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consensusID : consensus_10441#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 12 consensus length = 770 fasta sequence
[AGCCATATTCGGCACGAGGGTTACTGTGTAGTTTCCCACCGTACTCCTATAAATGTCGATA-AAAGGTGGGGATCGGTTAACTTATTTTATGGCTCATGTCCGGGATTTCTTTATGGGAAGGAAATATAATAATTGTCTTAGATATGCTGAACAGTGCTCGAAACGAACTCAACCACTTGCTTATCTTCCCAACGGCATAAATGACAAAATATCACATAATGATTACTTTGCTCGAGATGGGCGACGCGAAGTTAGGAAATCTGTTGATATTTATGTTTCTGGCTTAAAAAGGCTTGAAGCTAGGTCAGAGTCTAAGCGTCCAAATGTTCTATCAAAGTCGATTGATGTTGTCCCGGGACAAAAGTTTGACTGGGATAAACCAGTAGAATCAAAATGAACTAAATCATTTGGTTTCTCTCGCTCCAACTATTCAGTATTTGGGTACATAAAGTGATTTTGATTCATTTCACCTAACGTAGTGTTTTTTCCCGTTCTAGACTTCATCCATTAAGCATTATATAGCCCTTTGTTACTCATAGTAACGTAAAAAGTATGTACATTTCATATTTTGGTCTTGCCTTTTTTCTATATAGTTATTGTTAGTGGTTTTGATGATACGTAATTTACGTCCATCCAAGACATGGATTTGACGTTTGTTGATTGCCTTTGTTAATAAAATAGTAATAGTGTCTTTCGTAGTATCTAATTTCCCAAGACAATATTTTGTTTGAAATTCAGTATGCTAATGACTAAAAAAAAAAAAAAAAAAA]
[+] EMBL CD081734 [AGCCATATTCGGCACGAGGGTTACTGTGTAGTTTCCCACCGTACTCCTATAAATGTCGATA AAAGGTGGGGATCGGTTAACTTATTTTATGGCTCATGTCCGGGATTTCTTTATGGGAAGGAAATATAATAATTGTCTTAGATATGCTGAACAGTGCTCGAAACGAACTCAACCACTTGCTTATCTTCCCAACGGCATAAATGACAAAATATCACATAATGATTACTTTGCTCGAGATGGGCGACGCGAAGTTAGGAAATCTGTTGATATTTATGTTTCTGGCTTAAAAAGGCTTGAAGCTAGGTCAGAGTCTAAGCGTCCAAATGTTCTATCAAAGTCGATTGATGTTGTCCCGGGACAAAAGTTTGACTGGGATAAACCAGTAGAATCAAAATGAACTAAATCATTTGGTTTCTCTCGCTCCAACTATTCAGTATTTGGGTACATAAAGTGATTTTGATTCATTTCACCTAACGTAGTGTTTTTTCCCGTTCTAGACTTCATCCATTAAGCATTATATAGCCCTTTGTTACTCATAGTAACGTAAAAAGTATGTACATTTCATATTTTGGTCTTGCCTTTTTTCTATATAGTTATTGTTAGTGGTTTTGATGATACGTAATTTACGTCCATCCAAGACATGGATTTGACGTTTGTTGATAGCCTTTGTTAATAAAATAGTAATAGTGTCTTTCGTAGTATCTAATTTCCCAAGACAATATTTTG ]
[-] EMBL CD075467 [ TTACTGTGTAGTTTCCCACCGTACTCCTATAAATGTCGATA AAAGGTGGGGATCGGTTAACTTATTTTATGGCTCATGTCCGGGATTTCTTTATGGGAAGGAAATATAATAATTGTCTTAGATATGCTGAACAGTGCTCGAAACGAACTCAACCACTTGCTTATCTTCCCAACGGCATAAATGACAAAATATCACATAATGATTACTTTGCTCGAGATGGGCGACGCGAAGTTAGGAAATCTGTTGATATTTATGTTTCTGGCTTAAAAAGGCTTGAAGCTAGGTCAGAGTCTAAGCGTCCAAATGTTCTATCAAAGTCGATTGATGTTGTCCCGGGACAAAAGTTTGACTGGGATAAACCAGTAGAATCAAAATGAACTAAATCATTTGGTTTCTCTCGCTCCAACTATTCAGTATTTGGGTACATAAAGTGATTTTGATTCATTTCACCTAACGTAGTGTTTTTTCCCGTTCTAGACTTCATCCATTAAGCATTATATAGCCCTTTGTTACTCATAGTAACGTAAAAAGTATGTACATTTCATATTTTGGTCTTGCCTTTTTTCTATATAGTTATTGTTAGTGGTTTTGATGATACGTAATTTACGTCCATCCAAGACATGGATTTGACGTTTGTAAATTGCCTTTGTTAATAAAATAGTAATAGTGTCTTTCGTAGTATCTAATTTCGCTTGCCAATATTTnta ]
