cluster # 10730

These datas are free for academic use only, please contact me for any other use.

Schistosoma mansoni
cluster # 10730 cluster # 10730 Sequences # 20 consensus # 9

see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :

consensus_10730#0 length = 555 sequences # 5
consensus_10730#1 length = 505 sequences # 2
consensus_10730#2 length = 471 sequences # 6
consensus_10730#3 length = 454 sequences # 1

consensus_10730#4 length = 380 sequences # 1
consensus_10730#5 length = 291 sequences # 1
consensus_10730#6 length = 278 sequences # 2
consensus_10730#7 length = 263 sequences # 1
consensus_10730#8 length = 174 sequences # 1

consensusID : consensus_10730#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 5
consensus length = 555
fasta sequence

                              [GAGAAGGAATGTGAGTGAGCCGATGATGATCATGATTTTGAAGAT-GATACATCCATGACCGTGGTGATGAAGATGGCGAGGACGACGAAACTGATGAGTGTGTTGACGGTCACGTGATCACCTTGAGGATGAGCTTGAGAAGGAATGTGAGTGAGCCGATGATGATCATGATTTTGAAGATGGAGACATCCATGACCGTGATGAAGAAGATGGCGAGGACGACGAAACTGATGAGTGTGTTGACGGTCACGTGATCACCTTGAGGATGAGCTTGAGAAGGAATGTGAGTGAGCCGATGATGATCATGATTTTGAAGATGGAGACATCCATGACCGTGGTGATGAAGATGGCGAGGACGACGAAACTGATGAGTGTGTTGACGGTCACGTGATCACCTTGAGGATGAGCTTGAGAAGGAATGTGAGTGAGCCGATGATGATCA-TGATTTTGAAGATGGAGACATCCATGACCGTGGTGATGAAGATGGCGAGGACGACGAAACTGATGAGTGTGTTGACGGTCACGTGATCACCTTGAGGATGAGCTTGAGAAGGA]

[+] EMBL CD088968             [GAGAAGGAATGTGAGTGAGCCGATGATGATCATGATTTTGAAGAT GATACATCCATGACCGTGGTGATGAAGATGGAGAGGACGACGAAACTAATGAGGGTGTTGACGGTCACGTGATCACCTTGAGGATGAGCTTGAGAAGGAATGTGAGTGAGCCGATGATGATCATGATTTTGAAGATGGAGACATCCATGACCGTGATGAAGAAGATGGCGAGGACGACGAAACTGATGAGTGTGTTGACGGTCACGTGATCACCTTGAGGATGAGCTTGAGAAGGAATGTGAGTGAGCCGATGATGATCATGATTTTGAAGATGGAGACATCCATGACCGTGGTGATGAAGATGGCGAGGACGACGAAACTGATGAGTGTGTTGACGGTCACGTGATCACCTTGAGGATGAGCTTGAGAAGGAATGTGAGTGAGCCGATGATGATCA TGATTTTGAAGATGGAGACATCCATGACCGTGGTGATGAAAATGGCGAGGACGACAAAACTGATGAGTGTGTTGACGGTCACGTGATCACCTTGAGG                ]
[+] EMBL CD191417             [                                          GATGGAGACATCCACGACCGTGGTGATGAAGATGGCGAGGACGACGAAACTGATGAGTGTGTTGACGGTCACGTGATCACCTTGAGGATGAGCTTGTGAAGGAATGTGAGTGAGCCGATGATGATCATGATTTTGAAGATGGAGACATCCATGACCGTGATGAAGAAGATGGCGAGGACGACGAAACTGATGAGTGTGTTGACGGTCACGTGATCACCTTGAGGATGAGCTTGAGAAGGAATGTGAGTGAGCCGATGATGATCATGATTTTGAAGATGGAGACATC                                                                                                                                                                                                                                     ]
[+] EMBL CD090209             [                                                               gaTGAAGAAGATGGCGAGGACGACGAAACTGATGAGTGTGTTGACGGTCACGTGATCACCTTGAGGATGAGCTTGAGAAGGAATGTGAGTGAGCCGATGATGATCATGATTTTGAAGATGAAGATATCCATGACCGTGGTGATGAAGATGGCACGGACGACGAAACTGATGAGTGTGTTGACGGTCACGTGATCACCTTGAGGATGAGCTTGAGAAGGAATGTGAGTGAGCCGATGATGATCATGATTTTGAAGATGGAGACATCCATGACCGTGATGAAGAAGATGGCGAGGACGACGAAACTGATGAGTGTGTTGACGGTCACGTGATCACCTTGAGGATGAGCTTGAGAAGGAATGTGAGTGAGCCGATGATGATCA TGATTTTGAAGATGAAGATATCCATGACCGTGGTGATGAAGATGGCACGGACGACGAAACTGATGAGTGTGTTGACGGTCACGTGA                           ]
[-] EMBL CD096793             [                                                                   ATGAAGATGGCGAGGACGACGAAACTGATGAGTGTGTTGACGGTCACGTGATCACCTTGAGGATGAGCTTGAGAAGGAATGTGAGTGAGCCGATGATGATCATGATATTGAAGATGGAGACATCCATGCCCGTGATGAAGAAGATGGCGAGGACGACGAAACTGATGAGTGTGTTGACGGTCACGTGATCACCTTGAGGATGAGCTTGAGAAGGAATGTGAGTGAGCCGATGATGATCATGATTTTGAAGAT GATACATCCATGACCGTGATGATGAAAATGGCGCGGTCGATGAAACTGATGAGTGTGTTGACGGTCACGTGATCACCTTGAGGATGAGCTTGAGAAGGAATGTGAGTGAGCCGATGAT AACAGTGATTTTGAAGATGGAGACATCCATGACCGTGGTGATGAAGATGGCGAGGACGACGAAACTGATGAGTGTGTTGACGGTCACGTGATCACCTTGAGGATGAGCTTGAGAAGGA]
[+] EMBL CD191400             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                           ATGATCATGATTTTGAAGACGGAGACATCCATGACCGTGGTGATGAAGATGGCGAGGACG CACAACAGATGAGTGTGTTGACGGTCACGTGATCACCTTGAGGATGAGCTTGAGAAGGAATGTGAGTGAGCCGATGATGATCA TGATTTTGAAGATGAAGACATC                                                                                           ]




