Home
Who am I
Technology
EST Assembly
Contact

These datas are free for academic use only, please contact me for any other use.

Schistosoma mansoni
cluster # 10435 cluster # 10435       Sequences # 16       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_10435#0 length = 543 sequences # 16  

consensusID : consensus_10435#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 16
consensus length = 543
fasta sequence
                              [TAGCGGTGTTCAATCCGATCATATCGGGCCAGACACAAGCTTTGACGGAGTCATCCCAAATTGTACCACCTGGGCACGATTCAACGAACATACGTTCACCATCACACATAACGAAACCTTTGTCTGAGATTCCTAATGGAATGGCACCATCGATGTTTCGGCATGGGCTTGGGGTAACTTGTTGTGAAGAGAATCCGTAGGCAAGTTCATTTTGGTGGATGCAAATGTATTCGAGGGCAGCTCCACTTCGGAATGATTGACATCGGGTACCTGGGTTTTGTCCGCATGGTTGTTGGTTTTGGCAAACTCGGGCATCTAATTCACAGTTGCTTCCATCGAAACCTGGGGCACATCGGCATTTGAATGTTGTAGCATCAAAAGGTAAGCATTGACCACCGTTGAGGCAACCGAGGACACCACATGGGTTTTCAGTGACACCACTTCGTCGTTCGCATCGTTTCGATTCAATGTTGTAGTAGAGGCTCTTTGGGCAAGTTTGTTCGTTTCCTTTGGCATCATCGAGGCAAACAACGAATCGTCGAC]

[+] EMBL CD143577             [TAGCGGTGTTCAATCCGATCATATCGGGCCAGACACAAGCTTTGACGGAGTCATCCCAAATTGTACCACCTGGGCACGATTCAACGAACATACGTTCACCATCACACATAACGAAACCTTTGTCTGAGATTCCTAATGGAATGGCACCATCGATGTTTCGGCATGGGCTTGGGGTAACTTGTTGTGAAGAGAATCCGTAGGCAAGTTCATTTTGGTGGATGCAAATGTATTCGAGGGCAGCTCCACTTCGGAATGATTGACATCGGGTACCTGGGTTTTGTCCGCATGGTTGTTGGTTTTGGCAAACTCGGGCATCTAATTCACAGTTGCTTCCATCGAAACCTGNGGCACATCGGCATTTGAATGTTGTAGCATCAAAAGGTAAGCATTGACCACCGTTGAG                                                                                                                                            ]
[+] EMBL CD143476             [                  TCATATCGGGCCAGACACAAGCTTTGACGGAGTCATCCCAAATTGTACCACCTGGGCACGATTCAACGAACATACGTTCACCATCACACATAACGAAACCTTTGTCTGAGATTCCTAATGGAATGGCACCATCGATGTTTCGGCATGGGCTTGGGGTAACTTGTTGTGAAGAGAATCCGTAGGCAAGTTCATTTTGGTGGATGCGAATGTATTCGAGGGCAGCTCCACTTCGGAATGATTGACATCGGGTACCTGGGTTTTGTCCGCATGGTTGTTGGTTTTGGCAAACTCGGGCATCTAATTCACAGTTGCTTCCATCGAAACCTGGGGCACATCGGCATTTGAGTGTTGTAGCATCAAAAGGTAAGCATTGACCACCGTTGAG                                                                                                                                            ]
[+] EMBL CD143480             [                  TCATATCGGGCCAGACACAAGCTTTGACGGAGTCATCCCAAATTGTACCACCTGGGCACGATTCAACGAACATACGTTCACCATCACACATAACGAAACCTTTGTCTGAGATTCCTAATGGAATGGCACCATCGATGTTTCGGCATGGGCTTGGGGTAACTTATTGTGAAGAGAATCCGTAGGCAAGTTCATTTTGGTGGATGCAAATGTATTCGAGGGCAGCTCCACTTCGGAATGATTGACATCGGGTACCTGGGTTTTGTCCGCATGGTTGTTGGTTTTGGCAAACTCGGGCATCTAATTCACAGTTGCTTCCATCGAAACCTGGGGCACATCGGCATTTGAATGTTGTAGCATCAAAAGGTAAGCATTGACCACCGTTGAG                                                                                                                                            ]
