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Schistosoma mansoni
cluster # 10386 cluster # 10386       Sequences # 16       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_10386#0 length = 842 sequences # 16  

consensusID : consensus_10386#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 16
consensus length = 842
fasta sequence
                              [ATTGTGCAATAGTAGGTGTAGTAATACGCAGTCAG-AAACGATAATCGGGTTGACAATCTCACTTCAGTCA-ACCGAAAATAAGTGACTGCTATTAGTAAACGCTAAGAATTGGACGGTTGCATTTTTCATTGAGATTTGATGTAGAACAAATATCACAGTGGGTTTCACGACTTCTCATAGTAGAGTTCGATCCACGACAGCTTAACAGTACTGGTGTAGATGGAACTAAACTCCCCAGAAGGGAGGATGATGGTCGACTGTATGAGAAGCAAAGTGGACGAGAACGACCAGCAGCAACAGATGCGCTGCGAACATATACTGAAGATGGATAAGACGGGTATTTCTGAACATATTCCGAAATCCACGAGTTTGTTGGCTCCCAGTTGATATTGTTGTTTGAGCGAGAATGTGAAGCACCCAACCCAGATAGTTGCGGCACACTGCTAACTCTTGTTGACTTGTGGATGGTAGGAACGGGTTTTTCAGTTTTACTTAGTTCAATTGCCTTACTTTTCACAATACACTGTTTTGGCCCACATATTATAGATGACACTTTAGAGTTTACGGTATTCGTATGTGTAAAACTATTCAGCCTTTCTTTACGGCGAGCCTCAGCACGTATAGCAGAAGGATAAACATCTCGGTCTGACTTAACGTTGAAAGTTTTTCTAGCCCCCAACATAGGACCAGGAGAACTTCCGATAGCGTAAGGTACAAAAGCTTTGGGTTGTTCTATTGCCTTTATTTGGGGTTTTTGAGTTTGGGTACCGACGTCTGTTCTCTCAGTGGTCGAAACGCCGTCATTCTTTTCCTTCACCTGTGTAACATCATGCGGGCCTTCA]

[+] EMBL CD127573             [ATTGTGCAATAGTAGGTGTAGTAATACGCAGTCAG AAACGATAATCGGGTTGACAATCTCACTTCAGTCA ACCG AAATAAGTGACTGCTATTAGTAAACGCTAAGAATTGGACGGTTGCATTTTTCATTGAGATTTGATGTAGAACAAATATCACAGTGGGTTTCACGACTTCTCATAGTAGAGTTCGATCCACGACAGCTTAACAGTACTGGTGTAGATGGAACTAAACTCCCCAGAAGGGAGGATGATGGTCGACTGTATGAGAAGCAAAGTGGACGAGAACGACCAGCAGCAACAGATGCGCTGCGAACATATACTGAAGATGGATAAGACGGGTATTTCTGAACATATTCCGAAATCCACGAGTTTGT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     ]
[+] EMBL CD127938             [           GTAGGTGTAGTAATACGCAGTTAGNAAACGATAATCGGGTTGACAATCTCACTTCAGTCA ACCG AAATAAGTGACTGCTATTAGTAAACGCTAAGAATTGGACGGTTGCATTTTTCATTGAGATTTGATGTAGAACAAATATCACAGTGGGTTTCACGACTTCTCATAGTAGAGTTCGATCCACGACAGCTTAACAGTACTGGTGTAGATGGAACTAAACTCCCCAGAAGGGAGGATGATGGTCGACTGTATGAGAAGCAAAGTGGACGAGAACGACCAGCAGCAACAGATGCGCTGCGAACATATACTGAAGATGGATAAGACGGGTATTTCTGAACATATTCCGAAATCCACGAGTTTGTTGGCTCCCAGTTGATATTGTTGTTTGAGCGAGAATGTGAAGCACCCAACCCAGATAGTTGCGGCACACTGCTAACTCTTGTTGACTTGTGGATGGTAGGAACGGGTTTTTCAGTTTTACT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             ]
[+] EMBL CD179130             [                         ACGCAGTCAG AAACGATAATCGGGTTGACAATCTCACTTCAGTCA