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These datas are free for academic use only, please contact me for any other use. Schistosoma mansoni see consensus multiple alignment with clustalw Direct access to contigs :
consensusID : consensus_10380#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 15 consensus length = 1848 fasta sequence
[CATCGGGAGTCGAAGGAATGTCGGATGATTTC-CACCCATCCATAAAAATAACTGACCACCACTATCCAGAATATAAACATGTTTCGAATATAATAATCGTTTGGACAAAAGACCATTTTCAAGTTCCACTTGCGGTAATTCTAAATAACCTCTTCCCATTTGAACATCATATAAAATTGGTTGAGGTAGTTGCCAGTCCGTAGGGATGAAGTCACGTGATATTACTTTCGGTGGATGAACCACCGGAGCAGGTGGATAATTGATTTCTTTATTTTCTTCATGATTATCTAAAGGTTTAATTATATGATCTTTTTGATCTGAATTGGTAGTTGGTTTCGGCAGTGGTGCAGGAACCCAAACACCGGTTATAATGGCCCAAAATGCATTGGATTCACGAGTTTCCGGTTCAATATGAATGGATGCTTCACCTCGACGTTCACGAACTGAAATTTTCTCAGCTAATAATCGCCCTTTAGTTTGTATGATAGGACGTGAATTTTTTCCTATCCATAAATAGAGATGAGATTGAGCATCGAGTAGATAACTGAATTTAGAATCTAAACTGAGATGAGTTAATGGCATTGAGACAATTTTCAAACGTTTTTCTGTGCCAAATAACCTATAAAATCTGGGTACTACAACATCATCTTCAACATGAATAAATCCAGTCTCACCACGAGC-------ACCATCT-AATA-C-TATCAAATTGCCATCGAATAATGCTACAAATTCTGAAGATTCATCTCCTTCTTCTTCACGTTTAGTTCGACATTCAGCACCAAGGAAATTACGTAAATTTACAGCATGAATAGCTGCACAAGTCTGTTTATCTTTTGTTGAACGAGAACCAATCCAATAATATATAGTCCATTCAAATACTTGATTATTACTTATAGTAGTTTGTAAGATAACATAACAATCACCATTAAGCAAATGACCTTGTAAAACATCATCTTCAACACGTTTGGGATAAAACTGATCCAATTCCCACATCTGCACACCAGGATGTATACCAGTATCATGCCTCGTCAAAAATTCCTGTATAATCCAGTCGTGGTCTAGCCAATAGATCTTGCCAACGTCTAGCCGCTAATTTACGTGTTTCTTCTTCAACCTCATGTTCTTTTTGTTCAAGTAGTTCTTCTTTTTCTTTAGCTATTCGTTGCATACCTTCAAGTACACATTTACTATCTTTCCCGACACCTTCTCCTCGACGTCTTCTGAGACGTCGTAACCGAGCAGCCGGATCCTTTGGATGATGAGTTGTTTCAGTATTTAACGCTGGTTTCCCACGCATCATACGTAGTTGGGCATCCAGTGAGAAATCAATGTTATAAAAAGCTAGACCTGCACCTTTCTGCAACTCGGGTGGTTTTGGT-GGTATTTTTAATTGAGGATTATTGTCAACT-TCAAAAACATCTAAAGATTCCTTCAAATAATGAATAGCGTCAGGAAGTGTAAGAAGACGATTTGAGTTAAGTATCAGACGTTTTAAACGACCACAACGACATAGACTTTCTGGTATAGTCTCCAATTCATTGTGTGATGCATCGAATATTTCCAAATCTTGTAATTCACCAATTCCTGAAGGTATACCACCAAATGTCAACTGATTATTATTCACATATAATTTACGTAAACATGACAAACGAATTAATCCGGTTGGTAAATGAATTAACTGATTATAACTGAGATTAAGATATTCCAGTTTAGGCCAGTCACCGGTTAAAGTGGATAAATCTGACAATTCATTATGCGCTAAATTTAGTTTACGAAGATTTTTAAGCGATAAAACTGGTTCAGGAATTTTTGTCAATAAATTACACGACAAATCTAATTCAACAAGACGTTCTA]