[+] EMBL CD143501             [                  TCATATCGGGCCAGACACAAGCTTTGACGGAGTCATCCCAAATTGTACCACCTGGGCACGATTCAACGAACATACGTTCACCATCACACATAACGAAACCTTTGTCTGAGATTCCTAATGGAATGGCACCATCGATGTTTCGGCATGGGCTTGGGGTAACTTGTTGTGAAGAGAATCCGTAGGCAAGTTCATTTTGGTGGATGCAAATGTATTCGAGGGCAGCTCCACTTCGGAATGATTGACATCGGGTACCTGGGTTTTGTCCGCATGGTTGTTGGTTTTGGCAAACTCGGGCATCTAATTCACAGTTGCTTCCATCGAAACCTGAGGCACATCGGCATTTGAATGTTGTAGCATCAAAAGGTAAGCATTGACCACCGTTGAG                                                                                                                                            ]
[+] EMBL CD143523             [                  TCATATCGGGCCAGACACAAGCTTTGACGGAGTCATCCCAAATTGTACCACCTGGGCACGATTCAACGAACATACGTTCACCATCACACATAACGAAACCTTTGTCTGAGATTCCTAATGGAATGGCACCATCGATGTTTCGGCATGGGCTTGGGGTAACTTGTTGTGAAGAGAATCCGTAGGCAAGTTCATTTTGGTGGATGCAAATGTATTCGAGGGCAGCTCCACTTCGGAATGATTGACATCGGGTACCTGGGTTTTGTCCGCATGGTTGTTGGTTTTGGCAAACTCGGGCATCTAATTCACAGTTGCTTCCATCGAAACCTGGGGCACATCGGCATTTGAATGTTGTAGCATCAAAAGGTAAGCATTGACCACCGTTGAG                                                                                                                                            ]
[+] EMBL CD143432             [                  TCATATCGGGCCAGACACAAGCTTTGACGGAGTCATCCCAAATTGTACCACCTGGGCACGATTCAACGAACATACGTTCACCATCACACATAACGAAACCTTTGTCTGAGATTCCTAATGGAATGGCACCATCGATGTTTCGGCATGGGCTTGGGGTAACTTGTTGTGAAGAGAATCCGTAGGCAAGTTCATTTTGGTGGATGCAAATGTATTCGAGGGCAGCTCCACTTCGGAATGATTGACATCGGGTACCTGGGTTTTGTCCGCATGGTTGTTGGTTTTGGCAAACTCGGGCATCTAATTCACAGTTGCTTCCATCGAAACCTGNGGCACATCGGCATTTGAATGTTGTAGCATCAAAAGGTAAGCATTGACCACCGTTGAG                                                                                                                                            ]
[+] EMBL CD143477             [                  TCATATCGGGCCAGACACAAGCTTCGACGGAGTCATCCCAAATTGTACCACCTGGGCACGATTCAACGAACATACGTTCACCATCACACATAACGAAACCTTTGTCTGAGATTCCTAATGGAATGGCACCATCGATGTTTCGGCATGGGCTTGGGGTAACTTGTTGTGAAGAGAATCCGTAGGCAAGTTCATTTTGGTGGATGCAAATGTATTCGAGGGCAGCTCCACTTCGGAATGATTGACATCGGGTACCTGGGTTTTGTCCGCATGGTTGTTGGTTTTGGCAAACTCGGGCATCTAATTCACAGTTGCTTCCATCGAAACCTGNGGCACATCGGCATTTGAATGTTGTAGCATCAAAAGGTAAGCATTGACCACCGTTGAG                                                                                                                                            ]
[+] EMBL CD143487             [                  TCATATCGGGCCAGACACAAGCTTTGACGGAGTCATCCCAAATTGTACCACCTGGGCACGATACAACGAACATACGTTCACCATCACACATAACGAAACCTTTGTCTGAGATTCCTAATGGAATGGCACCATCGATGTTTCGGCATGGGCTTGGGGTAACTTGTTGTGAAGAGAATCCGTAGGCAAGTTCATTTTGGTGGATGCAAATGTATTCGAGGGCAGCTCCACTTCGGAATGATTGACATCGGGTACCTGGGTTTTGTCCGCATGGTTGTTGGTTTTGGCAAACTCGGGCATCTAATTCACAGTTGCTTCCATCGAAACCTGNGGCACATCGGCATTTGAATGTTGTAGCATCAAAAGGTAAGCATTGACCACCGTTGAG                                                                                                                                            ]