>consensus_10730#0
GAGAAGGAATGTGAGTGAGCCGATGATGATCATGATTTTGAAGATGATACATCCATGACC
GTGGTGATGAAGATGGCGAGGACGACGAAACTGATGAGTGTGTTGACGGTCACGTGATCA
CCTTGAGGATGAGCTTGAGAAGGAATGTGAGTGAGCCGATGATGATCATGATTTTGAAGA
TGGAGACATCCATGACCGTGATGAAGAAGATGGCGAGGACGACGAAACTGATGAGTGTGT
TGACGGTCACGTGATCACCTTGAGGATGAGCTTGAGAAGGAATGTGAGTGAGCCGATGAT
GATCATGATTTTGAAGATGGAGACATCCATGACCGTGGTGATGAAGATGGCGAGGACGAC
GAAACTGATGAGTGTGTTGACGGTCACGTGATCACCTTGAGGATGAGCTTGAGAAGGAAT
GTGAGTGAGCCGATGATGATCATGATTTTGAAGATGGAGACATCCATGACCGTGGTGATG
AAGATGGCGAGGACGACGAAACTGATGAGTGTGTTGACGGTCACGTGATCACCTTGAGGA
TGAGCTTGAGAAGGA

consensusID : consensus_10730#1
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 2
consensus length = 505
fasta sequence

                              [GAAGATGGCGTGGACGACGAAACTGATGAGTGTGTTGACGGTCACGTGATCACTCTGAGGATGACCTTGAGAAGGAATGTGAGTGAGCCGATGATGAACATGATTTTGAAGATGGTGAAGATGATTTCCATAGTGGTGATTGTGGTGCTGCTGCTGGTGGTGATGAAGATGGCGCGGACGACGATACTGATGAGTGTGTTGACGGTCACGCGATCTCCCTGAGGATGACCATGAGAAGGAATGTGAGTGAGCCGATGATAAACATGATTTTGAAGATAGTGAAGATGATTTCCATAATGGTGATTGTGGTGCTGGTGCTGGTGGTGATGAAGACGGCGCGGACGACGATACTGATGAGTGTGTTGACGGTCACGCGATCTCCCTGAGGATGACCTTGAGATGGAATGTGAGTGAGCCGATGATAAACATGATTTTGAAGATGGCGACGATGATTTCCATAATTGTGATTGTGGTGCTGATGGTGATGAAGATGGCGCGGACGACG]

[+] EMBL CD122120             [GAAGATGGCGTGGACGACGAAACTGATGAGTGTGTTGACGGTCACGTGATCACTCTGAGGATGACCTTGAGAAGGAATGTGAGTGAGCCGATGATGAACATGATTTTGAAGATGGTGAAGATGATTTCCATAGTGGTGATTGTGGTGCTGCTGCTGGTGGTGATGAAGATGGCGCGGACGACGATACTGATGAGTGTGTTGACGGTCACGCGATCTCCCTGAGGATGACCATGAGAAGGAATGTGAGTGAGCCGATGATAAACATGATTTTGAAGATAGTGAAGATGATTTCCATAATGGTGATTGTGGTGCTGGTGCTGGTGGTGATGAAGACGGCGCGGACGACGATACTGATGAGTGTGTTGACGGTCACGCGATCTCCCTGAGGATGACCTTGAGATGGAATGTGAGTGAGCCGATGATAAACATGATTTTGAAGATGGCGACGATGATTTCCATAATTGTGATTGTGGTGCTGATGGTGATGAAGATGGCGCGGACGACG]
[+] EMBL CD122080             [GAAGATGGCGTGGACGACGAAACTGATGAGTGTGTTGACGGTCACGTGATCACTCTGAGGATGACCTTGAGAAGGAATGTGAGTGAGCCGATGATGAACATGATTTTGAAGATGGTGAAGATGATTTCCATAGTGGTGATTGTGGTGCTGCTGCTGGTGGTGATGAAGATGGCGCGGACGACGATACTGATGAGTGTGTTGACGGTCACGCGATCTCCCTGAGGATGACCATGAGAAGGAATGTGAGTGAGCCGATGATAAACATGATTTTGAAGATAGTGAAGATGATTTCCATAATGGTGATTGTGGTGCTGGTGCTGGTGGTGATGAAGATGGCGCGGACGACGATACTGATGAGTGTGTTGACGGGCACTCGATCTCCCTGAGGA                                                                                                                    ]




