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These datas are free for academic use only, please contact me for any other use. Schistosoma mansoni see consensus multiple alignment with clustalw Direct access to contigs :
consensusID : consensus_10496#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 17 consensus length = 574 fasta sequence
[GTCTCTGGGGACAATCAATGAGGTACTGTGGTTTTATGAATCCCAATGC-GTGAGCCATCGGCGTGTCACCCCGTCATTCGGCAAGAATACTAACTTTT-GCGAGGCGCAATATATCAAACCAACGTAGCCAGTCATTTGATTAGGCCTCATCGCATATTGAGCTAATATCAATTGGCGTTTACAATTATCAACGTGTACTGCATAGTTCTGTGGTTTGCTCCAGTTTATCGGCTTTATTTGATGTAAAAGTGAAACAACTATCCAGTCATGTCAGTTACCGAACAGAGCACCGTTGTTAGAATGCCACGACTTTCAAACGCCGATGCTCGTCATGGTAGTTTCCAGCCGTATCCCAGAGGTTCAAAACTCTCACGTCAGTTACAACAGCCTCACGTCACACTGGTTGAATATAAAACAGCTCGTTTTTTAATCACAGATGAACCTAATGCACACAATATGGAAAATTTTGTCATGGTTTTTAAACTACACAATGTACGCAAATTGGTTCGAGTGTGTAAAGCTACCTATGATAAAGAACCACTTGAAGCTGTTGGAATTGAAGTTGTGGAT-CTTT]
[+] EMBL CD141972 [GTCTCTGGGGACAATCAATGAGGTACTGTGGTTTTATGAATCCCAATGCAGTGAGCCATCGGCGTGTCACCCCGTCATTCGGCAAGAATACTAACTTTT GCGAGGCGCAATATATCAAACCAACGTAGCCAGTCATTTGATTAGGCCTCATCGCATATTGAGCTAATATCAATTGGCGTTTACAATTATCAACGTGTACTGCATAGTTCTGTGGTTTGCTCCAGTTTATCGGCTTTATTTGATGTAAAAGTGAAACAACTATCCAGTCATGTCAGTTACCGAACAGAGCACCGTTGTTAGAATGCCACGACTTTCAAACGCCGATGCTCGTCATGGTAGTTT ]
[+] EMBL CD069930 [ aGC GTGAGCCATCGGCGTGTCACCCCTTCATTCGGCAAGAATACTAACTTTT CCGAGGCGCAATATATCAAACCAACGTAGCCAGTCATTTGATTAGGCCTCATCGCATATTGAGCTAATATCAATTGGCGTTTACAATTATCAACGTGTACTGCATAGTTCTGTGGTTTGCTCCAGTTTATCGGCTTTATTTGATGTAAAAGTGAAACAACTATCCAGTCATGTCAGTTACCGAACAGAGCACCGTTGTTAGAATGCCACGACTTTCAAACGCCGATGCTCGTCATGGTAGTTTCCAGCCGTATCCCAGAGGTTCAAAACTCTCACGTCAGTTACAACAGCCTCACGTCACACTGGTTGAATATAAAACAGCTCGTTTTTTAATCACAGATGAACCTAATGCACACAATATGGAAAATTTTGTCATGGTTTTTAAACTACACAATGTACGCAGATTGGTTCGAGTGTGTAAAGCTACCTATGATAAAGAACCACTTGAAGATGTTGGAATTGAAGTTGTGGAT CT ]
[-] EMBL CD063128 [ TGAGCCATCGGCGTGTCACCCCGTCATTCGGCAAGAATACTAGCTTTT GCGAGGCGCAATATATCAAACCAACGTAGCCAGTCATTTGATTAGGCCTCATCGCATATTGAGCTAATATCAATTGGCGTTTACAATTATCAACGTGTACTGCATAGTTCTGTGGTTTGCTCCAGTTTATCGGCTTTATTTGATGTAAAAGTGAAACAACTATCCAGTCATGTCAGTTACCGAACAGAGCACCGTTGTTAGAATGCCACGACTTTCAAACGCCGATGCTCGTCATGGTAGTTTCCAGCCGTATCCCA ]
[+] EMBL CD069895 [ CCATCGGCGTGTCCCTCNGTC TTCGGCAAGAATACTAACTCTT GCGAGGCGCAATATATCAAACCAACGTAGCCAGTCATTTGATTAGGCCTCATCGCATATTGAGCTAATATCAATTGGCGTTTACAATTATCAACGTGTACTGCATAGTTCTGTGGTTTGCTCCAGTTTATCGGCTTTATTTGATGTAAAAGTGAAACAACTATCCAGTCATGTCAGCTACCGAACAGAGCACCGTTGTTAGAATGCCACGACTTTCAAACGCCGATGCTCGTCATGGTAGTTTCCTGCCGTATCCCAGAGGTTCAAAACTCTCACGTCAGTTACAACAGCCTCACGTCACACTGGTTGAATATAAAACAGCTCGTTTTTTAATCACAGATGAACCTAATGCACACAATATGGAAAATTTTGTCATGGTTTTTAAACTACACAATGTACGCAAATTGGTTCGAGTGTGTAAAGCTACCTATGATAAAGAACCACTTGAAGCTGTTGGAATTGAAGTTGTGGAT CT ]
[+] EMBL CD069837 [ CCCTTTCATTCGGCAAGAATACTAACTTTTCGCGAGGCGCAATATATCAAACCAACGTAGCCAGTCATTTGATTAGGCCTCATCGCATATTGAGCTAATATCAATTGGCGCTTACAATTATCAACGTGTACTGCATAGTTCTGTGGTTTGCTCCAGTTTATCGGCTTTATTTGATGTAAAAGTGAAACAACTATCCAGTCATGTCAGTTACCGAACAGAGCACCGTTGTTAGAATGCCACGACTTTCAAACGCCGATGCTCGTCATGGTAGTTTCCAGCCGTATCCCAGAGGTTCAAAACTCTCACGTCAGTTACAGCAGCCTCACGTCACACTGGTTGAATATAAAACAGCTCGTTTTTTAATCACAGATGAACCTAATGCACACAATATGGAAAATTTTGTCATGGTTTTTAAACTACACAATGTACGCAAATTGGTTCGAGTGTGTAAAGCTACCTATGATAAAGAACCACTTGAAGCTGTTGGAATTGAAGTTGTGGAT CT ]
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[+] EMBL CD069883 [ cctttTCATTCGGCAAGAATACTAACTTTC GCGAGGCGCAATATATCAAACCAACGTAGCCAGTCATTTGATTAGGCCTCATCGCATATTGAGCTAATATCAATTGGCGTTTACAATTATCAACGTGTACTGCATAGTTCTGTGGTTTGCTCCAGTTTATCGGCTTTATTTGATGTAAAAGTGAAACAACTATCCAGTCATGTCAGTTACCGAACAGAGCACCGTTGTTAGAATGCCACGACTTTCAAACGCCGATGCTCGTCATGGTAGTTTCCAGCCGTATCCCAGAGGTTCAAAACTCTCACGTCAGTTACAACAGCCTCACGTCACACTGGTTGAATATAAAACAGCTCGTTTTTTAATCACAGATGAACCTAATGCACACAATATGGAAAATTTTGTCATGGTTTTTAAACTACACAATGTACGCAAATTGGTTCGAGTGTGTAAAGCTACCTATGATAAAGAACCACTTGAAGCTGTTGGAATTGAAGTTGTGGAT CT ]
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clustalw multiple alignements is not computed in this case |
| Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) | ||||