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Schistosoma mansoni
cluster # 10438 cluster # 10438       Sequences # 16       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_10438#0 length = 1563 sequences # 16  

consensusID : consensus_10438#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 16
consensus length = 1563
fasta sequence
                              [ANNTTATAATNCAATNCAATAAAAATGGTCCTCTCTTCATCTAGCATANCAGTCAAACGAAAAGGAGTCGAAAAAAACNAGATAAGTANCGAGTAAAAAAAACTAGTGAATAAAAGTTAATCACAGCTATTTGATTATGAAGAAGCTGAGTAAAGGTAAGTTAGCAACAAAACAGAAATAACTAAAGATTTTTAGATTAGATCTTGTGTACCCGTATAAAAAGATTGTTAGCCTAAAAAGCAACCGTAATCATAAAAATTCACATAAATCCTCTTCTTTTGACAATATAAGCTAGATAGCTGAAAACAAACTCATAGCAGTGATTGTTGCTGTTATTGAGATACTGGTGGAAACATTAGGGACGATGAACAAAACGTATTTTCCCCTATTGTTGATGCTGGCATAAATATATTAGTAGGTGTACAAAGTGGACCAGGGATAATAGATGGTACGACAGACATTGGATGATTAACAAAAGCGGATGAGGTTGGCGGTGTTGTTGGACGAAATGGAAGTATGGAAGGTGTAAAAGAACTAGTAGTTGGATTAGTGACAGAAATTTGTTTACGATGAGCTCGTCCCTGTATATTTGAATATTGTTGTTTTTGCGTTTGTAAATAATTTCCAGCGGTATTTGAAAACTCTTGTGACATACAAACAGAGATTTGTGGAGATATATATTTTTGAGTTAAACAGTCAGAGGGGATATGAGATGATAGTGGATCTGCAGAGGATTAAAGCTGACTAATTGGTGCCTGGTAGTACGAATCGGTAACCATAGTTTGTATATAATGAGTATTATTATCATTGGTAGTGGTAAGAATGACTGGGGGAGGTGTCATGTATGATAAGGATGGTGACAGTTGACCTTGAATATTGGAAATCGTGGAAATAGAAGAAACAGTACTAGCTACAGCAGTTGTAGCAAGATAAGGTTGATTTTGGTTGATAGCAGATAAGGAAACCAAATGATCGAATTGTTGAGATGCAGACATTTGATGACCACTATTTACATTTTCAAAAGAATCACCTATTACAGAAGGTGGATTAGGCACAGAATGAACAGAAGTTGAGCCGGCAGAAGTAAGAGAAGGTGATAATGCTCTTACATGGATTGTATTTTGAGGCATATTCTTTTGACCAGGCATTATAGGAGCTATACCTTTTTCGGAATATGCTTCTGTTAGTATAAATAACACAGTGTCCACTGAATCCCAATAGGTTGCATGACTTGTAAGAGCAAAAAGGTACTCATTGAAACTTTCCAAAGTAGCTTCCTGTAAAACATAATCCATACGTCTACCTTGATTAAGTCGACTGTTAAAAGATAAATCCTGAGTTGTTAAATTACGATAAGTTGTTGTAACAACATCATTACGATTGTCAGTGATATTACAAACATTTTCATAATCTTCTAGTCCATCCTCATTTGAACTGCTACCACAAGTATATGCAGTGGAAACAGATCCTAATTCATCGGGGGCACTAATAAATTTATGAGCCAATGCAAATTCATGTAGACTGCGCCAAGTAGATTGAACTGAATTGTAAAATTTACTTTTT]

[-] EMBL CD138281             [ANNTTATAATNCAATNCAATAAAAATGGTCCTCTCTTCATCTAGCATANCAGTCAAACGAAAAGGAGTCGAAAAAAACNAGATAAGTANCGAGTAAAAAAAACTAGTGAATAAAAGTTAATCACAGCTATTTGATTATGAAGAAGCTGAGTAAAGGTAAGTTAGCAACAAAACAGAAATAACTAAAGATTTTTAGATTAGATCTTGTGTACCCGTATAAAAAGATTGTTAGCCTAAAAAGCAACCGTAATCATAAAAATTCACATAAATCCTCTTCTTTTGACAATATAAGCTAGATAGCTGAAAACAAACTCATAGCAGTGATTGTTGCTGTTATTGAGATACTGGTGGAAACATTTGAGACGATGAACAAAACGTATTTTCCCCTATTGTTGATGCTGGCATAAATATATTAGTAGGTGTACAAAGTGGACCAGGGATAATAGATGGTACGACAGACATTGGATGGTTAACAAAA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              ]
[+] EMBL CD124350             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     AGGGACGATGAACAAGACGTATTTTCCCCTATTGTTGATGCTGGCATAAATTTATTAGTAGGTGTACAAAGTGGACCAGGGATAATAGATGGTACGACAGACATTGGATGATTAACAAAAGCGGATGAGGTTGGCGGTGTTGTTGGACGAAATGGAAGTATGGAAGGTGTAAAAGAACTAGTAGTTGGATTAGTGACAGAAATTTGTTTACGATGAGCTCGTCCC                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     ]
