cluster # 10409

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Schistosoma mansoni
cluster # 10409 cluster # 10409 Sequences # 16 consensus # 2

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consensus_10409#0 length = 823 sequences # 6

consensus_10409#1 length = 362 sequences # 10

consensusID : consensus_10409#0
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Sequences nbr = 6
consensus length = 823
fasta sequence

                              [ATGTGATAATCGACGTGATTTGTTATGCAATGAAGGATTTCAATGGAATCGAGAAAAAGGCTGTATAGATATTGATGAATGTAATCCATCATTTGGTTCAAGTCCATGTCAGTATAATTGTGTAGATACATATGGTGCTTATCGTTGTGAATGTCCAATAGGCTATGAAATAGATCGTAAAACAAATTTATGCAGAGATATAGATGAGTGCAATTTAAGCAATCCTTGTAGATCAGATGAAGTTTGTTTAAATCTTCCAGGTAATTACACATGCGTACAACAAAGATGTCCGAAAAATTATGTTTACGATAAAAAGTCTAGATCTTGTCGAATAAGATGTATTGATTCTAAATTAAATTGTCCTTATGGTGCTATGTTCGCTGATACTGTGGAATATTTAGTTGTTAGTCTTCCATCGCCTGAATCATACCGTGTGACGGGGTCAAGGATAATGCTTCGTGTTGTTGACTGGCATCAAGTTCAACAATCGAATTGTTACTATCAACTATTAGATAAAGCACCAAATACACCAGTTCAACATCGTACAGAAGATGGAGTTGTTTATTTAACACCAAATTGGGCTAGAAATAATAATACAAATCAAACTCGTGAACGTACATTATTAAGTGCACATATTGAAGCAGCAACTAATCCAACATATCAACAAATAAAATATGATGAACCTGGTCAATTGTATTAT-TTGTTCTTC-CGTGTATCATGTTATGAAAATGATTCATCACCATCATCCGCATCATCATCCTCATTATCAACAATGGAATCTTTACAAACGACGATATCATCAGGGCATAAATCAGCGGCTATG]

