These datas are free for academic use only, please contact me for any other use. Schistosoma mansoni see consensus multiple alignment with clustalw Direct access to contigs :
consensusID : consensus_10399#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 3 consensus length = 768 fasta sequence [CGACTGCTATAACTATAGCTTTAAGTTTTCAGCATTATTTTTGGAAAGCCTCAGGTCGTACCTCAGGGTGCTGTTGCAGTTGACGATGATTTGTGTGGTCAAATAGGCTTAAATATAATGCGAGAAAACAAAGGGAATGCTGTTGATGCGATGGTATCTGATTGGACAAGGACGGTGTTCTGTTGAGTGTTACGTAAATAATAGTTGTGTAACGGTGGTGACTGATTGGAC-AGGACGGTGTTCTGTTGAGTGTAACGAGAGTTGGTGTGATTTGGTGTTTGTACCAACTGGTTGTGGCGTTAATTGTGTCGAGTGATAAGAGAGTTTGTTGGTGATATTGATGGCGATAGAGTGGTGATGGGTGACGGTTGAAGTATGCGGTGATGGTGATAATTTATAAGCGATGTGTTTGAATCGGAATAGCGTAAATAATAGTTGTGTAACGGTGGTGACTGATTGGACGAGGATGGTGTTCTGTTGAGTGTAACGAGAGTTGGTGTGATTTGGTGTTTGTACCAACTGGTTGTGGCGTAAATTGTGTCGAGTGATAAAAGAGTAAATAATAGTTGTGTAACGGTGGTGACTGATTGGACGAGGATGGTGTTCTGTTGAGTGTAACGAGAGTTGGTGTGATTTGGTGTTTGTACCAACTGGTTGTGGCGTTAATTGTGTCGAGTGATAAAAGAGTAAATAATAGTTGTGTAACGGTGGTGACTGATTGNNAC-AGGACGGTGTTCTGTTGAGTGTTACGAGAGTTGGTGTGATTTG] [+] EMBL CD060146 [CGACTGCTATAACTATAGCTTTAAGTTTTCAGCATTATTTTTGGAAAGCCTCAGGTCGTACCTCAGGGTGCTGTTGCAGTTGACGATGATTTGTGTGGTCAAATAGGCTTAAATATAATGCGAGAAAACAAAGGGAATGCTGTTGATGCGATGGTATCTGATTGGACAAGGACGGTGTTCTGTTGAGTGTTACGTAAATAATAGTTGTGTAACGGTGGTGACTGATTGGAC AGGACGGTGTTCTGTTGAGTGTAACGAGAGTTGGTGTGATTTGGTGTTTGTACCAACTGGTTGTGGCGTTAATTGTGTCGAGTGATAAGAGAGTTTGTTGGTGATATTGATGGCGATAGAGTGGTGATGGGTGACG ] [+] EMBL CD153925 [ TTGGACAAGGACGGTGTTCTGTTGAGTGTTACGAGAGTTGGTGTGATTTGGTGTTTGTACCAACTGGTTGTGGCGTTAATTGTGTCGAGTGATAAAAGAGTTTGTTGGTGATATTGATGGCGATAGAGTGGTGATGGGTGACGGTTGAAGTATGCGGTGATGGTGATAATTTATAAGCGATGTGTTTGAATCGGAATAGCGTAAATAATAGTTGTGTAACGGTGGTGACTGATTGGACGAGGATGGTGTTCTGTTGAGTGTAACGAGAGTTGGTGTGATTTGGTGTTTGTACCAACTGGTTGTGGCGTAAATTGTGTCGAGTGATAAAAGAGTAAATAATAGTTGTGTAACGGTGGTGACTGATTGGACGAGGATGGTGTTCTGTTGAGTGTAACGAGAGTTGGTGTGATTTGGTGTTTGTACCAACTGGTTGTGGCGTTAATTGTGTCGAGTGATAAAAGAGTAAATAATAGTTGTGTAACGGTGGTGACTGATTGNNAC AGGACGGTGTTCTGTTGAGTGTTACGAGAGTTGGTGTGATTTG] [+] EMBL CD115747 [ TATTGATGGCGATAGAGTGGTGATGGGTGACGATTGAAGTTTGCGGTGATGGCGATAATTTATAAGCGATGTGTTTGAATCGGAATAGCGTAAATAATAGTTGTGTAACGGTGGTGACTGATTGGACGAGGATGGTGTTCTGTTGAGTGTTACGAGAGTTGGTGTGATTTGGTGTTTGTACGAACTGGCTGTGGCGCTAATTATGTCGAGTAATAAAAGAGTAAATAATAGTTGTGTAACGGTGGTGACTGATTGGACGAGGATGGTGTTCTGTTGAGTGTTACGAGAGTTGGTGTGATTTGGTGTTTGTACGAACTGGTTGTGGCGCTAATTATGTCGAGTAATAAAAGAGTAAATAATAGTTGTGTAACGGTGGTGACTGATTG GACGAGGATGGTGTTCTGTTGAGTGTTACGAGAGTTGGTGTGATT ] consensusID : consensus_10399#1 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 2 consensus length = 645 fasta sequence [TGGTGACTGATTGGACGAGGATGGTGTTCTGTTGAGTGTTACGAGAGTTGGTGTGATTTGGTGTTTGTACGAACTGGTTGTGGCGCTAATTATGTCGAGTAATAAAAGAGTAAATAATAGTTGTGTAACGGTGGTGACTGATTGGACGAGGATGGTGTTCTGTTGAGTGTTACGAGAGTTGGTGTGATTTGGTGTTTGTACGAACTGGTTGTGGCGCTAATTATGTCGAGTAATAAAAGAGTAAATAATAGTTGTGTAACGGTGGTGACTGATTGGACGAGGATGGTGTTCTGTTGAGTGTTACGAGAGTTGGTGTGATTTGGTGTTTGTACGAACTGGTTGTGGCGCTAATTATGTCGAGTAATAAAAGAGTAAATAATAGTTGTGTAACGGTGGTGACTGATTGGACGAGGATGGTGTTCTGTTGAGTGTTACGAGAGTTGGTGTGATTTGGTGTTTGTACGAACTGGTTGTGGCGCTAATTATGTCGAGTAATANAAGAGTAAATAATAGTTGTGTAACGGTGGTGACTGATTGNACGAGGATGGTGTTCTGTTGAGTGTTACGAGAGTTGNTGTGATTTGGTGTTTGTACGAACTGGTTGTGGCGCT-ATTATGTCGAGTAATAAAAGAGTAAATATAGTTC] [+] EMBL CD154239 [TGGTGACTGATTGGACGAGGATGGTGTTCTGTTGAGTGTTACGAGAGTTGGTGTGATTTGGTGTTTGTACGAACTGGTTGTGGCGCTAATTATGTCGAGTAATAAAAGAGTAAATAATAGTTGTGTAACGGTGGTGACTGATTGGACGAGGATGGTGTTCTGTTGAGTGTTACGAGAGTTGGTGTGATTTGGTGTTTGTACGAACTGGTTGTGGCGCTAATTATGTCGAGTAATAAAAGAGTAAATAATAGTTGTGTAACGGTGGTGACTGATTGGACGAGGATGGTGTTCTGTTGAGTGTTACGAGAGTTGGTGTGATTTGGTGTTTGTACGAACTGGTTGTGGCGCTAATTATGTCGAGTAATAAAAGAGTAAATAATAGTTGTGTAACGGTGGTGACTGATTGGACGAGGATGGTGTTCTGTTGAGTGTTACGAGAGTTGGTGTGATTTGGTGTTTGTACGAACTGGTTGTGGCGCTAATTATGTCGAGTAATANAAGAGTAAATAATAGTTGTGTAACGGTGGTGACTGATTGNACGAGGATGGTGTTCTGTTGAGTGTTACGAGAGTTGNTGTGATTTGGTGTTTGTACGAACTGGTTGTGGCGCT ATTATGTCGAGTAATAAAAGAGTAAATATAGTT ] [+] EMBL CD115876 [ CTAATTATGTCGAGTAATAAAAGAGTAAATAATGGTTGTGTAACGGTGGTGACTGATTGGACGAGGATGGTGTTCTGTTGAGTGTAACGAGAGTTGGTGTGATTTGGTGTTTGTACGAGCTGGTTGTGGCGCTAATTATGTCGAGTAATAAAAGAGTAAATAATAGTTGTGTAACGGTGGTGACTGATTGGACGAGGATGGTGTTCTGTTGAGTGTTACGAGAGTTGGTGTGATTTGGTGTTTGTACGAACTGGTTGTGGCGCTAATTATGTCGAGTAATAAAAGAGTAAATAATAGTTGTGTAACGGTGGTGACTGATTGGACGAGGATGGTGTTCTGTTGAGTGTTACGAGAGTTGGTGTGATTTGGTGTTTGTACGAACTGGTTGTGGCGCTAATTATGTCGAGTAATATAAGAGTAAATAATAGTTGTGTAACGGTGGTGACTGATTGCACGAGGATGGTGTTCTGTTGAGTGCAACGAGAGTTGGCGTGATTTGGTGTTCGT CCAACTGGTTGTGGCGCTAATTGTGTCGAGTGATAAAAGATTAAATATtacgc] consensusID : consensus_10399#2 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 2 consensus length = 598 fasta sequence [GGTTGTGGCGTTAATTGTGTCGAGTGATAAAAGAGTTAGTTGGTGATATTGATGGCGATAGAGTGGTGATGGGTGACGGTTGAAGTATGCGGTGATGGTGATAATTTATAAGCGATGTGTTTGAATCGGAATAGCGAGAGTTGGTGTGATTTGGTGTTTGTACCAACTGGTTGTGGCGTTAATTATGTCGAGTGGTAAAAGAGTAAATAATAGTTGTGTAATGGTGGTGACTGACTGGACGAGGATGGTGTTCTGTTGAGTGTAACGAGAGTTGGTGTGATTTGGTGTTTGTACCAACTGGTTGTGGCGTAAATTGCGTCGAGTGATAAAAGAGTAAATAATAGTTGTGTAATGGTGGTGACTGACTGGACGAGGATGGTGCTGTGTTGAGTGTAACGTAAATAATAGTTGTGTAATGGTGGTGACTGACTGGACGAGGATGGTGCTGTGTTGAGTGTAACGAGAGTTGGTGTGATTTGGTGTTTGTACCAACTGGTTGTGGCGTAAATTGCGTCGAGTGATAAAAGAGTTTGTTGGTGATATTGATGACGATAGAGTGGTGATGGGTGACGAATGAAGTATGCGGTGAGCTCAAGAG] [-] EMBL CD142950 [GGTTGTGGCGTTAATTGTGTCGAGTGATAAAAGAGTTAGTTGGTGATATTGATGGCGATAGAGTGGTGATGGGTGACGGTTGAAGTATGCGGTGATGGTGATAATTTATAAGCGATGTGTTTGAATCGGAATAGCGAGAGTTGGTGTGATTTGGTGTTTGTACCAACTGGTTGTGGCGTTAATTATGTCGAGTGGTAAAAGAGTAAATAATAGTTGTGTAATGGTGGTGACTGACTGGACGAGGATGGTGTTCTGTTGAGTGTAACGAGAGTTGGTGTGATTTGGTGTTTGTACCAACTGGTTGTGGCGTAAATTGCGTCGAGTGATAAAAGAGTAA ] [-] EMBL CD128906 [ GGTGTGATTTGGTGTTTGTACCAACTGGTTGTGGCGTAAATTGCGTCGAGTGATAAAAGAGTAAATAATAGTTGTGTAACGGTGGTGACTGATTGGCCGAGGACGGTGTTCTGTTGAGTGTAACGAGAGTTGGTGTGATTTGGTGTTTGTACCAACTGGTTGTGGCGTTAATTGTGTCGAGTGATAAAAGAGTAAATAATAGTTGTGTAATGGTGGTGACTGACTGGACGAGGATGGTGCTGTGTTGAGTGTAACGTAAATAATAGTTGTGTAATGGTGGTGACTGACTGGACGAGGATGGTGCTGTGTTGAGTGTAACGAGAGTTGGTGTGATTTGGTGTTTGTACCAACTGGTTGTGGCGTAAATTGCGTCGAGTGATAAAAGAGTTTGTTGGTGATATTGATGACGATAGAGTGGTGATGGGTGACGAATGAAGTATGCGGTGAGCTCAAGAG] consensusID : consensus_10399#3 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 4 consensus length = 562 fasta sequence [CCACGAGACGACGAACTTTACAGAACCCAGCAAGCTAATCTCTAATGCACAGATCAAAACTTTGAAGTTCTGATTATTTTCCGTTCGAAGAGGTTTAAGTAAATATAACAGTAGTTTTATTGAGACTTATCTATGTGCATCTTGAAATTAATGTGTTATGGGTAGTGAACATCACTCAGTTATATAGGTAGGATTAAACTATACTGCCGAGCCAATCAGAAGCTTTCGCTGGTTTTCAAGTTCACGGCGCTAAGTTCGGTACCTGATGCTTACGTACGGTCGGTTTACAGAGGTTTTTAGGGAAGGCGTGATAATTTAGCGTCTACAATAGAAGTGATCATAAGATTCTGGCGCGAAATTCAATTATCCATTTGGATAGATAGAGTTTTGGCATTATAGCTGATGTCAGTTCGTGATGAAAACCCTAAGTATAATTCCTAGCCTTAATCATGAACTGTAAATCATAATTTGAATTCTTCACACAGGTTTATAAACCTCATTTGGTCTTAGTTATTATGTTGACACTCTCAGAGTCACTCTAGCGTCGCTCAAAGGTTGTCCA] [+] EMBL