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Schistosoma mansoni
cluster # 10371 cluster # 10371       Sequences # 15       consensus # 1

see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_10371#0 length = 621 sequences # 15  
consensusID : consensus_10371#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 15
consensus length = 621
fasta sequence 
                              [CCAAGTGTCTTTCCAAATGCTGAATTCTTTCAAACATTACAACAGACTGCCGCAGCGGCTGCATTACCAACTGTACTGCCATACGATCAATCACAGTATATTGGTCAATTAATGTATTTCCCATATCCCACAGCTGCTGCTGCTGCCGCAAATGGATTGTTCAATACTGGACAATCAAATGATACTGCTACTCATCATATGTCTATTGGTTCGTCTACACCTGGTGGTAGTGTTAGTGGTAATCAGGCAACAATTATTAATCAAGCATCGTGTCATGCTACTGCTGGACAATTATTAACTGGTGGACTTGTATCAGCCACACCTAGTGGAATGATGACTTTGAATAATGCAACTGGTTCGAATCAAGTTAATAATGCTAATCATCTATTTGCATCTGGAGCAGGATTAGTTGGAATTGGTGGCAGTGGCGTCGGTGGTGCATCTGGTTCAAATACTGTTTCTGTGTCTAATTCCGCTTCTTTAGCACCTTTA-TTTACAACTGCTCATTTTTATCCGCATCATCATACACAACAAACTGGTCAACAAC-AACCACAACAACAGTTTCAAATTCATCATTCATTACAACAACCGCATCATCCACATACATCTGTACATATGCAA]

[+] EMBL CD154404             [CCAAGTGTCTTTCCAAATGCTGAATTCTTTCAAACATTACAACAGACTGCCGCAGCGGCTGCATTACCAACTGTACTGCCATACGATCAATCACAGTATATTGGTCAATTAATGTATTTCCCATATCCCACAGCTGCTGCTGCTGCCGCAAATGGATTGTTCAATACTGGACAATCAAATGATACTGCTACTCATCATATGTCTATTGGTTCGTCTACACCTGGTGGTAGTGTTAGTGGTAATCAGGCAACAATTATTAATCAAGCATCGTGTCATGCTACTGCTGGACAATTATTAACTGGTGGACTTGTATCAGCCACACCTAGTGGAATGATGACTTTGAATAATGCAACTGGTTCGAATCAAGTTAATAATGCTAATCATCTATTTGCATCTGGAGCAGGATTAGTTGGAATTGGTGGCAGTGGCGTCGGTGGTGCATCTGGTTCAAATACTGTTTCTGTGTCTAATTCCGCTTCTTTAGCACCTTCA TTTACAACTGCTCATTTTTATCCGCACCATCATACACAACANACTGGTCAACAACAAACCAC ACAACAGTTTCAAATTCATCATTCATTA                                       ]
[-] EMBL CD195041             [                                                              ATTACCAACTGTACTGCCATACGATCAATCACAGTATATTGGTCAATTAATGTATTTCCCACATCCCACAGCTGCTGCTGCTGCCGCAAATGGATTGTTCAATACTGGACAATCAAATGATACTGCTACTCATCATATGTCTATTGGTTCGTCTACACCTGGTGGTAGTGTTAGTGGTAATCAGGCAACAATTATTAATCAAGCATCGTGTCATGCTACTGCTGGACAATTATTAACTGGTGGACTTGTATCAGCCACACCTAGTGGAATGATGACTTTGAATAATGCAACTGGTTCGAATCAAGTTAATAATGCTAATCATCTATTTGCATCTGGAGCAGGATTAGTTGGAATTGGTGGCAGTGGCGTCGGTGGTGCATCTGGTTCAAATACTGTTTCTGTGTCTAATTCCGCTTCTTTAGCACCTTTA TTTACAACTGCTCATTTTTATCCGCATCATCATACACAACAAACTGGTCAACAAC AACCACAACAACAGTTTCAAATTCATCATTC                                           ]
[+] EMBL CD093818             [                                                                                                                                                     AAATGGATTGTTCAATACTGGACAATCAAATGATACTGCTACTCATCATATGTCTATTGGTTCGTCTACACCTGGTGGTAGTGTTAGTGGTAATCAGGCAACAATTATTAATCAAGCATCGTGTCATGCTACTGCTGGACAATTATTAACTGGTGGACTTGTATCAGCCACACCTAGTGGAATGATGACTTTGAATAATGCAACTGGTTCGAATCAAGTTAATAATGCTAATCATCTATTTGCATCTGGAGCAGGATTAGTTGGAATTGGTGGCAGTGGCGTCGGTGGTGCATCTGGTTCAAATACTGTTTCTGTGTCTAATTCCGCTTCTTTAGCACCTTTA CTTACAACTGCTC                                                                                                                     ]
[+] EMBL CD182766             [                                                                                                                                                     AAATGGATTGTTCAATACTGGACAATCAAATGATACTGCTACTCATCATATGTCTATTGGTTCGTCTACACCTGGTGGTAGTGTTAGTGGTAATCAGGCAACAATTATTAATCAAGCATCGTGTCATGCTACTGCTGGACAATTATTAACTGGTGGACTTGTATCAGCCACACCTAGTGGAATGATGACTTTGAATAATGCAACTGGTTCGAATCAAGTTAATAATGCTAATCATCTATTTGCATCTGGAGCAGGATTAGTTGGAATTGGTGGCAGTGGCGTCGGTGGTGCATCTGGGTC AATACTGTTTCTGTGTCTAATCCNGCTTCTTTAGCACCTTTATTTTAC ACTGCTC                                                                                                                     ]
