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Schistosoma mansoni
cluster # 10720 cluster # 10720       Sequences # 20       consensus # 2


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_10720#0 length = 1141 sequences # 6  
consensus_10720#1 length = 1010 sequences # 14  

consensusID : consensus_10720#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 6
consensus length = 1141
fasta sequence
                              [ATTTACCTTTTAGAAGAAAAAAACACTGAACATTAAATATTGACAGAGTTAGTAAAAAAATTAATGACATAATTAATGAAACTAACCAAATTTATCTTGATTAATTAAATCAGAAAATTTACAAAATAAAAACAAAACAATAAAAATGACCTATTAGGGAGAGAGATAAAAATAAAATTAATACAAATACAAGA-TTAATTATGTAAGTATAGATGGATCATCAAGGTACAAAGTGATTCAATACTAAAACAGTTCATTAAGCAACTTAAACCAATGTATATATGTGCCTGGTCCTACGTTGTAGCTGATTGAAACAAATCTATACTCAACCATAACCCATATATTTACTAGTGTTTGAACCTAACATTAATTAAATAAGTACCCATGTATTAAAATACACACACAGTGAAGAGAAACACAAGACATATTTATTAAACATA-ACGAATAATAATTACCAATAATATATACCATGTAAAAGTATCAAAGGAAATAAAAAATAAAAATAAAGAATATTA-CCTTTCTTAATAGAATTTGGGTCAAATTAATGTATGGTTGATTAAGTATACGTAATTAATGAAAAATAATGATCAAGTTTCTTGATAGTTAAAAACCAAAAGGAGATTATTCACATATTTTTTTTTGGAAATAACTGTATATGCTAACTGTGTAGAATGCAAGTGGACATTTATATAATAGTTTAACAACAGTCTCCATAAAGTTTTGGTTCATTACTATCAAATTGTATTGATCTACTTGCTAAAGAAGCAGCTAATGCAGCATTATGACCTTGTTTAACACCATCCCAAATACCACCTGCGCATAACTCATTGTAACTTCCTTTAATAACATT-GGAGTAAATGCCCTCAGCTAGCAGTTCGAAAGTTTTCTCAATATTTTGGTTAGTAAGTGAAGATGTCTCAATATAGATATAATCACCAAGTCGCTGTGCAAGAGCCTCTGCTTCAATTTTGGTAACTTGTCTTTCATCACGACGATCAGCCTTATGACCAACTATTATGAACACAGGAGCAGAGCATTTAATTGAAGCACGAGCTTCTTCATACCATTCAGCAACATGGTCAAGTGTCTCCCTGTCAGTAAAATCAAACACAACAACAACACCAACACAATTGGTCCTCGA]