[+] EMBL CD069651             [ATGTGATAATCGACGTGATTTGTTATGCAATGAAGGATTTCAATGGAATCGAGAAAAAGGCTGTATAGATATTGATGAATGTAATCCATCATTTGGTTCAAGTCCATGTCAGTATAATTGTGTAGATACATATGGTGCTTATCGTTGTGAATGTCCAATAGGCTATGAAATAGATCGTAAAACAAATTTATGCAGAGATATAGATGAGTGCAATTTAAGCAATCCTTGTAGATCAGATGAAGTTTGTTTAAATCTTCCAGGTAATTACACATGCGTACAACAAAGATGTCCGAAAAATTATGTTTACGATAAAAAGTCTAGATCTTGTCGAATAAGATGTATTGATTCTAAATTAAATTGTCCTTATGGTGCTATGTTCGCTGATACTGTGGAATATTTAGTTGTTAGTCTTCCATCGCCTGAATCATACCGTGTGACGGGGTCAAGGATAATGCTTCGTGTTGTTGACTGGCATCA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            ]
[-] EMBL CD069644             [                                                                                                                                                                                                                                                                                    ACAACAAAGATGTCCGAAAAATTATGTGTACGATAAAAAGTCTAGATCTTGTCGAATAAGATGTATTGATTCTAAATTAAATTGTCCTTATGGTGCTATGTTCGCTGATACTGTGGAATATTTAGTTGTTAGTCTTCCATCGCCTGAATCATACCGTGTGACGGGGTCAAGGATAATGCTTCGTGTTGTTGACTGGCATCAAGTTCAACAATCGAATTGTTACTATCAACTATTAGATAAAGCACCAAATACACCAGTTCAACATCGTACAGAAGATGGAGTTGTTTATTTAACACCAAATTGGGCTAGAAATAATAATACAAATCAAACTCGTGAACGTACATTATTAAGTGCACATATTGAAGCAGCAACTAATCCAACATATCAACAAATAAAATATGATGAACCTGGTCAATTGTATTAT TTGTTCTTC CGTGTATCATGTTATGAAAATGATTCA                                                                                       ]
[-] EMBL CD069654             [                                                                                                                                                                                                                                                                                         AAAGATGTCCGAAAAATTATGTTTACGATAGAAAGTCTAGATCTTGTCGAATAAGATGTATTGATTCTAAATTAAATTGTCCTTATGGTGCTATGTTCGCTGATACTGTGGAATATTTAGTTGTTAGTCTTCCATCGCCTGAATCATACCGTGTGACGGGGTCAAGGATAATGCTTCGTGTTGTTGACTGGCATCAAGTTCAACAATCGAATTGTTACTATCAACTATTAGATAAAGCACCAAATACACCAGTTCAACATCGTACAGAAGATGGAGTTGTCTATTTAACACCAAATTGGGCTAGAAATAATAATACAAATCAAACTCGTGAACGTACATTATTAAGTGCACATATTGAAGCAGCAACTAATCCAACATATCAACAAATAAAATATGATGAACCTGGTCAATTGTATTATATTGTTCTTCGCGTGTATCATGTTATGAAAATGATTCA                                                                                       ]
