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Schistosoma mansoni
cluster # 10486 cluster # 10486       Sequences # 17       consensus # 3


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_10486#0 length = 988 sequences # 2  
consensus_10486#1 length = 914 sequences # 6  
consensus_10486#2 length = 884 sequences # 9  

consensusID : consensus_10486#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 2
consensus length = 988
fasta sequence
                              [TACGCAGTACGGTAATGCAGCTGCATGGCATGTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTAAAAGTAATAATTTCAGATCACAATGTATTGTTTCATGGAAAAATCTGTTCATTCAACAAATTATGCATTAAAAAATTTAGAAGCCAACTTTTCCAAGTCTTTCGTCAGTTTTTGGATCTGCTGTCAATTTTTG-AACATGTACTAT-GCTAGCATTTGCTTGGTTTTGTAATTTTCGTAGCCGATCTATATTTAACAATCTTAACGCAACAGCCGCAGCCTCTACAACAGGATCTTTAACACTAAATCCAAGACATACATCATCGAGCTTTAACATA-TCAATTTTAGATGTCCCATAGTCCTTTATAGCATCATTCAATATATTTACCTCAAGTTTTTGTTCAATAACCAAACAGACGGCCTTAAATAATATTCTGATATCTGGATGAACAGGTATCTGCAACAGCTTAGCTATCTTTAAAACGTTTTCCTTAAATTCATCACTGGTAACATCTATGTTATT-AAAAGCGTCGTGGAAGAGTANAGTCTCANATACGTGTATTTCTNNNNNNNNNNNAATATNGTATTCAATATANTGCCTTGCTAGAAGCCATCCACATAGCCCACACCTGATTCATAAAAGGCCCTTTACTGCTGAAATACTATTAATAACTGGCATCCAAAAATGACGGCCCCATCTGCTAACCGGAAACTTAATAATTTCCTTACCATCAACATTGGGCATGGGCAATTGAATTTGAACTCCCCCCNNNNNNNNNNNNATTTGACGTGCGTTTCCCCTTTTTTTTCCCGGGGAAAATGGGAAAATCGATGAAAATTTTCCCCCATTTGGCCAGGCCACCTTAAGGGGAAAAAAATTATATCTCTGGAGATTCTCTCTCCNCAAACANNNNNNAAGGNAGGGGGGAAAGAAAAAATATTGTCCTCTTAAAAAGCCCTTAAAGCGGGGGGGGGGTTCTCTCCTTTCTCG]

[+] EMBL AI975113             [TACGCAGTACGGTAATGCAGCTGCATGGCATGTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTAAAAGTAATAATTTCAGATCACAATGTATTGTTTCATGGAAAAATCTGTTCATTCAACAAATTATGCATTAAAAAATTTAGAAGCCAACTTTTCCAAGTCTTTCGTCAGTTTTTGGATCTGCTGTCAATTTTTG AACATGTACTAT GCTAGCATTTGCTTGGTTTTGTAATTTTCGTAGCCGATCTATATTTAACAATCTTAACGCAACAGCCGCAGCCTCTACAACAGGATCTTTAACACTAAATCCAAGACATACATCATCGAGCTTTAACATA TCAATTTTAGATGTCCCATAGTCCTTTATAGCATCATTCAATATATTTACCTCAAGTTTTTGTTCAATAACCAAACAGACGGCCTTAAATAATATTCTGATATCTGGATGAACAGGTATCTGCAACAGCTTAGCTATCTTTAAAACGTTTTCCTTAAATTCATCACTGGTAACATCTATGTTATT AAAAGCG                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             ]
[+] EMBL CD075443             [                                                                          AGATCACAATGTATTGTTTCATGGAAAAATCTGTTCATTCAACAAATTATGCATTAAAAAATTTAGAAGCCAACTTTTCCAAGTCTTTCGTCAGTTTTTGGATCTGCTGTCAATTTTTGAAACATGTACTATGGCTAGCATTTGCTTGGTTTTGTAATTTTCGTAGCCGATCTATATTTAACAATCTTAACGCAACAGCCGCAGCCTCTACAACAGGATCTTTAACACTAAATCCAAGACATACATCATCGAGCTTTAACATATTCAATTTTAGATGTCCCATAGTCCTTTATAGCATCATTCAATATATTTACCTCAAGTTTTTGTTCAATAACCAAACAGACGGCCTTAAATAATATTCTGATATCTGGATGAACAGGTATCTGCAACAGCTTANCTATCTTT AAACGTTTTCCTTAAA TCATCACTGGTAACATCCTNNNNATTAAAAAGCGTCGTGGAAGAGTANAGTCTCANATACGTGTATTTCTNNNNNNNNNNNAATATNGTATTCAATATANTGCCTTGCTAGAAGCCATCCACATAGCCCACACCTGATTCATAAAAGGCCCTTTACTGCTGAAATACTATTAATAACTGGCATCCAAAAATGACGGCCCCATCTGCTAACCGGAAACTTAATAATTTCCTTACCATCAACATTGGGCATGGGCAATTGAATTTGAACTCCCCCCNNNNNNNNNNNNATTTGACGTGCGTTTCCCCTTTTTTTTCCCGGGGAAAATGGGAAAATCGATGAAAATTTTCCCCCATTTGGCCAGGCCACCTTAAGGGGAAAAAAATTATATCTCTGGAGATTCTCTCTCCNCAAACANNNNNNAAGGNAGGGGGGAAAGAAAAAATATTGTCCTCTTAAAAAGCCCTTAAAGCGGGGGGGGGGTTCTCTCCTTTCTCG]