ACCGAAAATAAGTGACTGCTATTAGTAAACGCTAAGAATTGGACGGTTGCATTTTTCATTGAGATTTGATGTAGAACAAATATCACAGTGGGTTTCACGACTTCTCATAGTAGAGTTCGATCCACGACAGCTTAACAGTACTGGAGTAGATGGAACTAAACTCCCCAGAAGGGAGGATGATGGTCGACTGTATGAGAAGCAAAGTGGACGAGAACGACCAGCAGCAACAGATGCGCTGCGAACATATACTGAAGATGGATAAGACGGGTATTTCTGAACATATTCCGAAATCCACGAGTTTGTTGGCTCCCAGTTGATATTGTTGTTTGAGCGAGAATGTGAAGCACCCAACCCAGATAGTTGCGGCACACTGCTAACTCTTGTTGACTTGTGGATGGTAGGAACGGGTTTTTCAGTTTTACTTAGTTCAATTGCCTTACTTTTCGCAATACACTGTTTTGGCCCACATATTATAGATGACACTTTAGAGTTTACGGT                                                                                                                                                                                                                                                                                  ]
[+] EMBL CD178798             [                         ACGCAGTCAG AAACGATAATCGGGTTGACAATCTCACTTCAGTCAGACCGAAAATAAGTGACTGCTATTAGTAAACGCTAAGAATTGGACGGTTGCATTTTTCATTGAGATTTGATGTAGAACAAATATCACAGTGGGTTTCACGACTTCTCATAGTAGAGTTCGATCCACGACAGCTTAACAGTACTGGTGTAGATGGAACTAAACTCCCCAGAAGGGAGGATGATGGTCGACTGTATGAGAAGCAAAGTGGACGAGAACGACCAGCAGCAACAGATGCGCTGCGAACATATACTGAAGATGGATAAGACGGGTATTTCTGAACATATTCCGAAATCCACGAGTTTGTAGGC                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 ]
[+] EMBL CD127151             [                          CGCAGTCAG AAACGATAATCGGGTTGACAATCTCACTTCAGTCA ACCGAAAATAAGTGACTGCTATTAGTAAACGCTAAGAATTGGACGGTTGCATTTTTCATTGAGATTTGATGTAGAACAAATATCACAGTGGGTTTCACGACTTCTCATAGTAGAGTTCGATCCACGACAGCTTAACAGTACTGGTGTAGATGGAACTAAACTCCCCAGAAGGGAGGATGATGGTCGACTGTATGAGAAGCAAAGTGGACGAGAACGACCAGCAGCAACAGATGCGCTGCGAACATATACTGAAGATGGATAAGACGGGTATTTCTGAACATATTCCGAAATCCACGAGTTTGTTGGCTCCCAGTTGATATTGTTGTTTGAGCGAGAATGTGAAGCACCCAACCCAGATAGTTGCGGCACACTGCTAACTCTTGTTGACTTGTGGATGGTAGGAACGGGTTTTTCAGTTTTACT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             ]
[+] EMBL CD128065             [                          CGCAGTCAG AAACGATAATCGGGTTGACAATCTCACTTCAGTCA ACCGAAAATAAGTGACTGCTATTAGTAAACGCTAAGAATTGGACGGTTGCATTTTTCATTGAGATTTGATGTAGAACAAATATCACAGTGGGTTTCACGACTTCTCATAGTAGAGTTCGATCCACGACAGCTTAACAGTACTGGTGTAGATGGAACTAAACTCCCCAGAAGGGAGGATGATGGTCGACTGTATGAGAAGCAAAGTGGACGAGAACGACCAGCAGCAACAGATGCGCTGCGAACATATACTGAAGATGGATAAGACGGGTATTTCTGAACATATTCCGAAATCCACGAGTTTGTTGGCTCCCAGTTGATATTGTTGTTTGAGCGAGAATGTGAAGCACCCAACCCAGATAGTTGCGGCACACTGCTAACTCTTGTTGACTTGTGGATGGTAGGAACGGGTTTTTCAGTTTTACT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             ]
[-] EMBL CD178724             [                          CGCAGTCAG AAACGATAATCGGGTTGACAATCTCACTTCAGTCA ACCGAAAATAAGTGACTGCTATTAGTAAACGCTAAGAATTGGACGGTTGCATTTTTCATTGAGATTTGATGTAGAACAAATATCACAGTGGGTTTCACGACTTCTCATAGTAGAGTTCGATCCACGACAGCTTAACAGTACTGGTGTAGATGGAACTAAACTCCCCAGAAGGGAGGATGATGGTCGACTGTATGAGAAGCAAAGTGGACGAGAACGACCAGCAGCAACAGATGCGCTGCGAACATATACTGAAGATGGATAAGACGGGTATTTCTGAACATATTCCGAAATCCACGAGTTTGTTGGCTCCCAGTTGATATTGTT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                ]