[+] EMBL CD143554             [                  TCATATCGGGCCAGACACAAGCTTTGACGGAGTCATCCCAAATTGTACCACCTGGGCACGATTCAACGAACATACGTTCACCATCACACATAACGAAACCTTTGTCTGAGATTCCTAATGGAATGGCACCATCGATGTTTCGGCATGGGCTTGGGGTAACTTGTTGTGAAGAGAATCCGTAGGCAAGTTCATTTTGGTGGATGCAAATGTATTCGAGGGCAGCTCCACTTCGGAATGATTGACATCGGGTACCTGGGTTTTGTCCGCATGGTTGTTGGTTTTGGCAAACTCGGGCATCTAATTCACAGTTGCTTCCATCGAAACCTGNGGCACATCGGCATTTGAATGTTGTAGCATCAAAAGGTAAGCATTGACCACCGTTGAG                                                                                                                                            ]
[+] EMBL CD143578             [                  TCATATCGGGCCAGACACAAGCTTTGACGGAGTCATCCCAAATTGTACCACCTGGGCACGATTCAACGAACATACGTTCACCATCACACATAACGAAACCTTTGTCTGAGATTCCTAATGGAATGGCACCATCGATGTTTCGGCATGGGCTTGGGGTAACTTGTTGTGAAGAGAATCCGTAGGCAAGTTCATTTTGGTGGATGCAAATGTATTCGAGGGCAGCTCCACTTCGGAATGATTGACATCGGGTACCTGGGTTTTGTCCGCATGGTTGTTGGTTTTGGCAAACTCGGGCATCTAATTCACAGTTGCTTCCATCGAAACCTGNGGCACATCGGCATTTGAATGTTGTAGCATCAAAAGGTAAGCATTGACCACCGTTGAG                                                                                                                                            ]
[+] EMBL CD143514             [                  TCATATCGGGCCAGACACAAGCTTTGACGGAGTCATCCCAGATTGTACCACCTGGGCACGATTCAACGAACATACGTTCACCATCACACATAACGAAACCTTTGTCTGAGATTCCTAATGGAATGGCACCATCGATGTTTCGGCATGGGCTTGGGGTAACTTGTTGTGAAGAGAATCCGTAGGCAAGTTCATTTTGGTGGATGCAAATGTATTCGAGGGCAGCTCCACTTCGGAATGATTGACATCGGGTACCTGGGTTTTGTCCGCATGGTTGTTGGTTTTGGCAAACTCGGGCATCTAATTCACAGTTGCTTCCATCGAAACCTGGGGCACATCGGCATTTGAATGTTGTAGCATCAAAAGGTAAGCATTGACCACCGTTGAG                                                                                                                                            ]
[+] EMBL CD143522             [                  TCATATCGGGCCAGACACAAGCTTTGACGGAGTCATCCCAAATTGTACCACCTGGGCACGATTCAACGAACATACGTTCACCATCACACATAACGAAACCTTTGTCTGAGATTCCTAATGGAATGGCACCATCGATGTTTCGGCATGGGCTTGGGGTAACTTGTTGTGAAGAGAATCCGTAGGCAAGTTCATTTTGGTGGATGCAAATGTATTCGAGGGCAGCTCCACTTCGGAATGATTGACATCGGGTACCTGGGTTTTGTCCGCATGGTTGTTGGTTTTGGCAAACTCGGGCATCTAATTCACAGTTGCTTCCATCGAAACCTGGGGCACATCGGCATTTGAATGTTGTAGCATCAAAAGGTAAGCATTGACCACCGTTGAG                                                                                                                                            ]
