cluster # 10777

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Schistosoma mansoni
cluster # 10777 cluster # 10777 Sequences # 21 consensus # 2

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consensus_10777#0 length = 1219 sequences # 20

consensus_10777#1 length = 200 sequences # 1

consensusID : consensus_10777#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 20
consensus length = 1219
fasta sequence

                              [AATTATTATACGGTATTGGATTCGCGGTAGATAGCAGTCTTCTATTCCCTGTTAAACGGGACTTTCAAAAGTACACAAACGATGACTGATCAGAAGTTAGCCAAAGCAAAAGTGATATTTGTATTAGGTGGACCAGGAAGTGGTAAGGGAACACAGTGTGAAAAATTAGTACAGAAATTTCATTTTAACCACTTATCCAGTGGTGATCTTTTACGAGCTGAAGTTCAGTCTGGTTCACCAAAAGGTAAAGAGTTAAAAGCTATGATGGAGAGAGGCGAACTTGTTCCTTTGGAAGTTGTTTTAGCTTTACTTAAAGAGGCAATGATTAAACTGGTTGACAAAAATTGTCATTTCCTTAT--CGA-TGGATATCCACGTGAATTGGATCAAGGCATTAAGTTTGAAAAAGAGGTATGTCCTTGTCTGTGCGTAATTAATTTCGACGTGAGTGAAGAAGTGATGCGTAAAAGACTATTGAAAAGAGCAGAGACTAGTAATCGTGTTGATGATAATGAAGAGACAATTGTGAAACGTTTTCGCACTTTCAATGAATTAACAAAACCTGTTATTGAACATTATAAGCAACAAAATAAAGTAATCACTATTGA-TGCTTCTGGTACGGTAGACGCAATTTTCGACAAAGTTAATCATGAACTTCAAAAATTCGGTGTGAAATAATTCAATCCTTTTTCATCAACCCATTACTACCTAGATATTTGCTTAATGTCATTTTACTTTAAGTATCCTAAATATCTTATATTGTACTATTATTGTTTGTAATATTGTGTTATTATATTGATTTGTATTTTAAAACCTTAGATGA-TAGATATTACTTACAAATAGTTTATTAGTACAACTATATAATCAATAATATATGACCTAATTTTACCCAGTAGAATATTTTTTTTCTTGTTTATTTTTTATTTATACT-ATCAAATTTTTTTGTTTTTATCTCAATTACTCACCTTTTAAGTGTGTTTTCTTTTAGTAGTACAAGGTTCATGTATTTTATCTCCTTTTTTGTATCACGCTTTATCAAGTGTCTGTACATCTATTTATTGTCTTTTCTAGATTGTTTGTTTTCTATTGTTTATATAATATATAAACTTTCTTTTGGAAATACCATAGAGTAAACAAGTAAATAATCAATTTCTTATTTAATTTGTTTACTTATTGAACTAATTAACGTTTAATATAAAAAAAATTAGTAGTAAAAAAAAAA]

