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Schistosoma mansoni
cluster # 10472 cluster # 10472       Sequences # 17       consensus # 2


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_10472#0 length = 1427 sequences # 16  
consensus_10472#1 length = 586 sequences # 1  

consensusID : consensus_10472#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 16
consensus length = 1427
fasta sequence
                              [TTGAAACGAAGTTCGAAAATGAGGCTGACCTTGAGCTTGTGGAGGCTATTTCCCAGTCGGGTTCATTTAGTACCATCCTTTGGAATACCTGGGAATATCAAAACTTTCTCTAGTACTACTAATGTGATTACAAATGCCAATTTGGATGCTCCTGCTGGATCAAAACACTTTCTAGGCCTAGGGTTTCATAAAGAGCTCCCAAAAGCTTGCTATGGTGGCCGCCATACTGTTGCAATGCTTCTTGGAGATGGTGTAGGACCCGAACTTCTATCATACGTCAAAGAAGTTTTTCAAGTTATTGGAGCTCCGATAGATTTTGAAGAAGTTGCCGTAAATCAAGAATCTGAAGATGCTACGTTTACTGATGCTCTACTTGCTATGAAACGCAATGGTGTTGGAATTAAAGGAAATTTTGCCACAGAACCAGGTCAATCGTCAAGAAATGTAGCTCTTCGTTTAAACCTGAATTTATATGCCTTTGTCCAACGATGTCGAAACTTTCCAGGGGTGGTTACACGTCATCAAAATGTTGATATCGTTATAATACGAGAGAATACAGAGGGTGAATATAGTCGGTTGGAGCACGAAAATGTTCCTGGAGTGGTAGAATCTTTGAAGATTATAACTAGAGAAAAATCCACTAGAATTGCCCAATTCGCATTTGATTATGCCGTTCGACATAACCGAAAAAAAGTCACAGCAGTACACAAAGCCAATATCATGAAATTGGGTGATGGTCTATTTTTGGATGTATGCTCTTCAATAGCTAAAAATTATCCACAGATTGAATTCAATCATATGATCATTGATAATACATGTATGCAGTTAGTTACTAAACCTCAACAATTCGATGTGATTGTTTTACCAAATTTATACGGAAATATAGTTGGTAATGTAGCAGCTGGCTTAGTCGGTGGAGCTGGTCTAACAACAGGCATAAATTTAGGCCCACAAAATGC-TTTGTTTGAAATGGGCACACGAAATTCCGGACGTTCATTAGCTGGAAAAAATATTGCTAATCCATGTGGTATGTTGCTAACATCAGCAGATATGTTAGAATATTTAGGTCATATTAAAGAAGCTAAACTTATTCGTGATTCAGTTGTTGATGTTATTGGTGAACAAAAAATACGTACAGCTGATTTGGGTGGTAGTTTTAAAACTAGTAAAGTGATTGAAGCAGTTTTGAAAAGTTTAAGAAATCAACTGGCATCGTGATACTGCAAATAATTGGAAGCTACTGCGTTTTTACTTAGCACATATATTTAAAGTATCCATATAGCTTTCAGCACTGTACGCTGTAATTTGGTCTTTCTTCGCTCCTGTCCTATCTTCAGGTTAACACATTTAGTGAAACAACGAATTCATATCCATGTTATCGTATAAATTATATACGTTCACTTTGAAATATGCTTTAAATATATATA]