>consensus_10486#0 TACGCAGTACGGTAATGCAGCTGCATGGCATGTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTA AAAGTAATAATTTCAGATCACAATGTATTGTTTCATGGAAAAATCTGTTCATTCAACAAA TTATGCATTAAAAAATTTAGAAGCCAACTTTTCCAAGTCTTTCGTCAGTTTTTGGATCTG CTGTCAATTTTTGAACATGTACTATGCTAGCATTTGCTTGGTTTTGTAATTTTCGTAGCC GATCTATATTTAACAATCTTAACGCAACAGCCGCAGCCTCTACAACAGGATCTTTAACAC TAAATCCAAGACATACATCATCGAGCTTTAACATATCAATTTTAGATGTCCCATAGTCCT TTATAGCATCATTCAATATATTTACCTCAAGTTTTTGTTCAATAACCAAACAGACGGCCT TAAATAATATTCTGATATCTGGATGAACAGGTATCTGCAACAGCTTAGCTATCTTTAAAA CGTTTTCCTTAAATTCATCACTGGTAACATCTATGTTATTAAAAGCGTCGTGGAAGAGTA NAGTCTCANATACGTGTATTTCTNNNNNNNNNNNAATATNGTATTCAATATANTGCCTTG CTAGAAGCCATCCACATAGCCCACACCTGATTCATAAAAGGCCCTTTACTGCTGAAATAC TATTAATAACTGGCATCCAAAAATGACGGCCCCATCTGCTAACCGGAAACTTAATAATTT CCTTACCATCAACATTGGGCATGGGCAATTGAATTTGAACTCCCCCCNNNNNNNNNNNNA TTTGACGTGCGTTTCCCCTTTTTTTTCCCGGGGAAAATGGGAAAATCGATGAAAATTTTC CCCCATTTGGCCAGGCCACCTTAAGGGGAAAAAAATTATATCTCTGGAGATTCTCTCTCC NCAAACANNNNNNAAGGNAGGGGGGAAAGAAAAAATATTGTCCTCTTAAAAAGCCCTTAA AGCGGGGGGGGGGTTCTCTCCTTTCTCG



consensusID : consensus_10486#1
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 6
consensus length = 914
fasta sequence
                              [AAAGAAGTTCACTTTAAAAGTAATAATTTCAGATCACAATGTATTGTTTCATGGAAAAATCTGTTCATTCAACAAATTATGCATTAAAAAATTTAGAAGCCAACTTTTCCAAGTCTTTCGTCAGTTTTTGGATCTGCTGTCAATTTTTGAACATGTACTATGCTAGCATTTGCTTGGTTTTGTAATTTTCGTAGCCGATCTATATTTAACAATCTTAACGCAACAGCCGCAGCCTCTACAACAGGATCTTTAACACTAAATCCAAGACATACATCATCGAGCTTTAACATATCAATTTTAGATGTCCCATAGTCCTTTATAGCATCATTCAATATATTTACCTCAAGTTTTTGTTCAATAACCAAACAGACGGCCTTAAATAATATTCTGATATCTGGATGAACAGGTATCTGCAACAGCTTAGCTATCTTTAAAACGTTTTCCTTAAATTCATCACTGTTAACATCTATGTTATTAAAAGCGTTCGTGGAAAGAGTAGAGTTCTCAGATATACTGTTGTGTTGAGTATTTCTAGATGAGTTGTATTCCAATAGTAGTGCTTTGCTAAGAAGCCAATCCAACATAGCCCAACAACTAGATTCATTAAAAGGGCACTTTACTGTCTGGAGATACTTATTTAAATAGCTTGTCCATTCCAAAGATTGTACGTCACGCAATCTTGCTTCAGCAGGAAGAGCTCGAATAATTCTATCCTCTAGCCATACGATCACATTGCGTACATTGGTCAAATCTGAAATATCGAAAACATCGTGCACGGGATAGTTGACAGAATGAAGCTTGAAACGTAGTCGTTCATTAGCCAACATCGTAATAATCCGACGAGGGAGAGAAATATGGAAGAAATCAGACTAAGGGATCAAAAGTCTGGTTATTCTTTAATTTGTTGCATTCAA]

