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Schistosoma mansoni
cluster # 10717 cluster # 10717       Sequences # 20       consensus # 3


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_10717#0 length = 826 sequences # 18  
consensus_10717#1 length = 577 sequences # 1  
consensus_10717#2 length = 565 sequences # 1  

consensusID : consensus_10717#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 18
consensus length = 826
fasta sequence
                              [GAAATTAATGAAGAGAAATTTGGTCTTTCATCACCTGTCACTGTGCCAACGTGTACTGTTAATGATAATAAGAAATACTCAGTATCTTCACTATCCAATTTAAATACAAATCCTTCAAATTGTTGTGTAAATAATTCAGATAACTTCAAATTTTCTACTCCTACTTCATCATCTCCTTCTTCACAACATTTATTGCATTATTCTTCATCACCTAATTTTCCGCCTTGTCAACGGCCATCATCAATATTGTTATCTAATAAATCTGCACATAATCACAATCGTACAACTTCCGTTTACATTGACTGTCCAAATACATCATATTATGATGTAATTACA-TTCGGTCGAACTTATGAACAGTATATTGCTAAAGCACGAGCAATGGTAGCTTTATCTCCAAAAGATTTAGATGAAATATTTAGTCCATTACGAGAATTACCATTTATTAATCGTGAAAATCAATTATCCCATACTTCACTTCATTATCACAATCAAGATGATATATTATCTACTAATGTTATCAATGTAAAAACAACTCATTGTTCAACTATTCCATTAATATTAAACACAAATGTTAATTCAATGAAACAATTATCTGATACCAATTCGACAACGATGGTGAAGAATCGAAATTGCTTAGGTTCTGAATTAAAATTATCTTTAACTAATCTTACATCTTCTGTAGAAGAAAATAATGGTAATGATAAAAGTAATGATTATTGCTCTTCGTCTGGTGCTAGTTCTCCACGACATTTAGTTAGTTGTATCGCTGTAACACATAATCGGAATGGACTGAATAGTAATTTAGTAACAAAAAATATAACTGTTT]

