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Schistosoma mansoni
cluster # 10661 cluster # 10661       Sequences # 19       consensus # 2


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_10661#0 length = 1350 sequences # 18  
consensus_10661#1 length = 414 sequences # 1  

consensusID : consensus_10661#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 18
consensus length = 1350
fasta sequence
                              [AGGAATTGAACTGTAAAGAAGCGGGGTTTTGATAACTACACGGATGCTTTTGTGTTTCGCCATGGTGGAATGTAACGGAACCAGGTAATTTAGAGATATCCGGCTTTTGACCATCTGTTTGGTAAAAAGATGATTGGTTGAAACCAGAAAAATATGGAGTGGCTGTATATTGAGTAAATGAACCATGTGAATTCAAATTATAATCGTTGACTGTAGATGGAAAGTCATTTGGAACCAAAACCTTTTCGTTTTTTATTTTCCTAGCAGATGAATCATGATTAATAGCAGAGGACATATTATCTTCAAGACCAGCCCAAGTGTTGTGGCGTACACGTGAATTAAAGTTTGTATTCATTGTTGAGTCGAATCCAGTGTTCATTTGCGCAGGATAATGCCCAAACAAGGCTGCAGATTGCTGGGTATATGGAACATGAACATTTGGATTGGTAGGATAGACAGCTTGAACATACTCTACCATCCCATGTAACGACGGTGGCTGAAGTGTAGGACTCGTGTATAGTTGATGGTGTGAGACAACGGGATGCTGTTGGACTGGGACAGATGGCACGTAGGCTGATTGGTTCATTGATACATTAACGTCAAGAATCCGAGGGTGTAGGTCACGTGCAGTGTTCGTATTGTTAAGATTATTTACTTGCTTTGAACCAGATGTTAAAAGTGGTTGAGTGGATCCAGATTCTCTGTATGCTGGAGATAAGTTATCCTGTGTCAATGTTCTTATAGTCGGTTGCCCTACAATTCCCGGAATAAGAAATGGTTGACCTAAAGAGCCAGATGGATGTTGAGCGTTTGGATGAAGGACACCAGTTTGTTCAGAACGTATTGATGTAGACGGGTTTTGTAGGCCTGTATGTGGCTGAACTAAACCATTGGGAGTAGCCGCGACAGCGAAATGAACCTGTTGGGCTCCCAGAGTAATAGATCCATGATTCCCACCAGTATTTCCGTTTGATGGTTGGAAAGAATGAGTACAAGATCTTGAATTTAGTTCATTTAGTTTGATGTTGGGTGCATATTTATAACTCTCACTTGACTGACTGATTGGTGTTTGTTCCATATCTGTCACGCTTTGCCCGGGAAATACATTAATCATTTTATTTAACCCATTGACATACATTCCCTGCGTCTGAGTCCACGACCCATCCATAGGGCCAAGGTTTTGATAAGGTTGTGAGAGA-GCAACTTGATATTGTGTGTGAACATTTGGTCCAGCGTTAGACGTTGAAGCTGACCGACTACGCTGAGTAACTATGTGCTGTTGCTGTTGATGTGGTATGAGGGAAGATAATGCAGTATTGGAATACAT-AAAATTAGCTGACATGTTATCAA]

