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Schistosoma mansoni
cluster # 10806 cluster # 10806       Sequences # 22       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_10806#0 length = 422 sequences # 22  

consensusID : consensus_10806#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 22
consensus length = 422
fasta sequence
                              [CCCGTCGTCGTCGTTGTTATCACCATCTGTCTATCTATGTATATGTTCATACATGGAATGTATGTATGTAATATTTTTTTCTTTTACATGTATATCAATT-TCTTCATATATATAGAGTTGGATATAAGCGATATAAGATCTCGTGTTTCACACGCAATCAATATATATTCAATGAATAATCGTACTTGTTGTTCCCGTCGTCAGTTTATCGATTTC-TTGCTCATATGAATTTTCTTTGATTCTTCTCCACTATTGTCAATACCAATCATGATGATGACTTGATGACATGTTGTTG-TTTTTTTATTTTATAGTATATATACTACTCAATAATGCTATTTATTTGATCA-TTTTTTGTAAAATTGATTTTGTACCATTATTTTTCATCAATTGGCGCTCTATTATTACGGAATGACAAAAGATGA]

[+] EMBL CD116166             [  CGTCGTCGTCGTTGTTATCACCATCTGTCTATCTATGTATATGTTCATACATGGAATGTATGTATGTAATATTTTTTTCTTTTACATATATATCAATT TCTTCATATATATAGAGTTGGATATAAGCGATATAAGATCTCGTGTTTCACACGCAATCAATATATATTCAATGAATAATCGTACTTGTTGTTCCCGTCGTCAGTTTATCGATTTC TTGCCCATATGAATTTTCTTTGATTCTTCTCCACTATTGTCAATACCAATCATGATGATGACTTGATGACATGTTGTTG TTTTTTTATTTTATAGTATATATACTACTCAATAATGCTATTTATTTGATCA TTTTTTGTAAAATTGATTTTGTACCATTATTTTTCATCAATTGGCGCTCTATTATTACGGAATGACAAAAGATG ]
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[-] EMBL CD154543             [   GTCGTCGTCGTTGTTATCACCATCTGTCTATCTATGTATATGTTCATACATGGAATGTATGTATGTAATATTTTTTTCTTTTACATGTATATCAATT TCTTCATATATATAGAGTTGGATATAAGCGATATAAGATCTCGTGTTTCACACGCAATCAATATATATTCAATGAATAATCGTACTTGTTGCCCCCGTCGTCAGTTTATCGATTTC TTGCTCATATGAATTTTCTTTGATTCTTCTCCACTATTGTCAATACCAATCATGATGATGACTTGATGACATGTTGTTG TTTTTTTATTTTATAGCATATATACTACTCAATAATGCTATTTATTTGATCATTTTTTTGTAAAATTGATTTTGTACCATTATTTTTCATCAGTTGGCGCTCTATTATTACGGAATGACAAAAGATGA]
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[-] EMBL CD116133             [   GTCGTCGTCGTTGTTATCACCATCTGTCTATCTATGTATATGTTCATACATGGAATGTATGTATGTAATATTTTTTTCTTTTACATGTATATCAATT TCTTCATATATATAGAGTTGGATATAAGCGATATAAGATCTCGTGTTTCACACGCAATCAATATATATTCAATGAATAATCGTACTTGTTGTTCCCGTCGTCAGTTTATCGATTTC TTGCTCATATGAATTTTCTTTGATTCTTCTCCACTATTGTCAATACCAATCATGATGATGACTTGATGACATGTTGTTG TTTTTTTATTTTATAGTATATATACTACTCAATAATGCTATTTATTTGATCA TTTTTTGTAAAATTGATTTTGTACCATTATTTTTCATCAATTGGCGCTCTATTATTACGGAATGACAAAAGATGA]
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[-] EMBL CD154446             [   GTCGTCGTCGTTGTTATCACCATCTGTCTATCTATGTATATGTTCATACATGGAATGTATGTATGTAATATTTTTTTCTTTTACATGTATATCAATT TCTTCATATATATAGAGTTGGATATAAGCGATATAAGATCTCGTGTTTCACACGCAATCAATATATATTCAATGAATAATCGTACTTGTTGTTCCCGTCGTCAGTTTATCGATTTC TTGCTCATATGAATTTTCTTTGATTCTTCTCCACTATTGTCAATACCAATCATGATGATGACTTGATGACATGTTGTTG TTTTTTTATTTTATAGTATATATACTACTCAATAATGCTATTTATTTGATCA TTTTTTGTAAAATTGATTTTGTACCATTATTTTTCATCAATTGGCGCTCTATTATTACGGAATGACAAAAGATGA]
