|
These datas are free for academic use only, please contact me for any other use. Schistosoma mansoni see consensus multiple alignment with clustalw Direct access to contigs :
consensusID : consensus_10970#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 18 consensus length = 870 fasta sequence
[AGTTGACGATCACGTGAAAATTACCAAAGAAAATGACAATAATAAAGAATGGTATTTTGGTGAAATTACTGATAAATCTGGTATTGTGAATAAAGGATGGTTTCCAGCTTGTTGTTTAAAGCCTTCTACTAAGTCCAATACGTCTAATATAAATCAAAATGGGCTAAATATCTCTTCATCATCAAATAGCTCATCAAAACAACCGGACATTCTATTTTCATGTATTGCATTATATCCGTATGAGTCGAATGTACCAGGCGATTTGAATCTTTCTGTTGGTGATTTGATTAGAGTTTGTGTTATAAAAGACGATTGGTGGGAGGGTATTTGTGAACGAACTAAACTCAAAGGTTTATTCCCAGCTAATTATGTTCGTAAACTGAGCAGTGAAGAAACACGGTCAATGGAAGAAAAGTTAGACATAAGCGGATCAACTAATAACCAAATGGACCATAATGACACAATTAATCCTCCATCTCCATCAAAAATAACTCCTATATCATCACCAAAGTTAATGGAAGCTAATCTTAATAATTGTATGGCTAGTTTACTTTCTTCATCAAATACATCTTCGACTTCATCATCTGGTGTTATTGTATGCACTCAACCAGAGTTCGCTCGAGTAATTGCACCATACAAAGCTACTTCAGCTGGTCAACTAACTCTTCAACCTGGTCAAGTTGTACAACTTCGTAAAAGATCACCTAAAGGTTGGTGGGAAGGAGAGTTACAGGTGTTCTCTGGATCAAATTTAAACTTGATTGATAATGAAGATTAATTGTTTGTTGATTAACTGGCTGTTATCAAATTTACCATGAATTATTTTCTGCAATCTATTGGCTGCCTCTATTGATAAATACTATGTCTTGA]
[+] EMBL AI977701 [AGTTGACGATCACGTGAAAATTACCAAAGAAAATGACAATAATAAAGAATGGTATTTTGGTGAAATTACTGATAAATCTGGTATTGTGAATAAAGGATGGTTTCCAGCTTGTTGTTTAAAGCCTTCTACTAAGTCCAATACGTCTAATATAAATCAAAATGGGCTAAATATCTCTTCATCATCAAATAGCTCATCAAAACAACCGGACATTCTATTTTCATGTATTGCATTATATCCGTATGAGTCGAATGTACCAGGCGATTTGAATCTTTCTGTTGGTGATTTGATTAGAGTTTGTGTTATAAAAGACGATTGGTGGGAGGGTATTTGTGAACGAACTAAACTCAAAGGTTTATTCCCAGCTAATTATGTTCGTAAACTGAGCAGTGAAGAAACACGGTCAATGGAAGAAAAGTTAGACATAAGCGGATCAACTAATAACCAAATGGACCATAATGACACAATTAATCCTCCATCTCTATCAAAAATAACTCCTATATCATCACCAAAGTTAATGGAAGCTAATCTTAATAATTGTATGGCTAGTTTACTTTCTTCATCAAATACATCTTCGACTT ]
[-] EMBL CD178408 [ ACGTGAAAATTACCAAAGATAATGTCAATAATAAAGAATGGTATTTTGGTGAAATTACTGATAAATGTGGTATTGTGAATAAAGGATGGTTTCCAGCTTGTTGTTTAAAGCCTTCcatcgg ]
