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Schistosoma mansoni
cluster # 10425 cluster # 10425       Sequences # 16       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_10425#0 length = 609 sequences # 16  

consensusID : consensus_10425#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 16
consensus length = 609
fasta sequence
                              [TTACATCTCCACAAGTAAAACGACTACGAAAGATAAAAAAAGAATGTACAAGGAGGAAAACACTATCGAAGTTCGTAAACTAAATGGTCAAGTAAACCTAGAGATTAGACGTCTCAACTCTATGTTTGCTCAGAAATTTCTATCTTGTAAAAACTCTCCAAGTATGGGGAAACTCTTTAAAGAACTTACAGGGGACAGGCAGATCAGAAGCAATAACCAGCTGAATGTTTGTGACTTAAATAAGTCTTTTGTATGTCAATCATCTGACGTCATACTCCCTATATCCACAGGTTTGAAGAATAATTGTGTTCCTAGTTTCA-CTGAAACTGATGTCCG-AAAATGTTTCCTGTCACTTAATCCTTTCTAATGTTTAGGACCTATTGAAATCTTAAACCTCTGTCTTATAAAGTGTTCTGACGTTTCTATGTTATCTGTTCACGATCATCTTTAACAGATCCTCCTCAACTAATCTCATACCGAAAATGTGAACAAAGATAAAGATAACCTCAATACTTTAGAAAGTATCAGGCGATAAAAATGTGAAATTTAGACCCATAGCAATGACTTCACCTTTCCTCAGAACAATGGAAAAATTAGTGGTACTCCCAA]

