cluster # 11005

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Schistosoma mansoni
cluster # 11005 cluster # 11005 Sequences # 28 consensus # 2

see consensus multiple alignment with clustalw

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consensus_11005#0 length = 2881 sequences # 23

consensus_11005#1 length = 572 sequences # 5

consensusID : consensus_11005#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 23
consensus length = 2881
fasta sequence

                              [AATTTTACTTTAAGAATCTGAAATTGATTACAGAAGCACGTATCATTTGAAAAACAAAACCGCACACATATTAAACCAAATAAGTTTGTATGCATTTGACAAGCATCTTTTTTTCTAAAAAATACAAATAAACTATTCATTACTGTCGGGCTGTTTGTTTGTGTTTTCCTGTGTTATATAAACAATGTCGTCATCATCACAGGAATTCATTGAAAGAAACGAAGCATTTGAAATAAAGAAAGAAAAATTCAGGACAATGAACAAAAGTAGTATTAGTAGTAGTAATGGGGATATGAAATTATTCGATGCAACCAGTTGACAAGATCTTATGAAAAATATGAATTAGATGACAATAATGATAGTAATAATAATAATACAGATAG------TAATAATAATAATAATTTAAGGATTATACAGCAATTTGTGCGGTGAAGAGATAAAGGAACAGTAATTCAATTCATGAATATAATTTTAAAAAATTGGTCATCATAATCATGTTAGTTATAACAATAATAATTTTTCATTTTAGAGATCAAAGTTTACATTCAAAGCTTATTGAATAAGTAAAGTCACCAGGTAAAATATT--AAAAAAAAAGTAACAAGAAACAGAACAGCATTTAGTAACTTAGGTTACATAATGTAAGTAAATTTGTGGGGGTGTGTGTATGTTCTCTATTTGTTAATTTTTTTTATTTTTGATATTACTTATTGTTCAGTCTTTTAAAACATCATTGATAATTAATTCTGCTCTTTGTAGAATTACAATGAGCACAATTATTGTTCATAATACGTAATAGTTCTTTTCTCTTTTATTAAAAAAAAGAAAGTTGATTTGGACAAATTAAGCAAAAACAAAGCCAAAGGAACTCAAAAGAAAGTTATATGTTTCACAAGTTAAAAACTATACGTTC-TGGTGTAAAATCATCGTCATCATCATCATCGTTAACATTAAACAAGTAATGAAAGATGAATAGTTAAATGATAAAGAATGAACAGCACACAAAATATAGATATTGATAAACACATAGTAATCATAACAACATAAGACAAAAAAGGATCGTCATTGTGTTTGCATGACAACATTGATTTAAAATAATGAAAATAACCTGAT-GATGAAAATTATATGCATGTTTCATACATTATATAATGAAGTGAAATTATACACATATGTTATAGCGTACATATATATGTTATATTTATATAAAATGGAAGGTGCATACACTAATTCCCTAGACTATAAACTCAATGAAGTGTCTATGA-TTTTTTTTTCAGTTTAACCAGTTATGTTCTGTAAGCATATTCCAAAAACTCCTTTATGCATACATACCTTTGTCATTGTCACTTCGAGGATAAAGTAATGACTCAGAAGCTGGACCTTCATTATTCCCTTGTTTAGTGAATACAGTAAGATTACGATCTTCCAAAGCTGTAGTACGTTTGCCTACAACAATATTTCCAAATGCAAGATCACGTGCAACTTCATCAAATGTACGATTTTTAGTTTCTGGCATAAACAGGAAAAAGAAGATCCAGCAAATCACAACGACCACAAGGAAGGGCAAAAATGAATAACCACCGATGTTTTTCTGTATAACAGGATAACTACACAATACAATTAGATTGGATAACCATTGAATTGATTGACTCAGTGAATAAGCTGCAGCACGTGGACCTTGTCTAAATATTTCTGATACAATTAATGCAGGAACTGGACCCAAGCCAAGTGCAAAACTGCATATATAAATTAATATCAAAATGATCGATATTATACCCATAGCATTTTTCGTACTTTGCGGACCGGAATCTGCCAAATTAACAAATATCGTAAGTAATAACAAGGATAAAGCTAATGATACTGTAGGCCATAATAATAATGTACGACGTCCAGCACGTTCGATTAGTGGGAGAGAGACAACAGTTACGATAACATTAAGAACTCCAATAGCAAAGACACAATATTGTAAGTACACATCAGGAATACCAGCTAATTCTAGCATAAGAGATGAGTATGTTATAACCGCATTAATTCCAGATAATTGTTGTAAAACTTGTATTAAACAAGCAATAAGCACTGGCATTCGAAGATCTCTTTGTGTAAATAATTGTGTAAATTTAAAAACTGGTTGATTTTTTGCAACTTCAATTTCCTCACGTAATTCACCAATAAATGTATCGACATTTTCTTTAACATTTAATTGCAAAAATGCTTTACGTGCCTCAGCTTCTTTATGTTTTTTCATGTATAAAAATCGTGGACTTTCAGGACAAAACGGTAAAGTAACCAATGAT-ATAGCTGCTGGAACGGCACCCAAAGCAACAGCAAGTGGCCATAGATTTAGTGTATTCAACAGAAATGTAAATGTAATGAAATACGAGAAAGCAATACCAACAGTTACAGCTAACTGATGACAAGCACCAATACCACCACGTAGATCACGTGGTGCCACTTCAGTTAAATAAAGTGAAGCTATGCCAATTGTAATGCCGCTATTAATACCAATAACAAAACGACCAACATATAATAACGCAGGTTGTTTGACAAGAACACAAGGACCAACAATTACACCGCCGATAATGCCAATAACATTATTGAGTATTAAACCATTCCGTCGACCAAGTCCATCAGCAACCCAACCACAACTGAATGCTCCTATTGCAGCGGCAACTACAAATATTGTACTGACATGAGTGTAGAAGAAGCTTGAATCTAATTCTGGAGTATTTGGAACAACTGTCTCATTGAAATATATTTCAATA-TTCCTTCTTGGTAGA-TTCAAAA-CGCCAAGATTGTATCCGATTAGAAATGATGATCCAACACATGTTATAAGTACAGTTAAGACAAGTTTCCCTGTGATACCGTTATTTGAAGCTACTCCCATCTTCT]