[+] EMBL CD075740             [ATTTACCTTTTAGAAGAAAAAAACACTGAACATTAAATATTGACAGAGTTAGTAAAAAAATTAATGACATAATTAATGAAACTAACCAAATTTATCTTGATTAATTAAATCAGAAAATTTACAAAATAAAAACAAAACAATAAAAATGACCTATTAGGGAGAGAGATAAAAATAAAATTAATACAAATACAAGA TTAATTATGTAAGTATAGATGGATCATCAAGGTACAAAGTGATTCAATACTAAAACAGTTCATTAAGCAACTTAAACCAATGTATATATGTGCCTGGTCCTACGTTGTAGCTGATTGAAACAAATCTATACTCAACCATAACCCATATATTTACTAGTGTTTGAACCTAACATTAATTAAATAAGTACCCATGTATTAAAATACACACACAGTGAAGAGAAACACAAGACATATTTATTAAACATA ACGAATAATAATTACCAATAATATATACCATGTAAAAGTATCAAAGGAAATAAAAAATAAAAATAAAGAATATTA CCTTTCTTAATAGAATTTGGGTCAAATTAATGTATGGTTGATTAAGTATACGTAATTAATGAAAAATAATGATCAAGTTTCTTGAT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             ]
[-] EMBL CD082125             [                                                                                                                                                                                          ATNCNAGATTTAATTATGTAAGTATAGATGGATCATCAAGGTACANAGTGATTCAATACTAAAACAGTTCATTAAGCAACTTAGACCAATGTATATATGTGCCTGGTCCTACGTTGTAGCTGATTGAAACAAATCTATACTCAACCATAACCCATATATTTACTAGTGTTTGAACCTAACATTAATTAAATAAGTACCCATGTATTAAAATACACACACAGTGAAGAGAAACACAAGACATATTTATTAAACATA ACGAATAATAATTACCAATAATATATACCATGTAAAAGTATCAAAGGAAATAAAAAATAAAAATAAAGAATATTA CCTTTCTTAATAGAATTTGGGTCAAATTAATGTATGGTTGATTAAGTATACGTAATTAATGAAAAATAATGATCAAGTTTCTTGATAGTTAAAAACCAAAAGGAGATTATTCACATATTTTTTTTTGGAAATAACTGTATATGCTAACTGTGTAGAATGCAAGTGGACATTTATATAATAGTTTAACAACAGTCTCCATAAAGTTTTGGTTCATTACTATCAAATTATATTGATCTACTTGCTAAAGAAGCAGCTAATGCAGCATTATGACCTTGTTTAACACCATCCCAAATACCACCTGCGCGTAACTCATTGTAACTTAAATTAATAACATT GGAGTAAATGCCCTCAGCTgt                                                                                                                                                                                                                                                                              ]
[+] EMBL CD075796             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 CACAAGACATATTTATTAAACATA ACGAATAATAATTACCAATAATATATACCATGTAAAAGTATCAAAGGAAATAAAAAATAAAAATAAAGAATATTA CCTTTCTTAATAGAATTTGGGTCAAATTAATGTATGGTTGATTAAGTATACGTAATTAATGAAAAATAATGATCAAGTTTCTTGATAGTTAAAAACCAAAAGGAGATTATTCACATATTTTTTTTTGGAAATAACTGTATATGCTAACTGTGTAGAATGCAAGTGGACATTTATATAATAGTTTAACAACAGTCTCCATAAAGTTTTGGTTCATTACTATCAAATTGTATTGATCTACTTGCTAAAGAAGCAGCTAATGCAGCATTATGACCTTGTTTAACACCATCCCAAATACCACCTGCGCATAACTCATTGTAACTTCCTTTAATAACATT GGAGTAAATGCCCTCAGCTAGCAGTTCGAAAGTTTTCTCAATATTTTGGTTAGTAAGTGAAGATGTCTCAATATAGATATAATCACCAAGTCGCTGTGCAAGAGCCTCTGCTTCAATTTTGGTAACTTGTCTTTCATCACGACGATCAGCCTTATGACCAA                                                                                                                                  ]
[+] EMBL AA999253             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 CACAAGACATATTTATTAAACATA ACGAATAATAATTACCAATAATATATACCATGTAAAAGTATCAAAGGAAATAAAAAATAAAAATAAAGAATATTA CCTTTCTTAATAGAATTTGGGTCAAATTAATGTATGGTTGATTAAGTATACGTAATTAATGAAAAATAATGATCAAGTTTCTTGATAGTTAAAAACCAAAAGGAGATTATTCACATATTTTTTTTTGGAAATAACTGTATATGCNAACTGTGTAGAATGCAAGTGGACATTTATATAATAGTTTAACAACAGTCTCCATAAAGTTTTGGTTCATTACTATCAAATTGTATTGATCTACTTGCTAAAGAAGCAGCTAATGCAGCATTATGACCTTGTTTAACACCATCCCAAATACCACCTGCGCATAACTCATTGTAACTTCCTTTAATAACATTGGGGGTAAATGCCCTCAGCTAGCAGTTCGAAAGTTTTCTCAATATTTTGGGTAGTAAGTGAAGATGTCCCAA                                                                                                                                                                                                                            ]
[-] EMBL CD082181             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 ncagnnnCATATTTATT AACATACNNGAATAAT ATTACCAATAATATATACCATGTAAAAGTATCAAAGGAAATAAANAATANNAATANAGAAT TTACCCTTTCTTAATAGAATTTGGGTCAAATTAATGTATGGTTGATTAAGTATACGTAATTAATGAAAAATAATGATCAAGTTTCTTGATAGTTAAAAACCAAAAGGAGATTATTCACATATTTTTTTTTGGAAATAACTGTATATGCTAACTGTGTAGAATGCAAGTGGACATTTATATAATAGTTTAACAACAGTCTCCATAAAGTTTTGGTTCATTACTATCAAATTGTATTGATCTACTTGCTAAAGAAGCAGCTAATGCAGCATTATGACCTTGTTTAACACCATCCCAAATACCACCTGCGCATAACTCATTGTAACTTCCTTTAATAACATT GGAGTAAATGCCCTCAGCTAGCAGTTCGAAAGTTTTCTCAATATTTTGGTTAGTAAGTGAAGATGTCTCAATATAGATATAATCACCAAGTCGCTGTGCAAGAGCCTCTGCTTCAATTTTGGTAACTTGTCTTTCATCACGACGATCAGCCTTATGACCAACTATTATGAACACAGGAGCAGAGCATTTAATTGAAGCACGAGCTTCTTCATACCATTCAGCAACATGGTCAAGTGTCTCCCTGTCAGTAAAATCAAACACAACAACAACACCAACACAATTGGTCCTCGA]
[+] EMBL AA999495             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        A ACGAATAATAATTACCAATAATATATACCATGTAAAAGTATCAAAGGAAATAAAAAATAAAAATAAAGAATATTA CCTTTCTTAATAGAATTTGGGTCAAATTAATGTATGGTTGATTAAGTATACGTAATTAATGAAAAATAATGATCAAGTTTCTTGATAGTTAAAAACCAAAAGGNGATTATTCACATATTTTTTTTTGGAAATAACTGTATATGTTAACTGTGTAGAATGCAAGTGGACATTTATATAATAGTTTAACAACAGTCTCCATAAAGTTTTGGTTCATTACTATCAAATTGTATTGATCTACTTGCTAAAGAAGCAGCTAATGCAGCATTA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        ]


