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These datas are free for academic use only, please contact me for any other use. Schistosoma mansoni see consensus multiple alignment with clustalw Direct access to contigs :
consensusID : consensus_10435#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 16 consensus length = 543 fasta sequence
[TAGCGGTGTTCAATCCGATCATATCGGGCCAGACACAAGCTTTGACGGAGTCATCCCAAATTGTACCACCTGGGCACGATTCAACGAACATACGTTCACCATCACACATAACGAAACCTTTGTCTGAGATTCCTAATGGAATGGCACCATCGATGTTTCGGCATGGGCTTGGGGTAACTTGTTGTGAAGAGAATCCGTAGGCAAGTTCATTTTGGTGGATGCAAATGTATTCGAGGGCAGCTCCACTTCGGAATGATTGACATCGGGTACCTGGGTTTTGTCCGCATGGTTGTTGGTTTTGGCAAACTCGGGCATCTAATTCACAGTTGCTTCCATCGAAACCTGGGGCACATCGGCATTTGAATGTTGTAGCATCAAAAGGTAAGCATTGACCACCGTTGAGGCAACCGAGGACACCACATGGGTTTTCAGTGACACCACTTCGTCGTTCGCATCGTTTCGATTCAATGTTGTAGTAGAGGCTCTTTGGGCAAGTTTGTTCGTTTCCTTTGGCATCATCGAGGCAAACAACGAATCGTCGAC]
[+] EMBL CD143577 [TAGCGGTGTTCAATCCGATCATATCGGGCCAGACACAAGCTTTGACGGAGTCATCCCAAATTGTACCACCTGGGCACGATTCAACGAACATACGTTCACCATCACACATAACGAAACCTTTGTCTGAGATTCCTAATGGAATGGCACCATCGATGTTTCGGCATGGGCTTGGGGTAACTTGTTGTGAAGAGAATCCGTAGGCAAGTTCATTTTGGTGGATGCAAATGTATTCGAGGGCAGCTCCACTTCGGAATGATTGACATCGGGTACCTGGGTTTTGTCCGCATGGTTGTTGGTTTTGGCAAACTCGGGCATCTAATTCACAGTTGCTTCCATCGAAACCTGNGGCACATCGGCATTTGAATGTTGTAGCATCAAAAGGTAAGCATTGACCACCGTTGAG ]
[+] EMBL CD143476 [ TCATATCGGGCCAGACACAAGCTTTGACGGAGTCATCCCAAATTGTACCACCTGGGCACGATTCAACGAACATACGTTCACCATCACACATAACGAAACCTTTGTCTGAGATTCCTAATGGAATGGCACCATCGATGTTTCGGCATGGGCTTGGGGTAACTTGTTGTGAAGAGAATCCGTAGGCAAGTTCATTTTGGTGGATGCGAATGTATTCGAGGGCAGCTCCACTTCGGAATGATTGACATCGGGTACCTGGGTTTTGTCCGCATGGTTGTTGGTTTTGGCAAACTCGGGCATCTAATTCACAGTTGCTTCCATCGAAACCTGGGGCACATCGGCATTTGAGTGTTGTAGCATCAAAAGGTAAGCATTGACCACCGTTGAG ]
[+] EMBL CD143480 [ TCATATCGGGCCAGACACAAGCTTTGACGGAGTCATCCCAAATTGTACCACCTGGGCACGATTCAACGAACATACGTTCACCATCACACATAACGAAACCTTTGTCTGAGATTCCTAATGGAATGGCACCATCGATGTTTCGGCATGGGCTTGGGGTAACTTATTGTGAAGAGAATCCGTAGGCAAGTTCATTTTGGTGGATGCAAATGTATTCGAGGGCAGCTCCACTTCGGAATGATTGACATCGGGTACCTGGGTTTTGTCCGCATGGTTGTTGGTTTTGGCAAACTCGGGCATCTAATTCACAGTTGCTTCCATCGAAACCTGGGGCACATCGGCATTTGAATGTTGTAGCATCAAAAGGTAAGCATTGACCACCGTTGAG ]
[+] EMBL CD143501 [ TCATATCGGGCCAGACACAAGCTTTGACGGAGTCATCCCAAATTGTACCACCTGGGCACGATTCAACGAACATACGTTCACCATCACACATAACGAAACCTTTGTCTGAGATTCCTAATGGAATGGCACCATCGATGTTTCGGCATGGGCTTGGGGTAACTTGTTGTGAAGAGAATCCGTAGGCAAGTTCATTTTGGTGGATGCAAATGTATTCGAGGGCAGCTCCACTTCGGAATGATTGACATCGGGTACCTGGGTTTTGTCCGCATGGTTGTTGGTTTTGGCAAACTCGGGCATCTAATTCACAGTTGCTTCCATCGAAACCTGAGGCACATCGGCATTTGAATGTTGTAGCATCAAAAGGTAAGCATTGACCACCGTTGAG ]