[+] EMBL CD161706             [AGGAATTGAACTGTAAAGAAGCGGGGTTTTGATAACTACACGGATGCTTTTGTGTTTCGCCATGGTGGAATGTAACGGAACCAGGTAATTTAGAGATATCCGGCTTTTGACCATCTGTTTGGTAAAAAGATGATTGGTTGAAACCAGAAAAATATGGAGTGGCTGTATATTGAGTAAATGAACCATGTGAATTCAAATTATAATCGTTGACTGTAGATGGAAAGTCATTTGGAACCAAAACCTTTTCGTTTTTTATTTTCCTAGCAGATGAATCATGATTAATAGCAGAGGACATATTATCTTCAAGACCAGCCCAAGTGTTGTGGCGTACACGTGAATTAAAGTTTGTATTCATTGTTGAGTCGAATCCAGTGTTCATTTGCGCAGGATAATGCCCAAACAAGGCTGCAGATTGCTGGGTATATGGAACATGAACATTTGGATTGGTAGGATAGACAGCTTGAACATACTCTACCATCCCATGTAACGACGGTGGCTGAAGTGTAGGACTCGTGTATAGTTGATGGTGTGAGACAACG                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             ]
[+] EMBL CD121983             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                TGGGTATATGGAACATGAACATTTGGATTGGTAGGATAGACAGCTTGAACATACTCTACCATCCCATGTAACGACGGTGGCTGAAGTGTAGGACTCGTGTATAGTTGATGGTGTGAGACAACGGGATGCTGTTGGACTGGGACAGATGGCACGTAGGCTGATTGATTCATTGATACATTAACGTCAAGAATCCGAGGGTGTAGGTCACGTGCAGTGTTCGTATTGTTAAGATTATTTACTTGCTTTGAACCAGATGTTAAAAGTGGTTGAGTGGATCCAGATTCTCTGTATGCTGGAGATAAGTTATCCTGTGTCAATGTTCTTATAGTCGGTTGCCCTACAATTCCCGGAATAAGAAATGGTTGACCTAAAGAGCCAGATGGATGTTGAG                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 ]
[+] EMBL CD121388             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  GGTATATGGAACATGAACATTTGGATTGGTAGGATAGACAGCTTGAACATACTCTACCATCCCATGTAACGACGGTGGCTGAAGTGTAGGACTCGTGTATAGTTGATGGTGTGAGACAACGGGATGCTGTTGGACTGGGACAGATGGCACGTAGGCTGATTGGTTCATTGATACATTAACGTCAAGAATCCGAGGGTGTAGGTCACGTGCAGTGTTCGTATTGTTAAGATTATTTACTTGCTTTGAACCAGATGTTAAAAGTGGTTGAGTGGATCCAGATTCTCTGTATGCTGGAGATAAGTTATCCTGTGTCAATGTTCTTATAGTCGGTTGCCCTACAATTCCCGGAATAAGAAATGGTTGACCTAAAGAGCCAGATGGATGTTGAGCGTTTGGATGAAGGACACCAGTTTGTTCAGAACGTATTGATGTAGACGGGTTTTGTAGGCCTGTA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                ]
[+] EMBL CD121327             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  GGTATATGGAACGTGAACATTTGGATTGGTAGGATAGACAGCTTGAACATACTCTACCATCCCATGTAACGACGGTGGCTGAAGTGTAGGACTCGTGTATAGTTGATGGTGTGAGACAACGGGATGCTGTTGGACTGGGACAGATGGCACGTAGGCTGATTGGTTCATTGATACATTAACGTCAAGAATCCGAGGGTGTAGGTCACGTGCAGTGTTCGTATTGTTAAGATTATTTACTTGCTTTGAACCAGATGTTAAAAGTGGTTGAGTGGATCCAGATTCTCTGTATGCT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  ]
[+] EMBL CD149972             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              GGCTGAAGTGTAGGACTCGTGTATAGTTGATGGTGTGAGACAACGGGATGCTGTTGGACTGGGACAGATGGCACGTAGGCTAATTGGTTCATTGATACATTAACGTCAAGAATCCGAGGGTGTAGGTCACGTGCAGTGTTCGTATTGTTAAGATTATTTACTTGCTTTGAACCAGATGTTAAAAGTGGTTGAGTGGATCCAGATTCTCTGTATGCTGGAGATA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           ]
[-] EMBL CD193838             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  GAAGTGTAGGACTCGTGTATAGTAGATGGTGTGAGACAACGGNATGCTGTTGGACTGGGACAGATGGCACGTAGGCTGATTGATTCATTGATACATTAACGTCAAGAATCCGAGGGTGTAGGTCACGTGCAGTGTTCGTATTGTTAAGATTATTTACTTGCTTTGAACCAGATGTTAAAAGTGGTTGAGTGGATCCAGATTCTCTGTATGCTGGAGATAAGTTATCCTGTGTCAATGTTCTTATAGTCGGTTGCCCTACAATTCCCGGAATAAGAAATGGTTGACCTAAAGAGCCAGATGGATGTTGAGCGTTTGGATGAAGGACACCAGTTTGTTCAGAACGTATTGATGTAGACGGGTTTTGTAGGCCTGTATGTGGCTGAACTAAACC                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               ]
[+] EMBL CD158710             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           GACTCGTGTATAGTTGATGGTGTGAGACAACGGGATGCTGTTGGACTGGGACAGATGGCACGTAGGCTGATTGGTTCATTGATACATTAACGTCAAGAATCCGAGGGTGTAGGTCACGTGCAGTGTTCGTATTGTTAAGATTATTTACTTGCTTTGAACCAGATGTTAAAAGTGGTTGAGTGGATCCAGATTCTCTGTATGCTGGAGATAAGTTATCCTGTGTCAATGTTCTTATAGTCGGTTGCCCTACAATTCCCGGAATAAGAAATGGTTGACCTAAAGAGCCAGATGGATGTTGAGCGTTTGGATGAAGGACACCAGTTTGTTCAGAACGTATTGATGTAGACGGGTTTTGTAGGCCTGTATGTGGCTGAACTAAAC                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                ]
[+] EMBL CD177695             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           GACTCGTGTATAGTTGATGGTGTGAGACAACGGGATGCTGTTGGACTGGGACAGATGGCACGTAGGCTGATTGGTTCATTGATACATTAACGTCAAGAATCCGAGGGTGTAGGTCACGTGCAGTGTTCGTATTGTTAAGATTATTTACTTGCTTTGAACCAGATGTTAAAAATGGTTGAGTGGATCCAGATTCTCTGTATGCTGGAGATAAGTTATCCTGTGTCAATGTTCTTATAGTCGGTTGCCCTACAATTCCCGGAATAAGAAATGGT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             ]
[-] EMBL CD120704             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            ACTCGTGTATAGTTGATGGTGTGAGACAACGGGATGCTGTTGGACTGGGACAGATGGCACGTAGGCTGATTGGTTCATTGATACATTAACGTCAAGAATCCGAGGGTGTAGGTCACGTGCAGTGTTCGTATTGTTAAGATTATTTACTTGCTTTGAACCAGATGTTAAAAGTGGTTGAGTGGATCCAGATTCTCTGTATGCTGGAGATAAGTTATCCTGTGTCAATGTTCTTATAGTCGGTTGCCCTACAATTCCCGGAATAAGAAATGGTTGACCTAAAGAGCCAGATGGATGTTGAGCGTTTGGATGAAGGACACCAGTTTGTTCAGAACGTATTGATGTAGACGGGTTTTGTAGGCCTGTATGTGGCTGAACTAAACC                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               ]