>consensus_10720#0 ATTTACCTTTTAGAAGAAAAAAACACTGAACATTAAATATTGACAGAGTTAGTAAAAAAA TTAATGACATAATTAATGAAACTAACCAAATTTATCTTGATTAATTAAATCAGAAAATTT ACAAAATAAAAACAAAACAATAAAAATGACCTATTAGGGAGAGAGATAAAAATAAAATTA ATACAAATACAAGATTAATTATGTAAGTATAGATGGATCATCAAGGTACAAAGTGATTCA ATACTAAAACAGTTCATTAAGCAACTTAAACCAATGTATATATGTGCCTGGTCCTACGTT GTAGCTGATTGAAACAAATCTATACTCAACCATAACCCATATATTTACTAGTGTTTGAAC CTAACATTAATTAAATAAGTACCCATGTATTAAAATACACACACAGTGAAGAGAAACACA AGACATATTTATTAAACATAACGAATAATAATTACCAATAATATATACCATGTAAAAGTA TCAAAGGAAATAAAAAATAAAAATAAAGAATATTACCTTTCTTAATAGAATTTGGGTCAA ATTAATGTATGGTTGATTAAGTATACGTAATTAATGAAAAATAATGATCAAGTTTCTTGA TAGTTAAAAACCAAAAGGAGATTATTCACATATTTTTTTTTGGAAATAACTGTATATGCT AACTGTGTAGAATGCAAGTGGACATTTATATAATAGTTTAACAACAGTCTCCATAAAGTT TTGGTTCATTACTATCAAATTGTATTGATCTACTTGCTAAAGAAGCAGCTAATGCAGCAT TATGACCTTGTTTAACACCATCCCAAATACCACCTGCGCATAACTCATTGTAACTTCCTT TAATAACATTGGAGTAAATGCCCTCAGCTAGCAGTTCGAAAGTTTTCTCAATATTTTGGT TAGTAAGTGAAGATGTCTCAATATAGATATAATCACCAAGTCGCTGTGCAAGAGCCTCTG CTTCAATTTTGGTAACTTGTCTTTCATCACGACGATCAGCCTTATGACCAACTATTATGA ACACAGGAGCAGAGCATTTAATTGAAGCACGAGCTTCTTCATACCATTCAGCAACATGGT CAAGTGTCTCCCTGTCAGTAAAATCAAACACAACAACAACACCAACACAATTGGTCCTCG A



consensusID : consensus_10720#1
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fasta sequence
                              [TATTTTTTTTGGATATTAACTGTATATGCTAACTGTGTAGAATGCAAGTGGACATTTATATAATAGTTTAACAACAGTCTCCATAAAGTTTTGGTTCATTACTATCAAATTGTATTGATCTACTTGCTAAAGAAGCAGCTAATGCAGCATTATG-ACCTTGTTTA-ACACCATCCC-AAATACCACCTGCGCATAACTC-TTGTAACT-TCCTTTAATAACATTGGAGTAAATGCCCTCAGCTAGCAGTTCGAAAGTTTTCTCAATATTTTGGTTAGTAAGTGAAGATGTCTCAATATAGATATAATCACCAAGTCGCTGTGCAAGAGCCTCTGCTTCAATTTTGGTAACTTGTCTTTCATCACGACGATCAGCCTTATGACCAACTATTATGAACACAGGAGCAGAGCATTTAATTGAAGCACGAGCTTCTTCATACCATTCAGCAACATGGTCAAATGTCTCCCTGTCAGTAAGATCAAACACAACAACAACACCAACACAATTGCGATAATAAGACGAAGTTATTGTT-CTAAACTTCTC-TTGACCTGCAGTATCCCATAGTTGCAGCTTAACGAAGACCTCCTCTTGAATTCGGA-CAGTTCGTGAGAAAAAATCAACTCCAATAGTTGGATCTGAAACAGGAGTGAAATTTCCTTCTACGAAACTTTTCATTAACGAGGATTTCCCAACCATACTATCACCAATTATGATAACACGAAATTGATAGTCGAAATAAGGTAGCATCTTTTGCTGACCAACCAAACATTAAGAACCAGATCTCATGTTATTTTTGAGAAGTTCAACCCTAGTAAGATGTGCAAGAATAGCTTTGTGTTGTAAGTAGGCAGATTGTTAGGAATCTCTAGAGAATATTACGTATAAAGCTTACGAAGTCGAAAATGATAATTTTTGTGATATTTCGGCTTTGAATGATTAATTTCGGAAAGGGTTAAGACGAAGTCCAACGTAACGCATTTATTCATGAATTGCCTCGTGCCGAATCCTGCCTCGAG]