[+] EMBL CD147204             [GAAATTAATGAAGAGAAATTTGGTCTTTCATCACCTGTCACTGTGCCAACGTGTACTGTTAATGATAATAAGAAATACTCAGTATCTTCACTATCCAATTTAAATACAAATCCTTCAAATTGTTGTGTAAATAATTCAGATAACTTCAAATTTTCTACTCCTACTTCATCACCTCCTTCTTCACAACATTTATTGCATTATTCTTCATCACCTAATTTTCCGCCTTGTCAACGGCCATCATCAATATTGTTATCTAATAAATCTGCACATAATCACAATCGTACAACTTCCGTTTACATTGACTGTCCAAATACATCATATTATGATGTAATTGCA TTCGGTCGAACTTATGAACAGTATATTGCTAAAGCACGAGCAATGGTAGCTTTATCTCCAAAAGATTTAGATGAAATATTTAGTCCATTACGAGAATTACCATTTATTAATCGTGAAAATCAATTATCCCATACTTCACTTCATTATCACAATCAAGATGATATATTATCTACTAATGTTATCAATGTAAAAACAACTCATTGTTCAACTATTCCATTAATATTAAACACANATGTTAATTCAATGAAACAATTATCTGATACCAATTCGACAACGATGGTGAAGAATCGAAATT                                                                                                                                                                                                   ]
[+] EMBL CD147189             [GAAATTAATGAAGAGAAATTTGGTCTTTCATCACCTGTCACTGTGCCAACGTGTACTGTTAATGATAATAAGAAATACTCAGTATCTTCACTATCCAATTTAAATACAAATCCTTCAAATTGTTGTGTAAATAATTCAGATAACTTCAAATTTTCTACTCCTACTTCATCATCTCCTTCTTCACAACATTTATTGCATTATTCTTCATCACCTAATTTTCCGCCTTGTCAACGGCCATCATCAATATTGTTATCTAATAAATCTGCACATAATCACAATCGTACAACTTCCGTTTACATTGACTGTCCAAATACATCATATTATGATGTAATTGCA TTCGGTCGAACTTATGAACAGTATATTGCTAAAGCACGAGCAATGGTAGCTTTATCTCCAAAAGATTTAGATGAAATATTTAGTCCATTACGAGAATTACCATTTATTAATCGTGAAAATCAATTATCCCATACTTCAC                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               ]
[+] EMBL CD096446             [GAAATTAATGAAGAGAAATTTGGTCTTTCATCACCTGTCACTGTGCCAACGTGTACTGTTAATGATAATAAGAAGTACTCAGTATCTTCACTATCCAATTTAAATACAAATCCTTCAAATTGTTGTGTAAATAATTCAGATAACTTCAAATTTTCTACTCCTACTTCATCATCTCCTTCTTCACAACATTTATTGCATTATTCTTCATCACCTAATTTTCCGCCTTGTCAACGGCCATCATCAATATTGTTATCTAATAAATCTGCACATAATCACAATCGTACAACTTCCGTTTACATTGACTGTCCAAATACATCATATTATGATGTAATTGCA TTCGGTCGAACTTATGAACAGTATATTGCTAAAGCACGAGCAATGGTAGCTTTATCTCCAAAAGATTTAGATGAAATATTTAGTCCATTACGAGAATTACCATTTATTAATCGTGAAAATCAATTATCCCATACTTCACTTCATTATCACAATCAAGATGATATATTATCTACTAATGTTATCAATGTANAAACAACTCATTGTTCAACTATTCCATTAATATTANACACANATGTTAATTCAATGAAACAATTATCTG                                                                                                                                                                                                                                       ]
[+] EMBL CD147161             [GAAATTAATGAAGAGAAATTTGGTCTTTCATCACCTGTCACTGTGCCAACGTGTACTGTTAATGATAATAAGAAATACTCAGTATCTTCACTATCCAATTTAAATACAAATCCTTCAAATTGTTGTGTAAATAATTCAGATAACTTCAAATTTTCTACTCCTACTTCATCATCTCCTTCTTCACAACATTTATTGCATTATTCTTCATCACCTAATTTTCCGCCTTGTCAACGGCCATCATCAATGTTGTTATCTAATAAATCTGCACATAATCACAATCGTACAACCTCCGTTTACATTGACTGTCCAAATACATCATATTATGATGTAATTGCA TTCGGTCGAACTTATGAACAGTATATTGCTAAAGCACGAGCAATGGTAGCTTTATCTCCAAAAGATTTAGATGAAATATTTAGTCCATTACGAGAATTACCATTTATTAATCGTGAAAATCAATTATCCCATACTTCACTTCATTATCACAATCAAGATGATATATTATCTACTAATGTTATCAATGTAA                                                                                                                                                                                                                                                                                                            ]
[+] EMBL CD147222             [GAAATTAATGAAGAGAAATTTGGTCTTTCATCACCTGTCACTGTGCCAACGTGTACTGTTAATGATAATAAGAAATACTCAGTATCTTCACTATCCAATTTAAATACAAATCCTTCAAATTGTTGTGTAAATAATTCAGATAACTTCAAATTTTCTACTCCTACTTCATCATCTCCTTCTTCACAACATTTATTGCATTATTCTTCATCACCTAATTTTCCGCCTTGTCAACGGCCATCATCAATATTGTTATCTAATAAATCTGCACATAATCACAATCGTACAACTTCCGTTTACATTGACTGTCCAAATACATCATATTATGATGTAATTACA TTCGGTCGAACTTATGAACAGTATATTGCTAAAGCACGAGCAATGGTAGCTNTATCTCCAAAAGATTTAGATGANATATTTAGTCCATTACGAGAATTACCATTTATTAATCGTGAAAATCAATTATCCCATACTTCACTT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             ]
[-] EMBL CD096659             [                                                                                                                                                                                                                            CGCCTTGTCAACGGCCATCATCAATATGTTTATCTAATAAATCTGCACATAATCACAATCGTACAGCTTCCGTTTACATTGACTGTCCAAATACATCATATTATGATGTAATTGCA TTCGGTCGAACTTATGAACAGTATATTGCTAAAGCACGAGCAATGGTAGCTTTATCTCCAGAAGATTTAGATGAAATATTTAGTCCATTACGAGAATTACCATTTATTAATCGTGAAAATCAATTATCCCATACTTCACTTCATTATCACAATCAAGATGATATATTATCTACTAATGTTATCAATGTAAAAACAACTCATTGTTCAACTATTCCATTAATATTAAACACAAATGTTAATTCAATGAAACAATTATCTGATACCAATTCGACAACGATGGTGAAGAATCGAAATTGCTTAGGTTCTGAATTAAAATTATCTTTAACTAATCTTACATCTTCTGTAGAAGAAAATAATGGTAATGATAAAAGTAATGATTATTGCTCTTCGTCTGGTGCTAGTTCTCCACGACATTTAGTTAGTTGTATCGCTGTAACACATAATCGGAATGGACTGAATAGTAATTTAGTAACAAAAAATATAACTGTTT]
