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Schistosoma mansoni
cluster # 10928 cluster # 10928       Sequences # 25       consensus # 2


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_10928#0 length = 904 sequences # 20  
consensus_10928#1 length = 892 sequences # 5  

consensusID : consensus_10928#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 20
consensus length = 904
fasta sequence
                              [TTCATTATGAAGGGCTGTATACAGTGTTTAAGAGTCATACTAGTAGTTTTCAACTTCCTGGTTGTGCTTATTGGGTTGTCAGTTTTGGGTTTCTCTGTTTACATCTACCTGGAACCAGAGGCACAAGACATCATACTTGCTTCGGGACAACAACATGCCGTACAAATAATGTTATATGCTCTTATGGGCATCGGTGGAATTACTCTAGTAATAGCGCTGTTTGGTTGTTGTGGTGC-GTACCATGAATCCCAATGTCTTTTG-GGAACATATTTCACTATTCTTATTGTGATCTTTGCAACGCAAGTAACAGGAGCCACATTGGGTTATTTATAC-AGAGAGGAGATTATGAAATATGTTGACGATCGTATGAGAGAAGGTATTGAAGAGTATTCAATGCTACGTGATCAACGTGAAAATCCTGTACCGTTTATGGATTCAATCCAACGTATGTTGCGCTGTTGTGGTGTCAATGGTTACGAAGATTACCGTGAAAGTATACCCATAGCATGTTGTGATCATCATGTTAGCACATGTCTAAATGCATTACTGTCACCCGAAGAAGTTTATAAAGAAGGTTGCA-AAGATAAATATAAAGTAATGTTGAAAGATAAATTGGTCATTATCTTCCTTGCAACTGTTTCTATTGCAGCTTTCGAAATATTTTGTCTTCTGTTTTCAATGGTTATGTGTTGCACAA-TTCGACAATATCATTCAGATTATTATGGAGTCAATTATTCAATTGCTACTTGATCAAC-GGGAGTTCTGTTTCTTTTCTTCTAATTAGTATTATTTTTTATCTAATATACCACCAGGTACTTTTTGATTATTTTCATGTTTTGTTGTTTTCCAATCCTACTTTCTTGCTTTTGTTGCTTCTTGTTGTTCCTTACGTCATTTTAAAAAA]