[+] EMBL AI977096             [AAAGAAGTTCACTTTAAAAGTAATAATTTCAGATCACAATGTTTTGTTTCATGGAAAAATTTGTTCATTCAACAAATTATGCATTAAAAAATTTAGAAGCCAACTTTTCCAAGTCTTTCGTCAGTTTTTGGATCCGCTGTCAATTTTTGAACATGTACTATGCTAGCATTTGCTTGGTTTTGTAATTTTCGTAACCGATCTATATTTAACAATCTTAACGCAACAGTCGTAGCCTCTACAACAGGATCTTTTACACTAAATCCACGACATACATCATGGAGCTTTAACATATCAATTTTAGATGTCCCATAGTCCTTTATAGCATCATTCAATATATTTACCTCAAGTTTTTGTTCAATAACCAAACAAACGGCCTTAAA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      ]
[+] EMBL CD074390             [                                      ATGTATTGTTTCATGGAAAAATCTGTTCATTCAACAAATTATGCATTAAAAAATTTAGAAGCCAACTTTTCCAAGTCTTTCGTCAGTTTTTGGATCTGCTGTCAATTTTTGAACATGTACTATGCTAGCATTTGCTTGGTTTTGTAATTTTCGTAGCCGATCTATATTTAACAATCTTAACGCAACAGCCGCAGCCTCTACAACAGGATCTTTAACACTAAATCCAAGACATACATCATCGAGCTTTAACATATCAATTTTAGATGTCCCATAGTCCTTTATAGCATCATTCAATATATTTACCTCAAGTTTTTGTTCAATAACCAAACAGACGGCCTTAAATAATATTCTGATATCTGGATGAACAGGTATCTGCAACAGCTTAGCTATCTTTAAAACGTTTTCCTTAAATTCATC       ACATCTATGTTATTAAAAGCGTTCGTGGAAAGAGTAGAGTTCTCAGATATACTGTTGTGTTGAGTATTTCTAGATGAGTTGTATTCCAATAGTAGTGCTTTGCTAAGAAGCCAATCCAACATAGCCCAACAACTAGATTCATTAAAAGGGCACTTTACTGTCTGGAGATACTTATTTAAATAGCTTGTCCATTCCAAAGAT                                                                                                                                                                                                                                                           ]
[+] EMBL CD073956             [                                      ATGTATTTTTTCATGGAAAAATCTGCTCATTCAACAAATTATGCATTAAAAAATTTAAAAGCCAACTTTTCCAAGTCTTTCGTCAGTTTTTGGATCTGCTGTCAATTTTTGAACATGTACTATGCTAGCATTTGCTTGGTTTTGTAATTTTCGTAGCCGATCTATATTTAACAATCTTAACGCAACAGCCGCAGCCTCTACAACAGGATCTTTAACACTAAATCCAAGACATACATCATCGAGCTTTAACATATCAATTTTAAATGTCCCATAGTCCTTTATAGCATCATTCAATATATTTACCTCAAGTTTTTGTTCAATAACCAAACAGACGGCCTTAAATAATATTCTGATATCTGGATGAACAGGTATCTGCAACAGCTTAGCTATCTTTAAAACGTTTTCCTTAAATTCATCACTGTTAACATCTATGTTATTAAAAGCGTTCGTGGAAAGAGTAGAGTTATCAGATATACTGTTGTGTTGAGTATTTCTAGATGAGTTGTATTCCAATAGTAGTGCTTTGCTAAGAAGCCAATCCAACATAGCCCAACAACTAGATTCATTAAAAGGGCACTTTACTGTCTGGAGATACTTAT                                                                                                                                                                                                                                                                                     ]
[+] EMBL CD076313             [                                      ATGTATTGTTTCATGGAAAAATCTGTTCATTCAACAAATTATGCATTAAAAAATTTAAAAGCCAACTTTTCCAAGTCTTTCGTCAGTTTTTGGATCTGCTGTCAATTTTTGAACATGTACTATGCTACCATTTGCTTGGTTTTGTAATTTTCGTAGCCGATCTATATTTAACAATCTTAACGCAACAGCCGCAGCCTTTACAACAGGATCTTTAACACTAAATCCAAGACATACATCATCGAGCTTTAACATATCAATTTTAAATGTCCCATAGTCCTTTATAGCATCATTCAATATATTTACCTCAAGTTTTTGTTCAATAACCAAACAGACGGCCTTAAATAATATTCTGATATCTGGATGAACAGGTATCTGCAACAGCTTAGCTATCTTTAAAACGTTTTCCTTAAATTCATCACTGTTAACATCTATGTTATTAAAAGCGTTCGTGGAAAGAGTAAAGTTCTC                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        ]
[-] EMBL CD159292             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              AATCCAACATAGCCCAACAAATAGATTCATTAAAAGGGCACTTTACTGTCTGGAGATACTTATTTAAACAGCTTGTCCATTCCAAAGATTGTACGTCACGCAATCTTGCTTCAGCAGGAAGAGCTCGAATAATTCTATCCTCTAGCCATACGATCACATTGCGTACATTGGTCAAATCTGAAATATCGAAAACATCGTGCACGGGATAGTTGACAGAATGAAGCTTGAAACGTAGTCGTTCATTAGCCAACATCGTAATAATCCGACGAGGGAGAGAAATATGGAAGAAATCAGACTAAGGGATCAAAAGTCTGGTTATTCTTTAATTTGTTGCATTCAA]
[+] EMBL CD098122             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       ACTTATTTAAATAGCTTGTCCATTCCAAAGATTGTACGTCACGCAATCTTGCTTCAGCAGGAAGAGCTCGAATAATTCTATCCTCTAGCCATACGATCACATTGCGTACATTGGTCAAATCTGAAATATCGAAAACATCGTGCACGGGATAGTTGACAGAATGAAGCTTGAAACGTAGTCGTTCATTAGCCAACATCGTAATAATCCGACGAGGGAGAGAAATATGGAAGAAATCAGACTAAGGGATCAAAAGTCTGGTTATTCTTTAATT            ]


