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Schistosoma mansoni
cluster # 10892 cluster # 10892       Sequences # 24       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_10892#0 length = 909 sequences # 24  

consensusID : consensus_10892#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 24
consensus length = 909
fasta sequence
                              [ATTCGACTGGTGATAATGATGCTTCATATTTAGGGAACAAAGGTCAATGCTTGAAAGCAAAGCTCAATGCCTTTAAAAATTTAGATAAATTGATTTCCCAAAAAAGTGACATATTTAAATCTTGGTTAGAAAGTGTTTCACCACGCAGCAGATGTTCCTGAATTGTGGGAAGCACCCAACTCACCAAATGACTGGTTTGGAGTTGTACGTAACCAGCTGTATAGTCTACTTCTTATTCAAGCTTTCCGTCCTGACCGCATTCTTGCTGCTGCCCATCCTTTTGTCATCACATGTTTTGGACAAAACTTTATGGAGTCGGCTCGTGGTCATTTAGATTTAATGTCAATTGTAGAGCATGAAATCCGAGCTAATATACCAGTTTTATTGTGTGCTGCACAAGGTTTCGATCCAAGTGGTCGTGTGGAGGAGCTAGCAAATGAACACAACAAACAGCTAACAAGTATAGCTATTGGTTCTGCTGAAGGTTTTTCACAGGCTGATAAAGCAATCAATTCTGCAGCAAAAAGTGGAAAATGGGTTATGTTGAAAAATGTTCATTTGGCCTCTGGATGGTTGGTACAAATGGAGAAGAAGCTTCATAGTGTACAACCTCATCCGAACTTCCGACTATTCCTTACAATGGAAATAAATCCCAAGCTACCCGTAAATGTACTACGTTCTGGTCGTGTTTTAGTGTTTGAACCGCCACCTGGTATTAAGGCAAGTCTTTTACGGACATTTGCCAATGTTCCTGCCAGTCGAATTTCTCGTGCGCCTGCTGAAAGAGCTCGCCTTTACTTCCTACTCGCTTGGTTTAATGCTGTGGTACAAGAGCGATTACGTTATGTTCCTTTAGGTTGGTCTAAACGATACGAATTCAATGAATCCGATCTCAAAGTCGCTTGTGAT]

[+] EMBL CD068094             [ATTCGACTGGTGATAATGATGCTTCATATTTAGGGAACAAAGGTCAATGCTTGAAAGCAAAGCTCAATGCCTTTAAAAATTTAGATAAATTGATTTCCCAAAAAAGTGACATATTTAAATCTTGGTTAGAAAGTGTTTCACCACGCAGCAGATGTTCCTGAATTGTGGGAAGCACCCAACTCACCAAATGACTGGTTTGGAGTTGTACGTAACCAGCTGTATAGTCTACTTCTTATTCAAGCTTTCCGTCCTGACCGCATTCTTGCTGCTGCCCATCCTTTTGTCATCACATGTTTTGGACAAAACTTTATGGAGTCGGCTCGTGGTCATTTAGATTTAATGTCAATTGTAGAGCATGAAATCCGAGC                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             ]
[+] EMBL CD096230             [                                                                                                                                                                                                                                  TACTTCTTATTCAAGCTTTCCGTCCTGACCGCATTCTTGCTGCTGCCCATCTTTTTGTCATCACATGTTTTGGACAAAACTTTATGGAGTCGGCTCGTGGTCATTTAGATTTAATGCCAATTGTAGAGCATGAAATCCGAGCTAATATACCAGTTTTATTGTGTGCTGCACAAGGTTTCGATCCAAGTGGTCGTGTGGAGGAGCTAGCAAATGAACACAACAAACAGCTAACAAGTATAGCTATTGGTTCTGCTGAAGGTTTTTCACAGGCTGATAAAGCAATCAATTCTGCAGCAAAAAGTGGAAAATGGGTTATGTTGAAAAATGTTCATTTGGCCTCTGGATGGTTGGTACAAATGGAGAAGAAGCTTCATAGTGTACAACCTCATCCGAACTTCCGACTATTCCTTACAATGGAAATAAATCCCAAGCTACCCGTAAATGTACTACGTTCTGGTCGTGTTTTAGTGTTTGAACCGCCACCTGGTATTAAGGCAAGTCTTTTACGGACATTTGCCAATGTTCCTGCCAGTCGAATTTCTCGTGCGCCTGCTGAAAGAGCTCGCCTTTA                                                                                                                ]
[+] EMBL CD182762             [                                                                                                                                                                                                                                                                                         TGTCATCACATGTTTTGGACAAAACTTTATGGAGTCGGCTCGTGGTCATTTAGATTTAATGTCAATTGTAGAGCATGAAATCCGAGCTAATATACCAGTTTTATTGTGTGCTGCACAAGGTTTCGATCCAAGTGGTCGTGTGGAGGAGCTAGCAAATGAACACAACAAACAGCTAACAAGTATAGCTATTGGTTCTGCTGAAGGTTTTTCACAGGCTGATAAAGC                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   ]
