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Schistosoma mansoni
cluster # 10744 cluster # 10744       Sequences # 21       consensus # 3


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_10744#0 length = 921 sequences # 12  
consensus_10744#1 length = 872 sequences # 8  
consensus_10744#2 length = 284 sequences # 1  

consensusID : consensus_10744#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 12
consensus length = 921
fasta sequence
                              [CCTCCAGGCCAAAAATTCGGCACGAGGTCACCAATACCACTAACATCACTATTATCACGTTGTTTAAACATTCCAAGGTGAGGATATTTATTTTCGTTCTTATTCGCTGTTGTCTCCTCTATTTTTGACTTTTCAATATTTAGGTTGCTTTATTGAGTGTTTCTTTTAAAAAAGAGTAACTGTCTGCGCACATTTTTGTGGTGTTCGTTTTTTCCTCCGCGGGCAGATGAAAAATGTTAGTCATTTTTTATGTGAGTGTGGGGATACTTGTGTGTTATCTTCTTTATTGTCATCTTTTAAACCATGAAATCAGCTTATTTTTGCCCATGTTTACGCTCCCACTTTGTTGACTATCTCTTTACCCTCATTCAGTCTATTCTCGATCTAATCCATATATGTGTGAAGAAATTTACTCGAAGCCGCGCATCCATCAAATCACATTTATTCACATAAAATGCAGGGGATATCTTGCTCCTTCTCAACTTATATCTTCCTCTCTCATTTCATTTATTACCTTTATCCTGTTGTCAAATATTAAGTGTTTATTAGTTTTCTATGTGTTTACTTTGTTTGTTTTGATGATGATTTTATTGATGAAAGATGATTGACTTGTTATCTGTAAATTTTATCATTATTATTATTATTATCGTTCCTCATCAAAATTCGTATGGTCAACGTAGATATAATCATTATACACTTGTCATACTTTTTTTTCGACTAAGGTTTCTTTCTGTTAC-TTGTTT-CTTATTTATATTTATTCAACTAGTCCATATATATATTCATTC-TTGCTTTAATTACATA-TTGTTCCCAGTTGAGTTATTCATGTCCTGCTTAGGTCACCACTNNTCTTATCATCTTTTTTTGTTTCATTGTACATATTCTAAAATATCACTATCTATATGTAAATATGGCATCACANTA]

