cluster # 10716

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Schistosoma mansoni
cluster # 10716 cluster # 10716 Sequences # 20 consensus # 3

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consensus_10716#0 length = 760 sequences # 8

consensus_10716#1 length = 729 sequences # 11
consensus_10716#2 length = 720 sequences # 1

consensusID : consensus_10716#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 8
consensus length = 760
fasta sequence

                              [AGAATTTCGGCACGAGGCCGCCAAACTCGAGTAGTCTTACAAATTCCGAAGTCTGTCTCATCATACA-GTTTTTCAAATCATTTGGGGATTGGCTATATATGCAGTTACTGACCCGTTCATCTACAAAGTAATTTCACTGCATTGAAAATGGTTGACTTAAGTGAAAAGGATCTTAACGATGTCCACGAAATGTTCCTACTATTTGACACGAAAGGAGATGAGAAAATCGAGGCGAAAGATATCGGTGAAGTTGTGCGTGCAATGGGTCTAAATCCAACAGAGTCGGACATTGGTAAATATGGCTATCAAAACAATCCAAATGAACGTATCAGTTTCGAATCATTTGTTCCAATTTATCATGGTTTGTTAAAAGAACAAGTGGAAGTAGATCAAGAAACATTTATTGAATCATTTCGTGTATTTGATAAAGA-GGATAATGGATTAATTAGTGCAGCTGAATTAAGACATTTACTAACAGCATTAGGTGAAAAACTACGTGATAATGAAGTGGATGTATTATTATCTGGTTTAGAAAATAGTCAAGGTCTTGTACCATATGAAGCTTTTGTACAACGTGTCATGAGTTAAAAACAAAATTTATTCTGTACCCAAAAATCATCAACGTACCCTAATAAACATGTTGATTTTTGATAAGTAATGAAATAAATTATCAGCTTTTTTCATTATTTTAAAACGTTAAGCAAGTTCTATAAAAGAGCTTAGTGATGTGTTACATATACATAAATATATATACTCTNGT]

