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Schistosoma mansoni
cluster # 1055 cluster # 1055       Sequences # 2       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_1055#0 length = 878 sequences # 2  

consensusID : consensus_1055#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 2
consensus length = 878
fasta sequence
                              [ACTATTTATTGATACATAACAAAAAGAAATTTAACTTGTAGTGATGAACATGATGAGACGAAAAAAAAGAACAATGAATTATCATAACTACATGATTGTAAAATAATGCTCATTAGCAGTAATACTAGCAATATGAAAACCTTTGGAAAATTTCAGTGAGATAAAGATTGTTATTTGGTTTGAATAAAGAGTAGTCTGTAATACTGCTGCTAATTTAATGTTAAACGCTTAACAAAACAATGTTAAGCAATAATAATAGTAATAATAACAATAAGAATTAACGCAAATTTGCTTAAATATGCAAAATTTTTAGGGATACGAACGAGAATATTCACTTGATGAATATTATGGAACAATGCATGATCACAGTAGGGCTATTGCACCT-AAGGAAAAAAAAGGAAACCAAACAGTAGACGACTCTTGATAAACAAAGATTAGCCTAATGAAAAAAAGAAGAAAAAATCAACCACATTATTGTATCGATTTTATCGACAAACTAATGAATAAAAGAATTAATTCATTTACATAATTATATACAGAAAGTAACAGTATTGATATTATTTGTTTATATGTTATCATAAATTATTTATATCTGATGTATCAACAGCTGTAACATCTGATCCTATTAGATAATGATTCATTTGTTCTGCTTTCGGTGTCATTTGTGAAGTTTGCGGTTGTCCTTCTATTTTTACTCTTGTTAAATCAGGTCGAACAGCATTTAAACATTCCCAGCTGATATCCAACGACGATCGACGTCCACGCATCCATGCTACATATTCTTCTAATTTATCATTGCCAATAGCAGTTGTTGCATTATCGTGATGAACAGAGTTCACAAACGATAAAAGTCCCAACGACGAACAAAACGCCCTCGA]

[+] EMBL CD075809             [ACTATTTATTGATACATAACAAAAAGAAATTTAACTTGTAGTGATGAACATGATGAGACGAAAAAAAAGAACAATGAATTATCATAACTACATGATTGTAAAATAATGCTCATTAGCAGTAATACTAGCAATATGAAAACCTTTGGAAAATTTCAGTGAGATAAAGATTGTTATTTGGTTTGAATAAAGAGTAGTCTGTAATACTGCTGCTAATTTAATGTTAAACGCTTAACAAAACAATGTTAAGCAATAATAATAGTAATAATAACAATAAGAATTAACGCAAATTTGCTTAAATATGCAAAATTTTTAGGGATACGAACGAGAATATTCACTTGATGAATATTATGGAACAATGCATGATCACAGTAGGGCTATTGCACCT AAGGAAAAAAAAGGAAACCAAACAGTAGACGACTCTTGATAAACAAAGATTAGCCTAATGAAAAAAAGAAGAAAAAATCAACCACATTATTGTATCGATTTTATCGACAAACTAATGAATAAAAGAATTAATTCATTTACATAATTATATACAGAAAGTAACAGTATTGATATTATTTGTTTATATGTTATCATAAATTATTTATATCTGATGTATCAACAGCTGTAACATCTGATCCTATTAGATAATGATTCATTTGTTC                                                                                                                                                                                                                                       ]
[-] EMBL CD082196             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   ATGCATGATCACAGTAGGGCTA TGCACCTAAAGGAAAAAAAAGGAAACCAAACAGTAGACGACTCTTGATAAACAAAGATTAGCCTAATGAAAAAAAGAAGAAAAAATCAACCACATTATTGTATCGATTTTATCGACAAACTAATGAATAAAAGAATTAATTCATTTACATAATTATATACAGAAAGTAACAGTATTGATATTATTTGTTTATATGTTATCATAAATTATTTATATCTGATGTATCAACAGCTGTAACATCTGATCCTATTAGATAATGATTCATTTGTTCTGCTTTCGGTGTCATTTGTGAAGTTTGCGGTTGTCCTTCTATTTTTACTCTTGTTAAATCAGGTCGAACAGCATTTAAACATTCCCAGCTGATATCCAACGACGATCGACGTCCACGCATCCATGCTACATATTCTTCTAATTTATCATTGCCAATAGCAGTTGTTGCATTATCGTGATGAACAGAGTTCACAAACGATAAAAGTCCCAACGACGAACAAAACGCCCTCGA]


>consensus_1055#0 ACTATTTATTGATACATAACAAAAAGAAATTTAACTTGTAGTGATGAACATGATGAGACG AAAAAAAAGAACAATGAATTATCATAACTACATGATTGTAAAATAATGCTCATTAGCAGT AATACTAGCAATATGAAAACCTTTGGAAAATTTCAGTGAGATAAAGATTGTTATTTGGTT TGAATAAAGAGTAGTCTGTAATACTGCTGCTAATTTAATGTTAAACGCTTAACAAAACAA TGTTAAGCAATAATAATAGTAATAATAACAATAAGAATTAACGCAAATTTGCTTAAATAT GCAAAATTTTTAGGGATACGAACGAGAATATTCACTTGATGAATATTATGGAACAATGCA TGATCACAGTAGGGCTATTGCACCTAAGGAAAAAAAAGGAAACCAAACAGTAGACGACTC TTGATAAACAAAGATTAGCCTAATGAAAAAAAGAAGAAAAAATCAACCACATTATTGTAT CGATTTTATCGACAAACTAATGAATAAAAGAATTAATTCATTTACATAATTATATACAGA AAGTAACAGTATTGATATTATTTGTTTATATGTTATCATAAATTATTTATATCTGATGTA TCAACAGCTGTAACATCTGATCCTATTAGATAATGATTCATTTGTTCTGCTTTCGGTGTC ATTTGTGAAGTTTGCGGTTGTCCTTCTATTTTTACTCTTGTTAAATCAGGTCGAACAGCA TTTAAACATTCCCAGCTGATATCCAACGACGATCGACGTCCACGCATCCATGCTACATAT TCTTCTAATTTATCATTGCCAATAGCAGTTGTTGCATTATCGTGATGAACAGAGTTCACA AACGATAAAAGTCCCAACGACGAACAAAACGCCCTCGA



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)