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Schistosoma mansoni
cluster # 10575 cluster # 10575       Sequences # 18       consensus # 2


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_10575#0 length = 1372 sequences # 17  
consensus_10575#1 length = 543 sequences # 1  

consensusID : consensus_10575#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 17
consensus length = 1372
fasta sequence
                              [CTTGTGATTTGTTGCATGTTTCCCAATATGAACATTTACACATTTCTGTACATCTTAGTTTATTTATTCAATACGAACAGTTCAACAGTAACAACGACAATCTTAGATAATGACTCGTCAGGTTCTTCATCTCGTTTACTGGTTCTTCTAATTGATGGGCTAAGATGGGATGTAATAGCTGGTCATTTAGAAAATAATACTAATCGATTCGGATTTAAACGACTACAGAAAAATGGTGCGTATTTGCAGCGTTTCAC-TCCTGTATTTCCTGCAGAGTGTTATCCGAATATTTACTCACTATTTACAGGTCGTCATCCAGTCGATCATGGAGTTATTCTGCCAACAACATTTAGTGAACATACAACTATTAATGGTAAGCCTATTCGTTCACAAGTTGAAGGTCTTTGGGAAACAGGAGTAAAAC-AAAATAAAGGTGCTCATCTTTATCATTTGCCTATATGTTCTACTGAAGCTGGCACTGATAATAGTTGGTATTGTGAACCGTATAGTCAAGAAGTTATGAATCCTATGCATTTGAATGCTACAATACAAAAAGCTGTGGATGGGCTAAAAAACGG-AGTG-GAATTTGGCAGTGGTATACTACGATGAATTAGATCGTATCGGACATAGATATGGTCCATTATCTAATGAATTAGTTCATAAACATTTAGTGTATTTGGATCATGTTTTAGACTATGCATTGAACATCATAGAATCTATACCAAATTTAAATTTAATGCTAACTTCTGACCATGGTATGGCTACAGTCTCACATCAAGCACATGCTGATCGTTATTTTAAAGGGACAGAATTAGATAGAGTACTGAATCGTGGAAGTACATTGTGGATCTGGCCTAAACCAGAATTTGAAAACAATGTGTATAATCGTTTACTAATTCAACAAAGTAAATCTCCTTTCACTGTATACAATTCATCGACCATTCTTTCACATTGGGAAATTATGACAAATAACAATAATAATAATTCATTATTGCCACCGGTATTGTTAATCGCTTCACCGAATTATATATTTCATTCCAAGGCATGGCCATTAAATATGAGTCATTACAATTTAATCGATCCCAAAGGAATGCATGGCTATGATCCAGAACTACCTGATATGCATATTCCATTATTTATTTATGGTCCAAATATTAATCGTGGTGTTCAATTAAATTTTACCAAAGAAATTCGTTCAGTTCATATACATAGTTTAATGGCTTATTTAGCATCGATTAATCTGCCAGATTTTCGTTCACTCGATTTATTCAAACCATTACTTTCACACAATTATTATCATCATCAGTTGTCACCTGTGGTGAAATATTTCTATTGGCCATTGAATGACAAATCATCATCATCATTATCATTT]

