cluster # 10473

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Schistosoma mansoni
cluster # 10473 cluster # 10473 Sequences # 17 consensus # 2

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consensus_10473#0 length = 1082 sequences # 16

consensus_10473#1 length = 524 sequences # 1

consensusID : consensus_10473#0
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Sequences nbr = 16
consensus length = 1082
fasta sequence

                              [CTCGAGGGCCANAATTCGGCACGAGGAAGCTATTGATGCACAGATTCCTCTCATTGTCTGTATAACCGAAGGTATCCCGCAGCATGATATGATACGCGTACGAAAACGTCTTTCTGAACAGTCTGCCTCAAGATTAATTGGACCAAATTGTCCAGGAATAATAAAACCGGACGTATGCAAAATTGGTATTATGCCTGCACATATTCATAAACCAGGAACAGTAGGAATAGTATCCAGATCAGGGACATTGACTTATGAAGCTGTCTTTCAAACTACACAGGTTGGTCTTGGTCAATCTCTATGTGTTGGAATCGGTGGTGATCCGTTTAATGGAACAAATTTCACCGATTGTCTTGAGGTGTTTTTAGAAGATCCTAACACAAAATCAATAATCCTGCTTGGCGAAATCGGTGGTGACTCAGAAGAACAAGCTGCAGAATTCTTAAAAGAGCATAATACTGGTCCAAATCGCAAACCAGTTGTATCTTTTATTGCTGGTGTTACAGCGCCACCCGGACGTCGTATGGGTCATGCTGGAGCTATCATTTCGCTGGGTAAAGGTGGTGCTAAAGAGAAAATGGCAGCTTTAGAAAGTGCAGGTGTTGTTGTCACACCTTCCCCAGCTCAAATAGGTAAAACTCTCTTGCAAGCCATTGCAGATCTTCCGAACTCGTAAATAGACGTATATGTTTCTGGAATATATCAAAGATTATTGTGCTCTTTATTATTTGACTTCTCA-TCTTATTTCAGTCATCAATGTTTCGCTAAAAAACGTTAACAGTGTTCTATACGT-TGAGTATCTTATTTACGCTGCTAGTTCTTTTTCTGTACTAAATTGTTTTCATTTCTTAAATTCTTGTCCACATGTTTATGTGATTAAATATTCGACTAGATTCAGTATACCATTAATTCTTATTAAGATAGTTTCGACAAATGA-ATGCGTTGTTTTATTTCATGGAATTTTATCTTTTCACGTTTTTATTTTTGTAACTTTCATCTCTTTTTAGTGGATATTAAAATAGCAGTAGTCTTTTGTGCCGCTAGCTAATA-TAAAAATTGATATTATCAAAAAAAAAAAAAAA]

