|
These datas are free for academic use only, please contact me for any other use. Schistosoma mansoni see consensus multiple alignment with clustalw Direct access to contigs :
consensusID : consensus_10454#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 16 consensus length = 2036 fasta sequence
[GTGGAGACAGAAGCAGTAACACCATTCTTGTTGTCAATAGCGACAGGTGCTAAGTTGTTGTTGTCGGTTGTGTTATTATTATTATTAGTAGTAGTAGTAGGATGGCTACTACTGCTACATCCACCTCCAGTATTAATATTATCTGATTGTACTTGACATTGTACAGCAGCTGATCTTAATGAACATAAACAATTATTTTGTGATGCTAATGCAGCATTTATTCCATCATCAAATCCATCATCACGTTCTTCATTACCAGTAGCTGGTCTTGCAAAATCCCATATTAATATAGTATCATCATGTGATGATGAAACAATTTGAAAATCATCAAATTGTAAACGAAATACACGACCAGTATGCTGTTGTAATGTATGAATACATAATTGATTTGGTTTAGAACGAGGATTGAGTGCAGCTTTTAAATTCCATACTTTAATTTTACCATCATAAGCACCTGATACAATACGTTTAGAGTCAAAGCGAATACACCGAACTAGTTCTTCATGCCCTTCAAGAACTCTGAAACACACACCAGTCTCAATATCCCAAATACGAATTGTATTATCGGAACTTCCAGAAACCACTAATCGATCACGATATTGTAGACAAGCAATACCTCGACGATGACCTGTCAATGTACGCACGTAAGCACATGTATCCGTAGCCCAAACTTTGATTGTACGATCACCGCTGGCTGAAACAATGTACTTATCATCGAAATCAACAACATTAACAGCAGCTCGATGTCCAACAAGAACTTGACGTAACTGAACATC-TTTGGCCAAGGACCCATATCCCATACTGCAATACTGCGATCTTTTGAACATGTTACTAGAATATTATTGCGAAACCGTAAATGTAGCACAGCTTCAGCATGATGATTGATAACATTTAAACAGCATCCAGTGGACAAATCCCATAAACGAACTGTTGTATCACTGGAACCACTGATTAGCAAATTCCCGATATATTGCAAACATAAAACGGAACCTGAATGTCCTTCAAGGACTTGTGTACAGCGGTAACCGTCGGAGCACGTTGCTTCATTGAAACCTTCTTGATTTGGTGCTTCAACAGCTGCGGGAGCAGCTGTGGGAGCATCACTCCTCCCCCTGACTTTATGCCCAGACTCATCAGGATTGGGAGTAGTAGTACAATCAGAACTAGATCCTTTATTTTTATTGATTGCACAAATGTTTGGAATTCTTTGCCATACCTTGATAGTATCATCTCTTAGACCACTAACAATTTTATGCTTATCATACTGAAGACAATAGACGCCCTTTGTGACATCACTTCGACATGGTATCCGAGTTAAATGATACTGACCACGGGTCCAGTTATCTTCAACGCGTGCTATATCACGAATTATTCGAGGATAGAGTTGTTTGTAGAAGCGATGGGCAAACATAACTGTCTCGTAGGAAAGTGCATCATG---TAGATCTGTCTCCATGGAAAAAGAAGCTGCATTCACGGACCGATGATTTAATCCATCATTGATATTATATGGGCTTAAAGAACAACTAGGTGTGTTGGATGCATCAGTTGTAGAATCTCTTGAAAATGGGATACTTTGAGTTCTCGATACGTAGGAGTGTCTATCAGTAGGATATATTAAAGAATGCTGAATGTCTGATTGACACTGACATACTAGAGATTGCTGACGATTTACACTACAGGTTGATTCTAGTTTTGGAGAAAGTTTGGATGCTTCACATTCCATGCATGAATTACTATCAAGGAATGG-GGAGAATTCGGTTAGTTTATGTCTAACACCTATGGGGACCCGACGTCTTTCGAGTAAGGCAGGTAAATAAGCTGGATCAGAATGTTTAATAAATTCAATCCATCCTCTACGTTCACAAAGCCCATGCCAAACTGGATCAGTAGCTACACGACAGGCTAGTAGACGACGCCAAAGTTGGTACTTTGCAACACTCCATTGCCATCCCCTAGAAGCGAGCTCGACTGANAGAAGACTAGATGCATCTAGCTGGACTAAAATCATTTCAGCAAGATAAGGAACACCGCGATTN]
[-] EMBL CD120735 [GTGGAGACAGAAGCAGTAACACCATTCTTGTTGTCAATAGCGACAGGTGCTAAGTTGTTGTTGTCGGTTGTGTTATTATTATTATTAGTAGTAGTAGTAGGATGGCTACTACTGCTACATCCACCTCCAGTATTAATATTATCTGATTGTACTTGACATTGTACAGCAGCTGATCTTAATGAACATAAACAATTATTTTGTGATGCTAATGCAGCATTTATTCCATCATCAAATCCATCATCACGTTCTTCATTACCAGTAGCTGGTCTTGCAAAATCCCATATTAATATAGTATCATCATGTGATGATGAAACAATTTGAAAATCATCAAATTGTAAACGAAATACACGACCAGTATGCTGTTGTAATGTATGAATACATAATTGATTTGGTTTAGAACGAGGATTGAGTGCAGCTTTTAAATTCCATACTTTAATTTTACC ]
[-] EMBL CD116666 [GTGGAGACAGAAGCAGTAACACCATTCTTGTTGTCAATAGCGACAGGTGCTAAGTTGTTGTTGTCGGTTGTGTTATTATTATTATTAGTAGTAGTAGTAGGATGGCTACTACTGCTACATCCACCTCCAGTATTAATATTATCTGATTGTACTTGACATTGTACAGCAGCTGATCTTAATGAACATAAACAATTATTTTGTGATGCTAATGCAGCATTTATTCCATCATCAAATCCATCATCACGTTCTTCATTACCAGTAGCTGGTCTTGCAAAATCCCATATTAATATAGTATCATCATGTGATGATGAAACAATTTGAAAATCATCAAATTGTAAACGAAATACACGACCAGTATGCTGTTGTAATGTATGAATACATAATTGATTTGGTTTAGAACGAGGATTGAGTGCAGCTTTTAAATTCCATACTTTAATTTTACC ]
[+] EMBL CD169364 [ ATTATTATTAGTAGTAGTAGTAGGATGGCTACTACTGCTACATCCACCTCCAGTATTAATATTATCTGATTGTACTTGACATTGTACAGCAGCTGATCTTAATGAACATAAACAATTATTTTGTGATGCTAATGCAGCATTTATTCCATCATCAAATCCATCATCACGTTCTTCATTACCAGTAGCTGGTCTTGCAAAATCCCATATTAATATAGTATCATCATGTGATGATGAAACAATTTGAAAATCATCAAATTGTAAACGAAATACACGACCAGTATGCTGTTGTAATGTATGAATACATAATTGATTTGGTTTAGAACGAGGATTGAGTGCAGCTTTTAAATTCCATACTTTAATTTTACCATCATAAGCACCTGATACAATACGTTTAGAGTCAAAGCGAATACACCGAACT ]