[+] EMBL BF936305             [CTTGTGATTTGTTGCATGTTTCCCAATATGAACATTTACACATTTCTGTACATCTTAGTTTATTTATTCAATACGAACAGTTCAACAGTAACAACGACAATCTTAGATAATGACTCGTCAGGTTCTTCATCTCGTTTACTGGTTCTTCTAATTGATGGGCTAAGATGGGATGTAATAGCTGGTCATTTAGAAAATAATACTAATCGATTCGGATTTAAACGACTACAGAAAAATGGTGCGTATTTGCAGCGTTTCA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                ]
[+] EMBL AI975128             [  TGTGATTTGTTGCATGTTTCCCAATATGAACATTTACACATTTCTGTACATCTTAGTTTATTTATTCAATACGAACAGTTCAACAGTAACAACGACAATCTTAGATAATGACTCGTCAGGTTCTTCATCTCGTTTACTGGTTCTTCTAATTGATGGGCTAAGATGGGATGTAATAGCTGGTCATTTAGAAAATAATACTAATCGATTCGGATTTAAACGACTACAGAAAAATGGTGCGTATTTGCAGCGTTTCAC TCCTGTATTTCCTGCAGAGTGTTATCCGAATATTTACTCACTATTTACAGGTCGTCATCCAGTCGATCATGGAGTTATTCTGCCAACAACATTTAGTGAACATACAACTATTAATGGTAAGCCTATTCGTTCACAAGTTGAAGGTCTTTGGGAAACAGGAGTAAAAC AAAATAAAGGTGCTCATCTTTATCATTTGCCTATATGTTCTACTGAAGCTGGC                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 ]
[+] EMBL AI975201             [  cGTGATTTGTTGCATGTTTCCCAATATGAACATTTACACATTTCTGTACATCTTAGTTTATTTATTCAATACGAACAGTTCAACAGTAACAACGACAATCTTATATAATGACTCGTCAGGTTCTTCATCTCGTTTACTGGTTCTTCTAATTGATGGGCTAAGATGGGATGTAATAGCTGGTCATTTAGAAAATAATACTAATCGATTCAGATTTAAACGACTACAGAAAAATGGTGCGTATTTGCAGCGTTACAC TCCTGTATTTCCTGCAGAGTGTTATCCGAATATTTACTCACTATTTACAGGTCGTCATCCAGTCGATCATGGAGTTATTCTGCCAACAACATTTAGTGAACATACAACTATTAATGGTAAGCCTATTCGTTCACAAGTTGAAGGTCTTTGGGAAACAGGAGTAAAAC AAAATAAAGGTGCTCATCTTTATCATTTGCCTATATGTTCTACTGAAGCTGGCACTGATAATAGTTGGTATTGTGAACCGTA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    ]
[+] EMBL AI975883             [     GATTTGTTGCATGTTTCCCAATATGAACATTTACACATTTCTGTACATCTTAGTTTATTTATTCAATACGAACAGTTCAACAGTAACAACGACAATCTTAGATAATGACTCGGCAGGTTCTTCATCTCGTTTACTGGTTCTTCTAATTGATGGGCTAAGATGGGATGTAATAGCTGGTCATTTATAAAATAATACTAATCGATTCGGATTTAAACGACTACAGAAAAATGGTGCGTATTTGCAGCGGTTCACTTCCTGTATTTCCTGCGGAGGGTTATCCGAATATTTACTCACTATTTACAGGTCGTCATCCAGTCGATCATGGAGTTATTCTGCCAACAACATTTAGTGAACATACAACTATTAATGGTTAGCCTATTCGTTCACAAGTTGAAGGTCTTTGGGAAACAGGAGTAAAAC AAAATACAGGTGTTCATCTTTATCATTTGCCTATATGTTCTACTGAAGCTG                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   ]
[-] EMBL CD159563             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    gAAACGAGAATAAAGGTGTTCATCTTTATCATTTGCCTATATGTTCTACTGAAGCTGGCACTGAAAATAGTTGGTATTGTGAACCGTATAGTCAAGAAGTTATGAATCCTATGCATTTGAATGCTACAATACAAAAAGCTGTGGATGGGCTAAAAAACGGCAGTGCGAATTTGGCAGTGGTATACTACGATGAATTAGATCGTATCGGACATAGATATGGTCCATAATCTAATGAATTAGTTCATAAACATTTAGTGTATTTGGATCATGTTTTAGACTATGCATTGAACATCATAGAATCTATACCAAATTTAAATTTAAT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          ]
[+] EMBL CD069320             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              TCCTATGCATTTGAATGCTACAATACAAAAAGCTGTGGATGGGCTAAAAAACGG AGTG GAATTTGGCAGTGGTATACTACGATGAATTAGATCGTATCGGACATAGATATGGTCCATTATCTAATGAATTAGTTCATAAACATTTAGTGTATATGGATCATGTTTTAGACTATGCATTGAACATCATAGAATCTATACCAAATTTAAATTTAATGCTAACTTCTGACCATGGTATGGCTACAGTCTCACATCAAGC                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                ]
[+] EMBL BF936839             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           TCGTATCGGACATAGATATGGTCCATTATCTAATGAATTAGTTCATAAACATTTAGTGTATTTGGATCATGTTTTAGACTATGCATTGAACATCATAGAATCTATACCAAATTTAAATTTAATGCTAACTTCTGACCATGGTATGGCTACAGTCTCACATCAAGCACATGCTGATCGTTATTTTAAAGGGACAGAATTAGATAGAGTACTGAATCGTGGAAGTACATTGTGGATCTGGCCTAAACCAGAATTTGAAAACAATGTGTATAATCGTTTACTAATTCAACAAAGTAAATCTCCTTTCACTGTATACAATTCATCGACCATTCTTTCACATTGGGAAATTATGACAAATAACAATAATAATAATTCATTATTGCCACCGGTATTGTTAATCGCTTCACCGAATTATATATTTCATTCCAAGGCATGGCCATTAAATATGAGTCATTACAATTTAATCGATCCCAAAGGAATGCATGGCTATGATCCAGAACTACCTGATATGCATATTCCATTATTTATTTATGGTCCAAATATTAATCGTGGTGTTCAATTAAATTTTACCAAAGAAATTCGTTCAGTTCATATACATAGTTTAATGGCTTATTTAGCATCGATTAATCTGCCAGATTTTCGTTCACTCGATTTATTCAAACCATTACTTTCACACAATTATTATCATCATCAGTTGTCACCTGTGGTGAAATATTTCTATTGGCCATTGAATGACAAATCATCATCATCATTATCATTT]