[+] EMBL CD080364             [CTCGAGGGCCANAATTCGGCACGAGGAAGCTATTGATGCACAGATTCCTCTCATTGTCTGTATAACCGAAGGTATCCCGCAGCATGATATGATACGCGTACGAAAACGTCTTTCTGAACAGTCTGCCTCAAGATTAATTGGACCAAATTGTCCAGGAATAATAAAACCGGACGTATGCAAAATTGGTATTATGCCTGCACATATTCATAAACCAGGAACAGTAGGAATAGTATCCAGATCAGGGACATTGACTTATGAAGCTGTCTTTCAAACTACACAGGTTGGTCTTGGTCAATCTCTATGTGTTGGAATCGGTGGTGATCCGTTTAATGGAACAAATTTCACCGATTGTCTTGAGGTGTTTTTAGAAGATCCTAACACAAAATCAATAATCCTGCTTGGCGAAATCGGTGGTGACTCAGAAGAACAAGCTGCAGAATTCTTAAAAGAGCATAATACTGGTCCAAATCGCAAACCAGTTGTATCTTTTATTGCTGGTGTTACAGCGCCACCCGGACGTCGTATGGGTCATGCTGGAGCTATCATTTCGCTGGGTAAAGGTGGTGCTAAAGAGAAAATGGCAGCTTTAGAAAGTGCAGGTGTTGTTGTCACACCTTCCCCAGCTCAAATAGGTAAAACTCTCTTGCAAGCCATTGCAGATCTTCCGAACTCGTAAATAGACGTATATGTTT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          ]
[+] EMBL CD115993             [                                                                                                                                                       CCAGGAATAATAAAACCGGACGTATGCAAAATTGGTATTATGCCTGCACATATTCATAAACC         AGGAATAGTATCCAGATCAGGGACATTGACTTATGAAGCTGTCTTTCAAACTACACAGGTTGGTCTTGGTCAATCTCTATGTGTTGGATTCGGTGGTGATCCGTTTAATGGAACAAATTTCACCGATTGTCTTGAGGTGTTTTTAGAAGATCCTAACACAAAATCAATAATCCTGCTTGGCGAAATCGGTGGTGACTCAGAAGAACAAGCTGCAGAATTCTTAAAAGAGCATAATACTGGTCCAAATCGCAAACCAGTTGTATCTTTTATTGCTGGTGTTACAGCGCCACCCGGACGTCGTATGGGTCATGCTGGAGCTATCATTTCGCTGGGTAAAGGTGGTGCTAAAGAGAAAATGGCAGCTTTAGAAAGTGCAGGTGTTGTTGTCACACCTTCCCCAGCTCANATAGGTAAAACTCTCTTGCAAGCCATTGCAGATCTTCCGAACTCGTAAATAGACGTATATGTTTCTGGAATATATCAAGGATTATTGTGCTCTTTATTATTTGACTT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               ]
[+] EMBL CD155299             [                                                                                                                                                                                                                                                   GACATTGACTTATGAAGCTGTCTTTCAAACTACACAGGTTGGTCTTGGTCAATCTCTATGTGTTGGAATCGGTGGTGATCCGTTTAATGGAACAAATTTCACCGATTGTCTTGAGGTGTTTTTAGAAGATCCTAACACAAAATCAATAATCCTGCTTGGCGAAATCGGTGGTGACTCAGAAGAACAAGCTGCAGAATTCTTAAAAGAGCATAATACTGGTCCAAATCGCAAACCAGTTGTATCTTTTATTGCTGGTGTTACAGCGCCACCCGGACGTCGTATGGGTCATGCTGGAGCTATCATTTCGCTGGGTAAAGGTGGTGCTAAAGAGAAAATGGCAGCTTTAGAAAGTGCAGGTGTTGTTGTCACACCTTCCCCAGCTCAAAT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        ]
[-] EMBL CD142932             [                                                                                                                                                                                                                                                        TGACTTATGAAGCTGTCTTTCAAACTACACAGGTTGGTCTTGGTCAATCTCTATGTGTTGGAATCGGTGGTGATCCGTTTAATGGAACAAATTTCACCGATTGTCTTGAGGTGTTTTTAGAAGATCCTAACACAAAATCAATAATCCTGCTTGGCGAAATCGGTGGTGACTCAGAAGAACAAGCTGCAGAATTCTTAAAAGAGCATAATACTGGTCCAAATCGCAAACCAGTTGTATCTTTTATTGCTGGTGTTACAGCGCCACCCGGACGTCGTATGGGTCATGCTGGAGCTATCATTTCGCTGGGTAAAGGTGGTGCTAAAGAGAAAATGGCAGCTTTAGAAAGTGCAGGct                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    ]
[-] EMBL CD157349             [                                                                                                                                                                                                                                                           CTTATGAAGCTGTCTTTCAAACTACACAGGTTGGTCTTGGTCAATCTCTATGTGTTGGAATCGGTGGTGATCCGTTTAATGGAACAAATTTCACCGATTGTCTTGAGGTGTTTTTAGAAGATCCTAACACAAAATCAATAATCCTGCTTGGCGAAATCGGTGGTGACTCAGAAGAACAAGCTGCAGAATTCTTAAAAGAGCATAATACTGGTCCAAATCGCAAACCAGTTGTATCTTTTATTGCTGGTGTTACAGCGCCACCCGGACGTCGTATGGGTCATGCTGGAGCTATCATTTCGCTGGGTAAAGGTGGTGCTAAAGAGAAAATGGCAGCTTTAGAAAGTGCAGGTGTTGTTGTCACACCTTCCCCAGCTCAAATAGGCAAAACTCTCTTGCAAGCCATTGCAGATCTTCCGA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  ]