[+] EMBL CD068782 [ AAAATGACAATAATAAAGAATGGTATTTTGGTGAAATTACTGATAAATCTGGTATTGTGAATAAAGGATGGTTTCCAGCTTGTTGTTTAAAGCCTTCTACTAAGTCCAATACGTCTAATATAAATCAAAATGGGCTAAATATCTCTTCATCATCAAATAGCTCATCAAAACAACCGGACATTCTATTTTCATGTATTGCATTATATCCGTATGAGTCGAATGTACCAGGCGATTTGAATCTTTCTGTTGGTGATTTGATTAGAGTTTGTGTTATAAAAGACGATTGGTGGGAGGGTATTTGTGAACGAACTAAACTCAAAGGTTTATTCCCAGCTAATTATGTTCGTAAACTGAGCAGTGAAGAAACACGGTCAATGGAAGAAAAGTTAGACATAAGCGGATCAACTAATAACCAAATGGACCATAATGACACAATTAATCCTCCATCTCCATCAAAAATAACTCCTATATCATCACCAAAGTTAATGGAAGCTAATCTTAATAATTGTATGGCTAGTTTACTTTC ]
[-] EMBL CD168152 [ TTCCAGCTGTTTGTTTAAAGCCTTCTACTAAGTCCAATACGTCTAATATAAATCAAAATGGGCTAAATATCTCTTCATCATCAAATAGCTCATCAAAACAACCGGACATTCTATTTTCATGTATTGCATTATATCCGTATGAGTCGAATGTACCAGGCGATTTGAATCTTTCTGTTGGTGATTTGATTAGAGTTTGTGTTATAAAAGACGATTGGTGGGAGGGTATTTGTGAACGAACTAAACTCAAAGGTTTATTCCCAGCTAATTATGTTCGTAAACTGAGCAGTGAAGAAACACGGTCAATGGAAGAAAAGTTAGACATAAGCGGATCAACTAATAACCAAATGGACCATAATGACACAATTAATCCTCCATCTCTATCAAAAATAACTCCTATATCATCACCAAAGTTAATGGAAGCTAATCTTAATAATTGTATGGCTAGTTTACTTTCTTCATCAAATACATCTTCGACTTCATCATCTGGTGTTATTGTATGCACTCAACCAGAGTTCGCTCGAGTAATTGCACCGTACAAAGCTACTTCAGCTGGTCAACTAACTCTTCAACCTGGTCAAGTTGTACAACTTCGTAAAAGATCACCTAAAGGTTGGTGGGAAGGAGAGTTACAGGTGTTCTCTGGATCAAATT ]
[+] EMBL CD067483 [ GCTTGTTGTTTAAAGCCTTCTACTAAGTCCAATACGTCTAATATAAATCAAAATGGGCTAAATATCTCTTCATCATCAAATAGCTCATCAAAACAACCGGACATTCTATTTTCATGTATTGCATTATATCCGTATGAGTCGAATGTACCAGGCGATTTGAATCTTTCTGTTGGTGATTTGATTAGAGTTTGTGTTATAAAAGACGATTGGTGGGAGGGTATTTGTGAACGAACTAAACTCAAAGGTTTATTCCCAGCTAATTATGTTCGTAAACTGAGCAGTGAAGAAACACGGTCAATGGAAGAAAAGTTATACATAAGCGGATCAACTAATAACCAAATGGACCATAATGACACAATTAATCCTCCATCTCCATCAAAAATAACTCCTATATCATCACCAAAGTTAATGGAAGCTAATCTTtaaa ]
[+] EMBL CD066935 [ GCTTGTTGTTTAAAGCCTTCTACTAAGTCCAATACGTCTAATATAAATCAAAATGGGCTAAATATCTCTTCATCATCAAATAGCTCATCAAAACAACCGGACATTCTATTTTCATGTATTGCATTATATCCGTATGAGTCGAATGTACCAGGCGATTTGAATCTTTCTGTTGGTGATTTGATTAGAGTTTGTGTTATAAAAGACGATTGGTGGGAGGGTATTTGTGAACGAACTAAACTCAAAGGTTTATTCCCAGCTAATTATGTTCGTAAACTGAGCAGTGAAGAAACACGGTCAATGGAAGAAAAGTTAGACATAAGCGGATCAACTAATAACCAAATGGACCATAATGACACAATTAATCCTCCATCTCCATCAAAAATAACTCCTATATCATCACCAAAGTTAATGGAAGCTAATCTTAATAATTGTATGGCTAGTTTACTTTCTTCATCAAATACATCTTCGACTTCA ]