[+] EMBL AI975169             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           TCGTATCGGACATAGATATGGTCCATTATCTAATGAATTAGTTCATAAACATTTAGTGTATTTGGATCATGTTTTAGACTATGCATTGAACATCATAGAATCTATACCAAATTTAAATTTAATGCTAACTTCTGACCATGGTATGGCTACAGTCTCACATCAAGCACATGCTGATCGTTATTTTAAAGGGACAGAATTAGATAGAGTACTGAATCGTGGAAGTACATTGTGGATCTGGCCTAAACCAGAATTTGAAAACAATGTGTATAATCGTTTACTAATTCAACAAAGTAAATCTCCTTTCACTGTATACAATTCATCGACCATTCTTTCACATTGGGAAATTATGACAAATAACAATAATAATAATTCATTATTGCCACCGGTATTGTTAATCGCTTCACCGAATTATATATTTCATTCCAAGGCATGGCCATTAAATATGAGTCATTACAATTTAATCGATCCCAAAGGAATGCATGGCTATGATCCAGAACTACCTGATATGCATATTCCATT                                                                                                                                                                                                                                              ]
[+] EMBL AI975701             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           TCGTATCGGACATAGATATGGTCCATTATCTAATGAATTAGTTCATAAACATTTAGTGTATTTGGATCATGTTTTAGACTATGCATTGAACATCATAGAATCTATACCAAATTTAAATTTAATGCTAACTTCTGACCATGGTATGGCTACAGTCTCACATCAAGCACATGCTGATCGTTATTTTAAAGGGACAGAATTAGATAGAGTACTGAATCGTGGAAGTACATTGTGGATCTGGCCTAAACCAGAATTTGAAAACAATGTGTATAATCGTTTACTAATTCAACAAAGTAAATCTCCTTTCACTGTATACAATTCATCGACCATTCTTTCACATTGGGAAATTATGACAAATAACAATAATAGTAATTCATTATTGCCACCGGTATTGTTAATCGCTTCACCGAATTATATATTTCATTCCAAGGCATGGCCATTAAATATGAGTCATTACAATTTAATCGATCCCAAAGGAATGCATGGCTATGATCCAGAACTACCTGATATGCA                                                                                                                                                                                                                                                       ]
[+] EMBL CD112155             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           TAAACCAGAATTTGAAAATAATGTGTATTATCGTTTACTAATTCAACAAAGTAAATCTCCTTTCACTGTATACAATTCATCGACCATTCTTTCACATTGGGAAATTATGACAAATAACAATAATAATAATTCATTATTGCCACCGGTATTGTTAATCGCTTCACCGAATTATATATTTCATTCCAAGGCATGGCCATTAAATATGAGTCATTACAATTTAATCGATCCCAAAGGAATGCATGGCTATGATCCAGAACTACCTGATATGCATATTCCATTATTTATTTATGGTCCAAATATTAATCGTGGTGTTCAATTAAATTTTACCAAAGAAATTCGTGCAGTTCATGTACATAGTTTAATGGCTTATTTAGCATCGATTAGTCTGCCAGATTTCCGTTCACTCGATTTATTCAGACC                                                                                                 ]
[+] EMBL CD112059             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           TAAACCAGAATTTGAAAACAATGTGTATAATCGTTTACTAATTCAACAAAGTAAACCTCCTTTCACTGTATACAATTCATCGACCATTCTTTCACATTGGGAAATTATGACAAATAACAATAATAATAATTCATTATTGCCACCGGTATTGTTAATCGCTTCACCGAATTATATATTTCATTCCAAGGCATGGCCGTTAAATATGAGTCATTACAATTTAATCGATCCCAAAGGAATGCATGGCTATGATCCAGAACTACCTGATATGCATATTCCATTATTTATTTATGGTCCAAATATTAATCGTGGTGTTCAATTAAATTTTACCAAAGAAATTCGTTCAGTTCATATACATAGTTTAATGGCTTATTTAGCATCGATTAATCCGCCAGATTTTCGTTCACTCGATTTATTCAAACC                                                                                                 ]