[-] EMBL CD143564             [                                                                                                                                                                                                                                                                         CACATAATCACATTCGTACAACTTCCGTTTATATTGACTGTCCANATACATCATATTATGATGTAATTACA TTCGGTCGAACTTATGAACAGTATATTGCTAAAGCACGAGCAATGGTAGCTTTATCTCCAAAAGATTTAGATGAAATATTTAGTCCATTACGAGAATTACCATTTATTAATCGTGAAAATCAATTATCCCATACTTCACTTCATTATCACAATCAAGATGATATATTATCTACTAATGTTATCAATGTAAAAACAACTCATTGTTCAACTATTCCATTAATATTAAACACAAATGTTAATTCAATGAAACAATTATCTGATACCAATTCGACAACGATGGTGAAGAATCGAAATTGCTTAGGTTCTGAATTAAAATTATCTTTAACTAATCTTACATCTTCTGTAGAAGAAAATAATGGTAATGATAAAAGTAATGATTATTGCTCTTCGTCTGGTGCTAGTTCTCCACGACATTTAGTTAGTTGTATCGCTGTAACACATAATCGGAATGGACTGAATAGTAATTTAGTAACAAAAAATATAACTGTTT]
[-] EMBL CD096309             [                                                                                                                                                                                                                                                                           CATAATCACAATCGTACAACTTCCGTTTACATTGACTGTCCAAATACATCATATTATGATGTAATTGCA TTCGGTCGAACTTATGAACAGTATATTGCTAAAGCACGAGCAATGGTAGCTTTATCTCCAAAAGATTTAGATGAAATATTTAGTCCATTACGAGAATTACCATTTATTAATCGTGAAAATCAATTATCCCATACTTCACTTCATTATCACAATCAAGATGATATATTATCTACTAATGTTATCAATGTAAAAACAACTCATTGTTCAACTATTCCATTAATATTAAACACAAATGTTAATTCAATGAAACAATTATCTGATACCAATTCGACAACGATGGTGAAGAATCGAAATTGCTTAGGTTCTGAATTAAAATTATCTTTAACTAATCTTACATCTTCTGTAGAAGAAAATAATGGTAATGATAAAAGTAATGATTATTGCTCTTCGTCTGGTGCTAGTTCTCCACGACATTTAGTTAGTTGTATCGCTGTAACACATAATCGGAATGGACTGAATAGTAATTTAGTAACAAAAAATATAACTGTTT]
[-] EMBL CD143572             [                                                                                                                                                                                                                                                                           CATAATCACAATCGTACACTTTCCGTTTATATTGACTGTCCAAATACATCATATTATGATGTAATTACA TTCGGTCGAACTTATGAACAGTATATTGCTAAAGCACGAGCAATGGTAGCTTTATCTCCAAAAGATTTAGATGAAATATTTAGTCCATTACGAGAATTACCATTTATTAATCGTGAAAATCAATTATCCCATACTTCACTTCATTATCACAATCAAGATGATATATTATCTACTAATGTTATCAATGTAAAAACAACTCATTGTTCAACTATTCCATTAATATTAAACACAAATGTTAATTCAATGAAACAATTATCTGATACCAATTCGACAACGATGGTGAAGAATCGAAATTGCTTAGGTTCTGAATTAAAATTATCTTTAACTAATCTTACATCTTCTGTAGAAGAAAATAATGGTAATGATAAAAGTAATGATTATTGCTCTTCGTCTGGTGCTAGTTCTCCACGACATTTAGTTAGTTGTATCGCTGTAACACATAATCGGAATGGACTGAATAGTAATTTAGTAACAAAAAATATAACTGTTT]
[-] EMBL CD143576             [                                                                                                                                                                                                                                                                                TCACAATCGTACACTTTCCGTNTATATTGACTGTCCAAATACATCATATTATGATGTAATTACA TTCGGTCGAACTTATGAACAGTATATTGCTAAAGCACGAGCAATGGTAGCTTTATCTCCAAAAGATTTAGATGAAATATTTAGTCCATTACGAGAATTACCATTTATTAATCGTGAAAATCAATTATCCCATACTTCACTTCATTATCACAATCAAGATGATATATTATCTACTAATGTTATCAATGTAAAAACAACTCATTGTTCAACTATTCCATTAATATTAAACACAAATGTTAATTCAATGAAACAATTATCTGATACCAATTCGACAACGATGGTGAAGAATCGAAATTGCTTAGGTTCTGAATTAAAATTATCTTTAACTAATCTTACATCTTCTGTAGAAGAAAATAATGGTAATGATAAAAGTAATGATTATTGCTCTTCGTCTGGTGCTAGTTCTCCACGACATTTAGTTAGTTGTATCGCTGTAACACATAATCGGAATGGACTGAATAGTAATTTAGTAACAAAAAATATAACTGTTT]
[-] EMBL CD143525             [                                                                                                                                                                                                                                                                                             ctTTCCGTTTATATTGACTGTCCANATACATCATATTATGATGTAATTACA TTCGGTCGAACTTATGAACAGTATATTGCTAAAGCACGAGCAATGGTAGCTTTATCTCCAAAAGATTTAGATGAAATATTTAGTCCATTACGAGAATTACCATTTATTAATCGTGAAAATCAATTATCCCATACTTCACTTCATTATCACAATCAAGATGATATATTATCTACTAATGTTATCAATGTAAAAACAACTCATTGTTCAACTATTCCATTAATATTAAACACAAATGTTAATTCAATGAAACAATTATCTGATACCAATTCGACAACGATGGTGAAGAATCGAAATTGCTTAGGTTCTGAATTAAAATTATCTTTAACTAATCTTACATCTTCTGTAGAAGAGAATAATGGTAATGATAAAAGTAATGATTATTGCTCTTCGTCTGGTGCTAGTTCTCCACGACATTTAGTTAGTTGTATCGCTGTAACACATAATCGGAATGGACTGAATAGTAATTTAGTAACAAAAAATATAACTGTTT]