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[+] EMBL CD154307             [cctacgttaGTCGTTGTTATCACCATCTGACTATCTATGTATATGCTCATACATGGAACGTATGCATGTAAGATTTTTTTCTTTTACATGTATATCAAGT TCTTCATATATATAAAGTTGGATATAAGCGATATAAGATCTCGTGATTCACACGCAGTCAATATATATTCAATGAATAACCGTACTTGTTGTTCCCGCCGTCAGTTTATCGATTTC TTGCTCATATGAATTTTCTTTGATTCTTCTCCACTATTGTCAATACCAATCATGACGATGACTTGATGACATGTTGGTG ATTTTTTATTTTATAGTATATATACTACTCAATAATGCTATTTATTTGATCA TTTTTTGTAAAATTGATTTTGCACCATTATTTTTCATCAATTGGCGCTCTATTATTACGGAATGACCAACGATG ]
[-] EMBL CD116301             [                             TCTATCTATGTATATGTTCATACATGGAATGTATGTATGTAATATTTTTTTCTTTTACATGTATATCAATT TCTTCATATATATAGAGTTGGATATAAGCGATATAAGATCTCGTGTTTCACACGCAATCAATATATATTCAATGAATAATCGTACTTGTTGTTCCCGTCGTCAGTTTATCGATTTC TTGCTCATATGAATTTTCTTTGATTCTTCTCCACTATTGTCAATACCAATCATGATGATGACTTGATGACATGTTGTTGTTTTTTTTATTTTATAGTATATATACTACTCAATAATGCTATTTATTTGATCA TTTTTTGTAAAATTGATTTTGTACCATTATTTTTCATCAATTGGCGCTCTATTATTACGGAATGACAAAAGATGA]
[-] EMBL CD135512             [                                                                                                               TATAGAGTTGGATATAAGCGATATAAGATCTCGTGTTTCACACGCAATCAATATATATTCAATGAATAATCGTACTTGTTGTTCCCGTCGTCAGTTTATCGATTTC TTGCTCATATGAATTTTCTTTGATTCTTCTCCACTATTGTCAATACCAATCATGATGATGACTTGATGACATGTTGTTG TTTTTTTATTTTATAGTATATATACTACTCAATAATGCTATTTATTTGATCA TTTTTTGTAAAATTGATTTTGTACCATTATTTTTCATCAATTGGCGCTCTATTATTACGGAATGACAAAAGATGA]
[-] EMBL CD193035             [                                                                                                                    AGTTGGATATAAGCGATATAAGATCTCGTGTTTCACACGCAATCAATATATATTCAATGAATAATCGTACTTGTTGTTCCCGTCGTCAGTTTATCGATTTC TTGCTCATATGAATTTTCTTTGATTCTTCTCCACTATTGTCAATACCAATCATGATGATGACTTGATGACATGTTGTTG TTTTTTTATTTTATAGTATATATACTACTCAATAATGCTATTTATTTGATCA TTTTTTGTAAAATTGATTTTGTACCATTATTTTTCATCAATTGGCGCTCTATTATTACGGAATGACAAAAGATGA]


>consensus_10806#0 CCCGTCGTCGTCGTTGTTATCACCATCTGTCTATCTATGTATATGTTCATACATGGAATG TATGTATGTAATATTTTTTTCTTTTACATGTATATCAATTTCTTCATATATATAGAGTTG GATATAAGCGATATAAGATCTCGTGTTTCACACGCAATCAATATATATTCAATGAATAAT CGTACTTGTTGTTCCCGTCGTCAGTTTATCGATTTCTTGCTCATATGAATTTTCTTTGAT TCTTCTCCACTATTGTCAATACCAATCATGATGATGACTTGATGACATGTTGTTGTTTTT TTATTTTATAGTATATATACTACTCAATAATGCTATTTATTTGATCATTTTTTGTAAAAT TGATTTTGTACCATTATTTTTCATCAATTGGCGCTCTATTATTACGGAATGACAAAAGAT GA



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)