[+] EMBL CD097754 [ CCACCGTACTCCTATAAATGTCGATATAAAGGTGGGGATCGGTTAACTTATTTTATGGCTCATGTCCGGGATTTCTTTATGGGAAGGAAATATAATAATTGTCTTAGATATGCTGAACAGTGCTCGAAACGAACTCAACCACTTGCTTATCTTCCCAACGGCATAAATGACAAAATATCACATAATGATTACTTTGCTCGAGATGGGCGACGCGAAGTTAGGAAATCTGTCGATATTTATGTTTCTGGCTTAAAACGGCTTGAAGCTAGGTCAGAGTCTAAGCGTCCAAATGTTCTATCAAAGTCGATTGATGTTGTCCCGGGACAAAAGTTTGACTGGGATAAACC ]
[-] EMBL CD097794 [ CACCGTACTCCTATAAATGTCGATA AAAGGTGGGGATCGGTTAACTTATTTTATGGCTCATGTCCGGGATTTCTTTATGGGAAGGAAATATAATAATTGTCTTAGATATGCTGAACAGTGCTCGAAACGAACTCAACCACTTGCTTATCTTCCCAACGGCATAAATGACAAAATATCACATAATGATTACTTTGCTCGAGATGGGCGACGCGAAGTTAGGAAATCTGTTGATATTTATGTTTCTGGCTTAAAAGGGCTTGAAGCTAGGTCAGAGTCTAAGCGTCCAAATGTTCTATCAAAGTCGATTGATGTTGTCCCGGGACAAAAGTTTGACTGGGATAAACCAGTAGAATCAAAATGAACTAAATCATTTGGTTTCTCTCGCT ]
[-] EMBL CD098034 [ GTACTCCTATAAATGTCGATA AAAGGTGGGGATCGGTTAACTTATTTTATGGCTCATGTCCGGGATTTCTTTATGGGAAGGAAATATAATAATTGTCTTAGATATGCTGAACAGTGCTCGAAACGAACTCAACCACTTGCTTATCTTCCCAACGGCATAAATGACAAAATATCACATAATGATTACTTTGCTCGAGATGGGCGACGCGAAGTTAGGAAATCTGTTGATATTTATGTTTCTGGCTTTAAAAGGCTTGAAGCTAGGTCAGAGTCTAAGCGTCCAAATGTTCTATCAAAGTCGATTGATGTTGTCCCGGGACAAAAGGTTGACTGGGATAAACCAGTAGAATCGAAATGAACTAAATCATTTGGTTTCTCTCGCT ]
[+] EMBL CD080639 [ TGGGGATCGGTTAACTTATTTTATGGCTCATGTCCGGGATTTCTTTATGGGAAGGAAATATAATAATTGTCTTAGATATGCTGAACAGTGCTCGAAACGAACTCAACCACTTGCTTATCTTCCCAACGGCATAAATGACAAAATATCACATAATGATTACTTTGCTCGAGATGGGCGACGCGAAGTTAGGAAATCTGTTGATATTTATGTTTCTGGCTTAAAAAGGCTTGAAGCTAG GTCTAAGCGTCCAAATGTTCTATCAAAGTCGATTGATGTTGTCCCGGGACAAAAGTTTGACTGGGATAAACCAGTAGAATCAAAATGAACTAAATCATTTGGTTTCTCTCGCTCCAACTATTCAGTATTTGGGTACATAAAGTGATTTTGATTCATTTCACCTAACGTAGTGTTTTTTCCCGTTCTAGACTTCATCCATTAAGCATTATATAGCCCTTTGTTACTCATAGTAACGTAAAAAGTATGTACATTTCATATTTTGGTCTTGCCTTTTTTCTATATAGTTATTGTTAGTGGTTTTGATGATACGTAATTTACGTCCATCCAAGACATGGATTTGACGTTTGTTGATTGCCTTTGTTAATAAAATAGTAATAGTGTCTTTCGTAGTATCTAATTTCCC AGACAATATTTTGTTT ]
