGATTTGAAGGCATAGCTACATTTGATAATGGTCTACAACTTGGAGTAGGACGCCGATTACTATCATCATTATTGTTGTAATTATTACTTGTCTCGTTTAGAAAATAATGTTGAGGTGATTGTGTATTTGATATTGAATTTCGATATGGACATTTCTGATCATTAACGAACGGAGTGTCTAAATTTTGATATTCTGCAAAATCAGAGAATGGATCTTGACTGTAAGTCGGCGCTGGACGAGGTTTATCTTCATCAAAACTATTCAAACTATTACGTTT]
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[-] EMBL CD125347 [ATACTGTATTCTATTCATTGTACCATACGATCCCGATATATTGGTTGGAGTTGTAGATCTTTGTCTTAAACGATCATATTCATACTGTAACGCACGATGTTCATCTTCAAGTGACCGAACAGTCTGTTGCA TTTGTCCATAGGGTTGT TGTTGTAGTTGTTGGATTGGGTAGTTTGTAAGATAGGTTGGGGGACGAGAAAGTATATTTGTGCTACCGTTATGTTTCCACATTGTTTCCTGGATCTCTGGTGGAGGTTGTGATCTAG ]
[-] EMBL CD191687 [ CAAGTGACNGAACAGTCTG TGCATTTTGTCCATAGGG TGTGNNNTGTAGTGTTTGGATTGGGTAGTTTGTAAGATAGGTTGGGGGACGAGAAAGTATATNTGTGCTACCGTTATGTTTCCACATTGTTTCCTGGATCTCTGGTGGAGGTTGTGATCTAGCTCTTAGTGAAAATGTACGTTGAATATGACGTGCATAAATATCTGGAATAACTTCTTGACCCATAGAAGTTTGATAAGATGTTTGAGCTAAATGACCTGTTGGGCCAAATTGATTGTCAACACGTAAAGTACCATTTAAAGCACGTGGTGTCCATCCGGAAAAAGAACCACGTAGTGCAGGATTTCCAAAACCTAATGATGGGAAAGCTACTCCTCGATCAATTTGACGTCGGTCCAAACTAAGATGTCCACTAATAAACGGTTGTGTTTGTTCAACATCCATACCTGGAACATTCGTTGAAATACCATCTGATATGGTAGATCTTTCCATGATCATCGGACCAGTGGAACAAGACATTGATTGAAGTACTGATGTTTGTTGCAAATGAGGCAATTCAGGTTCGCTATATTGTCTTAATT ]
[-] EMBL CD154554 [ TTGTAGTTGTTGGATTGGGTAGTTTGTAAGATAGGTTGGGGGACGAGAAAGTATATTTGTGCTACCGTTATGTTTCCACATTGTTTCCTGGATCTCTGGTGGAGGTTGTGATCTAGCTCTTAGTGAAAATGTACGTTGAATATGACGTGCATAAATATCTGGAATAACTTCTTGACCCATAGAAGTTTGATAAGATGTTTGAGCTAAATGACCTGTTGGGCCAAATTGATTGTCAACACGTAAAGTACCATTTAAAGCACGTGGTGTCCATCCGGAAAAAGAACCACGTAGTGCAGGATTTCCAAAACCTAATGATGGGAAAGCTACTCCTCGATCAATTTGACGTCGGTC ]
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[-] EMBL CD200537 [ TATATTTGTGCTACCGTTATGTTCCCACATTGTTTCCTGGATCTCTGGTGGAGGTTGTGATCTAGCTCTTAGTGAAAGTGTACGTTGAATATGACGTGCATAAATATCTGGAATAACTTCTTGACCCATAGAAGTTTGATAAGATGTTTGAGCTAAATGACCTGTTGGGCCAAATTGATTGTCAACACGTAAAGTACCATTTAAAGCACGTGGTGTCCATCCGGAAAAAGAACCACGTAGTGCAGGATTTCCAAAACCTAATGATGGGAAAGCTACTCCTCGATCAATTTGACGTCGGTCCAAACTAAGATGTCCACTAATAAACGGTTGTGTTTGTTCAACATCCATACCTGGAACATTCGTTGAAATACCATCTGATATGGTAGATCTTTCCATGATCATCGGACCAGTGGAACAAGACATTGATTGAAGTACTGATGTTTGTTGCAAATGAGGCAATTCAGGTTCGCTATATTGTCTTAATTCTTGACTATAACGTGCAATCAATTTATGTTCTTCATTATCACC ]