>consensus_10486#1 AAAGAAGTTCACTTTAAAAGTAATAATTTCAGATCACAATGTATTGTTTCATGGAAAAAT CTGTTCATTCAACAAATTATGCATTAAAAAATTTAGAAGCCAACTTTTCCAAGTCTTTCG TCAGTTTTTGGATCTGCTGTCAATTTTTGAACATGTACTATGCTAGCATTTGCTTGGTTT TGTAATTTTCGTAGCCGATCTATATTTAACAATCTTAACGCAACAGCCGCAGCCTCTACA ACAGGATCTTTAACACTAAATCCAAGACATACATCATCGAGCTTTAACATATCAATTTTA GATGTCCCATAGTCCTTTATAGCATCATTCAATATATTTACCTCAAGTTTTTGTTCAATA ACCAAACAGACGGCCTTAAATAATATTCTGATATCTGGATGAACAGGTATCTGCAACAGC TTAGCTATCTTTAAAACGTTTTCCTTAAATTCATCACTGTTAACATCTATGTTATTAAAA GCGTTCGTGGAAAGAGTAGAGTTCTCAGATATACTGTTGTGTTGAGTATTTCTAGATGAG TTGTATTCCAATAGTAGTGCTTTGCTAAGAAGCCAATCCAACATAGCCCAACAACTAGAT TCATTAAAAGGGCACTTTACTGTCTGGAGATACTTATTTAAATAGCTTGTCCATTCCAAA GATTGTACGTCACGCAATCTTGCTTCAGCAGGAAGAGCTCGAATAATTCTATCCTCTAGC CATACGATCACATTGCGTACATTGGTCAAATCTGAAATATCGAAAACATCGTGCACGGGA TAGTTGACAGAATGAAGCTTGAAACGTAGTCGTTCATTAGCCAACATCGTAATAATCCGA CGAGGGAGAGAAATATGGAAGAAATCAGACTAAGGGATCAAAAGTCTGGTTATTCTTTAA TTTGTTGCATTCAA



consensusID : consensus_10486#2
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 9
consensus length = 884
fasta sequence
                              [GATCACAATGTATTGTTTCATGGAAAAATCTGTTCATTCANCAAATTATGCATTAAAAAATTTAGAAGC-CAACTTTTCCAAGTCTTTCGTCAGTTTTTGGATCTGCTGTCAATTTTTGAACATGTACTATGCTAGCATTTGCTTGGTT-TTGTAATTTTCGTAGCCGATCTATATTTAACAATCTTAACGCAACAGCCGCAGCCTCTACAACAGGATCTTTAACACTAAATCCAAGACATACATCATCGAGCTTTAACATATCAATTTTAGATGTCCCATAGTCCTTTATAGCATCATTCAATATATTTACCTCAAGTTTTTGTTCAATAACCAAACAGACGGCCTTAAATAATATTCTGATATCTGGATGAACAGGTATCTGCAACAGCTTAGCTATCTTTAAAACGTTTTCCTTAAATTCATCACTGTTAACATCTATGTTATTAAAAGCGTTCGTGGAAAGAGTAGAGTTCTCAGATATACTGTTGTGTTGAGTATTTCTAGATGAGTTGTATTCCAATAGTAGTGCTTTGCTAAGAAGCCAATCCAACATAGCCCAACAACTAGATTCATTAAAAGGGCACTTTACTGTCTGGAGATACTTATTTAAATAGCTTGTCCATTCCAAAGATTGTACGTCACGCAATCTTGCTTCAGCAGGAAGAGCTCGAATAATTCTATCCTCTAGCCATACGATCACATTGCGTACATTGGTCAAATCTGAAATATCGAAAACATCGTGCACGGGATAGTTGACAGAATGAAGCTTGAAACGTAGTCGTTCATTAGCCAACATCGTAATAATCCGACGAGGGAGAGAAATATGGAAGAAATCAGACTAAGGGATCAAAAGTCTG--------CCTCGTGCCGAATTNTTGG-CTCGAGGG]