[+] EMBL CD153854 [ CAGTAGCTGGTCTTGCAAAATCCCATATTAATATAGTATCATCATGTGATGATGAAACAATTTGAAAATCATCAAATTGTAAACGAAATACACGACCAGTATGCTGTTGTAATGTATGAATACATAATTGATTTGGTTTAGAACGAGGATTGAGTGCGGCTTTTAAATTCCATACTTTAATTTTACCATCATAAGCACCTGATACAATACGTTTAGAGTCAAAGCGAATACACCGAACTAGTTCTTCATGCCCTTCAAGAACTCTGAAACACACACCAGTCTCAATATCCCAAATACGAATTGTATTATCGGAACTTCCAGAAACCACTAATCGATCACGATATTGTAGACAAGCAATACCTCGACGATGACCTGTCAATGTACGCACGTAAGCACATGTATCCGTAGCCCAAACTTTGATTGTACGATCACCGC ]
[-] EMBL CD117127 [ GATTGAGTGCAGCTTTTAAATTCCATACTTTAATTTTACCATCATAAGCACCTGATACAATACGTTTAGAGTCAAAGCGAATACACCGAACTAGTTCTTCATGCCCTTCAAGAACTCTGAAACACACACCAGTCTCAATATCCCAAATACGAATTGTATTATCGGAACTTCCAGAAACCACTAATCGATCACGATATTGTAGACAGGCAATACCTCGACGATGACCTGTCAATGTACGCACGTAAGCACATGTATCCGTAGCCCAAACTTTGATTGTACGATCACCGCTGGCTGAAACAATGTACTTATCATCGAAATCAACAACATTAACAGCAGCTCGATGTCCAACAAGAACTTGACGTAACTGAACATCTTTTGGCCAAGGACCCATATCCCATACTGCAATACTGCGATCTTTTGAACATGTTACTAGAATATTATTGCGAAACCGTAAATGTAGCACAGCTTCAGCATGATGATTGATAACATTTAAACAGCATCCAGTGGACAAATCCCATAAACGAACTGTTGTATCACTGGAACCACTGATTAGCAAATTCCCGATATATTGCAAACATAAAA ]
[-] EMBL CD117137 [ CTTATCATGGAAATCAACAACATTAACAGCAGCTCGATGTCCAACAAGAACTTGACGTAGCTGAACATCTTTTGGCCAAGGACCCATATCCCATACTGCAATACTGCGATCTTTTGAACATGTTACTAGAATATTATTGCGAAACCGTAAATGTAGCACAGCTTCAGCATGATGATTGATAACATTTAAACAGCATCCAGTGGACAAATCCCATAAACGAACTGTTGTATCACTGGAACCACTGATTAGCAAATTCCCGATATATTGCAAACATAAAA ]
[-] EMBL CD117343 [ ACTTGACGTAACTGAACATC TTTGGCCAAGGACCCATATCCCATACTGCAATACTGCGATCTTTTGAACATGTTACTAGAATATTATTGCGAAACCGTAAATGTAGCACAGCTTCAGCATGATGATTGATAACATTTAAACAGCATCCAGTGGACAAATCCCATAAACGAACTGTTGTATCACTGGAACCACTGATTAGCAAATTCCCGATATATTGCGAACATAAAACGGAACCTGAATGTCCTTCAAGGACTTGTGTACAGCGGTAACCGTCGGAGCACGTTGCTTCATTGAAACCTTCTTGATTTGGTGCTTCAACAGCTGCGGGAGCAGCTGTGGGAGCATCACTCCTCCCCCTGACTTTATGCCCAGACTCATCAGGATTGGGAGTAGTAGTACAATCAGAACTAGATCCTTTATTTTTATTGATTGCACAAATGTTTGGAATTCTTTGCCATACCTTGATAGTATCATCTCTTAGACCACTAACAATTTTATGCTTATCATACTGAAGACAATAGACGCCCTTTGTGACATCAC ]