[+] EMBL CD079608             [AGAATTTCGGCACGAGGCCGCCAAACTCGAGTAGTCTTACAAATTCCGAAGTCTGTCTCATCATACANGTTTTTCAAATCATTTGGGGATTGGCTATATATGCAGTTACTGACCCGTTCATCTACAAAGTAATTTCACTGCATTGAAAATGGTTGACTTAAGTGAAAAGGATCTTAACGATGTCCACGAAATGTTCCTACTATTTGACACGAAAGGAGATGAGAAAATCGAGGCGAAAGATATCGGTGAAGTTGTGCGTGCAATGGGTCTAAATCCAACAGAGTCGGACATTGGTAAATATGGCTATCAAAACAATCCAAATGAACGTATCAGTTTCGAATCATTTGTTCCAATTTATCATGGTTTGTTAAAAGAACAAGTGGAAGTAGATCAAGAAACATTTATTGAATCATTTCGTGTATTTGATAAAGA GGATAATGGATTAATTAGTGCAGCTGAATTAAGACATTTACTAACAGCATTAGGTGAAAAACTACGTGATAATGAAGTGGATGTATTATTATCTGGTTTAGAAAATAGTCAAGGTCTTGTACCATATGAAGCTTTTGTACAACGTGTCATGAGTTAAAAACAAAATTTATTCTGTACCCAAAAATCATCAACGTACCCTAATAAACATGTTGATTNTTGATAAGTAATGAAATAAATTATCAGCTNTTTTCATTATTTTAAAACGTTAAGCAAGTTCTATAAAAGAGCTTAGTGATGTGTTACATATACATAAATATATATACTCTNG ]
[-] EMBL CD137275             [                 CCGCCAACNTCGAGTAGTCTTACAAATTCCGAAGTCTGTCTCATCATACA GTTTTTCAAATCATTTGGGGATTGGCTATAT T CAGTTACTGACCCGTTCATCTACAAAGTAATTTCACTGCATTGAAAATGGTTGACTTAAGTGAAAAGGATCTTAACGATGTCCACGAAATGTTCCTACTATTTGACACGAAAGGAGATGAGAAAATCGAGGCGAAAGATATCGGTGAAGTTGTGCGTGCAATGGGTCTAAATCCAACAGAGTCGGACATTGGTAAATATGGCTATCAAAACAATCCAAATGAACGTATCAGTTTCGAATCATTTGTTCCAATTTGTCATGGTTTGTTAAAAGAACAAGTGGAAGTAGATCAAGAAACATTTATTGAATCATTTCGTGTATTTGATAAAGA GGATAATGGATTAATTAGTGCAGCTGAATTAAGACATTTACTAACAGCATTAGGTGAAAAACTACGTGATAATGAAGTGGATGTATTATTATCTGGTTTAGAAAATAGTCAAGGT                                                                                                                                                                                                                      ]
[+] EMBL CD134659             [                                                     TGTCTCATCATACA GTTTTTCAAATCATTTGGGGATTGGCTATAT T CAGTTACTGACCCGTTCATCTACAAAGTAATTTCACTGCATTGAAAATGGTTGACTTAAGTGAAAAGGATCTTAACGATGTCCACGAAACGTCCCTACTATTTGACACGAAAGGAGATGAGAAAATCGAGGCGAAAGATATCGGTGAAGTTGTGCGTGCAATGGGTCTAAATCCAACAGAGTCGGACATTGGTAAATATGGCTATCAAAACAATCCAAATGAACGTATCAGTTTCGAATCATTTGTTCCAATTTATCATGGTTTGTTAAAAGAACAAGTGGAAGTAGATCAAGAAACATTTATTGAATCATTTCGTGTATTTGATAAAGA GGATAATGGATTAATTAGTGCAGCTGAATTAAGACATTTACTAACAGCATTAGGTGAAAAACTACGTGATAATGAAGTGGATGTATTATTATCTGGTTTAGAAAATAGTCAAGGTCTTGTACCATATGAA                                                                                                                                                                                                       ]
[-] EMBL CD073870             [                                                                     gTTTTCAAATCATTGGGGGATTGGCTATATATGCAGTTACTGACCCGTTCATCTACAAAGTAATTTCACTGCATTGAAAATGGTTGACTTAAGTGAAAAGGATCTTAACGATGTCCACGAAATGTTCCTACTATTTGACACGAAAGGAGATGAGAAAATCGAGGCGAAAGATATCGGTGAAGTTGTGCGTGCAATGGGTCTAAATCCAACAGAGTCGGACATTGGTAAATATGGCTATCAAAACAATCCAAATGAACGTATCAGTTTCGAATCATTTGTTCCAATTTATCATGGTTTGTTAAAAGAACAAGTGGAAGTAGATCAAGAAACATTTATTGAATCATTTCGTGTATTTGATAAAGA GGATAATGGATTAATTAGTGCAGCTGAATTAAGACATTTACTAACAGCATTAGGTGAAAAACTACGTGATAATGAAGTGGATGTATTATTATCTGGTTTAGAAAATAGTCAAGGTCTTGTACCATATGAAGCTTTTGTACAACGTGTCATGAGTTAAAAACAAAATTTATTCTGTACCCAAAAATCATCAACGTACCCTAATAAACATGTTGATTTTTGATAAGTAATGAAATAAATTATCAGCTTTTTTCATTATTTTAAAACGTTAAGCAAGTTCTATAAAAGAGCTTAGTGATGTGTTACATATACATAAATATATATACTCTgtt]
[-] EMBL CD073764             [                                                                                                                     TCATCTACAAAGTAATTTCACTGCATTGAAAATGGTTGACTTAAGTGAAAAGGATCTTAACGATGTCCACGAAATGTTCCTACTATTTGACACGAAAGGAGATGAGAAAATCGAGGCGAAAGATATCGGTGAAGTTGTGCGTGCAATGGGTCTAAATCCAACAGAGTCGGACATTGGTAAATATGGCTATCAAAACAATCCAAATGAACGTATCAGTTTCGAATCATTTGTTCCAATTTATCATGGTTTGTTAAAAGAACAAGTGGAAGTAGATCAAGAAACATTTATTGAATCATTTCGTGTATTTGATAAAGA GGATAATGGATTAATTAGTGCAGCTGAATTAAGACATTTACTAACAGCATTAGGTGAAAAACTACGTGATAATGAAGTGGATGTATTATTATCTGGTTTAGAAAATAGTCAAGGTCTTGTACCATATGAAGCTTTTGTACAACGTGTCATGAGTTAAAAACAAAATTTATTCTGTACCCAAAAATCATCAACGTACCCTAATAAACATGTTGATTTTTGATAAGTAATGAAATAAATTATCAGCTTTTTTCATTATTTTAAAACGTTAAGCAAGTTCTATAAAAGAGCTTAGTGATGTGTTACATATAAATAAATATATATAC      ]
[-] EMBL CD144999             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                     GTAAATATGGCTATCAAAACAATCCAAATGAACGTATCAGTTTCGAATCATTTGTTCCAATTTATCATGGTTTGTTAAAAGAACAAGTGGAAGTAGATCAAGAAACATTTATTGAATCATTTCGTGTATTTGATAAAGA GGATAATGGATTAATTAGTGCAGCTGAATTAAGACATTTACTAACAGCATTAGGTGAAAAACTACGTGATAATGAAGTGGATGTATTATTATCTGGTTTAGAAAATAGTCAAGGTCTTGTACCATATGAAGCTTTTGTACAACGTGTCATGAGTTAAAAACAAAATTTATTCTGTACCCAAAAATCATCAACGTACCCTAATAAACATGTTGATTTTTGATAAGTAATGAAATAAATTATCAGCTTTTTTCATTATTTTAAAACGTTAAGCAAGTTCTATAAAAGAGCTTAGTGATGTGTTACATATACATAA                ]
[-] EMBL CD114845             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                     GTAAATATGGCTATC AAACAATCCAAATGAACGTATCAGTTTCGAATCATTTGTTCCAATTTATCATGGTTTGTTAAAAGAACAAGTGGAAGTAGATCAAGAAACATTTATTGAATCATTTCGTGTATTTGATAAAGA GGATAATGGATTAATTAGTGCAGCTGAATTAAGACATTTACTAACAGCATTAGGTGAAAAACTACGTGATAATGAAGTGGATGTATTATTATCTGGTTTAGAAAATAGTCAAGGTCTTGTACCATATGAAGCTTTTGTACAACGTGTCATGAGTTAAAAACAAAATTTATTCTGTACCCAAAAATCATCAACGTACCCTAATAAACATGTTGATTTTTGATAAGTAATGAAATAAATTATCAGCTTTTTTCATTATTTTAAAACGTTAAGCAAGTTCTATAAAAGAGCTTAGTGATGTGTTACATATACATAA                ]
[-] EMBL CD145098             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       TGAT AAGANGGATAATGGATTAATTAGTGCAGCCGAATTAAGACATTTACTAACAGCATTAGGTGAANAACTACGTGATAATGAAGTGGATGTATTATTATCTGGTTTAGAAAATAGTCAAGGTCTTGTACCATATGAAGCTTTTGTACAACGTGTCATGAGTTAAAAACAAAATTTATTCTGTACCCAAAAATCATCAACGTACCCTAATAAACATGTTGATTTTTGATAAGTAATGAAATAAATTATCAGCTTTTTTCATTATTTTAAAACGTTAAGCAAGTTCTATAAAAGAGCTTAGTGATGTGTTACATATACATAA                ]