[+] EMBL CD125540             [                                                                                                                                                                                                                                                                                         TGTCATCACATGTTTTGGACAAAACTTTATGGAGTCGGCTCGTGGTCATTTAGATTTAATGTCAATTGTAGAGCATGAAATCCGAGCTAATATACCAGTTTTATTGTGTGCTGCACAAGGTTTCGATCCAAGTGGTCGTGTGGAGGAGCTAGCAAATGAACACAACAAACAGCTAACAAGTATAGCTATTGGTTCTGCTGAAGGTTTTTCACAGGCTGATAAAGC                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   ]
[+] EMBL CD182883             [                                                                                                                                                                                                                                                                                         TGTCATCACATGTTTTGGACAAAACTTTATGGAGTCGGCTCGTGGTCATTTAGATTTAATGTCAATTGTAGAGCATGAAATCCGACCTAATATACCAGTTTTATTGTGTGCTGCACAAGGTTTCGATCCAAGTGGTCGTGTGGAGGAGCTAGCAAATGAACACAACANACAGCTAACAAGTATAGCTATTGGTTCTGCTGAAGGTTTTTCACAGGCTGATAAAGCAATCAATTCT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         ]
[+] EMBL CD164840             [                                                                                                                                                                                                                                                                                         TGTCATCACATGTTTTGGACAAAACTTTATGGAGTCGGCTCGTGGTCATTTTGATTTAATGTCAATTGTAGAGCATGAAATCCGAGCTAATATACCAGTTTTATTGTGTGCTGCACAAGGTTTCGATCCAAGTGGTCGTGTGGAGGAGCTAGCAAATGAACGCAACAAACAGCTAACAAGTATAGCTATTGGTTCTGCTGAAGGTTTTTCACAGGCTGATAAAGC                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   ]
[+] EMBL CD182900             [                                                                                                                                                                                                                                                                                         TGTCATCACATGTTTTGGACAAAACTTTATGGAGCCGGCTCGTGGTCATTTAGATTTAATGTCAATTGTAGAGCATGAAATCCGAGCTAATATACCAGTTTTATTGTGTGCTGCACAAGGTTTCGATCCAAGTGGTCGTGTGGAGGAGCTAGCAAATGAACACAACANACAGCTAACANGTATAGCTATTGGTTCTGCTGAAGGTTTTTCACAGGCTGATAAAag                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   ]
[+] EMBL CD125425             [                                                                                                                                                                                                                                                                                         TGTCATCACATGTTTTGGACAAAACTTTATGGAGTCGGCTCGTGGTCATTTAGATTTAATGTCAATTGTAGAGCATGAAATCCGAGCTAATATACCAGTTTTATTATGTGCGGCACAAGGTTTCGATCCAAGTGGTCGTGTGGAGGAGCTAGCAAATGAACACAACAAACAGCTAACAAGTATAGCTATTGGTTCTGCTGAAGGTTTTTCACAGGCTGATAAAGC                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   ]
[+] EMBL CD125430             [                                                                                                                                                                                                                                                                                         TGTCATCACATGTTTTGGACAAAACTTTATGGAGTCGGCTCGTGGTCATTTAGATTTAATGTCAATTGTAGAGCATGAAATCCGAGCTAATATACCAGTTTTATTGTGTGCTGCACAAGGTTTCGATCCAAGTGGTCGTGTGGAGGAGCTAGCAAATGAACACAACAAACAGCTAACAAGTATAGCTATTGGTTCTGCTGAAGGTTTTTCACAGGCTGATAAAGC                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   ]