[-] EMBL CD143424             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                      TATATTGACTGTCCAAATACATCATATTATGATGTAATACCA TTCGGTCGAACTTATGAACAGTATATTGCTAAAGCACGAGCAATGGTAGCTTTATCTCCAAAAGATTTAGATGAAATATTTAGTCCATTACGAGAATTACCATTTATTAATCGTGAAAATCAATTATCCCATACTTCACTTCATTATCACAATCAAGATGATATATTATCTACTAATGTTATCAATGTAAAAACAACTCATTGTTCAACTATTCCATTAATATTAAACACAAATGTTAATTCAATGAAACAATTATCTGATACCAATTCGACAACGATGGTGAAGAATCGAAATTGCTTAGGTTCTGAATTAAAATTATCTTTAACTAATCTTACATCTTCTGTAGAAGAAAATAATGGTAATGATAAAAGTAATGATTATTGCTCTTCGTCTGGTGCTAGTTCTCCACGACATTTAGTTAGTTGTATCGCTGTAACACATAATCGGAATGGACTGAATAGTAATTTAGTAACAAAAAATATAACTGTTT]
[-] EMBL CD143535             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                     tatCATTGACTGTCCANATACATCATATTATGATGTAATTACA TTCGGTCGAACTTATGAACAGTATATTGCTAAAGCACGAGCAATGGTAGCTTTATCTCCAAAAGATTTAGATGAAATATTTAGTCCATTACGAGAATTACCATTTATTAATCGTGAAAATCAATTATCCCATACTTCACTTCATTATCACAATCAAGATGATATATTATCTACTAATGTTATCAATGTAAAAACAACTCATTGTTCAACTATTCCATTAATATTAAACACAAATGTTAATTCAATGAAACAATTATCTGATACCAATTCGACAACGATGGTGAAGAATCGATATTGCTTAGGTTCTGAATTAAAATTATCTTTAACTAATCTTACATCTTCTGTAGAAGAAAATAATGGTAATGATAAAAGTAATGATTATTGCTCTTCGTCTGGTGCTAGTTCTCCACGACATTTAGTTAGTTGTATCGCTGTAACACATAATCGGAATGGACTGAATAGTAATTTAGTAACAAAAAATATAACTGTTT]
[-] EMBL CD143539             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                       atATTGACTGTCCANATACATCATATTATGATGTAATTACA TTTGGTCGAACTTATGAACAGTATATTGCTAAAGCACGAGCAATGGTAGCTTTATCTCCAAAAGATTTAGATGAAATATTTAGTCCATTACGAGAATTACCATTTATTAATCGTGAAAATCAATTATCCCATACTTCACTTCATTATCACAATCAAGATGATATATTATCTACTAATGTTATCAATGTAAAAACAACTCATTGTTCAACTATTCCATTAATATTAAACACAAATGTTAATTCAATGAAACAATTATCTGATACCAATTCGACAACGATGGTGAAGAATCGAAATTGCTTAGGTTCTGAATTAAAATTATCTTTAACTAATCTTACATCTTCTGTAGAAGTAAATAATGGTAATGATAAAAGTAATGATTATTGCTCTTCGTCTGGTGCTAGTTCTCCACGACATTTAGTTAGTTGTATCGCTGTAACACATAATCGGAATGGACTGAATAGTAATTTAGTAACAAAAAATATAACTGTTT]
[-] EMBL CD143488             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                        atTTGACTGTCCANATACATCATATTATGATGTAATTACA TTCGGTCGAACTTATGAACAGTATATTGCTAAAGCACGAGCAATGGTAGCTTTATCTCCAAAAGATTTAGATGAAATATTTAGTCCATTACGAGAATTACCATTTATTAATCGTGAAAATCAATTATCCCATACTTCACTTCATTATCACAATCAAGATGATATATTATCTACTAATGTTATCAATGTAAAAACAACTCATTGTTCAACTATTCCATTAATATTAAACACAAATGTTAATTCAATGAAACAATTATCTGATACCAATTCGACAACGATGGTGAAGAATCGAAATTGCTTAGGTTCTGAATTAAAATTATCTTTAACTAATCTTACATCTTCTGTAGAAGAAAATAATGGTAATGATAAAAGTAATGATTATTGCTCTTCGTCTGGTGCTAGTTCTCCACGACATTTAGTTAGTTGTATCGCTGTAACACATAATCGGAATGGACTGAATAGTAATTTAGTAACAAAAAATATAACTGTTT]
[-] EMBL CD143422             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                               TGTCCANATACATCATATTATGATGTAATTACA TTCGGTCGAACTTATGAACAGTATATTGCTANAGCACGAGCAATGGTAGCTCTATCTCCAAAAGATTTAGATGAAATATTTAGTCCATTACGAGAATTACCATTTATTAATCGTGAAAATCAATTATCCCATACTTCACTTCATTATCACAATCAAGATGATATATTATCTACTAATGTTATCAATGTAAAAACAACTCATTGTTCAACTATTCCATTAATATTAAACACAAATGTTAATTCAATGAAACAATTATCTGATACCAATTCGACAACGATGGTGAAGAATCGAAATTGCTTAGGTTCTGAATTAAAATTATCTTTAACTAATCTTACATCTTCTGTAGAAGAAAATAATGGTAATGATAAAAGTAATGATTATTGCTCTTCGTCTGGTGCTAGTTCTCCACGACATTTAGTTAGTCGTATCGCTGTAACACATAATCGGAATGGACTGAATAGTAATTTAGTAACAAAAAATATAACTGTTT]
[-] EMBL CD143438             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               ATTGTGATGTAA TACATTTCGGTCGAACTTATGAACAGTATATTGCTANAGCACGAGCAATGGTAGCTTTATCTCCAAAAGATTTAGATGAAATATTTAGTCCATTACGAGAATTACCATTTATTAATCGTGAAAATCAATTATCCCATACTTCACTTCATTATCACAATCAAGATGATATATTATCTACTAATGTTATCAATGTAAAAACAACTCATTGTTCAACTATTCCATTAATACTAAACACAAATGTTAATTCAATGAAACAATTATCTGATACCAATTCGACAACGATGGTGAAGAATCGAAATTGCTTAGGTTCTGAATTAAAATTATCTTTAACTAATCTTACATCTTCTGTAGAAGAAAATAATGGTAATGATAAAAGTAATGATTATCGCTCTTCGTCTGGTGCTAGTTCTCCACGACATTTAGTTAGTTGTATCGCTGTAACACATAATCGGAATGGACTGAATAGTAATTTAGTAACAAAAAATATAACTGTTT]
[-] EMBL CD143471             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 AACAGTATATTGCTAAAGCACGAGCAATGGTAGC TTATCTCCAAAAGATTTAGATGAAATATTTAGTCCATTACGAGAATTACCATTTATTAATCGTGAAAATCAATTATCCCATACTTCACTTCATTATCACAATCAAGATGATATATTATCTACTAATGTTATCAATGTAAAAACAACTCATTGTTCAACTATTCCATTAATATTAAACACAAATGTTAATTCAATGAAACAATTATCTGATACCAATTCGACAACGATGGTGAAGAATCGAAATTGCTTAGGTTCTGAATTAAAATTATCTTTAACTAATCTTACATCTTCTGTAGAAGAAAATAATGGTAATGATAAAAGTAATGATTATTGCTCTTCGTCTGGTGCTAGTTCTCCACGACATTTAGTTAGTTGTATCGCTGTAACACATAATCGGAATGGACTGAATAGTAATTTAGTAACAAAAAATATAACTGTTT]