[-] EMBL CD074552 [ GTTAACTTATTTTATGGCTCATGTCCGGGATTTCTTTATGGGAAGGAAATATAATAATTGTCTTAGATATGCTGAACAGTGCTCGAAACGAACTCAACCACTTGCTTATCTTCCCAACGGCATAAATGACAAAATATCACATAATGATTACTTTGCTCGAGATGGGCGACGCGAAGTTAGGAAATCTGTTGATATTTATGTTTCTGGCTTAAAAAGGCTTGAAGCTAG GTCTAAGCGTCCAAATGTTCTATCAAAGTCGATTGATGTTGTCCCGGGACAAAAGTTTGACTGGGATAAACCAGTAGAATCAAAATGAACTAAATCATTTGGTTTCTCTCGCTCCAACTATTCAGTATTTGGGTACATAAAGTGATTTTGATTCATTTCACCTAACGTAGTGTTTTTTCCCGTTCTAGACTTCATCCATTAAGCATTATATAGCCCTTTGTTACTCATAGTAACGTAAAAAGTATGTACATTTCATATTTTGGTCTTGCCTTTTTTCTATATAGTTATTGTTAGTGGTTTTGATGATACGTAATTTACGTCCATCCAAGACATGGATTTGACGTTTGTTGATTGCCTTTGTTAATAAAATAGTAATAGTGTCTTTCGTAGGATCTAATTTCCCAAGAAAATATTTTGTTTG ]
[-] EMBL CD077247 [ AATATAATAATTGTCTTAGATATGCTGAACAGTGCTCGAAACGAACTCAACCACTTGCTTATCTTCCCAACGGCATAAATGACAAAATATCACATAATGATTACTTTGCTCGAGATGGGCGACGCGAAGTTAGGAAATCTGTTGATATTTATGTTTCTGGCTTAAAAAGGCTTGAAGCTAGGTCAGAGTTTAAGCGTCCAAATGTTCTATCAAAGTCGATTGATGTTGTCCCGGGACAAAAGTTTGACTGGGATAAACCAGTAGAATCAAAATGAACTAAATCATTTGGTTTCTCTCGCTCCAACTATTCAGTATTTGGGTACATAAAGTGATTTTGATTCATTTCACCTAACGTAGTGTTTTTTCCCGTTCTAGACTTCATCCATTAAGCATTATATAGCCCTTTGTTACTCATAGTAACGTAAAAAGTATGTACATTTCATATTTTGGTCTTGCCTTTTTTCTATATAGTTATTGTTAGTGGTTTTGATGATACGTAATTTACGTCCATCCAAGACATGGATTTGACGTTTGTTGATTGCCTTTGTTAATAAAATAGTAATAGTGTCTTTCGTAGTATCTAATTTCCCAAGACAATt ]
[+] EMBL SMT14360 [ nATTGTCTTAGATATGCTGAACAGTGCTCGAAACGAACTCAACCACTTGCTTATCTTCCCAACGGCATAAATNACAAAATATCACATAATGATTACTTTGCTCGAGATGGGCGACGCGAAGTTAGGAAATCTGTTGATATTTATGTTTCTGGCTTAAAAAGGCTTGAAGCTAGGTCAGAGTCTAAACGTCCAAATGTTCTATCAAAGTCGATTGATGTTGTCCCGGGACAA ]
[+] EMBL CD145837 [ ACATAATGATTACTTTGCTCGAGATGGGCGACGCGAAGTTAGGAAATCTGTTGATATTTATGTTTCTGGCTTAAAAAGGCTTGAAGCTAGGTCAGAGTCTAAGCGTCCAAATGTTCTATCAAAGTCGATTGATGTTGTCCCGGGACAAAAGTTTGACTGGGATAAACCAGTAGAATCAAAATGAACTAAATCATTTGGTTTCTCTCGCTCCAACTATTCAGTATTTGGGTACATAAAGTGATTTTGATTCATTTCACCTAACGTAGTGTTTTTTCCCGTTCTAGACTTCATCCATTAAGCATTATATAGCCCTTTGTTACTCATAGTAACGTAAAAAGTATGTACATTTC ]
[-] EMBL AI395701 [ ACT AATCATTTGG TTCTCTCGCTCCAACTATTCAGTATTTGGGTACATAAAGTGA TTTGATTCATTTCACCTAACGTAGTGTTTTTTCCCGTTCTAGACTTCATCCATTAAGCATTATATAACCCTTTGTTACTCATAGTAACGTAAAAAGTATGTACATTTCATATTTTGGTCTTACCTTTTTTCTATATAGTTATTGTTAGTGGTTTTGATGATACGTAATTTACGTCCATCCAAGACATGGATTTGACGTTTGTTGATTGCCTTTGTTAATAAAATAGTAATAGTGTCTTTCGTAGTATCTAATTTCCCAAGACAATATTTTGTTTGAAATTCAGTATGCTAATGACTAAAAAAAAAAAAAAAAAAA]
[-] EMBL SMT14359 [ AACGTAGTGTTTTTTCCCGTTCTAGACNTCATCCATTAAGCATTATATAACCCTTTGTTACTCATAGTANCGTAAAAAGTATGTACATTTCATATTTTGGTCTTACCTTTTTTCTATATAGTTATTGTTAGTGGTTTTGATGATACGTAATTTACGTCCATCCAAGACATGGATTTGACGTTTGTTGATTGCCTTTGTTAATAAAATAGTAATAGTGTCTTTCGTAGTATCTAATTTCCCAAGACAATATTTTGTTTGAAATTCAGTATG ]
