|
These datas are free for academic use only, please contact me for any other use. Schistosoma mansoni see consensus multiple alignment with clustalw Direct access to contigs :
consensusID : consensus_10617#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 19 consensus length = 735 fasta sequence
[TATGTATTGTGATGGATGGGTGGTCGTATGGCTGCGTATGTTGCTTTGGCGAAATTTCCCAAGGTTGAGGTCTGACCACGAGCACTTGTGTAGACATCTTCGATACCAGCCATTTGAAGAAGCTTTTTGGG-AACTGGGGCACCAACAATGCCTGTTCCACGA-GGGGCTGGAATCAAACGTACTGACACAGAACCACATTTTCCAGTCACTTTACATGGAACAGTGTGTGGTTTACCAATTTGATTACCCCAGTATCCTTTCCTTACAGGAATTATTGACAGCTTAGCCTGAATGATAGCGCCTCTAATTGCTGTAGCGACCTCCTTAGCACATTTTACTCCTAGCCCAACGTGACAGTTATGGTCT--CCCATTGCAACAATTGCTTTA-AAGCGGGTTCTCTGGCCAGCACAAGTCTGCTTTTGAACTGGCATGATTTTAAGTACTTCATCTTTTAAACTTGAACCCAATATGGTATCTATAATTTCACACTCCTTAATCGGGAGACTGAACATGTATATTTCTTCTAATGTAGTAATTTTCCTTTCGTTTACTAGACGTCCCAACTGGGTAACAGGCTTCCATTCTTTTGTTGCAACTCCACGACCACGACCTCGTCCGCAGCCACGTCCTCGTCCGCGTCCTCTTCCNCTAGCTCNCAACGAACCACGAAAACCACCGCGACCCCCACCTGACGAATCCATTTGATAGCCTCTGATTCCCACGCTCGATGATCTT]
[-] EMBL BG931907 [TATGTATTGTGATGGATGGGTGGTCGTATGGCTGCGTATGTTGCTTTGGCGAAATTTCCCAAGGTTGAGGTCTGACCACGAGCACTTGTGTAGACATCTTCGATACCAGCCATTTGAAGAAGCTTTTTGGG AACTGGGGCACCAACAATGCCTGTTCCACGA GGGGCTGGAATCAAACGTACTGACACAGAACCACATTTTCCAGTCACTTTACATGGAACAGTGTGTGGTTTACCAATTTGATTACCCCAGTATCCTTTCCTTACAGGAATTATTGACAGCTTAGCCTGAATGATAGCGCCTCTAATTGCTGTAGCGACCTCCTTAGCACATTTTACTCCTAGCCCAACGTGACAGTTATGac ]
[+] EMBL CD141755 [ atcttCGGGCACTTGTGTAGACATCTTCGATACCAGCCATTTGAAGAAGCTTTTTGGG AACTGGGGCACCAACAATGCCTGTTCCACGA GGGGCTGGAATCAAACGTACTGACACAGAACCACATTTTCCAGTCACTTTACATGGAACAGTGTGTGGTTTACCAATTTGATTACCCCAGTATCCTTTCCTTACAGGAATTATTGACAGCTTAGCCTGAATGATAGCGCCTCTAATTGCTGTAGCGACCTCCTTAGCACATTTTACTCCTAGCCCAACGTGACAGTTATGGTCT CCCATTGCAACAATTGCTTTA AAGCGGGTTCTCTGGCCAGCACAAGTCTGCTGTTGAACTGGCATGATTTTAAGTACTTCATCTTTTAAACTTGAACCCAATATGGTATCTATAATTTCACACCCCTTAATCGGGAGACTGAACATGTATATTTCTTCTAATGTAGTAATTTTCCTTTCGTTTACTAGACGTCCCAACTGGGTAACAGGCTTCCATTCTTTTGTTGCAACTCCACGACCACGACCTCGTCCGCAGCCACGTCCTCGTCCGCGTCCTCTTCCNCTAGCTCNCAACGAACCACGAAAACCACCGCGACCCCCACCTGACGAATCCATTTGATAGCCTCTGATTCCCACGCTCGATGATCTT]