>consensus_10716#0
AGAATTTCGGCACGAGGCCGCCAAACTCGAGTAGTCTTACAAATTCCGAAGTCTGTCTCA
TCATACAGTTTTTCAAATCATTTGGGGATTGGCTATATATGCAGTTACTGACCCGTTCAT
CTACAAAGTAATTTCACTGCATTGAAAATGGTTGACTTAAGTGAAAAGGATCTTAACGAT
GTCCACGAAATGTTCCTACTATTTGACACGAAAGGAGATGAGAAAATCGAGGCGAAAGAT
ATCGGTGAAGTTGTGCGTGCAATGGGTCTAAATCCAACAGAGTCGGACATTGGTAAATAT
GGCTATCAAAACAATCCAAATGAACGTATCAGTTTCGAATCATTTGTTCCAATTTATCAT
GGTTTGTTAAAAGAACAAGTGGAAGTAGATCAAGAAACATTTATTGAATCATTTCGTGTA
TTTGATAAAGAGGATAATGGATTAATTAGTGCAGCTGAATTAAGACATTTACTAACAGCA
TTAGGTGAAAAACTACGTGATAATGAAGTGGATGTATTATTATCTGGTTTAGAAAATAGT
CAAGGTCTTGTACCATATGAAGCTTTTGTACAACGTGTCATGAGTTAAAAACAAAATTTA
TTCTGTACCCAAAAATCATCAACGTACCCTAATAAACATGTTGATTTTTGATAAGTAATG
AAATAAATTATCAGCTTTTTTCATTATTTTAAAACGTTAAGCAAGTTCTATAAAAGAGCT
TAGTGATGTGTTACATATACATAAATATATATACTCTNGT

consensusID : consensus_10716#1
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 11
consensus length = 729
fasta sequence

                              [CTCACCGCCAAACTCGAGTAGTCTTACAAATTCCGAAGTTTTTCAAATCATTTGGGGATTGGCTATATTCAGTTACTGACCCGTTCATCTACAAAGTAATTTCACTGCATTGAAAATGGTTGACTTAAGTGAAAAGGATCTTAACGATGTCCACGAAATGTTCCTACTATTTGACACGAAAGGAGATGAGAAAATCGAGGCGAAAGATATCGGTGAAGTTGTGCGTGCAATGGGTCTAAATCCAACAGAGTCGGACATTGGTAAATATGGCTATCAAAACAATCCAAATGAACGTATCAGTTTCGAATCATTTGTTCCAA-TTTATCATGGTTTGTTAAAAGAACAAGTGGAAGTAGATCAAGAAACATTTATTGAATCATTTCGTGTATTTGATAAAGAGGATAATGGATTAATTAGTGCAGCTGAATTAAGACATTTACTAACAGCATTAGGTGAAAAACTACGT-GATAATGAAGTGGATGTATTATTATCTGG-TTTAGAAAATAGTCAAGGTCTTGTACCATATGAAGCTTTTGTACAACGTGTCATGAGTTAAAAACAAAATTTATTCTGTACCCAAAAATCATCAACGTACCCTAATAAANCATGTTGATTTTTGATAAGTAATGAAATAAATTATCAGCTTTTTTCATTATTTTAAAACGTTAAGCAAGTTCTATAAAAGAAGCTTAGTGATGTGTTACATATACATAAATATATATACTCTGT]