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[+] EMBL CD062504 [ AAGGAAT TCGAGTGATTTCTCACCCATCCATAAAAATAACTGA CACCACTATCCAGAATATAAACATGTTTCGGATCTAATAATCG TTGGACAAAAGACCATTTTCAAGTTCCACTTGCGGTAATTCTAAATAACCTCTCCCCATTTGAACATCATATAAAATTGGTTGAGGTAGTTGCCAGTCCGTAGGGATGAAGTCACGTGATATTACTTTCGGTGGATGAACCACCGGAGCAGGTGGATAATTGATTTCTTTATTTTCTTCATGATTATCTAAAGGTTTAATTATATGATCTTTTTGATCTGAATTGGTAGTTGGCTTCGGCAGTGGTGCAGGAACCCAAACACCG ]
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[-] EMBL CD185580 [ GACGTGAATTTTTTCCTATCCATAAATAGAGATGAGATTGAGCATCGAGTAGATAACTGAATTTAGAATCTAAACTGTGATGAGTTAATGGCATTGAGACAATTTTCAAACGTTTTTCTGTGCCAAATAACCTATAAAATCTGGGTACTACAACATCATCTTCAACATGAATAAATCCAGTCCCACCACGAGC ACCATCT AATA C TATCAAATTGCCATCGAATAATGCTACAAATTCTGAAGATTCATCTCCTTCTTCTTCACGTTTAGTTCGACATTCAGCACCAAGGAAATTACGTAAATTTACAGCATGAATAGCTGCACAAGTCTGTTTATCTTTTGTTGAACGAGAACCAATCCAATAATATATAGTCCATTCAAATACTTGATTATTACTTATAGTAGTTTGTAAGATAACATAACAATCACCATTAAGCAAATGACCTTGTAAAAC ]
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[-] EMBL AI976576 [ TGCATACCTTCAAGTACACATTTACTATCTTTCCCGACACCTTCTCCTCGACGTCTTCTGAGACGTCGTAACCGAGCAGCCGGATCCTTTGGATGATGAGTTGTTTCAGTATTTAACGCTGGTTTCCCACGCATCATACGTAGTTGGGCATCCAGTGAGAAATCAATGTTATAAAAAGCTAGACCTGCACCTTTCTGCAACTCGGGTGGTTTTGGT GGTATTTTTAATTGAGGATTATTGTCAACT TCAAAAACATCTAAAGATTCCTTCAAATAATGAATAGCGTCAGGAAGTGTAAGAAGACGATTTGAGTTAAGTATCAGACGTTTTAAACGACCACAACGACATAGACTTTCTGGTATAGTCTCCAATTCA ]
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[+] EMBL CD110976 [ cccGGTGGGTATTTGGAATCGACGATTGTTGTCAACTCTCATAAACATCTAAAGATTCCTTCAAATAATGAATAGCGTCAGGAAGTGTAAGAAGACGATTTGAGTTAAGTATCAGACGTTTTAAACGACCACAACGACATAGACTTTCTGGTATAGTCTCCAATTCATTGTGTGATGCATCGAATATTTCCAAATCTTGTAATTTACCAATTCCTGAAGGTATACCACCAAATGTCAACTGATTATTATTCACATATAATTTACGTAAACATGACAAACGAATTAATCCGGTTGGTAAATGAATTAACTGATTATAACTGAGATTAAGATATTCCAGTTTAGGCCAGTCACCGGTTAAAGTGGATAAATCTGACAATTCATTATGCGCTAAATTTAGTTTACGAAGATTTTTAAGCGATAAAACTGGTTCAGGAATTTTTGTCAATAAATTACACGACAAATCTAATTCAACAAGACGTTCTA]
clustalw multiple alignements is not computed in this case |
| Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) | ||||