[+] EMBL CD115084             [TTCATTATGAAGGGCCGTATACAGTGTTTAAGAGTCATACTAGTAGTTTTCAACTTCCTGGTTGTGCTTATTGGGTTGTCAGTTTTGGGTTTCTCTGTTTACATCTACCTGGAACCAGAGGCACAAGACATCATACTTGCTTCGGGACAACAACATGCCGTACAAATAATGTTATATGCTCTTATGGGCATCGGTGGAATTACTCTAGTAATAGCGCTGTTTGGTTGTTGTGGTGC GTACCATGAATCCCAATGTCTTTTG GGAACATATTTCACTATTCTTATTGTGATCTTTGCAACGCAAGTAACAGGAGCCACATTGGGTTATTTATAC AGAGAGGAGATTATGAAATATGTTGACGATCGTATGAGAGAAGGTATTGAAGAGTATTCAATGCTACGTGATCAACGTGAAAATCCTGTACCGTTTATGGATTCAATCCAACGTATGTTGCGCTGTTGTGGTGTCAATGGTTACGAAGATTACCGTGAAAGTATACCCATAGCATGTTGTGATCATCATGTTAGCACATGTCTAAATGCATTACTGTCACCCGAAGAAGTTTATAAA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 ]
[+] EMBL CD114877             [TTCATTATGAAGGGCTGTATACAGTGTTTAAGAGTCATACTAGTAGTTTTCAACTTCCTGGTTGTGCTTATTGGGTTGTCAGTTTTGGGTTTCTCTGTTTACATCTACCTGGAACCAGAGGCACAAGACATCATACTTGCTTCGGGACAACAACATGCCGTACAAATAATGTTATATGCTCTTATGGGCATCGGTGGAATTACTCTAGTAATAGCGCTGTTTGGTTGTTGTGGTGC GTACCATGAATCCCAATGTCTTTTG GGAACATATTTCACTATTCTTATTGTGATCTTTGCAACGCAAGTAACAGGAGCCACATTGGGTTATTTATAC AGAGAGGAGATTATGAAATATGTTGACGATCGTATGAGAGAAGGTATTGAAGAGTATTCAATGCTACGTGACCAACGTGAAAATCCTGTACCGTTTATGGATTCAATCCAACGTATGTTGCGCTGTTGTGGTGTCAATGGTTACGAAGATTACCGTGAAAGTATACCCATAGCATGTTGTGAT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       ]
[+] EMBL CD114964             [TTCATTATGAAGGGCTGTATACAGTGTTTAAGAGTCATACTAGTAGTTTTCAACTTCCTGGTTGTGCTTATTGGGTTGTCAGTTTTGGGTTTCTCTGTTTACATCTACCTGGAACCAGAGGCACAAGACATCATACTTGCTTCGGGACAACAACATGCCGTACAAATAATGTTATATGCTCTTATGGGCATCGGTGGAATTACTCTAGTAATAGCGCTGTTTGGTTGTTGTGGTGC GTACCATGAATCCCAATGTCTTTTG GGAACATATTTCACTATTCTTATTGTGATCTTTGCAACGCAAGTAACAGGAGCCACATTGGGTTATTTATAC AGAGAGGAGATTATGAAATATGTTGACGATCGTATGAGAGAAGGTATTGAAGAGTATTCAATGCTACGTGATCAACGTGAAAATCCTGTACCGTTTATGGATTCAATCCAACGTATGTTGCGCTGTTGTGGTGTCAATGGTTACGAAGATTACCGTGAAAGTATACCCATAGCATGTTGTG                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         ]
[+] EMBL CD114977             [TTCATTATGAAGGGCTGTATACAGTGTTTAAGAGTCATACTAGTAGTTTTCAACTTCCTGGTTGTGCTTATTGGGTTGTCAGTTTTGGGTTTCTCTGTTTACATCTACCTGGAACCAGAGGCACAAGACATCATACTTGCTTCGGGACAACAACATGCCGTACAAATAATGTTATATGCTCTTATGGGCATCGGTGGAATTACTCTAGT ATAGCGCTGTTTGGTTGTTGTGGTGC GTACCATGAATCCCAATGTCTTTTG GGAACATATTTCACTATTCTTATTGTGATCTTTGCAACGCAAGTAACAGGAGCCACATTGGGTTATTTATAC AGAGAGGAGATTATGAAATATGTTGACGATCGTATGAGAGAAGGTATTGAAGAGTATTCAATGCTACGTGATCAACGTGAAAATCCTGTACCGTTTATGGATTCAATCCAACGTATGTTGCGCTGTTGTGGTGTCAATGGTTACGAAGATTACCGTGAAAGTATACCCATAGCATGTTGTGATCATCATGTTAGCACA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        ]
[+] EMBL AF521093             [               TGTATACAGTGTTTAAGAGTCATACTAGTAGTTTTCAACTTCCTGGTTGTGCTTATTGGGTTGTCAGTTTTGGGTTTCTCTGTTTACATCTACCTGGAACCAGAGGCACAAGACATCATACTTGCTTCGGGACAACAACATGCCGTACAAATAATGTTATATGCTCTTATGGGCATCGGTGGAATTACTCTAGTAATAGCGCTGTTTGGTTGTTGTGGTGC GTACCATGAATCCCAATGTCTTTTG GGAACATATTTCACTATTCTTATTGTGATCTTTGCAACGCAAGTAACAGGAGCCACATTGGGTTATTTATAC AGAGAGGAGATTATGAAATATGTTGACGATCGTATGAGAGAAGGTATTGAAGAGTATTCAATGCTACGTGATCAACGTGAAAATCCTGTACCGTTTATGGATTCAATCCAACGTATGTTGCGCTGTTGTGGTGTCAATGGTTACGAAGATTACCGTGAAAGTATACCCATAGCATGTTGTGATCATCATGTTAGCACATGTCTAAATGCATTACTGTCTCCCGAAGAAGTTTATAAAGAAGGTTGCA AAGATAAATATAAAGTAATGTTGAAAGATAAATTGGTCATTATCTTCCTTGCAACTGTTTCTATTGCAGCTTTCGAAATATTTTGTCTTCTGTTTTCAATGGTTATGTGTTGCACAA TTCGACAATATCATTCAGATTATTATGGAGTCAATTATTCAATTGCTACTTGATCAAC GGGAGTTCTGTTTCTTTTCTTCTAATTAGTATTATTTTTTATCTAATATACCACCAGGTACTTTTTGATTATTTTCATGTTTTGTTGTTTTCCAATCCTACTTTCTTGCTTTTGTTGCTTCTTGTTGTTCCTTACGTCATTTTAAAAAA]
[+] EMBL CD183316             [                                                                                                                                                                      TAATGTTATATGCTCTTATGGGCATCGGTGGAATTACTCTAGTAATAGCGCTGTTTGGTTGTTGTGGTGC GTACCATGAATCCCAATGTCTTTTG GGAACATATTTCACTATTCTTATTGTGATCTTTGCAACGCAAGTAACAGGAGCCACATTGGGTTATTTATAC AGAGAGGAGATTATGAAATATGTTGACGATCGTATGAGAGAAGGTATTGAAGAGTATTCAATGCTACGTGATCAACGTGAAAATCCTGTACCGTTTATGGATTCAATCCAACGTATGTTGCGCTGTTGTGGTGTCAATGGTTACGAAGATTACCGTGAAAGTATACCCATAGCATGTTGTGATCATCATGTTAGCACATGTCTAAATGCATTACTGTCACCCGAAGAAGTTTATAAAGAAGGTTGCANNAGAT AATATAAAGTAATGTTGAAAGATAAATTGGTCATTATCTTCCTTGNCACTGTTTCTATTGCAGCTTTCGAAATATTNTGTCTTCTGTTTTCAATGGTTATGTGTTGCACAATTTCGAC ATATCATTCAGATTATTATGGAGTNCATTATTNCATTGCTACTTGATCAACGGGGAGGTCTGTTTCTTTTCTTCTAATTAGNATCATTTTTTATC                                                                                                          ]
[+] EMBL CD132670             [                                                                                                                                                                                                  TGGAATTACTCTAGTAATAGCGCTGTTTGGTTGTTGTGGTGC GTACCATGAATCCCAATGTCTTTTG GGAACATATTTCACTATTCTTATTGTGATCTTTGCAACGCAAGTAACAGGAGCCACATTGGGTTATTTATAC AGAGAGGAGATTATGAAATATGTTGACGATCGTATGAGAGAAGGTATTGAAGAGTATTCAATGCTACGTGGTCAACGTGAAAATCCTGTACCGTTTATGGATTCAATCCAACGTATGTTGCGCTGTTGTGGTGTCAATGGTTACGAAGATTACCGTGAAAGTATACCCATAGCATGTTGTGATCATCATGTTAGCACATGTCTAAATGCATTACTGTCACCCGAAGAAGTTTATAAAGAAGGTTGCA AAGATAAATATAAAGTAATGTTGAAAGATAAATTGGTCATTATCTTCCTTGCAACTGTTTCTATTGCAGCTTTCGAAATATTTTGTCTTCTGTTTTCAATGGTTATGTGTTGCACAANTTCGAC ATATCATTCAGATTATTATGGAGTCAATTATTCAATTGCTACTTGATCAAC GGGAGTTCTGGTTCTTTTCTTCTAA TAGNATTATTTTTTATCTAAT                                                                                                      ]
[+] EMBL CD153577             [                                                                                                                                                                                                                                        GTGC GTACCATGAATCCCAATGTCTTTTG GGAACATATTTCACTATTCTTATTGTGATCTTTGCAACGCAAGTAACAGGAGCCACATTGGGTTATTTATAC AGAGAGGAGATTATGAAATATGTTGACGATCGTATGAGAGAAGGTATTGAAGAGTATTCAATGCTACGTGATCAACGTGAAAATCCTGTACCGTTTATGGATTCAATCCAACGTATGTTGCGCTGTTGTGGCGTCAATGGTTACGAAGATTACCGTGAAAGTATACCCATAGCATGTTGTGATCATCATGTTAGCACATGTCTAAATGCATTACTGTCACCCGAAGAAGTTTAT AAGAAGGTTGC  AAGAT AATATAAA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        ]
[+] EMBL CD153499             [                                                                                                                                                                                                                                        GTGCTGTACCATGAATCCCAATGTCTTTTGTGGAACATATTTCACTATTCTTATTGTGATCTTTGCAACGCAAGTAACAGGAGCCACATTGGGTTATTTATACTAGACAGGAGATTATGAAATATGTTGACGATCGTATGAGAGAAGGTATTGAAGAGTATTCAATGCTACGTGATCAACGTGAAAATCCTGTACCGTTTATGGATTCAATCCAACGTATGTTGCGCTGTTGTGGCGTCAATGGTTACGAAGATTACCGTGAAAGTATACCCATAGCATGTTGTGATCATCATGTTAGCACATGTCTAAATGCATTACTGTCACCCGAAGAAGTTTATAAAGAAGGTTGCca                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      ]
