These datas are free for academic use only, please contact me for any other use. Schistosoma mansoni see consensus multiple alignment with clustalw Direct access to contigs :
consensusID : consensus_10720#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 6 consensus length = 1141 fasta sequence [ATTTACCTTTTAGAAGAAAAAAACACTGAACATTAAATATTGACAGAGTTAGTAAAAAAATTAATGACATAATTAATGAAACTAACCAAATTTATCTTGATTAATTAAATCAGAAAATTTACAAAATAAAAACAAAACAATAAAAATGACCTATTAGGGAGAGAGATAAAAATAAAATTAATACAAATACAAGA-TTAATTATGTAAGTATAGATGGATCATCAAGGTACAAAGTGATTCAATACTAAAACAGTTCATTAAGCAACTTAAACCAATGTATATATGTGCCTGGTCCTACGTTGTAGCTGATTGAAACAAATCTATACTCAACCATAACCCATATATTTACTAGTGTTTGAACCTAACATTAATTAAATAAGTACCCATGTATTAAAATACACACACAGTGAAGAGAAACACAAGACATATTTATTAAACATA-ACGAATAATAATTACCAATAATATATACCATGTAAAAGTATCAAAGGAAATAAAAAATAAAAATAAAGAATATTA-CCTTTCTTAATAGAATTTGGGTCAAATTAATGTATGGTTGATTAAGTATACGTAATTAATGAAAAATAATGATCAAGTTTCTTGATAGTTAAAAACCAAAAGGAGATTATTCACATATTTTTTTTTGGAAATAACTGTATATGCTAACTGTGTAGAATGCAAGTGGACATTTATATAATAGTTTAACAACAGTCTCCATAAAGTTTTGGTTCATTACTATCAAATTGTATTGATCTACTTGCTAAAGAAGCAGCTAATGCAGCATTATGACCTTGTTTAACACCATCCCAAATACCACCTGCGCATAACTCATTGTAACTTCCTTTAATAACATT-GGAGTAAATGCCCTCAGCTAGCAGTTCGAAAGTTTTCTCAATATTTTGGTTAGTAAGTGAAGATGTCTCAATATAGATATAATCACCAAGTCGCTGTGCAAGAGCCTCTGCTTCAATTTTGGTAACTTGTCTTTCATCACGACGATCAGCCTTATGACCAACTATTATGAACACAGGAGCAGAGCATTTAATTGAAGCACGAGCTTCTTCATACCATTCAGCAACATGGTCAAGTGTCTCCCTGTCAGTAAAATCAAACACAACAACAACACCAACACAATTGGTCCTCGA] [+] EMBL CD075740 [ATTTACCTTTTAGAAGAAAAAAACACTGAACATTAAATATTGACAGAGTTAGTAAAAAAATTAATGACATAATTAATGAAACTAACCAAATTTATCTTGATTAATTAAATCAGAAAATTTACAAAATAAAAACAAAACAATAAAAATGACCTATTAGGGAGAGAGATAAAAATAAAATTAATACAAATACAAGA TTAATTATGTAAGTATAGATGGATCATCAAGGTACAAAGTGATTCAATACTAAAACAGTTCATTAAGCAACTTAAACCAATGTATATATGTGCCTGGTCCTACGTTGTAGCTGATTGAAACAAATCTATACTCAACCATAACCCATATATTTACTAGTGTTTGAACCTAACATTAATTAAATAAGTACCCATGTATTAAAATACACACACAGTGAAGAGAAACACAAGACATATTTATTAAACATA ACGAATAATAATTACCAATAATATATACCATGTAAAAGTATCAAAGGAAATAAAAAATAAAAATAAAGAATATTA CCTTTCTTAATAGAATTTGGGTCAAATTAATGTATGGTTGATTAAGTATACGTAATTAATGAAAAATAATGATCAAGTTTCTTGAT ] [-] EMBL CD082125 [ ATNCNAGATTTAATTATGTAAGTATAGATGGATCATCAAGGTACANAGTGATTCAATACTAAAACAGTTCATTAAGCAACTTAGACCAATGTATATATGTGCCTGGTCCTACGTTGTAGCTGATTGAAACAAATCTATACTCAACCATAACCCATATATTTACTAGTGTTTGAACCTAACATTAATTAAATAAGTACCCATGTATTAAAATACACACACAGTGAAGAGAAACACAAGACATATTTATTAAACATA ACGAATAATAATTACCAATAATATATACCATGTAAAAGTATCAAAGGAAATAAAAAATAAAAATAAAGAATATTA CCTTTCTTAATAGAATTTGGGTCAAATTAATGTATGGTTGATTAAGTATACGTAATTAATGAAAAATAATGATCAAGTTTCTTGATAGTTAAAAACCAAAAGGAGATTATTCACATATTTTTTTTTGGAAATAACTGTATATGCTAACTGTGTAGAATGCAAGTGGACATTTATATAATAGTTTAACAACAGTCTCCATAAAGTTTTGGTTCATTACTATCAAATTATATTGATCTACTTGCTAAAGAAGCAGCTAATGCAGCATTATGACCTTGTTTAACACCATCCCAAATACCACCTGCGCGTAACTCATTGTAACTTAAATTAATAACATT