[+] EMBL CD080189             [CCTCCAGGCCAAAAATTCGGCACGAGGTCACCAATACCACTAACATCACTATTATCACGTTGTTTAAACATTCCAAGGTGAGGATATTTATTTTCGTTCTTATTCGCTGTTGTCTCCTCTATTTTTGACTTTTCAATATTTAGGTTGCTTTATTGAGTGTTTCTTTTAAAAAAGAGTAACTGTCTGCGCACATTTTTGTGGTGTTCGTTTTTTCCTCCGCGGGCAGATGAAAAATGTTAGTCATTTTTTATGTGAGTGTGGGGATACTTGTGTGTTATCTTCTTTATTGTCATCTTTTAAACCATGAAATCAGCTTATTTTTGCCCATGTTTACGCTCCCACTTTGTTGACTATCTCTTTACCCTCATTCAGTCTATTCTCGATCTAATCCATATATGTGTGAAGAAATTTACTCGAAGCCGCGCATCCATCAAATCACATTTATTCACATAAAATGCAGGGGATATCTTGCTCCTTCTCAACTTATATCTTCCTCTCTCATTTCATTTATTACCTTTATCCTGTTGTCAAATATTAAGTGTTTATTAGTTTTCTATGTGTTTACTTTGTTTGTTTTGATGATGATTTTATTGATGAAAGATGATTGACTTGTTATCTGTAAATTNTATCATTATTATTATTATTATCGTTCCTCATCANAATTCGTATGGTCAACGTAGATATAATCATTATACACTTGTCATACTTTTTTTTCGACTAAAGTTTCTTTCTGTTAC TTGNTT C TAATTATATTTATTC ACTAGTCC TATATATATTCATTC TTGCTNTAA TACATA TNGNT CCAGTTGAGTTATTCATGTCCTGCTTAGGTCACCACTNNTCTTATCATCTTTTTTTGTTTCATTGTACATATTCTAAAATATCACTATCTATATGTAAATATGGCATCACANTA]
[+] EMBL CD143331             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         CCTTCTCAACTTATATCTTCCTCTCTCATTTCATTTATTACCTTTATCCTGTTGTCAAATATTAAGTGTTTATTAGTTTTCTATGTGTTTACTTTGTTTGTTTTGATGATGATTTTATTGATGAAAGATGATTGACTTGCTATCTGTAAATTTTATCATTATTATTATTATTATCGTTCCTCATCAAAATTCGTATGGTCAACGTAGATATAATCATTATACACTTGTCATACTTTTTTTTCGGCTAAGGTTTCTTTCTGTTAC TTGTTT CTTATTTATATTTATTCAACTAGTCCATATATATATTCATTC TTGCTTTAATTACATA TTGTTCCCAGTTGAG                                                                                                         ]
[+] EMBL CD143414             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         CCTTCTCAACTTATATCTTCCTCTCTCATTTCATTTATTACCTTTATCCTGTTGTCAAATATTAAGTGTTTATTAGTTTTCTATGTGTTTACTTTGTTTGTTTTGATGATGATTTTATTGATGAAAGATGATTGACTTGTTATCTGTAAATTTTATCATTATTATTATTATTATCGTTCCTCATCAAAATTCGTATGGTCAACGTAGATATAATCATTATACACTTGTCATACTTTTTTTTCGACTAAGGTTTCTTTCTGTTAC TTGTTT CTTATTTATATTTATTCAACTAGTCCATATATATATTCATTC TTGCTTTAATTACATA TTGTGCCCAGATGAG                                                                                                         ]
[+] EMBL CD143308             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         CCTTCTCAACTTATATCTTCCTCTCTCATTTCATTTATTACCTTTATCCTGTTGTCAAATATTAAGTGTTTATTAGTTTTCTATGTGTTTACTTTGTTTGTTTTGATGATGATTTTATTGATGAAAGATGATTGACTTGTTATCTGTAAATTTTATCATTATTATTATTATTATCGTTCCTCATCAAAATTCGTATGGTCAACGTAGATATAATCATTATACACTTGTCATACTTTTTTTTCGACTAAGGTTTCTTTCTGTTAC TTGTTT CTTATTTATATTTATTCAACTAGTCCATATATATATTCATTC TTGCTTTAATTACATA TTGTTCCCAGTTGAG                                                                                                         ]
[+] EMBL CD198809             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         CCTTCTCAACTTATATCTTCCTCTCTCATTTCATTTATTACCTTTATCCTGTTGTCAAATATTAAGTGTTTATTAGTTTTCTATGTGTTTACTTTGTTTGTTTTGATGATGATTTTATTGATGAAAGATGATTGACTTGTTATCTGTAAATTTTATCATTATTATTATTATTATCGTTCCTCATCANAATTCGTATGGTCAACGTAGATATAATCATTATACACTTGTCATACTTTTTTTTCGACTAAGGTTTCTTTCTNGTACTTTGTTT C TATTTATATNTATTCAACTAGNCCATATATATATTCATTCTTTGCTTTAA TACATATTTGTTCCagnntga                                                                                                          ]
[+] EMBL CD198706             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         CCTTCTCAACTTATATCTTCCTCTCTCATTTCATTTATTACCTTTATCCTGTTGTCAAATATTAAGTGTTTATTAGTTTTCTATGTGTTTACTTTGTTTGTTTTGATGATGATTTTATTGATGAAAGATGATTGACTTGTTATCTGTAAATTTTATCATTATTATTATTATTATCGTTCCTCATCAAAATTCGTATGGTCAACGTAGATATAATCATTATACACTTGTCATACTTTTTTTTCGACTAAGGTTTCTTTCTGTTAC TTGTTTCCTTA TTATATTTATTCAACTAGTCCATATATATATTCATTCTTTGCTTTAA TACATA TTGNTCCCAGnntga                                                                                                         ]
[+] EMBL CD143419             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         CCTTCTCAACTTATATCTTCCTCTCTCATTTCATTTATTACCTTTATCCTGTTGTCAAATATTAAGTGTTTATTAGTTTTCTATGTGTTTACTTTGTTTGTTTTGATGATGATTTTATTGATGAAAGATGATTGACTTGTTATCTGTAAATTTTATCATTATTATTATTATTATCGTTCCTCATCAAAATTCGTATGGTCAACGTAGATATAATCATTATACACTTGTCATACTTTTTTTTCGACTAAGGTTTCTTTCTGTTAC TTGTTT CTTATTTATATTTATTCAACTAGTCCATATATATATTCATTC TTGCTTTAATTACATA TTGTTCCCAGTTGAG                                                                                                         ]
[-] EMBL CD198726             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          CTTCTCAACTTATATCTTCCTCTCTCATTTCATTTATTACCTTTATCCTGTTGTCAAATATTAAGTGTTTATTAGTNTTCTATGTGTTTACTTTGTTTGTTTTGATGATGATTTTATTGATGAAAGATGATTGACTTGTTATCTGTAAATTTTATCATTATTATTATTATTATCGTTCCTCATCAAAATTCGTATGGTCAACGTAGATATAATCATTATACACTTGTCATACTTTTTTTTCGACTAAGGTTTCTTTCTGTTAC TTGTTT CTTATTTATATTTATTCAACTAGTCCATATATATATTCATTC TTGCTTTAATTACATA TTGTTCCCAGTTGAGT                                                                                                        ]
[-] EMBL CD143302             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          CTTCTCAACTTATATCTTCCTCTCTCATTTCATTTATTACCTTTATCCTGTTGTCAAATATTAAGTGTTTATTAGTTTTCTATGTGTTTACTTTGTTTGTTTTGATGATGATTTTATTGATGAAAGATGATTGACTTGTTATCTGTAAATTTTATCATTATTATTATTATTATCGTTCCTCATCAAAATTCGTATGGTCAACGTAGATATAATCATTATACACTTGTCATACTTTTTTTTCGACTAAGGTTTCTTTCTGTTAC TTGTTT CTTATTTATATTTATTCAACTAGTCCATATATATATTCATTC TTGCTTTAATTACATA TTGTTCCCAGTTGAGT                                                                                                        ]
[-] EMBL CD143358             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          CTTCTCAACTTATATCTTCCTCTCTCATTTCATTTATTACCTTTATCCTGTTGTCAAATATTAAGTGTTTATTAGTTTTCTATGTGTTTACTTTGTTTGTTTTGATGATGATTTTATTGATGAAAGATGATTGACTTGTTATCTGTAAATTTTATCATTATTATTATTATTATCGTTCCTCATCAAAATTCGTATGGTCAACGTAGATATAATCATTATACACTTGTCATACTTTTTTTTCGACTAAGGTTTCTTTCTGTTAC TTGTTT CTTATTTATATTTATTCAACTAGTCCATATATATATTCATTC TTGCTTTAATTACATA TTGTTCCCAGTTGAGT                                                                                                        ]
[-] EMBL CD143274             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          CTTCTCAACTTATATCTTCCTCTCTCACTTCATTTATTACCTTTATCCTGTTGTCAAATATTAAGTGTTTATTAGTTTTCTATGTGTTTACTTTGTTTGTTTTGATGATGATTTTATTGATGAAAGATGATTGACTTGTTATCTGTAAATTTTATCATTATTATTATTATTATCGTTCCTCATCAAAATTCGTATGGTCAACGTAGATATAATCACTATACACTTGTCATACTTTTTTTTCGACTAAGGTTTCTTTCTGTTAC TTGTTT CTTATTTATATTTATTCAACTAGTCCATATATATATTCATTC TTGCTTTAATTACATA TTGTTCCCAGTTGAGT                                                                                                        ]
[-] EMBL CD198724             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              TCTCTCATATCATTTATTACCTTCATCCTGTTGACAAATATTAAGTGTTTATTAGTTTTCTATGTGTNTACTATGTTTGTTTTGATGATGATTTTATTGATGAAAGATGATTGACTTGTTATCTGTAAATTTTATCATTATTATTATTATTATCGTTCCTCATCAAAATTCGTATGGTCAACGTAGATATAATCATTATACACTTGTCATACTTTTTTTTCGACTAAGGTTTCTTTCTGTTAC TTGTTT CTTATTTATATTTATTCAACTAGTCCATATATATATTCATTC TTGCTTTAATTACATA TTGTTCCCAGTTGAGT                                                                                                        ]