>consensus_10730#1
GAAGATGGCGTGGACGACGAAACTGATGAGTGTGTTGACGGTCACGTGATCACTCTGAGG
ATGACCTTGAGAAGGAATGTGAGTGAGCCGATGATGAACATGATTTTGAAGATGGTGAAG
ATGATTTCCATAGTGGTGATTGTGGTGCTGCTGCTGGTGGTGATGAAGATGGCGCGGACG
ACGATACTGATGAGTGTGTTGACGGTCACGCGATCTCCCTGAGGATGACCATGAGAAGGA
ATGTGAGTGAGCCGATGATAAACATGATTTTGAAGATAGTGAAGATGATTTCCATAATGG
TGATTGTGGTGCTGGTGCTGGTGGTGATGAAGACGGCGCGGACGACGATACTGATGAGTG
TGTTGACGGTCACGCGATCTCCCTGAGGATGACCTTGAGATGGAATGTGAGTGAGCCGAT
GATAAACATGATTTTGAAGATGGCGACGATGATTTCCATAATTGTGATTGTGGTGCTGAT
GGTGATGAAGATGGCGCGGACGACG

consensusID : consensus_10730#2
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 6
consensus length = 471
fasta sequence

                              [TGATGAACATGATTTTGAAGCATGGCGACGATGATTTCCTTAGTGGTGATTGTGACGCTGGTGCTGTTGGTGATAAAAATGGCGCGGACGACAAAACTGATGAGTGTGTTGACGGTCACGTGATCACTCTGAGGATGACCTTGAGAAGGAATGTGAGTGAGCCGATGATGAACATGATTTCGAAGATGGCGACGATGATTTCCTTAGTGGTGTTGGTGGTGAAGATGGCGCGGACGACGAAACTGATGAGTGTGTTGACGGTCACGAGATCTCCCTGAGGATGACCTTGAGAAGGAATGTGAGTGAGTCGATGATGAACATGATTTTGAAGATGGCGACGATGATTTCCATAGTGGTGTTGGTGGTGAAGATGGCGCGGACGACGAAACTGATGAGTGTGTTGACGGTCACGTGATCACTCTGAGGATGACCTTGAGAAGGAATGTGAGTGAGTCGATGATGAACATGATT]

[+] EMBL CD126842             [TGATGAACATGATTTTGAAGCATGGCGACGATGATTTCCTTAGTGGTGATTGTGACGCTGGTGCTGTTGGTGATAAAAATGGCGCGGACGACAAAACTGATGAGTGTGTTGACGGTCACGTGATCACTCTGAGGATGACCTTGATAAGGAATGTGAGTGACCCGATGATGAACATGATTTTGAAGATGGCGACGATGATTTCCTTAGTGGTGTTGGTGGTGAAGATGGCGCGGACGACAAAACCGATGAGTGTGTTGACGGTCACGTGATCACCCTGAGGATGACCTTGAGAAGGAATGTGAGTGAGCCGATGGTGAACATGATTTCGAAGATGGCGACGATGATTTCCTTAGTGGTGTTGGTGGTGAAGATGGCGCGGACGACGAAACTGATGAGTGTGTTGACGGTCACGTGATCACTCTGAGGATGACCTTGAGAAGGAATGTGAGTGAGTCGATGATGAACATGATT]
[+] EMBL CD126831             [TGATGAACATGATTTTGAAGCATGGCGACGATGATTTCCTTAGTGGTGATTGTGACGCTGGTGCTGTTGGTGATAAAGATGGCGCGGACGACAAAACTGATGAGTGTGTTGACGGTCACGTGATCACTCTGAGGATGACCTTGATAAGGAATGTGAGTGAGCCGATGATGAACATGATTTTGAAGATGGCGACGATGATTTCCTTAGTGGTGTTGGTGGT                                                                                                                                                                                                                                                           ]
[+] EMBL CD156907             [                                                                                                     GAGTGTGTTGACGGTCACGTGATCACTCTGAGGATGACCTTGAGAAGGAATGTGAGTGAGCCGATGATAAAGATGATTTCGAAGATGGCGACGATGATTTCCTTAGTGGTGTTGGTGGTGAAGATGGCGCGGACGACGAAACCGATGAGTGTGTTGACGGTCACGTGATCACCCTGAGGATGACCTTGAGAAGGAATGTGAGTGAGTCGATGATGAAGATGATTTTGAAGATGGCGACGATGATTTCCATAGTGGTGTTGGTGGTGAAGATGGCGCGGACGACGATACTGAT                                                                              ]
[+] EMBL CD121757             [                                                                                                                               TCTGAGGATGACCTTGAGAAGGAATGTGAGTGAGCCGATGATGAACATGATTTCGAAGATGGCGACGACGATTTCCTTAGTGGTGTTGGTGGTGAAGATGGCGCGGACGACGAAACTGATGAGTGTGTTGACGGTCACGAGATCTCCCTGAGGATGACCTTGAGAAGGAATGTGAGTGAGTCGATGATGAACATGATTTTGAAGATGGCGACGATGATTTCCATAGTGGTG                                                                                                                 ]
[+] EMBL CD121195             [                                                                                                                               TCTGAGGATGACCTTGAGAAGGAATGTGAGTGAGCCGATGATGAACATGATTTCGAAGATGGCGACGATGATTTCCTTAGCGGTGTTGGTGGTGAAGATGGCGCGGACGACGAAACTGATGAGTGTGTTGACGGTCACGAGATCTCCCTGAGGATGACCTTGAGAAGGAATGTGAGTGAGTCGATGATGAACATGATTTTGAAGATGGCGACGATGATTTCCATAGTGGTG                                                                                                                 ]
[-] EMBL CD121271             [                                                                                                                                CTGAGGATGACCTTGAGAAGGAATGTGAGTGAGCCGATGATGAACATGATTTCGGAGATGGCGACGATGATTTCCTTAGTGGTGTTGGTGGTGAAGATGGCGCGGACGACGAAACTGATGAGTGTGTTGACGGTCACGAGATCTCCCTGAGGATGACCTTGAGAAGGAATGTGAGTGAGTCGATGATGAACATGATTTTGAAGATGGCGACGATGATTTCCATAGTGGTGa                                                                                                                ]