[+] EMBL CD076019             [TATTTTTTTTGGATATTAACTGTATATGCTAACTGTGTAGAATGCAAGTGGACATTTATATAATAGTTTAACAACAGTCTCCATAAAGTTTTGGTTCATTACTATCAAATTGTATTGATCTACTTGCTAAAGAAGCAGCTAATGCAGCATTATG ACCTTGTTTA ACACCATCCC AAATACCACCTGCGCATAACTCATTGTAACT TCCTTTAATAACATTGGAGTAAATGCCCTCAGCTAGCAGTTCGAAAGTTTTCTCAATATTTTGGTTAGTAAGTGAAGATGTCTCAATATAGATATAATCACCAAGTCGCTGTGCAAGAGCCTCTGCTTCAATTTTGGTAACTTGTCTTTCATCACGACGATCAGCCTTATGACCAACTATTATGAACACAGGAGCAGAGCATTTAATTGAAGCACGAGCTTCTTCATACCATTCAGCAACATGGTCAAATGTCTCCCTGTCAGTAAGATCAAACACAACAACAACACCAACACAATTGCGATAATAAGACGAAGTTATTGTT CTAAACTTCTC TTGACCTGCAGTATCCCATAGTTGCAGCTTAACGAAGACCTCCTCTTGAATTCGGA CAGT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             ]
[-] EMBL CD082420             [     TTTTTTGAAAT   CCGT TATGC  ACTGTGTA AATGCAA  GG CCTTTA ATAATAGTT  ACCACAGTCTCCAT AAGTTTT GTCCA TACTACCNAA TGTA TGATCTAC TGCTAAAGAGCCAGCTAATGCAGCA TATGNACC TGNTTACAC CCATCCCNNAATACCACCTGCGCAT ACTC ATGTAACTNNCCTTNAATACCATGNNAGTAAATGCCCTCAGCTAGCAGTTCGANAGTNTTCTCAATATTTGGGTTAGTAAGTGAAGATGTCTCAATATAGATATAATCACCAAGTCGCTGTGCAAGAGCCTCTGCTTCAATTTTGGTAACTTGTCTTTCATCACGACGATCAGCCTTATGACCAACTATTATGAACACAGGAGCAGAGCATTTAATTGAAGCACGAGCTTCTTCATACCATTCAGCAACATGGTCAAATGTCTCCCTGTCAGTAAGATCAAACACAACAACAACACCAACACAATTGCGATAATAAGACGAAGTTATTGTT CTAAACTTCTC TTGACCTGCAGTATCCCATAGTTGCAGCTTAACGAAGACCTCCTCTTGAATTCGGA CAGTTCGTGAGAAAAAATCAACTCCAATAGTTGGATCTGAAACAGGAGTGAAATTTCCTTCTACGAAACTTTTCATTAACGAGGATTTCCCAACCATACTATCACCAATTATGATAACACGAAATTGATAGTCGAAATAAGGTAGCATCTTTTGCTGACCAACCAAACATTAAGAACCAGATCTCATGTTATTTTTGAGAAGTTCAACCCTAGTAAGATGTGCAAGAATAGCTTTGTGTTGTAAGTAGGCAGATTGTTAGGAATCTCTAGAGAATATTACGTATAAAGCTTACGAAGTCGAAAATGATAATTTTTGTGATATTTCGGCTTTGAATGATTAATTTCGGAAAGGGTTAAGACGAAGTCCAACGTAACGCATTTATTCATGAA                           ]
[+] EMBL CD095318             [                                                                                                                                                                                                        TTGTAACT TCCTTTAATAACATTGGAGTAAATGCCCTCAGCTAGCAGTTCGAAAGTTTTCTCAATATTTTGGTTAGTAAGTGAAGATGTCTCAATATAGATATAATCACCAAGTCGCTGTGCAAGAGCCTCTGCTTCAATTTTGGTAACTTGTCTTTCATCACGACGATCAGCCTTATGACCAACTATTATGAACACAGGAGCAGAGCATTTAATTGAAGCACGAGCTTCTTCATACCATTCAGCAACATGGTCAAATGTCTCCCTGTCAGTAAGATCAAACACAACAACAACACCAACACAATTGCGATAATAAGACGAAGTTATTGTT CTAAACT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               ]
[+] EMBL CD094862             [                                                                                                                                                                                                        TTGTAACT TCCTTTAATAACATTGGAGTAAATGCCCTCAGCTAGCAGTTCGAAAGTTTTCTCAATATTTTGGTTAGTAAGTGAAGATGTCTCAATATAGATATAATCGCCAAGTCGCTGTGCAAGAGCCTCTGCTTCAATTTTGGTAACTTGTCTTTCATCACGACGATCAGCCTTATGACCAACTATTATGAACACAGGAGCAGAGCATTTAATTGAAGCACGAGCTTCTTCATACCATTCAGCAACATGGTCAAATGTCTCCCTGTCAGTAAGATCAAACACAACAACAACACCAACACAATTGCGATAATAAGACGAAGTTATTGTT CTAAACTTCTC TTGACCTGCAGTATCCCATAGTTGCAGCTTAACGA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       ]
[+] EMBL CD141059             [                                                                                                                                                                                                                             ATTGGAGTAAATGCCCTCAGCTAGCAGTTCGAAAGTTTTCTCAATATTTTGGTTAGTAAGTGAAGATGTCTCAATATAGATATAATCACCAAGTCGCTGTGCAAGAGCCTCTGCTTCAATTTTGGTAACTTGTCTTTCATCACGACGATCAGCCTTATGACCAACTATTATGAACACAGGAGCAGAGCATTTAATTGAAGCACGAGCTTCTTCATACCATTCAGCAACATGGTCAAATGTCTCCCTGTCAGTAAGATCAAACACAACAACAACACCAACACAATTGCGATAATAAGACGAAGNTATTGTT CTAAACTTCTCTTTGA CTGCAGTATCCCATAGTTGCAGCTTAACGA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       ]
[-] EMBL CD144907             [                                                                                                                                                                                                                                                       GTTCGAAAGTTTTCTCAATATTTTGGTTAGTAAGTGAAGATGTCTCAATATAGATATAATCACCAAGTCGCTGTGCAAGAGCCTCTGCTTCAATTTTGGTAACTTGTCTTTCATCACGACGATCAGCCTTATGACCAACTATTATGAACACAGGAGCAGAGCATTTAATTGAAGCACGAGCTTCTTCATACCATTCAGCAACATGGTCAAATGTCTCCCTGTCAGTAAGATCAAACACAACAACAACACCAACACAATTGCGATAATAAGACGAAGTTATTGTT CTAAACTTCTC TTGACCTGCAGTATCCCATAGTTGCAGCTTAACGAAGACCTCCTCTTGAATTCGGA CAGTTCGTGAGAAAAAATCAACTCCAATAGTTGGATCTGAAACAGGAGTGAAATTTCCTTCTACGAAACTTTTCATTAACGAGGATTTCCCAACCATACTATCACCAATTATGATAACACGAAATTGATAGT                                                                                                                                                                                                                                                                                             ]