[+] EMBL CD143523 [ TCATATCGGGCCAGACACAAGCTTTGACGGAGTCATCCCAAATTGTACCACCTGGGCACGATTCAACGAACATACGTTCACCATCACACATAACGAAACCTTTGTCTGAGATTCCTAATGGAATGGCACCATCGATGTTTCGGCATGGGCTTGGGGTAACTTGTTGTGAAGAGAATCCGTAGGCAAGTTCATTTTGGTGGATGCAAATGTATTCGAGGGCAGCTCCACTTCGGAATGATTGACATCGGGTACCTGGGTTTTGTCCGCATGGTTGTTGGTTTTGGCAAACTCGGGCATCTAATTCACAGTTGCTTCCATCGAAACCTGGGGCACATCGGCATTTGAATGTTGTAGCATCAAAAGGTAAGCATTGACCACCGTTGAG ]
[+] EMBL CD143432 [ TCATATCGGGCCAGACACAAGCTTTGACGGAGTCATCCCAAATTGTACCACCTGGGCACGATTCAACGAACATACGTTCACCATCACACATAACGAAACCTTTGTCTGAGATTCCTAATGGAATGGCACCATCGATGTTTCGGCATGGGCTTGGGGTAACTTGTTGTGAAGAGAATCCGTAGGCAAGTTCATTTTGGTGGATGCAAATGTATTCGAGGGCAGCTCCACTTCGGAATGATTGACATCGGGTACCTGGGTTTTGTCCGCATGGTTGTTGGTTTTGGCAAACTCGGGCATCTAATTCACAGTTGCTTCCATCGAAACCTGNGGCACATCGGCATTTGAATGTTGTAGCATCAAAAGGTAAGCATTGACCACCGTTGAG ]
[+] EMBL CD143477 [ TCATATCGGGCCAGACACAAGCTTCGACGGAGTCATCCCAAATTGTACCACCTGGGCACGATTCAACGAACATACGTTCACCATCACACATAACGAAACCTTTGTCTGAGATTCCTAATGGAATGGCACCATCGATGTTTCGGCATGGGCTTGGGGTAACTTGTTGTGAAGAGAATCCGTAGGCAAGTTCATTTTGGTGGATGCAAATGTATTCGAGGGCAGCTCCACTTCGGAATGATTGACATCGGGTACCTGGGTTTTGTCCGCATGGTTGTTGGTTTTGGCAAACTCGGGCATCTAATTCACAGTTGCTTCCATCGAAACCTGNGGCACATCGGCATTTGAATGTTGTAGCATCAAAAGGTAAGCATTGACCACCGTTGAG ]
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[+] EMBL CD143554 [ TCATATCGGGCCAGACACAAGCTTTGACGGAGTCATCCCAAATTGTACCACCTGGGCACGATTCAACGAACATACGTTCACCATCACACATAACGAAACCTTTGTCTGAGATTCCTAATGGAATGGCACCATCGATGTTTCGGCATGGGCTTGGGGTAACTTGTTGTGAAGAGAATCCGTAGGCAAGTTCATTTTGGTGGATGCAAATGTATTCGAGGGCAGCTCCACTTCGGAATGATTGACATCGGGTACCTGGGTTTTGTCCGCATGGTTGTTGGTTTTGGCAAACTCGGGCATCTAATTCACAGTTGCTTCCATCGAAACCTGNGGCACATCGGCATTTGAATGTTGTAGCATCAAAAGGTAAGCATTGACCACCGTTGAG ]
[+] EMBL CD143578 [ TCATATCGGGCCAGACACAAGCTTTGACGGAGTCATCCCAAATTGTACCACCTGGGCACGATTCAACGAACATACGTTCACCATCACACATAACGAAACCTTTGTCTGAGATTCCTAATGGAATGGCACCATCGATGTTTCGGCATGGGCTTGGGGTAACTTGTTGTGAAGAGAATCCGTAGGCAAGTTCATTTTGGTGGATGCAAATGTATTCGAGGGCAGCTCCACTTCGGAATGATTGACATCGGGTACCTGGGTTTTGTCCGCATGGTTGTTGGTTTTGGCAAACTCGGGCATCTAATTCACAGTTGCTTCCATCGAAACCTGNGGCACATCGGCATTTGAATGTTGTAGCATCAAAAGGTAAGCATTGACCACCGTTGAG ]