[-] EMBL CD127100             [                           GCAGTCAG AAACGATAATCGGGTTGACAACCTCACTTCAGTCA ACCGAAAATAAGTGACTGCTATTAGTAAACGCTAAGAATTGGACGGTTGCATTTTTCATTGAGATTTGATGTAGAACAAATATCACAGTGGGTTTCACGACTTCTCATAGTAGAGTTCGATCCACGACAGCTTAACAGTACTGGTGTAGATGGAACTAAACTCCCCAGAAGGGAGGATGATGGTCGACTGTATGAGAAGCAAAGTGGACGAGAACGACCAGCAGCAACAGATGCGCTGCGAACATATACTGAAGATGGATAAGACGGGTATTTCTGAACATATTCCGAAATCCACGAGTTTGTTGGCTCCCAGTTGATATTGTTGTTTGAGCGAGAATGTGAAGCACCCAACCCAGATAGTTGCGGCACACTGCTAACTCTTGTTGACTTGTGGATGGTAGGAACGGGTTTTTCAGTTTTACTT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            ]
[-] EMBL CD127646             [                           GCAGTCAG AAACGATAATCGGGTTGACAATCTCACTTCAGTCA ACCGAAAATAAGTGACTGCTATTAGTAAACGCTAAGAATTGGACGGTTGCATTTTTCATTGAGATTTGATGTAGAACAAATATCACAGTGGGTTTCACGACTTCTCATAGTAGAGTTCGATCCACGACAGCTTAACAGTACTGGTGTAGATGGAACTAAACTCCCCAGAAGGGAGGATGATGGTCGACTGTATGAGAAGCAAAGTGGACGAGAACGACCAGCAGCAACAGATGCGCTGCGAACATATACTGAAGATGGATAAGACGGGTATTTCTGAACATATTCCGAAATCCACGAGTTTGTTGGCTCCCAGTTGATATTGTTGTTTGAGCGAGAATGTGAAGCACCCAACCCAGATAGTTGCGGCACACTGCTAACTCTTGa                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    ]
[-] EMBL CD127282             [                           GCAGTCAG AAACGATAATCGGGTTGACAATCTCACTTCAGTCA ACCGAAAATAAGTGACTGCTATTAGTAAACGCTAAGAATTGGACGGTTGCATTTTTCATTGAGATTTGATGTAGAACAAATATCACAGTGGGTTTCACGACTTCTCATAGTAGAGTTCGATCCACGACAGCTTAACAGTACTGGTGTAGATGGAACTAAACTCCCCAGAAGGGAGGATGATGGTCGACTGTATGAGAAGCAAAGTGGACGAGAACGACCAGCAGCAACAGATGCGCTGCGAACATATACTGAAGATGGATAAGACGGGTATTTCTGAACATATTCCGAAATCCACGAGTTTGTTGGCTCCCAGTTGATATTGTTGTTTGAGCGAGAATGTGAAGCACCCAACCCAGATAGTTGCGGCACACTGCTAACTCTTGTTGACTTGTGGATGGTAGGAACGGGTTTTTCAGTTATACTTAGTTCAATTACC TACTatgt                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       ]
[-] EMBL CD127622             [                           GCAGTCAG AAACGATAATCGGGTTGACAATCTCACTTCAGTCA ACCGAAAATAAGTGACTGCTATTAGTAAACGCTAAGAATTGGACGGTTGCATTTTTCATTGAGATTTGATGTAGAACAAATATCACAGTGGGTTTCACGACTTCTCATAGTAGAGTTCGATCCGCGACAGCTTAACAGTACTGGTGTAGATGGAACTAAACTCCCCAGAAGGGAGGATGATGGTCGACTGTATGAGAAGCAAAGTGGACGAGAACGACCAGCAGCAACAGATGCGCTGCGAACATATACTGAAGATGGATAAGACGGGTATTTCTGAACATATTCCGAAATCCACGAGTTTGTTGGCTCCCAGTTGATATTGTTGTTTGAGCGAGAATGTGAAGCACCCAACCCAGATAGTTGCGGCACACTGCTAACTCTTGTTGACTTGTGGATGGTAGGAACGGGTTTTTCAGTTTTACTT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            ]
[-] EMBL CD127996             [                           GCAGTCAG AAACGATAATCGGGTTGACAATCTCACTTCAGTCA ACCGAAAATAAGTGACTGCTATTAGTAAACGCTAAGAATTGGACGGTTGCATTTTTCATTGAGATTTGATGTAGAACAAATATCACAGTGGGTTTCACGACTTCTCATAGTAGAGTTCGATCCACGACAGCTTAACAGTACTGGTGTAGATGGAACTAAACTCCCCAGAAGGGAGGATGATGGTCGACTGTATGAGAAGCAAAGTGGACGAGAACGACCAGCAGCAACAGATGCGCTGCGAACATATACTGAAGATGGATAAGACGGGTATTTCTGAACATATTCCGAAATCCACGAGTTTGTTGGCTCCCAGTTGATATTGTTGTTTGAGCGAGAATGTGAAGCACCCAACCCAGATAGTTGCGGCACACTGCTAACTCTTGTTGACTTGTGGATGGTAGGAACGGGTTTTTCAGTTTTACTT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            ]