[+] EMBL CD141766 [ AGACATCTTCGATACCAGCCATTTGAAGGAGCTTTTTGGG AACTGGGGCACCAACAATGCCTGTTCCACGA GGGGCTGGAATCAAACGTACTGACACAGAACCACATTTTCCAGTCACTTTACATGGAACAGTGTGTGGTTTACCAATTTGATTACCCCAGTATCCTTTCCTTACAGGAATTATTGACAGCTTAGCCTGAATGATAGCGCCTCTAATTGCTGTAGCGACCTCCTTAGCACATTTTACTCCTAGCCCAACGTGACAGTTATGGTCT CCCATTGCAACAATTGCTTTA AAGCGGGTTCTCTGGCCAGCACAAGTCTGCTTTTGAACTGGCATGATTTTAAGTACTTCATCTTTTAAACTTGAACCCAATATGGTTTCTATAATTTCACACTCCTTAATCGGGAGACTGAACATGTATATTTCTTCTAATGTAGTAATTTTCCTTTCGTTTACTAGACGTCCCAACTGGGTAACAGGCTTCCATTCTTTTGTTGCAACTCCACGACCACGACCTCGTCC ]
[+] EMBL CD141709 [ AGACATCTTCGATACCAGCCATTTGAAGAAGCTTTTTGGG AACTGGGGCACCAACAATGCCTGTTCCACGA GGGGCTGGAATCAAACGTACTGACACAGAACCACATTTTCCAGTCACTTTACATGGAACAGTGTGTGGTTTACCAATTTGATTACCCCAGTATCCTTTCCTTACAGGAATTATTGACAGCTTAGCCTGAATGATAGCGCCTCTAATTGCTGTAGCGACCTCCTTAGCACATTTTACTCCTAGCCCAACGTGACAGTTATGGTCT CCCATTGCAACAATTGCTTTA AAGCGGGTTCTCTGGCCAGCACAAGTCTGCTTTTGAACTGGCATGATTTTAAGTACTTCATCTTTTAAACTTGAACCCAATATGGTATCTATAATTTCACACTCCTTAATCGGGAGACTGAACATGTATATTTCTTCTAATGTAGTAATTTTCCTTTCGTTTACTAGACGTCCCAACTGGGTAACAGGCTTCCATTCTTTTGTTGCAACTCCACGACCACGACCTCGTCC ]
[-] EMBL CD141781 [ GACATCTCGGATCCCAGCCATTTGAAAAAGCTTTCTGGGAAACTGGGGCACCAACAAAGCCTGTTCCACGAGGGGGCTGGAATCAAACGTACTGACACAGACCCACATTTTCCAGTCACTTTACATGGAACAGTGTGTGGTTTACCAATTTGATTACCCCAGTATCCTTTCCTTACAGGAATTATTGACAGCTTAGCCTGAATGATAGCGCCTCTAATTGCTGTAGCGACCTCCTTAGCACATTTTACTCCTAGCCCAACGTGACAGTTATGGTCT CCCATTGCAACAATTGCTTTA AAGCGGGTTCTCTGGCCAGCGCAAGTCTGCTTTTGAACTGGCATGATTTTAAGTACTTCATCTTTTAAACTTGAACCCAATATGGTATCTATAATTTCACACTCCTTAATCGGGAGACTGAACATGTATATTTCTTCTAATGTAGTAATTTTCCTTTCGTTTACTAGACGTCCCAACTGGGTAACAGGCTTCCATTCTTTTGTCGCAACTCCACGACCACGACCTCGTCCG ]
[-] EMBL CD141751 [ GACATCTTCGAAACCAGCCATTTGANGAAGCTTTTTGGG ANCGGGGGCACCAACAATGCCTGTTCCACGA GGGGCTGGAATCAAACGTACTGACACAGAACCACATTTTCCAGTCACTTTACATGGAACAGTGTGTGGTTTACCAATTTGATTACCCCAGTATCCTTTCTTTACAGGAATTATTGACAGCTTAGCCTGAATGATAGCGCCTCTAATTGCTGTAGCGACCTCCTTAGCACATTTTACTCCTAGCCCAACGTGACAGTTATGGTCT CCCATCGCAACAATTGCTNTA AAGCGGGTTCTCTGGCCAGCACAAGTCTGCTTTTGAACTGGCATGATTTTAAGTACTTCATCCTTTAAACTTGAACCCAATATGGTATCTATAATTTCACACTCCTTAATCGGGAGACTGAACATGTATATTTCTTCTAATGTAGTAATTTTCCTTTCGTTTACTAGACGTCCCAACTGGGTAACAGGCTTCCATTCTTTTGTTGCAACTCCACGACCACGACCTCGTCCG ]