[+] EMBL CD077601             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      ttCCGAGGGTCTCGAGGTGTTTTTAGAAGATCCTAACACAAAATCAATAATCCTGCTTGGCGAAATCGGTGGTGACTCAGAAGAACAAGCTGCAGAATTCTTAAAAGAGCATAATACTGGTCCAAATCGCAAACCAGTTGTATCTTTTATTGCTGGTGTTACAGCGCCACCCGGACGTCGTATGGGTCATGCTGGAGCTATCATTTCGCTGGGTAAAGGTGGTGCTAAAGAGAAAATGGCAGCTTTAGAAAGTGCAGGTGTTGTTGTCACAC                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        ]
[+] EMBL CD080698             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    cgaggaccGCTTGGCGAAATCGGTGGTGACTCAGAAGATC AGCTGCAGAATTCTTACAAGAGCATAATACTGGTCCAAATCGCAAACCAGTTGTATCTTTTATTGCTGGTGTTACAGCGCCACCCGGACGTCGTATGGGTCATGCTGGAGCTATCATTTCGCTGGGTAAAGGTGGTGCTAAAGAGAAAATGGCAGCTTTAGAAAGTGCAGGTGTTGTTGTCACACCTTCCCCAGCTCAAATAGGTAAAACTCTCTTGCAAGCCATTGCAGATCTTCCGAACTCGTAAATAGACGTATATGTTTCTGGAATATATCAAAGATTATTGTGCTCTTTATTATTTGACTTCTCA TCTTATTTCAGTCATCAATGTTTCGCTAAAAAACGTTAACAGTGTTCTATACGT TGAGTATCTTATTTACGCTGCTAGTTCTTTTTCTGTACTAAATTGTTTTCATTTCTTAAATTCTTGTCCACATGTTTATGTGATTAAATATTCGACTAGATTCAGTATACCATTAATTCTTATTAAGATAGTTTCGACAAATGA ATGCGTTGTTTTATTTCATGGAATTTTATCTTTTCACGTTTTTATTTTTGTAACTNTCATCTCTTTTTAGTGGATATTAAAATAGCAGTAGTCTTTTGTGCCGCTAGCTAATANTAAAAt                          ]
[-] EMBL CD074460             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     AATCGGTGGTGACTCAGAAGAACAAGCTGCAGAATTCTTAAAAGAGCATAATACTGGTCCAAATCGCAAACCAGTTGTATCTTTTATTGCTGGTGTTACAGCGCCACCCGGACGTCGTATGGGTCATGCTGGAGCTATCATTTCGCTGGGTAAAGGTGGTGCTAAAGAGAAAATGGCAGCTTTAGAAAGTGCAGGTGTTGTTGTCACACCTTCCCCAGCTCAAATAGGTAAAACTCTCTTGCAAGCCATTGCAGATCTTCCGAACTCGTAAATAGACGTATATGTTTCTGGAATATATCAAAGATTATTGTGCTCTTTATTATTTGACTTCTCA TCTTATTTCAGTCATCAATGTTTCGCTAAAAAACGTTAACAGTGTTCTATACGT TGAGTATCTTATTTACGCTGCTAGTTCTTTTTCTGTACTAAATTGTTTTCATTTCTTAAATTCTTGTCCACATGTTTATGTGATTAAATATTCGACTAGATTCAGTATACCATTAATTCTTATTAAGATAGTTTCGACAAATGA ATGCGTTGTTTTATTTCATGGAATTTTATCTTTTCACGTTTTTATTTTTGTAACTTTCATCTCTTTTTAGTGGATATTAAAATAGCAGTAGTCTTTTGTGCCGCTAGCTAATA TAAAAATT                        ]
[-] EMBL CD075669             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   AGAA TCTTAAAAGAGCATAATACTGGTCCAAATCGCAAACCAGTTGTATCTTTTATTGCTGGTGTTACAGCGCCACCCGGACGTCGTATGGGTCATGCTGGAGCTATCATTTCGCTGGGTAAAGGTGGTGCTAAAGAGAAAATGGCAGCTTTAGAAAGTGCAGGTGTTGTTGTCACACCTTCCCCAGCTCAAATAGGTAAAACTCTCTTGCAAGCCATTGCAGATCTTCCGAACTCGTAAATAGACGTATATGTTTCTGGAATATATCAAAGATTATTGTGCTCTTTATTATTTGACTTCTCA TCTTATTTCAGTCATCAATGTTTCGCTAAAAAACGTTAACAGTGTTCTATACGT TGAGTATCTTATTTACGCTGCTAGTTCTTTTTCTGTACTAAATTGTTTTCATTTCTTAAATTCTTGTCCACATGTTTATGTGATTAAATATTCGACTAGATTCAGTATACCATTAATTCTTATTAAGATAGTTTCGACAAATGA ATGCGTTGTTTTATTTCATGGAATTTTATCTTTTCACGTTTTTATTTTTGTAACTTTCATCTCTTTTTAGTGGATATTAAAATAGCAGTAGTCTTTTGTGCCGCTAGCTAATA TAAAAATT                        ]
[+] EMBL CD125526             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            AAAAGAGCATAATACTGGTCCAAATCGCAAACCAGTTGTATCTTTTATTGCTGGTGTTTCAGCGCCACCCGGACGTCGTATGGGTCATGCTGGAGCTATCATTTCGCTGGGTAAAGGTGGTGCTAA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    ]