[+] EMBL CD067279 [ GCTTGTTGTTTAAAGCCTTCTACTAAGTCCAATACGTCTAATATAAATCAAAATGGGCTAAATATCTCTTCATCATCAAATAGCTCATCAAAACAACCGGACATTCTATTTTCATGTATTGCATTATATCCGTATGAGTCGAATGTACCAGGCGATTTGAATCTTTCTGTTGGTGATTTGATTAGAGTTTGTGTTATAAAAGACGATTGGAGGGAGGGTATTTGTGAACGAACTAAACTCAAAGGTTTATTCCCAGCTAATTATGTTCGTAAACTGAGCAGTGAAGAAACACGGTCAATGGAAGAAAAGTTATACATAATCGGATCAACTAATAACCAAATGGACCATAATGACACAATTAA ]
[+] EMBL CD067473 [ GCTTGTTGTTTAAAGCCTTCTACTAAGTCCAATACGTCTAATATAAATCAAAATGGGCTAAATATCTCTTCATCATCAAATAGCTCATCAAAACAACCGGACATTCTATTTTCATGTATTGCATTATATCCGTATGAGTCGAATGTACCAGGCGATTTGAATCTTTCTGTTGGTGATTTGATTAGAGTTTGTGTTATAAAAAACCATTGGTGGGAGGGTATTTGTGAACGAACTAA ]
[+] EMBL CD067019 [ GCTTGTTGTTTAAAGCCTTCTACTAAGTCCAATACGTCTAATATAGATCAAAATGGGCTAAATATCTCTTCATCATCAAATAGCTCATCAAAACAACCGGACATTCTATTTTCATGTATTGCATTATATCCGTATGAGTCGAATGTACCAGGCGATTTGAATCTTTCTGTTGGTGATTTGATTAGAGTTTGTGTTATAAAAGACGATTGGTGGGAGGGTATTTGTGAACGAACTAAACTCAAAGGCTTATTCCCAGCTAATTATGTTCGTAAACTGAGCAGTGAAGAAACACGGTCAATGGAAGAAAAGTTAGACATAAGCGGATCAACTAATAACCAAATGGACCATAATGACACAATTAATCCTCCATCTCCATCAAAAATAACTCCTATATCATCACCAAAGTTAATGGAAGCTAATCTTAATAATTGTATGGCTAGTTTACTTTCTTCATCAAATACATCTTCGACTTCATCATCTGGTGTTATTGTATGCACTCA ]
[+] EMBL CD083993 [ gGCATTATATCCGTATGAGTCGAATGTACCAGGCGATTTGAATCTTTCTGTTGGTGATTTGATTAGAGTTTGTGTTATAAAAGACGATTGGTGGGAGGGTATTTGTGAACGAACTAAACTCAAAGGTTTATTCCCAGCTAATTATGTTCGTAAACTGAGCAGTGAAGAAACACGGTCAATGGAAGAAAAGTTAGACATAAGCGGATCAACTAATAACCAAATGGACCATAATGACACAATTAATCCTCCATCTCTATCAAAAATAACTCCTATATCATCACCAAAGTTAATGGAAGCTAATCTTAATAATTGTATGGCTAGTTTACTTTCTTCATCAAATACATCTTCGACTTCATCATCTGGTGTTATTGTATGCACTCAACCAGAGTTCGCTCGAGTAATTGCACCATACAAAGCTACTT ]
[-] EMBL CD066866 [ AGCTAATTATGTTCGTAAACTGAGCAGTGAAGAAACACGGTCAATGGAAGAAAAGTTAGACATAAGCGGATCAACTAATAACCAAATGGACCATAATGACACAATTAATCCTCCATCTCCATCAAAAATAACTCCTATATCATCACCAAAGTTAATGGAAGCTAATCTTAATAATTGTATGGCTAGTTTACTTTCTTCATCAAATACATCTTCGACTTCATCATCTGGTGTTATTGTATGCACTCAACCAGAGTTCGCTCGAGTAATTGCACCATACAAAGCTACTTCAGCTGGTCAACTAACTCTTCAACCTGGTCAAGTTGTACAACTTCGTAAAAGATCACCTAAAGGTTGGTGGGAAGGAGAGTTACAGGTGTTCTCTGGATCAAATTTAAACTTGATTGATAATGAAGATTAATTGTTTGTTGATTAACTGGCTGTTATCAAATTTACCATGAATTATTTTCTGCAATCTATTGGCTGCCTCTATTGATA ]