[-] EMBL CD141812 [ GACATCTTCGATACCAGCCATTTGAAGAAGCTTTNTGGA AACTGGGGCACCAACAATG CTGTTCCACGA GGGGCTGGAATCAAACGTACTGACACAGAACCACATTTCCAAGTCACTTTACATGGAACAGTGTGTGGTTTACCAATTTGATTACNNCAGTATCC TTCCTTACAGGAATTATTGACAGCTTAGCCTGAATGATAGCGCCTCTAATTGCTGTAGCGACCTCCTTAGCACATTTTACTCCTAGCCNAACGTGACAGTTATGGTCT CCCATTGCAACAATTGCTTTA AAGCGGGTTCTCTGGCCAGCACAAGTCTGCTTTTGAACTGGCATGATTTTAAGTACTTCATCTTTTAAACTTGAACCCAATATGGTATCTATAATTTCACACTCCTTAATCGGGAGACTGAACATGTATATTTCTTCTAATGTAGTAATTTTCCTTTCGTTTACTAGACGTCCCAACTGGGTAACAGGCTTCCATTCTTTTGTTGCAACTCCACGACCACGACCTCGTCCG ]
[+] EMBL CD098167 [ CACATTTTCCAGTCACTTTACATGGAACAGTGTGTGGTTTACCAATTTGATTACCCCAGTATCCTTTCCTTACAGGAATTATTGACAGCTTAGCCTGAATGATAGCGCCTCTAATTGCTGTAGCGACCTCCTTAGCACATTTTACTCCTAGCCCAACGTGACAGTTATGGTCT CCCATTGCAACAATTGCTTTA AAGCGGGTTCTCTGGCCAGCACAAGTCTGCTTTTGAACTGGCATGATTTTAAGTACTTCATCTTTTAAACTTGAACCCAATATGGTATCTATAATTTCACACTCCTTAATCGGGAGACTGAACATGTATATCTCTTCTAATGTAGTAATTTTCCTTTCGTTTACTAGACGTCCCAACTGGGTAACAGGCTTCCATTCTTTTGTTGCAACTCCACGACCACGACCTCGTCC ]
[-] EMBL BF936153 [ ACATTTTCCAGTCACTTTACATGGAACAGTGTGTGGTTTACCAATTTGATTACCCCAGTATCCTTTCCTTACAGGAATTATTGACAGCTTAGCTTGAATGATAGCGCCTCTAATTGCTGTAGCGACCTCCTTAGCACATTTTACTCCTAGCCCAACGTGACAGTTATGGTCT CCCATTGCAACAATTGCTTTA AAGCGGGTTCTCTGGCCAGCACAAGTCTGCTTTTGAACTGGCATGATTTTAAGTACTTCATCTTTTAAACTTGAACCCAATATGGTATCTATAATTTCACACTCCTTAATCGGGAGACTGAACATGTATATTTCTTCTAATGTAGTAATTTTCCTTTCGTTTACTAGACGTCCCAACTGGGTAACAGGCTTCCATTCTTTTGTTGCAACTCCACGACCACGACCTCGTCCG ]
[-] EMBL CD146755 [ GAATTATTGACAGCTTAGCCTGAATGATAGCGCCTCTAATTGCTGTAGCGACCTCCTTAGCACATTTTACTCCTAGCCCAACGTGACAGTTATGGTCT CCCATTGCAACAATTGCTTTA AAGCGGGTTCTCTGGCCAGCACAAGTCTGCTTTTGAACTGGCATGATTTTAAGTACTTCATCTTTTAAACTTGAACCCAATATGGTATCTATAATTTCACACTCCTTAATCGGGAGACTGAACATGTATATTTCTTCTAATGTAGTAATTTTCCTTTCGTTTACTAGACGTCCCAACTGGGTAACAGGCTTCCATTCTTTTGTTGCAACTCCACGACCACGACCTCGTCCG ]
[-] EMBL CD097880 [ AATTATTGACAGCTTAGCCTGAATGATAGCGCCTCTAATTGCTGTAGCGACCTCCTTAGCACATTTTGCTCCTAGCCCAACGTGACAGTTATGGTCT CCCATTGCAACAATTGCTTTA AAGCGGGTTCTCTGGCCAGCACAAGTCTGCTTTTGAACTGGCATGATTTTAAGTACTTCATCTTTTAAACTTGAACCCAATATGGTATCTATAATTTCACACTCCTTAATCGGGAGACTGAACATGTATATTTCTTCTAATGTAGTAATTTTCCTTTCGTTTACTAGACGTCCCAACTGGGTAACAGGCTTCCATTCTTTTGTTGCAACTCCACGACCACGACCTCGTCCG ]