[-] EMBL CD143517             [                   CATATCGGGCCAGACACAAGCTTTGACGGAGTCATCCCAAATTGTACCACCTGGGCACGATTCAACGAACATACGTTCACCATCACACATAACGAAACCTTTGTCTGAGATTCCTAATGGAATGGCACCATCGATGTTTCGGCATGGGCTTGGGGTAACTTGTTGTGAAGAGAATCCGTAGGCAAGTTCATTTTGGTGGATGCAAATGTATTCGAGGGCAGCTCCACTTCGGAATGATTGACATCGGGTACCTGGGTTTTGTCCGCATGGTTGTTGGTTTTGGCAAACTCGGGCATCTAATTCACAGTTGCTTCCATCGAAACCTGGGGCACATCGGCATTTGTATGTTGTAGCATCAAAAGGTAAGCATTGACCACCGTTGAGG                                                                                                                                           ]
[-] EMBL CD143492             [                   CATATCGGGCCAGACACAAGCTTTGACGGAGTCATCCCAAATTGTACCACCTGGGCACGATTCAACGAACATACGTTCACCATCACACATAACGAAACCTTTGTCTGAGATTCCTAATGGAATGGCACCATCGATGTTTCGGCATGGGCTTGGGGTAACTTGTTGTGAAGAGAATCCGTAGGCAAGTTCATTTTGGTGGATGCAAATGTATTCGAGGGCAGCTCCACTTCGGAATGATTGACATCGGGTACCTGGGTTTTGTCCGCATGGTTGTTGGTTTTGGCAAACTCGGGCATCTAATTCACAGTTGCTTCCATCGAAACCTGGGGCACATCGGCATTTGAATGTTGTAGCATCAAAAGGTAAGCATTGACCACCGTTGAGG                                                                                                                                           ]
[-] EMBL CD143528             [                   CATATCGGGCCAGACACAAGCTTTGACGGAGTCATCCCAAATTGTACCACCTGGGCACGATTCAACGAACATACGTTCACCATCACACATGACGAAACCTTTGTCTGAGATTCCTAATGGAATGGCACCATCGATGTTTCGGCATGGGCTTGGGGTAACTTGTTGTGAAGAGAATCCGTAGGCAAGTTCATTTTGGTGGATGCAAATGTATTCGAGGGCAGCTCCACTTCGGAATGATTGACATCGGGTACCTGGGTTTTGTCCGCATGGTTGTTGGTTTTGGCAAACTCGGGCATCTAATTCACAGTTGCTTCCATCGAAACCTGGGGCACATCGGCATTTGAATGTTGTAGCATCAAAAGGTAAGCATTGACCACCGTTGAGG                                                                                                                                           ]
[-] EMBL CD094186             [                                                                                                                                                                                    GTTGTGAAGAGAATCCGTAGGCAAGTTCATTTTGGTGGATGCAAATGTATTCGAGGGCAGCTCCACTTCGGAATGATTGACATCGGGTACCTGGGTTTTGTCCGCATGGTTGTTGGTTTTGGCAAACTCGGGCATCTAATTCACAGTTGCTTCCATCGAAACCTGGGGCACATCGGCATTTGAATGTTGTAGCATCAAAAGGTAAGCATTGACCACCGTTGAGGCAACCGAGGACACCACATGGGTTTTCAGTGACACCACTTCGTCGTTCGCATCGTTTCGATTCAATGTTGTAGTAGAGGCTCTTTGGGCAAGTTTGTTCGTTTCCTTTGGCATCATCGAGGCAAACAACGAATCGTCGAC]


>consensus_10435#0 TAGCGGTGTTCAATCCGATCATATCGGGCCAGACACAAGCTTTGACGGAGTCATCCCAAA TTGTACCACCTGGGCACGATTCAACGAACATACGTTCACCATCACACATAACGAAACCTT TGTCTGAGATTCCTAATGGAATGGCACCATCGATGTTTCGGCATGGGCTTGGGGTAACTT GTTGTGAAGAGAATCCGTAGGCAAGTTCATTTTGGTGGATGCAAATGTATTCGAGGGCAG CTCCACTTCGGAATGATTGACATCGGGTACCTGGGTTTTGTCCGCATGGTTGTTGGTTTT GGCAAACTCGGGCATCTAATTCACAGTTGCTTCCATCGAAACCTGGGGCACATCGGCATT TGAATGTTGTAGCATCAAAAGGTAAGCATTGACCACCGTTGAGGCAACCGAGGACACCAC ATGGGTTTTCAGTGACACCACTTCGTCGTTCGCATCGTTTCGATTCAATGTTGTAGTAGA GGCTCTTTGGGCAAGTTTGTTCGTTTCCTTTGGCATCATCGAGGCAAACAACGAATCGTC GAC



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)