cluster # 10831

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Schistosoma mansoni
cluster # 10831 cluster # 10831 Sequences # 23 consensus # 3

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consensus_10831#0 length = 793 sequences # 2

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consensusID : consensus_10831#0
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NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
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fasta sequence

                              [GATCACATCCTCTTTTCTTCTCTACAGGCGAGTTCAAAATGCAGAAACGAACTGAGTACCAGTGACGTACAGATTTTCTCAGTAAGTCATCAATTCTTGGGAGTAGTGTCTACAACTTTAATTGGCTAATTCAAGGGAACACTACGCTAACAGACCACTAGAGAGGATAAATATAGGCCGTCAGTCTTTTCTTCAATACGCAGTTCAAAGTTTGGAAGCATATTACCGACAAAACAAGTTTATATTGCTTTAAAGAAAATCAGTCTTAAGGCAATGACTTACAGTTAATAAATCTTAGGAATGGTCCAAACACTCTGCTTCCACTATAAACCATTAACGAGACTACAGATTATTGTATCTATTTGAGAACTTATGTATCCTTGACAAAACCCACTGATGTCCCTAAACGTGATTTACTTAATACAACGAAAACGAAAAATGGGTGACAATGTCAAGTCACAAACTCATCACAGATTAATAGAAAATACGTAAGAATGTCTACATACATAAGGAACGGAAGGTGGTAACCGAGTAAAAATAACCTACACACAAATATTTTGTTATCTTG-AAATTATATTGAAGAGTACAAAAGTTCTGTACATGACTCAAGGCAATATTTAGGGGTTTTTCTGTTGTTTTTTTTAATTAATCAAGCATTTCATTGTTTTCCACATTGGAAAGAAAATTGTTAGAATCATTTAATGTTTGCTGCTTTACTTGTATATACATAGATTTTATATATAAAACANATATTAAACCATTTTACGTTGTCTTGTTTTATGCTAATGATCGG]

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[+] EMBL CD131398             [                                                                                                                                                                                                          GTTCAAAGTTTGGAAGCATATTACCGACAAAACAAGTTTATATTGCTTTAAAGAAAATCAGTCTTAAGGCAATGACTTACAGTTAATAAATCTTAGGAATGGTCCAAACACTCTGCTTCCACTATAAACCATTAACGAGACTACAGATTATTGTATCTATTTGAGAACTTATGTATCCTTGACAAAACCCACTGATGTCCCTAAACGTGATTTACTTAATACAACGAAAACGAAAAATGGGTGACAATGTCAAGTCACAAACTCATCACAGATTAATAGAAAATACGTAAGAATGTCTACATACATAAGGAACGGAAGGTGGTAACCGAGTAAAAATAACCTACACACAAATATTTTGTTATCTTGAAAATTATATTGAAGAGTACAAAAGTTCTGTACATGACTCAAGGCAATATTTAGGGGTTTTTCTGTTGTTTTTTTTAATTAATCAAGCATTTCATTGTTTTCCACATTGGAAAGAAAATTGTTAGAATCATTTAATGTTTGCTGCTTTACTTGTATATACATAGATTTTATATATAAAACANATATTAAACCATTTTACGTTGTCTTGTTTTATGCTAATGATCGG]




>consensus_10831#0
GATCACATCCTCTTTTCTTCTCTACAGGCGAGTTCAAAATGCAGAAACGAACTGAGTACC
AGTGACGTACAGATTTTCTCAGTAAGTCATCAATTCTTGGGAGTAGTGTCTACAACTTTA
ATTGGCTAATTCAAGGGAACACTACGCTAACAGACCACTAGAGAGGATAAATATAGGCCG
TCAGTCTTTTCTTCAATACGCAGTTCAAAGTTTGGAAGCATATTACCGACAAAACAAGTT
TATATTGCTTTAAAGAAAATCAGTCTTAAGGCAATGACTTACAGTTAATAAATCTTAGGA
ATGGTCCAAACACTCTGCTTCCACTATAAACCATTAACGAGACTACAGATTATTGTATCT
ATTTGAGAACTTATGTATCCTTGACAAAACCCACTGATGTCCCTAAACGTGATTTACTTA
ATACAACGAAAACGAAAAATGGGTGACAATGTCAAGTCACAAACTCATCACAGATTAATA
GAAAATACGTAAGAATGTCTACATACATAAGGAACGGAAGGTGGTAACCGAGTAAAAATA
ACCTACACACAAATATTTTGTTATCTTGAAATTATATTGAAGAGTACAAAAGTTCTGTAC
ATGACTCAAGGCAATATTTAGGGGTTTTTCTGTTGTTTTTTTTAATTAATCAAGCATTTC
ATTGTTTTCCACATTGGAAAGAAAATTGTTAGAATCATTTAATGTTTGCTGCTTTACTTG
TATATACATAGATTTTATATATAAAACANATATTAAACCATTTTACGTTGTCTTGTTTTA
TGCTAATGATCGG

consensusID : consensus_10831#1
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NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
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fasta sequence