[-] EMBL CD097262             [AATTATTATACGGTATTGGATTCGCGTTAGATAGCAGTCTTCTATTCCCTGTTAAACGGGACTTTCAAAAGTACACAAACGATGACTGATCAGAAGTTAGCCAAAGCAAAAGTGATATTTGTATTAGGTGGACCAGGAAGTGGTAAGGGAACACAGTGTGAAAAATTAGTACAGAAATTTCATTTTAACCACTTATCCAGTGGTGATCTTTTACGAGCTGAAGTTCAGTCTGGTTCACCAAAAGGTAAAGAGTTAAAAGCTATGATGGAGAGAGGCGAACTTGTTCCTTTGGAAGTTGTTTTAGCTTTACTTAAAGAGGCAATGATTAAACTGGTTGACAAAAATTGCCATTTCCTTAT  CGA TGGATATCCACGTGAATTGGATCAAGGCATTAAGTTTGAAAAAGAGGTATGTCCTTGTCTGTGCGTAAT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       ]
[+] EMBL CD162315             [AATTATTATACGGTATTGGATTCGCGGTAGATAGCAGTCTTCTATTCCCTGTTAAACGGGACTTTCAAAAGTACACAAACGATGACTGATCAGAAGTTAGCCAAAGCAAAAGTGATATTTGTATTAGGTGGACCAGGAAGTGGTAAGGGAACACAGTGTGAAAAATTAGTACAGAAATTTCATTTTAACCACTTATCCAGTGGTGATCTTTTACGAGCTGAAGTTCAGTCTGGTTCACCAAAAGGTAAAGAGTTAAAAGCTATGATGGAGAGAGGCGAACTTGTTCCTTTGGAAGTTGTTTTAGCTTT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     ]
[-] EMBL CD097247             [ ATTATTATACGGTATGGGATTCGCGGTAGATAGCAGTCTTCTATTCTCTGTTAAACGGGACTTTCAAAAGTACACAAACGATGACTGATCAGAAGTTAGCCAAAGCAAAAGTGATATTTGTATTAGGTGGACCAGGAAGTGGTAAGGGAACACAGTGTGAAAAATTAGTACAGAAATTTCATTTTAACCACTTATCCAGTGGTGATCTTTTACGAGCTGAAGTTCAGTCTGGTTCACCAAAAGGTAAAGAGTTAAAAGCTATGATGGAGAGAGGCGAACTCGTTCCTTTGGAAGTTGTTTTAGCTTTACTTAAAGAGGCAATGATTAAACTGGTTGACAAAAATTGTCATTTCCTTAT  CGA TGGATATCCACGTGAATTGGATCAAGGCATTAAGTTTGAAAAAGAGGTATGTCCTTGTCTGTGCGTAAT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       ]
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[+] EMBL SMNPK                [ ATTATTATACGGTATTGGATTCGCGGTAGATAGCAGTCTTCTATTCCCTGTTAAACGGGACTTTCAAAAGTACACAAACGATGACTGATCAGAAGTTAGCCAAAGCAAAAGTGATATTTGTATTAGGTGGACCAGGAAGTGGTAAGGGAACACAGTGTGAAAAATTAGTACAGAAATTTCATTTTAACCACTTATCCAGTGGTGATCTTTTACGAGCTGAAGTTCAGTCTGGTTCACCAAAAGGTAAAGAGTTAAAAGCTATGATGGAGAGAGGCGAACTTGTTCCTTTGGAAGTTGTTTTAGCTTTACTTAAAGAGGCAATGA TAAACTGGTTGACAAAAATTGTCATTTCCTTAT  CGATTAGATATCCACGTGAATTGGATCAAGGCATTAAGTTTGAAAAAGAGGTATGTCCTTGTCTGTGCGTAATTAATTTCGACGTGAGTGAAGAAGTGATGCGTAAAAGACTATTGAAAAGAGCAGAGACTAGTAATCGTGTTGATGATAATGAAGAGACAATTGTGAAACGTTTTCGCACTTTCAATGAATTAACAAAACCTGTTATTGAACATTATAAGCAACAAAATAAAGTAATCACTATTGA TGCTTCTGGTACGGTAGACGCAATTTTCGACAAAGTTAATCATGAACTTCAAAAATTCGGTGTGAAATAATTCAATCCTTTTTCATCAACCCATTACTACCTAGATATTTGCTTAATGTCATTTTACTTTAAGTATCCTAAATATCTTATATTGTACTATTATTGTTTGTAATATTGTGTTATTATATTGATTTGTATTTTAAAACCTTAGATGA TAGATATTACTTACAAATAGTTTATTAGTACAACTATATAATCAATAATATATGACCTAATTTTACCCAGTAGGATATTTTTTTTCTTGTTTATTTTTTATTTATACTCATCAAATTTTTTTGTTTTTATCTCAATTACTCACCTTTTAAGTGTGTTTTCTTTTAGTAGTACAAGGTTCATGTATTTTATCTCCTTTTTTGTATCACGCTTTATCAAGTGTCTGTACATCTATTTATTGTCTTTTCTAGATTGCTTGTTTTCTATTGTTTATATAATATATAAACTTTCTTTTGAAAATACCATAGAGTAAACAAGTAAATAATCAATTTCTTATTTAATTTGTTTACTTATTGAACTAATTAACGTTTAATATAAAAAAAATTAGTAGTAAAAAAAAAA]
[+] EMBL CD180881             [  TTATTATACGGTATTGGATTCGCGGTAGATAGCAGTCTTCTATTCCCTGTTAAACGGGACTTTCAAAAGTACACAAACGATGACTGATCAGAAGTTAGCCAAAGCAAAAGTGATATTTGTATTAGGTGGACCAGGAAGTGGTAAGGGAACACAGTGTGAAAAATTAGTACAGAAATTTCATTTTAACCACTTATCCAGTGGTGATCTTTTACGAGCTGAAGTTCAGTCTGGTTCACCAAAAGGTAAAGAGTTAAAAGCTATGATGGAGAGAGGCGAACTTGTTCCTTTGGAAGTTGTTTTAGCTTTACTTAAAGAGGC                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         ]
[-] EMBL CD097231             [                    TTCGCGGTAGATAGCAGTCTTCTATTCTCTGTTAAACGGGACTTTCAAAAGTACACAAACGATGACTGATCAGAAGTTAGCCAAAGCAAAAGTGATATTTGTATTAGGTGGACCAGGAAGTGGTAAGGGAACACAGTGTGAAAAATTAGTACAGAAATTTCATTTTAACCACTTATCCAGTGGTGATCTTTTACGAGCTGAAGTTCAGTCTGGTTCACCAAAAGGTAAAGAGTTAAAAGCTATGATGGAGAGAGGCGAACTTGTTCCTTTGGAAGTTGTTTTAGCTTTACTTAAAGAGGCAATGATTAAACTGGTTGACAAAAATTGTCATTTCCTTAT  CGA TGGATATCCACGTGAATTGGATCAAGGCATTAAGTTTGAAAAAGAGGTATGTCCTTGTCTGTGCGTAAT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       ]