[-] EMBL CD121363             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                TTAAAAGTGNTTGAGTGGATCCAGATTCTCTGTATGCTGGAGATAAGTTATCCTGTGTCAATGTTCTTATAGTCGGTTGCCCTACAATTCCCGGAATAAGAAATGGTTGACCTAAAGAGCCAGATGGATGTTGAGCGTTTGGATGAAGGACACCAGTTTGTTCAGAACGTATTGATGTAGACGGGTTTTGTAGGCCTGTATGTGGCTGAACTAAACCATTGGGAGTAGCCGCGACAGCGAAATGAACCTGTTGGGCTCCCAGAGTAATAGATCCATGATTCCCACCAGTATTTCCGTTTGATGGTTGGAAAGAATGAGTACAAGATCTTGAATTTAGTTCATTTAGTTTGATGTTGGGTGCATATTTATAACTCTCACTTGACTGACTGATTGGTGTTTGTTCCATATCTGTCACGCTTTGCCCGGGAAATACATTAATCATTTTATTTAACCCATTGACA                                                                                                                                                                                                                           ]
[+] EMBL CD183420             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 ATCCTGTGTCAATGTTCTTATAGTCGGTTGCCCTACAATTTCCGGAATAAGAAATGGTTGACCTAAAGAGCCAGATGGATGTTGAGCGTTTGGATGAAGGACACCAGTTTGTTCAGAACGTATTGATGTAGACGGGTTTTGTAGGGCTGTATGTGGCTGAACTAAACCATTGGGAGTAGCCGCGACAGCGAAATGAACCTGTTGGGCTCCCAGAGTAATAGATCCATGATTCCCACCAGTATTTCCGTTTGATGGTTGGAAAGAATGAGTACAAGATCTTGAATTTAGTTCATTTAGTTTGATGTTGGGTGCATATTTATAACTCTCACTTGACTGACTGATTGGTGTTTGTTCCATATCTGTCATGCTTTGCCCGGGAAATACATTAATCATTTTATTTAACCCATTG                                                                                                                                                                                                                              ]
[-] EMBL CD189964             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  TCCTGTGTCAATGTTCTTATAGTCGGTTGCCCTACAATTCCCGGAATAAGAAATGGTTGACCTAAAGAGCCAGATGGATGTTGAGCGTTTGGATGAAGGACACCAGTTTGTTCAGAACGTATTGATGTAGACGGGTTTTGTAGGCCTGTATGTGGCTGAACTAAACCATTGGGAGTAGCCGCGACAGCGAAATGAACCTGTTGGGCTCCCAGAGTAATAGATCCATGATTCCCACCAGTATTTCCGTTTGATGGTTGGAAAGAATGAGTACAAGATCTTGAATTTAGTTCATTTAGTTTGATGTTGGGTGCATATTTATAACTCTCACTTGACTGACTGATTGGTGTTTGTTCCATATCTGTCATGCTTTGCCCGGGAAGTACATTAATCATTTTATTTAACCCATTGAC                                                                                                                                                                                                                            ]
[-] EMBL CD121372             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               GTTCAGAACGTATTGATGTAGACGGGTTTTGTAGGCCTGTATGTGGCTGAACTAAACCATTGGGAGTAGCCGCGACAGCGAAATGAACCTGTTGGGCTCCCAGAGTAATAGATCCATGATTCCCACCAGTATTTCCGTTTGATGGTTGGAAAGAATGAGTACAAGATCTTGAATTTAGTTCATTTAGTTTGTTGTTGGGTGCATATTTATAACTCTCACTTGACTGACTGATTGGTGTTTGTTCCATATCTGTCACGCTTTGCCCGGGAAATACATTAATCATTTTATTTAACCCATTGACATACATTCCCTGCGTCTGAGTCCACGACCCATCCATAGGGCCAAGGTTTTGATAAGGTTGTGAGAGA GCAACTTGATATTGTGTGTGAACATTTGGTCCAGCGTTAGACGTTGAAGCTGACCGACTACGCTGAGTAACTATGTGCTGTT                                                                      ]
[-] EMBL CD069118             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   GACGGGTTTTGTAGGCCTGTATGTGGCTGAACTAAACCATTGGGAGTAGCCGCGACAGCGAAATGAACCTGTTGGGCTCCCAGAGTAATAGATCCATGATTCCCACCAGTATTTCCGTTTGATGGTTGGAAAGAATGAGTACAAGATCTTGAATTTAGTTCATTTAGTTTGATGTTGGGTGCATATTTATAACTCTCACTTGACTGACTGATTGGTGTTTGTTCCATATCTGTCACGCTTTGCCCGGGAAATACATTAATCATTTTATTTAACCCATTGACATACATTCCCTGCGTCTGAGTCCACGACCCATCCATAGGGCC AGGTTTTGATAAGTTCGTGAGAGACGCAACTTGA                                                                                                                                               ]
[-] EMBL CD121355             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                GGCCTGTATGTGGCTGAACTAAACCATTGGGAGTAGCCGCGACAGCGAAATGAACCTGTTGGGCTCCCAGAGTAATAGATCCATGATTCCCACCAGTATTTCCGTTTGATGGTTGGAAAGAATGAGTACAAGATCTTGAATTTAGTTCATTTAGTTTGATGTTGGGTGCATATTTATAACTCTCACTTGACTGACTGATTGGTGTTTGTTCCATATCTGTCACGCTTTGCCCGGGAAATACATTAATCATTTTATTTAACCCATTGACATACATTCCCTGCGTCTGAGTTCACGACCCATCCATAGGGCCAAGGTTTTGATAAGGTTGTGAGAGA GCAACTTGATATTGTGTGTGAACATTTGGTCCAGCGTTAGACGTTGAAGCTGACCGACTACGCTGACTAACTATGTGCTGTT                                                                      ]
[-] EMBL CD071756             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                GTTCATATAGTTTGATGTCGGGTGCATATTTATAACTCTCACTTGACTGAGTGATTGGTGTTTGTTCCATATCTGTCACGCTTTGCCCGGGAAATACATTAATCATTTTATTTAACCCATTGACATACATTCCCTGCGTCTG                                                                                                                                                                                                          ]
[+] EMBL CD189860             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            GACTGACTGATTGGTGTTTGTTCCATATCTGTCATGCTTTGCCCGGGAAATACATTAATCATTTTATTTAACCCATTGACATACATTCCCTGCGTCTGAGTCCACGACCCATCCATAGGGCCAAGGTTTTGATAAGGTTGTGAGAGA GCAACTTGATATTGTGTGTGAACATTTGGTCCAGCGTTAGACGTTGAAGCTGACCGACTACGTTGAGTAACTATGTGCTGTTGCTGTTGATGTGGTATGAGGGAAGATAATGCAGTATTGGAATACAT AAAATTAGCTGACATGTTATCAA]
[-] EMBL CD068259             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           TCCATAGGGCCAAGGTTTTGATAAGGTTGTGAGAGA GCAACTTGATATTGTGTGTGAACATTTGGTCCAGCGTTAGACGTTGAAGCTGACCGACTACGCTGAGTAACTATGTGCTGTTGCTGTTGATGTGGTATGAGGGAAGATAATGCAGTATTGGAATACATGAATATTAGCTGACATGTTATCtt]