[+] EMBL CD124493             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     AGGGACGATGAACAAAACGTATTTTCCCCTATTGTTGATGCTGGCATAAATATATTAGTAGGTGTACAAAGTGGACCAGGGATAATAGATGGTACGACAGACATTGGATGATTAACAAAAGCGGATGAGGTTGGCGGTGTTGTTGGACGAAATGGAAGTATGGAAGGTGTAAAAGAACTAGTAGTTGGATTAGTGACAGAAATTTGTTTACGATGAGCTCGTCCC                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     ]
[+] EMBL CD124478             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     AGGGACGATGAACAAAACGTATTTTCCCCTATTGTTGATGCTGGCATAAATATATTAGTAGGTGTACAAAGTGGACCAGGGATAATAGATGGTACGACAGACATTGGATGATTAACAAAAGCGGATGAGGTTGGCGGTGTTGTTGGACGAAATGGAAGTATGGAAGGTGTAAAAGAACTAGTAGTTGGATTAGTGACAGAAATTTGTTTACGATGAGCTCGTCCC                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     ]
[+] EMBL CD124357             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     AGGGACGATGAACAAAACGTATTTTCCCCTATTGTTGATGCTGGCGTAAATATATTAGTAGGTGTACAAAGTGGACCAGGGATAATAGATGGTACGACAGACATTGGATGATTAACAAAAGCGGATGAGGTTGGCGGTGTTGTTGGACGAAATGGAAGTATGGAATGTGTAAAAGAACTAGTAGTTGGATTAGTGACAGAAATTTGTTTACGATGAGCTCGTCCC                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     ]
[-] EMBL CD124377             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      GGGACGATGAACAAAACGTATTTTCCCCTATTGTTGATGCTGGCATAAATATATTAGTAGGTGTACAAAGTGGACCAGGGACAATAGATGGTACGACAGACATTGGATGATTAACAAAAGCGGATGAGGTTGGCGGTGTTGTTGGACGAAATGGAAGTATGGAAGGTGTAAAAGAACTAGTAGTTGGATTAGTGACAGAAATTTGTTTACGATGAGCTCGTCCCT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    ]
[-] EMBL CD124338             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      GGGACGATGAACAAAACGTATTTTCCCCTATTGTTGATGCTGGCATAAATATATTAGTAGGTGTACAAAGTGCACCAGGGATAATAGATGGTA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        ]
[-] EMBL CD124494             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      GGGACGATGAACAAAACGTATTTTCCCCTATTGTTGATGCTGGCATAAATATATTAGTAGGTGTACAAAGTGGACCAGGGATAATAGATGGTACGACAGACATTGGATGATTAACAAAAGCGGATGAGGTTGGCGGTGTTGTTGGACGAAATGGAAGTATGGAAGGTGTAAAAGAACTAGTAGTTGGATTAGTGACAGAAATTTGTTTACGATGAGCTCGTCCCT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    ]
[-] EMBL CD124358             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      GGGACGATGAACAAAACGTATTTTCCCCTATTGTTGATGCTGGCATAAATATATTAGTAGGTGTACAAAGTGGACCAGGGATAATAGATGGTACGACAGACATTGGATGATTAACAAAAGCGGATGAGGTTGGCGGTGTTGTTGGACGAAATGGAAGTATGGAAGGTGTAAAAGAACTAGTAGTTGGATTAGTGACAGAAATTTGTTTACGATGAGCTCGTCCCT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    ]
