These datas are free for academic use only, please contact me for any other use. Schistosoma mansoni see consensus multiple alignment with clustalw Direct access to contigs :
consensusID : consensus_10584#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 18 consensus length = 1946 fasta sequence [TTGTGACTTAACTAGTTCGATCTATATTCCAAGGGGTGTAAATGTTCCTGCATTAGATCGTAAAGTTGAATGGGAATTTATTCCGACATCAGGTTTAAAGCCTGGAATGCATATAACTGGTGGAGATATTTATGGTATTGTGCCTG--AATACTTTAGTTCAACATCGAATCATGCTTTCACCTAAAGCCCAAGGTACAGTAAAATGGATTGCTCCGACTGGGCACTACACATTATCGGATAAAATATTGGAAATAGAATTCGACGGACAAATCAGCCACCATACTATGTTACAAGTATGGCCTGTACGTCAACCTCGTCCAGTAGCTGAAAAATTACCTGGCAATCATCCACTTCTAACTGGCCAACGAATTTTGGATGCTTTATTTCCATGTGTTCAAGGAGGAACTACTGCAATTCCTGGAGCATTTGGTTGTGGTAAAACTGTTATTTCTCAGTC-ATTATCAAAATACTCTAATTCGGATATTATTGTTTATGTTGGTTGTGGTGAACGTGGTAATGAAATGTCCGAAGTGTTACGCGATTTTCCAGAGTTAACAGTTGAAGTTAATGGAAAACAAGAATCAATTATGCAACGTACAGCTCTCGTAGCAAATACATCT-AATATGCCTGTAGCTGCTCGTGAAGCGTCAATTTATACAGGGATAACATTATCAGAATATTTTCGTGATATGGGTTATAATGTTAGTATGATGGCTGATTCAACTAGTCGTTGGGCTGAAGCATTACGTGAAATCTCTGGTCGATTAGCTGAAATGCCTGCAGATTCCGGTTATCCAGCTTATTTAGGTGCACGACTTGCAAGCTTTTATGAACGTGCTGGTCGTGTACATTGTCTTGGTGGTCCAGATTTACGTTATGGATCAGTCGGTATTGTCGGTGCTGTATCTCCACCTGGTGGTGATTTTGCCGATCCTGTTACATCAGCTACATTAAGTATTGTACAGGTATTTTGGGGATTAGATAAGAAACTAGCTCAACGTAAACACTTTCCTAGTGTTAATTGGCTTATATCCTATTCAAAATACTTACGTGTACTTGATGATTATTTTGATCGTAATTTCCCAGAATTCGTTGCATTAAGAACT-AAATGCAAGAAATTTTAC-AGAAGAAGAAGAATTATCTGAAATTGTACAATTAGTTGGCAAAGCATCTCTAGCAGAGGCAGATAAAATCACACTGGAAGTTGCACGTATCATTAAAGATGATTTCCTTCAACAGAATGGTTATTCATCGTATGATAGATTTTGTCCATTTTATAAAACTGTTGGCATGATGAAAAATATTATTGCATTCTATGATCAAGCTAGACATGCTGTTGAAGTAACTGCTCAATCTGATCGTCGTGTTACATGGGCATTGATACGTGAAGCTATGGGTCAAACAATTTATAAAATTTCTAGTATGAAATTTAAAGATCCTACAGCTGATGGAAAGGAGAAAATTCTACGAGACTATGATGAATTATATGAAGAAATATCATCTGGTTTTAGAAATCTAGAAGATTTATAGATGAAAATATCTAATTACTTTTTCATTTATATATCAACGTTTATTTATTTATTTACTCTTGAAATTATCTAATTATCGACATATTCTCATCTTCTCTTTCCTTCTTTCTATTCATGTTCCTTGTTTCTAAGTTACAAAAGTTCCCCACTTACTGTCGCTGTTCTTCTCCACTATCATGGTCGTTTACTCCTTGATCTTATAGTCG-TTTTTTTTTCTTTTTGCTTGTCTTTCTTTTACAATATCTCGTTATTTTATTATTTATTCACGGAAATTTTCTTGCCATTATAGTTACTTACTTATGCCTGATACCTCTCGTCGAGGAGCATAGGCCGCTCATCATCATTCTTCATCCAACTCTGTCCTGAGCCTTTCTTTTCAGTTCTTTTCAGGTGTTATTCATTCTTTTCATATCTGCT] [+] EMBL CD128342 [TTGTGACTTAACTAGTTCGATCTATATTCCAAGGGGTGTAAATGTTCCTGCATTAGATCGTAAAGTTGAATGGGAATTTATTCCGACATCAGGTTTAAAGCCTGGAATGCATATAACTGGTGGAGATATTTATGGTATTGTGCCTGAAAATACTTTAGTTCAACATCGAATCATGCTTTCACCTAAAGCCCAAGGTACAGTAAAATGGATTGCTCCGACTGGGCACTACACATTATCGGATAAAATATTGGAAATAGAATTCGACGGACAAATCAGCCACCATACTATGTTACAAGTATGGCCTGTACGTCAACCTCGTCCAGTAGCTGAAAAATTACCTGGCAATCATCCACTTCTAACTGGCCAACGAATTTTGGATGCTTTATTTCCATGTGTTCAAGGAGGAACTACTGCAATTCCTGGAGCATTTGGTTGTGGTAAAACTGTTATTTCTCAGTC ATTATCAAAATACTCTAATTC ] [-] EMBL CD128273 [ TGTGACTTAACTAGTTCGATCTATATTCCAAGGGGTGTAAATGTTCCTGCATTAGATCGTAAAGTTGAATGGGAATTTATTCCGACATCAGGTTTAAAGCCTGGAATGCATATAACTGGTGGAGATATTTATGGTATTGTGCCTG AATACTTTAGTTCAACATCG ATCATGCTTT ] [-] EMBL CD167212 [ TGTGACTTAACTAGTTCGATCTATATTCCAAGGGGTGTAAATGTTCCTGCATTAGATCGTAAAGTTGAATGGGAATTTATTCCGACATCAGGTTTAAAGCCTGGAATGCATATAACTGGTGGAGATATTTATGGTATTGTGCCTG AATACTTTAGTTCAACATCGAATCATGCT ] [-] EMBL CD126768 [ CAGCCACCATACTATGTTACAAGTATGGCCTGTACGTCAACCTCGTCCAGTAGCTGAAAAATTACCTGGCAATCATCCGCTTCTAACTGGCCAACGAATTTTGGATGCTTTATTTCCATGTGTTCAAGGAGGAACTACTGCAATTCCTGGAGCATTTGGTTGTGGTAAAACTGTTATTTCTCAGTC ATTATCAAAATACTCTAATTCGGATATTATTGTTTATGTTGGTTGTGGTGAACGTGGTAATGAAATGTCCGAAGTGTTACGCGATTTTCCAGAGTTAACAGTTGAAGTTAATGGAAAACAAGAATCAATTATGCAACGTACAGCTCTCGTAGCAA ACATCTGAATATGCCTGTAG ] [+] EMBL CD126739 [ CTATGTTACAAGTATGGCCTGTACGTCAACCTCGTCCAGTAGCTGAAAAATTACCTGGCAATCATCCACTTCTAACTGGCCAACGAATTTTGGATGCTTTATTTCCATGTGTTCAAGGAGGAACTACTGCAATTCCTGGAGCATTTGGTTGTGGTAAAACTGTTATTTCTCAGTC