[-] EMBL CD069655             [                                                                                                                                                                                                                                                                                         AAAGATGTCCGAAAAATTATGTTTACGATAAAAAGTCTAGATCTTGTCGAATAAGATGTATTGATTCTAAATTAAATTGTCCTTATGGTGCTATGTTCGCTGATACTGTGGAATATTTAGTTGTTAGTCTTCCATCGCCTGAATCATACCGTGTGACGGGGTCAAGGATAATGCTTCGTGTTGTTGACTGGCATCAAGTTCAACAATCGAATTGTTACTATCAACTATTAGATAAAGCACCAAATACACCAGTTCAACATCGTACAGAAGATGGAGTTGTCTATTTAACACCAAATTGGGCTAGAAATAATAATACAAATCAAACTCGTGAACGTACATTATTAAGTGCACATATTGAAGCAGCAACTAATCCAACATATCAACAAATAAAATATGATGAACCTGGTCAATTGTATTAT TTGTTCTTC CGTGTATCATGTTATGAAAATGATTCA                                                                                       ]
[-] EMBL CD069676             [                                                                                                                                                                                                                                                                                            GATGTCCGAAAAATTATGTTTACGATAAAAAGTCTAGATCTTGTCGAATAAGATGTATTGATTCTAAATTAAATTGTCCTTATGGTGCTATGTTCGCTGATACTGTGGAATATTTAGTTGTTAGTCTTCCATCGCCTGAATCATACCGTGTGACGGGGTCAAGGATAATGCTTCGTGTTGTTGACTGGCATCAAGTTCAACAATCGAATTGTTACTATCAACTATTAGATAAAGCACCAAATACACCAGTTCAACATCGTACAGAAGATGGAGTTGTTTATTTAACACCAAATTGGGCTAGAAATAATAATACAAATCAAACTCGTGAACGTACATTATTAAGTGCACATATTGAAGCAGCAACTAATCCAACATATCAACAAATAAAATATGATGAACCTGGTCAATTGTATTAT TTGTTCTTC CGTGTATCATGTTATGAAAATGATTCA                                                                                       ]
[-] EMBL CD178819             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            TTAGATAAAGCACCAAATACACCAGTTCAACATCGTACAGAAGATGGAGTTGTTTATTTAACACCAAATTGGGCTAGAAATAATAATACAAATCAAACTCGTGAACGTACATTATTAAGTGCACATATTGAAGCAGCAACTAATCCAACATATCAACAAATAAAATATGATGAACCTGGTCAATTGTATTAT TTGTTCTTC CGTGTATCATGTTATGAAAATGATTCATCACCATCATCCGCATCATCATCCTCATTATCAACAATGGAATCTTTACAAACGACGATATCATCAGGGCATAAATCAGCGGCTATG]




>consensus_10409#0
ATGTGATAATCGACGTGATTTGTTATGCAATGAAGGATTTCAATGGAATCGAGAAAAAGG
CTGTATAGATATTGATGAATGTAATCCATCATTTGGTTCAAGTCCATGTCAGTATAATTG
TGTAGATACATATGGTGCTTATCGTTGTGAATGTCCAATAGGCTATGAAATAGATCGTAA
AACAAATTTATGCAGAGATATAGATGAGTGCAATTTAAGCAATCCTTGTAGATCAGATGA
AGTTTGTTTAAATCTTCCAGGTAATTACACATGCGTACAACAAAGATGTCCGAAAAATTA
TGTTTACGATAAAAAGTCTAGATCTTGTCGAATAAGATGTATTGATTCTAAATTAAATTG
TCCTTATGGTGCTATGTTCGCTGATACTGTGGAATATTTAGTTGTTAGTCTTCCATCGCC
TGAATCATACCGTGTGACGGGGTCAAGGATAATGCTTCGTGTTGTTGACTGGCATCAAGT
TCAACAATCGAATTGTTACTATCAACTATTAGATAAAGCACCAAATACACCAGTTCAACA
TCGTACAGAAGATGGAGTTGTTTATTTAACACCAAATTGGGCTAGAAATAATAATACAAA
TCAAACTCGTGAACGTACATTATTAAGTGCACATATTGAAGCAGCAACTAATCCAACATA
TCAACAAATAAAATATGATGAACCTGGTCAATTGTATTATTTGTTCTTCCGTGTATCATG
TTATGAAAATGATTCATCACCATCATCCGCATCATCATCCTCATTATCAACAATGGAATC
TTTACAAACGACGATATCATCAGGGCATAAATCAGCGGCTATG

