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Schistosoma mansoni
cluster # 1054 cluster # 1054       Sequences # 2       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_1054#0 length = 745 sequences # 2  

consensusID : consensus_1054#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 2
consensus length = 745
fasta sequence
                              [CGGGCCAGAATTCGGCACGAGGAGCAACCGCGCGATCCGAAATTTTGTCTAACAGTGTATATGGATTTCGGCTTCTTCGTTTCTTGGTAGCTGCTCATCATATGACATAGATTTGCAGGTAGTAAAACCCAATTTTAGAGTGTAAACTACCTAGTTGATCATGTTCTTCGACACTATATGATGGAATTAGAATTCGGTTTCACTTGTAACACAAACACAACGACATCTCCAAGGCGAAGGATACAGTATTCTCAAGTAATACGCAACCTGCAAATAAGTAAACGACAGATTTCCAAGGGGTTAGCAAGATATTTACGCTAGAAGTTAAGATTGTCAACGAGTACTATATGAGGATCCTCAGTAACTGGCAAGTTACATGTTGATTATGGTTTGGTTTTTTCCTGTTGAGTCTCAGTTGCATATGTCCTTTATAACATCTTTCAGAATGACTTTAAAAAAGGGGGATTTGTTATCAATTATAAGGAGTCTAAACTTCTCAGGATACCATGATTTTAGATACTAACTGGTTTATAATGAAAGTGTTAGTGGGACATAGATTGGATTAAAGCATGTTTTATGCATGATGGTGTTGCTGCGCACTGATTGACTAATTCTAAACCGATCAACCCGGGCATATTATTGGAGAAAAATCTAGAAGCTTCTTATGTATATACTGTAAATATATGACCGTTATTTAAACTAGTGATTGCTGTTCA-TTATCATTATTATTTTGAATACAATTTCG]

[+] EMBL CD079317             [CGGGCCAGAATTCGGCACGAGGAGCAACCGCGCGATCCGAAATTTTGTCTAACAGTGTATATGGATTTCGGCTTCTTCGTTTCTTGGTAGCTGCTCATCATATGACATAGATTTGCAGGTAGTAAAACCCAATTTTAGAGTGTAAACTACCTAGTTGATCATGTTCTTCGACACTATATGATGGAATTAGAATTCGGTTTCACTTGTAACACAAACACAACGACATCTCCAAGGCGAAGGATACAGTATTCTCAAGTAATACGCAACCTGCAAATAAGTAAACGACAGATTTCCAAGGGGTTAGCAAGATATTTACGCTAGAAGTTAAGATTGTCAACGAGTACTATATGAGGATCCTCAGTAACTGGCAAGTTACATGTTGATTATGGTTTGGTTTTTTCCTGTTGAGTCTCAGTTGCATATGTCCTTTATAACATCTTTCAGAATGACTTTAAAAAAGGGGGATTTGTTATCAATTATAAGGAGTCTAAACTTCTCAGGATACCATGATTTTAGATACTAACTGGTTTATAATGAAAGTGTTAGTGGGACATAGATTGGATTAAAGCATGTTTTATGCATGATGGTGTTGCTGCGCACTGATTGACTAATTCTAAACCGATCAACCCGGGCATATTATTGGAGAAAAATCTAGAAGCTTCTTATGTATATACTGTAAATATATGACCGTTATTTAAACTAGTGATTGCTGTTCA TTATCATTATTATTTTGAATACAATT   ]
[-] EMBL CD073595             [                                                                                                                              ACCCAATTTTAGAGTGTAAACTACCTAGTTGATCATGTTCTTCGACACTATATGATGGAATTAGAATTCGGTTTCACTTGTAACACAAACACAACGACATCTCCAAGGCGAAGGATACAGTATTCTCAAGTAATACGCAACCTGCAAATAAGTAAACGACAGATTTCCAAGGGGTTAGCAAGATATTTACGCTAGAAGTTAAGATTGTCAACGAGTACTATATGAGGATCCTCAGTAACTGGCAAGTTACATGTTGATTATGGTTTGGTTTTTTCCTGTTGAGTCTCAGTTGCATATGTCCTTTATAACATCTTTCAGAATGACTTTAAAAAAGGGGGATTTGTTATCAATTATAAGGAGTCTAAACTTCTCAGGATACCATGATTTTAGATACTAACTGGTTTATAATGAAAGTGTTAGTGGGACATAGATTGGATTAAAGCATGTTTTATGCATGATGGTGTTGCTGCGCACTGATTGACTAATTTTAAACCGATCAACCCGGGCATATTATTGGAGAAAAATCTAGAAGCTTCTTATGTATATACTGTAAATATATGAACGTTATTTAAACTAGTGATTGCTGTTCACTTATCATTATTATTTTGAATACAATTTCG]


>consensus_1054#0 CGGGCCAGAATTCGGCACGAGGAGCAACCGCGCGATCCGAAATTTTGTCTAACAGTGTAT ATGGATTTCGGCTTCTTCGTTTCTTGGTAGCTGCTCATCATATGACATAGATTTGCAGGT AGTAAAACCCAATTTTAGAGTGTAAACTACCTAGTTGATCATGTTCTTCGACACTATATG ATGGAATTAGAATTCGGTTTCACTTGTAACACAAACACAACGACATCTCCAAGGCGAAGG ATACAGTATTCTCAAGTAATACGCAACCTGCAAATAAGTAAACGACAGATTTCCAAGGGG TTAGCAAGATATTTACGCTAGAAGTTAAGATTGTCAACGAGTACTATATGAGGATCCTCA GTAACTGGCAAGTTACATGTTGATTATGGTTTGGTTTTTTCCTGTTGAGTCTCAGTTGCA TATGTCCTTTATAACATCTTTCAGAATGACTTTAAAAAAGGGGGATTTGTTATCAATTAT AAGGAGTCTAAACTTCTCAGGATACCATGATTTTAGATACTAACTGGTTTATAATGAAAG TGTTAGTGGGACATAGATTGGATTAAAGCATGTTTTATGCATGATGGTGTTGCTGCGCAC TGATTGACTAATTCTAAACCGATCAACCCGGGCATATTATTGGAGAAAAATCTAGAAGCT TCTTATGTATATACTGTAAATATATGACCGTTATTTAAACTAGTGATTGCTGTTCATTAT CATTATTATTTTGAATACAATTTCG



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)