[-] EMBL CD065720             [                                                                           CAAACGATGACTGATCAGAAGTTAGCCAAAGCAAAAGTGATATTTGTATTAGGTGGACCAGGAAGTGGTAAGGGAACACAGTGTGAAAAATTAGTACAGAAATTTCATTTTAACCACTTATCCAGTGGTGATCTTTTACGAGCTGAAGTTCAGTCTGGTTCACCAAAAGGTAAAGAGTTAAAAGCTATGATGGAGAGAGGCGAACTTGTTCCTTTGGAAGTTGTTTTAGCTTTACTTAAAGAGGCAATGATTAAACTGGTTGACAAAAATTGTCATTTCCTTAT  CGA TGGATATCCACGTGAATTGGATCAGGGCATTAAGTTTGAAAAAGAGGTATGTCCTTGTCTGTGCGTAATTAATTTCGACGTGAGTGAAGAAGTGATGCGTAAAAGACTATTGAAAAGAGCAGAGACTAGTAATCGTGTTGATGATAATGAAGAGACAATTGTGAAACGTCTTCGCACTTTCAATGAATTAAC  AACCTGTTATTGAAC                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           ]
[+] EMBL SMRAP034             [                                                                                                                                                                                                                                                           GTTAAAAGCTATGATGGAGAGAGGCGAACTTSTTCCTTTGGAAGTTGTTTTAGCTTTACTTAAAGAGGCAATGATTAAACTGGTTGACAAAAATTGTCATTTCCTTAT  CGA TGGATATCCACGTGAATTGGATC AGGCATTAAGTT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        ]
[+] EMBL CD156318             [                                                                                                                                                                                                                                                                                AGGCGAACTTGTTCCTTTGGAAGTTGTTTTAGCTTTACTTAAAGAGGCAATGATTAAACTGGTTGACAAAAATTGTCATTTCCTTAT  CGA TGGATATCCACGTGAATTGGATCAAGGCATTAAGTTTGAAAAAGAGGTATGTCCTTGTCTGTGCGTAATTAATTTCGACGTGAGTGAAGAAGTGATGCGTAAAAGACTATTGAAAAGAGCAGAGACTAGTAATCGTGTTGATGATAATGAAGAGACAATTGTGAAACGTTTTCGCACTTTCAATGAATTAACAAAACCTGTTATTGAACATTATAAGCAACAAAATAAAGTAATCACTATTGA TGC                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     ]
[+] EMBL AI764937             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           TCATTTCCTTATCACGG TGGATATCCACGTGAATTGGATCAAGGCATTAAGTTTGAAAAAGAGGTATGTCCTTGTCTGTGCGTAATTAATTTCGACGTGAGTGAAGAAGTGATGCGTAAAAGACTATTGAAAAGAGCAGAGACTAGTAATCGTGTTGATGATAATGAAGAGACAATTGTGAAACGTTTTCGCACTTTCAATGAATTAACAAAACCTGTTATTGAACATTAT AGC ACCAAATTAAGTACTC CTATGGATTGCTTCGGGAAC GAAGACGCAATTTCCGAC AAGTTAACCAg                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             ]
[-] EMBL CD186134             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         ATTAAGTTTGAAAAAGAGGTATGTCCTTGTCTGTGCGTAATTAATTTCGACGTGAGTGAAGAAGTGATGCGTAAAAGACTATTGAAAAGAGCAGAGACTAGTAATCGTGTTGATGATAATGAAGAGACAATTGTGAAACGTTTTCGCACTTTCAATGAATTAACAAAACCTGTTATTGAACATTATAAGCAACAAAATAAAGTAATCACTATTGA TGCTTCTGGTACGGTAGACGCAATTTTCGACAAAGTTAATCATGAACTTCAAAAATTCGGTGTGAAATAATTCAATCCTTTTTCATCAACCCATTACTACCTAGATATTTGCTTAATGTCATTTTACTTTAAGTATCCTAAATATCTTATATTGTACTATTATTGTTTGTAATATTGTGTTATTATATTGATTTGTATTTTAAAACCTTAGATGA TAGATATTACTTACAAATAGTTTATTAGTACAACTATATAATCAATAATATATGAC                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        ]
[-] EMBL CD169252             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             TGAGTGAAGAAGTGATGCGTAAAAGACTATTGAAAAGAGCAGAGACTAGTAATCGTGTTGATGATAATGAAGAGACAATTGTGAAACGTTTTCGCACTTTCAATGAATTAACAAAACCTGTTATTGAACATTATAAGCAACAAAATAAAGTAATCACTATTGA TGCTTCTGGTACGGTAGACGCAATTTTCGACAAAGTTAATCATGAACTTCAAAAATTCGGTGTGAAATAATTCAATCCTTTTTCATCAACCCATTACTACCTAGATATTTGCTTAATGTCATTTTACTTTAAGTATCCTAAATATCTTATATTGTACTATTATTGTTTGTAATATTGTGTTATTATATTGATTTGTATTTTAAAACCTTAGATGA TAGATATTACTTACAAATAGTTTATTAGTACAACTACATAATCAATAATATATGACCTAATTTTACCCAGTAGAATATTTTTTTTCTTGTTTATTTTTTATTTATACT ATCAAATTTTTTTGTTTTTATCTCAATTACTCACCTTTTAAGTGTGTTTTCTTTTAGTAGTACAAGGTTCATGTATTTTATCTCCTTCTTTGTATCACGCTTTATCAAGTGTCTGTACATC                                                                                                                                                                          ]
