Home
Who am I
Technology
EST Assembly
Contact

These datas are free for academic use only, please contact me for any other use.

Schistosoma mansoni
cluster # 1040 cluster # 1040       Sequences # 2       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_1040#0 length = 418 sequences # 2  

consensusID : consensus_1040#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 2
consensus length = 418
fasta sequence
                              [TAGTTACGGCTCTGGTTGATATTAATCAAAACCTATCACAGTTGCACA-GATTCATGTCCCTAAATCGTAAATACAGTGTGATTGGATATCTTTGATTCAATTTA-ATGTATTCATTTTCTATTAGATAATTATCTTAAAATTTGCAGGTCACTTGTTTGAACCGTATTTCAATTACTAAAGCTTAAGCCATTGATT-AATATTTATAACTTCATAGAAAGTGTGACCTGTACCTTAACGCGCGAACTTGTGTGCATTTTCTGTACAATATAAGGGACTTACCCTCTCAGTTTTACGTACAGACATACATGTTGTCTTTCAAGAAAAACAATGGGATATTTTCATGATTTGAAGAGCAGACCGAGTAACGTAATGTGCCCGATTTAAACCAGTTATTGGTCCCACGTAAGACTTCATCACT]

[+] EMBL CD159597             [TAGTTACGGCTCTGGTTGATATTAATCAAAACCTATCACAGTTGCACA GATTCATGTCCCTAAATCGTAAATACAGTGTGATTGGATATCTTTGATTCAATTTA ATGTATTCATTTTCTATTAGATAATTATCTTAAAATTTGCAGGTCACTTGTTTGAACCGTATTTCAATTACTAAAGCTTAAGCCATTGATT AATATTTATAACTTCATAGAAAGTGTGACCTGTACCTTAACGCGCGAACTTGTGTGCATTTTCTGTACAATATAAGGGACTTACCCTCTCAGTTTTACGTACAGACATACATGTTGTCTTTCAAGAAAAACAATGGGATATTTTCATGATTTGAAGAGCAGACCGAGTAACGTAATGTGCCCGATTTAAACCAGTTATTGGTCCCACGTAAGACTTCATCACT]
[+] EMBL CD159546             [TAGTTACGGCTCTGGTTGATATTAATCAAAACCTATCACAGTTGCACATGATTCATGTCCCTAAATCGTAAATACAGTGTGATTGGATATCTTTGATTCAATTTAGATGTATTCATTTTCTATTAGATAATTATCTTAAAATTTGCAGGTCACTTGTTTGAACCGTATTTCAATTACTAAAGCTTAAGCCATTGATTAAATA TCATAACTTCATAGAAAGTGTGACCTGTACCTTAACGCGCGAACTTGTGTGCATTTTCTGTACAATATAAGAGACTTACCCTCTCAGTTTTACGTACAGACATACATGTTGTCTTTCAAGAAAAACAATGGGATATTTTCATGATTTGAAGAGCAGACAGAGTAACGTAATGTGCACGATTTAAACCAG                             ]


>consensus_1040#0 TAGTTACGGCTCTGGTTGATATTAATCAAAACCTATCACAGTTGCACAGATTCATGTCCC TAAATCGTAAATACAGTGTGATTGGATATCTTTGATTCAATTTAATGTATTCATTTTCTA TTAGATAATTATCTTAAAATTTGCAGGTCACTTGTTTGAACCGTATTTCAATTACTAAAG CTTAAGCCATTGATTAATATTTATAACTTCATAGAAAGTGTGACCTGTACCTTAACGCGC GAACTTGTGTGCATTTTCTGTACAATATAAGGGACTTACCCTCTCAGTTTTACGTACAGA CATACATGTTGTCTTTCAAGAAAAACAATGGGATATTTTCATGATTTGAAGAGCAGACCG AGTAACGTAATGTGCCCGATTTAAACCAGTTATTGGTCCCACGTAAGACTTCATCACT



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)