consensusID : consensus_10441#1 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 4 consensus length = 434 fasta sequence
[TCTGGAGGGGGGCTGGGCGGGATTTACTTACTGTTACTGTGTAGTTTCCCACCGTACTCCTATAAATGTCGATAAAAGGTGGGGATCGGTTAACTTATTTTATGGCTCATGTCCGGGATTTCTTTATGGGAAGGAAATATAATAATTGTCTTAGATATGCTGAACAGTGCTCGAAACGAACTCAACCACTTGCTTATCTTCCCAACGGCATAAATGACAAAATATCACATAATGATTACTTTGCTCGAGATGGGCGACGCGAAGTTAGGAAATCTGTTGATATTTATGTTTCTGGCTTAAAAAGGCTTGAAGCTTGGTCAGAGTCTAAGCGTCCAAATGTTCTATCAAAGTCGATTGATGTTGTCCCGGGACAAAAGTTTGACTGGGATAAACCAGTAGAATCAAAATGAACTAAATCATTTGGTTTCTCTCGC]
[+] EMBL CD097860 [TCTGGAGGGGGGCTGGGCGGGATTTACTTACTGTTACTGTGTAGTTTCCCACCGTACTCCTATAAATGTCGATAAAAGGTGGGGATCGGTTAACTTATTTTATGGCTCATGTCCGGGATTTCTTTATGGGAAGGAAATATAATAATTGTCTTAGATATGCTGAACAGTGCTCGAAACGAACTCAACCACTTGCTTATCTTCCCAACGGCATAAATGACAAGATATCACATAATGATTACTTTGCTCGAGATGGGCGACGCGAAGTTAGGAAATCTGTTGATATTTATGTTTCTGGCTTAAAAAGGCTTGAAGCTTGGTCAGAGTCTAAGCGTCCAAATGTTCTATCAAAGTCGATTGATGTTGTCCCGGGACAAAAGTTTGACTGGGATAAACCAGTAGAATCAAAATGAACTAAATCATTTGGTTTCTCTCGC]
[-] EMBL CD190143 [ GGGCTGGGCGGGATTTACTTACTGTTACTGTGTAGTTTCCCACCGTACTCCTATAAATGTCGATAAAAGGTGGGGATCGGTTAACTTATTTTATGGCTCACGTCCGGGATTTCTTTATGGGAAGGAAATATAATAATTGTCTTAGATATGCTGAACAGTGCTCGAAACGAACTCAACCACTTGCTTATCTTCCCAACGGCATAAATGACAAAATATCACATAATGATTACTTTGCTCGAGATGGGCGACGCGAAGTTAGGAAATCTGTTGATATTTATGTTTCTGGCTTAAAAgg ]
[+] EMBL CD077494 [ gaggTGGGCGGGATTTACTTACTGTTACTGTGTAGTTTCCCACCGTACTCCTATAAATGTCGATAAAAGGTGGGGATCGGTTAACTTA TTATGGCTCATGTCCGGGATTTCTTTATGGGAAGGAAATATAATAATTGTCTTAGATATGCTGAACAGTGCTCGAAACGAACTCAACCACTTGCTTATCTTCCCAACGGCATANATGACANAATATCACATAATGATTACTTTGCTCG ]
[+] EMBL CD183518 [ GGCGGGATTTACTTACTGTTACTGTGTAGTTTCCCACCGTACTCCTATAAATGTCGATAAAAGGTGGGGTTCGGTTAACTTATTTTATGGCTCATGTCCGGGATTTCTTTATGGGAAGGAAATATAATAATTGTCTTAGATATGCTGAACAGTGCTCGAAACGAACTCAACCACTTGCTTATCTTCCCAACGGCATAAATGACAAAATATCACATAATGATTACTTTGCTCGGGATGGGCGACGCGAAG TAGGAAATCTGTTGATATTTATGTTTCTGGCTTAAAA ]
consensus multiple alignement with clustalw CLUSTAL W (1.82) multiple sequence alignment
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consensus_10441#1 TCTGGAGGGGGGCTGGGCGGGATTTACT--TACTGTTACTGTGTAGTTTCCCACCGTACT 58
** *** * **************************
consensus_10441#0 CCTATAAATGTCGATAAAAGGTGGGGATCGGTTAACTTATTTTATGGCTCATGTCCGGGA 105
consensus_10441#1 CCTATAAATGTCGATAAAAGGTGGGGATCGGTTAACTTATTTTATGGCTCATGTCCGGGA 118