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[-] EMBL CD131645             [            TTTTTTTCAATACGCAGTTCAAAGTTTGGAAGCATATTACCGACAAAACAAGTTTATATTGCTTTAAAGAAAATCAGTCTTAAGGCAATGACTTACAGTTAATAAATCTTAGGAATGGTCCAAACACTCTGCTTCCACTATAAACCATTAACGAGACTACAGATTATTGTATCTATTTGAGAACTTATGTATCCTTGACAAAACCCACTGATGTCCCTAAACGTGATTTACTTAATACAACGAAAACGAAAAATGGGTGACAATGTCAAGTCACAAACTCATCACAGATTAATAGAAAATACGTAAGAATGTCTACATACATAAGGAACGGAAGGTGGTAACCGAGTAAAAATAACCTACACACAAATATTTTGTTATCTTGAAAATTATATTGAAGAGTACAAAAGTTCTGTACATGACTCAAGGCAATATTTAGGGGTTTTTTGTCTTGTTATATTTCCGAGTGACTTATTCTCAGCGTTAAAATCAAAAACCCTAGAACTGTTC]
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[+] EMBL CD131430             [                             TTCAAAGTTTGGAAGCATATTACCGACAAAACAAGTTTATATTGCTTTAAAGAGAATCAGTCTTAAGGCAATGACTTACAGTTAATAAATCTTAGGAATGGTCCAAACACTCTGCTTCCACTATAAACCATTAACGAGACTACAGATTATTGTATCTATTTGAGAACTTATGTATCCTTGACAAAACCCACTGATGTCCCTAAACGTGATTTACTTAATACAACGAAAACGAAAAATGGGTGACAATGTCAAGTCACAAACTCATCACAGATTAATAGAAAATACGTAAGAATGTCTACATACATAAGGAACGGAAGGTGGTAACCGAGTAAAAATAACCTACACACAAATATTTTGTTATCTTGAAAATTATATTGAAGAGTACAAAAGTTCTGTACGTGACTCAAGGCAATATTTAGGGG TTTTTGTCTTGTTATATTTCCGAGTGACTTATTCTCAGCGTTAAAATCAAAAACCCTAGAACTGTT ]
[-] EMBL CD133731             [                                                  ACCGACAAAACAAGTTTATATTGCCTTAAAGAAAATCAGTCTTAAGGCAATGACTTACAGTTAATAAATCTTAGGAATGGTCCAAACACTCTGCTTCCACTATAAACCATTAACGAGACTACAGATTATTGTATCTATTTGAGAACTTATGTATCCTTGACAAAACCCACTGATGTCCCTAAACATGATTTACTTAATACAACGAAAACGAAAAATGGGTGACAATGTCAAGTCACAAACTCATCACAGATTAATAGAAAATACGTAAGAATGTCTACATACATAAGGAACGGAAGGTGGTAACCGAGTAAAAATAACCTACACACAAATATTTTGTTATCTTGAAAATTATATTGAAGAGTACAAAAGTTCTGTACATGACTCAAGGCAATATTTAGGGGTTTTTTGTCTTGTTATATTTCCGAGTGACTTATTCTCAGCGTTAAAATCAAAAACCCTAGAACTGTTC]




>consensus_10831#1
ANGCGGCCGCCNTTTTTTTCAATACGCAGTTCAAAGTTTGGAAGCATATTACCGACAAAA
CAAGTTTATATTGCTTTAAAGAAAATCAGTCTTAAGGCAATGACTTACAGTTAATAAATC
TTAGGAATGGTCCAAACACTCTGCTTCCACTATAAACCATTAACGAGACTACAGATTATT
GTATCTATTTGAGAACTTATGTATCCTTGACAAAACCCACTGATGTCCCTAAACGTGATT
TACTTAATACAACGAAAACGAAAAATGGGTGACAATGTCAAGTCACAAACTCATCACAGA
TTAATAGAAAATACGTAAGAATGTCTACATACATAAGGAACGGAAGGTGGTAACCGAGTA
AAAATAACCTACACACAAATATTTTGTTATCTTGAAAATTATATTGAAGAGTACAAAAGT
TCTGTACATGACTCAAGGCAATATTTAGGGGTTTTTTGTCTTGTTATATTTCCGAGTGAC
TTATTCTCAGCGTTAAAATCAAAAACCCTAGAACTGTTC

consensusID : consensus_10831#2
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 1
consensus length = 498
fasta sequence