[+] EMBL CD082950             [                                                                                                                                                                                                                                                         gagggcTCTTTTG GGAACATATTTCACTATTCTTATTGTGATCTTTGCAACGCAAGTAACAGGAGCCACATTGGGTTATTTATAC AGAGAGGAGATTATGAAATATGTTGACGATCGTATGAGAGAAGGTATTGAAGAGTATTCAATGCTACGTGATCAACGTGAAAATCCTGTACCGTTTATGGATTCAATCCAACGTATGTTGCGCTGTTGTGGTGTCAATGGTTACGAAGATTACCGTGAAAGTATACCCATAGCATGTTGTGATCATCATGTTAGCACATGTCTAAATGCATTACTGTCACCCGAAGAAGTTTATAAAGAAGGTTGCA AAGATAAATATAAATTAATGTTGAAAGATAAATTGGTCATTATCTTCCTTGCAACTGTTTCTATTGCAGCTTTCGAAATATTTTGTCTTCTGTTTTCAATGGTTATGTGTTGCACAA TTCGACAATATCATTCAGATTATTATGGAGTCAATTATTCAATTGCTACTTGATCAAC GGGAGTTCTGTTTCTTTTCTTCTAATTAGTATTATTTTTTATCTAATATACCACCAGGTACTTTTTGATTATT                                                                            ]
[-] EMBL CD072016             [                                                                                                                                                                                                                                                                                       TTCTTATGGTGATCTTTGCAACGCAAGTAACAGGAGCCACATTGGGTTATTTATAC AGAGAGGAGATTGTGAAATATGTTGACGATCGTATGAGAGAAGGTATTGAAGAGTATTCAATGCTACGTGATCAACGTGAAAATCCTGTACCGTTTATGGATTCAATCCAACGTATGTTGCGCTGTTGTGGTGTCAATGGTTACGAAGATTACCGTGAAAGTATACCCATAGCATGTTGTGATCATCATGTTAGCACATGTCTAAATGCATTACTGTCACCCGAAGAAGTTTATAAAGAAGGTTGCA AAGATAAATATAAAGTAATGTTGAAAGATAAATTGGTCATTATCTTCCTTGCAACTGTTTCTATTGCAGCTTTCGAAATATTTTGTCTTCTGTTTTCAATGGTTATGTGTTGCACAA TTCGA                                                                                                                                                                                                           ]
[+] EMBL CD168305             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 TGGGTTATTTATAC AGAGAGGAGATTATTAAATATGTTGACGATCGTATGAGAGAAGGTATTGAAGAGTATTCAATGCTACGTGATCAACGTGAAAATCCTGTACCGTTTATGGATTCAATCCAACGTATGTTGCGCTGTTGTGGTGTCAATGGTTACGAAGATTACCGTGAAAGTATACCCATAGCATGTTGTGATCATCATGTTAGCACATGTCTAAATGCATTACTGTCACCCGAAGAAGTTTATAAAGAAGGTTGCA AAGATAAATATAAAGTAATGTTGAAAGATAAATTGGTCATTATCTTCCTTGCAACTGTTTCTATTGCAGCTTTCGAAATATTTTGTCTTCTGTTTTCAATGGTTATGTGTTGCACAA TTCGACAATATCATTCAGATTATTATGGAGTCAATTATTCAATTGCTACTTGATCAAC GGGAGTTCTGTTTCTTTTCTTCTAATTAGTATTATTTTTTATCTAATATACCACCAGGTACTTTTTGATTATTTTTATGTTTTGg                                                                ]
[+] EMBL CD067488             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   GGTGATTTATAC AGAGAGGAGATTATGAAATATGTTGACGATCGTATGAGAGAAGGTATTGAAGAGTATTCAATGCTACGTGATCAACGTGAAAATCCTGTACCGTTTATGGATTCAATCCAACGTATGTTGCGCTGTTGTGGTGTCAATGGTTACGAAGATTACCGTGAAAGTATACCCATAGCATGTTGTGATCATCATGTTAGCACATGTCTAAATGCATTACTGTCACCCGAAGAAGTTTATAAAGAAGGTTGCA AAGATAAATATAAAGTAATGTTGAAAGATAAATTGGTCATTATCTTCCTTGCAACTGTTTCTATTGCAGCTTTCGAAATATTTTGTCTTCTGTTTTCAATGGTTATGTGTTGCACAA TTCGACAATATCATTCAGAT                                                                                                                                                                                            ]
[+] EMBL CD189649             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            ATGAAATATGTTGACGATCGTATGAGAGAAGGTATTGAAGAGTATTCAATGCTACGTGATCAACGTGAAAATCCTGTACCGTTTATGGATTCAATCCAACGTATGTTGCGCTGTTGTGGTGTCAATGGTTACGAAGATTACCGTGAAAGTATACCCATAGCATGTTGTGATCATCATGTTAGCACATGTCTAAATGCATTACTGTCACCCGAAGAAGTTTATAAAGAAGGTTGCA AAGATAAATATAAAGTAATGTTGAAAGATAAATTGGTCATTATCTTCCTTGCAACTGTTTCTATTGCAGCTTTCGAAATATTTTGTCTTCTGTTTTCAATGGTTATGTGTTGCACAA TTCGACAATATCATTCAGATTATTATGGGGTCAATTATTCAATTGCTACTTGATCAAC GGGAGTTCTGTTTCTTTTCTTCTAATTAGTATTATTTTTTATC                                                                                                          ]
[+] EMBL CD197170             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     CTGTACCGTTTATGGATTCAATCCAACGTATGTTGCGCTGTTGTGGTGTCAATGGTTACGAAGATTACCGTGAAAGTATACCCATAGCATGTTGTGATCATCATGTTAGCACATGTCTAAATGCATTACTGTCACCCGAAGAAGTTTATAAAGAAGGTTGCA AAGATAAATATAAAGTAATGTTGAAAGATAAATTGGTCATTATCTTCCTTGCAACTGTTTCTATTGCAGCTTTCGAAATATTTTGTCTTCTGTTTTCAATGGTTATGTGTTGCACAA TTCGACAATATCATTCAGATTATTATGGAGTCAATTATTCAATTGCTACTTGATCAAC GGGAGTTCTGTTTCTTTTCTTCTAATGAGTATTATTTTTTATCTAATATACCACCAGGTATTTTTTGATTATTTTCATGTTT                                                                   ]
[+] EMBL CD196586             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     CTGTACCGTTTATGGATTCAATCCAACGTATGTTGCGCTGTTGTGGTGTCAATGGTTACGAAGATTACCGTGAAAGTATACCCATAGCATGTTGTGATCATCATGTTAGCACATGTCTAAATGCATTACTGTCACCCGAAGAAGTTTATAAAGAAGGTTGCA AAGATAAATATAAAGTAATGTTGAAAGATAAATTGGTCATTATCTTCCTTGCAACTGTTTCTATTGCAGCTTTCGAAATATTTTGTCTTCTGTTTTCAATGGTTATGTGTTGCACAA TTCGACCATATCATTCAGATTATTATGGAGTCAATTATTCAATTGCTACTTGATCAAC GGGAGTTCTGTTTCTTTTCTTCTAATTAGTATTATTTTTTATCTAATATACCACCAGGTACTTTTTGAT                                                                                ]
[-] EMBL CD196568             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 TGGATTCAATCCAACGTATGTTGCGCTGTTGTGGTGTCAATGGTTACGAAGATTACCGTGAAAGTATACCCATAGCATGTTGTGATCATCATGTTAGCACATGTCTAAATGCATTACTGTCACCCGAAGAAGTTTATAAAGAAGGTTGCA AAGATAAATATAAAGTAATGTTGAAAGATAAATTGGTCATTATCTTCCTTGCGACTGTTTCTATTGCAGCTTTCGAAATATTTTGTCTTCTGTTTTCAATGGTTATGTGTTGCACAA TTCGACAATATCATTCAGATTATTATGGAGTCAATTATTCAATTGCTACTTGATCAAC GGGAGTTCTGTTTCTTTTCTTCTAATTAGTATTATTTTTTATCTAATATACCACCAGGTACTTTTTGATTATTTTCATGTTTTGTTGTTTTCC                                                        ]
[-] EMBL BG931799             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     TCAATGGTTACGAAGATTACCGTGAAAGTATACCCATAGCATGTTGTGATCATCATGTTAGCACATGTCTAAATGCATTACTGTCACCCGAAGAAGTTTATAAAGAAGGTTGCA AAGATAAATATAAAGTAATGTTGAAAGATAAATTGGTCATTATCTTCCTTGCAACTGTTTCTATTGCAGCTTTCGAAATATTTTGTCTTCTGTTTTCAATGGTTATGTGTTGCACAA TTCGACAATATCATTCAGATTATTATGGAG                                                                                                                                                                                  ]
[+] EMBL CD196875             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        CCGTGAAAGTATACCCATAGCATGTTGTGATCATCATGTTAGCACATGTCTAAATGCATTACTGTCACCCGAAGAAGTTTATAAAGAAGGTTGCA AAGATAAATATAAAGTAATGTTGAAAGATAAATTGGTCATTATCTTCCTTGCAACTGTTTCTATTGCAGCTTTCGAAATATTTTGTCTTCTGTTTTCAATGGTTATGTGTTGCACAA TTCGACAATATCATTCAGATTATTATGGAGTCAATTATTCAATTGCTACTTGATCAAC GGGAGTTCTGTTTCCTTTCTTCTAATTAGTATTATTTTTTATCTAATATACCACCAGGTACTTTTTGATTATTTTCATGTTTTGTTGTTTTC                                                         ]
[-] EMBL CD196579             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              GAAAGATAAATTGGTCATTATCTTCCTTGCAACTGTTTCTATTGCAGCTTTCGAAATATTTTGTCTTCTGTTTTCAATGGTTATGTGTTGCACAA TTCGACAATATCATTCAGATTATTATGGAGTCAATTATTCAATTGCTACTTGATCAAC GGGAGTTCTGTTTCTTTTCTTCTAATTAGTATTATTTTTTATCTAATATACCACCAGGTACTTTTTGATTATTTTCATGTTTTGTTGTTTTCC                                                        ]