>consensus_10730#2
TGATGAACATGATTTTGAAGCATGGCGACGATGATTTCCTTAGTGGTGATTGTGACGCTG
GTGCTGTTGGTGATAAAAATGGCGCGGACGACAAAACTGATGAGTGTGTTGACGGTCACG
TGATCACTCTGAGGATGACCTTGAGAAGGAATGTGAGTGAGCCGATGATGAACATGATTT
CGAAGATGGCGACGATGATTTCCTTAGTGGTGTTGGTGGTGAAGATGGCGCGGACGACGA
AACTGATGAGTGTGTTGACGGTCACGAGATCTCCCTGAGGATGACCTTGAGAAGGAATGT
GAGTGAGTCGATGATGAACATGATTTTGAAGATGGCGACGATGATTTCCATAGTGGTGTT
GGTGGTGAAGATGGCGCGGACGACGAAACTGATGAGTGTGTTGACGGTCACGTGATCACT
CTGAGGATGACCTTGAGAAGGAATGTGAGTGAGTCGATGATGAACATGATT

consensusID : consensus_10730#3
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 1
consensus length = 454
fasta sequence

                              [ATAGATGGCGACTATGATTCCCATAGTGGTGATTGTGGTGGCGGTGATGGGGATGAAGATGGCGCGGACGACGACACTGATGAGTGTGTTGACGGTCACGTGATCACCTTGAGGATGACCTTGAGAAGGAATGTGAGTGAGCCGATGATGAAGATGATTTTGAAGATGGCGACGATGATTTCCATACTGGTGATTGTGGTGGTGGTGTTGATGGTGATGAAGATGGCGCGGACGACGACACTGATGAGTGTGTTGACGGCCACGTGGTTACTCTGAGGATGACCTTGAGAAGGAATGTGAGTGAGCCGCTGATGATCATGATTTCGAAGATGGCGACGATGATTTCCATAGTGGTGATTGTGGTGGTGGTGTTGATGGTGATGAAGATGGCGCGGACGACGACACTGATGAGTGTGTTGACGGCCACGTGGTTCCTCTGAGGATGACCTTGACA]

[+] EMBL CD115536             [ATAGATGGCGACTATGATTCCCATAGTGGTGATTGTGGTGGCGGTGATGGGGATGAAGATGGCGCGGACGACGACACTGATGAGTGTGTTGACGGTCACGTGATCACCTTGAGGATGACCTTGAGAAGGAATGTGAGTGAGCCGATGATGAAGATGATTTTGAAGATGGCGACGATGATTTCCATACTGGTGATTGTGGTGGTGGTGTTGATGGTGATGAAGATGGCGCGGACGACGACACTGATGAGTGTGTTGACGGCCACGTGGTTACTCTGAGGATGACCTTGAGAAGGAATGTGAGTGAGCCGCTGATGATCATGATTTCGAAGATGGCGACGATGATTTCCATAGTGGTGATTGTGGTGGTGGTGTTGATGGTGATGAAGATGGCGCGGACGACGACACTGATGAGTGTGTTGACGGCCACGTGGTTCCTCTGAGGATGACCTTGACA]




>consensus_10730#3
ATAGATGGCGACTATGATTCCCATAGTGGTGATTGTGGTGGCGGTGATGGGGATGAAGAT
GGCGCGGACGACGACACTGATGAGTGTGTTGACGGTCACGTGATCACCTTGAGGATGACC
TTGAGAAGGAATGTGAGTGAGCCGATGATGAAGATGATTTTGAAGATGGCGACGATGATT
TCCATACTGGTGATTGTGGTGGTGGTGTTGATGGTGATGAAGATGGCGCGGACGACGACA
CTGATGAGTGTGTTGACGGCCACGTGGTTACTCTGAGGATGACCTTGAGAAGGAATGTGA
GTGAGCCGCTGATGATCATGATTTCGAAGATGGCGACGATGATTTCCATAGTGGTGATTG
TGGTGGTGGTGTTGATGGTGATGAAGATGGCGCGGACGACGACACTGATGAGTGTGTTGA
CGGCCACGTGGTTCCTCTGAGGATGACCTTGACA

consensusID : consensus_10730#4
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 1
consensus length = 380
fasta sequence