[+] EMBL CD186014             [TTGAAACGAAGTTCGAAAATGAGGCTGACCTTGAGCTTGTGGAGGCTATTTCCCAGTCGGGTTCATTTAGTACCATCCTTTGGAATACCTGGGAATATCAAAACTTTCTCTAGTACTACTAATGTGATTACAAATGCCAATTTGGATGCTCCTGCTGGATCAAAAC                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              ]
[+] EMBL CD146858             [                AAATGAGGCTGACCTTGAGCTTGTGGAGGCTATTTCCCAGTCGGGTTCATTTAGTACCATCCTTTGGAATACCTGGGAATATCAAAACTTTCTCTAGTACTACTAATGTGATTACAAATGCCAATTTGGATGCTCCTGCTGGATCAAAACACTTTCTAGGCCTAGGGTTTCATAAAGAGCTCCCAAAAGCTTGCTATGGTGGCCGCCATACTGTTGCAATGCTTCTTGGAGATGGTGTAGGACCCGAACTTCTATCATACGTCAAAGAAGTTTTTCAAGTTATTGGAGCTCCGATAGATTTTGAAGAAGTTGCCGTAAATCAAGAATCTGAAGATGCTACGTTTACTGATGCTCTACTTGCTATGAAACGCAATGGTGTTGGAATTAAAGGAAATTTTGCCACAGAACCAGGTCAATCGTCAAGAAATGTAGCTCTTCGTTTAAACCTGAATTTATATGCCTTTGTCCAACGATGTCGAAACTTTCCAGGGGTGGTTACACGTCATCAAAATGTTGATATCGTTATAATACGAGAGAATACAGAGGGTGAATATAGTCGGTTGGAGCACGAAAATGTTCCTGGAGTGGTAGAAT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  ]
[+] EMBL CD146717             [                AAATGAGGCTGACCTTGAGCTTGTGGAGGCTATTTCCCAGTCGGGTTCATTTAGTACCATCCTTTGGAATACCTGGGAATATCAAAACTTTCTCTAGTACTACTAATGTGATTACAAATGCCAATTTGGATGCTCCTGCTGGATCAAAACACTTTCTAGGCCTAGGGTTTCATAAAGAGCTCCCAAAAGCTTGCTATGGTGGCCGCCATACTGTTGCAATGCTTCTTGGAGATGGTGTAGGACCCGAACTTCTATCATACGTCAAAGAAGTTTTTCAAGTTATTGGAGCTCCGATAGATTTTGAAGAAGTTGCCGTAAATCAAGAATCTGAAGATGCTACGTTTACTGATGCTCTACTTGCTATGAAACGCAATGGTGTTGGAATTAAAGGAAATTTTGCCACAGAACCAGGTCAATCGTCAAGAAATGTAGCTCTTCGTTTAAACCTGAATTTATATGCCTTTGTCCAACGATGTCGAAACTTTCCAGGGGTGGTTACACGTCATCAAAATGTTGATATCGTTATAATACGAGAGAATACAGAGGGTGAATA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           ]
[+] EMBL CD131540             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       GCCGTAAATCAAGAATCTGAAGATGCTACGTTTACTGATGCTCTACTTGCTATGAAACGCAATGGTGTAGGAATTAAAGGAAATTTTGCCACAGAACCAGGTCAATCGTCAAGAAATGTAGCTCTTCGTTTAAACCTGAATTTATATGCCTTTGTCCAACGATGTCGAAACTTTCCAGGGGTGGTTACACGTCATCAAAATGTTGATATCGCTATAATACGAGAGAATACAGAGGGTGAATATAGTCGGTTGGAGCACGAAAATGTTCCTGGAGTGGTAGAATCTTTGAAGATTATAACTAGAGAAAAATCCACTAGAATTGCCCAATTCGCATTTGATTATGCCGTTC                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                ]
[+] EMBL CD131346             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       GCCGTAAATCAAGAATCTGAAGATGCTACGTTTACTGATGCTCTACTTGCTATGAAACGCAATGGTGTTGGAATTAAAGGAAATTTTGCCACAGAACCAGGTCAATCGTCAAGAAATGTAGCTCTTCGTTTAAACCTGAATTTATATGCCTTTGTCCAACGATGTCGAAACTTTCCAGGGGTGGTTACACGTCATCAAAATGTTGATATCGTTATAATACGAGAGAATACAGAGGGTGAATATAGTCGGTTGGAGCACGAAAATGTTCCTGGAGTGGTAGAATCTTTGAAGATTATAACTAGAGAAAAATCCACTAGAATTGCCCAATTCGCATTTGATTATGCCGTTC                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                ]
[+] EMBL CD139905             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             TAGCTCTTCGTTTAAACCTGAATTTATATGCCTTTGTCCAACGATGTCGAAACTTTCCAGGGGTGGTCACACGTCATCAAAATGTTGATATCGTTATAATACGAGAGAATACAGAGGGTGAATATAGTCGGTTGGAGCACGAAAATGTTCCTGGAGTGGTAGAATCTTTGAAGATTATAACTAGAGAAAAATCCACTAGAATTGCCCAATTCGCATTTGATTATGCCGTTCGACATAACCGAAAAAAAGTCACAGCAGTACACAAAGCCAATATCATGAAATTGGGTGATGGTCTATTTTTGGATGTATGCTCTTCAATAGCTANAAAT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              ]
[+] EMBL CD140020             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             TAGCTCTTCGTTTAAACCTGAATTTATATGCCTTTGTCCAACGATGTCGAAACTTTCCAGGGGTGGTTACACGTCATCAAAATGTTGATATCGTTATAATACGAGAGAATACAGAGGGTGAATATAGTCGGTTGGAGCACGAAAATGTTCCTGGAGTGGTAGAATCTTTGAAGATTATAACTAGAGAAAAATCCACTAGAATTGCCCAATTCGCATTTGATTATGCCGTTCGACATAACCGAAAAAAAGTCACAGCAGTACACAAAGCCAATATCATNGAATTGGGTGATGGTCTATTTTTGGATGTATGCTCTTTCATAGC                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     ]
[+] EMBL CD139876             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             TAGCTCTTCGTTTAAACCTGAATTTATATGCCTTTGTCCAACGATGTCGAAACTTTCCAGGGGTGGTTACACGTCATCAAAATGTTGATATCGTTATAATACGAGAGAATACAGAGGGTGAATATAGTCGGTTGGAGCACGAAAATGTTCCTGGAGTGGTAGAATCTTTGAAGATTATAACTAGAGAAAAATCCACTAGAATTGCCCAATTCGCATTTGATTATGCCGTTCGACATAACCGAAAAAAAGTCACAGCAGTA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   ]
[+] EMBL CD078331             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         GGTGATGGTCTATTTTTGGATGTATGCTCTTCAATAGCTAAAAATTATCCACAGATTGAATTCAATCATATGATCATTGATAATACATGTATGCAGTTAGTTACTAAACCTCAACAATTCGATGTGATTGTTTTACCAAATTTATACGGAAATATAGTTGGTAATGTAGCAGCTGGCTTAGTCGGTGGAGCTGGTCTAACAACAGGCATAAATTTAGGCCCACAAAATGC TTTGTTTGAAATGGGCACACGAAATTCCGGACGTTCATTAGCTGGAAAAAATATTGCTAATCCATGTGGTATGTTGCTAACATCAGCAGATATGTTAGAATATTTAGGTCATATTAAAGAAGCTAAACTTATTCGTGATTCAGTTGTTGATGTTATTGGTGAACAAAAAATACGTACAGCTGATTTGGGTGGTAGTTTTAAAACTAGTAAAGTGATTGAAGCAGTTTTGAAAAGTTTAAGAAATCAACTGGCATCGTGATACTGCAAATAATTGGAAGCTACTGCGTTTTTACTTAGCACATATATTTAAAGTATCCATATAGCTTTCAGCACTGTACGCTGTAATTTGGTCTTTCTTCGCTCCTGTCCTATCTTCAGGTTAACACATTTAG                                                                            ]