>consensus_10928#0 TTCATTATGAAGGGCTGTATACAGTGTTTAAGAGTCATACTAGTAGTTTTCAACTTCCTG GTTGTGCTTATTGGGTTGTCAGTTTTGGGTTTCTCTGTTTACATCTACCTGGAACCAGAG GCACAAGACATCATACTTGCTTCGGGACAACAACATGCCGTACAAATAATGTTATATGCT CTTATGGGCATCGGTGGAATTACTCTAGTAATAGCGCTGTTTGGTTGTTGTGGTGCGTAC CATGAATCCCAATGTCTTTTGGGAACATATTTCACTATTCTTATTGTGATCTTTGCAACG CAAGTAACAGGAGCCACATTGGGTTATTTATACAGAGAGGAGATTATGAAATATGTTGAC GATCGTATGAGAGAAGGTATTGAAGAGTATTCAATGCTACGTGATCAACGTGAAAATCCT GTACCGTTTATGGATTCAATCCAACGTATGTTGCGCTGTTGTGGTGTCAATGGTTACGAA GATTACCGTGAAAGTATACCCATAGCATGTTGTGATCATCATGTTAGCACATGTCTAAAT GCATTACTGTCACCCGAAGAAGTTTATAAAGAAGGTTGCAAAGATAAATATAAAGTAATG TTGAAAGATAAATTGGTCATTATCTTCCTTGCAACTGTTTCTATTGCAGCTTTCGAAATA TTTTGTCTTCTGTTTTCAATGGTTATGTGTTGCACAATTCGACAATATCATTCAGATTAT TATGGAGTCAATTATTCAATTGCTACTTGATCAACGGGAGTTCTGTTTCTTTTCTTCTAA TTAGTATTATTTTTTATCTAATATACCACCAGGTACTTTTTGATTATTTTCATGTTTTGT TGTTTTCCAATCCTACTTTCTTGCTTTTGTTGCTTCTTGTTGTTCCTTACGTCATTTTAA AAAA