[-] EMBL CD169248             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              TTTCAATGAATTAACAAAACCTGTTATTGAACATTATAAGCAACAAAATAAAGTAATCACTATTGA TGCTTCTGGTACGGTAGACGCAATTTTCGACAAAGTTAATCATGAACTTCAAAAATTCGGTGTGAAATAATTCAATCCTTTTTCATCAACCCATTACTACCTAGATATTTGCTTAATGTCATTTTACTTTAAGTATCCTAAATATCTTATATTGTACTATTATTGTTTGTAATATTGTGTTATTATATTGATTTGTATTTTAAAACCTTAGATGA TAGATATTACTTACAAATAGTTTATTAGTACAACTACATAATCAATAATATATGACCTAATTTTACCCAGTAGAATATTTTTTTTCTTGTTTATTTTTTATTTATACT ATCAAATTTTTTTGTTTTTATCTCAATTACTCACCTTTTAAGTGTGTTTTCTTTTAGTAGTACAAGGTTCATGTATTTTATCTCCTTCTTTGTATCACGCTTTATCAAGTGTCTGTACATC                                                                                                                                                                          ]
[+] EMBL CD097848             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      CAACAAAATAAAGTAATCACTATTGA TGCTTCTGGTACGGTAGACGCAATTTTCGACAAAGTTAATCATGAACTTCAAAAATTCGGTGTGAAATAATTCAATCCTTTTTCATCAACCCATTACTACCTAGATATTTGCTTAATGTCATTTTACTTTAAGTATCCTAAATATCTTATATTGTACTATTATTGTTTGTAATATTGTGTTATTATATTGATTTGTATTTTAAAACCTTAGATGA TAGATATTACTTACAAATAGTTTATTAGTACAACTATATAATCAATAATATATGACC                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       ]
[-] EMBL AI977679             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 AAGTTAATCATG ACTTTCAAAATTCGGTGTGAAATAATTCAATCCTTTTTCATCAACCCATTACTACCTAGATATTTGCTTAATGTCATTTTACTTTAAGTATCCTAAATATCTTATATTGTACTATTATTGTTTGTAATATTGTGTTATTATATTGATTTGTATTTTAAAACCTTAGATGA TAGATATTACTTACAAATAGTTTATTAGTACAACTATATAATCAATAATATATGACCTAATTTTACCCAGTAGAATATTTTTTTTCTTGTTTATTTTTTATTTATACT ATCAAATTTTTTTGTTTTTATCTCAATTACTCACCTTTTAAGTGTGTTTTCTTTTAGTAGTACAAGGTTCATGTATTTTATCTCCTTTTTTGTATCACGCTTTATCAAGTGTCTGTACATCTATTTATTGTCTTTTCTAGATTGTTTGTTTTCTATTGTTTATATAATATATAAACTTTCTTTTGGAAATACCATAGAGTAAACAAGTAAATAATCAATTTCTTATTTAATTTGTTTACTTATTGAACTAATTAACGTTTAATATAAAAAAA                   ]
[-] EMBL CD185364             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               ccctttttTTCAATCCTTTTTCATCAACCCATTACTACCTAGATATTTGCTTAATGTCATTTTACTTTAAGTATCCTAAATATCTTATATTGTACTATTATTGTTTGTAATATTGTGTTATTATATTGATTTGTATTTTAAAACCTTAGATGA TAGATATTACTTACAAATAGTTTATTAGTACAACTATATAATCAATAATATATGACCTAATTTTACCCAGTAGAATATTTTTTTTCTTGTTTATTTTTTATTTATACT ATCAAATTTTTTTGTTTTTATCTCGATTACTCACCTTTTAAGTGTGTTTTCTTTTAGTAGTACAAGGTTCATGTATTTTATCTCCTTTTTTGTATCACGCTTTATCAAGTGTCTGTACATCTATTTATTGTCTTTTCTAGATTGTTTGTTTTCTATTGTTTATATAATATATAAACTTTCTTTTGGAAATACCATAGAGTAAACAAGTAAATAATCAATTTCTTATTTAATTTGTTTACTTATTGAACTAATTAACGT                                 ]
[-] EMBL CD153768             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              TGCTTAATGTCATTTTACTTTAAGTATCCTAAATATCTTATATTGTAGTATTATTGTTTGTAATATTGTGTTATTATATTGATTTGTATTTTAAAACCTTAGATGAGTAGATATTACTTACAAATAGTTTATTAGTACAACTATATAATCAATAATATATGACCTAATTTTACCCAGTAGAATATTTTTTTTCTTGTTTATTTTTTATTTATACT ATCAAATTTTTTTGTTTTTATCTCAATTACTCACCTTTTAAGTGTGTTTTCTTT                                                                                                                                                                                                                                             ]
[-] EMBL AA999315             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      TTTACCCAGTAGAATATTTTTTTTCTTGTTTATTTTTTATTTATACT ATCAAATAATTTTGTTTTTATCTCAATTACTCCCCTTTTAAGTGTGTTTTCTTTTAGTAGTACAAGGTTCATGTATTTTATCGCCTTTTTTGTATCACGCTTTATCAAGTGTCTGTACATCTATTTATTGTCTTTTCTAGATTGTTTGTTTTCTATTGTTTATATAATATATAAACTTTATTTTGGAAATACCATAGAG                                                                                            ]