CD093708 [CCACGAGACGACGAACTTTACAGAACCCAGCAAGCTAATCTCTAATGCACAGATCAAAACTTTGAAGTTCTGATTATTTTCCGTTCGAAGAGGTTTAAGTAAATATAACAGTAGTTTTATTGAGACTTATCTATGTGCATCTTGAAATTAATGTGTTATGGGTAGTGAACATCACTCAGTTATATAGGTAGGATTAAACTATACTGCCGAGCCAATCAGAAGCTTTCGCTGGTTTTCAAGTTCACGGCGCTAAGTTCGGTACCTGATGCTTACGTACGGTCGGTTTACAGAGGTTTTTAGGGAAGGCGTGATAATTTAGCGTCTACAATAGAAGTGATCATAAGATTCTGGCGCGAAATTCAATTATCCATTTGGATAGATAGAGTTTTGGCATTATAGCTGATGTCAGTTCGTGATGAAAACCCTAAGTATAATTCCTAGCCTTAATCATGAACTGTAAATCATAATTTGAATTCTTCACACAGGTTTATAAACCTCATTTGGTCTTAGTTATTATGTTGACACTCTCAGAGTCACTCTAGCGTCGCTCAAAGGTTGTCCA] [+] EMBL CD093716 [CCACGAGACGACGAACTTTACAGAACCCAGCAAGCTAATCTCTAATGCACAGATCAAAACTTTGAAGTTCTGATTATTTTCCGTTCGAAGAGGTTTAAGTAAATATAACAGTAGTTTTATTGAGACTTATCTATGTGCATCTTGAAATTAATGTGTTATGGGTAGTGAACATCACTCAGTTATATAGGTAGGATTAAACTATACTGCCGAGCCAATCAGAAGCTTTCGCTGGTTTTCAAGTTCACGGCGCTAAGTTCGGTACCTGATGCTTACGTACGGTCGGTTTACAGAGGTTTTTAGGGAAGGCGTGATAATTTAGCGTCTACAATAGAAGTGATCATAAGATTCTGGCGCGAAATTCAATTATCCATTTGGATAGATAGAGTTTTGGCATTATAGCTGATGTCAGTTCGTGATGAAAACCCTAAGTATAATTCCTAGCCTTAATCATGAACTGTAAATCATAATTTGAATTCTTCACACAGGTTTATAAACCTCATTTGGTCTTAGTTATTATGTTGACACTCTCAGAGTCACTCTAGCGTCGCTCAAAGGTTGTCCA] [+] EMBL CD093633 [ctACGAGACGACGAACTTTACAGAACCCAGCAAGCTAATCTCTAATGCACAGATCAAAACTTTGAAGTTCTGATTATTTTCCGTTCGAAGAGGTTTAAGTAAATATAACAGTAGTTTTATTGAGACTTATCTATGTGCATCTTGAAATTAATGTGTTATGGGTAGTGAACATCACTCAGTTATATAGGTAGGATTAAACTATACTGCCGAGCCAATCAGAAGCTTTCGCTGGTTTTCAAGTTCACGGCGCTAAGTTCGGTACCTGATGCTTACGTACGGTCGGTTTACAGAGGTTTTTAGGGAAGGCGTGATAATTTAGCGTCTACAATANAAGTGATCATAAGATTCTGGCGCGAAATTCAATTATCCATTTGGATAGATAGAGTTTTGGCATTATAGCTGATGTCANTTCGTGATGAAAACCCTAAGTATAATTCCTAACCTTAATCATGAACTGTAAATCATAATTTGAATTCTTCACACAGGTTTATAAACC ] [+] EMBL CD093679 [ tgCAGAACCCAGCAAGCTAATCTCTAATGCACAGATCAAAACTTTGAAGTTCTGATTATTTTCCGTTCGAAGAGGTTTAAGTAAATATAACAGTAGTTTTATTGAGACTTACCTATGTGCATCTTGAAATTAATGTGTTATGGGTAGTGAACATCACTCAGTTATATAGGTAGGATTAAACTATACTGCCGAGCCAATCAGAAGCTTTCGCTGGTTTTCAAGTTCACGGCGCTAAGTTCGGTACCTGATGCTTACGTACGGTCGGTTTACAGAGGTTTTTAGGGAAGGCGTGATAATTTAGCGTCTACAATAGAAGTGATCATAAGATTCTGGCGCGAAATTCAATTATCCATTTGGATAGATAGAGTTTTGGCATTATAGCTGATGTCAGTTCGTGATGAAAACCCTAAGTATAATTCCTAGCCTTAATCATGAACTGTAAATCATAATTTGAATTCTTCACACAGGTTTATAAACCTCATTTGGTCTTAGTTATTATGTTGACACTCTCAGAGTCACTCTAGCGTCGCTCAAAGGTTGTCC ] consensusID : consensus_10399#4 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 1 consensus length = 471 fasta sequence [GTTTAAATCGGAATAGCGTAAATAATAGTTGTGTAACGGTGGTGACTGATTGGCCGAGGACGGTGTTCTGTTGAGTGTAACGAGAGTTGGTGTGATTTGGTGTTTGTACCAACTGGTTGCGGCGTAAATTGTGTCGAGTGATAAAAGAGTAAATAATAGTTGTGTAACGGTGGTGACTGATTGGCCGAGGACGGTGTTCTGTTGAGTGTAACGTTTGTTGGTGATATTGATGACGATAGAGTGGTGATGGGTGACGGTTGAAGTATGCGGTGATGGTGATAATTTATAAGCGATGTGTTTAAATCGGAATAGCGTAAATAATAGTTGTGTAACGGTGGTGACTGATTGGCCGAGGACGGTGTTCTGTTGAGTGTAACGTAAATAATAGTTGTGTAATGGTGGTGACTGACTGGACGAGGATGGTGCTGTGTTGAGTGTAACGAGAGTTGGTGTGATTTGGTGTTTGTACCA] [-] EMBL CD168666 [GTTTAAATCGGAATAGCGTAAATAATAGTTGTGTAACGGTGGTGACTGATTGGCCGAGGACGGTGTTCTGTTGAGTGTAACGAGAGTTGGTGTGATTTGGTGTTTGTACCAACTGGTTGCGGCGTAAATTGTGTCGAGTGATAAAAGAGTAAATAATAGTTGTGTAACGGTGGTGACTGATTGGCCGAGGACGGTGTTCTGTTGAGTGTAACGTTTGTTGGTGATATTGATGACGATAGAGTGGTGATGGGTGACGGTTGAAGTATGCGGTGATGGTGATAATTTATAAGCGATGTGTTTAAATCGGAATAGCGTAAATAATAGTTGTGTAACGGTGGTGACTGATTGGCCGAGGACGGTGTTCTGTTGAGTGTAACGTAAATAATAGTTGTGTAATGGTGGTGACTGACTGGACGAGGATGGTGCTGTGTTGAGTGTAACGAGAGTTGGTGTGATTTGGTGTTTGTACCA] consensusID : consensus_10399#5 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 1 consensus length = 424 fasta sequence [GGTGTGATTTGGTGTTTGTACCAACTGGTTGTGGCGTAAATTGCGTCGAGTGATAAAAGAGTTTGTTGTTGCTATCTGGGGACGACCGATCGGTGATGGGTGACGCTTCAGACTCTGCGATGATGATGATAACTTCATAATGACGATGTGATTTGGACTCGGAATTACGCATAGATTCACACTCTGTCAAACCGGTGCTGGGTGATTGGACGCGGACCGTATTTCATCGATTAGAACGAGAGTTGGTGTGATTTGGTGTTTGTACCAACTGGTTGTGGCGTAAATTGTGTCGAGTGATAAAAGAGTTTGTTGGTGATATTGATGACGATAGAGTGGTGATGGGTGACGAGTGAAGTATGCGGTGATGGTGATAATTTATAAGCGATGTGTTTGAATCGGAATAGCGTAAATAATAGTTGTGTAA] [-] EMBL CD159726 [GGTGTGATTTGGTGTTTGTACCAACTGGTTGTGGCGTAAATTGCGTCGAGTGATAAAAGAGTTTGTTGTTGCTATCTGGGGACGACCGATCGGTGATGGGTGACGCTTCAGACTCTGCGATGATGATGATAACTTCATAATGACGATGTGATTTGGACTCGGAATTACGCATAGATTCACACTCTGTCAAACCGGTGCTGGGTGATTGGACGCGGACCGTATTTCATCGATTAGAACGAGAGTTGGTGTGATTTGGTGTTTGTACCAACTGGTTGTGGCGTAAATTGTGTCGAGTGATAAAAGAGTTTGTTGGTGATATTGATGACGATAGAGTGGTGATGGGTGACGAGTGAAGTATGCGGTGATGGTGATAATTTATAAGCGATGTGTTTGAATCGGAATAGCGTAAATAATAGTTGTGTAA] consensusID : consensus_10399#6 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 1 consensus length = 407 fasta sequence [GTAATAAAAGAGAGAGTTGGTGTGATNTGGTGTTTGTACGAGCTGGTTGTGGCGCTAATTATGTCGAGTAATAAAAGAGAGAGTTGGTGTGATTTGGTGTTTGTACGAACTGGTTGTGGCGCTAATTATGTCGAGTAATAAAAGAGTAAATAATAGTTGTGTAACGGTGGTGACTGATTGGACGAGGATGGTGTTCTGTTGAGTGTTACGAGAGTTGGTGTGATTTGGTGTTTGTACGAACTGGTTGTGGCGCTAATTATGTCGAGTAATAAAAGAGTAAATAATAGTTGTGTAACGGTGGTGACTGATTGGACGAGGATGGTGTTCTGTTGAGTGTTACGTAAATAATAGTTGTGTAACGGTGGTGACTGATTGGACGAGGATGGTGTTCTGTTGAGTGTTACGTT] [-] EMBL CD137189 [GTAATAAAAGAGAGAGTTGGTGTGATNTGGTGTTTGTACGAGCTGGTTGTGGCGCTAATTATGTCGAGTAATAAAAGAGAGAGTTGGTGTGATTTGGTGTTTGTACGAACTGGTTGTGGCGCTAATTATGTCGAGTAATAAAAGAGTAAATAATAGTTGTGTAACGGTGGTGACTGATTGGACGAGGATGGTGTTCTGTTGAGTGTTACGAGAGTTGGTGTGATTTGGTGTTTGTACGAACTGGTTGTGGCGCTAATTATGTCGAGTAATAAAAGAGTAAATAATAGTTGTGTAACGGTGGTGACTGATTGGACGAGGATGGTGTTCTGTTGAGTGTTACGTAAATAATAGTTGTGTAACGGTGGTGACTGATTGGACGAGGATGGTGTTCTGTTGAGTGTTACGTT] consensusID : consensus_10399#7 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 1 consensus length = 335 fasta sequence [GGTGTTCTGTTGAGTGTAACGAGAGTTGGTGTGATCTGGTGTTTGTACGACCTGGTTGTGGCGCTAATTATGTCGAGTAATAAAAGAGTAAATAATAGTTGTGTAGCGGTGGTGTCTGATTGGACGAGGATGGTGTTCTGTTGAGTGTTACGAGAGTTGGTGATATTGATGGCGATAGAGTGGTGATGGGTGACGATTGAAGTTTGCGGTGATGGCGATAATTTATAAGCGATGTGTTTGAATCGGAATAGCGTAAATAATAGTTGTGTAACGGTGGTGACTGATTGGACGAGGATGGTGTTCTGTTGAGTGTTACGTAAATAATAGTTGTGTAA] [-] EMBL CD143219 [GGTGTTCTGTTGAGTGTAACGAGAGTTGGTGTGATCTGGTGTTTGTACGACCTGGTTGTGGCGCTAATTATGTCGAGTAATAAAAGAGTAAATAATAGTTGTGTAGCGGTGGTGTCTGATTGGACGAGGATGGTGTTCTGTTGAGTGTTACGAGAGTTGGTGATATTGATGGCGATAGAGTGGTGATGGGTGACGATTGAAGTTTGCGGTGATGGCGATAATTTATAAGCGATGTGTTTGAATCGGAATAGCGTAAATAATAGTTGTGTAACGGTGGTGACTGATTGGACGAGGATGGTGTTCTGTTGAGTGTTACGTAAATAATAGTTGTGTAA] consensusID : consensus_10399#8 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 1 consensus length = 272 fasta sequence [TGAATTATGCGGTGATGGTGATAATTTATAAGCGATGTGTTTGAATCGGAATAGCGTAAATAATAGTTGTGTAACGGTGGTGACTGATTGGACAAGGACGGTGTTCTGTTGAGTGTTACGAGAGTTGGTGTGATTTGGTGTTTGTACCAACTGGTTGTGGCGTTAATTGTGTCGAGTGATAAAAGAGAGAGTTGGTGTGATTTGGTGTTTGTACCAACTGGTTGTGGCGTTAATTGTGTCGAGTGATAAAAGAGTAAATAATAGTTGTGTAA] [-] EMBL CD159892 [TGAATTATGCGGTGATGGTGATAATTTATAAGCGATGTGTTTGAATCGGAATAGCGTAAATAATAGTTGTGTAACGGTGGTGACTGATTGGACAAGGACGGTGTTCTGTTGAGTGTTACGAGAGTTGGTGTGATTTGGTGTTTGTACCAACTGGTTGTGGCGTTAATTGTGTCGAGTGATAAAAGAGAGAGTTGGTGTGATTTGGTGTTTGTACCAACTGGTTGTGGCGTTAATTGTGTCGAGTGATAAAAGAGTAAATAATAGTTGTGTAA] consensus multiple alignement with clustalw CLUSTAL W (1.82) multiple sequence alignment consensus_10399#0 CGACTGCTATAACTATAGCTTTAAGTTTTCAGCATTATTTTTGGAAAGCCTCAGGTCGTA 60 consensus_10399#8 ------------------------------------------------------------ consensus_10399#1 ------------------------------------------------------------ consensus_10399#6 ------------------------------------------------------------ consensus_10399#4 ------------------------------------------------------------ consensus_10399#7 ------------------------------------------------------------ consensus_10399#2 ------------------------------------------------------------ consensus_10399#5 ------------------------------------------------------------ consensus_10399#3 ------------------------------------------------------------ consensus_10399#0 CCTCAGGGTGCTGTTGCAGTTGACGATGATTTGTGTGGTCAAATAGGCTTAAATATAATG 120 consensus_10399#8 ------------------------------------------------------------ consensus_10399#1 ------------------------------------------------------------ consensus_10399#6 ------------------------------------------------------------ consensus_10399#4 ------------------------------------------------------------ consensus_10399#7 ------------------------------------------------------------ consensus_10399#2 ------------------------------------------------------------ consensus_10399#5 ------------------------------------------------------------ consensus_10399#3 ------------------------------------------------------------ consensus_10399#0 CGAGAAAACAAAGGGAATGCTGTTGATGCGATGGTATCTGATTGGACAAGGACGGTGTTC 180 consensus_10399#8 ------------------------------------------------------------ consensus_10399#1 ------------------------------------------------------------ consensus_10399#6 ------------------------------------------------------------ consensus_10399#4 ------------------------------------------------------------ consensus_10399#7 ------------------------------------------------------------ consensus_10399#2 ------------------------------------------------------------ consensus_10399#5 ------------------------------------------------------------ consensus_10399#3 ------------------------------------------------------------ consensus_10399#0 TGTTGAGTGTTACGTAAATAATAGTTGTGTAACGGTGGTGACTGATTGGACAGGACGGTG 240 consensus_10399#8 ------------------------------------------------------------ consensus_10399#1 ------------------------------------------------------------ consensus_10399#6 ------------------------------------------------------------ consensus_10399#4 ------------------------------------------------------------ consensus_10399#7 ------------------------------------------------------------ consensus_10399#2 ------------------------------------------------------------ consensus_10399#5 ------------------------------------------------------------ consensus_10399#3 ------------------------------------------------------------ consensus_10399#0 TTCTGTTGAGTGTAACGAGAGTTGGTGTGATTTGGTGTTTGTACCAACTGGTTGTGGCGT 300 consensus_10399#8 ------------------------------------------------------------ consensus_10399#1 ------------------------------------------------------------ consensus_10399#6 ------------------------------------------------------------ consensus_10399#4 ------------------------------------------------------------ consensus_10399#7 ------------------------------------------------------------ consensus_10399#2 ------------------------------------------------------------ consensus_10399#5 ------------------------------------------------------------ consensus_10399#3 ------------------------------------------------------------ consensus_10399#0 TAATTGTGTCGAGTGATAAGAGAGTTTGTTGGTGATATTGATGGCGATAGAGTGGTGATG 360 consensus_10399#8 ------------------------------------------------------------ consensus_10399#1 -----------------TGGTGACTGATTGGACGAGGATGGTGTTCTGTTGAGTGTTACG 43 consensus_10399#6 ------------------------------------------------GTAATAAAAGAG 12 consensus_10399#4 ------------------------------------------------------------ consensus_10399#7 ------------------------------------------------------------ consensus_10399#2 ------------------------------------------------------GGTTGT 6 consensus_10399#5 ------------------------------------------------------------ consensus_10399#3 ---------------------------------CCACGAGACGACGAACTTTACAGAACC 27 consensus_10399#0 GGTGACGGTTGAAGTATGCGGTGATGGTGATAATTTATAA---GCGATGTGTTTGAATCG 417 consensus_10399#8 ---------TGAATTATGCGGTGATGGTGATAATTTATAA---GCGATGTGTTTGAATCG 48 consensus_10399#1 AGAGTTGGTGTGATTTGGTGTTTGTACGAACTGGTTGTGGCGCTAATTATG-TCGAGTAA 102 consensus_10399#6 AGAGTTGGTGTGATNTGGTGTTTGTACGAGCTGGTTGTGGCGCTAATTATG-TCGAGTAA 71 consensus_10399#4 -------------------------------------------------GT-TTAAATCG 10 consensus_10399#7 ------------------------------------------------------------ consensus_10399#2 GGCGTTAATTGTGTCGAGTGATAAAAGAGTTAGTTGGTGATATTGATGGCGATAGAGTGG 66 consensus_10399#5 ------GGTGTGATTTGGTGTTTGTACCAACTGGTTGTGGCGTAAATTGCG-TCGAGTGA 53 consensus_10399#3 CAGCAAGCTAATCTCTAATGCACAGATCAAAACTTTGAAGTTCTGATTATTTTCCGTTCG 87 consensus_10399#0 GAATAGCGTAAATAATAGTTGTGTAACGGTGGTGACTGATTGGACGAGGATGGTGTTCTG 477 consensus_10399#8 GAATAGCGTAAATAATAGTTGTGTAACGGTGGTGACTGATTGGACAAGGACGGTGTTCTG 108 consensus_10399#1 TAAAAGAGTAAATAATAGTTGTGTAACGGTGGTGACTGATTGGACGAGGATGGTGTTCTG 162 consensus_10399#6 TAAAAGAG---------------------------------------------------- 79 consensus_10399#4 GAATAGCGTAAATAATAGTTGTGTAACGGTGGTGACTGATTGGCCGAGGACGGTGTTCTG 70 consensus_10399#7 ---------------------------------------------------GGTGTTCTG 9 consensus_10399#2 TGATGGGTGACGGTTGAAGTATGCGGTGATGGTGATAATTTA--TAAGCGATGTGTTTGA 124 consensus_10399#5 TAAAAGAGTTTGTTGTTGCTATCT---GGGGACGACCGATCGGTGATGGGTGACGCTTCA 110 consensus_10399#3 AAGAGGTTTAAGTAAATATAACAGTAGTTTTATTGAGACTTATCTATGTGCATCTTGAAA 147 consensus_10399#0 TTGA-GTGTAACGAG-AGTTGGTGTGATTTGGT---GTTTGTACCAACTGGTTGTGGCGT 532 consensus_10399#8 TTGA-GTGTTACGAG-AGTTGGTGTGATTTGGT---GTTTGTACCAACTGGTTGTGGCGT 163 consensus_10399#1 TTGA-GTGTTACGAG-AGTTGGTGTGATTTGGT---GTTTGTACGAACTGGTTGTGGCGC 217 consensus_10399#6 -------------AG-AGTTGGTGTGATTTGGT---GTTTGTACGAACTGGTTGTGGCGC 122 consensus_10399#4 TTGA-GTGTAACGAG-AGTTGGTGTGATTTGGT---GTTTGTACCAACTGGTTGCGGCGT 125 consensus_10399#7 TTGA-GTGTAACGAG-AGTTGGTGTGATCTGGT---GTTTGTACGACCTGGTTGTGGCGC 64 consensus_10399#2 ATCG-GAATAGCGAG-AGTTGGTGTGATTTGGT---GTTTGTACCAACTGGTTGTGGCGT 179 consensus_10399#5 GACT-CTGCGATGAT-GATGATAACTTCATAAT---GACGATGTGATTTGGACTCGGAAT 165 