>consensus_10717#0 GAAATTAATGAAGAGAAATTTGGTCTTTCATCACCTGTCACTGTGCCAACGTGTACTGTT AATGATAATAAGAAATACTCAGTATCTTCACTATCCAATTTAAATACAAATCCTTCAAAT TGTTGTGTAAATAATTCAGATAACTTCAAATTTTCTACTCCTACTTCATCATCTCCTTCT TCACAACATTTATTGCATTATTCTTCATCACCTAATTTTCCGCCTTGTCAACGGCCATCA TCAATATTGTTATCTAATAAATCTGCACATAATCACAATCGTACAACTTCCGTTTACATT GACTGTCCAAATACATCATATTATGATGTAATTACATTCGGTCGAACTTATGAACAGTAT ATTGCTAAAGCACGAGCAATGGTAGCTTTATCTCCAAAAGATTTAGATGAAATATTTAGT CCATTACGAGAATTACCATTTATTAATCGTGAAAATCAATTATCCCATACTTCACTTCAT TATCACAATCAAGATGATATATTATCTACTAATGTTATCAATGTAAAAACAACTCATTGT TCAACTATTCCATTAATATTAAACACAAATGTTAATTCAATGAAACAATTATCTGATACC AATTCGACAACGATGGTGAAGAATCGAAATTGCTTAGGTTCTGAATTAAAATTATCTTTA ACTAATCTTACATCTTCTGTAGAAGAAAATAATGGTAATGATAAAAGTAATGATTATTGC TCTTCGTCTGGTGCTAGTTCTCCACGACATTTAGTTAGTTGTATCGCTGTAACACATAAT CGGAATGGACTGAATAGTAATTTAGTAACAAAAAATATAACTGTTT