[+] EMBL CD164886             [                                                                                                                                                     AAATGGATTGTTCAATACTGGACAATCAAATGATACTGCTACTCATCATATGTCTATTGGTTCGTCTACACCTGGTGGTAGTGTTAGTGGTAATCAGGCAACAATTATTAATCAAGCATCGTGTCATGCTACTGCTGGACAATTATTAACTGGTGGACTTGTATCAGCCACACCTAGTGGAATGATGACTTTGAATGATGCAACTGGTTCGAATCAAGTTAATAATGCTAATCATCTATTTGCATCTGGAGCAGGATTAGTT                                                                                                                                                                                                                    ]
[+] EMBL CD164879             [                                                                                                                                                     AAATGGATTGTTCAATACTGGACAATCAAATGATACTGCTACTCATCATATGTCTATTGGTTCGTCTACACCTGGTGGTAGTGTTAGTGG                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                ]
[+] EMBL CD138935             [                                                                                                                                                     AAATGGATTGTTCAATACTGGACAATCAAATGATACTGCTACTCATCATATGTCTATTGGTTCGTCTACACCTGGTGGTAGTGTTAGTGGTAATCAGGCAACAATTATTAATCAAGCATCGTGTCATGCTACTGCTGGACAATTATTAACTGGTGGACTTGTATCAGCCACACCTAGTGGAATGATGACTTTGAATAATGCAACTGGTTCGAATCAAGTTAATAATGCTAATCATCTATTTGCATCTGGAGCAGGATTAGTT                                                                                                                                                                                                                    ]
[+] EMBL CD138980             [                                                                                                                                                     AAATGGATTGTTCAATACTGGACAATCAAATGATACTGCTACTCATCATATGTCTATTGGTTCGTCTACACCTGGTGGTAGTGTTAGTGGTAATCAGGCAACAATTATTAATCAAGCATCGTGTCATGCTACTGCTGGACAATTATTAACTGGTGGACTTGTATCAGCCACACCTAGTGGAATGATGACTTTGAATAATGCAACTGGTTCGAATCAAGTTAATAATGCTAATCATCTATTTGCATCTGGAGCAGGATTAGTT                                                                                                                                                                                                                    ]
[+] EMBL CD139020             [                                                                                                                                                     AAATGGATTGTTCAATACTGGACAATCAAATGATACTGCTACTCATCATATGTCTATTGGTTCGTCTACACCTGGTGGTAGTGTTAGTGGTAATCAGGCAACAATTATTAATCAAGCATCGTGTCATGCTACTGCTGGACAATTATTAACTGGTGGACTTGTATCAGCCACACCTAGTGGAATGATGACTTTGAATAATGCAACTGGTTCGAATCAAGTTAATAATGCTAATCATCTATTTGCATCTGGAGCAGGATTAGTT                                                                                                                                                                                                                    ]