[-] EMBL SMGTP1A              [AATTTTACTTTAAGAATCTGAAATTGATTACAGAAGCACGTATCATTTGAAAAACAAAACCGCACACATATTAAACCAAATAAGTTTGTATGCATTTGACAAGCATCTTTTTTTCTAAAAAATACAAATAAACTATTCATTACTGTCGGGCTGTTTGTTTGTGTTTTCCTGTGTTATATAAACAATGTCGTCATCATCACAGGAATTCATTGAAAGAAACGAAGCATTTGAAATAAAGAAAGAAAAATTCAGGACAATGAACAAAAGTAGTATTAGTAGTAGTAATGGGGATATGAAATTATTCGATGCAACCAGTTGACAAGATCTTATGAAAAATATGAATTAGATGACAATAATGATAGTAATAATAATAATACAGATAGTAATAATAATAATAATAATAATTTAAGGATTATACAGCAATTTGTGCGGTGAAGAGATAAAGGGACAGTAATTCAATTCATGAATATAATTTTAAAAAATTGGTCATCATAATCATGTTAGTTATAACAATAATAATTTTTCATTTTAGAGATCAAAGTTTACATTCAAAGCTTATTGAATAAGTAAAGTCACCAGGTAAAATATT  AAAAAAAAAGTAACAAGAAACAGAACAGCATTTAGTAACTTAGGTTACATAATGTAAGTAAATTTGTGGGGGTGTGTGTATGTTCTCTATTTGTTAATTTTTTTTATTTTTGACATTACTTATTGTTCAGTCTTTTAAAACATCATTGATAATTAATTCTGCTCTTTGTAGAATTACAATGAGCACAATTATTGTTCATAATACGTAATAGTTCTTTTCTCTTTTATTAAAAAAAAGAAAGTTGATTTGGACAAATTAAGCAAAAACAAAGCCAAAGGAACTCAAAAGAAAGTTATATGTTTCACAAGTTAAAAACTATACGTTC TGGTGTAAAATCATCGTCATCATCATCATCGTTAACATTAAACAAGTAATGAAAGATGAATAGTTAAATGATAAAGAATGAACAGCACACAAAATATAGATATTGATAAACACATAGTAATCATAACAACATAAGACAAAAAAGGATCGTCATTGTGTTTGCATGACAACATTGATTTAAAATAATGAAAATAACCTGAT GATGAAAATTATATGCATGTTTCATACATTATATAATGAAGTGAAATTATACACATATGTTATAGCGTACATATATATGTTATATTTATATAAAATGGAAGGTGCATACACTAATTCCCTAGACTATAAACTCAATGAAGTGTCTATGA TTTTTTTTTCAGTTTAACCAGTTATGTTCTGTAAGCATATTCCAAAAACTCCTTTATGCATACATACCTTTGTCATTGTCACTTCGAGGATAAAGTAATGACTCAGAAGCTGGACCTTCATTATTCCCTTGTTTAGTGAATACAGTAAGATTACGATCTTCCAAAGCTGTAGTACGTTTGCCTACAACAATATTTCCAAATGCAAGATCACGTGCAACTTCATCAAATGTACGATTTTTAGTTTCTGGCATAAACAGGAAAAAGAAGATCCAGCAAATCACAACGACCACAAGGAAGGGCAAAAATGAATAACCACCGATGTTTTTCTGTATAACAGGATAACTACACAATACAATTAGATTGGATAACCATTGAATTGATTGACTCAGTGAATAAGCTGCAGCACGTGGACCTTGTCTAAATATTTCTGATACAATTAATGCAGGAACTGGACCCAAGCCAAGTGCAAAACTGCATATATAAATTAATATCAAAATGATCGATATTATACCCATAGCATTTTTCGTACTTTGCGGACCGGAATCTGCCAAATTAACAAATATCGTAAGTAATAACAAGGATAAAGCTAATGATACTGTAGGCCATAATAATAATGTACGACGTCCAGCACGTTCGATTAGTGGGAGAGAGACAACAGTTACGATAACATTAAGAACTCCAATAGCAAAGACACAATATTGTAAGTACACATCAGGAATACCAGCTAATTCTAGCATAAGAGATGAGTATGTTATAACCGCATTAATTCCAGATAATTGTTGTAAAACTTGTATTAAACAAGCAATAAGCACTGGCATTCGAAGATCTCTTTGTGTAAATAATTGTGTAAATTTAAAAACTGGTTGATTTTTTGCAACTTCAATTTCCTCACGTAATTCACCAATAAATGTATCGACATTTTCTTTAACATTTAATTGCAAAAATGCTTTACGTGCCTCAGCTTCTTTATGTTTTTTCATGTATAAAAATCGTGGACTTTCAGGACAAAACGGTAAAGTAACCAATGAT ATAGCTGCTGGAACGGCACCCAAAGCAACAGCAAGTGGCCATAGATTTAGTGTATTCAACAGAAATGTAAATGTAATGAAATACGAGAAAGCAATACCAACAGTTACAGCTAACTGATGACAAGCACCAATACCACCACGTAGATCACGTGGTGCCACTTCAGTTAAATAAAGTGAAGCTATGCCAATTGTAATGCCGCTATTAATACCAATAACAAAACGACCAACATATAATAACGCAGGTTGTTTGACAAGAACACAAGGACCAACAATTACACCACCGATAATGCCAATAACATTATTGAGTATTAAACCATTCCGTCGACCAAGTCCATCAGCAACCCAACCACAACTGAATGCTCCTATTGCAGCGGCAACTACAAATATTGTACTGACATGAGTGTAGAAGAAGCTTGAATCTAATTCTGGAGTATTTGGAACAACTGTCTCATTGAAATATATTTCAATA TTCCTTCTTGGTAGA TTCAAAA CGCCAAGATTGTATCCGATTAGAAATGATGATCCAACACATGTTATAAGTACAGTTAAGACAAGTTTCCCTGTGATACCGTTATTTGAAGCTACTCCCATCTTCT]