[+] EMBL CD125468             [                                                                                                                                                                                                                                                                                         TGTCATCACATGTTTTGGACAAAACTTTATGGAGTCGGCTCGTGGTCATTTAGATTTAATGTCAATTGTAGAGCATGAAATCCGAGCTAGTATACCAGTTTTATTGTGTGCTGCACAAGGTTTCGATCCAAGTGGTCGTGTGGAGGAGCTAGCAAATGAACACAACAAACAGCTAACAAGTATAGCTATTGGTTCTGCTGAAGGTTTTTCACAGGCTGATAAAGC                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   ]
[+] EMBL CD182825             [                                                                                                                                                                                                                                                                                         TGTCATCACATGTTTTGGACAAAACTTTATGGAGTCGGCTCGTGGTCATTTAGATTTAATGTCAATTGTAGAGCATGAAATCCGAGCTAATATACCAGTTTTATTGTGTGCTGCACAAGGTTTCGATCCAAGTGGTCGTGTGGAGGAGCTAGCAAATGAACACAACAAACAGCTAACAAGTATAGCTATTGGTTCTGCTGAAGGTTTTTCACAGGCTGATAAAGC                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   ]
[+] EMBL CD182839             [                                                                                                                                                                                                                                                                                         TGTCATCACATGTTTTGGACAAAACTTTATGGAGTCGGCTCGTGGTCATTTAGATTTAATGTCAATTGTAGAGCATGAAATCCGAGCTAATATACCAGTTTTATTGTGTGCTGCACAAGGTTTCGATCCAAGTGGTCGTGTGGAGGAGCTAGCAAATGAACACAACAAACAGCTAACAAGTATAGCTATTGGTTCTGCTGAAGGTTTTTCACAGGCTGATAAAGC                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   ]
[+] EMBL CD182840             [                                                                                                                                                                                                                                                                                         TGTCATCACATGTTTTGGACAAAACTTTATGGAGTCGGCTCGTGGTCATTTAGATTTAATGTCAATTGTAGAGCATGAAATCCGAGCTAATATACCAGTTTTATTGTGTGCTGCACAAGGTTTCGATCCAAGTGGTCGTGTGGAGGAGCTAGCAAATGAACACAACAAACAGCTAACAAGTATAGCTATTGGTTCTGCTGAAGGTTTTTCACAGGCTGATAAAGC                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   ]
[+] EMBL CD182820             [                                                                                                                                                                                                                                                                                         TGTCATCACATGTTTGGGACAAAACTTTATGGAGCCGGCTCGTGGTCATTTAGATTTAATGTCAATTGTAGAGCATGAAATCCGAGCTAATATACCAGTTTTATTGTGTGCTGCACAAGGTTTCGATCCAAGTGGTCGTGTGGAGGAGCTAGCAAATGAACACAACAAACAGCTAACAAGTATAGCTATTGGTTCTGCTGAAGGTTTTTCACAGGCTGATAAAGC                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   ]