************************************************************
consensus_10441#0 TTTCTTTATGGGAAGGAAATATAATAATTGTCTTAGATATGCTGAACAGTGCTCGAAACG 165
consensus_10441#1 TTTCTTTATGGGAAGGAAATATAATAATTGTCTTAGATATGCTGAACAGTGCTCGAAACG 178
************************************************************
consensus_10441#0 AACTCAACCACTTGCTTATCTTCCCAACGGCATAAATGACAAAATATCACATAATGATTA 225
consensus_10441#1 AACTCAACCACTTGCTTATCTTCCCAACGGCATAAATGACAAAATATCACATAATGATTA 238
************************************************************
consensus_10441#0 CTTTGCTCGAGATGGGCGACGCGAAGTTAGGAAATCTGTTGATATTTATGTTTCTGGCTT 285
consensus_10441#1 CTTTGCTCGAGATGGGCGACGCGAAGTTAGGAAATCTGTTGATATTTATGTTTCTGGCTT 298
************************************************************
consensus_10441#0 AAAAAGGCTTGAAGCTAGGTCAGAGTCTAAGCGTCCAAATGTTCTATCAAAGTCGATTGA 345
consensus_10441#1 AAAAAGGCTTGAAGCTTGGTCAGAGTCTAAGCGTCCAAATGTTCTATCAAAGTCGATTGA 358
**************** *******************************************
consensus_10441#0 TGTTGTCCCGGGACAAAAGTTTGACTGGGATAAACCAGTAGAATCAAAATGAACTAAATC 405
consensus_10441#1 TGTTGTCCCGGGACAAAAGTTTGACTGGGATAAACCAGTAGAATCAAAATGAACTAAATC 418
************************************************************
consensus_10441#0 ATTTGGTTTCTCTCGCTCCAACTATTCAGTATTTGGGTACATAAAGTGATTTTGATTCAT 465
consensus_10441#1 ATTTGGTTTCTCTCGC-------------------------------------------- 434
****************
consensus_10441#0 TTCACCTAACGTAGTGTTTTTTCCCGTTCTAGACTTCATCCATTAAGCATTATATAGCCC 525
consensus_10441#1 ------------------------------------------------------------
consensus_10441#0 TTTGTTACTCATAGTAACGTAAAAAGTATGTACATTTCATATTTTGGTCTTGCCTTTTTT 585
consensus_10441#1 ------------------------------------------------------------
consensus_10441#0 CTATATAGTTATTGTTAGTGGTTTTGATGATACGTAATTTACGTCCATCCAAGACATGGA 645
consensus_10441#1 ------------------------------------------------------------
consensus_10441#0 TTTGACGTTTGTTGATTGCCTTTGTTAATAAAATAGTAATAGTGTCTTTCGTAGTATCTA 705
consensus_10441#1 ------------------------------------------------------------
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consensus_10441#1 ------------------------------------------------------------
consensus_10441#0 AAAAA 770
consensus_10441#1 -----
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| Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) | ||||