[+] EMBL CD112583             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           TAAACCAGAATTTGAAAACAATGTGTATAATCGTTTACTAATTCAACAAAGTAAATCTCCTTTCACTGTATACAATTCATCGACCATTCTTTCACATTGGGAAATTATGACAAATAACAATAATAATAATTCATTATTGCCACCGGTATTGTTAATCGCTTCACCGAATTATATATTTCATTCCAAGGCATGGCCATTATATATGAGTCATTACAATTTAATCGATCCCAAAGGAATGCATGGCTATGATCCAGAACTACCTGATATGCATATTCCATTATTTATTTATGGTCCAAATATTAATCGTGGTGTTCAATTAAATTTTACCAAAGAAATTCGTTCAGTTCATATACATAGTTTAATGGCTTATTTAGCATCGATTAATCTGCCAGATTTTCGTTCACTCGATTTATTCAAACC                                                                                                 ]
[+] EMBL CD112303             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           TAAACCAGAATTTGAAAACAATGTGTATAATCGTTTACTAATTCAACAAAGTAAATCTCCTTTCACTGTATACAATTCATCGACCATTCTTTCACATTGGGAAATTATGACAAATAACAATAATAATAATTCATTATTGCCACCGGTATTGTTAATCGCTTCACCGAATTATATATTTCATTCCAAGGCATGGCCATTAAATATGAGTCATTACAATTTAATCGATCCCAAAGGAATGCATGGCTATGATCCAGAACTACCTGATATGCATATTCCATTATTTATTTATGGTCCAAATATTAATCGTGGTGTTCAATTAAATTTTACCAAAGAAATTCGTTCAGTTCATATACATAGTTTAATGGCTTATTTAGCATCGATTAATCTGCCAGATTTTCGTTCACTCGATTTATTCAAACC                                                                                                 ]
[-] EMBL CD112530             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            AAACCAGAATTTGAAAACAATGTGTATAATCGTTTACTAATTCGACAAAGT AATCTCCTTTCACTGTATACAATTCATCGACCATTCTTTCACATTGGGAAATTATGACAAATAACAATAGTAATAATTCATTATTGCCACCGGTATTGTTAATCGCTTCACCGAATTATATATTTCATTCCAAGGCATGGCCATTAAATATGAGTCATTACAATTTAATCGATCCCAAAGGAATGCATGGCTATGATCCAGAACTACCTGATATGCATATTCCATTATTTATTTATGGTCCAAATATTAATCGTGGTGTTCAATTAAATTTTACCAAAGAAATTCGTTCAGTTCATATACATAGTTTAATGGCTTATTTAGCATCGATTAATCTGCCAGATTTTCGTTCACTCGATTTATTCAAACCA                                                                                                ]
[-] EMBL CD112424             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            AAACCAGAATTTGAAAACAATGTGTATAATCGTTTACTAATTCAACAAAGTAAATCTCCTTTCACTGTATACAATTCATCGACCATTCTTTCACATTGGGAAATTATGACAAATAACAATAATAATAATTCATTATTGCCACCGGTATTGTTAATCGCTTCACCGAATTATATATTTCATTCCAAGGCATGGCCATTAAATATGAGTCATTACAATTTAATCGATCCCAAAGGAATGCATGGCTATGATCCAGAACTACCTGATATGCATATTCCATTATTTATTTATGGTCCAAATATTAATCGTGGTGTTCAATTAAATTTTACCAAAGAAATTCGTTCAGTTCATATACATAGTTTAATGGCATATTTAGCATCGATTAACCTGCCAGATTTTCGTTCACTCGATTTATTCAAACCA                                                                                                ]
[-] EMBL CD112603             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            AAACCAGAATTTGAAAACAATGTGTATAATCGTTTACTAATTCAACAAAGTAAATCTCCTTTCACTGTATACAATTCATCGACCATTCTTTCACATTGGGAAATTATGACAAATAACAATAATAATAATTCATTATTGCCACCGGTATTGTTAATCGCTTCACCGAATTATATATTTCATTCCAAGGCATGGCCATTAAATATGAGTCATTACAATTTAATCGATCCCAAAGGAATGCATGGCTATGATCCAGAACTACCTGATATGCATATTCCATTATTTATTTATGGTCCAAATATTAATCGTGGTGTTCAATTAAATTTTACCAAAGAAATTCGTTCAGTTCATATACATAGTTTAATGGCATATTTAGCATCGATTAATCTGCCAGATTTTCGTTCACTCGATTTATTCAAACCA                                                                                                ]
[-] EMBL CD112188             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            AAACCAGAATTTGAAACCAATGTGTATAATCGTTTACTAATTCAACAAAGTAAATCTCCTTTCACTGTATACAATTCATCGACCATTCTTTCACATTGGGAAATTATGACAAATAACAATAATAATAATTCATTATTGCCACCGGTATTGTTAATCGCCTCACCGAATTATATATTTCATTCCAAGGCATGGCCATTAAATATGAGTCATTACAATTTAATCGATCCCAAAGGAATGCATGGCTATGATCCAGAACTACCTGATATGCATATTCCATTATTTATTTATGGTCCAAATATTAATCGTGGTGTTCAATTAAATTTTACCAAAGAAATTCGTTCAGTTCATATACATAGTTTAATGGCATATTTAGCATCGATTAATCTGCCAGATTTTCGTTCACTCGATTTATTCAAACCA                                                                                                ]