>consensus_10744#0 CCTCCAGGCCAAAAATTCGGCACGAGGTCACCAATACCACTAACATCACTATTATCACGT TGTTTAAACATTCCAAGGTGAGGATATTTATTTTCGTTCTTATTCGCTGTTGTCTCCTCT ATTTTTGACTTTTCAATATTTAGGTTGCTTTATTGAGTGTTTCTTTTAAAAAAGAGTAAC TGTCTGCGCACATTTTTGTGGTGTTCGTTTTTTCCTCCGCGGGCAGATGAAAAATGTTAG TCATTTTTTATGTGAGTGTGGGGATACTTGTGTGTTATCTTCTTTATTGTCATCTTTTAA ACCATGAAATCAGCTTATTTTTGCCCATGTTTACGCTCCCACTTTGTTGACTATCTCTTT ACCCTCATTCAGTCTATTCTCGATCTAATCCATATATGTGTGAAGAAATTTACTCGAAGC CGCGCATCCATCAAATCACATTTATTCACATAAAATGCAGGGGATATCTTGCTCCTTCTC AACTTATATCTTCCTCTCTCATTTCATTTATTACCTTTATCCTGTTGTCAAATATTAAGT GTTTATTAGTTTTCTATGTGTTTACTTTGTTTGTTTTGATGATGATTTTATTGATGAAAG ATGATTGACTTGTTATCTGTAAATTTTATCATTATTATTATTATTATCGTTCCTCATCAA AATTCGTATGGTCAACGTAGATATAATCATTATACACTTGTCATACTTTTTTTTCGACTA AGGTTTCTTTCTGTTACTTGTTTCTTATTTATATTTATTCAACTAGTCCATATATATATT CATTCTTGCTTTAATTACATATTGTTCCCAGTTGAGTTATTCATGTCCTGCTTAGGTCAC CACTNNTCTTATCATCTTTTTTTGTTTCATTGTACATATTCTAAAATATCACTATCTATA TGTAAATATGGCATCACANTA