>consensus_10661#0 AGGAATTGAACTGTAAAGAAGCGGGGTTTTGATAACTACACGGATGCTTTTGTGTTTCGC CATGGTGGAATGTAACGGAACCAGGTAATTTAGAGATATCCGGCTTTTGACCATCTGTTT GGTAAAAAGATGATTGGTTGAAACCAGAAAAATATGGAGTGGCTGTATATTGAGTAAATG AACCATGTGAATTCAAATTATAATCGTTGACTGTAGATGGAAAGTCATTTGGAACCAAAA CCTTTTCGTTTTTTATTTTCCTAGCAGATGAATCATGATTAATAGCAGAGGACATATTAT CTTCAAGACCAGCCCAAGTGTTGTGGCGTACACGTGAATTAAAGTTTGTATTCATTGTTG AGTCGAATCCAGTGTTCATTTGCGCAGGATAATGCCCAAACAAGGCTGCAGATTGCTGGG TATATGGAACATGAACATTTGGATTGGTAGGATAGACAGCTTGAACATACTCTACCATCC CATGTAACGACGGTGGCTGAAGTGTAGGACTCGTGTATAGTTGATGGTGTGAGACAACGG GATGCTGTTGGACTGGGACAGATGGCACGTAGGCTGATTGGTTCATTGATACATTAACGT CAAGAATCCGAGGGTGTAGGTCACGTGCAGTGTTCGTATTGTTAAGATTATTTACTTGCT TTGAACCAGATGTTAAAAGTGGTTGAGTGGATCCAGATTCTCTGTATGCTGGAGATAAGT TATCCTGTGTCAATGTTCTTATAGTCGGTTGCCCTACAATTCCCGGAATAAGAAATGGTT GACCTAAAGAGCCAGATGGATGTTGAGCGTTTGGATGAAGGACACCAGTTTGTTCAGAAC GTATTGATGTAGACGGGTTTTGTAGGCCTGTATGTGGCTGAACTAAACCATTGGGAGTAG CCGCGACAGCGAAATGAACCTGTTGGGCTCCCAGAGTAATAGATCCATGATTCCCACCAG TATTTCCGTTTGATGGTTGGAAAGAATGAGTACAAGATCTTGAATTTAGTTCATTTAGTT TGATGTTGGGTGCATATTTATAACTCTCACTTGACTGACTGATTGGTGTTTGTTCCATAT CTGTCACGCTTTGCCCGGGAAATACATTAATCATTTTATTTAACCCATTGACATACATTC CCTGCGTCTGAGTCCACGACCCATCCATAGGGCCAAGGTTTTGATAAGGTTGTGAGAGAG CAACTTGATATTGTGTGTGAACATTTGGTCCAGCGTTAGACGTTGAAGCTGACCGACTAC GCTGAGTAACTATGTGCTGTTGCTGTTGATGTGGTATGAGGGAAGATAATGCAGTATTGG AATACATAAAATTAGCTGACATGTTATCAA