>consensus_10575#0 CTTGTGATTTGTTGCATGTTTCCCAATATGAACATTTACACATTTCTGTACATCTTAGTT TATTTATTCAATACGAACAGTTCAACAGTAACAACGACAATCTTAGATAATGACTCGTCA GGTTCTTCATCTCGTTTACTGGTTCTTCTAATTGATGGGCTAAGATGGGATGTAATAGCT GGTCATTTAGAAAATAATACTAATCGATTCGGATTTAAACGACTACAGAAAAATGGTGCG TATTTGCAGCGTTTCACTCCTGTATTTCCTGCAGAGTGTTATCCGAATATTTACTCACTA TTTACAGGTCGTCATCCAGTCGATCATGGAGTTATTCTGCCAACAACATTTAGTGAACAT ACAACTATTAATGGTAAGCCTATTCGTTCACAAGTTGAAGGTCTTTGGGAAACAGGAGTA AAACAAAATAAAGGTGCTCATCTTTATCATTTGCCTATATGTTCTACTGAAGCTGGCACT GATAATAGTTGGTATTGTGAACCGTATAGTCAAGAAGTTATGAATCCTATGCATTTGAAT GCTACAATACAAAAAGCTGTGGATGGGCTAAAAAACGGAGTGGAATTTGGCAGTGGTATA CTACGATGAATTAGATCGTATCGGACATAGATATGGTCCATTATCTAATGAATTAGTTCA TAAACATTTAGTGTATTTGGATCATGTTTTAGACTATGCATTGAACATCATAGAATCTAT ACCAAATTTAAATTTAATGCTAACTTCTGACCATGGTATGGCTACAGTCTCACATCAAGC ACATGCTGATCGTTATTTTAAAGGGACAGAATTAGATAGAGTACTGAATCGTGGAAGTAC ATTGTGGATCTGGCCTAAACCAGAATTTGAAAACAATGTGTATAATCGTTTACTAATTCA ACAAAGTAAATCTCCTTTCACTGTATACAATTCATCGACCATTCTTTCACATTGGGAAAT TATGACAAATAACAATAATAATAATTCATTATTGCCACCGGTATTGTTAATCGCTTCACC GAATTATATATTTCATTCCAAGGCATGGCCATTAAATATGAGTCATTACAATTTAATCGA TCCCAAAGGAATGCATGGCTATGATCCAGAACTACCTGATATGCATATTCCATTATTTAT TTATGGTCCAAATATTAATCGTGGTGTTCAATTAAATTTTACCAAAGAAATTCGTTCAGT TCATATACATAGTTTAATGGCTTATTTAGCATCGATTAATCTGCCAGATTTTCGTTCACT CGATTTATTCAAACCATTACTTTCACACAATTATTATCATCATCAGTTGTCACCTGTGGT GAAATATTTCTATTGGCCATTGAATGACAAATCATCATCATCATTATCATTT