consensus_10399#3 TTAATGTGTTATGGGTAGTGAACATCACTCAGTTATATAGGTAGGATTAAACTATACTGC 207 * * * * consensus_10399#0 AAATTGTGTCGAG---TGATAAAAGAGTAAATAATAGTTGTGTAACGGTGGTGACTGATT 589 consensus_10399#8 TAATTGTGTCGAG---TGATAAAAGAG--------------------------------- 187 consensus_10399#1 TAATTATGTCGAG---TAATAAAAGAGTAAATAATAGTTGTGTAACGGTGGTGACTGATT 274 consensus_10399#6 TAATTATGTCGAG---TAATAAAAGAGTAAATAATAGTTGTGTAACGGTGGTGACTGATT 179 consensus_10399#4 AAATTGTGTCGAG---TGATAAAAGAGTAAATAATAGTTGTGTAACGGTGGTGACTGATT 182 consensus_10399#7 TAATTATGTCGAG---TAATAAAAGAGTAAATAATAGTTGTGTAGCGGTGGTGTCTGATT 121 consensus_10399#2 TAATTATGTCGAG---TGGTAAAAGAGTAAATAATAGTTGTGTAATGGTGGTGACTGACT 236 consensus_10399#5 TA--CGCATAGAT---TCACACTCTGTCAAAC-------------CGGTGCTGGGTGATT 207 consensus_10399#3 CGAGCCAATCAGAAGCTTTCGCTGGTTTTCAAGTTCACGGCGCTAAGTTCGGTACCTGAT 267 * * consensus_10399#0 GGACGAGGATGGTGTTCTGTTGAGTGTAACGAGAGTTGGTGTGATT-------------- 635 consensus_10399#8 -------------------------------AGAGTTGGTGTGATT-------------- 202 consensus_10399#1 GGACGAGGATGGTGTTCTGTTGAGTGTTACGAGAGTTGGTGTGATT-------------- 320 consensus_10399#6 GGACGAGGATGGTGTTCTGTTGAGTGTTACGAGAGTTGGTGTGATT-------------- 225 consensus_10399#4 GGCCGAGGACGGTGTTCTGTTGAGTGTAACGTTTGTTGGTGATATTGATGACGATAGAGT 242 consensus_10399#7 GGACGAGGATGGTGTTCTGTTGAGTGTTACGAGAGTTGGTGATATTGATGGCGATAGAGT 181 consensus_10399#2 GGACGAGGATGGTGTTCTGTTGAGTGTAACGAGAGTTGGTGTGATT-------------- 282 consensus_10399#5 GGACGCGGACCGTATTTCATCGATTAGAACGAGAGTTGGTGTGATT-------------- 253 consensus_10399#3 GCTTACGTACGGTCGGTTTACAGAGGTTTTTAGGGAAGGCGTGATAATTTAGCGTC---- 323 * ** * ** consensus_10399#0 ---------TGGTGTTTGT-ACCAACTGGTTGTGGCGTTAATT--------GTGT---CG 674 consensus_10399#8 ---------TGGTGTTTGT-ACCAACTGGTTGTGGCGTTAATT--------GTGT---CG 241 consensus_10399#1 ---------TGGTGTTTGT-ACGAACTGGTTGTGGCGCTAATT--------ATGT---CG 359 consensus_10399#6 ---------TGGTGTTTGT-ACGAACTGGTTGTGGCGCTAATT--------ATGT---CG 264 consensus_10399#4 GGTGATGGGTGACGGTTGA-AGTATGCGGTGATGGTGATAATTTATAAGCGATGTGTTTA 301 consensus_10399#7 GGTGATGGGTGACGATTGA-AGTTTGCGGTGATGGCGATAATTTATAAGCGATGTGTTTG 240 consensus_10399#2 ---------TGGTGTTTGT-ACCAACTGGTTGTGGCGTAAATT--------GCGT---CG 321 consensus_10399#5 ---------TGGTGTTTGT-ACCAACTGGTTGTGGCGTAAATT--------GTGT---CG 292 consensus_10399#3 -------TACAATAGAAGTGATCATAAGATTCTGGCGCGAAATTCAATTATCCATTT-GG 375 * * * * *** * ** * * consensus_10399#0 AGTGATAAAAGAGTAA-ATAATAGTTGTGTAACGGTGGTGACTGATTGNNACAGGACGGT 733 consensus_10399#8 AGTGATAAAAGAGTAA-ATAATAGTTGTGTAA---------------------------- 272 consensus_10399#1 AGTAATAAAAGAGTAA-ATAATAGTTGTGTAACGGTGGTGACTGATTGGACGAGGATGGT 418 consensus_10399#6 AGTAATAAAAGAGTAA-ATAATAGTTGTGTAACGGTGGTGACTGATTGGACGAGGATGGT 323 consensus_10399#4 AATCGGAATAGCGTAA-ATAATAGTTGTGTAACGGTGGTGACTGATTGGCCGAGGACGGT 360 consensus_10399#7 AATCGGAATAGCGTAA-ATAATAGTTGTGTAACGGTGGTGACTGATTGGACGAGGATGGT 299 consensus_10399#2 AGTGATAAAAGAGTAA-ATAATAGTTGTGTAATGGTGGTGACTGACTGGACGAGGATGGT 380 consensus_10399#5 AGTGATAAAAGAGT----TTGTTGGTG-ATATTGATGACGATAGAGTGGTGATGGGTGAC 347 consensus_10399#3 ATAGATAGAGTTTTGGCATTATAGCTGATGTCAGTTCGTGATGAAAACCCTAAGTATAAT 435 * * * * * * ** consensus_10399#0 GTTCTGTTGAGTGTTACGAGAGTTGGTGTGATTTG------------------------- 768 consensus_10399#8 ------------------------------------------------------------ consensus_10399#1 GTTCTGTTGAGTGTTACGAGAGTTGGTGTGATTTGGTGTTTGTACGAACTGGTTGTGGCG 