[-] EMBL CD074280             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               TTGTATCTTTTATTGCTGGTGTTACAGCGCCACCCGGACGTCGTATGGGTCATGCTGGAGCTATCATTTCGCTGGGTAAAGGTGGTGCTAAAGAGAAAATGGCAGCTTTAGAAAGTGCAGGTGTTGTTGTCACACCTTCCCCAGCTCAAATAGGTAAAACTCTCTTGCAAGCCATTGCAGATCTTCCGAACTCGTAAATAGACGTATATGTTTCTGGAATATATCAAAGATTATTGTGCTCTTTATTATTTGACTTCTCA TCTTATTTCAGTCATCAATGTTTCGCTAAAAAACGTTAACAGTGTTCTATACGT TGAGTATCTTATTTACGCTGCTAGTTCTTTTTCTGTACTAAATTGTTTTCATTTCTTAAATTCTTGTCCACATGTTTATGTGATTAAATATTCGACTAGATTCAGTATACCATTAATTCTTATTAAGATAGTTTCGACAAATGA ATGCGTTGTTTTATTTCATGGAATTTTATCTTTTCACGTTTTTATTTTTGTAACTTTCATCTCTTTTTAGTGGATATTAAAATAGCAGTAGTTTTTTGTGCCGCTAGCTAATA TAAAAATT                        ]
[-] EMBL CD074622             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       TTTATTGCTGGTGTANCAGCGCCACCCGGACGTCGTATGGGTCATGCTGGAGCTATCATTTCGCTGGGTAAAGGTGGTGCTAAAGAGAAAATGGCAGCTTTAGAAAGTGCAGGTGTTGTTGTCACACCTTCCCCAGCTCAAATAGGTAAAACTCTCTTGCAAGCCATTGCAGATCTTCCGAACTCGTAAATAGACGTATATGTTTCTGGAATATATCAAAGATTATTGTGCTCTTTATTATTTGACTTCTCA TCTTATTTCAGTCATCAATGTTTCGCTAAAAAACGTTAACAGTGTTCTATACGT TGAGTATCTTATTTACGCTGCTAGTTCTTTTTCTGTACTAAATTGTTTTCATTTCTTAAATTCTTGTCCACATGTTTATGTGATTAAATATTCGACTAGATTCAGTATACCATTAATTCTTATTAAGATAGTTTCGACAAATGA ATGCGTTGTTTTATTTCATGGAATTTTATCTTTTCACGTTTTTATTTTTGTAACTTTCATCTCTTTTTAGTGGATATTAAAATAGCAGTAGTCTTTTGTGCCGCTAGCTAATA TAAAAATT                        ]
[-] EMBL BG931777             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       GGAGCTATCATTTCGCTGGGTAAAGGTGGTGCTAAAGAGAAAATGGCAGCTTTAGAAAGTGCAGGTGTTGTTGTCACACCTTCCCCAGCTCAAATAGGTAAAACTCTCTTGCAAGCCATTGCAGATCTTCCGAACTCGTAAATAGACGTATATGTTTCTGGAATATATCAAAGATTATTGTGCTCTTTATTATTTGACTTCTCA TCTTATTTCAGTCATCAATGTTTCGCTAAAAAACGTTAACAGTGTTCTATACGT TGAGTATCTTATTTACGCTGCTAGTTCTTTTTCTGTACTAAATTGTTTTCATTTCTTAAATTCTTGTCCACATGTTTATGTGATTAAATATTCGAC                                                                                                                                                                                                   ]
[+] EMBL AI739737             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   GCAGGTGTTGTTGTCACACCTTCCCCAGCTCAAATAGGTAAAACTCTCTTGCAAGCTATTGCAGATCTTCCGAACTCGTAAATAGACGTATATGTTTCTGGAATATATCAAAGATTATTGTGCTCTTTATTATTGGACTTCTCACTCTTATTTCAGTCATCAATGTTTCGCTAAAAAACGTTAACAGTGTTCTATACGTGTGAGTATCTTATTTACGCTGCAAGTTCTTTTTCTGTACTAAATTGTTTTCATTTCTTAAATTCTTGTCCACATGTTTATGTGATTAAATATTCGACTAGATTCAGTATCACATTAATTCTTATTAAGATAGTTTCGACAAATGATATGCGTTGTTTTATTTCAGGGTATTTTATCTTCTCACGTTTTTA TTTTGCAACTCACATCTCTTTTGAGGGGATA TAAAAGAGAGGTAGT                                                      ]
[-] EMBL AI394786             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                TCA TCTAATTTCAGTCATC ATGTTTCGTTAAAAAA GTTNACAGTGTTCTATACGT TGAGTATCTTATTTACGCTGCTAGTTCTTTTTCTGTACTAAATTGTTTTCATTTCTTAAATTCTTGTCCACATGTTTATGTGATTAAATATTCGACTAGATTCAGTATACCATTAATTCTTATTAAGATAGTTTCGACAAATGA ATGCGTTGTTTTATTTCATGGAATTTTATCTTTTCACGTTTTTATTTTTGTAACTTTCATCTCTTTTTAGTGGATATTAAAATAGCAGTATTCTTTTGTGCCGCTAGCTAATA TAAAAATTGATATTATCAAAAAAAAAAAAAAA]
[-] EMBL AI975458             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               GTTCTATACGT TGAGTATCTTATTTACGCTGCTAGTTCTTTTTCTGTACTAAATTGTTTTCATTTCTTAAATTCTTGTCCACATGTTTATGTGATTAAATATTCGACTAGATTCAGTATACCATTAATTCTTATTAAGATAGTTTCGACAAATGA ATGCGTTGTTTTATTTCATGGAATTTTATCTTTTCACGTTTTTATTTTTGTAACTTTCATCTCTTTTTAGTGGATATTAAAATAGCAGTAGTCTTTTGTGCCGCTAGCTAATA TAAAAATT                        ]