consensusID : consensus_10575#1
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 1
consensus length = 543
fasta sequence
                              [TTACAATTTAATCGATCCCAAAGGAATGCATGGCTATGATCCAGAACTACCTGATATGCATATTCCATTATTTATTTATGGTCCAAATATTAATGGGTGTTGTTNNNNAAATTTTACCAAAGAAATTCGTTCAGTTCATATACATAGTTTAATGGCTTATTTAGCATCGATTAATCTGCCAGATTTTCGTTCACTCGATTTATTCAAACCATTACTTTCACACAATTATTATCATCATCAGTTGTCACCTGTGTTGAATAATTTCTANNNNNGCGGGGGGGGGGGGAGAAAAAACATTTTCCCTTTATCATTTTTCCTCAAACATTAATTACGGAGATCGGTGTTTTATGTGTGAAATTTTTCTAATCGTAGCACGCACGCGNTTAACCTGTTTCTTTGTGCTAATTTGCGCCCTCATCATATTAAAATACAGTAGATGTCGTATTTCATTGACGACTACACGAGTATTCGGTTATCAAGATGATTTAGACAAGGAATTAGTTAAATCTGAGGTACTTTCTGAAGCTTAACTTCTCGGTCATA]

[-] EMBL CD096998             [TTACAATTTAATCGATCCCAAAGGAATGCATGGCTATGATCCAGAACTACCTGATATGCATATTCCATTATTTATTTATGGTCCAAATATTAATGGGTGTTGTTNNNNAAATTTTACCAAAGAAATTCGTTCAGTTCATATACATAGTTTAATGGCTTATTTAGCATCGATTAATCTGCCAGATTTTCGTTCACTCGATTTATTCAAACCATTACTTTCACACAATTATTATCATCATCAGTTGTCACCTGTGTTGAATAATTTCTANNNNNGCGGGGGGGGGGGGAGAAAAAACATTTTCCCTTTATCATTTTTCCTCAAACATTAATTACGGAGATCGGTGTTTTATGTGTGAAATTTTTCTAATCGTAGCACGCACGCGNTTAACCTGTTTCTTTGTGCTAATTTGCGCCCTCATCATATTAAAATACAGTAGATGTCGTATTTCATTGACGACTACACGAGTATTCGGTTATCAAGATGATTTAGACAAGGAATTAGTTAAATCTGAGGTACTTTCTGAAGCTTAACTTCTCGGTCATA]


