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Schistosoma mansoni
cluster # 1085 cluster # 1085       Sequences # 2       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_1085#0 length = 1241 sequences # 2  

consensusID : consensus_1085#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 2
consensus length = 1241
fasta sequence
                              [AGACTAATTGTAACAACAGTAAATGGCAATTCAAACTTAAACTGTGATCGTAATCAAATTTCACAACCGATAAGTAAAGGAGCACGTTCAAGTACATTGACATTGTTATGTACATCATTTTATCTTATTATTGCACATCTATCTGTAGCAATAGCCGTAGTAATTCATAAACGTTTACCAACTGGTAATGAATATTTAAGTGATGAACAAATACGTAATGATCCTGGTTGGACAACTTATTTTCGTTTCTTTACAGTGCGTGTATTGATCGAATGTTTTGCGATGACACATTATGCAGCAAAATTTCCAATTTATTTAGCAACAAGTAAACAATTTCGTCATGAATTTTGTCGAATATTTCAATGTTGTTGCAGAAATCAATCTTATTTATCACGAGATACTGATGCAGATATGGATCAAAGTACACACTTACAAAATGGTAAACGTTCAACATACATGTCTAACAGTAAACATTCGTTAAACACTGTATGTAAAACAAGTTTTACACAAAAGAAACTAAGGAATTCTGCTGTATCATTCTCTTCCACAAATGAAAATTTGTTACCTACAAAAATTCGAAGACGTCCATCACCTGGTCTAAGTCGTACCGTTCTAGGTGTAGACGGACAACGTGTGAAAGTTAAATCAAATGTTTCTTTAAGTGTTTAATAAATCCAATAAATGAAATAAATATTATTATCTACGTCATATGAACAAACCCCCCCCCAACCCCCAAAAACACTATCAAGTATTCAAATATATCTACTTTTAAGTATGACAAAACTACTCATTTCAGTTTCGACGGTGTATACTTTTTTTATACCTTATACCAAGCACAATAAATGTATGAATGAAAATTTATTATTTTTATAATCAATGTAAAATGTCACAAACATTATCTCTTTAATATAAACAACTTATTAATCCAAAAAAGAAATGTTTGTTTGTTTTTCTATAAAACTACTAATCTATGCATTTGATAAAAAAGTTCAGCGATCTATAGATACTCTATATCTGTTCATTGGAAACATTACCATTATATTCATATGAAAGACAATCATTTCATTTTGATATCTGAATATATATGAAGTTTAATAAAGAGTAATTATAATACACAGTTCTATTTAGGAACTTATTTACAGTAAATTATTATATAATGAAATGTATTGTAATGTTAACAACAGAAAATGCATAAATGAGTCATAGTAATAAAAAAAAGAAAAAAANAAAGTCTGNCCGCG]