[+] EMBL CD137398 [ TTGTATCACTGGAACCACTGATTAGCAAATTCCCGATATATTGCAAACATAAAACGGAACCTAAATGTCCTTCAAGGACTTGTGTACAGCGGTAACCGTCGGAGCACGTTGCTTCATTGAAACCTTCTTGATTTGGTGCTTCAACAGCTGCGGGAGCAGCTGTGGGAGCATCACTCCTCCCCCTGACTTTATGCCCAGACTCATCAGGATTGGGAGTAGTAGTACAATCAGAACTAGATCCTTTATTTTTATTGATTGCACAAATGTTTGGAATTCTTTGCCATACCTTGATAGTATCATCTCTTAGACCACTAACAATTTTATGCTTATCATACTGAAGACAATAGACGCCCTTTGTGACATCACTTCGACATGGTATCCGAGTTAAATGATACTGACCACGGGTCCAGTTATCTTCAACGCGTGCTATATCACGAATTATTCGAGGATAGAGTTGTTTGTAGAAGCGATGGGCAAACATAACTGTCTCGTAGGAAAGTGCATCATG TAGATCTGTCTCCATGGAANAAGAAGCTGCATTCACGGACCGATGATTTAATCCATCATTGATATTATATGGGCTTAAAGAAC ACTAGGTGTGTTGGATGCA ]
[+] EMBL CD120174 [ TTGTATCACTGGAACCACTGATTAGCGAATTCCCGATATATTGCAAACATAAAACGGAACCTGAATGTCCTTCAAGGACTTGTGTACAGCGGTAACCGTCGGAGCACGCTGCTTCATTGAAACCTTCTTGATTTGGAGCTTCAACAGCTGCGGAAGCA ]
[+] EMBL CD154093 [ AAACCTTCTTGATTTGGTGCTTCAACAGCTGCGGGAGCAGCTGTGGGAGCATCACTCCTCCCCCTGACTTTATGCCCAGACTCATCAGGATTGGGAGTAGTAGTACAATCAGAACTAGATCCTTTATTTTTATTGATTGCACAAATGTTTGGAATTCTTTGCCATACCTTGATAGTATCATCTCTTAGACCACTAACAATTTTATGCTTATCATACTGAAGACAATAGACGCCCTTTGTGACATCACTTCGACATGGTATCCGAGTTAAATGATACTGACCACGGGTCCAGTTATCTTCAACGCGTGCTATATCACGAATTATTCGAGGATAGAGTTGTTTGTAGAAGCGATGGGCAAACATAACTGTCTCGTAGGAAAGTGCATCATG TAGATCTGTCTCCATGGAAAAAGAAGCTGCATTCACGGACCGATGATTTAATCCATCATTGATATTATATGGGCTTAAAGAACAACTAGGTGTGTTGGATGCATCAGTTGTAGAATCTCTTGAAAATGGGATACTTTGAGTTCTCGATACGTAGGAGTGTCTATCAGTAGGATATATTANAGAATGCTGAATGTCTGATTGACACTGACATACTAGAGATTGCTGACGATTTACAC ]
[+] EMBL CD120433 [ TTATTTTTATTGATTGCACAAATGTTTGGAATTCTTTGCCATACCTTGATAGTATCATCTCTTAGACCACTAACAATTTTATGCTTATCATACTGAAGACAATAGACGCCCTTTGTGACATCACTTCGACATGGTAGCCGAGTTAAATGATACTGACCACGGGTCCAGTTATCTTCAACGCGTGCTATATCACGAATTATTCGAGGATAGAGTTGTTTGTAGAAGCGATGGGCAAACATAACTGTCTGGTAGGAAAGTGCATCATG TAGATCTGTCTCCATGGAAAAAGAAGCTGCATTCACGGACCGATGATTTAATCCATCATTGATATTATATGGGCTTAAAGAACAACTAGGTGTGTTGGATGCATCAGTTGTAGAATCTCTTCAAAATGGGATACTTTGAGTTCTCGATACGTAGGAGTGTCTATCAGTAGGATATATTAAAGAATGCTGAATGTCTGATTGACACTGACATACTAGAGATTGCTGACGATTTACACTACAGGNTGATTCTAGTTTTGGAGAAAAGTTGGATGCTTCACATTCCATGCATNGATTACTATCAGGGAATGGNGGAGAA TCGGNTAGTTTAT ]
[-] EMBL CD162330 [ TAGTATCATCTCTTAGACCACTAACAATTTTATGCTTATCATACTGAAGGCAATAGACGCCCTTTGTGACATCACTTCGACATGGTATCCGAGTTAAATGATACTGACCACGGGTCCAGTTATCTTCAACGCGTGCTATATCACGAATTATTCGAGGATAGAGTTGTTTGT GAAGCGATGGGCAAACATAACTGTCTCGTAGGAAA ]