>consensus_10473#0
CTCGAGGGCCANAATTCGGCACGAGGAAGCTATTGATGCACAGATTCCTCTCATTGTCTG
TATAACCGAAGGTATCCCGCAGCATGATATGATACGCGTACGAAAACGTCTTTCTGAACA
GTCTGCCTCAAGATTAATTGGACCAAATTGTCCAGGAATAATAAAACCGGACGTATGCAA
AATTGGTATTATGCCTGCACATATTCATAAACCAGGAACAGTAGGAATAGTATCCAGATC
AGGGACATTGACTTATGAAGCTGTCTTTCAAACTACACAGGTTGGTCTTGGTCAATCTCT
ATGTGTTGGAATCGGTGGTGATCCGTTTAATGGAACAAATTTCACCGATTGTCTTGAGGT
GTTTTTAGAAGATCCTAACACAAAATCAATAATCCTGCTTGGCGAAATCGGTGGTGACTC
AGAAGAACAAGCTGCAGAATTCTTAAAAGAGCATAATACTGGTCCAAATCGCAAACCAGT
TGTATCTTTTATTGCTGGTGTTACAGCGCCACCCGGACGTCGTATGGGTCATGCTGGAGC
TATCATTTCGCTGGGTAAAGGTGGTGCTAAAGAGAAAATGGCAGCTTTAGAAAGTGCAGG
TGTTGTTGTCACACCTTCCCCAGCTCAAATAGGTAAAACTCTCTTGCAAGCCATTGCAGA
TCTTCCGAACTCGTAAATAGACGTATATGTTTCTGGAATATATCAAAGATTATTGTGCTC
TTTATTATTTGACTTCTCATCTTATTTCAGTCATCAATGTTTCGCTAAAAAACGTTAACA
GTGTTCTATACGTTGAGTATCTTATTTACGCTGCTAGTTCTTTTTCTGTACTAAATTGTT
TTCATTTCTTAAATTCTTGTCCACATGTTTATGTGATTAAATATTCGACTAGATTCAGTA
TACCATTAATTCTTATTAAGATAGTTTCGACAAATGAATGCGTTGTTTTATTTCATGGAA
TTTTATCTTTTCACGTTTTTATTTTTGTAACTTTCATCTCTTTTTAGTGGATATTAAAAT
AGCAGTAGTCTTTTGTGCCGCTAGCTAATATAAAAATTGATATTATCAAAAAAAAAAAAA
AA