consensusID : consensus_10717#1
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 1
consensus length = 577
fasta sequence
                              [TCATCACCTAATTTNCNGCCTTGTCANCGGCCATCATCAATATTGTTATCTAATAAATCTGCACATAATCACAATCGTACAACTTCCGTTTACATTGACTGTCCAAATACATCATATTATGATGTAATTGCATTCGGTCGAACTTATGAACAGTATATTGCTAAAGCACGAGCAATGGTAGCTTTATCTCCAAAAGATTTAGATGAAATATTTAGTCCATTACGAGAATTACCATTTATTAATCGTGAAAATCAATTATCCCATACTTCACTTCATTATCACAATCAAGATGATATATTATCTACTAATGTTATCAATGTAAAAACAACTCATTGTTCAACTATTCCATTAATATTAAACACAAATGTTAATTCAATGAAACAATTATCTGATACCAATTCGACAACGATGGTGAAGAATCGAAATTGCTTAGAAGAAAATAATGGTAATGATAAAAGTAATGATTATTGCTCTTCGTCTGGTGCTAGTTCTCCACGACATTTAGTTAGTTGTATCGCTGTAACACATAATCGGAATGGACTGAATAGTAATTTAGTAACAAAAAATATAACTGTTT]

[-] EMBL CD096334             [TCATCACCTAATTTNCNGCCTTGTCANCGGCCATCATCAATATTGTTATCTAATAAATCTGCACATAATCACAATCGTACAACTTCCGTTTACATTGACTGTCCAAATACATCATATTATGATGTAATTGCATTCGGTCGAACTTATGAACAGTATATTGCTAAAGCACGAGCAATGGTAGCTTTATCTCCAAAAGATTTAGATGAAATATTTAGTCCATTACGAGAATTACCATTTATTAATCGTGAAAATCAATTATCCCATACTTCACTTCATTATCACAATCAAGATGATATATTATCTACTAATGTTATCAATGTAAAAACAACTCATTGTTCAACTATTCCATTAATATTAAACACAAATGTTAATTCAATGAAACAATTATCTGATACCAATTCGACAACGATGGTGAAGAATCGAAATTGCTTAGAAGAAAATAATGGTAATGATAAAAGTAATGATTATTGCTCTTCGTCTGGTGCTAGTTCTCCACGACATTTAGTTAGTTGTATCGCTGTAACACATAATCGGAATGGACTGAATAGTAATTTAGTAACAAAAAATATAACTGTTT]