[+] EMBL CD078251             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         GGTGATGGTCTATTTTTGGATGTATGCTCTTCAATAGCTAAAAATTATCCACAGATTGAATTCAATCATATGATCATTGATAATACATGTATGCAGTTAGTTACTAAACCTCAACAATTCGATGTGATTGTTTTACCAAATTTATACGGAAATATAGTTGGTAATGTAGCAGCTGGCTTAGTCGGTGGAGCTGGTCTAACAACAGGCATAAATTTAGGCCCACAAAATGC TTTGTTTGAAATGGGCACACGAAATTCCGGACGTTCATTAGCTGGAAAAAATATTGCTAATCCATGTGGTATGTTGCTAACATCAGCAGATATGTTAGAATATTTAGGTCATATTAAAGAAGCTAAACTTATTCGTGATTCAGTTGTTGATGTTATTGGTGAACAAAAAATACGTACAGCTGATTTGGGTGGTAGTTTTAAAACTAGTAAAGTGATTGAAGCAGTTTTGAAAAGTTTAAGAAATCAACTGGCATCGTGATACTGCAAATAATTGGAAGCTACTGCGTTTATACTTAGCACATATATTTANAGTATCCATATAGCTTTCAGCACTGT                                                                                                                                    ]
[-] EMBL CD072889             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            AATTCGATGTGATTGTTTTACCAAATTTATACGGAAATATAGTTGGTAATGTAGCAGCTGGCTTAGTCGGTGGAGCTGGTCTAACAACAGGCATAAATTTAGGCCCACAAAATGC TTTGTTTGAAATGGGCACACGAAATTCCGGACGTTCATTAGCTGGAAAAAATATTGCTAATCCATGTGGTATGTTGCTAACATCAGCAGATATGTTAGAATATTTAGGTCATATTAAAGAAGCTAAACTTATTCGTGATTCAGTTGTTGATGTTATTGGTGAACAAAAAATACGTACAGCTGATTTGGGTGGTAGTTTTAAAACTAGTAAAGTGATTGAAGCAGTTTTGAAAAGTTTAAGAAATCAACTGGCATCGTGATACTGCAAATAATTGGAAGCTACTGCGTTTTTACTTAGCACATATATTTAAAGTATCCATATAGCTTTCAGCACTGTACGCTGTAATTTGGTCTTTCTTCGCTCCTGTCCTATCTTCAGGTTAACACATTTAGTGAAACAACGAATTCATATCCATGTTATCGTATAAATTATATACGTTCACTTTGAAATATGCTTTAAATATATATA]
[+] EMBL CD130314             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         TAAATTTAGGCCCACAAAATGC TTTGTTTGAAATGGGCACACGAAATTCCGGACGTTCATTAGCTGGAAAAAATATTGCTAATCCATGTGGTATGTTGCTAACATCAGCAGATATGTTAGAATATTTAGGTCATATTAAAGAAGCTAAACTTATTCGTGATTCAGTTGTTGATGTTATTGGTGAACAAAAAATACGTACAGCTGATTTGGGTGGTAGTTTTAAAACTAGTAAAGTGATTGAAGCGGTTTTGAAAAGTTTAAGAAATCAACTGGCATCGTGATACTGCAAATAATTGGAAGCTACT                                                                                                                                                                                         ]
[+] EMBL CD165185             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         TAAATTTAGGCCCACAAAATGC TTTGTTTGAAATGGGCACACGAAATTCCGGACGTTCATTAGCTGGAAAAAATATTGCTAATCCATGTGGTATGTTGCTAACATCAGCAGATATGTTAGAATATTTAGGTCATATTAAAGAAGCTAAACTTATTCGTGATTCAGTTGTTGATGTTATTGGTGAACAAAAAATACGTACAGCTGATTTGGGTGGTAGTTTTAAAACTAGTAAAGTGATTGAAGCAGn                                                                                                                                                                                                                                                   ]
[-] EMBL CD130242             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           AAATTAGGCCCAC AAATGCNNTTGTTTG AATGGGCACACGAATTTCCGGACGTTCATTAGCTGGAAAAAATATTGCTAATCCATGTGGTATGTTGCTAACATCAGCAGATATGTTAGAATATTTAGGTCATATTAAAGAAGCTAAACTTATTCGTGATTCAGTTGTTGATGTTATTGGTGAACAAAAAATACGTACAGCTGATTTGGGTGGTAGTTTTAAAACTAGTAAAGTGATTGAAGCAGTTTTGAAAAGTTTAAGAAATCAACTGGCATCGTGATACTGCAAATAATTGGAAGCTACTG                                                                                                                                                                                        ]
[-] EMBL CD140054             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 TTGTTTGAAATGGGCACACGAAATTCCGGACGTTCATTAGCTGGAAAAAATATTGCTAATCCATGTGGTATGTTGCTAACATCAGCAGATATGTTAGAATATTTAGGTCATATTAAAGAAGCTAAACTTATTCGTGATTCAGTTGTTGATGTTATTGGTGAACAAAAAATACGTACAGCTGATTTGGGTGGTAGTTTTAAAACTAGTAAAGTGATT                                                                                                                                                                                                                                                           ]
[-] EMBL CD130298             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    gTTGAATGGGGCACACGAAATTCCGGACGTTCATTAGCTGGAAAAAATATTGCTAATCCATGTGGTATGTTGCTAACATCAGCAGATATGTTAGAATATNTAGGTCATATTAAAGAAGTTAAACTTATTCGTGATTCAGTTGTTGATGTTATTGGTGAACAAAAAATACGTACAGCTGATTTGGGTGGTAGTTTTAAAACTAGTAAAGTGATTGAAGCAGTTTTGAAAAGTTTAAGAAATCAACTGGCATCGTGATACTGCAAATAATTGGAAGCTACTGCGTTTTTACTTAGCACATATATTTAAAGTATCCATATAGCTTTCAGCACTGTACGCTGTAATTTGGTCTTTCTTCGCTCCTGTCCTATCTTCAGG                                                                                         ]