[-] EMBL CD124487             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          TTTCCCCCTATTGTTGATGCTGGCATAAATATATTAGTAGGTGTACANAGTGGACCAGGGATAATAGATGGTACGACAGACATTGGATGATTAACAAAAGCGGATGAGGTTGGCGGTGTTGTTGGACGAAATGGAAGTATGGAAGGTGTAAAAGAACTAGTAGTTGGATTAGTGACAGAAATTTGTTTACGATGAGCTCGTCCCT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    ]
[-] EMBL CD179040             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      CTAGTAGTTGGATTAGTGACAGAAATTTGTTTACGATGAGCATAAGCTGGTATATTTGAATATTGTTGTTTTTGCGTTTGTAAATAATTTCCAGCGGTATTTGAAAACTCTTGTGACATACAAACAGAGATTTGTGGAGATATATATTTTTGAGTTAAACAGTCAGAGGGGATATGAGATGATAGTGGATCTGCAGAGGATTAAAGCTGACTAATTGGTGCCTGGTAGTACGAATCGGTAACCATAGTTTGTATATAATGAGTATTATTATCATTGGTAGTGGTAAGAATGACTGGGGGAGGTGTCATGTATGATAAGGATGGTGACAGTTGACCTTGAATATTGGAAATCGTGGAAATAGAAGAAACAGTACTAGCTACAGCAGTTGTAGCAAGATAAGGTTGATTTTGGTTGATAGCAGATAAGGAAACCAAATGATCGAATTGTTGAGATGCAGACATTTGATGACCACTATTTACATTTTCAAAAGAATCACCTATTA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               ]
[+] EMBL CD152960             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                GATATATATTTTTGAGTTAAACAGTCAGAGGGGATATGAGATGATAGTGGATCTGCAGAGGAATAAAGCTGACTAATTGGTGCCTGGTAGTACGAATCGGTAACCATAGTTTGTATATAATGAGTATTATTATCATTGGTAGTGGTAAGAATGACTGGGGGAGGTGTCATGTATGATAAGGATGGTGGCAGTTGACCTTGAATATTGGAAATCGTGGAAATAGAAGAAACAGTACTAGCTACAGCAGTTGTAGCAAGATAAGGTTGATTTTGGTTGATAGCAGATAAGGAAACCAAATGATCGAATTGTTGAGATGCAGACATTTGATGACCACTATTTACATTTTCAAAAGAATCACCTATTACAGAAGGTGGATTAGGCACAGAATGAACAGAAGTTGAGCCGGCAGAAGTAAGAGAAGGTGATAATGCTCTTACATGGATTGTATTTTGAGGCATATTCTTTTGACCAGGCATTATAGGAGCTATACCTTTTTCGGAATATGCTTCTGTTAGTATAAATAACACAGTGTCCACTGAATCCCAATAGGGTGC                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 ]
[-] EMBL CD186396             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           TGGGGGAGGTGTCATGTATGATAAGGATGGTGACAGTTGACCTTGAATATTGGAAATCGTGGAAATAGAAGAAACAGTACTAGCTACAGCAGTTGTAGCAAGATAAGGTTGATTCTGGTTGATAGCAGATAAGGAAACCAAATGATCGAATTGTTGAGATGCAGACATTTGATGACCACTATTTACATTTTCAAAAGAATCACCTATTACAGAAGGTGGATTAGGCACAGAATGAACAGAAGTTGAGCCGGCAGAAGTAAGAGAAGGTGATAATGCTCTTACATGGATTGTATTTTGAGGCATATTCTTTTGACCAGGCATTATAGGAGCTATACCTTTTTCGGAATATGCTTCTGTTAGTATAAATAACACAGTGTCC                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     ]
[-] EMBL CD095632             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    GAACAGAAGTTGAGCCGGCAGAAGTAAGAGAAGGTGATAATGCTCTTACATGGATTGTATTTTGAGGCATATTCTTTTGACCAGGCATTATAGGAGCTATACCTTTTTCGGAACATGCTTCTGTTAGTATAAATAACACAGTGTCCACTGAATCCCAATAGGTTGCATGACTTGTAAGAGCAAAAAGGTACTCATTGAAACTTTCCAAAGTAGCTTCCTGTAAAACATAATCCATACGTCTACCTTGATTAAGTCGACTGTTAAAAGATAAATCCTGAGTTGTTAAATTACGATAAGTTGTTGTAACAACATCATTACGATTGTCAGTGATATTACAAACA                                                                                                                                                                  ]