>consensus_10717#1 TCATCACCTAATTTNCNGCCTTGTCANCGGCCATCATCAATATTGTTATCTAATAAATCT GCACATAATCACAATCGTACAACTTCCGTTTACATTGACTGTCCAAATACATCATATTAT GATGTAATTGCATTCGGTCGAACTTATGAACAGTATATTGCTAAAGCACGAGCAATGGTA GCTTTATCTCCAAAAGATTTAGATGAAATATTTAGTCCATTACGAGAATTACCATTTATT AATCGTGAAAATCAATTATCCCATACTTCACTTCATTATCACAATCAAGATGATATATTA TCTACTAATGTTATCAATGTAAAAACAACTCATTGTTCAACTATTCCATTAATATTAAAC ACAAATGTTAATTCAATGAAACAATTATCTGATACCAATTCGACAACGATGGTGAAGAAT CGAAATTGCTTAGAAGAAAATAATGGTAATGATAAAAGTAATGATTATTGCTCTTCGTCT GGTGCTAGTTCTCCACGACATTTAGTTAGTTGTATCGCTGTAACACATAATCGGAATGGA CTGAATAGTAATTTAGTAACAAAAAATATAACTGTTT



consensusID : consensus_10717#2
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 1
consensus length = 565
fasta sequence
                              [GAAATTAATGAAGAGAAATTTGGTCTTTCATCACCTGTCACTGTGCCAACGTGTACTGTTAATGATAATAAGAAATACTCAGTATCTTCACTATCCAATTTAAATACAAATCCTTCAAATTGTTGTGTAAATAATTCAGTATATTGCTAAAGCACGAGCAATGGTAGCTTTATCTCCAAAAGATTTAGATGAAATATTTAGTCCATTACGAGAATTACCATTTATTAATCGTGTAAATCAATTATCCCATACTTCACTTCATTATCACAATCAAGATGATATATTATCTACTAATGTTATCAATGTAAAAACAACTCATTGTTCAACTATTCCATTAATATTAAACACAAATGTTAATTCAATGAAACAATTATCTGATACCAATTCGACAACGATGGTGAAGAATCGAAATTGCTTAGGTTCTGAATTAAAATTATCTTTAACTAATCTTACATCTTCTGTAGAAGAAAATAATGGTAATGATAAAAGTAATGATTATTGCTCTTCGTCTGGTGCTAGTTCTCCACGACATTTAGTTAGTTGTATCGCTGTAACACATAATCGG]

[+] EMBL CD147256             [GAAATTAATGAAGAGAAATTTGGTCTTTCATCACCTGTCACTGTGCCAACGTGTACTGTTAATGATAATAAGAAATACTCAGTATCTTCACTATCCAATTTAAATACAAATCCTTCAAATTGTTGTGTAAATAATTCAGTATATTGCTAAAGCACGAGCAATGGTAGCTTTATCTCCAAAAGATTTAGATGAAATATTTAGTCCATTACGAGAATTACCATTTATTAATCGTGTAAATCAATTATCCCATACTTCACTTCATTATCACAATCAAGATGATATATTATCTACTAATGTTATCAATGTAAAAACAACTCATTGTTCAACTATTCCATTAATATTAAACACAAATGTTAATTCAATGAAACAATTATCTGATACCAATTCGACAACGATGGTGAAGAATCGAAATTGCTTAGGTTCTGAATTAAAATTATCTTTAACTAATCTTACATCTTCTGTAGAAGAAAATAATGGTAATGATAAAAGTAATGATTATTGCTCTTCGTCTGGTGCTAGTTCTCCACGACATTTAGTTAGTTGTATCGCTGTAACACATAATCGG]


>consensus_10717#2 GAAATTAATGAAGAGAAATTTGGTCTTTCATCACCTGTCACTGTGCCAACGTGTACTGTT AATGATAATAAGAAATACTCAGTATCTTCACTATCCAATTTAAATACAAATCCTTCAAAT TGTTGTGTAAATAATTCAGTATATTGCTAAAGCACGAGCAATGGTAGCTTTATCTCCAAA AGATTTAGATGAAATATTTAGTCCATTACGAGAATTACCATTTATTAATCGTGTAAATCA ATTATCCCATACTTCACTTCATTATCACAATCAAGATGATATATTATCTACTAATGTTAT CAATGTAAAAACAACTCATTGTTCAACTATTCCATTAATATTAAACACAAATGTTAATTC AATGAAACAATTATCTGATACCAATTCGACAACGATGGTGAAGAATCGAAATTGCTTAGG TTCTGAATTAAAATTATCTTTAACTAATCTTACATCTTCTGTAGAAGAAAATAATGGTAA TGATAAAAGTAATGATTATTGCTCTTCGTCTGGTGCTAGTTCTCCACGACATTTAGTTAG TTGTATCGCTGTAACACATAATCGG



consensus multiple alignement with clustalw

CLUSTAL W (1.82) multiple sequence alignment


consensus_10717#0      GAAATTAATGAAGAGAAATTTGGTCTTTCATCACCTGTCACTGTGCCAACGTGTACTGTT 60
consensus_10717#1      ------------------------------------------------------------
consensus_10717#2      ------------------------------------------------------------
                                                                                   

consensus_10717#0      AATGATAATAAGAAATACTCAGTATCTTCACTATCCAATTTAAATACAAATCCTTCAAAT 120
consensus_10717#1      ------------------------------------------------------------
consensus_10717#2      ------------------------------------------------------------
                                                                                   

consensus_10717#0      TGTTGTGTAAATAATTCAGATAACTTCAAATTTTCTACTCCTACTTCATCATCTCCTTCT 180
consensus_10717#1      ------------------------------------------------------------
consensus_10717#2      ------------------------------------------------------------
                                                                                   

consensus_10717#0      TCACAACATTTATTGCATTATTCTTCATCACCTAATTTTCCGCCTTGTCAACGGCCATCA 240
consensus_10717#1      ------------------------TCATCACCTAATTTNCNGCCTTGTCANCGGCCATCA 36
consensus_10717#2      ---------------------------GAAATTAATGAAGAGAAATTTGGTCTTTCATCA 33
                                                    *  ****     *   * *   *   *****