[-] EMBL CD081621             [GATCACAATGTATTGTTTCATGGAAAAATCTGTTCATTCANCAAATTATGCATTAAAAAATTTAGAAGC CAACTTTTCCAAGTCTTTCGTCAGTTTTTGGATCTGCTGTCAATTTTTGAACATGTACTATGCTAGCATTTGCTTGGTT TTGTAATTTTCGTAGCCGATCTATATTTAACAATCTTAACGCAACAGCCGCAGCCTCTACAACAGGATCTTTAACACTAAATCCAAGACATACATCATCGAGCTTTAACATATCAATTTTAGATGTCCCATAGTCCTTTATAGCATCATTCAATATATTTACCTCAAGTTTTTGTTCAATAACCAAACAGACGGCCTTAAATAATATTCTGATATCTGGATGAACAGGTATCTGCAACAGCTTAGCTATCTTTAAAACGTTTTCCTTAAATTCATCACTGTTAACATCTATGTTATTAAAAGCGTTCGTGGAAAGAGTAGAGTTCTCAGATATACTGTTGTGTTGAGTATTTCTAGATGAGTTGTATTCCAATAGTAGTGCTTTGCTAAGAAGCCAATCCAACATAGCCCAACAACTAGATTCATTAAAAGGGCACTTTACTGTCTGGAGATACTTATTTAAATAGCTTGTCCATTCCAAAGATTGTACGTCACGCAATCTTGCTTCAGCAGGAAGAGCTCGAATAATTCTATCCTCTAGCCATACGATCACATTGCGTACATTGGTCAAATCTGAAATATCGAAAACATCGTGCACGGGATAGTTGACAGAATGAAGCTTGAAACGTAGTCGTTCATTAGCCAACATCGTAATAATCCGACGAGGGAGAGAAATATGGAAGAAATCAGACTAAGGGATCAAAAGTCT         CCTCGTGCCGAATTNATGG CTCncgg ]
[-] EMBL CD079697             [         GTA TG TTCATG  AAAATCTG TCA TCA CNNANTATGCAT  AANNA TTAG AGCNNANCTTTT CAAGTC TTCGTCAG TTTTGGATCTGCTGTCAA TTTTGAACATGTACTATGCTAGCA TTGC TGGTTNNTGT ATTTTCGTAGCCGATCTATA TTAACAATCTTAACGCAACAGCCGCAGCCTCTACAACAGGATCTTTAACACTAAATCCAAGACATACATCATCGAGCTTTAACATATCAATTTTAGATGTCCCATAGTCCTTTATAGCATCATTCAATATATTTACCTCAAGTTTTTGTTCAATAACCAAACAGACGGCCTTAAATAATATTCTGATATCTGGATGAACAGGTATCTGCAACAGCTTAGCTATCTTTAAAACGTTTTCCTTAAATTCATCACTGTTAACATCTATGTTATTAAAAGCGTTCGTGGAAAGAGTAGAGTTATCAGATATACTGTTGTGTTGAGTATTTCTAGATGAGTTGTATTCCAATAGTAGTGCTTTGCTAAGAAGCCAATCCAACATAGCCCAACAACTAGATTCATTAAAAGGGCACTTTACTGTCTGGAGATACTTATTTAAATAGCTTGTCCATTCCAAAGATTGTACGTCACGCAATCTTGCTTCAGCAGGAAGAGCTCGAATAATTCTATCCTCTAGCCATACGATCACATTGCGTACATTGGTCAAATCTGAAATATCGAAAACATCGTGCACGGGATAGTTGACAGAATGAAGCTTGAAACGTAGTCGTTCATTAGCCAACATCGTAATAATCCGACGAGGGAGAGAAATATGGAAGAAATCAGACTAAGGGATCAAAAGTNTGGC      CCTCGTGCCAAATTNTTGG         ]
[+] EMBL CD177935             [                                                                                                                     TGAACATGTACTATGCTAGCATTTGCTTGGTT TTGTAATTTTCGTCGCCGATCTATATTTAACAATCTTAACGCAACATCCGCAGCCTCTACAACAGGATCTTTAACACT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           ]
[-] EMBL AA791329             [                                                                                                                     gaAACTTTGACTAT CTAGCA TTGCTTGG T TTGT ATTTACGTAGCCGATCTATATTTAACAATCTTAACGCAACAGCCGCAGCCTCTACAACGGGATCTTTAACACTAAATCCAAGACATACATCATCGAGCTTTAACATATCAATTTTAGATGTCCCATAG CTTTTATAGCATCATTCAATATATTTACCTCAAGTTTTTGTTCAATAACCAAACAGACGGCCTTAAATAATATTCTGATATCTGGATGAACAGGTATCTGCAAC                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           ]
[-] EMBL CD082723             [                                                                                                                                                                                                                      GGATCTTTAACACTAAATCCAAGACATACATCATCGAGCTTTAACATATCAATNTTAGATGTCCCATAGTCCTTTATAGCATCATTCAATATATTTACCTCAAGTTTTTGTTCAATAACCAAACAGACGGCCTTAAATAATATTCTGATATCTGGATGAACAGGTATCTGCAACAGCTTAGCTATCTTTAAAACGTTTTCCTTAAATTCATCACTGTTAACATCTATGTTATTAAAAGCGTTCGTGGAAAGAGTAGAGTTCTCAGATATACTGTTGTGTTGAGTATTTCTAGATGAGTTGTATTCCAATAGTAGTGCTTTGCTAAGAAGCCAATCCAACATAGCCCAACAACTAGATTCATTAAAAGGGCACTTTACTGTCTGGAGATACTTATTTAAATAGCTTGTCCATTCCAAAGATTGTACGTCACGCAATCTTGCTTCAGCAGGAAGAGCTCGAATAATTCTATCCTCTAGCCATACGATCACATTGCGTACATTGGT AAATCTGAAATATCGAAAACATCGTGCACGGGATAGTTGACAGAATGAAGCTTGAAACGTAGTCGTTCATTAGCCAACATCGTAATAATCCGACGAGGGAGAGAAATATGGAAGAAATCAGACTAAGGGATCAAAAGTCTG        CCTCGTGCCGAATTNTGGC CTCGAGGG]
[-] EMBL CD135237             [                                                                                                                                                                                                                            TTAACACTAAATCCAAGACATACATCATCGAGCTTTAACATATCAATTTTAGATGTCCCATAGTCCTTTATAGCATCATTCAATATATTTACCTCAAGTTTTTGTTCAATAACCAAACAGACGGCCTTAAATAATATTCTGATATCTGGATGAACAGGTATCTGCAACAGCTTAGCTATCTTTAAAACGTTTTCCTTAAATTCATCACTGTTAACATCTATGTTATTAAAAGCGTTC                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      ]
[-] EMBL CD080479             [                                                                                                                                                                                                                                          AAGACATACATCATCGAGCTTACNNATATCAATTTTAGATGTCCCATAGTCCTTTATAGCATCATTCAATATATTTACCTCAAGTTTTTGTTCAATAACCAAACAGACGGCCTTAAATAATATTCTGATATCTGGATGAACAGGTATCTGCAACAGCTTAGCTATCTTTAAAACGTTTTCCTTAAATTCATC       ACATCTATGTTATTAAAAGCGTTCGTGGAAAGAGTAGAGTTCTCAGATATACTGTTGTGTTGAGTATTTCTAGATGAGTTGTATTCCAATAGTAGTGCTTTGCTAAGAAGCCAATCCAACATAGCCCAACAACTAGATTCATTAAAAGGGCACTTTACTGTCTGGAGATACTTATTTAAATAGCTTGTCCATTCCAAAGATTGTACGTCACGCAATCTTGCTTCAGCAGGAAGAGCTCGAATAATTCTATCCTCTAGCCATACGATCACATTGCGTACATTGGTCAAATCTGAAATATCGAAAACATCGTGCACGGGATAGTTGACAGAATGAAGCTTGAAACGTAGTCGTTCATTAGCCAACATCGTAATAATCCGACGAGGGAGAGAAATATGGAAGAAATCAGACTAAGGGATCAAAAGTCTGGTTATTNCCCTCGTGCCGAA TNTTGGCCTCGAG  ]
[+] EMBL CD137425             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                   AGCATCATTCAATATATTTACCTCAAGTTTTTGTTCAATAACCAAACAGTCGGCCTTAAATAATATTCTGATATCTGGATGAACAGGTATCTGCAACAGCTTAGCTATCTTTAAAACGTTTTCCTTAAATTCATCACTGTTAACATCTATGTTATTAAAAGCGTTCGTGGAAAGAGTAGAGTTCTCAGATATACTGTTGTGTTGAGTATTTCTAGATGAGTTGTATTCCAATAGTAGCGCTTTGCTAAGAAGCCAATCCAACATAGCCCAACAACTAGATTCATTAAAAGGGCACTTTACTGTCTGGAGATACTTATTTAAATAGCTTGTCCATTCCAAAGATTGTACGTCACGCAATCTTGCTTCAGCAGGAAGAGCTCGAATAATTCTATCCTCTAGCCATACGATCACATTGCGTACATTGGTC                                                                                                                                                                                 ]
[-] EMBL CD196435             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               cAACATCTATGTTATTAAAAGCGTTCGTGGAAAGAGTAGAGTTCCCAGATATACTGTTGTGTTGAGTATTTCTAGATGAGTTGTATTCCAATAGTAGTGCTTTGCTAAGAAGCCAATCCAACATAGCCCAACAACTAGATTCATTAAAAGGGCACTTTACTGTCTGGAGATACTTATTTAAATAGCTTGTCCATTCCAAAGATTGTACGTCACGCAATCTTGCTTCAGCAGGAAGAGCTCGAATAATTCTATCCTCTAGCCATACGATCACATTGCGTACATTGGTCAAATCTGAAATATCGAAAACATCGTGCACGGGATAGTTGACAGAATGAAGCTTGAAACGTAGTCGTTCATTAGCCAACATCGTAATAATCCGACGAGGGAGAGAAATATGGAAGAAATCAGACTAAGGGATCAAAA                                         ]