[-] EMBL CD066792 [ AAAATAACTCNTATATCATCACCAAAGTTAATGGAAGCTAATCTTAATAATTGTATGGCTAGTTTACTTTCTTCATCAAATACATCTTCGACTTCATCATCTGGTGTTATTGTATGCACTCAACCAGAGTTCGCTCGAGTAATTGCACCATACAAAGCTACTTCAGCTGGTCAACTAACTCTTCAACCTGGTCAAGTTGTACAACTTCGTAAAAGGTCACCTAAAGGTTGGTGGGAAGGAGAGTTACAGGTGTTCTCTGGATCAAATTTAAACTTGATTGATAATGAAGATTAATTGTTTGTTGATTAACTGGCTGTTATCAAATTTACCATGAATTATTTTCTGCAATCTATTGGCTGCCTCTATTGATA ]
[-] EMBL CD066576 [ CACAGTTAATGGAAGCTAATCTTAATAATTGTATGGATAGTTTACTTTATTCATCAAATACATCTTCGACTTCATCATCTGGTGTTATTGTATGCACTCAACCAGAGTTCGCTCGAGTAATTGCACCATACAAAGCTACTTCAGCTGGTCAACTAACTCTTCAACCTGGTCAAGTTGTACAACTTCGTAAAAGATCACCTAAAGGTTGGTGGGAAGGAGAGCTACAGGTGTTCTCTGGATCAAATTTAAACTTGATTGATAATGAAGATTAATTGTTTGTTGATTAACTGGCTGTTATCAAATTTACCATGAATTATTTTCTGCAATCTATTGGCTGCCTCTATTGATAAATACTATGTCTTGA]
[-] EMBL CD066350 [ TCTTCATCAAATACATCTTCGACTTCATCATCTGGTGTTATTGTATGCACTCAACCAGAGTTCGCTCGAGTAATTGCACCATACAAAGCTACTTCAGCTGGTCAACTAACTCTTCAACCTGGTCAAGTTG ACAACTTCGTAAAAGATCACCTAAAGGTTGGTGGGAAGGAGAGTTACAGGTGTTCTCTGGATCAAATTTAAACTTGATTGATAATGAAGATTAATTGTTTGTTGATTAACTGGCTGTTATCAAATTTACCATGAATTATTTTCTGCAATCTATTGGCTGCCTCTATTGATA ]
[-] EMBL CD067164 [ GTATGCACTCAACCAGAGTTCGCTCGAGTAATTGCACCATACANAGCTACTTCAGCTGGTCAACTAACTCTTCAACCTGGTCAAGTTGTACAACTTCGTAAAAGGTCACCTAAAGGTTGGTGGGAAGGAGAGTTACAGGTGTTCTCTGGATCAAATTTAAACTTGATTGATAATGAAGATTAATTGTTTGTTGATTAACTGGCTGTTATCAAATTTACCATGAATTATTTTCTGCAATCTATTGGCTGCCTCTATTGATA ]
[-] EMBL CD066530 [ CAACCTGGTCAAGTTGTACAACTTCGTAAAAGATCACCTAAAGGTTGGTGGGAAGGAGAGTTACAGGTGTTCTCTGGATCAAATTTAAACTCGATTGATAATGAAGATTAATTGTTTGTTGATTAACTGGCTGTTATCAAATTTACCATGAATTATTTTCTGCAATCTATTGGCTGCCTCTATTGATA ]
[-] EMBL CD066719 [ TGGTCAAGTTGTACAACTTCGTAAAAGATCACCTAAAGGTTGGTGGGAAGGAGAGTTACAGGTGTTCTCTGGATCAAATTTAAACTTGATTGATAATGAAGATTAATTGTTTGTTGATTAACTGGCTGTTATCAAATTTACCATGAATTATTTTCTGCAATCTATTGGCTGCCTCTATTGATA ]
[-] EMBL CD066449 [ GATCACATAAAGGTTGGTGGGAAGGAGAGTTACAGGTGTTCTCTGGATCAAATTTAAACTTGATTGATAATGAAGATTAATTGTTTGTTGATTAACTGGCTGTTATCAAATTTACCATGAATTATTTTCTGCAATATATTGGCTGCCTCTATTGATA ]