consensus_10717#0      TCAATATTGTTATCTAATAAATCTGCACATAATCACAATCGTACAACTTCCGTTTACATT 300
consensus_10717#1      TCAATATTGTTATCTAATAAATCTGCACATAATCACAATCGTACAACTTCCGTTTACATT 96
consensus_10717#2      CC--TGTCACTGTGCCA-ACGTGTACTGTTAATGATAATAAGAAATACTCAG--TATCTT 88
                        *  * *   * *   * *  * * *   **** * ***   * *   ** *  **  **

consensus_10717#0      GACTGTCCAAATACATCATATTATGATGTAATTACATTCGGTCGAACTTATGAACAGTAT 360
consensus_10717#1      GACTGTCCAAATACATCATATTATGATGTAATTGCATTCGGTCGAACTTATGAACAGTAT 156
consensus_10717#2      CACTATCCAATTTAAATACAAATCCTTCAAATTGTT----GTGTAAATAATT--CAGTAT 142
                        *** ***** *  *  * *      *  ****       **  ** * **   ******

consensus_10717#0      ATTGCTAAAGCACGAGCAATGGTAGCTTTATCTCCAAAAGATTTAGATGAAATATTTAGT 420
consensus_10717#1      ATTGCTAAAGCACGAGCAATGGTAGCTTTATCTCCAAAAGATTTAGATGAAATATTTAGT 216
consensus_10717#2      ATTGCTAAAGCACGAGCAATGGTAGCTTTATCTCCAAAAGATTTAGATGAAATATTTAGT 202
                       ************************************************************

consensus_10717#0      CCATTACGAGAATTACCATTTATTAATCGTGAAAATCAATTATCCCATACTTCACTTCAT 480
consensus_10717#1      CCATTACGAGAATTACCATTTATTAATCGTGAAAATCAATTATCCCATACTTCACTTCAT 276
consensus_10717#2      CCATTACGAGAATTACCATTTATTAATCGTGTAAATCAATTATCCCATACTTCACTTCAT 262
                       ******************************* ****************************

consensus_10717#0      TATCACAATCAAGATGATATATTATCTACTAATGTTATCAATGTAAAAACAACTCATTGT 540
consensus_10717#1      TATCACAATCAAGATGATATATTATCTACTAATGTTATCAATGTAAAAACAACTCATTGT 336
consensus_10717#2      TATCACAATCAAGATGATATATTATCTACTAATGTTATCAATGTAAAAACAACTCATTGT 322
                       ************************************************************

consensus_10717#0      TCAACTATTCCATTAATATTAAACACAAATGTTAATTCAATGAAACAATTATCTGATACC 600
consensus_10717#1      TCAACTATTCCATTAATATTAAACACAAATGTTAATTCAATGAAACAATTATCTGATACC 396
consensus_10717#2      TCAACTATTCCATTAATATTAAACACAAATGTTAATTCAATGAAACAATTATCTGATACC 382
                       ************************************************************

consensus_10717#0      AATTCGACAACGATGGTGAAGAATCGAAATTGCTTAGGTTCTGAATTAAAATTATCTTTA 660
consensus_10717#1      AATTCGACAACGATGGTGAAGAATCGAAATTGCTTAG----------------------- 433
consensus_10717#2      AATTCGACAACGATGGTGAAGAATCGAAATTGCTTAGGTTCTGAATTAAAATTATCTTTA 442
                       *************************************                       

consensus_10717#0      ACTAATCTTACATCTTCTGTAGAAGAAAATAATGGTAATGATAAAAGTAATGATTATTGC 720
consensus_10717#1      ----------------------AAGAAAATAATGGTAATGATAAAAGTAATGATTATTGC 471
consensus_10717#2      ACTAATCTTACATCTTCTGTAGAAGAAAATAATGGTAATGATAAAAGTAATGATTATTGC 502
                                             **************************************

consensus_10717#0      TCTTCGTCTGGTGCTAGTTCTCCACGACATTTAGTTAGTTGTATCGCTGTAACACATAAT 780
consensus_10717#1      TCTTCGTCTGGTGCTAGTTCTCCACGACATTTAGTTAGTTGTATCGCTGTAACACATAAT 531
consensus_10717#2      TCTTCGTCTGGTGCTAGTTCTCCACGACATTTAGTTAGTTGTATCGCTGTAACACATAAT 562
                       ************************************************************

consensus_10717#0      CGGAATGGACTGAATAGTAATTTAGTAACAAAAAATATAACTGTTT 826
consensus_10717#1      CGGAATGGACTGAATAGTAATTTAGTAACAAAAAATATAACTGTTT 577
consensus_10717#2      CGG------------------------------------------- 565
                       ***                                           




Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)