[+] EMBL CD154888             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  AATTTTGGTAACTTGTCTTTCATCACGACGATCAGCCTTATGACCAACTATTATGAACACAGGAGCAGAGCATTTAATTGAAGCACGAGCTTCTTCATACCATTCAGCAACATGGTCAAATGTCTCCCTGTCAGTAAGATCAAACACAACAACAACACCAACACAATTGCGATAATAAGACGAAGTTATTGTT CTAAACTTCTC TTGACCTGCAGTATCCCATAGTTGCAGCTTAACGAAGACCTCCTCTTGAATTCGGA CAGTTCGTGAGAAAATATCAACTCCAATAGTTGGATCTGAAACAGGAGTGAAATTTCCTTCTACGAAACTTTTCATTAACGAGGATTTCCCAACCATACTATCACCAATTATGATAACACGAAATTGATAGTCGAAATAAGGTAGCATCTTTTGCTGACCATCCAAACATTAAGAACCAGATCTCATGTTATTTTTGAGAAGTTCAACCCTAGTAAGATGTGCAAGAATAGCTTTGTGTTGTAAGTAGGCAGATTGTTAGGAATCTCTAGAGAATATTACGTATAAAGCTTACGAAGTCGAAAATG                                                                                                               ]
[-] EMBL CD077650             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        CATTTAATTGAAGCACGAGCTTCTTCATACCATTCAGCAACATGGTCAAATGTCTCCCTGTCAGTAAGATCAAACACAACAACAACACCAACACAATTGCGATAATAAGACGAAGTTATTGTT CTAAACTTCTC TTGACCTGCAGTATCCCATAGTTGCAGCTTAACGAAGACCTCCTCTTGAATTCGGATCAGTTCGTGAGAAAAAATCAA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            ]
[+] EMBL CD166596             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           AGCAACATGGTCAAATGT T CCTGTCAGTAAGATCAAACACAACAACAACACCAACACAATTGCGATAATAAGACGAAGTTA TGTTGCTAAACTTCTC TTGACCTGCAGTATCCCATAGTTGCAGCTTAACGAA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      ]
[-] EMBL CD150064             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 ACACAACAAC  CACCAACACAATTGCGATAATAAGACGAAGTTATTGTT CTAAACTTCTC TTGACCTGCAGTATCCCATAGTTGCAGCTTAACGAAGACCTCCTCTTGAATTCGGA CAGTTCGTGAGAAAAAATCAACTCCAATAGTTGGATCTGAAACAGGAGTGAAATTTCCTTCTACGAAACTTTTCATTAACGAGGATTTCCCAACCATACTATCACCAATTATGATAACACGAAATTGATAGTCGAAATAAGGTAGCATCTTTTGCTGACCAACCAAACATTAAGAACCAGATCTCATGTTATTTTTGAGAAGTTCAACCCTAGTAAGATGTGCAAGAATAGCTTTGTGTTGTAAGTAGGCAGATTGTTAGGAATCTCTAGAGAATATTACGTATAAAGCTTACGAAGTCGAAAATGATAATTTTTGTGATATTTCG                                                                                           ]
[-] EMBL CD150066             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 ACACCACAAC  CACCAACACAATTGCGATAATAAGACGAAGTTATTGTT CTAAACTTCTC TTGACCTGCAGTATCCCATAGTTGCAGCTTAACGAAGACCTCCTCTTGAATTCGGA CAGTTCGTGAGAAAAAATCAACTCCAATAGTTGGATCTGAAACAGGAGTGAAATTTCCTTCTACGAAACTTTTCATTAACGAGGATTTCCCAACCATACTATCACCAATTATGATAACACGAAATTGATAGTCGAAATAAGGTAGCATCTTTTGCTGACCAACCAAACATTAAGAACCAGATCTCATGTTATTTTTGAGAAGTTCAACCCTAGTAAGATGTGCAAGAATAGCTTTGTGTTGTAAGTAGGCAGATTGTTAGGAATCTCTAGAGAATATTACGTATAAAGCTTACGAAGTCGAAAATGATCATTTTTGTGATATTTCG                                                                                           ]
[-] EMBL CD077804             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     AACAACAACGCCAACACAATTGCGATAATAAGACGAAGTTATTGTT CTAAACTTCTC TTGACCTGCAGTATCCCATAGTTGCAGCTTAACGAAGACCTCCTCTTGAATTCGGA CAGTTCGTGAGAAAAAATCAACTCCAATAGTTGGATCTGAAACAGGAGTGAAATTTCCTTCTACGAAACTTTTCATTAGCGAGGATTTCCCAcct                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  ]
[-] EMBL CD084092             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  AAGACCTCCTCTTGAATTCGGA CAGTTCGTGAGAAAAAA  AACTCCAATAGTTGGATCTGAAACAGGAGTGAAATTTCCTTCTACGAAACTTTTCATTAACGAGGATTTCCCAACCATACTATCACCAATTATGATAACACGAAATTGATAGTCGAAATAAGGTAGCATCTTTTGCTGACCAACCAAACATTAAGAACCAGATCTCATGTTATTTTTGAGAAGTTCAACCCTAGTAAGATGTGCAAGAATAGCTTTGTGTTGTAAGTAGGCAGATTGTTAGGAATCTCTAGAGAATATTACGTATAAAGCTTACGAAGTCGAAAATGATAATTTTTGTGATATTTCGGCTTTGAATGATTAATTTCGGAAAGGGTTAAGACGAAGTCCAACGTAACGCATTTATTCATGAATTGCCTCGTGCCGAATCCTGCCTCGAG]
[+] EMBL CD194069             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                TGAGAAAAAATCAACTCCAATAGTTGGATCTGAAACAGGAGTGAAATTTCCTTCTACGAAACTTTTCATTAACGAGGATTTCCCAACCATACTATCACCAATTATGATAACACGAAATTGATAGTCGAAATAAGGTAGCATCTTTTGCTGACCAACCAAACATTAAGAACCAGATCTCATGTTATTTTTGAGAAGTTCAACCCTAGTAAGATGTGCAAGAATAGCTTTGTGTTGTAAGTAGGCAGATTGTTAGGAATCTCTAGAGAATATTACGTATAAAGCTTACGAAGTCGAAAATGATAATTTTTGTGATATTTCG                                                                                           ]