consensusID : consensus_10409#1
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 10
consensus length = 362
fasta sequence

                              [AGGACGGACTCTCCCCACTCTCGGTCGTACCAAGGAATTTGAGGACTCTAAAGTATCCTAGTTTTTAACAAGTCTATAACTAAGATTAACTCATGTTGCTAACTATGAAATGTTTGTTACTCTTTATTAGTTATGTTGCCTTATGTAACTAGTTAAACGATGACCAGAAGGTTAATCTATTCCTCGTTAGTTTAAAACTTTTAAATTTAAATTAACTTTGATTTTAACTGTACTTAAAATTCATCAAAAGGATGTTTCGTTTATTACTATCATTTCACAATCTAGATCTTGTCGAATAAGATGTATTGATTCTAAATTAAATTGTCCTTATGGTGCTATGTTCGCTGATACT-GTGGAATATT]

[+] EMBL CD092616             [AGGACGGACTCTCCCCACTCTCGGTCGTACCAAGGAATTTGAGGACTCTAAAGTATCCTAGTTTTTAACAAGTCTATAACTAAGATTAACTCATGTTGCTAACTATGAAATGTTTGTTACTCTTTATTAGTTATGTTGCCTTATGTAACTAGTTAAACGATGACCAGAAGGTTAATCTATTCCTCGTTAGTTTAAAACTTTTAAATTTAAATTAACTTTGATTTTAACTGTACTTAAAATTCATCAAAAGGATGTTTCGTTTATTACTATCATTTCACAATCTAGATCTTGTCGAATAAGATGTATTGATTCTAAATTAAATTGTCCTTATGGTGCTATGTTCGCTGATACT GTGGAATATT]
[+] EMBL CD092592             [AGGACGGACTCTCCCCACTCTCGGTCGTACCAAGGAATTTGAGGACTCTAAAGTATCCTAGTTTTTAACAAGTCTATAACTAAGATTAACTCATGTTGCTAACTATGAAATGTTTGTTACTCTTTATTAGTTATGTTGCCTTATGTAACTAGTTAAACGATGACCAGAAGGTTAATCTATTCCTCGTTAGTTTAAAACTTTTAAATTTAAATTAACTTTGATTTTAACTGTACTTAAAATTCATCAAAAGGATGTTTCGTTTATTACTATCATTTCACAATCTA                                                                               ]
[+] EMBL CD092546             [AGGACGGACTCTCCCCACTCTCGGTCGTACCAAGGAATTTGAGGACTCTAAAGTATCCTAGTTTTTAACAAGTCTATAACTAAGATTAACTCATGTTGCTAACTATGAAATGTTTGTCACTCTTTATTAGTTATGTTGCCTTATGTAACTAGTTAAACGATGACCAGAAGGTTAATCTATTCCTCGTTAGTTTAAAACTTTTAAATTTAAATTAACTTTGATTTTAACTGTACTTAAAATTCATCAAAAGGATGTTTCGTTTATTACTATCATTTCACAATCTAGATCTTGTCGAATAAGATGTATTGATTCTAAATTAAATTGTCCTTATGGTGCTATGTTCGCTGATACTGGTGGAATAT ]
[+] EMBL CD092621             [AGGACGGACTCTCCCCACTCTCGGTCGTACCAAGGAATTTGAGGACTCTAAAGTATCCTAGTTTTTAACAAGTCTATAACTAAGATTAACTCATGTTGCTAACTATGAAATGTTTGTTACTCTTTATTAGTTATGTTGCCTTATGTAACTAGTTAAACGATGACCAGAAGGTTAATCTATTTCTCGGTAGTTCAAAACTTTTGAATTTAAATTAACTTT                                                                                                                                                ]
[+] EMBL CD092626             [AGGACGGACTCTCCCCACTCTCGGTCGTACCAAGGAATTTGAGGACTCTAAAGTATCCTAGTTTTTAACAAGTCTATAACTAAGATTAACTCATGTTGCTAACTATGAAATGTTTGTTACTCTTTATTAGTTATGTTGCCTTATGTAACTAGTTAAACGATGACCAGAAGGTTAATCTATTCCTCGTTAGTTT                                                                                                                                                                          ]
[+] EMBL CD092625             [AGGACGGACTCTCCCCACTCTCGGTCGTACCAAGGAATTTGAGGACTCTAAAGTATCCTAGTTTTTAACAAGTCTATAACTAAGATTAACTCATGTTGCTAACTATGAAATGTTTGTTACTCTTTATTAGTTATGTTGCCTTATGTAACTAGTTAAACGATG                                                                                                                                                                                                         ]
[+] EMBL CD092613             [AGGACGGACTCTCCCCACTCTCGGTCGTACCAAGGAATTTGAGGACTCTAAAGTATCCTAGTTTTTAACAAGTCTATAACTAAGATTAACTCATGTTGCTAACTATGAAATGTTCGTTACTCTCTATTAGTTATGTTGCCTT                                                                                                                                                                                                                             ]
[+] EMBL CD092532             [  GACGGACTCTGCCCACTCTCGGTCGTACCAAGGAATTAGAGGACTCTAAAGTATGCTAGTGTTTAACAAGTGTATAACTAAGATTAACTGATGGTGCTAACTATGAAAGGTTTGTTACTCTTTATTAGTTATGTTGCCTTATGTAACTAGGTAAACGATGACCACAAAGTTAATCTATTGCTCGTTAGTTTAAAACTTTTAAATTTAAATGAACTATGATTTTAACTGTACTTAAAATTCATCAAAAGGATGTTTAGTTTATTACTATCATTTCACAATCTAGATCTTGGCGAATAACATGTATTGATTCTAAATTAAATTGGCCTTATGGTGCTATGTTCGCTGATACT GGGGAATATT]
[+] EMBL CD092533             [  GACGGACTCTCCCCACTCTCGGTCGTACCAAGGAATTTGAGGACTCTAAAGTATCCTAGTTTTTAACAAGTCTATAACTAAGATTAACTCATGTTGCTAACTATGAAATGTTTGTTACTCTTTATTAGTTATGTTGCCTTATGTAACTAGTTAAACGATGACCAGAAGGTTAATCTATTCCTCGTTAGTTTAAAACTTTTAAATTTAAATTAACTTTGATTTTAACTGTACTTAAAATTCATCAAAAGGATGTTTCGTTTATTACTATCATTTCACAATCTAGATCTTGTCGAATAAGATGTATTGATTCTAAATTAAATTGTCCTTATGGTGCTATGTTCGCTGATACT GTGGAATATT]
[+] EMBL CD092608             [aaGACGGACTCTCCCCACTCTCGTTCGTACCAAGGAATTTGAGGACTCTAAAGTATGCTAGTTTTTAACAAGTCTATAACTAAGATTAACTCATGTTGCTAACTATGAAATGTTTGTTACTCTTTATTACTTATGTGGCCTTATGTAACTAGTTAAACGATGACCAGAATGTTAATCTATTCCTCGCTAGTTTAAAACTTTTAAATTTAAATTAACTCTGATTTTAACTGTACTTAAAATTCATCAAAAGGATGTTTCGTTTATTACTATCATTTCACAATCTAGATCTTGTCGAATAAGATGTATCGATTCTAAATTAAATTGTTCTTATGGCGCTATGATCGCTGATACT GTAGAATATT]