[+] EMBL CD182910             [                                                                                                                                                                                                                                                                                         TGTCATCACATGTTTGGGACAAAACTTTATGGAGTCGGCTCGGGGTCATTTAGATTTAATGTCAATTGTAGAGCATGAAATCCGAGCTAATATACCAGTTTTATTGTGTGCTGCACAAGGTTTCGATCCAAGTGGTCGTGTGGAGGAGCTAGCAAATGAACACAACAAACAGCTAACAAGTATAGCTATTGGTTCTGCTGAAGGTTTTTCACAGGCTGATAAAGC                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   ]
[-] EMBL CD125527             [                                                                                                                                                                                                                                                                                          GTCATCACATGTTTTGGACAAAACTTTATGGAGTCGGCTCGTGGTCATTTAGATTTAATGTCAATTGTAGAGCATGAAATCCGAGCTAATATACCAGTTTTATTGTGTGCTGCACAAGGTTTCGATCCAAGTGGTCGTGTGGAGGAGCTAGCAAATGAACACAACAAACAGCTAACAAGTATAGCTATTGGTTCTGCTGAAGGTTTTTCACAGGCTGATAAAGCA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  ]
[-] EMBL CD139075             [                                                                                                                                                                                                                                                                                          GTCATCACATGTTTTGGACAAAACTTTATGGAGTCGGCTCGTGGTCATTTAGATTTAATGTCAATTGTAGAGCATGAAATCCGAGCTAATATACCAGTTTTATTGTGTGCTGCACAAGGTTTCGATCCAAGTGGTCGTGTGGAGGAGCTAGCAAATGAACACAACAAACAGCTAACAAGTATAGCTATTGGTTCTGCTGAAGGTTTTTCACAGGCTGATAAAGCA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  ]
[-] EMBL CD125441             [                                                                                                                                                                                                                                                                                          GTCATCACATGTTTTGGACAAAACTTTATGGAGTCGGCTCGTGGTCATTTAGATTTAATGTCAATTGTAGAGCATGAAATCCGAGCTAATATACCAGTTTTATTGTGTGCTGCACAAGGTTTCGATCCAAGTGGTCGTGTGGAGGAGCTAGCAAATGAACACAACAAACAGCTAACAAGTATAGCTATTGGTTCTGCTGAAGGTTTTTCACAGGCTGATAAAGCA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  ]
[-] EMBL CD125462             [                                                                                                                                                                                                                                                                                          GTCATCACATGTTTTGGACAAAACTTTATGGAGTCGGCTCGTGGTCATTTAGATTTAATGTCAATTGTAGAGCATGAAATCCGAGCTAATATACCAGTTTTATTGTGTGCTGCACAAGGTTTCGATCCAAGTGGTCGTGTGGAGGAGCTAGCAAATGAACACAACAAACAGCTAACAAGTATAGCTATTGGTTCTGCTGAAGGTTCTTCACAGGCTGATAAAGCA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  ]
[-] EMBL CD125474             [                                                                                                                                                                                                                                                                                          GTCATCACATGTTTTGGACAAAACTTTATGGAGTCGGCTCGTGGTCATTTAGATTTAATGTCAATTGTAGAGCATGAAATCCGAGCTAATATACCAGTTTTATTGTGTGCTGCACAAGGTTTCGATCCAAGTGGTCGTGTGGAGGAGCTAGCAAATGAACACAACAAACAGCTAACAAGTATAGCTATTGGTTCTGCTGAAGGTTTTTCACAGGCTGATAAAGCA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  ]