[+] EMBL CD080147             [CTCACCGCCAAACTCGAGTAGTCTTACAAATTCCGAAGTTTTTCAAATCATTTGGGGATTGGCTATATTCAGTTACTGACCCGTTCATCTACAAAGTAATTTCACTGCATTGAAAATGGTTGACTTAAGTGAAAAGGATCTTAACGATGTCCACGAAATGTTCCTACTATTTGACACGAAAGGAGATGAGAAAATCGAGGCGAAAGATATCGGTGAAGTTGTGCGTGCAATGGGTCTAAATCCAACAGAGTCGGACATTGGTAAATATGGCTATCAAAACAATCCAAATGAACGTATCAGTTTCGAATCATTTGTTCCAA TTTATCATGGTTTGTTAAAAGAACAAGTGGAAGTAGATCAAGAAACATTTATTGAATCATTTCGTGTATTTGATAAAGAGGATAATGGATTAATTAGTGCAGCTGAATTAAGACATTTACTAACAGCATTAGGTGAAAAACTACGT GATAATGAAGTGGATGTATTATTATCTGG TTTAGAAAATAGTCAAGGTCTTGTACCATATGAAGCTTTTGTACAACGTGTCATGAGTTAAAAACAAAATTTATTCTGTACCCAAAAATCATCAACGTACCCTAATAAANCATGTTGATTTTTGATAAGTAATGAAATAAATTATCAGCTTTTTTCATTATTTTAAAACGTTAAGCAAGTTCTATAAAAGAAGCTTAGTGATGTGTTACATATACATAAATATATATACTCTGT]
[+] EMBL CD137127             [   ACCGCCAAACTCGAGTAGTCTTACAAATTCCGAAGTTTTTCAAATCATTTGGGGATTGGCTATATTCAGTTACTGACCCGTTCATCTACAAAGTAATTTCACTGCATTGAAAATGGTTGACTTAAGTGAAAAGGATCTTAACGATGTCCACGAAATGTTCCTACTATTTGACACGAAAGGAGATGAGAAAATCGAGGCGAAAGATATCGGTGAAGTTGTGCGTGCAATGGGTCTAAATCCAACAGAGTCGGACATTGGTAAATATGGCTATCAAAACAATCCAAATGAACGTATCAGTTTCGAATCATTCGTTCCAA TTTATCATGGTTTGTTAAAAGAACAAGTGGAAGTAGATCAAGAAACATTTATTGAATCATTTCGTGTATTTGATAAAGAGGATAATGGATTAATTAGTGCAGCTGAATTAAGACATTTACTAACAGCATTAGGTGAAAAACTACGT GATAATGAAGTGGATGTATTATTATCTGG TTT                                                                                                                                                                                                                                       ]
[+] EMBL CD077673             [                          CAAATTCCGAAGTTTTTCAAATCATTTGGGGATTGGCTATATTCAGTTACTGACCCGTTCATCTACAAAGTAATTTCACTGCATTGAAAATGGTTGACTTAAGTGAAAAGGATCTTAACGATGTCCACGAAATGTTCCTACTATTTGACACGAAAGGAGATGAGAAAATCGAGGCGAAAGATATCGGTGAAGTTGTGCGTGCAATGGGTCTAAATCCAACAGAGTCGGACATTGGTAAATATGGCTATCAAAACAATCCANATGAACGTATCAGTTTCGAATCATTTG TCCAANNTTATCATGGn                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                ]
[+] EMBL CD137016             [                               ctaGAGGTTTTTCAAATCATTTGGGGATTGGCTATATTCAGTTACTGACCCGTTCATCTACAAAGTAATTTCACTGCATTGAAAATGGTTGACTTAAGTGAAAAGGATCTTAACGATGTCCACGAAATGTTCCTACTATTTAACACGAAAGGAGATGAGAAAATCGAGGCGAAAGATATCGGTGAAGTTGTGCGTGCAATGGGTCTAAATCTAACAGAGTCGGACATTGGTAAATATGGCTATCAAAACAATCCAAATGAACGTATCAGTTTCGAATCATTTGTTCCAA TTTATCATGGTTTGTTAAGAGAACAAGTGGAAGTAGATCAAGAAACATTTATTGAATCATTTCGTGTATTTGATAAAGAGGATAATGGATTAATTAGTGCAGCTGAATTAAGACATTTACTAACAGCATTAGGTGAAAAACTACGT GATAATGAAGTGGATGTATTATTATCTGG TTTAGAAAATAGTCAAGG                                                                                                                                                                                                                        ]
[+] EMBL AI977147             [                                                    TGGGGATTGGCTATATTCAGTTACTGACCCGTTCATCTACAAAGTAATTTCACTGCATTGAAAATGGTTGACTTAAGTGAAAAGGATCTTAACGATGTCCACGAAATGTTCCTACTATTTGACACGAAAGGAGATGAGAAAATCGAGGCGAAAGATATCGGTGAAGTTGTGCGTGCAATGGGTCTAAATCCAACAGAGTCGGACATTGGTAAATATGGCTATCAAAACAATCCAAATGAACGTATCAGTTTCGAATCATTTGTTCCAA TTTATCATGGTTTGTTAAAAGAACAAGTGGAAGTAGATCAAGAAACATTTATTGAATCATTTCGTGTATTTGATAAAGAGGATAATGGATTAATTAGTGCAGCTGAATTAAGACATTTACTAACAGCATTAGGTGAAAAACTACGT GATAATGAAGTGGATGTATTATTATCTGG TTTAGAAAATAGTCAAGGTCTTGTACCATATGAAGCTTTTGTACAACGTGTCATGAGTTAAAAACAAAATTTA                                                                                                                                                                 ]
[+] EMBL AW017429             [                                                    TGGGGATTGGCTATATTCAGTTACTGACCCGTTCATCTACAAAGTAATTTCACTGCATTGAAAATGGTTGACTTAAGTGAAAAGGATCTTAACGATGTCCACGAAATGTTCCTACTATTTGACACGAAAGGAGATGAGAAAATCGAGGCGAAAGATATCGGTGAAGTTGTGCGTGCAATGGGTCTAAATCCAACAGAGTCGGACATTGGTAAATATGGCTATCAAAACAATCCAAATGAACGTATCAGTTTCGAATCATTTGTTCCAA TTTATCATGGTTTGTTAAAAGAACAAGTGGAAGTAGATCAAGAAACATTTATTGAATCATTTCGTGTATTTGATAAAGAGGATAATGGATTAATTAGTGCAGCTGAATTAAGACATTTACTAACAGCAT                                                                                                                                                                                                                                                                                          ]
[+] EMBL SMEMLC               [                                                                                                                            TTAAGTGAAAAGGATCTTAACGATGTCCACGAAATGTTCCTACTATTTGACACGAAAGGAGATGAGAAAATCGAGGCGAAAGATATCGGTGAAGTTGTGCGTGCAATGGGTCTAAATCCAACAGAGTCGGACATTGGTAAATATGGCTATCAAAACAATCCAAATGAACGTATCAGTTTCGAATCATTTGTTCCAA TTTATCATGGTTTGTTAAAAGAACAAGTGGAAGTAGATCAAGAAACATTTATTGAATCATTTCGTGTATTTGATAAAGAGGATAATGGATTAATTAGTGCAGCTGAATTAAGACATTTACTAACAGCATTAGGTGAAAAACTACGT GATAATGAAGTGGATGTATTATTATCTGG TTTAGAAAATAGTCAAGGTCTTGTACCATATGAAGCTTTTGTACAACGTGT                                                                                                                                                                                       ]
[+] EMBL CD169951             [                                                                                                                                         ATCTTAACGATGTCCACGAAATGTTCCTACTATTTGACACGAAAGGAGATGAGAAAATCGAGGCGAAAGATATCGGTGAAGTTGTGCGTGCAATGGGTCTAAATCCAACAGAGTCGGACATTGGTAAATATGGCTATCAAAACAATCCAAATGAACGTATCAGTTTCGAATCATTTGTTCCAA TTTATCATGGTTTGTTAAAAGAACAAGTGGAAGTAGATCAAGAAACATTTATTGAATCATTTCGTGTATTTGATAAAGAGGATAATGGATTAATTAGTGCAGCTGAATTAAGACATTTACTAACAGCATTAGGTGAAAAACTACGTNGAT ATGAAGTGGATGTATTATTATCTGGNTTTAG AAATAGTCAAGG                                                                                                                                                                                                                        ]
[+] EMBL CD191808             [                                                                                                                                                                                       AGATGAGAAAATCGAGGCGAAAGATATCGGTGAAGTTGTGCGTGCAATGGGTCTAAATCCAACAGAGTCGGACATTGGTAAATATGGCTATCAAAACAATCCAAATGAACGTATCAGTTTCGAATCATTTGTTCCAA TTTATCATGGTTTGTTAAAAGAACAAGTGGAAGTAGATCAAGAAACATTTATTGAATCATTTCGTGTATTTGATAAAGAGGATAATGGATTAATTAGTGCAGCTGAATTAAGACATTTACTAACAGCATTAGGTGAAAAACTACGT GATAATGAAGTGGATGTATTATTATCTGG TTTAGAAAATAGTCAAGGTCTTGTACCATATGAA                                                                                                                                                                                                        ]
[+] EMBL CD135929             [                                                                                                                                                                                       AGATGAGAAAATCGAGGCGAAAGATATCGGTGAAGTTGTGCGTGCAATGGGTCTAAATCCAACAGAGTCGGACATTGGTAAATATGGCTATCAAAACAATCCAAATGAACGTATCAGTTTCGAATCATTTGTTCCAA TTTATCATGGTTTGTTAAAAGAACAAGTGGAAGTAGATCAAGAAACATTTATTGAATCATTTCGTGTATTTGATAAAGAGGATAATGGATTAATTAGTGCAGCTGAATTAAGACATTTACTAACAGCATTAGGTGAAAAACTAC                                                                                                                                                                                                                                                                           ]
[-] EMBL CD134742             [                                                                                                                                                                                        GATGAGAAAATCGAGGCGAAAGATATCGGTGAAGTTGTGCGTGCAATGGGTCTAAATCCAACAGAGTCGGACATTGGTAAATATGGCTATCAAAACAATCCAAATGAACGTATCAGTTTCGAATCATTTGTTCCAA TTTATCATGGTTTGTTAAAAGAACAAGTGGAAGTAGATCAAGAAACATTTATTGAATCATTTCGTGTATTTGATAAAGAGGATAATGGATTAATTAGTGCAGCTGAATTAAGACATTTACTAACAGCATTAGGTGAAAAACTACGT GATAATGAAGTGGATGTATTATTATCTGG TTTAGAAAATAGTCAAGGTCTTGTACCATATGAAG                                                                                                                                                                                                       ]