[+] EMBL CD143514 [ TCATATCGGGCCAGACACAAGCTTTGACGGAGTCATCCCAGATTGTACCACCTGGGCACGATTCAACGAACATACGTTCACCATCACACATAACGAAACCTTTGTCTGAGATTCCTAATGGAATGGCACCATCGATGTTTCGGCATGGGCTTGGGGTAACTTGTTGTGAAGAGAATCCGTAGGCAAGTTCATTTTGGTGGATGCAAATGTATTCGAGGGCAGCTCCACTTCGGAATGATTGACATCGGGTACCTGGGTTTTGTCCGCATGGTTGTTGGTTTTGGCAAACTCGGGCATCTAATTCACAGTTGCTTCCATCGAAACCTGGGGCACATCGGCATTTGAATGTTGTAGCATCAAAAGGTAAGCATTGACCACCGTTGAG ]
[+] EMBL CD143522 [ TCATATCGGGCCAGACACAAGCTTTGACGGAGTCATCCCAAATTGTACCACCTGGGCACGATTCAACGAACATACGTTCACCATCACACATAACGAAACCTTTGTCTGAGATTCCTAATGGAATGGCACCATCGATGTTTCGGCATGGGCTTGGGGTAACTTGTTGTGAAGAGAATCCGTAGGCAAGTTCATTTTGGTGGATGCAAATGTATTCGAGGGCAGCTCCACTTCGGAATGATTGACATCGGGTACCTGGGTTTTGTCCGCATGGTTGTTGGTTTTGGCAAACTCGGGCATCTAATTCACAGTTGCTTCCATCGAAACCTGGGGCACATCGGCATTTGAATGTTGTAGCATCAAAAGGTAAGCATTGACCACCGTTGAG ]
[-] EMBL CD143517 [ CATATCGGGCCAGACACAAGCTTTGACGGAGTCATCCCAAATTGTACCACCTGGGCACGATTCAACGAACATACGTTCACCATCACACATAACGAAACCTTTGTCTGAGATTCCTAATGGAATGGCACCATCGATGTTTCGGCATGGGCTTGGGGTAACTTGTTGTGAAGAGAATCCGTAGGCAAGTTCATTTTGGTGGATGCAAATGTATTCGAGGGCAGCTCCACTTCGGAATGATTGACATCGGGTACCTGGGTTTTGTCCGCATGGTTGTTGGTTTTGGCAAACTCGGGCATCTAATTCACAGTTGCTTCCATCGAAACCTGGGGCACATCGGCATTTGTATGTTGTAGCATCAAAAGGTAAGCATTGACCACCGTTGAGG ]
[-] EMBL CD143492 [ CATATCGGGCCAGACACAAGCTTTGACGGAGTCATCCCAAATTGTACCACCTGGGCACGATTCAACGAACATACGTTCACCATCACACATAACGAAACCTTTGTCTGAGATTCCTAATGGAATGGCACCATCGATGTTTCGGCATGGGCTTGGGGTAACTTGTTGTGAAGAGAATCCGTAGGCAAGTTCATTTTGGTGGATGCAAATGTATTCGAGGGCAGCTCCACTTCGGAATGATTGACATCGGGTACCTGGGTTTTGTCCGCATGGTTGTTGGTTTTGGCAAACTCGGGCATCTAATTCACAGTTGCTTCCATCGAAACCTGGGGCACATCGGCATTTGAATGTTGTAGCATCAAAAGGTAAGCATTGACCACCGTTGAGG ]
[-] EMBL CD143528 [ CATATCGGGCCAGACACAAGCTTTGACGGAGTCATCCCAAATTGTACCACCTGGGCACGATTCAACGAACATACGTTCACCATCACACATGACGAAACCTTTGTCTGAGATTCCTAATGGAATGGCACCATCGATGTTTCGGCATGGGCTTGGGGTAACTTGTTGTGAAGAGAATCCGTAGGCAAGTTCATTTTGGTGGATGCAAATGTATTCGAGGGCAGCTCCACTTCGGAATGATTGACATCGGGTACCTGGGTTTTGTCCGCATGGTTGTTGGTTTTGGCAAACTCGGGCATCTAATTCACAGTTGCTTCCATCGAAACCTGGGGCACATCGGCATTTGAATGTTGTAGCATCAAAAGGTAAGCATTGACCACCGTTGAGG ]
[-] EMBL CD094186 [ GTTGTGAAGAGAATCCGTAGGCAAGTTCATTTTGGTGGATGCAAATGTATTCGAGGGCAGCTCCACTTCGGAATGATTGACATCGGGTACCTGGGTTTTGTCCGCATGGTTGTTGGTTTTGGCAAACTCGGGCATCTAATTCACAGTTGCTTCCATCGAAACCTGGGGCACATCGGCATTTGAATGTTGTAGCATCAAAAGGTAAGCATTGACCACCGTTGAGGCAACCGAGGACACCACATGGGTTTTCAGTGACACCACTTCGTCGTTCGCATCGTTTCGATTCAATGTTGTAGTAGAGGCTCTTTGGGCAAGTTTGTTCGTTTCCTTTGGCATCATCGAGGCAAACAACGAATCGTCGAC]
clustalw multiple alignements is not computed in this case |
| Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) | ||||