consensusID : consensus_10970#1 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 8 consensus length = 450 fasta sequence
[CACCATACAAAGCTACTTCAGCTGGTCAACTAACTCTTCAACCTGGTCAAGTTGTACAACTTCGTAAAAGATCACCTAAAGGTTGGTGGGAAGGAGAGTTACAGCAAAGAGGTCATATTCGTCAAATTGGTTGGTTTCCGGCTGATTTCGTTCGACTTATTACACCACTGACAGTGAATGGATCGTCTAACTCATCTGATCAAAAACTTTTATCCAAACTAATAAGTCCTACTAATAATCAAATTGAAAATACTCCAACCAGTTTGAAAGCATTAGCATCAAAAGCAATTACTACATCGAATTCTTTTAACGATAATTCTGTACAAAGTCAGCAAACACAATCAAATCGTGTGGAAATGATGCAAACTATTTTTAGTTATAAAGCTGTCCATGCAGATGAGTTAACATTTGAAGAAGGTGCTATTATCACAGTACTAGGTCGAGATGAAC]
[+] EMBL CD200141 [CACCATACAAAGCTACTTCAGCTGGTCAACTAACTCTTCAACCTGGTCAAGTTGTACAACTTCGTAAAAGATCACCTAAAGGTTGGTGGGAAGGAGAGTTACAGCAAAGAGGTCATATTCGTCAAATTGGTTGGTTTCCGGCTGATTTCGTTCGACTTATTACACCACTGACAGTGAATGGATCGTCTAACTCACCTGATCAAAAACTTTTATCCAAACTAATAAGTCCTACTAATAATCAAATTGAAAATACTCCAACCAGTTTGAAAGCATTAGCAACAAAAGCAATTACTACATCGAATTCTTTTAACGATAATTCTGTACAAAGTCAGCAAACACAATCAAATCGTGTGGAAATGATGCAAACTATTTTTAGTTATAAAGCTGTCCATGCAGATGAGTTAACATTTGAAGAAGGTGCTATTATCACAGTACTAGGTCGAGATGAAC]
[+] EMBL CD200111 [CACCATACAAAGCTACTTCAGCTGGTCAACTAACTCTTCAACCTGGTCAAGTTGTACAACTTCGTAAAAGATCACCTAAAGGTTGGTGGGAAGGAGAGTTACAGCAAAGAGGTCATATTCGTCAAATTGGTTGGTTTCCGGCTGATTTCGTTCGACTTATTACACCACTGACAGTGAATGGATCGTCTAACTCATCTGATCAAAAACTTTTATCCAAACTAATAAGTCCTACTAATAATCAAATTGAAAATACTCCAACCAGTTTGAAAGCATTAGCATCAAAAGCAATTACTACATCGAATTCTTTTAACGATAATTCTGTACAAAGTCAGCAAACACAATCAAATCGTGTGGAAATGATGCAAACTATTTTTAGTTATAAAGCTGTCCATGCAGATGAGTTAACATTTGAAGAAGGTGCTATTATCACAGTACTAGGTC ]
[+] EMBL CD200128 [CACCATACTAACCTACTTCAGCTGGTCAACTAACTCTTCAACCTGGTCAAGTTGTACAGCTTCGTAAAAGATCACCTAAAGGTTGGTGGGAAGGAGAGTTACAGCAAAGAGGTCATATTCGTCAAATTGGTTGGTTTCCGGCTGATTTCGTTCGACTTATTACACCACTGACAGTGAATGGATCGTCTAACTCATCTGATCAAAAACTTTTATCCAAACTAATAAGTCCTACTAATAATCAAATTGAAAATACTCCAACCAGTTTGAAAGCATTAGCATCAAAAGCAATTACTACATCGAATTCTTTTAACGATAATTCTGTACAAAGTCAGCAAACACAATCAAATCGTGTGGAAATGATGCAAACTATTTTTAGTTATAAAGCTGTCCATGCAGATGAGTTAACATTTGAAGAAGGTGCTATTATCACAGTACTAGG ]