consensusID : consensus_10928#1
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
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Sequences nbr = 5
consensus length = 892
fasta sequence
                              [TCGGCACGAGGCTGACGGTGTTTTAAACTACTGACGGTGTTTTCATTATGAAGGGCTGTATACAGTGTTTAAGAGTCATACTAGTAGTTTTCAACTTCCTGGTTGTGCTTATTGGGTTGTCAGTTTTGGGTTTCTCTGTTTACATCTACCTGGAACCAGAGGCACAAGACATCATACTTGCTTCGGGACAACAACATGCCGTACAAATAATGTTATATGCTCTTATGGGCATCGGTGGAATTACTCTAGTAATAGCGCTGTTTGGTTGTTGTGGTGCGTACCATGAATCCCAATGTCTTTTGGGAACATATTTCACTATTCTTATTGTGATCTTTGCAACGCAAGTAACAGGAGCCACATTGGGTTATTTATACAGAGAGGAGATTATGAAATATGTTGACGATCGTATGAGAGAAGGTATTGAAGAGTATTCAATGCTACGTGATCAACGTGAAAATCCTGTACCGTTTATGGATTCAATCCAACGTATGTTGCGCTGTTGTGGTGTCAATGGTTACGAAGATTACCGTGAAAGTATACCCATAGCATGTTGTTGATCATCATGTTAGCACATGTCTAAATGCATTACTGTCACCCGAAGAAGTTTATAAAGAAGGTTGCAAAGATAAATATAAAGTAATGTTGAAAGATAAATTGGTCATTATCTTNCTTGNCACTGTTTCTATTGCAGCTNTCGAAATATTTTGTCTTCTGTTTTCAATGGGTATGTGTTGCACAATTCGACATATCATTCAGATATTATGGGAGTCATATTCATTGCTACTGATCACGGGGGAGTCTGTTCTTTCTCTAAATAGATNATTTTATCTATATACACAGTACTTTTGATATTTCAGTTTGGTGTTCCATCCACTTCTGCTTGGGCTCTGTG]