[-] EMBL CD190156 [ TCTGGTGGAGGTTGTGATCTAGCTCTTAGTGAAAATGTACGTTGAATATGACGTGCATAAATATCTGGAATAACTTCTTGACCCATAGAAGTTTGATAAGATGTTTGAGCTAAATGACCTGTTGGGCCAAATTGATTGTCAACACGTAAAGTACCATTTAAAGCACGTGGTGTCCATCCGGAAAAAGAACCACGTAGTGCAGGATTTCCAAAACCTAATGATGGGAAAGCTACTCCTCGATCAATTTGACGTCGGTCCAAACTAAGATGTCCACTAATAAACGGTTGTGTTTGTTCAACATCCA ]
[+] EMBL CD163317 [ TTTGACGTCGGTCCAAACTAAGATGTCCACTAATAAACGGTTGTGTTTGTTCAACATCCATACCTGGAACATTCGTTGAAATACCATCTGATATGGTAGATCTTTCCATGATCATCGGACCAGTGGAACAAGACATTGATTGAAGTACTGATGTTTGTTGCAAATGAGGCAATTCAGGTTCGCTATATTGTCTTAATTCTTGACTATAACGTGCAATCAATTTATGTTCTTCATTATCACCATGATATTGTTGATTATTTACACGTTCATCAGTTGGCTTGTAACTACGATCAATGTCAGCTTTTAATCTTGAGTTCAACTGTATAGTTTGCGGTGGACGGAGTTGTTGGTTAACGGTGGTG ]
[-] EMBL CD163500 [ TTGACGTCGGTCCAAACTAAGATGTCCACTAATAAACGGTTGTGTTTGTTCAACATCCATACCTGGAACATTCGTTGAAATACCATCTGATATGGTAGATCTTTCCATGATCATCGGACCAGTGGAACAAGACATTGATTGAAGTACTGATGTTTGTTGCAAATGAGGCAATTCAGGTTCGCTATATTGTCTTAATTCTTGACTATAACGTGCAATCAATTTATGTTCTTCATTATCACCATGATATTGTTGATTATTTACACGTTCATCAGTTGGCTTGTAACTACGATCAATGTCAGCTTTTAATCTTGAGTTCAACTGTATAGTTTGCGGT GACGGAGTTGTT GTTAAC ]
[+] EMBL CD193401 [ CATTGATTGAAGTACTGATGTTTGTTGCAAATGAGGCAATTCACGTTCGCTATATTGTCTTAATTCTTGACTATAACGTGCA ]
[+] EMBL CD065862 [ CAGGTTCGCTATATTGTCTTAATTCTTGACTATAACGTGCAATCAATTTATGTTCTTCATTATCACCATGATATTGTTGATTATTTACACGTTCATCAGTTGGCTTGTAACTACGATCAATGTCAGCTTTTAATCTTGAGTTCAACTGTATAGTTTGCGGT GACGGAGTTGTT GTTAACGGTGGTGGTGGTGTTGTAAATAAATTTGCATTTACATTTTTCTGTCTAGCCATTGATGATTGAGTATCAGATGATGCACGCGGCGGCATTGAATATTGATTTGAAGGCATAGCTACATTTGATAATGGTCTACAACTTGGAGTAGGACGCCGATTACTATCATCATTATTGTTGTAATTATTACTTGTCTCGTTTAGAAAATAATGTTGAGGTGATTGTGTATTTGATATTGAATTTCGATATGGACATTTCTGATCATTAACGAACGGAGTGTCTAAATTTTGATATTCTGCAAAATCAGAGAATGGATCTTGACTGTAAGTCGGCGCTGGACGAGGTTTATCTTCATCAAAACTATTCAAACTATTACGTTT]
[-] EMBL CD068961 [ GATTTGAAGGCATAGCTACATTTGATAATGGTCTACAACTTGGAGTAGGACGCTGATTACTATCATCATTATTGTTGTAATTATTACTTGTCTCGTTTAGAAAATAATGTTGAGGTGATTGTGTATTTGATATTGAATTTCGATATGGACATTTCTGATCATTAACGAACGGAGTGTCTAAATTTTGATATTCTGCAAAATCAGAGAATGGATCTTGACTG ]
clustalw multiple alignements is not computed in this case |
| Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) | ||||