[+] EMBL CD139044             [                                                                                                                                                     AAATGGATTGTTCAATACTGGACAATCAAATGATACTGCTACTCATCATATGTCTATTGGTTCGTCTACACCTGGTGGTAGTGTTAGTGGTAATCAGGCAACAATTATTAATCAAGCATCGTGTCATGCTACTGCTGGACAATTATTAACTGGTGGACTTGTATCAGCCACACCTAGTGGAATGATGACTTTGAATAATGCAACTGGTTCGAATCAAGTTAATAATGCTAATCATCTATTTGCATCTGGAGCAGGATTAGTT                                                                                                                                                                                                                    ]
[+] EMBL CD182912             [                                                                                                                                                     AAATGGATTGTTCAATACTGGACAATCAAATGATACTGCTACTCATCATATGTCTATTGGTTCGTCTACACCTGGGGGTAGTGTTAGTGGTAATCAGGCAACATTTATTAATCAAGCATCGTGTCATGCTACTGCTGGACAATTATTAACTGGGGGACTTGTATCAGCCACACCTAGTGGAATGATGACTTTGAATAATGCAACTGGTTCGAATCAAGTTAATAATGCTAATCATCTATTTGCATCTGGAGCAGGATTAGTT                                                                                                                                                                                                                    ]
[+] EMBL CD093127             [                                                                                                                                                                                                                                           GTGGTAATCAGGCAACAATTATTAATCAAGCATCGTGTCATGCTACTGCTGGACAATTATTAACTGGTGGACTTGTATCAGCCACACCTAGTGGAATGATGACTTTGAATAATGCAACTGGTTCGAATCAAGTTAATAATGCTAATCATCTATTTGCATCTGGAGCAGGATTAGTTGGAATTGGTGGCAGTGGCGTCGGTGGTGCATCTGGTTCAAATACTGTTTCTGTGTCTAATTCCGCTTCTTTAGCACCTTTA TTTACAACTGCTCATTTTTATCC                                                                                                           ]
[+] EMBL CD194401             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     GAATAATGCAACTGGTTCGAATCAAGTTAATAATGCTAATCATCTATTTGCATCTGGAGCAGGATTAGTTGGAATTGGTGGCAGTGGCGTCGGTGGTGCATCTGGTTCAAATACTGTTTCTGTGTCTAATTCCGCTTCTTTAGCACCTTTA TTTACAACTGCTCATTTTTATCCGCATCATCATACACAACAAACTGGTCAACAAC AACCACAACAACAGTTTCAAATTCATCATTCATTACAACAACCGCATCATCCACATACATCTGTACATATGCAA]
[+] EMBL CD182058             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         TTTCTGTGTCTAATTCCGCTTCTTTAGCACCTTTA TTTACAACTGCTCATTTTTATCCGCAACATCATACACAACAAACTGGTCAACAAC AACCACAACAACAGTTTCAAATTCATCATTCATTACAA                                    ]
[+] EMBL CD182081             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         TTTCTGTGTCTAATTCCGCTTCTTTAGCACCTTTA TTTACAACTGCTCATTTTTATCCGCAACATCATACACAACAAACTGGTCAACAAC AACCACAACAACAGTTTCAAATTCATCATTCATTACAA                                    ]




>consensus_10371#0
CCAAGTGTCTTTCCAAATGCTGAATTCTTTCAAACATTACAACAGACTGCCGCAGCGGCT
GCATTACCAACTGTACTGCCATACGATCAATCACAGTATATTGGTCAATTAATGTATTTC
CCATATCCCACAGCTGCTGCTGCTGCCGCAAATGGATTGTTCAATACTGGACAATCAAAT
GATACTGCTACTCATCATATGTCTATTGGTTCGTCTACACCTGGTGGTAGTGTTAGTGGT
AATCAGGCAACAATTATTAATCAAGCATCGTGTCATGCTACTGCTGGACAATTATTAACT
GGTGGACTTGTATCAGCCACACCTAGTGGAATGATGACTTTGAATAATGCAACTGGTTCG
AATCAAGTTAATAATGCTAATCATCTATTTGCATCTGGAGCAGGATTAGTTGGAATTGGT
GGCAGTGGCGTCGGTGGTGCATCTGGTTCAAATACTGTTTCTGTGTCTAATTCCGCTTCT
TTAGCACCTTTATTTACAACTGCTCATTTTTATCCGCATCATCATACACAACAAACTGGT
CAACAACAACCACAACAACAGTTTCAAATTCATCATTCATTACAACAACCGCATCATCCA
CATACATCTGTACATATGCAA

clustalw multiple alignements is not computed in this case
Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)