[+] EMBL CD081901             [TCGGCACGAGGCTGACGGTGTTTTAAACTACTGACGGTGTTTTCATTATGAAGGGCTGTATACAGTGTTTAAGAGTCATACTAGTAGTTTTCAACTTCCTGGTTGTGCTTATTGGGTTGTCAGTTTTGGGTTTCTCTGTTTACATCTACCTGGAACCAGAGGCACAAGACATCATACTTGCTTCGGGACAACAACATGCCGTACAAATAATGTTATATGCTCTTATGGGCATCGGTGGAATTACTCTAGTAATAGCGCTGTTTGGTTGTTGTGGTGCGTACCATGAATCCCAATGTCTTTTGGGAACATATTTCACTATTCTTATTGTGATCTTTGCAACGCAAGTAACAGGAGCCACATTGGGTTATTTATACAGAGAGGAGATTATGAAATATGTTGACGATCGTATGAGAGAAGGTATTGAAGAGTATTCAATGCTACGTGATCAACGTGAAAATCCTGTACCGTTTATGGATTCAATCCAACGTATGTTGCGCTGTTGTGGTGTCAATGGTTACGAAGATTACCGTGAAAGTATACCCATAGCATGTTGTTGATCATCATGTTAGCACATGTCTAAATGCATTACTGTCACCCGAAGAAGTTTATAAAGAAGGTTGCAAAGATAAATATAAAGTAATGTTGAAAGATAAATTGGTCATTATCTTNCTTGNCACTGTTTCTATTGCAGCTNTCGAAATATTTTGTCTTCTGTTTTCAATGGGTATGTGTTGCACAATTCGACATATCATTCAGATATTATGGGAGTCATATTCATTGCTACTGATCACGGGGGAGTCTGTTCTTTCTCTAAATAGATNATTTTATCTATATACACAGTACTTTTGATATTTCAGTTTGGTGTTCCATCCACTTCTGCTTGGGCTCTGTG]
[+] EMBL CD114949             [                                         TTCATTATGAAGGGCTGTATACAGTGTTTAAGAGTCATACTAGTAGTTTTCAACTTCCTGGTTGTGCTTATTGGGTTGTCAGTTTTGGGTTTCTCTGTTTACATCTACCTGGAACCAGAGGCACAAGACATCATACTTGCTTCGGGACAACAACATGCCGTACAAATAATGTTATATGCTCTTATGGGCATCGGTGGAATTACTCTAGTAATAGCGCTGTTTGGTTGTTGTGGTGCGTACCATGAATCCCAATGTCTTTTGGGAACATATTTCACTATTCTTATTGTGATCTTTGCAACGCAAGTAACAGGAGCCACATTGGGTTATTTATACAGAGAGGAGATTATGAAATATGTTGACGATCGTATGAGAGAAGGTATTGAAGAGTATTCAATGCTACGTGATCAACGTGAAAATCCTGTACCGTTTATGGATTCAATCCAACGTATGTTGCGCTGTTGTGGTGTCAATGGTTACGAAGATTACCGTGAAAGTATACCCAT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            ]
[+] EMBL CD114923             [                                         TTCATTATGAAGGGCTGTATACAGTGTTTAAGAGTCATACTAGTAGTTTTCAACTTCCTGGTTGTGCTTATTGGGTTGTCAGTTTTGGGTTTCTCTGTTTACATCTACCTGGAACCAGAGGCACAAGACATCATACTTGCTTCGGGACAACAACATGCCGTACAAATAATGTTATATGCTCTTATGGGCATCGGTGGAATTACTCTAGTAATAGCGCTGTTTGGTTGTTGTGGTGCGTACCATGAATCCCAATGTCTTTTGGGAACATATTTCACTATTCTTATTGTGATCTTTGCAACGCAAGTAACAGGAGCCACATTGGGTTATTTATACAGAGAGGAGATTATGAAATATGTTGACGATCGTATGAGAGAAGGTATTGAAGAGTATTCAATGCTACGTGATCAACGTGAAAATCCTGTACCGTTTATGGATTCAATCCAACGTATGTTGCGCTGTTGTGGTGTCAATGGTTACGAAGATTACCGTGAAA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      ]
[+] EMBL CD196649             [                                                       CTGTATACAGTGTTTAAGAGTCATACTAGTAGTTTTCAACTTCCTGGTTGTGCTTATTGGGTTGTCAGTTTTGGGTTTCTCTGTTTACATCTACCTGGAACCAGAGGCACAAGACATCATACTTGCTTCGGGACAACAACATGCCGTACAAATAATGTTATATGCTCTTATGGGCATCGGTGGAATTACTCTAGTAATAGCGCTGTTTGGTTGTTGTGGTGCGTACCATGAATCCCAATGTCTTTTGGGAACATATTTCACTATTCTTATTGTGATCTTTGCAACGCAAGTAACAGGAGCCACATTGGGTTATTTATACAGAGAGGAGATTATGAAATATGTTGACGATCGTATGAGAGAAGGTATTGAAGAGTATTCAATGCTACGTGATCAACGTGAAAATCCTGTACCGTTTATGGATTCAATCCAACGTATGTTGCG                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            ]
[+] EMBL CD196444             [                                                                                            AACTTCCTGGTTGTGCTTATTGGGTTGTCAGTTTTGGGTTTCTCTGTTTACATCTACCTGGAACCAGAGGCACAAGACATCATACTTGCTTCGGGACAACAACATGCCGTACAAATAATGTTATATGCTCTTATGGGCATCGGTGGAATTACTCTAGTAATAGCGCTGTTTGGTTGTTGTGGTGCGTACCATGAATCCCAATGTCTTTTGGGAACATATTTCACTATTCTTATTGTGATCTTTGCAACGCAAGTAACAGGAGCCACATTGGGTTATTTATACAGAGAGGAGATTATGAAATATGTTGACGATCGTATGGGAGAAGGTATTGAAGAGTATTCAATGCTACGTGATCAACGTGAAAATCCTGTACCGTTTATGGATTCAATCCAACGTATGTTGCGCTGTTGTGGTGTCAATGGTTACGAAGATTACCGTGAAAGTATACCCATA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           ]