>consensus_10716#1
CTCACCGCCAAACTCGAGTAGTCTTACAAATTCCGAAGTTTTTCAAATCATTTGGGGATT
GGCTATATTCAGTTACTGACCCGTTCATCTACAAAGTAATTTCACTGCATTGAAAATGGT
TGACTTAAGTGAAAAGGATCTTAACGATGTCCACGAAATGTTCCTACTATTTGACACGAA
AGGAGATGAGAAAATCGAGGCGAAAGATATCGGTGAAGTTGTGCGTGCAATGGGTCTAAA
TCCAACAGAGTCGGACATTGGTAAATATGGCTATCAAAACAATCCAAATGAACGTATCAG
TTTCGAATCATTTGTTCCAATTTATCATGGTTTGTTAAAAGAACAAGTGGAAGTAGATCA
AGAAACATTTATTGAATCATTTCGTGTATTTGATAAAGAGGATAATGGATTAATTAGTGC
AGCTGAATTAAGACATTTACTAACAGCATTAGGTGAAAAACTACGTGATAATGAAGTGGA
TGTATTATTATCTGGTTTAGAAAATAGTCAAGGTCTTGTACCATATGAAGCTTTTGTACA
ACGTGTCATGAGTTAAAAACAAAATTTATTCTGTACCCAAAAATCATCAACGTACCCTAA
TAAANCATGTTGATTTTTGATAAGTAATGAAATAAATTATCAGCTTTTTTCATTATTTTA
AAACGTTAAGCAAGTTCTATAAAAGAAGCTTAGTGATGTGTTACATATACATAAATATAT
ATACTCTGT