[+] EMBL CD200138 [CACCATACAAAGCTACTTCAGCTGGTCAACTAACTCTTCAACCTGGTCAAGTTGTACAACTTCGTAAAAGATCACCTAAAGGTTGGTGGGAAGGAGAGTTACAGCAAAGAGGTCATATTCGTCAAATTGGTTGGTTTCCGGCTGATTTCGTTCGACTTATTACACCACTGACAGTGAATGGATCGTCTAACTCATCTGATCAAAAACTTTTATCCAAACTAATAAGTCCTACTAATAATCAAATTGAAAATACTCCAACCAGTTTGAAAGCATTAGCATCAAAAGCAATTTCTACATCGAATTCTTTTGACGATAATTCTGTACAAAGTCAGCAAACACAATCAAATCGTGTGGAAATGATGCAAACTATTTTTAGTTATAAAGCTGTCCATGCAGATGAGTTAACATTTGAAGAAGGTGCTATTATCACAGTA ]
[+] EMBL CD200126 [CACCATACAAAGCTACTTCAGCTGGTCAACTAACTCTTCAACCTGGTCAAGTTGTACAACTTCGTAAAAGATCACCTAAAGGTTGGTGGGAAGGAGGGTTACAGCAAAGAGGTCATATTCGTCAAATTGGTTGGTTTCCGGCTGATTTCGTTCGACTTATTACACCACTGACAGTGAATGGATCGTCTAACTCATCTGATCAAAAACTTTTATCCAAACTAATAAGTCCTACTAATAATCAAATTGAAAATACTCCAACCAGTTTGAAAGCATTAGCATCAAAAGCAATTACTACATCGAATTCTTTTAACGATAATTCTGTACAAAGTCAGCAAACACAATCAAATCGTGTGGAAATGATGCAAACTATTTTTAGTTATAAAGCTGTCCATGCAGATGAGTTAACATTTGAAGAAGGTGCTATTATCA ]
[+] EMBL CD200118 [CACCATACAAAGCTACTTCAGCTGGTCAACTAACTCTTCAACCTGGTCAAGTTGTACAACTTCGTAAAAGATCACCTAAAGGTTGGTGGGAAGGAGAGTTACAGCAAAGAGGTCATATTCGTCAAATTGGTTGGTTTCCGGCTGATTTCGTTCGACTTATTACACCACTGACAGTGAATGGATCGTCTAACTCATCTGATCAAAAACTTTTATCCAAACTAATAAGTCCTACTAATAATCAAATTGAAAATACTCCAACCAGTTTGAAAGCATTAGCATCAAAAGCAATTACTACATCGAATTCTTTTAACGATAATTCTGTACAAAGTCAGCAAACACAATCAAATCGTGTGGAAATGATGCAAACTATTTTTAGTTATAAAGCTGTCCATGCAGATGAGTTAACATTTGAAGAAGGTGCTATTATCA ]
[+] EMBL CD200140 [CACCATACAAAGCTACTTCAGCTGGTCAACTATCTCTTCAACCTGGTCAAGTTGTACAACTTCGTAAAAGATCACCTAAAGGTTGGTGGGAAGGAGAGTTACAGCAAAGAGGTCATATTCGTCAAATTGGTTGGTTTCCGGCTGATTTCGTTCGACTTATTACACCACTGACAGTGAATGGATCGTCTAACTCATCTGATCAAAAACTTTTATCCAAACTAATAAGTCCTACTAATAATCAAATTGAAAATACTCCAACCAGTTTGAAAGCATTAGCATCAAAAGCAATTACTACATCGAATTCTTCTAACGATAATTCTGTACAAAGTCAGCAAACACAATCAAATCGTGTGGAAATGATGCAAACTATTTTTAGTTATAAAGCTGTCCATGCAGATGAGTTAACATTTGAAGAAGGTGCTATTAT ]
[+] EMBL CD200131 [CACCATACAAAGCTACTTCAGCTGGTCAACTAACTCTTCAACCTGGTCAAGTTGTACAACTTCGTAAAAGATCACCTAAAGGTTGGTGGGAAGGAGAGTTACAGCAAAGAGGTCATATTCGTCAAATTGGTTGGTTTCCGGCTGATTTCGTTCGACTTATTACACCACTGACAGTGAATGGATCGTCTAACTCATCTGATCAAAAACTTTTATCCAAACTAATAAGTCCTACTAATAATCAAATTGAAAATACTCCAACCAGTTTGAAAGCATTAGCATCAAAAGCAATTACTACATCGAATTCTTTTAACGATAATTCTGTACAAAGTCAGCAAACACAATCAAATCGTGTGGAAATGATGCAAACTATTTTTAGTTATAAAGCTGTCCATGCAGATGAGTTAACATTTGAAGAAAGTGCTATTA ]