ATTATCAAAATACTCTAATTCGGATATTATTGTTTATGTTGGTTGTGGTGAACGTGGTAATGAAATGTCCGAAGTGTTACGCGATTTTCCAGAGTTAACAGTTGAAGTTAATGGAAAACAAGAATCAATTATGCAACGTACAGCTCTCGTAGCAAATACATCT AATATGCCTG ] [-] EMBL CD166716 [ TATGTTACAAGTATGGCCTGTACGTCAACCTCGTCCAGTAGCTGAAAAATTACCTGGCAATCATCCACTTCTAACTGGCCAACGAATTTTGGATGCTTTATTTCCATGTGTTCAAGGAGGAACTACTGCAATTCCTGGAGCATTTGGTTGTGGTAAAACTGTTATTTCTCAGTCAATTATCAAAATACTCTAATTCGGATATTATTG TTATGTTGGTTGTGGTGAACGT GTAATGAATGGTCg ] [-] EMBL CD064170 [ TATGTTACAAGTATGGCCTGTACGTCAACCTCGTCCAGTAGCTGAAAAATTACCTGGCAATCATCCACTTCTAACTGGCCAACGAATTTTGGATGCTTTATTTCCATGTGTTCAAGGAGGAACTACTGCAATTCCTGGAGCATTTGGTTGTGGTAAAACTGTTATTTCTCAGTC ATTATCAAAATACTCTAATTCGGATATTATTGTTTATGTTGGTTGTGGTGAACGTGGTAATGAAATGTCCGAAGTGTTACGCGATTTTCCAGAGTTAACAGTTGAAGTTAATGGAAAACAAGAATCAATTATGCAACGTACAGCTCTCGTAGCAA ACATCT AATATGCCTGTAG ] [+] EMBL CD160608 [ TAATGGAAAACAAGAATCAATTATGCAACGTACAGCTCTCGTAGCAAATACATCT AATATGCCTGTAGCTGCTCGTGAAGCGTCAATTTATACAGGGATAACATTATCAGAATATTTTCGTGATATGGGTTATAATGTTAGTATGATGGCTGATTCAACTAGTCGTTGGGCTGAAGCATTACGTGAAATCTCTGGTCGATTAGTTGAAATGCCTGCAGATTCCGGTTATCCAGCTTATTTAGGTGCACGACTTGCAAGCTTTTATGAACGTGCTGGTCGTGTACATTGTCTTGGTGGTCCAGATTTACGTTATGGATCAGTCGGTATTGTCGGTGCTGTATCTCCACCTGGTGGTGATTTTGCCGATCCTGTTACATCAGCTACATTAAGTATTGTACAGGTATNTTGGGGATTAGATAAGAAACTAGCTCAACGTAAACACTNTCCTAGTGTTAATTGGCTTATATCCTATTCAAAATACTTACGTGTACTTGATGATTATTTTGATCGTAATTTCCCAGAATTCGTTGCATTAAGAACT AAATGCAAGAAAATTTAC AGAAGAAGAAGAA TATCTGAAATTGT CAATTAGTTGGCAAgc ] [+] EMBL CD066979 [ GCAACGTACAGCTCTCGTAGCAAATACATCT AATATGCCTGTAGCTGCTCGTGAAGCGTCAATTTATACAGGGATAACATTATCAGAATATTTTCGTGATATGGGTTATAATGTTAGTATGATGGCTGATTCAACTAGTCGTTGGGCTGAAGCATTACGTGAAATCTCTGGTCGATTAGCTGAAATGCCTGCAGATTCCGGTTATCCAGCTTATTTAGGTGCACGACTTGCAAGCTTTTATGAACGTGCTGGTCGTGTACATTGTCTTGGTGGTCCAGATTTACGTTATGGATCAGTCGGTATTGTCGGTGCTGTATCTCCACCTGGTGGTGATTTTGCCGATCCTGTTACATCAGCTACAT ] [+] EMBL CD067489 [ GCAACGTACAGCTCTCGTAGCAAATACATCT