>consensus_10486#2 GATCACAATGTATTGTTTCATGGAAAAATCTGTTCATTCANCAAATTATGCATTAAAAAA TTTAGAAGCCAACTTTTCCAAGTCTTTCGTCAGTTTTTGGATCTGCTGTCAATTTTTGAA CATGTACTATGCTAGCATTTGCTTGGTTTTGTAATTTTCGTAGCCGATCTATATTTAACA ATCTTAACGCAACAGCCGCAGCCTCTACAACAGGATCTTTAACACTAAATCCAAGACATA CATCATCGAGCTTTAACATATCAATTTTAGATGTCCCATAGTCCTTTATAGCATCATTCA ATATATTTACCTCAAGTTTTTGTTCAATAACCAAACAGACGGCCTTAAATAATATTCTGA TATCTGGATGAACAGGTATCTGCAACAGCTTAGCTATCTTTAAAACGTTTTCCTTAAATT CATCACTGTTAACATCTATGTTATTAAAAGCGTTCGTGGAAAGAGTAGAGTTCTCAGATA TACTGTTGTGTTGAGTATTTCTAGATGAGTTGTATTCCAATAGTAGTGCTTTGCTAAGAA GCCAATCCAACATAGCCCAACAACTAGATTCATTAAAAGGGCACTTTACTGTCTGGAGAT ACTTATTTAAATAGCTTGTCCATTCCAAAGATTGTACGTCACGCAATCTTGCTTCAGCAG GAAGAGCTCGAATAATTCTATCCTCTAGCCATACGATCACATTGCGTACATTGGTCAAAT CTGAAATATCGAAAACATCGTGCACGGGATAGTTGACAGAATGAAGCTTGAAACGTAGTC GTTCATTAGCCAACATCGTAATAATCCGACGAGGGAGAGAAATATGGAAGAAATCAGACT AAGGGATCAAAAGTCTGCCTCGTGCCGAATTNTTGGCTCGAGGG