>consensus_10472#0 TTGAAACGAAGTTCGAAAATGAGGCTGACCTTGAGCTTGTGGAGGCTATTTCCCAGTCGG GTTCATTTAGTACCATCCTTTGGAATACCTGGGAATATCAAAACTTTCTCTAGTACTACT AATGTGATTACAAATGCCAATTTGGATGCTCCTGCTGGATCAAAACACTTTCTAGGCCTA GGGTTTCATAAAGAGCTCCCAAAAGCTTGCTATGGTGGCCGCCATACTGTTGCAATGCTT CTTGGAGATGGTGTAGGACCCGAACTTCTATCATACGTCAAAGAAGTTTTTCAAGTTATT GGAGCTCCGATAGATTTTGAAGAAGTTGCCGTAAATCAAGAATCTGAAGATGCTACGTTT ACTGATGCTCTACTTGCTATGAAACGCAATGGTGTTGGAATTAAAGGAAATTTTGCCACA GAACCAGGTCAATCGTCAAGAAATGTAGCTCTTCGTTTAAACCTGAATTTATATGCCTTT GTCCAACGATGTCGAAACTTTCCAGGGGTGGTTACACGTCATCAAAATGTTGATATCGTT ATAATACGAGAGAATACAGAGGGTGAATATAGTCGGTTGGAGCACGAAAATGTTCCTGGA GTGGTAGAATCTTTGAAGATTATAACTAGAGAAAAATCCACTAGAATTGCCCAATTCGCA TTTGATTATGCCGTTCGACATAACCGAAAAAAAGTCACAGCAGTACACAAAGCCAATATC ATGAAATTGGGTGATGGTCTATTTTTGGATGTATGCTCTTCAATAGCTAAAAATTATCCA CAGATTGAATTCAATCATATGATCATTGATAATACATGTATGCAGTTAGTTACTAAACCT CAACAATTCGATGTGATTGTTTTACCAAATTTATACGGAAATATAGTTGGTAATGTAGCA GCTGGCTTAGTCGGTGGAGCTGGTCTAACAACAGGCATAAATTTAGGCCCACAAAATGCT TTGTTTGAAATGGGCACACGAAATTCCGGACGTTCATTAGCTGGAAAAAATATTGCTAAT CCATGTGGTATGTTGCTAACATCAGCAGATATGTTAGAATATTTAGGTCATATTAAAGAA GCTAAACTTATTCGTGATTCAGTTGTTGATGTTATTGGTGAACAAAAAATACGTACAGCT GATTTGGGTGGTAGTTTTAAAACTAGTAAAGTGATTGAAGCAGTTTTGAAAAGTTTAAGA AATCAACTGGCATCGTGATACTGCAAATAATTGGAAGCTACTGCGTTTTTACTTAGCACA TATATTTAAAGTATCCATATAGCTTTCAGCACTGTACGCTGTAATTTGGTCTTTCTTCGC TCCTGTCCTATCTTCAGGTTAACACATTTAGTGAAACAACGAATTCATATCCATGTTATC GTATAAATTATATACGTTCACTTTGAAATATGCTTTAAATATATATA