consensusID : consensus_10744#1
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 8
consensus length = 872
fasta sequence
                              [TCCTCGNGGCCAAGCTTATTCGCTGTTGTCTCCTCTATTTTT-GACTTTT--AATATTTT-GGTT-GCTTTATT-GTGTGTTTC-TTTTAAAAAAGAGTAACTGTCTGCGCACATTTTTGTGGTGTTCGTTTTTTCCTCCGCGGGCAGTT-GAAAAATGTTAGTCATTTTTTATGTGAGTGTGTGGATACTTGTGTGTTTTCTTCTTTATTGTCATCTTTTAAACCATGAGATCAGCTTATTTTTGTCCATGTTTACGCTCCCACTTTGTTGACTATCTCTTTACCCTCATTCAGTCTATTCTCGATCTAATCCATATATGTGTGAAGAAATTTACTCGAAGCCGCGCATCCATCAAATCACATTTATTCACATAAAATGCAGGGGATATCTTGCTCCTTCTCAACTTATATCTTCCTCTCTCATTTCATTTATTACCTTTATCCTGTTGTCAAATATTAAGTGTTTATTAGTTTTCTATGTGTTTACTTTGTTTGTTTTGATGATGATTTTATTGATGAAAGATGATTGACTTGTTATCTGTAAATTTTATCATTATTATTATTATTATCGTTCCTCATCAAAATTCGTATGGTCAACGTAGATATAATCATTATACACTTGTCATAC-TTT-TTTTCGACTAAGGTTTCTTTCTGTTACTTGTTTCTTATTTATATTTATTCAACTAGTCCATATATATATTCATTC-TTGCTTTAATTACATATTGTTCCCAGTTGAGTTATTTTATGTCCTGCTTAAGTCCCCCAACTTTTCTTTATTCATCTTTTTTTTGTTTTCTATTGTTATCATAATTTTTAAAATATGATCAACTTATTTAATAAATGTAAAAGTAAATGTGCAATCAACCAGTTAATAAAGTA]

