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consensusID : consensus_10703#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 9 consensus length = 853 fasta sequence
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consensus multiple alignement with clustalw CLUSTAL W (1.82) multiple sequence alignment
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* ** * ************** *****
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consensus_10703#4 CAAAAATACCACCAATTGGTTCAAGATCTGTTCTAATTGCTATCGATGGATCAGAACATT 115
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***** *** ********* * *** * ********** ***** **********
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************************* **********************************
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consensus_10703#1 AGAAAGATTATAGTGCAGATTGTTTAGCACATAATTTAACGTATCAATTTTTATATGAAT 351
consensus_10703#3 AGAAAGATTATAGTGCAGATTGTTTAGCACATAATTTAACGTATCAATTTTTATATGAAT 334
consensus_10703#4 AAAATGATTATAGTGCCGATTGTTTAGCATATAATTTAACATATCAATTTTTATATGAAT 355
consensus_10703#2 AAAATGATTATAGTGCCGATTGTTTAGCACATAATTTAACATATCAATTTTTATATGAAT 342
* ** *********** ************ ********** *******************
consensus_10703#0 CAGTAGATCATATTGGTGCATCTATTATAGAAAAAGCTGAAAAATATAATGCATGTCTAA 415
consensus_10703#1 CAGTAGATCATATTGGTGCATCTATTATAGAAAAAGCTGAAAAATATAATGCATGTCTAA 411
consensus_10703#3 CAGTAGATCATATTGGTGCATCTATTATAGAAAAAGCTGAAAAATATAATGCATGTCTAA 394
consensus_10703#4 CAGTAGATCATATTGGTGCAGCTATTGTACAAAATGCTGAAAAATATAA----------- 404
consensus_10703#2 CAGTAGATCATATTGGTGCAGCTATTGTACAAAATGCTGAAAAATATAATGTACATTTAT 402
******************** ***** ** **** **************
consensus_10703#0 TTATAATTGGTAGTCGTGGATTAGGTGCTATAAAACGTACAATTATGGGTAGTGTTAGTG 475
consensus_10703#1 TTATAATTGGTAGTCGTGGATTAGGTGCTATAAAACGTACAATTATGGGTAGTGTTAGTG 471
consensus_10703#3 TTATAATTGGTAGTCGTGGATTAGGTGCTATAAAACGTACAATTATGGGTAGTGTTAGTG 454
consensus_10703#4 ------------------------------------------------------------
consensus_10703#2 TAATTGTTGGAAGTCGTGGATTAGGTGCTATTAAACGTACATTTATGGGTAGTGTTAGTG 462
consensus_10703#0 ATTATGTTGTACATCATGCTAATACAACTATATGTGTTGTACCATGGATTGATGAAACTA 535
consensus_10703#1 ATTATGTTGTACATCATGCTAATACAACTATATGTGTTGTACCATGGATTGATGAAACTA 531
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consensus_10703#4 ------------------------------------------------------------
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consensus_10703#3 C-CAAGTCATATGAA---TTAAC---ATCTATATATGTATCGGATGGTATGGGGGATA-G 564
consensus_10703#4 ------------------------------------------------------------
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consensus_10703#4 ------------------------------------------------------------
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consensus_10703#2 TAAAGTGTTATC---ATTTATTCTATATTCAA-ATTCATTATGTAACATATATACATGAG 817
consensus_10703#0 TTATCATTAATATAAGTAAACATAATTATTAGG 853
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consensus_10703#2 TGAGTATAGATTGTTGT---------------- 834
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| Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) | ||||