[-] EMBL CD127887             [                           GCAGTCAG AAACGATAATCGGGTTGACAATCTCACTTCAGTCA ACCGAAAATAAGTGACTGCTATTAGTAAACGCTAAGAATTGGACGGTTGCATTTTTCATTGAGATTTGATGTAGAACAAATATCACAGTGGGTTTCACGACTTCTCATAGTAGAGTTCGATCCACGACAGCTTAACAGTACTGGTGTAGATGGAACTAAACTCCCCAGAAGGGAGGATGATGGTCGACTGTATGAGAAGCAAAGTGGACGAGAACGACCAGCAGCAACAGATGCGCTGCGAACATATANTGAAGATGGATAA AAAAAAATTTTTGAACATATTCNNAAATCCANGAGTT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        ]
[+] EMBL CD060479             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               GTTGCGGCACACTGCTAACTCTTGTTGACTTGTGGATGGTAGGAACGGGTTTTTCAGTTTTACTTAGTTCAATTGCCTTACTTTTCACAATACACTGTTTTGGCCCACATATTTTAGATGACACTTTGGAGTTTACGGTATTCGTATGTGTAAAACTATTCAGCCTTTCTTTACGGCGAGCCTCAGCACGTATAGCAGAAGGATAAACATCTCGGTCTGACTTAACGTTGAAAGTTTTTCTAGCCCCCAACATAGGACCAGGAGAACTTCCGATAGCGTAAGGTACAAAAGCTTTGGGTTGTTCTATTGCCTTTATTTGGG                                                                                            ]
[+] EMBL CD122326             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   TTCAGTTTTACTTAGTTCAATTGCCTTACTTTTCACAATACACTGTTTTGGCCCACATATTATAGATGACACTTTAGAGTTTACGGTATTCGTATGTGTAAAACTATTCAGCCTTTCTTTACGGCGAGCCTCAGCACGTATAGCAGAAGGATAAACATCTCGGTCTGACTTAACGTTGAAAGTTTTTCTAGCCCCCAACATAGGACCAGGAGAACTTCCGATAGCGTAAGGTACAAAAGCTTTGGGTTGTTCTATTGCCTTTATTTGGGGTTTTTGAGTTTGGGTACCGACGTCTGTTCTCTCAGTGGTCGAAACGCCGTCATTCTTTTCCTTCACCTGTGTAACATCATGCGGGCCTTCA]
[+] EMBL CD179294             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  CAGAAGGATAAACATCTCGGTCTGACTTAACGTTGAAAGTTTTTCTAGCCCCCAACATAGGACCAGGAGAACTTCCGATAGCGTAAGGTACAAAAGCTTTGGGTTGTTCTATTGCCTTTATTTGGGGTTTTTGAGTTTGGGTACCGACGTCTGTTCTCTCAGTGGTCGAAACGCCGTCATTCTTTTCCTTCACCTGTGTAACATCATGCGGGCCT   ]


>consensus_10386#0 ATTGTGCAATAGTAGGTGTAGTAATACGCAGTCAGAAACGATAATCGGGTTGACAATCTC ACTTCAGTCAACCGAAAATAAGTGACTGCTATTAGTAAACGCTAAGAATTGGACGGTTGC ATTTTTCATTGAGATTTGATGTAGAACAAATATCACAGTGGGTTTCACGACTTCTCATAG TAGAGTTCGATCCACGACAGCTTAACAGTACTGGTGTAGATGGAACTAAACTCCCCAGAA GGGAGGATGATGGTCGACTGTATGAGAAGCAAAGTGGACGAGAACGACCAGCAGCAACAG ATGCGCTGCGAACATATACTGAAGATGGATAAGACGGGTATTTCTGAACATATTCCGAAA TCCACGAGTTTGTTGGCTCCCAGTTGATATTGTTGTTTGAGCGAGAATGTGAAGCACCCA ACCCAGATAGTTGCGGCACACTGCTAACTCTTGTTGACTTGTGGATGGTAGGAACGGGTT TTTCAGTTTTACTTAGTTCAATTGCCTTACTTTTCACAATACACTGTTTTGGCCCACATA TTATAGATGACACTTTAGAGTTTACGGTATTCGTATGTGTAAAACTATTCAGCCTTTCTT TACGGCGAGCCTCAGCACGTATAGCAGAAGGATAAACATCTCGGTCTGACTTAACGTTGA AAGTTTTTCTAGCCCCCAACATAGGACCAGGAGAACTTCCGATAGCGTAAGGTACAAAAG CTTTGGGTTGTTCTATTGCCTTTATTTGGGGTTTTTGAGTTTGGGTACCGACGTCTGTTC TCTCAGTGGTCGAAACGCCGTCATTCTTTTCCTTCACCTGTGTAACATCATGCGGGCCTT CA



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)