>consensus_10928#1 TCGGCACGAGGCTGACGGTGTTTTAAACTACTGACGGTGTTTTCATTATGAAGGGCTGTA TACAGTGTTTAAGAGTCATACTAGTAGTTTTCAACTTCCTGGTTGTGCTTATTGGGTTGT CAGTTTTGGGTTTCTCTGTTTACATCTACCTGGAACCAGAGGCACAAGACATCATACTTG CTTCGGGACAACAACATGCCGTACAAATAATGTTATATGCTCTTATGGGCATCGGTGGAA TTACTCTAGTAATAGCGCTGTTTGGTTGTTGTGGTGCGTACCATGAATCCCAATGTCTTT TGGGAACATATTTCACTATTCTTATTGTGATCTTTGCAACGCAAGTAACAGGAGCCACAT TGGGTTATTTATACAGAGAGGAGATTATGAAATATGTTGACGATCGTATGAGAGAAGGTA TTGAAGAGTATTCAATGCTACGTGATCAACGTGAAAATCCTGTACCGTTTATGGATTCAA TCCAACGTATGTTGCGCTGTTGTGGTGTCAATGGTTACGAAGATTACCGTGAAAGTATAC CCATAGCATGTTGTTGATCATCATGTTAGCACATGTCTAAATGCATTACTGTCACCCGAA GAAGTTTATAAAGAAGGTTGCAAAGATAAATATAAAGTAATGTTGAAAGATAAATTGGTC ATTATCTTNCTTGNCACTGTTTCTATTGCAGCTNTCGAAATATTTTGTCTTCTGTTTTCA ATGGGTATGTGTTGCACAATTCGACATATCATTCAGATATTATGGGAGTCATATTCATTG CTACTGATCACGGGGGAGTCTGTTCTTTCTCTAAATAGATNATTTTATCTATATACACAG TACTTTTGATATTTCAGTTTGGTGTTCCATCCACTTCTGCTTGGGCTCTGTG