>consensus_10409#1
AGGACGGACTCTCCCCACTCTCGGTCGTACCAAGGAATTTGAGGACTCTAAAGTATCCTA
GTTTTTAACAAGTCTATAACTAAGATTAACTCATGTTGCTAACTATGAAATGTTTGTTAC
TCTTTATTAGTTATGTTGCCTTATGTAACTAGTTAAACGATGACCAGAAGGTTAATCTAT
TCCTCGTTAGTTTAAAACTTTTAAATTTAAATTAACTTTGATTTTAACTGTACTTAAAAT
TCATCAAAAGGATGTTTCGTTTATTACTATCATTTCACAATCTAGATCTTGTCGAATAAG
ATGTATTGATTCTAAATTAAATTGTCCTTATGGTGCTATGTTCGCTGATACTGTGGAATA
TT

consensus multiple alignement with clustalw

CLUSTAL W (1.82) multiple sequence alignment


consensus_10409#0      ATGTGATAATCGACGTGATTTGTTATGCAATGAAGGATTTCAATGGAATCGAGAAAAAGG 60
consensus_10409#1      ---------AGGACG-GACTCTCCCCACTCTCGGTCGTACCAAGGAATTTGAGGACTCTA 50
                                  **** ** *       *  *      *  *** * * * *** *     

consensus_10409#0      CTGTATAGATATTGATGAATGTAATCCATCATTTGGTTCAAGTCCATGTCAGTATAATTG 120
consensus_10409#1      AAGTATCC-TAGTTTTTAACA-AGTCTATAACTAAGATTAA-CTCATGTTGCTA--ACTA 105
                         ****   ** *  * **   * ** ** * *  * * **   *****   **  * * 

consensus_10409#0      TGTAGATACATATGGTGCTTATCGTTGTGAATGTCCAATAGGCTATGAAATAGATCGTAA 180
consensus_10409#1      TGAA---ATGTTTGTTACTCTTTATTAGTTATGT----TGCCTTATG---TAACTAGTTA 155
                       ** *   *  * ** * **  *  **    ****    *    ****   **  * ** *

consensus_10409#0      AACAAATTTATGCAGAGATATAGATGAGTGCAATTTAAGC-AATCCTTGTAGATCAGATG 239
consensus_10409#1      AACGA---TGACCAGAAGGTTAATCTATTCCTCGTTAGTTTAAAACTTTTAAAT----TT 208
                       *** *   *   ****    **    * * *   ***    **  *** ** **    * 

consensus_10409#0      AAGTTTGTTTAAATCTTCCAGGTAATTACACATGCGTACAACAAAGATGTCCGAAAAATT 299
consensus_10409#1      AAATTAACTTTGATTTTAACTGTACTTAAA-ATTCAT-CAA-AAGGATGTTTCGTTTATT 265
                       ** **   **  ** **    *** *** * ** * * *** ** *****       ***

consensus_10409#0      ATGTTTACGATAAAAAGTCTAGATCTTGTCGAATAAGATGTATTGATTCTAAATTAAATT 359
consensus_10409#1      ACTATCATTTCACAA--TCTAGATCTTGTCGAATAAGATGTATTGATTCTAAATTAAATT 323
                       *   * *    * **  *******************************************

consensus_10409#0      GTCCTTATGGTGCTATGTTCGCTGATACTGTGGAATATTTAGTTGTTAGTCTTCCATCGC 419
consensus_10409#1      GTCCTTATGGTGCTATGTTCGCTGATACTGTGGAATATT--------------------- 362
                       ***************************************                     

consensus_10409#0      CTGAATCATACCGTGTGACGGGGTCAAGGATAATGCTTCGTGTTGTTGACTGGCATCAAG 479
consensus_10409#1      ------------------------------------------------------------
                                                                                   

consensus_10409#0      TTCAACAATCGAATTGTTACTATCAACTATTAGATAAAGCACCAAATACACCAGTTCAAC 539
consensus_10409#1      ------------------------------------------------------------
                                                                                   

consensus_10409#0      ATCGTACAGAAGATGGAGTTGTTTATTTAACACCAAATTGGGCTAGAAATAATAATACAA 599
consensus_10409#1      ------------------------------------------------------------
                                                                                   

consensus_10409#0      ATCAAACTCGTGAACGTACATTATTAAGTGCACATATTGAAGCAGCAACTAATCCAACAT 659
consensus_10409#1      ------------------------------------------------------------
                                                                                   

consensus_10409#0      ATCAACAAATAAAATATGATGAACCTGGTCAATTGTATTATTTGTTCTTCCGTGTATCAT 719
consensus_10409#1      ------------------------------------------------------------
                                                                                   

consensus_10409#0      GTTATGAAAATGATTCATCACCATCATCCGCATCATCATCCTCATTATCAACAATGGAAT 779
consensus_10409#1      ------------------------------------------------------------
                                                                                   

consensus_10409#0      CTTTACAAACGACGATATCATCAGGGCATAAATCAGCGGCTATG 823
consensus_10409#1      --------------------------------------------