[-] EMBL CD125496             [                                                                                                                                                                                                                                                                                          GTCATCACATGTTTTGGACAAAACTTTATGGAGTCGGCTCGTGGTCATTTAGATTTAATGTCAATTGTAGAGCATGAAATCCGAGCTAATATACCAGTTTTATTGTGTGCTGCACAAGGTTTCGATCCAAGTGGTCGTGTGGAGGAGCTAGCAAATGAACACAACAAACAGCTAACAAGTATAGCTATTGGTTCTGCTGAAGGTTTTTCACAGGCTGATAAAGCA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  ]
[-] EMBL CD125505             [                                                                                                                                                                                                                                                                                          GTCATCACATGTTTTGGACAAAACTTTATGGAGTCGGCTCGTGGTCATTTAGATTTAATGTCAATTGTAGAGCATGAAATCCGAGCTAATATACCAGTTTTATTGTGTGCTGCACAAGGTTTCGATCCAAGTGGTCGTGTGGAGGAGCTAGCAAATGAACACAACAAACAGCTAACAAGTATAGCTATTGGTTCTGCTGAAGGTTTTTCACAGGCTGATAAAGCA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  ]
[+] EMBL CD118865             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  GTGTGGAGGAGCTAGCAAATGAACACAACAAACAGCTAACAAGTATAGCTATTGGTTCTGCTGAAGGTTTTTCACAGGCTGATAAAGCAATCAATTCTGCAGCAAAAAGTGGAAAATGGGTTATGTTGAAAAATGTTCATTTGGCCTCTGGATGGTTGGTACAAATGGAGAAGAAGCTTCATAGTGTACAACCTCACCCGAACTTCCGACTATTCCTTACAATGGAAATAAATCCCAAGCTACCCGTAAATGTACTACGTTCTGGTCGTGTTTTAGTGTTTGGACCGCCACCTGGTATTAAGGCAAGTCTTTTACGGACATTTGCCAATGTTCCTGCCAGTCGAATTTCTCGTGCGCCTGCTGAAAGAGCTCGCCTTTACTTCCTACTCGCTTGGTTTAATGCTGTGGTACAAGAGCGATTACGTTAT                                                               ]
[+] EMBL CD154984             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      aAAATCCCAAGCTACCCGTAAATGTACTACGTTCTGGTCGTGTTTTAGTGTTTGAACCGCCACCTGGTATTAAGGCAAGTCTTTTACGGACATTTGCCAATGTTCCTGCCAGTCGAATTTCTCGTGCGCCTGCTGAAAGAGCTCGCCTTTACTTCCTACTCGCTTGGTTTAATGCTGTGGTACAAGAGCGATTACGTTATGTTCCTTTAGGTTGGTCTAAACGATACGAATTCAATGAATCCGATCTCAAAGTCGCTTGTGAT]


>consensus_10892#0 ATTCGACTGGTGATAATGATGCTTCATATTTAGGGAACAAAGGTCAATGCTTGAAAGCAA AGCTCAATGCCTTTAAAAATTTAGATAAATTGATTTCCCAAAAAAGTGACATATTTAAAT CTTGGTTAGAAAGTGTTTCACCACGCAGCAGATGTTCCTGAATTGTGGGAAGCACCCAAC TCACCAAATGACTGGTTTGGAGTTGTACGTAACCAGCTGTATAGTCTACTTCTTATTCAA GCTTTCCGTCCTGACCGCATTCTTGCTGCTGCCCATCCTTTTGTCATCACATGTTTTGGA CAAAACTTTATGGAGTCGGCTCGTGGTCATTTAGATTTAATGTCAATTGTAGAGCATGAA ATCCGAGCTAATATACCAGTTTTATTGTGTGCTGCACAAGGTTTCGATCCAAGTGGTCGT GTGGAGGAGCTAGCAAATGAACACAACAAACAGCTAACAAGTATAGCTATTGGTTCTGCT GAAGGTTTTTCACAGGCTGATAAAGCAATCAATTCTGCAGCAAAAAGTGGAAAATGGGTT ATGTTGAAAAATGTTCATTTGGCCTCTGGATGGTTGGTACAAATGGAGAAGAAGCTTCAT AGTGTACAACCTCATCCGAACTTCCGACTATTCCTTACAATGGAAATAAATCCCAAGCTA CCCGTAAATGTACTACGTTCTGGTCGTGTTTTAGTGTTTGAACCGCCACCTGGTATTAAG GCAAGTCTTTTACGGACATTTGCCAATGTTCCTGCCAGTCGAATTTCTCGTGCGCCTGCT GAAAGAGCTCGCCTTTACTTCCTACTCGCTTGGTTTAATGCTGTGGTACAAGAGCGATTA CGTTATGTTCCTTTAGGTTGGTCTAAACGATACGAATTCAATGAATCCGATCTCAAAGTC GCTTGTGAT



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)