consensus multiple alignement with clustalw

CLUSTAL W (1.82) multiple sequence alignment


consensus_10486#1      --------------------------------------------AAAGAAGTTCACTTTA 16
consensus_10486#2      ------------------------------------------------------------
consensus_10486#0      TACGCAGTACGGTAATGCAGCTGCATGGCATGTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTA 60
                                                                                   

consensus_10486#1      AAAGTAATAATTTCAGATCACAATGTATTGTTTCATGGAAAAATCTGTTCATTCAACAAA 76
consensus_10486#2      ---------------GATCACAATGTATTGTTTCATGGAAAAATCTGTTCATTCANCAAA 45
consensus_10486#0      AAAGTAATAATTTCAGATCACAATGTATTGTTTCATGGAAAAATCTGTTCATTCAACAAA 120
                                      **************************************** ****

consensus_10486#1      TTATGCATTAAAAAATTTAGAAGCCAACTTTTCCAAGTCTTTCGTCAGTTTTTGGATCTG 136
consensus_10486#2      TTATGCATTAAAAAATTTAGAAGCCAACTTTTCCAAGTCTTTCGTCAGTTTTTGGATCTG 105
consensus_10486#0      TTATGCATTAAAAAATTTAGAAGCCAACTTTTCCAAGTCTTTCGTCAGTTTTTGGATCTG 180
                       ************************************************************

consensus_10486#1      CTGTCAATTTTTGAACATGTACTATGCTAGCATTTGCTTGGTTTTGTAATTTTCGTAGCC 196
consensus_10486#2      CTGTCAATTTTTGAACATGTACTATGCTAGCATTTGCTTGGTTTTGTAATTTTCGTAGCC 165
consensus_10486#0      CTGTCAATTTTTGAACATGTACTATGCTAGCATTTGCTTGGTTTTGTAATTTTCGTAGCC 240
                       ************************************************************

consensus_10486#1      GATCTATATTTAACAATCTTAACGCAACAGCCGCAGCCTCTACAACAGGATCTTTAACAC 256
consensus_10486#2      GATCTATATTTAACAATCTTAACGCAACAGCCGCAGCCTCTACAACAGGATCTTTAACAC 225
consensus_10486#0      GATCTATATTTAACAATCTTAACGCAACAGCCGCAGCCTCTACAACAGGATCTTTAACAC 300
                       ************************************************************

consensus_10486#1      TAAATCCAAGACATACATCATCGAGCTTTAACATATCAATTTTAGATGTCCCATAGTCCT 316
consensus_10486#2      TAAATCCAAGACATACATCATCGAGCTTTAACATATCAATTTTAGATGTCCCATAGTCCT 285
consensus_10486#0      TAAATCCAAGACATACATCATCGAGCTTTAACATATCAATTTTAGATGTCCCATAGTCCT 360
                       ************************************************************

consensus_10486#1      TTATAGCATCATTCAATATATTTACCTCAAGTTTTTGTTCAATAACCAAACAGACGGCCT 376
consensus_10486#2      TTATAGCATCATTCAATATATTTACCTCAAGTTTTTGTTCAATAACCAAACAGACGGCCT 345
consensus_10486#0      TTATAGCATCATTCAATATATTTACCTCAAGTTTTTGTTCAATAACCAAACAGACGGCCT 420
                       ************************************************************