consensusID : consensus_10716#2
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 1
consensus length = 720
fasta sequence

                              [TCCAGGCCAANAATTCGGCACGAGGCACATTCCGAAGTTTTTCAAATCATTTGGGGATTGGCTATATTCAGTTACTGACCCGTTCATCTACAAAGTAATTTCACTGCATTGAAAATGGTTGACTTAAGTGAAAAGGATCTTAACGATGTCCACGAAATGTTCCTACTATTTGACACGAAAGGAGATGAGAAAATCGAGGCGAAAGATATCGGTGAAGTTGTGCGTGCAATGGGTCTAAATCCAACAGAGTCGGACATTGGTAAATATGGCTATCAAAACAATCCAAATGAACGTATCAGTTTCGAATCATTTGTTCCAATTTATCATGGTTTGTTAAAAGAACAAGTGGAAGTAGATCAAGAAACATTTATTGAATCATTTCGTGTATTTGATAAAGAGGATAATGGATTAATTAGTGCAGCTGAATTAAGACATTTACTAACAGCATTAGGTGAAAAACTACGTGATAATGAAGTGGATGTATTATTATCTGGTTTAGAAAATAGTCAAGGTCTTGTACCATATGAAGCTTTTGTACAACGTGTCATGAGTTAAAAACAAAATTTATTCTGTACCCAAAAATCATCAACGTACCCTAATAAACATGTTGATTTTTGATAAGTAATGAAATAAATTATCAGCTTTTTTCATTATTTTAAAACGTTAAGCAAGTTCTATAAAAGAGCTTAGTGATGTGTTACATATACANTAATATATATA]