consensusID : consensus_10970#2 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 1 consensus length = 90 fasta sequence
[ATTTATCAATAGAGGCAGCCAATATATTGCAAAAAATAATACATGGTAAATTATATAACAGTCAGTTAATCGACAAACAATTAATCTTCA]
[+] EMBL CD067170 [ATTTATCAATAGAGGCAGCCAATATATTGCAAAAAATAATACATGGTAAATTATATAACAGTCAGTTAATCGACAAACAATTAATCTTCA]
consensus multiple alignement with clustalw CLUSTAL W (1.82) multiple sequence alignment
consensus_10970#0 AGTTGACGATCACGTGAAAATTACCAAAGAAAATGACAATAATAAAGAATGGTATTTTGG 60
consensus_10970#2 ------------------------------------------------------------
consensus_10970#1 ------------------------------------------------------------
consensus_10970#0 TGAAATTACTGATAAATCTGGTATTGTGAATAAAGGATGGTTTCCAGCTTGTTGTTTAAA 120
consensus_10970#2 ------------------------------------------------------------
consensus_10970#1 ---------------------------------------------------------CAC 3
consensus_10970#0 GCCTTCTACTAAGTCCAATACGTCTAATATAAATCAAAATGGGCTAAATATCTCTTCATC 180
consensus_10970#2 ------------------------------------------------------------
consensus_10970#1 CATACAAAGCTACTTCAGCTGGTCAACTAACTCTTCAACCTGGTCAAGTTGTACAACTTC 63
consensus_10970#0 ATCAAATAGCTCATCAAAACAACCGGACATTCTATTTTCATGTATTGCATTATATCCGTA 240
consensus_10970#2 ------------------------------------------------------------
consensus_10970#1 GTAAAAGATCACCTAAAGGTTGGTGGGAAGGAGAGTTACAGCAAAGAGGTCATATTCGTC 123
consensus_10970#0 TGAGTCGAATGTACCAGGCGATTTGAATCTTTCTGTTGGTGATTTGATTAGAGTTTGTGT 300
consensus_10970#2 ------------------------------------------------------------
consensus_10970#1 AAATTGGTTGGTTTCCGGCTGATTTCGTTCGACTTATTACACCACTGACAGTGAATGGAT 183
consensus_10970#0 TATAAAAGACGATTGGTGGGAGGGTATTTGTGAACGAACTAAACTCAAAGGTTTATTCCC 360
consensus_10970#2 ------------------------------------------------------------
consensus_10970#1 CGTCTAACTCATCTGATCAAAAACTTTT--------ATCCAAACTAATAAGTCCTACTAA 235
consensus_10970#0 AGCTAATTATGTTCGTAAACTGAGCAGTGAAGAAACACGGTCAATGGAAGAAAAGTTAGA 420
consensus_10970#2 ------------------ATTTATCAATAGAGGCAGCCAATATATTGCAAAAAA-TAATA 41