478 consensus_10399#6 GTTCTGTTGAGTGTTACG------------------------------------------ 341 consensus_10399#4 GTTCTGTTGAGTGTAACG------------------------------------------ 378 consensus_10399#7 GTTCTGTTGAGTGTTACG------------------------------------------ 317 consensus_10399#2 GCTGTGTTGAGTGTAACG------------------------------------------ 398 consensus_10399#5 GA-GTGAAGTATGCGGTGATGGTGATAATTTATAAGCG---------------------- 384 consensus_10399#3 TCCTAGCCTTAATCATGAACTGTAAATCATAATTTGAATT-------------------- 475 consensus_10399#0 ------------------------------------------------------------ consensus_10399#8 ------------------------------------------------------------ consensus_10399#1 CTAATTATGTCGAGTAATANAAGAGTAAATAATAGTTGTGTAACGGTGGTGACTGATTGN 538 consensus_10399#6 -------------------------TAAATAATAGTTGTGTAACGGTGGTGACTGATTGG 376 consensus_10399#4 -------------------------TAAATAATAGTTGTGTAATGGTGGTGACTGACTGG 413 consensus_10399#7 -------------------------TAAATAATAGTTGTGTAA----------------- 335 consensus_10399#2 -------------------------TAAATAATAGTTGTGTAATGGTGGTGACTGACTGG 433 consensus_10399#5 ---ATGTGTTTGAATCGGAATAGCGTAAATAATAGTTGTGTAA----------------- 424 consensus_10399#3 --------------CTTCACACAGGTTTATAAACCTCATTTGGTCTTAGTTATTATGTTG 521 consensus_10399#0 ------------------------------------------------------------ consensus_10399#8 ------------------------------------------------------------ consensus_10399#1 ACGAGGATGGTGTTCTGTTGAGTGTTACGAGAGTTGNTGTGATTTGGTGTTTGTACGAAC 598 consensus_10399#6 ACGAGGATGGTGTTCTGTTGAGTGTTACGTT----------------------------- 407 consensus_10399#4 ACGAGGATGGTGCTGTGTTGAGTGTAACGAGAGTTGGTGTGATTTGGTGTTTGTACCA-- 471 consensus_10399#7 ------------------------------------------------------------ consensus_10399#2 ACGAGGATGGTGCTGTGTTGAGTGTAACGAGAGTTGGTGTGATTTGGTGTTTGTACCAAC 493 consensus_10399#5 ------------------------------------------------------------ consensus_10399#3 ACACTCTCAGAGTCACTCTAGCGTCGCTCAAAGGTTGTCCA------------------- 562 consensus_10399#0 ------------------------------------------------------------ consensus_10399#8 ------------------------------------------------------------ consensus_10399#1 TGGTTGTGGCGCTA-TTATGTCGAGTAATAAAAGAGTAAATATAGTTC------------ 645 consensus_10399#6 ------------------------------------------------------------ consensus_10399#4 ------------------------------------------------------------ consensus_10399#7 ------------------------------------------------------------ consensus_10399#2 TGGTTGTGGCGTAAATTGCGTCGAGTGATAAAAGAGTTTGTTGGTGATATTGATGACGAT 553 consensus_10399#5 ------------------------------------------------------------ consensus_10399#3 ------------------------------------------------------------ consensus_10399#0 --------------------------------------------- consensus_10399#8 --------------------------------------------- consensus_10399#1 --------------------------------------------- consensus_10399#6 --------------------------------------------- consensus_10399#4 --------------------------------------------- consensus_10399#7 --------------------------------------------- consensus_10399#2 AGAGTGGTGATGGGTGACGAATGAAGTATGCGGTGAGCTCAAGAG 598 consensus_10399#5 --------------------------------------------- consensus_10399#3 --------------------------------------------- |
Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) | ||||