consensusID : consensus_10661#1
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 1
consensus length = 414
fasta sequence
                              [GATCTCAAAAATACAACAACGAGTTTCTAGATCGATTTCGCACGTGTAAGTCATGGTCCAGATTATTAAGAGTGTTTGCATACTGCAGACGGTTAATCAACAATATGCTAAACAAGAAGAATGGAAAATGTCTAATCTCGGGCACACCAAGTGTTGAAGATATTGGTAAATCGAAGAGCGACATAATTAAACTAGTCCAAAGTGCCGCATTCCCGGCCGAAAAAGGAATCCTAGACAGTTTACCATTAACGCTCGAAGACAACGCTTCTAAGCAGCAGGAAAGAATGAGTACAAGATCTTGAATTTAGTTCATTTAGTTTGATGTTGGGTGCATATTTATAACTCTCACTTGACTGACTGATTGGTGTTTGTTCCATATCTGTCACGCTTTGCCCGGGAAATACATTAATCATT]

[-] EMBL CD168908             [GATCTCAAAAATACAACAACGAGTTTCTAGATCGATTTCGCACGTGTAAGTCATGGTCCAGATTATTAAGAGTGTTTGCATACTGCAGACGGTTAATCAACAATATGCTAAACAAGAAGAATGGAAAATGTCTAATCTCGGGCACACCAAGTGTTGAAGATATTGGTAAATCGAAGAGCGACATAATTAAACTAGTCCAAAGTGCCGCATTCCCGGCCGAAAAAGGAATCCTAGACAGTTTACCATTAACGCTCGAAGACAACGCTTCTAAGCAGCAGGAAAGAATGAGTACAAGATCTTGAATTTAGTTCATTTAGTTTGATGTTGGGTGCATATTTATAACTCTCACTTGACTGACTGATTGGTGTTTGTTCCATATCTGTCACGCTTTGCCCGGGAAATACATTAATCATT]