                              [GATGAAGATGGTGCGGACGACGAAACTGATGAGTGTGTTGACGGTCACGTGCTCACCTTGAGGATGACCTTGAGAAGGAATGTGAGTGAGTCGATGACGAGGATGATTTTGAAGATGGCGACGATGATTTCCATAGTGGTGATTGTGGTGGTGCTGGTGGTGGTGGTGATGAAGTTGACGCGGAGGACGAAACTGATGAGTGTGTTGACGGTCACGTGATCACTCTGAGGATGACTTTGAGAAGGAATGTGAGTGAGTCAATGACGAAGATGATTTTGAAGATGGCGACGATGATTTCCATAGTGGTGATTGTGGTGGTGGTGGTGATGGTGATGAAGATGATGCGGACGACGAAATTGACGAGTGTGTTGACGGTCACG]

[+] EMBL CD128150             [GATGAAGATGGTGCGGACGACGAAACTGATGAGTGTGTTGACGGTCACGTGCTCACCTTGAGGATGACCTTGAGAAGGAATGTGAGTGAGTCGATGACGAGGATGATTTTGAAGATGGCGACGATGATTTCCATAGTGGTGATTGTGGTGGTGCTGGTGGTGGTGGTGATGAAGTTGACGCGGAGGACGAAACTGATGAGTGTGTTGACGGTCACGTGATCACTCTGAGGATGACTTTGAGAAGGAATGTGAGTGAGTCAATGACGAAGATGATTTTGAAGATGGCGACGATGATTTCCATAGTGGTGATTGTGGTGGTGGTGGTGATGGTGATGAAGATGATGCGGACGACGAAATTGACGAGTGTGTTGACGGTCACG]




>consensus_10730#4
GATGAAGATGGTGCGGACGACGAAACTGATGAGTGTGTTGACGGTCACGTGCTCACCTTG
AGGATGACCTTGAGAAGGAATGTGAGTGAGTCGATGACGAGGATGATTTTGAAGATGGCG
ACGATGATTTCCATAGTGGTGATTGTGGTGGTGCTGGTGGTGGTGGTGATGAAGTTGACG
CGGAGGACGAAACTGATGAGTGTGTTGACGGTCACGTGATCACTCTGAGGATGACTTTGA
GAAGGAATGTGAGTGAGTCAATGACGAAGATGATTTTGAAGATGGCGACGATGATTTCCA
TAGTGGTGATTGTGGTGGTGGTGGTGATGGTGATGAAGATGATGCGGACGACGAAATTGA
CGAGTGTGTTGACGGTCACG

consensusID : consensus_10730#5
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 1
consensus length = 291
fasta sequence

                              [TTAACGGTCACGTGATCACCTTGAGGATGAGCTTGAGAAGGAATGTGAGAGAGCCGATGATGATCATGATTTTGAAGATAATACATCCATGACTCTGATGATGAAGATGGCGCGGTCGATGAAACTCATGAGTGTGTTTACGGTCACGTGATCACCTTGAGGATGAGCTTTAGAAGGAATGTGAGTGAGCCCATGGTGAACGTTATTTTGTAGATGTCGACGATGATTTCCATAGTGGTGTTTGTTGTGGCTTTGGTAATGAAATAGGCGAGGGCGACGAAACTGATGAGT]

[-] EMBL CD182717             [TTAACGGTCACGTGATCACCTTGAGGATGAGCTTGAGAAGGAATGTGAGAGAGCCGATGATGATCATGATTTTGAAGATAATACATCCATGACTCTGATGATGAAGATGGCGCGGTCGATGAAACTCATGAGTGTGTTTACGGTCACGTGATCACCTTGAGGATGAGCTTTAGAAGGAATGTGAGTGAGCCCATGGTGAACGTTATTTTGTAGATGTCGACGATGATTTCCATAGTGGTGTTTGTTGTGGCTTTGGTAATGAAATAGGCGAGGGCGACGAAACTGATGAGT]




>consensus_10730#5
TTAACGGTCACGTGATCACCTTGAGGATGAGCTTGAGAAGGAATGTGAGAGAGCCGATGA
TGATCATGATTTTGAAGATAATACATCCATGACTCTGATGATGAAGATGGCGCGGTCGAT
GAAACTCATGAGTGTGTTTACGGTCACGTGATCACCTTGAGGATGAGCTTTAGAAGGAAT
GTGAGTGAGCCCATGGTGAACGTTATTTTGTAGATGTCGACGATGATTTCCATAGTGGTG
TTTGTTGTGGCTTTGGTAATGAAATAGGCGAGGGCGACGAAACTGATGAGT

consensusID : consensus_10730#6
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 2
consensus length = 278
fasta sequence

                              [TTGACGGTCACGTGGTCACTCTGAGGATGACCTTGAGAAGGAATGTGAGTGAGTCGATGATAAACATGATTTTGAAGATGGCGACGATGATTTCCATAGTGGTGATTGTGGTGCTGGTGCTGGTGGTGATGAAGATGGCGCGGACGACGAAACTGATGAGTGTGTTGACGGTCACGTGATCACCCTGAGGATGACCTTGAGAAGGAATGTGAGTGAGCTGATGATAAACATGATTTTGAAGATGGCGACGATGATTTCCATAATTGTGCCTTTATACC]