GGAGTAAATGCCCTCAGCTgt ] [+] EMBL CD075796 [ CACAAGACATATTTATTAAACATA ACGAATAATAATTACCAATAATATATACCATGTAAAAGTATCAAAGGAAATAAAAAATAAAAATAAAGAATATTA CCTTTCTTAATAGAATTTGGGTCAAATTAATGTATGGTTGATTAAGTATACGTAATTAATGAAAAATAATGATCAAGTTTCTTGATAGTTAAAAACCAAAAGGAGATTATTCACATATTTTTTTTTGGAAATAACTGTATATGCTAACTGTGTAGAATGCAAGTGGACATTTATATAATAGTTTAACAACAGTCTCCATAAAGTTTTGGTTCATTACTATCAAATTGTATTGATCTACTTGCTAAAGAAGCAGCTAATGCAGCATTATGACCTTGTTTAACACCATCCCAAATACCACCTGCGCATAACTCATTGTAACTTCCTTTAATAACATT GGAGTAAATGCCCTCAGCTAGCAGTTCGAAAGTTTTCTCAATATTTTGGTTAGTAAGTGAAGATGTCTCAATATAGATATAATCACCAAGTCGCTGTGCAAGAGCCTCTGCTTCAATTTTGGTAACTTGTCTTTCATCACGACGATCAGCCTTATGACCAA ] [+] EMBL AA999253 [ CACAAGACATATTTATTAAACATA ACGAATAATAATTACCAATAATATATACCATGTAAAAGTATCAAAGGAAATAAAAAATAAAAATAAAGAATATTA CCTTTCTTAATAGAATTTGGGTCAAATTAATGTATGGTTGATTAAGTATACGTAATTAATGAAAAATAATGATCAAGTTTCTTGATAGTTAAAAACCAAAAGGAGATTATTCACATATTTTTTTTTGGAAATAACTGTATATGCNAACTGTGTAGAATGCAAGTGGACATTTATATAATAGTTTAACAACAGTCTCCATAAAGTTTTGGTTCATTACTATCAAATTGTATTGATCTACTTGCTAAAGAAGCAGCTAATGCAGCATTATGACCTTGTTTAACACCATCCCAAATACCACCTGCGCATAACTCATTGTAACTTCCTTTAATAACATTGGGGGTAAATGCCCTCAGCTAGCAGTTCGAAAGTTTTCTCAATATTTTGGGTAGTAAGTGAAGATGTCCCAA ] [-] EMBL CD082181 [ ncagnnnCATATTTATT AACATACNNGAATAAT ATTACCAATAATATATACCATGTAAAAGTATCAAAGGAAATAAANAATANNAATANAGAAT TTACCCTTTCTTAATAGAATTTGGGTCAAATTAATGTATGGTTGATTAAGTATACGTAATTAATGAAAAATAATGATCAAGTTTCTTGATAGTTAAAAACCAAAAGGAGATTATTCACATATTTTTTTTTGGAAATAACTGTATATGCTAACTGTGTAGAATGCAAGTGGACATTTATATAATAGTTTAACAACAGTCTCCATAAAGTTTTGGTTCATTACTATCAAATTGTATTGATCTACTTGCTAAAGAAGCAGCTAATGCAGCATTATGACCTTGTTTAACACCATCCCAAATACCACCTGCGCATAACTCATTGTAACTTCCTTTAATAACATT GGAGTAAATGCCCTCAGCTAGCAGTTCGAAAGTTTTCTCAATATTTTGGTTAGTAAGTGAAGATGTCTCAATATAGATATAATCACCAAGTCGCTGTGCAAGAGCCTCTGCTTCAATTTTGGTAACTTGTCTTTCATCACGACGATCAGCCTTATGACCAACTATTATGAACACAGGAGCAGAGCATTTAATTGAAGCACGAGCTTCTTCATACCATTCAGCAACATGGTCAAGTGTCTCCCTGTCAGTAAAATCAAACACAACAACAACACCAACACAATTGGTCCTCGA] [+] EMBL AA999495 [ A ACGAATAATAATTACCAATAATATATACCATGTAAAAGTATCAAAGGAAATAAAAAATAAAAATAAAGAATATTA CCTTTCTTAATAGAATTTGGGTCAAATTAATGTATGGTTGATTAAGTATACGTAATTAATGAAAAATAATGATCAAGTTTCTTGATAGTTAAAAACCAAAAGGNGATTATTCACATATTTTTTTTTGGAAATAACTGTATATGTTAACTGTGTAGAATGCAAGTGGACATTTATATAATAGTTTAACAACAGTCTCCATAAAGTTTTGGTTCATTACTATCAAATTGTATTGATCTACTTGCTAAAGAAGCAGCTAATGCAGCATTA ] consensusID : consensus_10720#1 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! 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Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) | ||||