[-] EMBL CD097748 [ CTTAGCACATTTTACTCCTAGCCCAACGTGACAGTTATGGTCT CCCATTGCAACAATTGCTTTA AAGCGGGTTCTCTGGCCAGCACAAGTCTGCTTTTGAACTGGCATGATTTTAAGTACTTCATCTTTTAAACTTGAACCCAATATGGTATCTATAATTTCACACTCCTTAATCGGGAGACTGAACATGTATATTTCTTCTAATGTAGTAATTTTCCTTTCGTTTACTAGACGTCCCAACTGGGTAACAGGCTTCCATTCTTTTGTTGCAACTCCACGACCACGACCTCGTCCG ]
[-] EMBL AI976716 [ ACATTTTACTCCTAGCCCAACGTGACAGTTATGGTCT CCCATTGCAACAATTGCTTTA AAGCGGGTTCTCTGGCCAGCACAAGTCTGCTTTTGAACTGGCATGATTTTAAGTACTTCATCTTTTAAACTTGAACCCAATATGGTATCTATAATTTCACACTCCTTAATCGGGAGACTGAACATGTATATTTCTTCTAATGTAGTAATTTTCCTTTCGTTTACTAGACGTCCCAACTGGGTAACAGGCTTCCATTCTTTTGTTGCAACTCCACGACCACGACCTCGTCCG ]
[-] EMBL CD110745 [ CAG TAT GTCTNNCNCATGNCAACAA TGCTTAANAAGCGGGTTCTCTGGCCAGCACAAGTCTGCTTTTGAACTGGCATGATTTTAAGTACTTCATCTTNTAAACTGNAACCCAATATGGTATCTATAATTTCACACTCCTTAATCGGGAGACTGAACATGTATATTCCTTCTAATGTAGTAATTTTCCTTTCGTTTACTAGACGTCCCAACTGGGTAACAGGCTTCCATTCTTTTGTTGCAACTCCACGACCACGACCTCGTCCG ]
[-] EMBL CD141825 [ GGGTCTTCTGGCCAGCACAAGTCTGCTTTTGAACTGGCATGATTTTAAGTACTTCATCTTTTAAACTTGAACNCAATATGGTATCTATAATTTCACACTCCTTAATCGGGAGACTGAACATGTATATTTCTTCTAATGTAGTAATTTTCCTTTCGTTTACTAGACGTCCCAACTGGGTAACAGGCTTCCATTCCTTTGTTGCAACTCCACGACCACGACCTCGTCCG ]
[+] EMBL BG930219 [ gTCTCTGGCCAGCACAAGTCTGCTTTTGAACTGGCATGATTTTAAGTACTTCATCTTTTAAACTTGAACCCAATATGGTATCTATAATTTCACACTCCTTAATCGGGAGACTGAACATGTATATTTCTTCTAATGTAGTAATTTTCCTTTCGTTTACTAGACGTCCCAACTGGGTAACAGGCTTCCATTCTTTTGTTGCAACTCCACGACCACGACCTCGTCC ]
[-] EMBL CD113037 [ TACTTCATCTTTTAAACTTGAACCCAATATGGTATCTATAATTTCACACTCCTTAATCGGGAGACTGAACATGTATATTTCTTCT ATGTAGTAATTTTCCTTTCGTTTACTAGACGTCCCAACTGGGTAACAGGCTTCCATTCTTTTGTTGCAACTCCACGACCACGACCTCGCCCG ]
[-] EMBL BG931193 [ ACTCCTTAATCGGGAGACTGAACATGTATATTTCTTCTAATGTAGTAATTTTCCTTTCGTTTACTAGACGTCCCAACTGGGTAACAGGCTTCCATTCTTTTGTTGCAACTCCACGACCACGACCTCGTCCG ]
[-] EMBL CD149749 [ AACGAACCACGAAAACCACCGCGACCCCCACGTGAGGAATCCATTTGATAGCCTATGATTCCCACGCTCGATGATCTT]
clustalw multiple alignements is not computed in this case |
| Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) | ||||