consensusID : consensus_10472#1
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 1
consensus length = 586
fasta sequence
                              [AGGGCATTTGGGGGCTTGTACAAATTTATATATTAAATGAGCCAATTAAATAAAATTGTGTATTTGTATATTATCATTTTCAATCATAAGTCTGTTAAATTTATTATAATTGTTTTCTCTACTTTTTCAAGGTCATATTAAAGAAGCTAAACTTATTCGTGATTCAGTTGTTGATGTTATTGGTGAACAAAAAATACGTACAGCTGATTTGGGTGGTAGTTTTAAAACTAGTAAAGTGATTGAAGCAGTTTTGAAAAGTTTAAGAAATCAACTGGCATCGTGATACTGCAAATAATTGGAAGCTACTGCGTTTTTACTTAGCACATATATTTAAAGTATCCATATAGCTTTCAGCACTGTACGCTGTAATTTGGTCTTTCTTCGCTCCTGTCCTATCTTCAGGTTAACACATTTAGTGAAACAACGAATTCATATCCATGTTATCGTATAAATTATATACGTTCACTTTGAAATATGCTTTAAATATATATATATTTCAAGAATAGTGGGATGCACCTGTCTTCTAATCTCTAGTAAAAGAATGTTGTTAGCAGGTAACTGATTATAAATCACGTCGCCTATCAAT]