                              [ATACGCAGTTCAAAGTTTGGAAGCATATGACCGACAAAACAAGTTTATATTGCTTTAAAGAAAATCAGTCTTAAGGCAATGACTTACAGTTAATAAATCTTAGGAATGGTCCAAACACTCTGCTTCCACTATAAACCATTAACGAGACTACAGATTATTGTATCTATTTGAGAACTTATGTATCCTTGACCGCCCCTTTTTTGTGACTCATTTCTTGGTCCTCTACTCAACATCTTTTTTGTGAGGCATTTACACATTTATTCACTTCTATCATCGCAAATATGTGTACTTCTCCGGTACAACAGAACCAGCATACACGTGGAATAATATCAAGTAATTCAAACTCTCAAGATGTTCAGGAAACAGAAGTGTTACGAAGTAATGTATTGCGAACAAAGTTAGCGAATAAACTGGGAAAGTTCAAAAGTAGAAAATTAGTAAGACGTGGGACATTCGGAAGTGATAAAAAAAGTTTGATTTTTATCCATCATAATGATT]

[-] EMBL CD131505             [ATACGCAGTTCAAAGTTTGGAAGCATATGACCGACAAAACAAGTTTATATTGCTTTAAAGAAAATCAGTCTTAAGGCAATGACTTACAGTTAATAAATCTTAGGAATGGTCCAAACACTCTGCTTCCACTATAAACCATTAACGAGACTACAGATTATTGTATCTATTTGAGAACTTATGTATCCTTGACCGCCCCTTTTTTGTGACTCATTTCTTGGTCCTCTACTCAACATCTTTTTTGTGAGGCATTTACACATTTATTCACTTCTATCATCGCAAATATGTGTACTTCTCCGGTACAACAGAACCAGCATACACGTGGAATAATATCAAGTAATTCAAACTCTCAAGATGTTCAGGAAACAGAAGTGTTACGAAGTAATGTATTGCGAACAAAGTTAGCGAATAAACTGGGAAAGTTCAAAAGTAGAAAATTAGTAAGACGTGGGACATTCGGAAGTGATAAAAAAAGTTTGATTTTTATCCATCATAATGATT]




>consensus_10831#2
ATACGCAGTTCAAAGTTTGGAAGCATATGACCGACAAAACAAGTTTATATTGCTTTAAAG
AAAATCAGTCTTAAGGCAATGACTTACAGTTAATAAATCTTAGGAATGGTCCAAACACTC
TGCTTCCACTATAAACCATTAACGAGACTACAGATTATTGTATCTATTTGAGAACTTATG
TATCCTTGACCGCCCCTTTTTTGTGACTCATTTCTTGGTCCTCTACTCAACATCTTTTTT
GTGAGGCATTTACACATTTATTCACTTCTATCATCGCAAATATGTGTACTTCTCCGGTAC
AACAGAACCAGCATACACGTGGAATAATATCAAGTAATTCAAACTCTCAAGATGTTCAGG
AAACAGAAGTGTTACGAAGTAATGTATTGCGAACAAAGTTAGCGAATAAACTGGGAAAGT
TCAAAAGTAGAAAATTAGTAAGACGTGGGACATTCGGAAGTGATAAAAAAAGTTTGATTT
TTATCCATCATAATGATT

consensus multiple alignement with clustalw

CLUSTAL W (1.82) multiple sequence alignment


consensus_10831#0      GATCACATCCTCTTTTCTTCTCTACAGGCGAGTTCAAAATGCAGAAACGAACTGAGTACC 60
consensus_10831#1      ------------------------------------------------------------
consensus_10831#2      ------------------------------------------------------------
                                                                                   

consensus_10831#0      AGTGACGTACAGATTTTCTCAGTAAGTCATCAATTCTTGGGAGTAGTGTCTACAACTTTA 120
consensus_10831#1      ------------------------------------------------------------
consensus_10831#2      ------------------------------------------------------------
                                                                                   

consensus_10831#0      ATTGGCTAATTCAAGGGAACACTACGCTAACAGACCACTAGAGAGGATAAATATAGGCCG 180
consensus_10831#1      ------------------------------------------------------ANGCGG 6
consensus_10831#2      ------------------------------------------------------------
                                                                                   

consensus_10831#0      TCAGTCTTTTCTTCAATACGCAGTTCAAAGTTTGGAAGCATATTACCGACAAAACAAGTT 240
consensus_10831#1      CCGCCNTTTTTTTCAATACGCAGTTCAAAGTTTGGAAGCATATTACCGACAAAACAAGTT 66
consensus_10831#2      ---------------ATACGCAGTTCAAAGTTTGGAAGCATATGACCGACAAAACAAGTT 45
                                      **************************** ****************