>consensus_10720#1 TATTTTTTTTGGATATTAACTGTATATGCTAACTGTGTAGAATGCAAGTGGACATTTATA TAATAGTTTAACAACAGTCTCCATAAAGTTTTGGTTCATTACTATCAAATTGTATTGATC TACTTGCTAAAGAAGCAGCTAATGCAGCATTATGACCTTGTTTAACACCATCCCAAATAC CACCTGCGCATAACTCTTGTAACTTCCTTTAATAACATTGGAGTAAATGCCCTCAGCTAG CAGTTCGAAAGTTTTCTCAATATTTTGGTTAGTAAGTGAAGATGTCTCAATATAGATATA ATCACCAAGTCGCTGTGCAAGAGCCTCTGCTTCAATTTTGGTAACTTGTCTTTCATCACG ACGATCAGCCTTATGACCAACTATTATGAACACAGGAGCAGAGCATTTAATTGAAGCACG AGCTTCTTCATACCATTCAGCAACATGGTCAAATGTCTCCCTGTCAGTAAGATCAAACAC AACAACAACACCAACACAATTGCGATAATAAGACGAAGTTATTGTTCTAAACTTCTCTTG ACCTGCAGTATCCCATAGTTGCAGCTTAACGAAGACCTCCTCTTGAATTCGGACAGTTCG TGAGAAAAAATCAACTCCAATAGTTGGATCTGAAACAGGAGTGAAATTTCCTTCTACGAA ACTTTTCATTAACGAGGATTTCCCAACCATACTATCACCAATTATGATAACACGAAATTG ATAGTCGAAATAAGGTAGCATCTTTTGCTGACCAACCAAACATTAAGAACCAGATCTCAT GTTATTTTTGAGAAGTTCAACCCTAGTAAGATGTGCAAGAATAGCTTTGTGTTGTAAGTA GGCAGATTGTTAGGAATCTCTAGAGAATATTACGTATAAAGCTTACGAAGTCGAAAATGA TAATTTTTGTGATATTTCGGCTTTGAATGATTAATTTCGGAAAGGGTTAAGACGAAGTCC AACGTAACGCATTTATTCATGAATTGCCTCGTGCCGAATCCTGCCTCGAG