consensus multiple alignement with clustalw

CLUSTAL W (1.82) multiple sequence alignment


consensus_10928#0      -----------------------------------------TTCATTATGAAGGGCTGTA 19
consensus_10928#1      TCGGCACGAGGCTGACGGTGTTTTAAACTACTGACGGTGTTTTCATTATGAAGGGCTGTA 60
                                                                *******************

consensus_10928#0      TACAGTGTTTAAGAGTCATACTAGTAGTTTTCAACTTCCTGGTTGTGCTTATTGGGTTGT 79
consensus_10928#1      TACAGTGTTTAAGAGTCATACTAGTAGTTTTCAACTTCCTGGTTGTGCTTATTGGGTTGT 120
                       ************************************************************

consensus_10928#0      CAGTTTTGGGTTTCTCTGTTTACATCTACCTGGAACCAGAGGCACAAGACATCATACTTG 139
consensus_10928#1      CAGTTTTGGGTTTCTCTGTTTACATCTACCTGGAACCAGAGGCACAAGACATCATACTTG 180
                       ************************************************************

consensus_10928#0      CTTCGGGACAACAACATGCCGTACAAATAATGTTATATGCTCTTATGGGCATCGGTGGAA 199
consensus_10928#1      CTTCGGGACAACAACATGCCGTACAAATAATGTTATATGCTCTTATGGGCATCGGTGGAA 240
                       ************************************************************

consensus_10928#0      TTACTCTAGTAATAGCGCTGTTTGGTTGTTGTGGTGCGTACCATGAATCCCAATGTCTTT 259
consensus_10928#1      TTACTCTAGTAATAGCGCTGTTTGGTTGTTGTGGTGCGTACCATGAATCCCAATGTCTTT 300
                       ************************************************************

consensus_10928#0      TGGGAACATATTTCACTATTCTTATTGTGATCTTTGCAACGCAAGTAACAGGAGCCACAT 319
consensus_10928#1      TGGGAACATATTTCACTATTCTTATTGTGATCTTTGCAACGCAAGTAACAGGAGCCACAT 360
                       ************************************************************

consensus_10928#0      TGGGTTATTTATACAGAGAGGAGATTATGAAATATGTTGACGATCGTATGAGAGAAGGTA 379
consensus_10928#1      TGGGTTATTTATACAGAGAGGAGATTATGAAATATGTTGACGATCGTATGAGAGAAGGTA 420
                       ************************************************************

consensus_10928#0      TTGAAGAGTATTCAATGCTACGTGATCAACGTGAAAATCCTGTACCGTTTATGGATTCAA 439
consensus_10928#1      TTGAAGAGTATTCAATGCTACGTGATCAACGTGAAAATCCTGTACCGTTTATGGATTCAA 480
                       ************************************************************

consensus_10928#0      TCCAACGTATGTTGCGCTGTTGTGGTGTCAATGGTTACGAAGATTACCGTGAAAGTATAC 499
consensus_10928#1      TCCAACGTATGTTGCGCTGTTGTGGTGTCAATGGTTACGAAGATTACCGTGAAAGTATAC 540
                       ************************************************************

consensus_10928#0      CCATAGCATGTTGT-GATCATCATGTTAGCACATGTCTAAATGCATTACTGTCACCCGAA 558
consensus_10928#1      CCATAGCATGTTGTTGATCATCATGTTAGCACATGTCTAAATGCATTACTGTCACCCGAA 600
                       ************** *********************************************

consensus_10928#0      GAAGTTTATAAAGAAGGTTGCAAAGATAAATATAAAGTAATGTTGAAAGATAAATTGGTC 618
consensus_10928#1      GAAGTTTATAAAGAAGGTTGCAAAGATAAATATAAAGTAATGTTGAAAGATAAATTGGTC 660
                       ************************************************************

consensus_10928#0      ATTATCTTCCTTGCAACTGTTTCTATTGCAGCTTTCGAAATATTTTGTCTTCTGTTTTCA 678
consensus_10928#1      ATTATCTTNCTTGNCACTGTTTCTATTGCAGCTNTCGAAATATTTTGTCTTCTGTTTTCA 720
                       ******** ****  ****************** **************************

consensus_10928#0      ATGGTTATGTGTTGCACAATTCGACAATATCATTCAGATTATTATGG-AGTCAATTATTC 737
consensus_10928#1      ATGGGTATGTGTTGCACAATTCGACA-TATCATTCAGAT-ATTATGGGAGTCA--TATTC 776
                       **** ********************* ************ ******* *****  *****

consensus_10928#0      AATTGCTACTTGATCAACGGGAGTTCTGTTTCTTTTCTTCTAATTAGTATTATTTTTTAT 797
consensus_10928#1      A-TTGCTACT-GATCACGGGGGAGTCTGT---TCTTTCTCTAAATAG-ATNATTT--TAT 828
                       * ******** *****  ***   *****   * **  ***** *** ** ****  ***

consensus_10928#0      CTAATATACCACCAGGTACTTTTTGATTATTTTCATGTTTTGTTGTTTTCCAATCCTACT 857
consensus_10928#1      CTA-TATAC-AC--AGTACTTTTGA--TATTTCAGTTTGGTGTT-CCATCCACTTCTGCT 881
                       *** ***** **   ********    *****   * *  ****    **** * ** **

consensus_10928#0      TTCTTGCTTTTGTTGCTTCTTGTTGTTCCTTACGTCATTTTAAAAAA 904
consensus_10928#1      TGGGCTCTGTG------------------------------------ 892
                       *     ** *                                     




Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)