[+] EMBL CD082627             [TCCTCGNGGCCAAGCTTATTCGCTGTTGTCTCCTCTATTTTT GACTTTT  AATATTTT GGTT GCTTTATT GTGTGTTTC TTTTAAAAAAGAGTAACTGTCTGCGCACATTTTTGTGGTGTTCGTTTTTTCCTCCGCGGGCAGTT GAAAAATGTTAGTCATTTTTTATGTGAGTGTGTGGATACTTGTGTGTTTTCTTCTTTATTGTCATCTTTTAAACCATGAGATCAGCTTATTTTTGTCCATGTTTACGCTCCCACTTTGTTGACTATCTCTTTACCCTCATTCAGTCTATTCTCGATCTAATCCATATATGTGTGAAGAAATTTACTCGAAGCCGCGCATCCATCAAATCACATTTATTCACATAAAATGCAGGGGATATCTTGCTCCTTCTCAACTTATATCTTCCTCTCTCATTTCATTTATTACCTTTATCCTGTTGTCAAATATTAAGTGTTTATTAGTTTTCTATGTGTTTACTTTGTTTGTTTTGATGATGATTTTATTGATGAAAGATGATTGACTTGTTATCTGTAAATTTTATCATTATTATTATTATTATCGTTCCTCATCAAAATTCGTATGGTCAACGTAGATATAATCATTATACACTTGTCATAC TTTNTTTTCGACTAAGGTTTCTTTCTGTTACTTGTTTCTTATTTATATTTATTCAACTAGTCCATATATATATTCATT                                                                                                                                                                               ]
[+] EMBL SM749                [         tcgttCTTATTCGNTGTNGTCTCCTCTATTTTTGGACTTTTTCAATATTTTGGGTTGGTTTTATTGGTGTGTTTCTTTTTAAAAAAGAGTAACTGTCTGCGCACATTTTGGTGGTGTTCGTTTTTTCCTCCGCGGGCAGTTGGAAAAATGTTAGTCATTTTTTATGTGAGTGTGTGGATAC                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     ]
[-] EMBL CD141345             [                                                                               tgTTC TTNTAAAAAAGAGTAACTGTCTGCGCACATTTTTGTGGTGTTCGTTTTTTCCTCCGCGGGCAGTT GAAAAATGTTAGTCATTTTTTATGTGAGTGTGTGGATACTTGTGTGTTTTCTTCTTTATTGTCATCTTTTAAACCATGAGATCAGCTTATTTTTGTCCATGTTTACGCTCCCACTTTGTTGACTATCTCTTTACCCTCATTCAGTCTATTCTCGATCTAATCCATATATGTGTGAAGAAATTTACTCGAAGCCGCGCATCCATCAAATCACATTTATTCACATAAAATGCAGGGGATATCTTGCTCCTTCTCAAC                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             ]
[-] EMBL CD076223             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              GGGGATATCTTGCTCCTTCTCAACTTATATCTTCCTCTCTCATTTCATTTATTACCTTTATCCTGTTGTCAAATATTAAGTGTTTATTAGTTTTCTATGTGTTTACTTTGTTTGTTTTGATGATGATTTTATTGATGAAAGATGATTGACTTGTTATCTGTAAATTTTATCATTATTATTATTATTATCGTTCCTCATCAAAATTCGTATGGTCAACGTAGATATAATCATTATACCCTTGTCATACTTTT TTTTCGACTAAGGTTTCTTTCTGTTACTTGTTTTTTATTTATATTTATTCAACTAGTCCATATATATATTCATTC TTGCTTTAATTACATATTGTTCCCAGTTGAGTTATTTTATGTCCTGCTTAAGTCCCCCAACTTTTCTTTATTCATCTTTTTTTTGTTTTCTATTGTTATCATAATTTTTAAAATATGATCAACTTATTTAATAAATGTAAAAGTAAATGTGCAATCAACCAGTTAATAAAGTA]
[+] EMBL CD198780             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            CCTTCTCAACTTATATCTTCCTCTCTCATTTCATTTATTACCTTTATCCTGTTGTCAAATATTAAGTGTTTATTAGTTTTCTATGTGTTTACTTTGTTTGTTTTGATGATGATTTTATTGATGAAAGATGATTGACTTGTTATCTGTAAATTTTATCATTATTATTATTATTATCGTTCCTCATCAAAATTCGTATGGTCAACGTAGATATAATCATTATACACTTGTCATAC TTT TTTTCGACTAAGGTTTCTTTCTGTTACTTGTTTCTTATTTATATTTATTCAACTAGTCCATATACATATTCATTCTTTGC TTAATTACATNATGNNTCCAGnntga                                                                                                                                              ]
[-] EMBL CD143278             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             CTTCTCAACTTATATCTTCCTCTCTCATTTCATTTATTACCTTTATCCTGTTGTCAAATATTAAGTGTTTATTAGTTTTCTATGTGTTTACTTTGTTTGTTTTGATGATGATTTTATTGATGAAAGATGATTGACTTGTTATCTGTAAATTTTATCATTATTATTATTATTATCGTTCCTCATCAAAATTCGTATGGTCAACGTAGATATAATCATTATACACTTGTCATAC TTT TTTTCGACTAAGGTTTCTTTCTGTTACTTGTTTCTTATTTATATTTATTCAACTAGTCCATATATATATTCATTC TTGCTTTAATTACATATTGTTCCCAGTTGAGT                                                                                                                                             ]
[-] EMBL CD143322             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             CTTCTCAACTTATATCTTCCTCTCTCATTTCATTTATTACCTTTATCCTGTTGTCAAATATTAGGTGTTTATTAGTTTTCTATGTGTTTACTTTGTTTGTTTTGATGATGATTTTATTGATGAAAGATGATTGACTTGTTATCTGTAAATTTTATCATTATTATTATTATTATCGTTCCTCATCAAAATTCGTATGGTCAACGTAGATATAATCATTATACACTTGTCATAC TTT TTTTCGACTAAGGTTTCTTTCTGTTACTTGTTTCTTATTTATATTTATTCAACTAGTCCATATATATATTCATTC TTGCTTTAATTACATATTGTTCCCAGTTGAGT                                                                                                                                             ]
[-] EMBL CD198732             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             CTTCTCAACTTATATCTTCCTCTCTCATTTCATTTATTACCTTTATCCTGTTGTCAAATATTAAGTGTTTATTAGTTTTCTAGGTGTTTACTTGGTTGGTTTGGATGATGATTTTATTGATGAAAGATGATTGCCTTGTTATCGGTAAATTTTATCATTATTATTATTATTATCGTTCCTCATCAAAATTCGTATGGTCAACGTAGATATAATCACTATACACTTGTCATAC TTT TTTTCGACTAAGGTTTCTTTCTGTTACTTGTTTCTTATTTATATTTATTCAACTAGTCCATATATATATTCATTC TTGCTTTAATTACATATTGTTCCCAGTTGAGT                                                                                                                                             ]