[-] EMBL CD128263             [TTGACGGTCACGTGGTCACTCTGAGGATGACCTTGAGAAGGAATGTGAGTGAGTCGATGATAAACATGATTTTGAAGATGGCGACGATGATTTCCATAGTGGTGATTGTGGTGCTGGTGCTGGTGGTGATGAAGATGGCGCGGACGACGAAACTGATGAGTGTGTTGACGGTCACGTGATCACCCTGAGGATGACCTTGAGAAGGAATGTGAGTGAGCTGATGATAAACATGATTTTGAAGATGGCGACGATGATTTCCATAATTGTGCCTTTATACC]
[+] EMBL CD121143             [                   cCTGAGGATGACCTTGAGAAGGAATGTGAGTGAGTCGATGATGAACATGATTTTGAAGATGGCGACGATGATTTCCTTAGTGGTGATTGTGGTGCTGGTGCTGGTGGTGGTGAAGATGGCGCGGACGACGAAACTGATGAGTGTGTTGACGGTCACGTGATC                                                                                                 ]




>consensus_10730#6
TTGACGGTCACGTGGTCACTCTGAGGATGACCTTGAGAAGGAATGTGAGTGAGTCGATGA
TAAACATGATTTTGAAGATGGCGACGATGATTTCCATAGTGGTGATTGTGGTGCTGGTGC
TGGTGGTGATGAAGATGGCGCGGACGACGAAACTGATGAGTGTGTTGACGGTCACGTGAT
CACCCTGAGGATGACCTTGAGAAGGAATGTGAGTGAGCTGATGATAAACATGATTTTGAA
GATGGCGACGATGATTTCCATAATTGTGCCTTTATACC

consensusID : consensus_10730#7
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 1
consensus length = 263
fasta sequence

                              [NATGGCACGTTGATGAAGATGATTTCGAAGATGGCGACGATGATTTCCATAGTGGTGATTGTGGTGGTGGTGATGGTGATGAAGATGGCGCGGACGACGACACTGATGAGTGTGTTGACGGTCTTGTGATCACCTTGAGGATGACCTTGAGAAGGAATGTGAGTGATCCGATGATGATGATGATTTTGAAGATGGCGACGATGATTTCCATACTGGTGATTGTGGTGGTGGTGCTGCTGGCGATGAAGATGCCGCGCACGACG]

[+] EMBL CD115239             [NATGGCACGTTGATGAAGATGATTTCGAAGATGGCGACGATGATTTCCATAGTGGTGATTGTGGTGGTGGTGATGGTGATGAAGATGGCGCGGACGACGACACTGATGAGTGTGTTGACGGTCTTGTGATCACCTTGAGGATGACCTTGAGAAGGAATGTGAGTGATCCGATGATGATGATGATTTTGAAGATGGCGACGATGATTTCCATACTGGTGATTGTGGTGGTGGTGCTGCTGGCGATGAAGATGCCGCGCACGACG]




>consensus_10730#7
NATGGCACGTTGATGAAGATGATTTCGAAGATGGCGACGATGATTTCCATAGTGGTGATT
GTGGTGGTGGTGATGGTGATGAAGATGGCGCGGACGACGACACTGATGAGTGTGTTGACG
GTCTTGTGATCACCTTGAGGATGACCTTGAGAAGGAATGTGAGTGATCCGATGATGATGA
TGATTTTGAAGATGGCGACGATGATTTCCATACTGGTGATTGTGGTGGTGGTGCTGCTGG
CGATGAAGATGCCGCGCACGACG

consensusID : consensus_10730#8
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 1
consensus length = 174
fasta sequence

                              [AACAGATGAGTGTGTTGACGGTCACGTGATCACCTTGAGGATGAGCTTGAGAAGGAATGTGAGTGAGCCGATGATGATCATGATTTGAAGATGTCGACGATTATTTCCATAGTGGTGTTTTTGTGGCTTTGGTAATGAATTAGGCGAGGACGACGAAACTGATGAGTGTGTTGA]

[+] EMBL CD155725             [AACAGATGAGTGTGTTGACGGTCACGTGATCACCTTGAGGATGAGCTTGAGAAGGAATGTGAGTGAGCCGATGATGATCATGATTTGAAGATGTCGACGATTATTTCCATAGTGGTGTTTTTGTGGCTTTGGTAATGAATTAGGCGAGGACGACGAAACTGATGAGTGTGTTGA]




>consensus_10730#8
AACAGATGAGTGTGTTGACGGTCACGTGATCACCTTGAGGATGAGCTTGAGAAGGAATGT
GAGTGAGCCGATGATGATCATGATTTGAAGATGTCGACGATTATTTCCATAGTGGTGTTT
TTGTGGCTTTGGTAATGAATTAGGCGAGGACGACGAAACTGATGAGTGTGTTGA

consensus multiple alignement with clustalw

CLUSTAL W (1.82) multiple sequence alignment


consensus_10730#3      ------------------------------------------------------------
consensus_10730#7      ------------------------------------------------------------
consensus_10730#4      ------------------------------------------------------------
consensus_10730#1      -----------------------------------------GAAGATGGCGTGGACGACG 19
consensus_10730#6      ------------------------------------------------------------
consensus_10730#2      ------------------------------------------------------------
consensus_10730#8      ------------------------------------------------------------
consensus_10730#0      GAGAAGGAATGTGAGTGAGCCGATGATGATCATGATTTTGAAGATGATACATCCATGACC 60
consensus_10730#5      ------------------------------------------------------------
                                                                                   