consensusID : consensus_10473#1
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 1
consensus length = 524
fasta sequence

                              [GTGAACGAGGCTAAGGAAGCTACAGGTGCAACAGCTACTGTTATTTACGTGCCTCCACCCCATGCTGCCGCTGCTATCCATGAAGCTATTGATGCACAGATTCCTCTCATTGTCTGTATAACCGAAGGTATCCCGCAGCATGATATGATACGCGTACGAAAACGTCTTTCTGAACAGTCTGCCTCAAGATTAATTGGACCAAATTGTCCAGGAATAATAAAACCGGACGTATGCAAAATTGGTATTATGCCTGCACATATTCATAAACCAGGAACAGTAGGAATAGTATCCAGATCAGGGACATTGACTTATGAAGCTGTCTTTCAAACTACACAGGTTGGTCTTGGTCAATCTCTATGTGTTGGAATCGGTGGTGATCCGTTTAATGGAACAAATTTCACCGATTGTCTTGAGGTGTTTTTAGAAGATCCTAACACAAAATCAATAATCCTGCTTGGCGAAATCGGTGGTGACTCAGAAGAACAAGCTGCAGAATTCTTAAAAGAGCATAATACTGGTCCAAA]

[+] EMBL CD083314             [GTGAACGAGGCTAAGGAAGCTACAGGTGCAACAGCTACTGTTATTTACGTGCCTCCACCCCATGCTGCCGCTGCTATCCATGAAGCTATTGATGCACAGATTCCTCTCATTGTCTGTATAACCGAAGGTATCCCGCAGCATGATATGATACGCGTACGAAAACGTCTTTCTGAACAGTCTGCCTCAAGATTAATTGGACCAAATTGTCCAGGAATAATAAAACCGGACGTATGCAAAATTGGTATTATGCCTGCACATATTCATAAACCAGGAACAGTAGGAATAGTATCCAGATCAGGGACATTGACTTATGAAGCTGTCTTTCAAACTACACAGGTTGGTCTTGGTCAATCTCTATGTGTTGGAATCGGTGGTGATCCGTTTAATGGAACAAATTTCACCGATTGTCTTGAGGTGTTTTTAGAAGATCCTAACACAAAATCAATAATCCTGCTTGGCGAAATCGGTGGTGACTCAGAAGAACAAGCTGCAGAATTCTTAAAAGAGCATAATACTGGTCCAAA]