>consensus_10744#1 TCCTCGNGGCCAAGCTTATTCGCTGTTGTCTCCTCTATTTTTGACTTTTAATATTTTGGT TGCTTTATTGTGTGTTTCTTTTAAAAAAGAGTAACTGTCTGCGCACATTTTTGTGGTGTT CGTTTTTTCCTCCGCGGGCAGTTGAAAAATGTTAGTCATTTTTTATGTGAGTGTGTGGAT ACTTGTGTGTTTTCTTCTTTATTGTCATCTTTTAAACCATGAGATCAGCTTATTTTTGTC CATGTTTACGCTCCCACTTTGTTGACTATCTCTTTACCCTCATTCAGTCTATTCTCGATC TAATCCATATATGTGTGAAGAAATTTACTCGAAGCCGCGCATCCATCAAATCACATTTAT TCACATAAAATGCAGGGGATATCTTGCTCCTTCTCAACTTATATCTTCCTCTCTCATTTC ATTTATTACCTTTATCCTGTTGTCAAATATTAAGTGTTTATTAGTTTTCTATGTGTTTAC TTTGTTTGTTTTGATGATGATTTTATTGATGAAAGATGATTGACTTGTTATCTGTAAATT TTATCATTATTATTATTATTATCGTTCCTCATCAAAATTCGTATGGTCAACGTAGATATA ATCATTATACACTTGTCATACTTTTTTTCGACTAAGGTTTCTTTCTGTTACTTGTTTCTT ATTTATATTTATTCAACTAGTCCATATATATATTCATTCTTGCTTTAATTACATATTGTT CCCAGTTGAGTTATTTTATGTCCTGCTTAAGTCCCCCAACTTTTCTTTATTCATCTTTTT TTTGTTTTCTATTGTTATCATAATTTTTAAAATATGATCAACTTATTTAATAAATGTAAA AGTAAATGTGCAATCAACCAGTTAATAAAGTA



consensusID : consensus_10744#2
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 1
consensus length = 284
fasta sequence
                              [AGGACTTTGTTTTGATGATGATTTTATTGATGAAAGATGATTGACTTGTTATCTGTAAATTTTATCATTATTATTATTATTATCGTTCCTCATCAAAATTCGTATGGTCAACGTAGATATAATCATCATACACTTGTCATACTTTTTTTTTCGCCCCAGGTTTCTTTCTGTTACTTGTTTCTTATTCATATTTATTCAAGTAGCCCCCGTCAATCCGGAATTCGTGCAGCCCGGGGCATCCAGTAGTTATAGATCGTCGACCACCGCGTCGGCTGTTGGAGCAA]