[+] EMBL CD082278             [AGACTAATTGTAACAACAGTAAATGGCAATTCAAACTTAAACTGTGATCGTAATCAAATTTCACAACCGATAAGTAAAGGAGCACGTTCAAGTACATTGACATTGTTATGTACATCATTTTATCTTATTATTGCACATCTATCTGTAGCAATAGCCGTAGTAATTCATAAACGTTTACCAACTGGTAATGAATATTTAAGTGATGAACAAATACGTAATGATCCTGGTTGGACAACTTATTTTCGTTTCTTTACAGTGCGTGTATTGATCGAATGTTTTGCGATGACACATTATGCAGCAAAATTTCCAATTTATTTAGCAACAAGTAAACAATTTCGTCATGAATTTTGTCGAATATTTCAATGTTGTTGCAGAAATCAATCTTATTTATCACGAGATACTGATGCAGATATGGATCAAAGTACACACTTACAAAATGGTAAACGTTCAACATACATGTCTAACAGTAAACATTCGTTAAACACTGTATGTAAAACAAGTTTTACACAAAAGAAACTAAGGAATTCTGCTGTATCATTCTCTTCCACAAATGAAAATTTGTTACCTACAAAAATTCGAAGACGTCCATCACCTGGTCTAAGTCGTACCGTTCTAGGTGTAGACGGACAACGTGTGAAAGTTAAATCAAATGTTTCTTTAAGTGTTTAATA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          ]
[-] EMBL CD075883             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 GAAGACGTCCATCACCTGGTCTAAGTCGTACCGTTCTAGGTGTAGACGGACAACGTGTGAAAGTTAAATCAAATGTTTCTTTAAGTGTTTAATAAATCCAATAAATGAAATAAATATTATTATCTACGTCATATGAACAAACCCCCCCCCAACCCCCAAAAACACTATCAAGTATTCAAATATATCTACTTTTAAGTATGACAAAACTACTCATTTCAGTTTCGACGGTGTATACTTTTTTTATACCTTATACCAAGCACAATAAATGTATGAATGAAAATTTATTATTTTTATAATCAATGTAAAATGTCACAAACATTATCTCTTTAATATAAACAACTTATTAATCCAAAAAAGAAATGTTTGTTTGTTTTTCTATAAAACTACTAATCTATGCATTTGATAAAAAAGTTCAGCGATCTATAGATACTCTATATCTGTTCATTGGAAACATTACCATTATATTCATATGAAAGACAATCATTTCATTTTGATATCTGAATATATATGAAGTTTAATAAAGAGTAATTATAATACACAGTTCTATTTAGGAACTTATTTACAGTAAATTATTATATAATGAAATGTATTGTAATGTTAACAACAGAAAATGCATAAATGAGTCATAGTAATAAAAAAAAGAAAAAAANAAAGTCTGNCCGCG]


>consensus_1085#0 AGACTAATTGTAACAACAGTAAATGGCAATTCAAACTTAAACTGTGATCGTAATCAAATT TCACAACCGATAAGTAAAGGAGCACGTTCAAGTACATTGACATTGTTATGTACATCATTT TATCTTATTATTGCACATCTATCTGTAGCAATAGCCGTAGTAATTCATAAACGTTTACCA ACTGGTAATGAATATTTAAGTGATGAACAAATACGTAATGATCCTGGTTGGACAACTTAT TTTCGTTTCTTTACAGTGCGTGTATTGATCGAATGTTTTGCGATGACACATTATGCAGCA AAATTTCCAATTTATTTAGCAACAAGTAAACAATTTCGTCATGAATTTTGTCGAATATTT CAATGTTGTTGCAGAAATCAATCTTATTTATCACGAGATACTGATGCAGATATGGATCAA AGTACACACTTACAAAATGGTAAACGTTCAACATACATGTCTAACAGTAAACATTCGTTA AACACTGTATGTAAAACAAGTTTTACACAAAAGAAACTAAGGAATTCTGCTGTATCATTC TCTTCCACAAATGAAAATTTGTTACCTACAAAAATTCGAAGACGTCCATCACCTGGTCTA AGTCGTACCGTTCTAGGTGTAGACGGACAACGTGTGAAAGTTAAATCAAATGTTTCTTTA AGTGTTTAATAAATCCAATAAATGAAATAAATATTATTATCTACGTCATATGAACAAACC CCCCCCCAACCCCCAAAAACACTATCAAGTATTCAAATATATCTACTTTTAAGTATGACA AAACTACTCATTTCAGTTTCGACGGTGTATACTTTTTTTATACCTTATACCAAGCACAAT AAATGTATGAATGAAAATTTATTATTTTTATAATCAATGTAAAATGTCACAAACATTATC TCTTTAATATAAACAACTTATTAATCCAAAAAAGAAATGTTTGTTTGTTTTTCTATAAAA CTACTAATCTATGCATTTGATAAAAAAGTTCAGCGATCTATAGATACTCTATATCTGTTC ATTGGAAACATTACCATTATATTCATATGAAAGACAATCATTTCATTTTGATATCTGAAT ATATATGAAGTTTAATAAAGAGTAATTATAATACACAGTTCTATTTAGGAACTTATTTAC AGTAAATTATTATATAATGAAATGTATTGTAATGTTAACAACAGAAAATGCATAAATGAG TCATAGTAATAAAAAAAAGAAAAAAANAAAGTCTGNCCGCG



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)