AATATGCCTGTAGCTGCTCGTGAAGCGTCAATTTATACAGGGATAACATTATCAGAATATTTTCGTGATATGGGTTATAATGTTAGTATGATGGCTGATTCAACTAGTCGTTGGGCTGAAGCATTACGTGAAATCTCTGGTCGATTAGCTGAAATGCCTGCAGATTCCGGTTATCCAGCTTATTTAGGTGCACGACTTGCAAGCTTTTATGAACGTGCTGGTCGTGTACA ] [+] EMBL AI975039 [ TACATCAGCTACATTAAGTATTGTACAGGTATTTTGGGGATTAGATAAAAAACTAGCTCAACGTAAACACTTTCCTAGTGTCAATTGGCTTATATCCTATTCAAAATACTTACCTGTACTTGATGATTATCATGATCGTAATTACCCAGAATTCGATGCATTAATAACTAAAATGCAAGAAATTTTACAAGACGAAGAAGAATTATCTGAAATTGTACAATTAGTCGGCAAAGCATATCTAGCAGACGCGGATATAATCACACTGGAAGTTGCACGTATCATTAAACATGATTTCCTTCAACAGAATGGTTATTCATCGGATGATAGATTTTGGACATTTTATAAAACTGT ] [+] EMBL AI975445 [ TACATCAGCTACATTAAGTATTGTACAGGTATTTTGGGGATTAGATAAGAAACTAGCTCAACGTAAACACTTTCCTAGTGTTAATTGGCTTATATCCTATTCAAAATACTTACGTGTACTTGATGATTATTTTGATCGTAATTTCCCAGAATTCGTTGCATTAAGAACTAAAATGCAAGAAATTTTACAAGAAGAAGAAGAATTATCTGAAATTGTACAATTAGTTGGCAAAGCATCTCTAGCAGAGGCAGATAAAATCACACTGGAAGTTGCACGTATCATTAAAGATGATTTCCTTCAACAGAATGGTTATTCATCGTATGATAGATTTTGTCCATTTTATAAAACTGTTGGCATGATGAAAAATATTATTGCATTCTATGATCAAGCTAGACATGCTGTTGAAGTAACTGCTCAATCTGATCGTCGTGTTACATGGGCATTGATACGTGAAGCTATGGGTCAAACAATNTATAAAATTTCTAGTATGAAATTTAAAGATCCTACAGCTGATGGAAAGGAGAAAATTCTACGAG ] [+] EMBL CD201862 [ GAAGAATTATCTGAAATTGTACAATTAGTTGGCAAAGCATCTCTAGCAGAGGCAGATAAAATCACACTGGAAGTTGCACGTATCATTAAAGATGATTTCCTTCAACAGAATGGTTATTCATCGTATGATAGATTTTGTCCATTTTATAAAACTGTTGGCATGATGAAAAATATTATTGCATTCTATGATCAAGCTAGACATGCTGTTGAAGTAACTGCTCAATCTGATCGTCGTGTTACATGGGCATTGATACGTGAAGCTATGGGTCAAACAATTTATAAAATTTCTAGTATGAAATTTAAAGATCCTACAGCTGATGGAAAGGAGAAAATTCTACGAGACTATGATGAATTATATGAAGGAATATCATCTGGTTTTAGAAATCTAGAAGATTTATAGATGAAAATATCTAATTACTTTTTCATTTATATATCAACGTTTATTTATTTATTTACTCTTGAAATTATCTAATTATCGACATATTCTCATCTTCTCTTTCCTTCTTTCTATTCATGTTCCTTGTTTCTAAGTTACAAAAGTTCCCCACTTACTGTCGCTGTTCTTCTCCACTATCATGGTCGTTTACTCCTTGATC ] [-] EMBL CD128306 [ AATATTATTGCATTCTATGATCAAGCTAGACATGCTGTTGAAGTAACTGCTCAATCTGATCGTCGTGTTACATGGGCATTGATACGTGAAGCTATGGGTCAAACAATTTATAAAATTTCTAGTATGAAATTTAAAGATCCTACAGCTGATGGAAAGGAGAAAATTCTACGAGACTATGATGAATTATATGAAGAAATATCATCTGGTTTTAGAAATCTAGAAGATTTATAGATGAAAATATCTAATTACTTTTTCATTTATATATCAACGTTTATTTATTTATTTACTCTTGAAATTATCTAATTATCGACATATTCTCATCTTCTCTTTCCTTCTTTCTATTCATGTTCCTTGTTTC ] [-] EMBL CD066353 [ GAAAATTCTACGAGACTATGATGAATTATATGAAGAAATATCATCTGGTTTTAGAAATCTAGAAGATTTATAGATGAAAATATCTAATTACTTTTTCATTTATATATCAACGTTTATTTATTTATTTACTCTTGAAATTATCTAATTATCGACATATTCTCATCTTCTCATTCCTTCTTTCTATTCATGT ] [-] EMBL CD066354 [ AAATTCTACGAGACTATGATGAATTATATGAAGAAATATCATCTGGTTTTAGAAATCTAGAAGATTTATAGATGAAAATATCTAATTACTTTTTCATTTATATATCAACGTTTATTTATTTATTTACTCTTGAAATTATCTAATTATCGACATATTCTCATCTTCTCTTTCCTTCTTTCTATTCATGTTCCTTGTTTCTAAGTTACAAAAG TCCCCACTTACTGTCGCTGTTCTTCTCCACTATCATGGTCGTTTACTCCTTGATCTTATAGTCGTTTTTTTTTTCTTTTTGCTTGTCTTTCTTTTACAATATCTCGTTATTTTATTATTTATTCACGGAAATTTTCTTGCCATTATAGTTACTTACTTATGCCTGATACCTCTCGTCGAGGAGCATAGGCCGCTCATCATCATTCTTCAT ] [-] EMBL CD178544 [ TACGAGACTATGATGAATTATATGAAGAAATATCATCTGGTTTTAGAAATCTAGAAGATTTATAGATGAAAATATCTAATTACTTTTTCATTTATATATCAACGTTTATTTATTTATTTACTCTTGAAATTATCTAATTATCGACATATTCTCATCTTCTCTTTCCTTCTTTCTATTCATGTTCCTTGTTTCTAAGTTACAAAAGTTCCCCACTTACTGTCGCTGTTCTTCTCCACTATCATGGTCGTTTACTCCTTGATCTTATAGTCG TTTTTTTTTCTTTTTGCTTGTCTTTCTTTTACAATATCTCGTTATTTTATTATTTATTCACGGAAATTTTCTTGCCATTATAGTTACTTACTTATGCCTGATACCTCTCGTCGAGGAGCATAGGCCGCTCATCATCATTCTTCATCCAACTC ] [+] EMBL CD086598 [ TCATCTGGTTTTAGAAATCTAGAAGATTTATAGATGAAAATATCTAATTACTTTTTCATTTATATATCAACGTTTATTTATTTATTTACTCTTGAAATTATCTAATTATCGACATATTCTCATCTTCTCTTTCCTTCTTTCTATTCATGTACCTTGTTTCTAAGTTACAAAAGTTCCCCACTTACTGTCGCTGTTCTTCTCCACTATCATGGTCGTTTACTCCTTGATCTTATAGTCG TTTTTTTTTCTTTTTGCTTGTCTTTCTTTTACAATATCTCGTTATTTTATTATTTATTCACGGAAATTTTCTTGCCATTATAATTACTTACTTATGCCTGATACCTCTCGTCGAGGAGCATANGCCGCTCATCATCATTCTTCATCCAACTCTGTCCTGAGCCTTTCTTTTCAGTTCTTTTCAGGTGTTATTCATTCTTTTCATATCTGCT] clustalw multiple alignements is not computed in this case |
Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) | ||||