[+] EMBL AI976798             [AGGGCATTTGGGGGCTTGTACAAATTTATATATTAAATGAGCCAATTAAATAAAATTGTGTATTTGTATATTATCATTTTCAATCATAAGTCTGTTAAATTTATTATAATTGTTTTCTCTACTTTTTCAAGGTCATATTAAAGAAGCTAAACTTATTCGTGATTCAGTTGTTGATGTTATTGGTGAACAAAAAATACGTACAGCTGATTTGGGTGGTAGTTTTAAAACTAGTAAAGTGATTGAAGCAGTTTTGAAAAGTTTAAGAAATCAACTGGCATCGTGATACTGCAAATAATTGGAAGCTACTGCGTTTTTACTTAGCACATATATTTAAAGTATCCATATAGCTTTCAGCACTGTACGCTGTAATTTGGTCTTTCTTCGCTCCTGTCCTATCTTCAGGTTAACACATTTAGTGAAACAACGAATTCATATCCATGTTATCGTATAAATTATATACGTTCACTTTGAAATATGCTTTAAATATATATATATTTCAAGAATAGTGGGATGCACCTGTCTTCTAATCTCTAGTAAAAGAATGTTGTTAGCAGGTAACTGATTATAAATCACGTCGCCTATCAAT]


>consensus_10472#1 AGGGCATTTGGGGGCTTGTACAAATTTATATATTAAATGAGCCAATTAAATAAAATTGTG TATTTGTATATTATCATTTTCAATCATAAGTCTGTTAAATTTATTATAATTGTTTTCTCT ACTTTTTCAAGGTCATATTAAAGAAGCTAAACTTATTCGTGATTCAGTTGTTGATGTTAT TGGTGAACAAAAAATACGTACAGCTGATTTGGGTGGTAGTTTTAAAACTAGTAAAGTGAT TGAAGCAGTTTTGAAAAGTTTAAGAAATCAACTGGCATCGTGATACTGCAAATAATTGGA AGCTACTGCGTTTTTACTTAGCACATATATTTAAAGTATCCATATAGCTTTCAGCACTGT ACGCTGTAATTTGGTCTTTCTTCGCTCCTGTCCTATCTTCAGGTTAACACATTTAGTGAA ACAACGAATTCATATCCATGTTATCGTATAAATTATATACGTTCACTTTGAAATATGCTT TAAATATATATATATTTCAAGAATAGTGGGATGCACCTGTCTTCTAATCTCTAGTAAAAG AATGTTGTTAGCAGGTAACTGATTATAAATCACGTCGCCTATCAAT