>consensus_10575#1 TTACAATTTAATCGATCCCAAAGGAATGCATGGCTATGATCCAGAACTACCTGATATGCA TATTCCATTATTTATTTATGGTCCAAATATTAATGGGTGTTGTTNNNNAAATTTTACCAA AGAAATTCGTTCAGTTCATATACATAGTTTAATGGCTTATTTAGCATCGATTAATCTGCC AGATTTTCGTTCACTCGATTTATTCAAACCATTACTTTCACACAATTATTATCATCATCA GTTGTCACCTGTGTTGAATAATTTCTANNNNNGCGGGGGGGGGGGGAGAAAAAACATTTT CCCTTTATCATTTTTCCTCAAACATTAATTACGGAGATCGGTGTTTTATGTGTGAAATTT TTCTAATCGTAGCACGCACGCGNTTAACCTGTTTCTTTGTGCTAATTTGCGCCCTCATCA TATTAAAATACAGTAGATGTCGTATTTCATTGACGACTACACGAGTATTCGGTTATCAAG ATGATTTAGACAAGGAATTAGTTAAATCTGAGGTACTTTCTGAAGCTTAACTTCTCGGTC ATA



consensus multiple alignement with clustalw

CLUSTAL W (1.82) multiple sequence alignment


consensus_10575#0      CTTGTGATTTGTTGCATGTTTCCCAATATGAACATTTACACATTTCTGTACATCTTAGTT 60
consensus_10575#1      ------------------------------------------------------------
                                                                                   

consensus_10575#0      TATTTATTCAATACGAACAGTTCAACAGTAACAACGACAATCTTAGATAATGACTCGTCA 120
consensus_10575#1      ------------------------------------------------------------
                                                                                   

consensus_10575#0      GGTTCTTCATCTCGTTTACTGGTTCTTCTAATTGATGGGCTAAGATGGGATGTAATAGCT 180
consensus_10575#1      ------------------------------------------------------------
                                                                                   

consensus_10575#0      GGTCATTTAGAAAATAATACTAATCGATTCGGATTTAAACGACTACAGAAAAATGGTGCG 240
consensus_10575#1      ---------------------------TTACAATTTAATCGATCCCAAAGGAATG----- 28
                                                  **   ****** ***   ** *  ****     

consensus_10575#0      TATTTGCAGCGTTTCACTCCTGTATTTCCTGCAGAGTGTTATCCGAATATTTACTCACTA 300
consensus_10575#1      ------CATGGCTATGATCCAGAACTACCTGATATGCAT-ATTCCATTATTTATTTATGG 81
                             **  * *    *** * * * ****    *  * ** * * ****** * *   

consensus_10575#0      TTTACAGGTCGTCATCCAGTCGATCATGGAGTTATTCTGCCAACAA-CATTTAGTGAACA 359
consensus_10575#1      TCCAAATATTAATGGGT-GTTGTTNNNNAAATTTTACCAAAGAAATTCGTTCAGTTCATA 140
                       *  * *  *         ** * *     * ** * *     * *  * ** ***  * *

consensus_10575#0      TACAACTATTAATGGTAAGCCTATTCGTTCACAAGTTGAAGGTCTTTGGGAAACAGGAGT 419
consensus_10575#1      TACATAGTTTAATGGCTTATTTAGCATCGATTAATCTGCCAGATTTTCGTTCACTCGATT 200
                       ****    *******      **         **  **   *  *** *   **  ** *

consensus_10575#0      AAAACAAAATAAAGGTGCTCATCTTTAT-CATTTGCCTATATGTTCTACTGAAGCTGGCA 478
consensus_10575#1      TATTCAAACCA-------TTACTTTCACACAATTATTATCATCATCAGTTGTCACCTGTG 253
                        *  ****  *       * *  ** *  ** **      **  **   **   *  *  