[+] EMBL CD079495             [TCCAGGCCAANAATTCGGCACGAGGCACATTCCGAAGTTTTTCAAATCATTTGGGGATTGGCTATATTCAGTTACTGACCCGTTCATCTACAAAGTAATTTCACTGCATTGAAAATGGTTGACTTAAGTGAAAAGGATCTTAACGATGTCCACGAAATGTTCCTACTATTTGACACGAAAGGAGATGAGAAAATCGAGGCGAAAGATATCGGTGAAGTTGTGCGTGCAATGGGTCTAAATCCAACAGAGTCGGACATTGGTAAATATGGCTATCAAAACAATCCAAATGAACGTATCAGTTTCGAATCATTTGTTCCAATTTATCATGGTTTGTTAAAAGAACAAGTGGAAGTAGATCAAGAAACATTTATTGAATCATTTCGTGTATTTGATAAAGAGGATAATGGATTAATTAGTGCAGCTGAATTAAGACATTTACTAACAGCATTAGGTGAAAAACTACGTGATAATGAAGTGGATGTATTATTATCTGGTTTAGAAAATAGTCAAGGTCTTGTACCATATGAAGCTTTTGTACAACGTGTCATGAGTTAAAAACAAAATTTATTCTGTACCCAAAAATCATCAACGTACCCTAATAAACATGTTGATTTTTGATAAGTAATGAAATAAATTATCAGCTTTTTTCATTATTTTAAAACGTTAAGCAAGTTCTATAAAAGAGCTTAGTGATGTGTTACATATACANTAATATATATA]




>consensus_10716#2
TCCAGGCCAANAATTCGGCACGAGGCACATTCCGAAGTTTTTCAAATCATTTGGGGATTG
GCTATATTCAGTTACTGACCCGTTCATCTACAAAGTAATTTCACTGCATTGAAAATGGTT
GACTTAAGTGAAAAGGATCTTAACGATGTCCACGAAATGTTCCTACTATTTGACACGAAA
GGAGATGAGAAAATCGAGGCGAAAGATATCGGTGAAGTTGTGCGTGCAATGGGTCTAAAT
CCAACAGAGTCGGACATTGGTAAATATGGCTATCAAAACAATCCAAATGAACGTATCAGT
TTCGAATCATTTGTTCCAATTTATCATGGTTTGTTAAAAGAACAAGTGGAAGTAGATCAA
GAAACATTTATTGAATCATTTCGTGTATTTGATAAAGAGGATAATGGATTAATTAGTGCA
GCTGAATTAAGACATTTACTAACAGCATTAGGTGAAAAACTACGTGATAATGAAGTGGAT
GTATTATTATCTGGTTTAGAAAATAGTCAAGGTCTTGTACCATATGAAGCTTTTGTACAA
CGTGTCATGAGTTAAAAACAAAATTTATTCTGTACCCAAAAATCATCAACGTACCCTAAT
AAACATGTTGATTTTTGATAAGTAATGAAATAAATTATCAGCTTTTTTCATTATTTTAAA
ACGTTAAGCAAGTTCTATAAAAGAGCTTAGTGATGTGTTACATATACANTAATATATATA

consensus multiple alignement with clustalw

CLUSTAL W (1.82) multiple sequence alignment


consensus_10716#0      AGAATTTCGGCACGAGGCCGCCAAACTCGAGTAGTCTTACAAATTCCGAAGTCTGTCTCA 60
consensus_10716#1      -------------CTCACCGCCAAACTCGAGTAGTCTTACAAATTCCGAAGT-------- 39
consensus_10716#2      -----------TCCAGGCCAANAATTCGGCACGAG---GCACATTCCGAAGT-------- 38
                                        **   **    *          ** **********        

consensus_10716#0      TCATACAGTTTTTCAAATCATTTGGGGATTGGCTATATATGCAGTTACTGACCCGTTCAT 120
consensus_10716#1      ---------TTTTCAAATCATTTGGGGATTGGCTATAT--TCAGTTACTGACCCGTTCAT 88
consensus_10716#2      ---------TTTTCAAATCATTTGGGGATTGGCTATAT--TCAGTTACTGACCCGTTCAT 87
                                *****************************   *******************

consensus_10716#0      CTACAAAGTAATTTCACTGCATTGAAAATGGTTGACTTAAGTGAAAAGGATCTTAACGAT 180
consensus_10716#1      CTACAAAGTAATTTCACTGCATTGAAAATGGTTGACTTAAGTGAAAAGGATCTTAACGAT 148
consensus_10716#2      CTACAAAGTAATTTCACTGCATTGAAAATGGTTGACTTAAGTGAAAAGGATCTTAACGAT 147
                       ************************************************************