consensus multiple alignement with clustalw

CLUSTAL W (1.82) multiple sequence alignment


consensus_10472#0      TTGAAACGAAGTTCGAAAATGAGGCTGACCTTGAGCTTGTGGAGGCTATTTCCCAGTCGG 60
consensus_10472#1      ------------------------------------------------------------
                                                                                   

consensus_10472#0      GTTCATTTAGTACCATCCTTTGGAATACCTGGGAATATCAAAACTTTCTCTAGTACTACT 120
consensus_10472#1      ------------------------------------------------------------
                                                                                   

consensus_10472#0      AATGTGATTACAAATGCCAATTTGGATGCTCCTGCTGGATCAAAACACTTTCTAGGCCTA 180
consensus_10472#1      ------------------------------------------------------------
                                                                                   

consensus_10472#0      GGGTTTCATAAAGAGCTCCCAAAAGCTTGCTATGGTGGCCGCCATACTGTTGCAATGCTT 240
consensus_10472#1      ------------------------------------------------------------
                                                                                   

consensus_10472#0      CTTGGAGATGGTGTAGGACCCGAACTTCTATCATACGTCAAAGAAGTTTTTCAAGTTATT 300
consensus_10472#1      ------------------------------------------------------------
                                                                                   

consensus_10472#0      GGAGCTCCGATAGATTTTGAAGAAGTTGCCGTAAATCAAGAATCTGAAGATGCTACGTTT 360
consensus_10472#1      ------------------------------------------------------------
                                                                                   

consensus_10472#0      ACTGATGCTCTACTTGCTATGAAACGCAATGGTGTTGGAATTAAAGGAAATTTTGCCACA 420
consensus_10472#1      ------------------------------------------------------------
                                                                                   

consensus_10472#0      GAACCAGGTCAATCGTCAAGAAATGTAGCTCTTCGTTTAAACCTGAATTTATATGCCTTT 480
consensus_10472#1      ------------------------------------------------------------
                                                                                   

consensus_10472#0      GTCCAACGATGTCGAAACTTTCCAGGGGTGGTTACACGTCATCAAAATGTTGATATCGTT 540
consensus_10472#1      ------------------------------------------------------------
                                                                                   

consensus_10472#0      ATAATACGAGAGAATACAGAGGGTGAATATAGTCGGTTGGAGCACGAAAATGTTCCTGGA 600
consensus_10472#1      ------------------------------------------------------------
                                                                                   

consensus_10472#0      GTGGTAGAATCTTTGAAGATTATAACTAGAGAAAAATCCACTAGAATTGCCCAATTCGCA 660
consensus_10472#1      ------------------------------------------------------------
                                                                                   

consensus_10472#0      TTTGATTATGCCGTTCGACATAACCGAAAAAAAGTCACAGCAGTACACAAAGCCAATATC 720
consensus_10472#1      ------------------------------------------------------------
                                                                                   

consensus_10472#0      ATGAAATTGGGTGATGGTCTATTTTTGGATGTATGCTCTTCAATAGCTAAAAATTATCCA 780
consensus_10472#1      ------------------------------------------------------------
                                                                                   