consensus multiple alignement with clustalw

CLUSTAL W (1.82) multiple sequence alignment


consensus_10720#0      ATTTACCTTTTAGAAGAAAAAAACACTGAACATTAAATATTGACAGAGTTAGTAAAAAAA 60
consensus_10720#1      ---TATTTTTTTTG-GATATTAACTGTATATGCTAACTGTGTAGAATGCAAGTGGACATT 56
                          **  ****    ** *  ***  *  *   *** * *  * *  *  ***  * *  

consensus_10720#0      TTAATGACA--TAATTAATGAAACTAACCAAATTTATCTTGATTA--ATTAAATCAGAA- 115
consensus_10720#1      TATATAATAGTTTAACAACAGTCTCCATAAAGTTTTGGTTCATTACTATCAAATTGTATT 116
                       *  ** * *  * *  **        *  ** ***   ** ****  ** ****   *  

consensus_10720#0      AATTTACAAAATAAAAACAAAACAATAAAAATGACCTATTAGGGAGAGAGATAAAAATAA 175
consensus_10720#1      GATCTACTTGCTAAA---GAAGCAGCTAATGCAGC--ATTATGACCTTGTTTAACACCAT 171
                        ** ***    ****    ** **   **     *  **** *        *** *  * 

consensus_10720#0      AATTAATACAAATACAAGATTAATTATGTAAGTATAGATGG-ATCATCAAGGTACAAAG- 233
consensus_10720#1      CCCAAATACCACCTGCGCATAACTCTTGTAACTTCCTTTAATAACATTGGAGTAAATGCC 231
                           ***** *       ** * *  ***** *     *   * ***    *** *    

consensus_10720#0      -TGATTCAATACTAAAACAGTTCATTAAGCAACTTAAACCAATGTATATATGTGCCTGGT 292
consensus_10720#1      CTCAGCTAGCAGTTCGAAAGTTTTCTCAATATTTTGG-TTAGTAAGTGAAGATGTCTCAA 290
                        * *   *  * *   * ****   * *  *  **     * *   *  *  ** **   

consensus_10720#0      CCTACGTTGTAGCTGATTGAAACAAATCTATACTCAACCATAACCCATATATTTACTAGT 352
consensus_10720#1      TATA-GATATAATC-ACCAAGTCG---CTGTGCAAGAGCCTCTGCTTCAATTTTGGTAAC 345
                         ** * * **    *   *  *    ** * *   * * *   *   *  ***  **  

consensus_10720#0      GTTTGAACC-TAACATTAATTAAATAAGTACCCATGTATTA-AAATACACACACAGTGAA 410
consensus_10720#1      TTGTCTTTCATCACGACGATCAGCCTTATGACCAACTATTATGAACACAGGAGCAGAGCA 405
                        * *    * * **    ** *      *  ***  *****  ** ***    *** * *