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[+] EMBL AI067811             [TTACATCTCCACAAGTAAAACGACTACGAAAGATAAAAAAAGAATGTACAAGGAGGAAAACACTATCGAAGTTCGTAAACTAAATGGTCAAGTAAACCTAGAGATTAGACGTCTCAACTCTATGTTTGCTCAGAAATTTCTATCTTGTAAAAACTCTCCAAGTATGGGGAAACTCTTTAAAGAACTTACAGGGGACAGGCAGATCAGAAGCAATAACCAGCTGAATGTTTGTGACTTAAATAAGTCTTTTGTATGTCAATCATCTGACGTCATACTCCCTATATCCACAGGTTTGAAGAATAATTGTGTTCCTAGTTTCA CTGAAACTGATGTCCG AAAATGTTTCCTGTCACTTAATCCTTTCTAATGTTTAGGACCTATTGAAATCTTAAACCTCTGTCTTATAAAGTGTTCTGACGTTTCTATGTTATCTGTTCACGATCATCTTTAACAGATCCTC                                                                                                                                                     ]
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[+] EMBL AI067363             [      CTCCACAAGTAAAACGACTACGAAAGATAAAAAAAGAATGTACAAGGAGGAAAACACTATCGAAGTTCGTAAACTAAATGGTCAAGTAAACCTAGAGATTAGACGTCTCAACTCTATGTTTGCTCAGAAATTTCTATCTTGTAAAAACTCTCCAAGTATGGGGAAACTCTTTAAAGAACTTACAGGGGACAGGCAGATCAGAAGCAATAACCAGCTGAATGTTTGTGACTTAAATAAGTCTTTTGTATGTCAATCATCTGACGTCATACTCCCTATATCCACAGGTTTGAAGAATAATTGTGTTCCTAGTTTCA CTGAAACTGATGTCCG AAAATGTTTCCTGTCACTTAATCCTTTCTAATGTTTAGGACCTATTGAAATCTTAAACCTCTGTCTTATAAAGTGTTCTGACGTTTCTATGTTATCTGTTCACGATCATCTTTAACAGATCCTCCTCAACTAATCTCATACCGAAAATGTGAACAAAGATAAAGATAACCTCAATACTTTAGAAAGTATCAGGCGATAAAAATGTGAAATTTAGACCCATAGCAATGACTTCACCT                                     ]
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[+] EMBL AI068271             [      CTCCACAAGTAAAACGACTACGAAAGATAAAAAAAGAATGTACAAGGAGGAAAACACTATCGAAGTTCGTAAACTAAATGGTCAAGTAAACCTAGAGATTAGACGTCTCAACTCTATGTTTGCTCAGAAATTTCTATCTTGTAAAAACTCTCCAAGTATGGGGAAACTCTTTAAAGAACTTACAGGGGACAGGCAGATCAGAAGCAATAACCAGCTGAATGTTTGTGACTTAAATAAGTCTTTTGTATGTCAATCATCTGACGTCATACTCCCTATATCCACAGGTTTGAAGAATAATTGTGTTCCTAGTTTCA CTGAAACTGATGTCCG AAAATGTTTCCTGTCACTTAATCCTTTCTAATGTTTAGGACCTATTGAAATCTTAAACCTCTGTCTTATAAAGTGTTCTGACGTTTCTATGTTATCTGTTCACGATCATCTTTAACAGAT CTCCTCAACTAATCT                                                                                                                                         ]
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[+] EMBL AI068165             [      CTCCACAAGTAAAACGACTACGAAAGATAAAAAAAGAATGTACAAGGAGGAAAACACTATCGAAGTTCGTAAACTAAATGGTCAAGTAAACCTAGAGATTAGACGTCTCAACTCTATGTTTGCTCAGAAATTTCTATCTTGTAAAAACTCTCCAAGTATGGGGAAACTCTTTAAAGAACTTACAGGGGACAGGCAGATCAGAAGCAATAACCAGCTGAATGTTTGTGACTTAAATAAGTCTTTTGTATGTCAATCATCTGACGTCATACTCCCTATATCCACAGGTTTGAAGAATAATTGTGTTCCTAGTTTCA CTGAAACTGATGTCCG AAAATGTTTCCTGTCACTTAATCCTTTCTAATGTTT                                                                                                                                                                                                                                             ]
[+] EMBL AI066975             [      CTCCACAAGTAAAACGACTACGAAAGATAAAAAAAGAATGTACAAGGAGGAAAACACTATCGAAGTTCGTAAACTAAATGGTCAAGTAAACCTAGAGATTAGACGTCTCAACTCTATGTTTGCTCAGAAATTTCTATCTTGTAAAAACTCTCCAAGTATGGGGAAACTCTTTAAAGAACTTACAGGGGACAGGCAGATCAGAAGCAATAACCAGCTGAATGTTTGTGACTTAAATAAGTCTTTTGTATGTCAATCATCTGACGTCA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   ]
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[+] EMBL AI067090             [      CTCCACAAGTAAAACGACTACGAAAGATAAAAAAAGAATGTACAAGGAGGAAAACACTATCGAAGTTCGTAAACTAAATGGTCAAGTAAACCTAGAGATTAGACGTCTCAACTCTATGTTTGCTCAGAAATTTCTATCTTGTAAAAACTCTCCAAGTATGGGGAAACTCTTTAAAGAACTTACAGGGGACAGGCAGATCAGAAGCAATAACCAGCTGAATGTTT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             ]
[+] EMBL AI067159             [                                                                       TTCGTAAACTAAATGGTCAAGTAAACCTAGAGATTAGACGTCTCAACTCTATGTTTGCTCAGAAATTTCTATCTTGTAAAAACTCTCCAAGTATGGGGAAACTCTTTAAAGAACTTACAGGGGACAGGCAGATCAGAAGCAATAACCAGCTGAATGTTTGTGACTTAAATAAGTCTTTTGTATGTCAATCATCTGACGTCATACTCCCTATATCCACAGGTTTGAAGAATAATTGTGTTCCTAGTTTCACCTGAAACTGATGTCCGAAAAATG TTCCTGTCACTTTAACCTTTCTAATGATTAGGACC                                                                                                                                                                                                                                       ]


>consensus_10425#0 TTACATCTCCACAAGTAAAACGACTACGAAAGATAAAAAAAGAATGTACAAGGAGGAAAA CACTATCGAAGTTCGTAAACTAAATGGTCAAGTAAACCTAGAGATTAGACGTCTCAACTC TATGTTTGCTCAGAAATTTCTATCTTGTAAAAACTCTCCAAGTATGGGGAAACTCTTTAA AGAACTTACAGGGGACAGGCAGATCAGAAGCAATAACCAGCTGAATGTTTGTGACTTAAA TAAGTCTTTTGTATGTCAATCATCTGACGTCATACTCCCTATATCCACAGGTTTGAAGAA TAATTGTGTTCCTAGTTTCACTGAAACTGATGTCCGAAAATGTTTCCTGTCACTTAATCC TTTCTAATGTTTAGGACCTATTGAAATCTTAAACCTCTGTCTTATAAAGTGTTCTGACGT TTCTATGTTATCTGTTCACGATCATCTTTAACAGATCCTCCTCAACTAATCTCATACCGA AAATGTGAACAAAGATAAAGATAACCTCAATACTTTAGAAAGTATCAGGCGATAAAAATG TGAAATTTAGACCCATAGCAATGACTTCACCTTTCCTCAGAACAATGGAAAAATTAGTGG TACTCCCAA



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)