>consensus_10661#1 GATCTCAAAAATACAACAACGAGTTTCTAGATCGATTTCGCACGTGTAAGTCATGGTCCA GATTATTAAGAGTGTTTGCATACTGCAGACGGTTAATCAACAATATGCTAAACAAGAAGA ATGGAAAATGTCTAATCTCGGGCACACCAAGTGTTGAAGATATTGGTAAATCGAAGAGCG ACATAATTAAACTAGTCCAAAGTGCCGCATTCCCGGCCGAAAAAGGAATCCTAGACAGTT TACCATTAACGCTCGAAGACAACGCTTCTAAGCAGCAGGAAAGAATGAGTACAAGATCTT GAATTTAGTTCATTTAGTTTGATGTTGGGTGCATATTTATAACTCTCACTTGACTGACTG ATTGGTGTTTGTTCCATATCTGTCACGCTTTGCCCGGGAAATACATTAATCATT



consensus multiple alignement with clustalw

CLUSTAL W (1.82) multiple sequence alignment


consensus_10661#0      AGGAATTGAACTGTAAAGAAGCGGGGTTTTGATAACTACACGGATGCTTTTGTGTTTCGC 60
consensus_10661#1      ------------------------------------------------------------
                                                                                   

consensus_10661#0      CATGGTGGAATGTAACGGAACCAGGTAATTTAGAGATATCCGGCTTTTGACCATCTGTTT 120
consensus_10661#1      ------------------------------------------------------------
                                                                                   

consensus_10661#0      GGTAAAAAGATGATTGGTTGAAACCAGAAAAATATGGAGTGGCTGTATATTGAGTAAATG 180
consensus_10661#1      ------------------------------------------------------------
                                                                                   

consensus_10661#0      AACCATGTGAATTCAAATTATAATCGTTGACTGTAGATGGAAAGTCATTTGGAACCAAAA 240
consensus_10661#1      ------------------------------------------------------------
                                                                                   

consensus_10661#0      CCTTTTCGTTTTTTATTTTCCTAGCAGATGAATCATGATTAATAGCAGAGGACATATTAT 300
consensus_10661#1      ------------------------------------------------------------
                                                                                   

consensus_10661#0      CTTCAAGACCAGCCCAAGTGTTGTGGCGTACACGTGAATTAAAGTTTGTATTCATTGTTG 360
consensus_10661#1      ------------------------------------------------------------
                                                                                   

consensus_10661#0      AGTCGAATCCAGTGTTCATTTGCGCAGGATAATGCCCAAACAAGGCTGCAGATTGCTGGG 420
consensus_10661#1      ------------------------------------------------------------
                                                                                   

consensus_10661#0      TATATGGAACATGAACATTTGGATTGGTAGGATAGACAGCTTGAACATACTCTACCATCC 480
consensus_10661#1      ------------------------------------------------------------
                                                                                   

consensus_10661#0      CATGTAACGACGGTGGCTGAAGTGTAGGACTCGTGTATAGTTGATGGTGTGAGACAACGG 540
consensus_10661#1      ------------------------------------------------------------
                                                                                   