[-] EMBL CD162254 [ TAGTATCATCTCTTAGACCACTAACAATTTTATGCTTATCATACTGAAGACAATAGACGCCCTTTGTGACATCACTTCGACATGGTATCCGAGTTAAATGATACTGACCACGGGTCCAGTTATCTTCAACGCGTGCTATATCACGAATTATTCGAGGATAGAGTTGTTTGTAGAAGCGATGGGC AACATAACTGTCTCGTAGGAAAGTGCATCATGCAAGAGACTTGTC CCATCGAttcc ]
[-] EMBL CD062223 [ CTTATCATACTGAAGACGATAGACGCCCTTTGTGACATCACTTCGACATGGTATCCGAGTTAAATGATACTGACCACGGGTCCGGTTATCTTCAACGCGTGCTATATCACGAATTATTCGAGGATAGAGTTGTTTGTAGAGGCGATGGGCAAACATAACTGTCTCGTAGGAAAGTGCATCATG TAGATCTGTCTCCATGGAAAAAGAAGCTGCATTCACGGACCGATGATTTAATCCATCATTGATATTATATGGGCTTAAAGAACAACTAGGTGTGTTGGATGCATCAGTTGTAGAATCTCTTGAAAATGGGATACTTTGAGTTCTCGATACGTAGGAGTGTCTACCAGTAGGATATATTAAAGAATGCTGAATGTCTGATTGACACTGACATACTAGAGATTGCTGACGATTTACACTACAGGTTGATTCTAGTTTTGGAGAAAGTTTGGATGCTTCACATTCCATGCATGAATTACTATCAAGGAATGG GGAGAATTCGGTTAGTTTATGTCTAACACCTATGGGGACCCGACG ]
[+] EMBL CD118769 [ CATCATTGATATTATATGGGCTTAAAGAACAACTAGGTGTGTTGGATGCATCAGTTGTAGAATCTCTTGAAAATGGGATACTTTGAGTTCTCGATACGTAGGAGTGTCTATCAGTAGGATATATTAAAGAATGCTGAATGTCTGATTGACACTGACATACTAGAGATTGCTGACGATTTACACTACAGGTTGATTCTAGTTCTGGAGAAAGTTTGGATGCTTCACATTCCATGCATGAATTACTATCAAGGAATGG GGAGAATTCGGTTAGTTTATGTCTAACACCTATGGGGACCCGACGTCTTTCGAGTAAGGCAGGTAAATAAGCTGGATCAGAATGTTTAATAAATTCAATCCATCCTCTACGTTCACAAAGCCCATGCCAAACTGGATCAGTAGCTACACGACAGGCTAGTAGACGACGCCAAAGTTGGTACTTTGCAACACTCCATTGCCATCCCCTAGAAGCGAGCTCGACTGANAGAAGACTAGATGCATCTAGCTGGACTAAAATCATTTCAGCAAGATAAGGAACACCGCGATTN]
[-] EMBL CD195214 [ CTTGAAAATGGGATACTTTGAGTTCTCGATACGTAGGAGTGTCTATCAGTAGGATATATTAAAGAATGCTGAATGTCTGATTGACACTGACATACTAGAGATTGCTGACGATTTACACTACAGGTTGATTCTAGTTTTGGAGAAAGTTTGGATGCTTCACATTCCATGCATGAATTACTATCAAGGAATGG GGAGAATTCGGTTAGTTTATGTCTAACACCTATGGGGACCCGACGTCTTTCGAGTAAGGCAGGTAAATAAGCTGGATCAGAATGTTCAATAAATTCAATCCATCCTCTACGTTCACAAAGCCCATGCCAAACTGGATCAGTAGCTACACGACAGGCTAGTAGACGACGCC ]
clustalw multiple alignements is not computed in this case |
| Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) | ||||