consensus_10575#0      CTGA-TAATAGTTGGTATTGTGAACCGTATAGTCAAGAAGTTATGAATCCTATG-CATTT 536
consensus_10575#1      TTGAATAATTTCTANNNNNGCGGGGGGGGGGGGAGAAAAAACATTTTCCCTTTATCATTT 313
                        *** ****   *      * *    *    *   * **   **    *** *  *****

consensus_10575#0      GAATGCTACAATACAAAAAGCTGTGGATGGGCTAAAAAACGGAGTGGAATTTGGC-AGTG 595
consensus_10575#1      T--TCCTCAAACATTAATTACGGAGATCGGTGTTTTAT---GTGTGAAATTTTTCTAATC 368
                          * **  ** *  **   * * *   **  *   *    * *** *****  * * * 

consensus_10575#0      GTATACTACGATGAATTAGATCGTATCGG-ACATAGATATGGTCCATTATCTAATGAATT 654
consensus_10575#1      GTAGCACGCACGCGNTTAACCTGTTTCTTTGTGCTAATTTGCGCCCTCATCATATTAA-- 426
                       ***     *      ***    ** **         ** **  ** * ***  ** **  

consensus_10575#0      AGTTCATAAACATTTAGTGTATTTGGATCATGTTTTAGACTATGCATTGAACATCATAG- 713
consensus_10575#1      AATACA---GTAGATGTCGTATTTCATTGACGACT-ACACGAGTATTCGGTTATCAAGAT 482
                       * * **     *  *   ******   * * *  * * ** *    * *   ****    

consensus_10575#0      AATCTATACCAAATTTAAATTTAATGCTAACTTCTGACCATGGTATGGCTACAGTCTCAC 773
consensus_10575#1      GATTTAGACAAGGAATTAGTTAAATCTGAGGTACTTTCTGAAGCTTAACTTCTCGGTCAT 542
                        ** ** ** *    * * ** ***   *  * **  *    *  *  ** *    *** 

consensus_10575#0      ATCAAGCACATGCTGATCGTTATTTTAAAGGGACAGAATTAGATAGAGTACTGAATCGTG 833
consensus_10575#1      A----------------------------------------------------------- 543
                       *                                                           

consensus_10575#0      GAAGTACATTGTGGATCTGGCCTAAACCAGAATTTGAAAACAATGTGTATAATCGTTTAC 893
consensus_10575#1      ------------------------------------------------------------
                                                                                   

consensus_10575#0      TAATTCAACAAAGTAAATCTCCTTTCACTGTATACAATTCATCGACCATTCTTTCACATT 953
consensus_10575#1      ------------------------------------------------------------
                                                                                   

consensus_10575#0      GGGAAATTATGACAAATAACAATAATAATAATTCATTATTGCCACCGGTATTGTTAATCG 1013
consensus_10575#1      ------------------------------------------------------------
                                                                                   

consensus_10575#0      CTTCACCGAATTATATATTTCATTCCAAGGCATGGCCATTAAATATGAGTCATTACAATT 1073
consensus_10575#1      ------------------------------------------------------------
                                                                                   

consensus_10575#0      TAATCGATCCCAAAGGAATGCATGGCTATGATCCAGAACTACCTGATATGCATATTCCAT 1133
consensus_10575#1      ------------------------------------------------------------
                                                                                   

consensus_10575#0      TATTTATTTATGGTCCAAATATTAATCGTGGTGTTCAATTAAATTTTACCAAAGAAATTC 1193
consensus_10575#1      ------------------------------------------------------------
                                                                                   

consensus_10575#0      GTTCAGTTCATATACATAGTTTAATGGCTTATTTAGCATCGATTAATCTGCCAGATTTTC 1253
consensus_10575#1      ------------------------------------------------------------
                                                                                   

consensus_10575#0      GTTCACTCGATTTATTCAAACCATTACTTTCACACAATTATTATCATCATCAGTTGTCAC 1313
consensus_10575#1      ------------------------------------------------------------
                                                                                   

consensus_10575#0      CTGTGGTGAAATATTTCTATTGGCCATTGAATGACAAATCATCATCATCATTATCATTT 1372
consensus_10575#1      -----------------------------------------------------------
                                                                                  




Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)