>consensus_10777#0
AATTATTATACGGTATTGGATTCGCGGTAGATAGCAGTCTTCTATTCCCTGTTAAACGGG
ACTTTCAAAAGTACACAAACGATGACTGATCAGAAGTTAGCCAAAGCAAAAGTGATATTT
GTATTAGGTGGACCAGGAAGTGGTAAGGGAACACAGTGTGAAAAATTAGTACAGAAATTT
CATTTTAACCACTTATCCAGTGGTGATCTTTTACGAGCTGAAGTTCAGTCTGGTTCACCA
AAAGGTAAAGAGTTAAAAGCTATGATGGAGAGAGGCGAACTTGTTCCTTTGGAAGTTGTT
TTAGCTTTACTTAAAGAGGCAATGATTAAACTGGTTGACAAAAATTGTCATTTCCTTATC
GATGGATATCCACGTGAATTGGATCAAGGCATTAAGTTTGAAAAAGAGGTATGTCCTTGT
CTGTGCGTAATTAATTTCGACGTGAGTGAAGAAGTGATGCGTAAAAGACTATTGAAAAGA
GCAGAGACTAGTAATCGTGTTGATGATAATGAAGAGACAATTGTGAAACGTTTTCGCACT
TTCAATGAATTAACAAAACCTGTTATTGAACATTATAAGCAACAAAATAAAGTAATCACT
ATTGATGCTTCTGGTACGGTAGACGCAATTTTCGACAAAGTTAATCATGAACTTCAAAAA
TTCGGTGTGAAATAATTCAATCCTTTTTCATCAACCCATTACTACCTAGATATTTGCTTA
ATGTCATTTTACTTTAAGTATCCTAAATATCTTATATTGTACTATTATTGTTTGTAATAT
TGTGTTATTATATTGATTTGTATTTTAAAACCTTAGATGATAGATATTACTTACAAATAG
TTTATTAGTACAACTATATAATCAATAATATATGACCTAATTTTACCCAGTAGAATATTT
TTTTTCTTGTTTATTTTTTATTTATACTATCAAATTTTTTTGTTTTTATCTCAATTACTC
ACCTTTTAAGTGTGTTTTCTTTTAGTAGTACAAGGTTCATGTATTTTATCTCCTTTTTTG
TATCACGCTTTATCAAGTGTCTGTACATCTATTTATTGTCTTTTCTAGATTGTTTGTTTT
CTATTGTTTATATAATATATAAACTTTCTTTTGGAAATACCATAGAGTAAACAAGTAAAT
AATCAATTTCTTATTTAATTTGTTTACTTATTGAACTAATTAACGTTTAATATAAAAAAA
ATTAGTAGTAAAAAAAAAA