consensus_10970#1 TAATCAAATTGAAAATACTCCAACCAGTTTGAAAGCATTAGC-ATCAAAAGCAATTACTA 294
* ** * ** * ** * *
consensus_10970#0 CATAAGCGGATCAACTAATAACCAAATGGACCATAATGACACAATTAATCCTCCATCTCC 480
consensus_10970#2 CATG-GTAAATTATATAACAGTCAGTTAATCGACAA----ACAATTAATCTTCA------ 90
consensus_10970#1 CATC--GAATTCTTTTAACGATAATTCTGTACAAAGTCA-GCAAACA-CAATCAAATCGT 350
*** * *** * * * *** * **
consensus_10970#0 ATCAAAAATAACTCCTATATCATCACCAAAGTTAATGGAAGCTAATCTTAATAATTGTAT 540
consensus_10970#2 ------------------------------------------------------------
consensus_10970#1 GTGGAAATGATGCAAACTATTTTTAGTTATAAAGCTGTCCATGCAGATGAGTTAACATTT 410
consensus_10970#0 GGCTAGTTTACTTTCTTCATCAAATACATCTTCGACTTCATCATCTGGTGTTATTGTATG 600
consensus_10970#2 ------------------------------------------------------------
consensus_10970#1 GAAGAAGGTGCTATTATCAC--AGTACTAGGTCGAGATGAAC------------------ 450
consensus_10970#0 CACTCAACCAGAGTTCGCTCGAGTAATTGCACCATACAAAGCTACTTCAGCTGGTCAACT 660
consensus_10970#2 ------------------------------------------------------------
consensus_10970#1 ------------------------------------------------------------
consensus_10970#0 AACTCTTCAACCTGGTCAAGTTGTACAACTTCGTAAAAGATCACCTAAAGGTTGGTGGGA 720
consensus_10970#2 ------------------------------------------------------------
consensus_10970#1 ------------------------------------------------------------
consensus_10970#0 AGGAGAGTTACAGGTGTTCTCTGGATCAAATTTAAACTTGATTGATAATGAAGATTAATT 780
consensus_10970#2 ------------------------------------------------------------
consensus_10970#1 ------------------------------------------------------------
consensus_10970#0 GTTTGTTGATTAACTGGCTGTTATCAAATTTACCATGAATTATTTTCTGCAATCTATTGG 840
consensus_10970#2 ------------------------------------------------------------
consensus_10970#1 ------------------------------------------------------------
consensus_10970#0 CTGCCTCTATTGATAAATACTATGTCTTGA 870
consensus_10970#2 ------------------------------
consensus_10970#1 ------------------------------
|
| Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) | ||||