consensus_10716#0      GTCCACGAAATGTTCCTACTATTTGACACGAAAGGAGATGAGAAAATCGAGGCGAAAGAT 240
consensus_10716#1      GTCCACGAAATGTTCCTACTATTTGACACGAAAGGAGATGAGAAAATCGAGGCGAAAGAT 208
consensus_10716#2      GTCCACGAAATGTTCCTACTATTTGACACGAAAGGAGATGAGAAAATCGAGGCGAAAGAT 207
                       ************************************************************

consensus_10716#0      ATCGGTGAAGTTGTGCGTGCAATGGGTCTAAATCCAACAGAGTCGGACATTGGTAAATAT 300
consensus_10716#1      ATCGGTGAAGTTGTGCGTGCAATGGGTCTAAATCCAACAGAGTCGGACATTGGTAAATAT 268
consensus_10716#2      ATCGGTGAAGTTGTGCGTGCAATGGGTCTAAATCCAACAGAGTCGGACATTGGTAAATAT 267
                       ************************************************************

consensus_10716#0      GGCTATCAAAACAATCCAAATGAACGTATCAGTTTCGAATCATTTGTTCCAATTTATCAT 360
consensus_10716#1      GGCTATCAAAACAATCCAAATGAACGTATCAGTTTCGAATCATTTGTTCCAATTTATCAT 328
consensus_10716#2      GGCTATCAAAACAATCCAAATGAACGTATCAGTTTCGAATCATTTGTTCCAATTTATCAT 327
                       ************************************************************

consensus_10716#0      GGTTTGTTAAAAGAACAAGTGGAAGTAGATCAAGAAACATTTATTGAATCATTTCGTGTA 420
consensus_10716#1      GGTTTGTTAAAAGAACAAGTGGAAGTAGATCAAGAAACATTTATTGAATCATTTCGTGTA 388
consensus_10716#2      GGTTTGTTAAAAGAACAAGTGGAAGTAGATCAAGAAACATTTATTGAATCATTTCGTGTA 387
                       ************************************************************

consensus_10716#0      TTTGATAAAGAGGATAATGGATTAATTAGTGCAGCTGAATTAAGACATTTACTAACAGCA 480
consensus_10716#1      TTTGATAAAGAGGATAATGGATTAATTAGTGCAGCTGAATTAAGACATTTACTAACAGCA 448
consensus_10716#2      TTTGATAAAGAGGATAATGGATTAATTAGTGCAGCTGAATTAAGACATTTACTAACAGCA 447
                       ************************************************************

consensus_10716#0      TTAGGTGAAAAACTACGTGATAATGAAGTGGATGTATTATTATCTGGTTTAGAAAATAGT 540
consensus_10716#1      TTAGGTGAAAAACTACGTGATAATGAAGTGGATGTATTATTATCTGGTTTAGAAAATAGT 508
consensus_10716#2      TTAGGTGAAAAACTACGTGATAATGAAGTGGATGTATTATTATCTGGTTTAGAAAATAGT 507
                       ************************************************************

consensus_10716#0      CAAGGTCTTGTACCATATGAAGCTTTTGTACAACGTGTCATGAGTTAAAAACAAAATTTA 600
consensus_10716#1      CAAGGTCTTGTACCATATGAAGCTTTTGTACAACGTGTCATGAGTTAAAAACAAAATTTA 568
consensus_10716#2      CAAGGTCTTGTACCATATGAAGCTTTTGTACAACGTGTCATGAGTTAAAAACAAAATTTA 567
                       ************************************************************

consensus_10716#0      TTCTGTACCCAAAAATCATCAACGTACCCTAATAAAC-ATGTTGATTTTTGATAAGTAAT 659
consensus_10716#1      TTCTGTACCCAAAAATCATCAACGTACCCTAATAAANCATGTTGATTTTTGATAAGTAAT 628
consensus_10716#2      TTCTGTACCCAAAAATCATCAACGTACCCTAATAAAC-ATGTTGATTTTTGATAAGTAAT 626
                       ************************************  **********************

consensus_10716#0      GAAATAAATTATCAGCTTTTTTCATTATTTTAAAACGTTAAGCAAGTTCTATAAAAGA-G 718
consensus_10716#1      GAAATAAATTATCAGCTTTTTTCATTATTTTAAAACGTTAAGCAAGTTCTATAAAAGAAG 688
consensus_10716#2      GAAATAAATTATCAGCTTTTTTCATTATTTTAAAACGTTAAGCAAGTTCTATAAAAGA-G 685
                       ********************************************************** *

consensus_10716#0      CTTAGTGATGTGTTACATATACATAAATATATATACTCTNGT 760
consensus_10716#1      CTTAGTGATGTGTTACATATACATAAATATATATACTCTGT- 729
consensus_10716#2      CTTAGTGATGTGTTACATATACANTAATATATATA------- 720
                       ***********************  **********