consensus_10831#0      TATATTGCTTTAAAGAAAATCAGTCTTAAGGCAATGACTTACAGTTAATAAATCTTAGGA 300
consensus_10831#1      TATATTGCTTTAAAGAAAATCAGTCTTAAGGCAATGACTTACAGTTAATAAATCTTAGGA 126
consensus_10831#2      TATATTGCTTTAAAGAAAATCAGTCTTAAGGCAATGACTTACAGTTAATAAATCTTAGGA 105
                       ************************************************************

consensus_10831#0      ATGGTCCAAACACTCTGCTTCCACTATAAACCATTAACGAGACTACAGATTATTGTATCT 360
consensus_10831#1      ATGGTCCAAACACTCTGCTTCCACTATAAACCATTAACGAGACTACAGATTATTGTATCT 186
consensus_10831#2      ATGGTCCAAACACTCTGCTTCCACTATAAACCATTAACGAGACTACAGATTATTGTATCT 165
                       ************************************************************

consensus_10831#0      ATTTGAGAACTTATGTATCCTTGACAAAACCCACTGATGTCCCTAAACGTGATTTACTTA 420
consensus_10831#1      ATTTGAGAACTTATGTATCCTTGACAAAACCCACTGATGTCCCTAAACGTGATTTACTTA 246
consensus_10831#2      ATTTGAGAACTTATGTATCCTTGACCGC-CCCTTTTTTGTGACTCATTTCTTGGTCCTCT 224
                       *************************    ***  *  ***  ** *        * **  

consensus_10831#0      ATACAACGAAAACGAAAAATGGGTGACAATGTCAAGTCACAAACTCATCACAGATTAATA 480
consensus_10831#1      ATACAACGAAAACGAAAAATGGGTGACAATGTCAAGTCACAAACTCATCACAGATTAATA 306
consensus_10831#2      ACTCAAC----ATCTTTTTTGTGAGGCATTTACA---CATTTATTCACTTCTA--TCATC 275
                       *  ****    *       ** * * ** *  **   **   * ***   *    * ** 

consensus_10831#0      GAAAATACGTAAGAATGTCTACATACATAAGGAACGGAAGGTGGTAACCGAGTAAAAATA 540
consensus_10831#1      GAAAATACGTAAGAATGTCTACATACATAAGGAACGGAAGGTGGTAACCGAGTAAAAATA 366
consensus_10831#2      GCAAATATGTGTACTTCTCCG-GTACAACAGAACCAGCATACAC--GTGGAATAATATCA 332
                       * ***** **     * **    ****  ** * * * *          ** *** *  *

consensus_10831#0      ACCTACACACAAATATTTTGTTATCTTGAAA-TTATATTGAAGAGTACAAAAGTTCTGTA 599
consensus_10831#1      ACCTACACACAAATATTTTGTTATCTTGAAAATTATATTGAAGAGTACAAAAGTTCTGTA 426
consensus_10831#2      AGTAATTCA-AACTCTCAAGATGTTCAGGAAACAGAAGTGTTACGAAGTAATGTATTGCG 391
                       *   *  ** ** * *   * * *   * **     * **    * *  ** **  **  

consensus_10831#0      CATGACTCAAGGCAATATTTAGGGGTTTTTCTGTTGTTTTTTTTAATTAATCAAGCATTT 659
consensus_10831#1      CATGACTCAAGGCAATATTTAGGGGTTTTT----TGTCTTGTTATATTT-CCGAGTGACT 481
consensus_10831#2      AACAAAGTTAGCGAATAAACTGGGAAAGTTC---AAAAGTAGAAAATTAGTAAGACGTGG 448
                        *  *    **  ****    ***    **         *     ***            

consensus_10831#0      CATTGTTTTCCACATTGGAAAGAAAATTGTTAGAATCATTTAATGTTTGCTGCTTTACTT 719
consensus_10831#1      TA---TTCTCAGCGTTAAAATCAAAAACCCTAGAACTGTTC------------------- 519
consensus_10831#2      GA---CATTCGGAAGTGATAAAAAAAGTTTGATTTTTATCCATCATAATGATT------- 498
                        *      **     *   *  ****     *      *                     

consensus_10831#0      GTATATACATAGATTTTATATATAAAACANATATTAAACCATTTTACGTTGTCTTGTTTT 779
consensus_10831#1      ------------------------------------------------------------
consensus_10831#2      ------------------------------------------------------------
                                                                                   

consensus_10831#0      ATGCTAATGATCGG 793
consensus_10831#1      --------------
consensus_10831#2      --------------