>consensus_10473#1
GTGAACGAGGCTAAGGAAGCTACAGGTGCAACAGCTACTGTTATTTACGTGCCTCCACCC
CATGCTGCCGCTGCTATCCATGAAGCTATTGATGCACAGATTCCTCTCATTGTCTGTATA
ACCGAAGGTATCCCGCAGCATGATATGATACGCGTACGAAAACGTCTTTCTGAACAGTCT
GCCTCAAGATTAATTGGACCAAATTGTCCAGGAATAATAAAACCGGACGTATGCAAAATT
GGTATTATGCCTGCACATATTCATAAACCAGGAACAGTAGGAATAGTATCCAGATCAGGG
ACATTGACTTATGAAGCTGTCTTTCAAACTACACAGGTTGGTCTTGGTCAATCTCTATGT
GTTGGAATCGGTGGTGATCCGTTTAATGGAACAAATTTCACCGATTGTCTTGAGGTGTTT
TTAGAAGATCCTAACACAAAATCAATAATCCTGCTTGGCGAAATCGGTGGTGACTCAGAA
GAACAAGCTGCAGAATTCTTAAAAGAGCATAATACTGGTCCAAA

consensus multiple alignement with clustalw

CLUSTAL W (1.82) multiple sequence alignment


consensus_10473#0      --------------------------------------------------------CTCG 4
consensus_10473#1      GTGAACGAGGCTAAGGAAGCTACAGGTGCAACAGCTACTGTTATTTACGTGCCTCCACCC 60
                                                                                 * 

consensus_10473#0      AGGGCCANAATTCGGCACGAGGAAGCTATTGATGCACAGATTCCTCTCATTGTCTGTATA 64
consensus_10473#1      CATGCTGCCGCTGCTATCCATGAAGCTATTGATGCACAGATTCCTCTCATTGTCTGTATA 120
                          **      *     * * ***************************************

consensus_10473#0      ACCGAAGGTATCCCGCAGCATGATATGATACGCGTACGAAAACGTCTTTCTGAACAGTCT 124
consensus_10473#1      ACCGAAGGTATCCCGCAGCATGATATGATACGCGTACGAAAACGTCTTTCTGAACAGTCT 180
                       ************************************************************

consensus_10473#0      GCCTCAAGATTAATTGGACCAAATTGTCCAGGAATAATAAAACCGGACGTATGCAAAATT 184
consensus_10473#1      GCCTCAAGATTAATTGGACCAAATTGTCCAGGAATAATAAAACCGGACGTATGCAAAATT 240
                       ************************************************************