consensus_10472#0      CAGATTGAATTCAATCATATGATCATTGATAATACATGTATGCAGTTAGTTACTAAACCT 840
consensus_10472#1      ------------------------------------------------------------
                                                                                   

consensus_10472#0      CAACAATTCGATGTGATTGTTTTACCAAATTTATACGGAAATATAGTTGGTAATGTAGCA 900
consensus_10472#1      ------------------------------------------------------------
                                                                                   

consensus_10472#0      GCTGGCTTAGTCGGTGGAGCTGGTCTAACAACAGGCATAAATTTAGGCCCACAAAATGCT 960
consensus_10472#1      ---------------------------------AGGGCATTTGGGGGCTTGTACAAATTT 27
                                                         *   *  *   ***    * **   *

consensus_10472#0      TTGTTTGAAATGGGCACACGAAATTCCGGACGTTCATTAGCTGGAAAAAATATTGCTAAT 1020
consensus_10472#1      ATATATTAAATGAGCCAATTAAAT----AAAATTGTGTATTTGTATATTATCATTTTCAA 83
                        * * * ***** **  *  ****     *  **   **  ** * *  **  *  * * 

consensus_10472#0      CCATGTGGTATGTTG---CTAACATCAGCAGATATGTTAGAATATTTAGGTCATATTAAA 1077
consensus_10472#1      TCATA-AGTCTGTTAAATTTATTATAATTGTTTTCTCTACTTTTTCAAGGTCATATTAAA 142
                        ***   ** ****     **  ** *     *    **   * *  *************

consensus_10472#0      GAAGCTAAACTTATTCGTGATTCAGTTGTTGATGTTATTGGTGAACAAAAAATACGTACA 1137
consensus_10472#1      GAAGCTAAACTTATTCGTGATTCAGTTGTTGATGTTATTGGTGAACAAAAAATACGTACA 202
                       ************************************************************

consensus_10472#0      GCTGATTTGGGTGGTAGTTTTAAAACTAGTAAAGTGATTGAAGCAGTTTTGAAAAGTTTA 1197
consensus_10472#1      GCTGATTTGGGTGGTAGTTTTAAAACTAGTAAAGTGATTGAAGCAGTTTTGAAAAGTTTA 262
                       ************************************************************

consensus_10472#0      AGAAATCAACTGGCATCGTGATACTGCAAATAATTGGAAGCTACTGCGTTTTTACTTAGC 1257
consensus_10472#1      AGAAATCAACTGGCATCGTGATACTGCAAATAATTGGAAGCTACTGCGTTTTTACTTAGC 322
                       ************************************************************

consensus_10472#0      ACATATATTTAAAGTATCCATATAGCTTTCAGCACTGTACGCTGTAATTTGGTCTTTCTT 1317
consensus_10472#1      ACATATATTTAAAGTATCCATATAGCTTTCAGCACTGTACGCTGTAATTTGGTCTTTCTT 382
                       ************************************************************

consensus_10472#0      CGCTCCTGTCCTATCTTCAGGTTAACACATTTAGTGAAACAACGAATTCATATCCATGTT 1377
consensus_10472#1      CGCTCCTGTCCTATCTTCAGGTTAACACATTTAGTGAAACAACGAATTCATATCCATGTT 442
                       ************************************************************

consensus_10472#0      ATCGTATAAATTATATACGTTCACTTTGAAATATGCTTTAAATATATATA---------- 1427
consensus_10472#1      ATCGTATAAATTATATACGTTCACTTTGAAATATGCTTTAAATATATATATATTTCAAGA 502
                       **************************************************          

consensus_10472#0      ------------------------------------------------------------
consensus_10472#1      ATAGTGGGATGCACCTGTCTTCTAATCTCTAGTAAAAGAATGTTGTTAGCAGGTAACTGA 562
                                                                                   

consensus_10472#0      ------------------------
consensus_10472#1      TTATAAATCACGTCGCCTATCAAT 586
                                               




Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)