consensus_10486#1      TAAATAATATTCTGATATCTGGATGAACAGGTATCTGCAACAGCTTAGCTATCTTTAAAA 436
consensus_10486#2      TAAATAATATTCTGATATCTGGATGAACAGGTATCTGCAACAGCTTAGCTATCTTTAAAA 405
consensus_10486#0      TAAATAATATTCTGATATCTGGATGAACAGGTATCTGCAACAGCTTAGCTATCTTTAAAA 480
                       ************************************************************

consensus_10486#1      CGTTTTCCTTAAATTCATCACTGTTAACATCTATGTTATTAAAAGCGTTCGTGGAAAGAG 496
consensus_10486#2      CGTTTTCCTTAAATTCATCACTGTTAACATCTATGTTATTAAAAGCGTTCGTGGAAAGAG 465
consensus_10486#0      CGTTTTCCTTAAATTCATCACTGGTAACATCTATGTTATTAAAAGCGT-CGTGGAA-GAG 538
                       *********************** ************************ ******* ***

consensus_10486#1      TAGAGTTCTCAGATATACTGTTGTGTTGAGTATTTCTAGATGAGTTGTATTCCAATAGTA 556
consensus_10486#2      TAGAGTTCTCAGATATACTGTTGTGTTGAGTATTTCTAGATGAGTTGTATTCCAATAGTA 525
consensus_10486#0      TANAGT-CTCANATACG-TGTATTTCTNNNNNNNNNNNAATA--TNGTATTC-AATA-TA 592
                       ** *** **** ***   ***  *  *            **   * ****** **** **

consensus_10486#1      GTGCTTTGCTAAGAAGCCAATCCAACATAGCCCAACAACTAGATTCATTAAAAGGGCACT 616
consensus_10486#2      GTGCTTTGCTAAGAAGCCAATCCAACATAGCCCAACAACTAGATTCATTAAAAGGGCACT 585
consensus_10486#0      NTGCCTTGCTA-GAAGCCATCC--ACATAGCCCA--CACCTGATTCAT--AAAAGGCCCT 645
                        *** ****** *******  *  **********   **  *******  *** *** **

consensus_10486#1      TTACTGTCTGGAGATACTTA----------TTTAAATA-GCTTGTCCATTCCAAAGATTG 665
consensus_10486#2      TTACTGTCTGGAGATACTTA----------TTTAAATA-GCTTGTCCATTCCAAAGATTG 634
consensus_10486#0      TTACTGCTGAAATACTATTAATAACTGGCATCCAAAAATGACGGCCCCATCTGCTAACCG 705
                       ******     * *   ***          *  *** * *   * **  **     *  *

consensus_10486#1      TACGTCACGCAATCTTGCT-TCAGCAGGAA-GAGCTCGAATAATTCTAT--------CCT 715
consensus_10486#2      TACGTCACGCAATCTTGCT-TCAGCAGGAA-GAGCTCGAATAATTCTAT--------CCT 684
consensus_10486#0      GAAACTTAATAATTTCCTTACCATCAACATTGGGCATGGGCAATTGAATTTGAACTCCCC 765
                        *        *** *   *  ** **  *  * **  *   ****  **        ** 

consensus_10486#1      CTAGCCATACGATCACATTGCGTACATT----------------GGTCAAATCTGAAATA 759
consensus_10486#2      CTAGCCATACGATCACATTGCGTACATT----------------GGTCAAATCTGAAATA 728
consensus_10486#0      CCNNNNNNNNNNNNATTTGACGTGCGTTTCCCCTTTTTTTTCCCGGGGAAAATGGGAAAA 825
                       *             *  *  *** * **                **  ***   * ** *

consensus_10486#1      TCGA-AAACATCGTGCACGGGATAGTTGA--CAGAATGAAGCTTGAAACGTAGTCGTTCA 816
consensus_10486#2      TCGA-AAACATCGTGCACGGGATAGTTGA--CAGAATGAAGCTTGAAACGTAGTCGTTCA 785
consensus_10486#0      TCGATGAAAATTTTCCCCCATTTGGCCAGGCCACCTTAAGGGGAAAAAAATTATATCTCT 885
                       ****  ** **  * * *    * *      **   * * *    ***  *  *   ** 

consensus_10486#1      TTAG---CCAACATCGTAATAATCCGACGAGGGAGAGAAATATGGAAGAA-ATCAGACT- 871
consensus_10486#2      TTAG---CCAACATCGTAATAATCCGACGAGGGAGAGAAATATGGAAGAA-ATCAGACT- 840
consensus_10486#0      GGAGATTCTCTCTCCNCAAACANNNNNNAAGGNAGGGGGGAAAGAAAAAATATTGTCCTC 945
                         **   *   *  *  **  *       *** ** *    * * ** ** **    ** 

consensus_10486#1      ---AAGGGATCAAAAGTCTGGTTATTCTTTAATTTGTTGCATTCAA- 914
consensus_10486#2      ---AAGGGATCAAAAGTCTGCCTCGTGCCGAATTNTTGGCTCGAGGG 884
consensus_10486#0      TTAAAAAGCCCTTAAAGCGGGGGGGGGGTTCTCTCCTTTCTCG---- 988
                          **  *  *  **  * *             *  *  *       




Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)