consensus_10720#0      GAGAAACACAAGACATATTTATTAAACATAACGAATAATAATTACCAATAATATATACCA 470
consensus_10720#1      TTTAATTGAAGCACGAGCTTCTTCATACCATTCAGCAACA-TGGTCA--AATGTCTCCCT 462
                          **    *  **    ** ** *    *   *  ** * *   **  *** * * ** 

consensus_10720#0      TGTAAAAGTATCAAAGGAAATAAAAAATAAAAATAAAGAATATTACCTTTCTTAATAGAA 530
consensus_10720#1      GTCAGTAAGATCAAACACAACAA-----CAACACCAACACAATTGCGATAATAAGACGAA 517
                          *  *  ******   ** **      ** *  ** *  *** *  *  * *   ***

consensus_10720#0      TTTGGGTCAAATTAATGTATGGTTGATTAAGTATACGTAATTAATGAAAAATAATGATCA 590
consensus_10720#1      GTTA--TTGTTCTAAACTTCTCTTGACCTGCAGTATCCCATAGTTGCAGCTTAACGAAGA 575
                        **   *     ***  *    ****       **    **   ** *   *** **  *

consensus_10720#0      AGTTTCTTGATAGTTAAAAACCAAAAGGAGATTATTCACATATTTTTTTTTGGAAATAAC 650
consensus_10720#1      CCTCCTCTTGAATTCGGACAGTTCGTGAGAAAAAATCA---ACTCC--------AATAGT 624
                         *    *   * *   * *      *   *  * ***   * *          ****  

consensus_10720#0      TGTATATGCTAACTGTGTAGAATGCAAGTGGACATTTATATAATAGTTTAACAACAGTCT 710
consensus_10720#1      TGGATCTGAAACAGGAGTGAAATTTCCTTCTACG---AAACTTTTCATTAACGAGGATTT 681
                       ** ** **  *   * **  ***     *  **    * *   *   ***** *   * *

consensus_10720#0      CC--ATAAAGTTTTGGTTCATTACTATCAAATTGTATTGATCTACTTGCTAAAGAAGCAG 768
consensus_10720#1      CCCAACCATACTATCACCAATTATGATAACACGAAATTGATAGTCGAAATAAGGTAGCAT 741
                       **  *  *   * *     ****  ** * *    ******   *    *** * **** 

consensus_10720#0      CTAATGCAGCATTATGACCTTGTTTAACACCATCCCAAATACCACCTGCGCATAACTCAT 828
consensus_10720#1      CTTTTGCTG-ACCAACCAAACATTAAGAACCAGATCTCATGTTATTTTTGAGAAGTTCAA 800
                       **  *** * *  *        ** *  ****   *  **   *  *  *   *  *** 

consensus_10720#0      TGTAACTTCCTTTAATAACATTGGAGTAAATGCCCTCAGCTAGCAGTTCGAAAGTTTTCT 888
consensus_10720#1      ---------CCCTAGTAAGATGTGCAAGAATAGCTTTGTGTTGTAAGTAGGCAGATTGTT 851
                                *  ** *** **  *    ***  * *    * * *  * *  ** **  *

consensus_10720#0      CAATATTTTGGTTAGTAAGTGAAGATGTCTCAATATAGATATAATCACCAAGTCGCTGTG 948
consensus_10720#1      AGGAATCTCTA---------GAGAATATTACG-TATAAA---GCTTACGAAGTCG----- 893
                           ** *            **  ** *  *  **** *     * ** ******     

consensus_10720#0      CAAGAGCCTCTGCTTCAATTTTGGTAACTTGTCTTTCATCACGACGATCAGCCTTATGAC 1008
consensus_10720#1      --AAAATGATAATTT---TTGTGATATTTCGGCTTTGA-----ATGATTAATTTCGGAAA 943
                         * *        **   ** ** **  * * **** *     * *** *   *    * 

consensus_10720#0      CAACTATTATGAACACAGGAGCAGAGCATTTAATTGAAGCACGAGCTTCTTCATACC--A 1066
consensus_10720#1      GGGTTAAGACGAAGTCCAACGTAACGCATTTATT-----CATGAATTGCCTCGTGCCGAA 998
                           **  * ***  *    * *  ******* *     ** **  * * ** * **  *

consensus_10720#0      TTCAGCAACATGGTCAAGTGTCTCCCTGTCAGTAAAATCAAACACAACAACAACACCAAC 1126
consensus_10720#1      TCCTGCCTCGAG------------------------------------------------ 1010
                       * * **  *  *                                                

consensus_10720#0      ACAATTGGTCCTCGA 1141
consensus_10720#1      ---------------
                                      




Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)