consensusID : consensus_10777#1
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 1
consensus length = 200
fasta sequence

                              [ACAACCTTAGATGATAGATATTACTTACAAATAGTTTATTGAGTACAACTATATAATCAATAATATATGACCTTATTTAACCCAGTAGAATATTTTTTTTCTTGTTTATTTTATATTACACTATCAAATTTTTTGTATCAATCTCAAACTACTCACCTCTTAAGTGTGTTTTCTTTAAGGAGTACAAGGTCAATGTATCT]

[+] EMBL AW061429             [ACAACCTTAGATGATAGATATTACTTACAAATAGTTTATTGAGTACAACTATATAATCAATAATATATGACCTTATTTAACCCAGTAGAATATTTTTTTTCTTGTTTATTTTATATTACACTATCAAATTTTTTGTATCAATCTCAAACTACTCACCTCTTAAGTGTGTTTTCTTTAAGGAGTACAAGGTCAATGTATCT]




>consensus_10777#1
ACAACCTTAGATGATAGATATTACTTACAAATAGTTTATTGAGTACAACTATATAATCAA
TAATATATGACCTTATTTAACCCAGTAGAATATTTTTTTTCTTGTTTATTTTATATTACA
CTATCAAATTTTTTGTATCAATCTCAAACTACTCACCTCTTAAGTGTGTTTTCTTTAAGG
AGTACAAGGTCAATGTATCT

consensus multiple alignement with clustalw

CLUSTAL W (1.82) multiple sequence alignment


consensus_10777#0      AATTATTATACGGTATTGGATTCGCGGTAGATAGCAGTCTTCTATTCCCTGTTAAACGGG 60
consensus_10777#1      ------------------------------------------------------------
                                                                                   

consensus_10777#0      ACTTTCAAAAGTACACAAACGATGACTGATCAGAAGTTAGCCAAAGCAAAAGTGATATTT 120
consensus_10777#1      ------------------------------------------------------------
                                                                                   

consensus_10777#0      GTATTAGGTGGACCAGGAAGTGGTAAGGGAACACAGTGTGAAAAATTAGTACAGAAATTT 180
consensus_10777#1      ------------------------------------------------------------
                                                                                   

consensus_10777#0      CATTTTAACCACTTATCCAGTGGTGATCTTTTACGAGCTGAAGTTCAGTCTGGTTCACCA 240
consensus_10777#1      ------------------------------------------------------------
                                                                                   