[-] EMBL BG932016             [AGGACTTTGTTTTGATGATGATTTTATTGATGAAAGATGATTGACTTGTTATCTGTAAATTTTATCATTATTATTATTATTATCGTTCCTCATCAAAATTCGTATGGTCAACGTAGATATAATCATCATACACTTGTCATACTTTTTTTTTCGCCCCAGGTTTCTTTCTGTTACTTGTTTCTTATTCATATTTATTCAAGTAGCCCCCGTCAATCCGGAATTCGTGCAGCCCGGGGCATCCAGTAGTTATAGATCGTCGACCACCGCGTCGGCTGTTGGAGCAA]


>consensus_10744#2 AGGACTTTGTTTTGATGATGATTTTATTGATGAAAGATGATTGACTTGTTATCTGTAAAT TTTATCATTATTATTATTATTATCGTTCCTCATCAAAATTCGTATGGTCAACGTAGATAT AATCATCATACACTTGTCATACTTTTTTTTTCGCCCCAGGTTTCTTTCTGTTACTTGTTT CTTATTCATATTTATTCAAGTAGCCCCCGTCAATCCGGAATTCGTGCAGCCCGGGGCATC CAGTAGTTATAGATCGTCGACCACCGCGTCGGCTGTTGGAGCAA



consensus multiple alignement with clustalw

CLUSTAL W (1.82) multiple sequence alignment


consensus_10744#0      CCTCCAGGCCAAAAATTCGGCACGAGGTCACCAATACCACTAACATCACTATTATCACGT 60
consensus_10744#1      ------------------------------------------------------------
consensus_10744#2      ------------------------------------------------------------
                                                                                   

consensus_10744#0      TGTTTAAACATTCCAAGGTGAGGATATTTATTTTCGTTCTTATTCGCTGTTGTCTCCTCT 120
consensus_10744#1      ------------------------TCCTCGNGGCCAAGCTTATTCGCTGTTGTCTCCTCT 36
consensus_10744#2      ------------------------------------------------------------
                                                                                   

consensus_10744#0      ATTTTTGACTTTTCAATATTTAGGTTGCTTTATTGAGTGTTTCTTTTAAAAAAGAGTAAC 180
consensus_10744#1      ATTTTTGACTTTT-AATATTTTGGTTGCTTTATTGTGTGTTTCTTTTAAAAAAGAGTAAC 95
consensus_10744#2      ------------------------------------------------------------
                                                                                   

consensus_10744#0      TGTCTGCGCACATTTTTGTGGTGTTCGTTTTTTCCTCCGCGGGCAGATGAAAAATGTTAG 240
consensus_10744#1      TGTCTGCGCACATTTTTGTGGTGTTCGTTTTTTCCTCCGCGGGCAGTTGAAAAATGTTAG 155
consensus_10744#2      ------------------------------------------------------------
                                                                                   

consensus_10744#0      TCATTTTTTATGTGAGTGTGGGGATACTTGTGTGTTATCTTCTTTATTGTCATCTTTTAA 300
consensus_10744#1      TCATTTTTTATGTGAGTGTGTGGATACTTGTGTGTTTTCTTCTTTATTGTCATCTTTTAA 215
consensus_10744#2      ------------------------------------------------------------
                                                                                   

consensus_10744#0      ACCATGAAATCAGCTTATTTTTGCCCATGTTTACGCTCCCACTTTGTTGACTATCTCTTT 360
consensus_10744#1      ACCATGAGATCAGCTTATTTTTGTCCATGTTTACGCTCCCACTTTGTTGACTATCTCTTT 275
consensus_10744#2      ------------------------------------------------------------
                                                                                   