[-] EMBL CD095672             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    GAACAGAAGTTGAGCCGGCAGAAGTAAGAGAAGGTGATAATGCTCTTACATGGATTGTATTNTGAGGCATATTCTTTTGACCAGGCATTATAGGAGCTATACCTTTTTCGGAACATGCTTCTGTTAGTATAAATAACACAGTGTCCACTGAATCCCAATAGGTTGCATGACTTGTAAGAGCAAAAAGGTACTCATTGAAACTTTCCAAAGTAGCTTCCTGTAAAACATAATCCATACGTCTACCTTGATTAAGTCGACTGTTAAAAGATAAATCCTGAGTTGTTAAATTACGATAAGTTGTTGTAACAACATCATTACGATTGTCAGTGATATTACAAACA                                                                                                                                                                  ]
[+] EMBL CD161307             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         AAGTAAGAGAAGGTGATAATGCTCTTACATGGATTGTATTTTGAGGCATATTCTTTTGACCAGGCATTAAAGGAGCTATACCTTTTTCGGAATATGCTTCTGTTAGTATAAATAACACAGTGTCCACTGAATCCCAATAGGTTGCATGACTTGTAAGAGCAAAAAGGTACTCATTGAAACTTTCCAAAGTAGCTTCCTGTAAAACATAATCCATACGTCTACCTTGATTAAGTCGACTGTTAAAAGATAAATCCTGAGTTGTTAAATTACGATAAGTTGTTGTAACAACATCATTACGATTGTCAGTGATATTACAAACATTTTCATAATCTTCTAGTCCATCCTCATTTGAACTGCTACCACAAGTATATGCAGTGGAAACAGATCCTAATTCATCGGGGGCACTAATAAATTTATGAGCCAATGCAAATTCATGTAGACTGCGCCAAGTAGATTGAACTGAATTGTAAAATTTACTTTTT]


>consensus_10438#0 ANNTTATAATNCAATNCAATAAAAATGGTCCTCTCTTCATCTAGCATANCAGTCAAACGA AAAGGAGTCGAAAAAAACNAGATAAGTANCGAGTAAAAAAAACTAGTGAATAAAAGTTAA TCACAGCTATTTGATTATGAAGAAGCTGAGTAAAGGTAAGTTAGCAACAAAACAGAAATA ACTAAAGATTTTTAGATTAGATCTTGTGTACCCGTATAAAAAGATTGTTAGCCTAAAAAG CAACCGTAATCATAAAAATTCACATAAATCCTCTTCTTTTGACAATATAAGCTAGATAGC TGAAAACAAACTCATAGCAGTGATTGTTGCTGTTATTGAGATACTGGTGGAAACATTAGG GACGATGAACAAAACGTATTTTCCCCTATTGTTGATGCTGGCATAAATATATTAGTAGGT GTACAAAGTGGACCAGGGATAATAGATGGTACGACAGACATTGGATGATTAACAAAAGCG GATGAGGTTGGCGGTGTTGTTGGACGAAATGGAAGTATGGAAGGTGTAAAAGAACTAGTA GTTGGATTAGTGACAGAAATTTGTTTACGATGAGCTCGTCCCTGTATATTTGAATATTGT TGTTTTTGCGTTTGTAAATAATTTCCAGCGGTATTTGAAAACTCTTGTGACATACAAACA GAGATTTGTGGAGATATATATTTTTGAGTTAAACAGTCAGAGGGGATATGAGATGATAGT GGATCTGCAGAGGATTAAAGCTGACTAATTGGTGCCTGGTAGTACGAATCGGTAACCATA GTTTGTATATAATGAGTATTATTATCATTGGTAGTGGTAAGAATGACTGGGGGAGGTGTC ATGTATGATAAGGATGGTGACAGTTGACCTTGAATATTGGAAATCGTGGAAATAGAAGAA ACAGTACTAGCTACAGCAGTTGTAGCAAGATAAGGTTGATTTTGGTTGATAGCAGATAAG GAAACCAAATGATCGAATTGTTGAGATGCAGACATTTGATGACCACTATTTACATTTTCA AAAGAATCACCTATTACAGAAGGTGGATTAGGCACAGAATGAACAGAAGTTGAGCCGGCA GAAGTAAGAGAAGGTGATAATGCTCTTACATGGATTGTATTTTGAGGCATATTCTTTTGA CCAGGCATTATAGGAGCTATACCTTTTTCGGAATATGCTTCTGTTAGTATAAATAACACA GTGTCCACTGAATCCCAATAGGTTGCATGACTTGTAAGAGCAAAAAGGTACTCATTGAAA CTTTCCAAAGTAGCTTCCTGTAAAACATAATCCATACGTCTACCTTGATTAAGTCGACTG TTAAAAGATAAATCCTGAGTTGTTAAATTACGATAAGTTGTTGTAACAACATCATTACGA TTGTCAGTGATATTACAAACATTTTCATAATCTTCTAGTCCATCCTCATTTGAACTGCTA CCACAAGTATATGCAGTGGAAACAGATCCTAATTCATCGGGGGCACTAATAAATTTATGA GCCAATGCAAATTCATGTAGACTGCGCCAAGTAGATTGAACTGAATTGTAAAATTTACTT TTT



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)