consensus_10730#3      ------------------------------------------------------------
consensus_10730#7      ------------------------------------------------------------
consensus_10730#4      ------------------------------------------------------------
consensus_10730#1      AAACTGATGAGTGTGTTGACGGTCACGTGATCACTCTGAGGATGACCTTGAGAAGGAATG 79
consensus_10730#6      ------------------------------------------------------------
consensus_10730#2      ------------------------------------------------------------
consensus_10730#8      ------------------------------------------------------------
consensus_10730#0      GTGGTGATGAAGATGGCGAGGACGACGAAACTGATGAGTGTGTTGACGGTCACGTGATCA 120
consensus_10730#5      ------------------------------------------------------------
                                                                                   

consensus_10730#3      -------------------------------A-TAGATGGCGACTATGATTCCCATAGTG 28
consensus_10730#7      ------------------------------------------------------------
consensus_10730#4      ------------------------------------------------------------
consensus_10730#1      TGAGTGAGCCGATGATGAACATGATTTTGAAG-ATGGTGAAGATGATTTCCATAGTGGTG 138
consensus_10730#6      ------------------------------------------------------------
consensus_10730#2      ------------TGATGAACATGATTTTGAAGCATGGCGACGATGATTTCCTTAGTGGTG 48
consensus_10730#8      ------------------------------------------------------------
consensus_10730#0      CCTTGAGGATGAGCTTGAGAAGGAATGTGAGT-GAGCCGATGATGATCATGATTTTGAAG 179
consensus_10730#5      ------------------------------------------------------------
                                                                                   

consensus_10730#3      GTGATTGTGGTGGCGGTGATGGGGATGAAGATGGCGCGGACGACGACACTGATGAGTGTG 88
consensus_10730#7      ------------------------------------------------------------
consensus_10730#4      -----------------------GATGAAGATGGTGCGGACGACGAAACTGATGAGTGTG 37
consensus_10730#1      ATTGTGGTGCTGCTGCTGGTGGTGATGAAGATGGCGCGGACGACGATACTGATGAGTGTG 198
consensus_10730#6      ------------------------------------------------------------
consensus_10730#2      ATTGTGACGCTGGTGCTGTTGGTGATAAAAATGGCGCGGACGACAAAACTGATGAGTGTG 108
consensus_10730#8      ------------------------------------------------------------
consensus_10730#0      ATGGAGACATCCATGACCGTGATGAAGAAGATGGCGAGGACGACGAAACTGATGAGTGTG 239
consensus_10730#5      ------------------------------------------------------------
                                                                                   

consensus_10730#3      TTGACGGTCACGTGATCACCTTGAGGATGACCTTGAGAAGGAATGTGAGTGAGCCGATGA 148
consensus_10730#7      -----------------------------------------------NATGGCACGTTGA 13
consensus_10730#4      TTGACGGTCACGTGCTCACCTTGAGGATGACCTTGAGAAGGAATGTGAGTGAGTCGATGA 97
consensus_10730#1      TTGACGGTCACGCGATCTCCCTGAGGATGACCATGAGAAGGAATGTGAGTGAGCCGATGA 258
consensus_10730#6      TTGACGGTCACGTGGTCACTCTGAGGATGACCTTGAGAAGGAATGTGAGTGAGTCGATGA 60
consensus_10730#2      TTGACGGTCACGTGATCACTCTGAGGATGACCTTGAGAAGGAATGTGAGTGAGCCGATGA 168
consensus_10730#8      ------------------------------------------------------------
consensus_10730#0      TTGACGGTCACGTGATCACCTTGAGGATGAGCTTGAGAAGGAATGTGAGTGAGCCGATGA 299
consensus_10730#5      TTAACGGTCACGTGATCACCTTGAGGATGAGCTTGAGAAGGAATGTGAGAGAGCCGATGA 60
                                                                                   

consensus_10730#3      TGAAGATGATTTTGAAGATGGCGACGATGATTTCCATACTGGTGATTGTGGTGGTG---G 205
consensus_10730#7      TGAAGATGATTTCGAAGATGGCGACGATGATTTCCATAGTGGTGATTGTGGTGGTG---G 70
consensus_10730#4      CGAGGATGATTTTGAAGATGGCGACGATGATTTCCATAGTGGTGATTGTGGTGGTGCTGG 157
consensus_10730#1      TAAACATGATTTTGAAGATAGTGAAGATGATTTCCATAATGGTGATTGTGGTGCTG---G 315
consensus_10730#6      TAAACATGATTTTGAAGATGGCGACGATGATTTCCATAGTGGTGATTGTGGTGCTG---G 117
consensus_10730#2      TGAACATGATTTCGAAGATGGCGACGATGATTTCCTTAGTGGTGTT-------------- 214
consensus_10730#8      ------------------------------------------------------------
consensus_10730#0      TGATCATGATTTTGAAGATGGAGACA------TCCATGACCGTG---------------- 337
consensus_10730#5      TGATCATGATTTTGAAGATA-ATACA------TCCATGACTCTG---------------- 97
                                                                                   