consensus_10473#0      GGTATTATGCCTGCACATATTCATAAACCAGGAACAGTAGGAATAGTATCCAGATCAGGG 244
consensus_10473#1      GGTATTATGCCTGCACATATTCATAAACCAGGAACAGTAGGAATAGTATCCAGATCAGGG 300
                       ************************************************************

consensus_10473#0      ACATTGACTTATGAAGCTGTCTTTCAAACTACACAGGTTGGTCTTGGTCAATCTCTATGT 304
consensus_10473#1      ACATTGACTTATGAAGCTGTCTTTCAAACTACACAGGTTGGTCTTGGTCAATCTCTATGT 360
                       ************************************************************

consensus_10473#0      GTTGGAATCGGTGGTGATCCGTTTAATGGAACAAATTTCACCGATTGTCTTGAGGTGTTT 364
consensus_10473#1      GTTGGAATCGGTGGTGATCCGTTTAATGGAACAAATTTCACCGATTGTCTTGAGGTGTTT 420
                       ************************************************************

consensus_10473#0      TTAGAAGATCCTAACACAAAATCAATAATCCTGCTTGGCGAAATCGGTGGTGACTCAGAA 424
consensus_10473#1      TTAGAAGATCCTAACACAAAATCAATAATCCTGCTTGGCGAAATCGGTGGTGACTCAGAA 480
                       ************************************************************

consensus_10473#0      GAACAAGCTGCAGAATTCTTAAAAGAGCATAATACTGGTCCAAATCGCAAACCAGTTGTA 484
consensus_10473#1      GAACAAGCTGCAGAATTCTTAAAAGAGCATAATACTGGTCCAAA---------------- 524
                       ********************************************                

consensus_10473#0      TCTTTTATTGCTGGTGTTACAGCGCCACCCGGACGTCGTATGGGTCATGCTGGAGCTATC 544
consensus_10473#1      ------------------------------------------------------------
                                                                                   

consensus_10473#0      ATTTCGCTGGGTAAAGGTGGTGCTAAAGAGAAAATGGCAGCTTTAGAAAGTGCAGGTGTT 604
consensus_10473#1      ------------------------------------------------------------
                                                                                   

consensus_10473#0      GTTGTCACACCTTCCCCAGCTCAAATAGGTAAAACTCTCTTGCAAGCCATTGCAGATCTT 664
consensus_10473#1      ------------------------------------------------------------
                                                                                   

consensus_10473#0      CCGAACTCGTAAATAGACGTATATGTTTCTGGAATATATCAAAGATTATTGTGCTCTTTA 724
consensus_10473#1      ------------------------------------------------------------
                                                                                   

consensus_10473#0      TTATTTGACTTCTCATCTTATTTCAGTCATCAATGTTTCGCTAAAAAACGTTAACAGTGT 784
consensus_10473#1      ------------------------------------------------------------
                                                                                   

consensus_10473#0      TCTATACGTTGAGTATCTTATTTACGCTGCTAGTTCTTTTTCTGTACTAAATTGTTTTCA 844
consensus_10473#1      ------------------------------------------------------------
                                                                                   

consensus_10473#0      TTTCTTAAATTCTTGTCCACATGTTTATGTGATTAAATATTCGACTAGATTCAGTATACC 904
consensus_10473#1      ------------------------------------------------------------
                                                                                   

consensus_10473#0      ATTAATTCTTATTAAGATAGTTTCGACAAATGAATGCGTTGTTTTATTTCATGGAATTTT 964
consensus_10473#1      ------------------------------------------------------------
                                                                                   

consensus_10473#0      ATCTTTTCACGTTTTTATTTTTGTAACTTTCATCTCTTTTTAGTGGATATTAAAATAGCA 1024
consensus_10473#1      ------------------------------------------------------------
                                                                                   

consensus_10473#0      GTAGTCTTTTGTGCCGCTAGCTAATATAAAAATTGATATTATCAAAAAAAAAAAAAAA 1082
consensus_10473#1      ----------------------------------------------------------