consensus_10744#0      ACCCTCATTCAGTCTATTCTCGATCTAATCCATATATGTGTGAAGAAATTTACTCGAAGC 420
consensus_10744#1      ACCCTCATTCAGTCTATTCTCGATCTAATCCATATATGTGTGAAGAAATTTACTCGAAGC 335
consensus_10744#2      ------------------------------------------------------------
                                                                                   

consensus_10744#0      CGCGCATCCATCAAATCACATTTATTCACATAAAATGCAGGGGATATCTTGCTCCTTCTC 480
consensus_10744#1      CGCGCATCCATCAAATCACATTTATTCACATAAAATGCAGGGGATATCTTGCTCCTTCTC 395
consensus_10744#2      ------------------------------------------------------------
                                                                                   

consensus_10744#0      AACTTATATCTTCCTCTCTCATTTCATTTATTACCTTTATCCTGTTGTCAAATATTAAGT 540
consensus_10744#1      AACTTATATCTTCCTCTCTCATTTCATTTATTACCTTTATCCTGTTGTCAAATATTAAGT 455
consensus_10744#2      ------------------------------------------------------------
                                                                                   

consensus_10744#0      GTTTATTAGTTTTCTATGTGTTTACTTTGTTTGTTTTGATGATGATTTTATTGATGAAAG 600
consensus_10744#1      GTTTATTAGTTTTCTATGTGTTTACTTTGTTTGTTTTGATGATGATTTTATTGATGAAAG 515
consensus_10744#2      ------------------------AGGACTTTGTTTTGATGATGATTTTATTGATGAAAG 36
                                                    *******************************

consensus_10744#0      ATGATTGACTTGTTATCTGTAAATTTTATCATTATTATTATTATTATCGTTCCTCATCAA 660
consensus_10744#1      ATGATTGACTTGTTATCTGTAAATTTTATCATTATTATTATTATTATCGTTCCTCATCAA 575
consensus_10744#2      ATGATTGACTTGTTATCTGTAAATTTTATCATTATTATTATTATTATCGTTCCTCATCAA 96
                       ************************************************************

consensus_10744#0      AATTCGTATGGTCAACGTAGATATAATCATTATACACTTGTCATACTTTTTTTT-CGACT 719
consensus_10744#1      AATTCGTATGGTCAACGTAGATATAATCATTATACACTTGTCATACTTTTTTT--CGACT 633
consensus_10744#2      AATTCGTATGGTCAACGTAGATATAATCATCATACACTTGTCATACTTTTTTTTTCGCCC 156
                       ****************************** **********************  ** * 

consensus_10744#0      AAGGTTTCTTTCTGTTACTTGTTTCTTATTTATATTTATTCAACTAGTCCATATATATAT 779
consensus_10744#1      AAGGTTTCTTTCTGTTACTTGTTTCTTATTTATATTTATTCAACTAGTCCATATATATAT 693
consensus_10744#2      CAGGTTTCTTTCTGTTACTTGTTTCTTATTCATATTTATTCAAGTAGCCCCCGTCAA--T 214
                        ***************************** ************ *** **   *  *  *

consensus_10744#0      TCATTCTTGCTTTAATTACATATTGTTCCCAGTTG-AGTTATTC-ATGTCCTGCTTAGGT 837
consensus_10744#1      TCATTCTTGCTTTAATTACATATTGTTCCCAGTTG-AGTTATTTTATGTCCTGCTTAAGT 752
consensus_10744#2      CCGGAATTCGTGCAGCCCGGGGCATCCAGTAGTTATAGATCGTCGAC-CACCGCGTCGGC 273
                        *    **  *  *                ****  ** *  *  *    * ** *  * 

consensus_10744#0      CACC--ACTNNTCTT-----ATCATCTTTTTTTGTTTCATTGT----ACATATTCTAAAA 886
consensus_10744#1      CCCCCAACTTTTCTTTATTCATCTTTTTTTTGTTTTCTATTGTTATCATAATTTTTAAAA 812
consensus_10744#2      TGTTGGAGCAA------------------------------------------------- 284
                             *                                                     

consensus_10744#0      TATCACTATCT-ATATG-TAAATATGGCATCACANTA----------------------- 921
consensus_10744#1      TATGATCAACTTATTTAATAAATGTAAAAGTAAATGTGCAATCAACCAGTTAATAAAGTA 872
consensus_10744#2      ------------------------------------------------------------
                                                                                   




Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)