consensus_10730#3      TGTTGATGGTGATGAAGATGGCGCGGACGACGACACTGATGAGTGTGTTGACGGCCACGT 265
consensus_10730#7      ---TGATGGTGATGAAGATGGCGCGGACGACGACACTGATGAGTGTGTTGACGGTCTTGT 127
consensus_10730#4      TGGTGGTGGTGATGAAGTTGACGCGGAGGACGAAACTGATGAGTGTGTTGACGGTCACGT 217
consensus_10730#1      TGCTGGTGGTGATGAAGACGGCGCGGACGACGATACTGATGAGTGTGTTGACGGTCACGC 375
consensus_10730#6      TGCTGGTGGTGATGAAGATGGCGCGGACGACGAAACTGATGAGTGTGTTGACGGTCACGT 177
consensus_10730#2      -------GGTGGTGAAGATGGCGCGGACGACGAAACTGATGAGTGTGTTGACGGTCACGA 267
consensus_10730#8      ---------------------------------AACAGATGAGTGTGTTGACGGTCACGT 27
consensus_10730#0      --------GTGATGAAGATGGCGAGGACGACGAAACTGATGAGTGTGTTGACGGTCACGT 389
consensus_10730#5      --------ATGATGAAGATGGCGCGGTCGATGAAACTCATGAGTGTGTTTACGGTCACGT 149
                                                         **  *********** **** *  * 

consensus_10730#3      GGTTACTCTGAGGATGACCTTGAGAAGGAATGTGAGTGAGCCGCTGATGATCATGATTTC 325
consensus_10730#7      GATCACCTTGAGGATGACCTTGAGAAGGAATGTGAGTGATCCGATGATGATGATGATTTT 187
consensus_10730#4      GATCACTCTGAGGATGACTTTGAGAAGGAATGTGAGTGAGTCAATGACGAAGATGATTTT 277
consensus_10730#1      GATCTCCCTGAGGATGACCTTGAGATGGAATGTGAGTGAGCCGATGATAAACATGATTTT 435
consensus_10730#6      GATCACCCTGAGGATGACCTTGAGAAGGAATGTGAGTGAGCTGATGATAAACATGATTTT 237
consensus_10730#2      GATCTCCCTGAGGATGACCTTGAGAAGGAATGTGAGTGAGTCGATGATGAACATGATTTT 327
consensus_10730#8      GATCACCTTGAGGATGAGCTTGAGAAGGAATGTGAGTGAGCCGATGATGATCATGATTT- 86
consensus_10730#0      GATCACCTTGAGGATGAGCTTGAGAAGGAATGTGAGTGAGCCGATGATGATCATGATTTT 449
consensus_10730#5      GATCACCTTGAGGATGAGCTTTAGAAGGAATGTGAGTGAGCCCATGGTGAACGTTATTTT 209
                       * *  *  *********  ** *** *************     **   *   * **** 

consensus_10730#3      GAAGATGGCGACGATGATTTCCATAGTGGTGATTGTGGTGGTGGTGTTGATGGTGATGAA 385
consensus_10730#7      GAAGATGGCGACGATGATTTCCATACTGGTGATTGTGGTGGTGGTGCTGCTGGCGATGAA 247
consensus_10730#4      GAAGATGGCGACGATGATTTCCATAGTGGTGATTGTGGTGGTGGTGGTGATGGTGATGAA 337
consensus_10730#1      GAAGATGGCGACGATGATTTCCATA------ATTGTGATTGTGGTGCTGATGGTGATGAA 489
consensus_10730#6      GAAGATGGCGACGATGATTTCCATA------ATTGTGCCTTTA-TACC------------ 278
consensus_10730#2      GAAGATGGCGACGATGATTTCCATAGTGGTGTTGGTGGTGAAGATGGCGCGGACGACGAA 387
consensus_10730#8      GAAGATGTCGACGATTATTTCCATA------GTGGTGTTTTTG-TGGCTTTGGTAATGAA 139
consensus_10730#0      GAAGATGGAGACATCCATGACCGTG------GTGATG---AAGATGGCGAGGACGACGAA 500
consensus_10730#5      GTAGATGTCGACGATGATTTCCATA------GTGGTGTTTGTTGTGGCTTTGGTAATGAA 263
                       * *****  ***    **  ** *        *  **       *               

consensus_10730#3      GATGGCGCGGACGACGACACTGATGAGTGTGTTGACGGCCACGTGGTTCCTCTGAGGATG 445
consensus_10730#7      GATGCCGCGCACGACG-------------------------------------------- 263
consensus_10730#4      GATGATGCGGACGACGAAATTGACGAGTGTGTTGACGGTCACG----------------- 380
consensus_10730#1      GATGGCGCGGACGACG-------------------------------------------- 505
consensus_10730#6      ------------------------------------------------------------
consensus_10730#2      ACTGATGAGTGTGTTGACGGTCACGTGATCACTCTGAGGATGACCTTGAGAAGGAATGTG 447
consensus_10730#8      TTAGGCGAGGACGACGAAACTGATGAGTGTGTTGA------------------------- 174
consensus_10730#0      ACTGATGAGTGTGTTGACGGTCACGTGATCACCTTGAGGATGAGCTTGAGAAGGA----- 555
consensus_10730#5      ATAGGCGAGGGCGACGAAACTGATGAGT-------------------------------- 291
                                                                                   

consensus_10730#3      ACCTTGACA--------------- 454
consensus_10730#7      ------------------------
consensus_10730#4      ------------------------
consensus_10730#1      ------------------------
consensus_10730#6      ------------------------
consensus_10730#2      AGTGAGTCGATGATGAACATGATT 471
consensus_10730#8      ------------------------
consensus_10730#0      ------------------------
consensus_10730#5      ------------------------