consensus_10661#0      GATGCTGTTGGACTGGGACAGATGGCACGTAGGCTGATTGGTTCATTGATACATTAACGT 600
consensus_10661#1      ------------------------------------------------------------
                                                                                   

consensus_10661#0      CAAGAATCCGAGGGTGTAGGTCACGTGCAGTGTTCGTATTGTTAAGATTATTTACTTGCT 660
consensus_10661#1      ------------------------------------------------------------
                                                                                   

consensus_10661#0      TTGAACCAGATGTTAAAAGTGGTTGAGTGGATCCAGATTCTCTGTATGCTGGAGATAAGT 720
consensus_10661#1      --------GATCTCAAAAAT-----ACAACAACGAGTTTCTAGATCGATTTCGCACGTGT 47
                               *** * **** *     *    * * ** ****   *    *    *   **

consensus_10661#0      TATCCTGTGTCAATGTTCTTATAGTCGGTTGCCCTACAATTCCCGGAATAAGAAATGGTT 780
consensus_10661#1      AAGTCATGGTCCAGATTATTAAGAGTGTTTGC------ATACTGCAGACGGTTAATCAAC 101
                        *  *   *** *  ** ***     * ****      ** *     *     ***    

consensus_10661#0      GACCTAAAGAGCCAGATGGATGTTGAGCGTTTGGATGAAGG-ACACCAGTTTGTTCAGAA 839
consensus_10661#1      AATATGCTAAACAAGAAGAATGGAAAATGTCTAATCTCGGGCACACCAA---GTGTTGAA 158
                        *  *    * * *** * ***   *  ** *       ** ******    **   ***

consensus_10661#0      CGTATTGATGTAGACGGGTTTTGTAGGCCTGTATGTGGCTGAACTAAACCATTGGGA-GT 898
consensus_10661#1      GATATTGGTAAA--------TCGAAGAGCGACAT--AATTAAACTAGTCCAAAGTGCCGC 208
                         ***** *  *        * * **  *   **     * *****  ***  * *  * 

consensus_10661#0      AGCCGCGACAGCGAAATGAACCTGTTGGGCTCCCAGAGTAATAGATCCATGATTCCCACC 958
consensus_10661#1      ATTCCCGGCCGAAAAAGGAA----------TCCTAGA-CAGTTTACCATTAACGCTCGAA 257
                       *  * ** * *  *** ***          *** ***  * *  * *  * *  * *   

consensus_10661#0      AGTATTTCCGTTTGATGGTTGGAAAGAATGAGTACAAGATCTTGAATTTAGTTCATTTAG 1018
consensus_10661#1      GACAACGCTTCTAAGCAGCAGGAAAGAATGAGTACAAGATCTTGAATTTAGTTCATTTAG 317
                          *   *   *     *  ****************************************

consensus_10661#0      TTTGATGTTGGGTGCATATTTATAACTCTCACTTGACTGACTGATTGGTGTTTGTTCCAT 1078
consensus_10661#1      TTTGATGTTGGGTGCATATTTATAACTCTCACTTGACTGACTGATTGGTGTTTGTTCCAT 377
                       ************************************************************

consensus_10661#0      ATCTGTCACGCTTTGCCCGGGAAATACATTAATCATTTTATTTAACCCATTGACATACAT 1138
consensus_10661#1      ATCTGTCACGCTTTGCCCGGGAAATACATTAATCATT----------------------- 414
                       *************************************                       

consensus_10661#0      TCCCTGCGTCTGAGTCCACGACCCATCCATAGGGCCAAGGTTTTGATAAGGTTGTGAGAG 1198
consensus_10661#1      ------------------------------------------------------------
                                                                                   

consensus_10661#0      AGCAACTTGATATTGTGTGTGAACATTTGGTCCAGCGTTAGACGTTGAAGCTGACCGACT 1258
consensus_10661#1      ------------------------------------------------------------
                                                                                   

consensus_10661#0      ACGCTGAGTAACTATGTGCTGTTGCTGTTGATGTGGTATGAGGGAAGATAATGCAGTATT 1318
consensus_10661#1      ------------------------------------------------------------
                                                                                   

consensus_10661#0      GGAATACATAAAATTAGCTGACATGTTATCAA 1350
consensus_10661#1      --------------------------------
                                                       




Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)