consensus_10777#0      AAAGGTAAAGAGTTAAAAGCTATGATGGAGAGAGGCGAACTTGTTCCTTTGGAAGTTGTT 300
consensus_10777#1      ------------------------------------------------------------
                                                                                   

consensus_10777#0      TTAGCTTTACTTAAAGAGGCAATGATTAAACTGGTTGACAAAAATTGTCATTTCCTTATC 360
consensus_10777#1      ------------------------------------------------------------
                                                                                   

consensus_10777#0      GATGGATATCCACGTGAATTGGATCAAGGCATTAAGTTTGAAAAAGAGGTATGTCCTTGT 420
consensus_10777#1      ------------------------------------------------------------
                                                                                   

consensus_10777#0      CTGTGCGTAATTAATTTCGACGTGAGTGAAGAAGTGATGCGTAAAAGACTATTGAAAAGA 480
consensus_10777#1      ------------------------------------------------------------
                                                                                   

consensus_10777#0      GCAGAGACTAGTAATCGTGTTGATGATAATGAAGAGACAATTGTGAAACGTTTTCGCACT 540
consensus_10777#1      ------------------------------------------------------------
                                                                                   

consensus_10777#0      TTCAATGAATTAACAAAACCTGTTATTGAACATTATAAGCAACAAAATAAAGTAATCACT 600
consensus_10777#1      ------------------------------------------------------------
                                                                                   

consensus_10777#0      ATTGATGCTTCTGGTACGGTAGACGCAATTTTCGACAAAGTTAATCATGAACTTCAAAAA 660
consensus_10777#1      ------------------------------------------------------------
                                                                                   

consensus_10777#0      TTCGGTGTGAAATAATTCAATCCTTTTTCATCAACCCATTACTACCTAGATATTTGCTTA 720
consensus_10777#1      ------------------------------------------------------------
                                                                                   

consensus_10777#0      ATGTCATTTTACTTTAAGTATCCTAAATATCTTATATTGTACTATTATTGTTTGTAATAT 780
consensus_10777#1      ------------------------------------------------------------
                                                                                   

consensus_10777#0      TGTGTTATTATATTGATTTGTATTTTAAAACCTTAGATGATAGATATTACTTACAAATAG 840
consensus_10777#1      --------------------------ACAACCTTAGATGATAGATATTACTTACAAATAG 34
                                                 * ********************************

consensus_10777#0      TTTATT-AGTACAACTATATAATCAATAATATATGACCTAATTTTACCCAGTAGAATATT 899
consensus_10777#1      TTTATTGAGTACAACTATATAATCAATAATATATGACCTTATTTAACCCAGTAGAATATT 94
                       ****** ******************************** **** ***************

consensus_10777#0      TTTTTTCTTGTTTATTTTTTATTTATACTATCAAATTTTTTTGTTTTTATCTCAA-TTAC 958
consensus_10777#1      TTTTTTCTTGTTTATTTTATATT-ACACTATCAAATTTTTT-GTATCAATCTCAAACTAC 152
                       ****************** **** * *************** ** *  *******  ***

consensus_10777#0      TCACCTTTTAAGTGTGTTTTCTTTTAGTAGTACAAGGTTCATGTATTTTATCTCCTTTTT 1018
consensus_10777#1      TCACCTCTTAAGTGTGTTTTCTTTAAGGAGTACAAGGTCAATGTATCT------------ 200
                       ****** ***************** ** **********  ****** *            

consensus_10777#0      TGTATCACGCTTTATCAAGTGTCTGTACATCTATTTATTGTCTTTTCTAGATTGTTTGTT 1078
consensus_10777#1      ------------------------------------------------------------
                                                                                   

consensus_10777#0      TTCTATTGTTTATATAATATATAAACTTTCTTTTGGAAATACCATAGAGTAAACAAGTAA 1138
consensus_10777#1      ------------------------------------------------------------
                                                                                   

consensus_10777#0      ATAATCAATTTCTTATTTAATTTGTTTACTTATTGAACTAATTAACGTTTAATATAAAAA 1198
consensus_10777#1      ------------------------------------------------------------
                                                                                   

consensus_10777#0      AAATTAGTAGTAAAAAAAAAA 1219
consensus_10777#1      ---------------------