[-] EMBL CD185520             [                                                                                                                            CAAATAAACTATTCATTACTGTCGGGCTGTTTGTTTGTGTTTTCCTGTGTTATATAAACAATGTCGTCATCATCACAGGAATTCATTGAAAGAAACGAAGCATTTGAAATAAAGAAAGAAAAATTCAGGACAATGAACAAAAGTAGTATTAGTAGTAGTAATGGGGATATGAAATTATTCGATGCAACCAGTTGACAAGATCTTATGAAAAATATGAATTAGATGACAATAATGATAGTAATAATAATAATACAGATAG      TAATAATAATAATAATTTAAGGATTATACAGCGATTTGTGCGGTGAAGAGATAAAGGAACAGTAATTCAATTCATGAATATAATTTTAAAAAATTGGTCATCATAATCATGTCAGTTATAACAATAATAATTTTTCATTTTAGAGATCAAAGTTTACATTCAAAGCTTATTGAATAAGTAAAGTCACCAGGTA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          ]
[-] EMBL CD185512             [                                                                                                                            CAAATAAACTATTCATTACTGTCGGGCTGTTTGTTTGTGTTTTCCTGTGTTATATAAACAATGTCGTCATCATCACAGGAATTCATTGAAAGAAACGAAGCATTTGAAATAAAGAAAGAAAAATTCAGGACAATGAACAAAAGTAGTATTAGTAGTAGTAATGGGGATATGAAATTATTCGATGCAACCAGTTGACAAGATCTTATGAAAAATATGAATTAGATGACAATAATGATAGTAATAATAATAATACAGATAG      TAATAATAATAATAATTTAAGGATTATACAGCGATTTGTGCGGTGAAGAGATAAAGGAACAGTAATTCAATTCATGAATATAATTTTAAAAAATTGGTCATCATAATCATGTCAGTTATAACAATAATAATTTTTCATTTTAGAGATCAAAGTTTACATTCAAAGCTTATTGAATAAGTAAAGTCACCAGGTA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          ]
[-] EMBL SMAA28855            [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          GTTGACAAGATCTTATGAAAAATATGAATTAGATGACAATAATGATAGTAATAATAATAATACAGATAG      TAATAATAATAATAATTTAAGGATTATACAGCAATTTGTGCGGTGAAGAGATAAAGGAACAGTAATTCAATTCATGAATATAATTTTAAAAAATTGGTCATCATAATCATGTTAGTTATAACAATAATAATTTTTCATTTTAGAGATCAAAGTTTACATTCAAAGCTTATTGAATAAGTAAAGTCACCAGGTAAAATATTAAAAAAAAAAAGTAACAAGAAACAGAACAGCATTTAGTAACTTAGGTTACATAATGTAAGTA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     ]
[+] EMBL CD068371             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 TTCTCTA TTGTTAATTTTTTTTATTTTTGATATTACTTATTGTTCAGTCTTTTAAAACATCATTGATAATTAATTCTGCTCTTTGTAGAATTACAATGAGCACAATTATTGTTCATAATACGTAATAGTTCTTTTCTCTTTTATTAAAAAAAAGAAAGTTGATTTGGACAAATTAAGCAAAAACAAAGCCAAAGGAACTCAAAAGAAAGTTATATGTTTCACAAGTTAAAAACTATACGTTCATGGTGTAAAATCATCGTCATCATCATCATCGTTAACATTAAACAAGTAATGAAAGATGAATAGTTAAATGATAAAGAATGAACAGCACACAAAATATAGATATTGATAAACACATAGTAATCATAACAACATAAGAC AAAAAGGATCGTCATTGTGTTTGCATGACAACATTGATTTAAAATAATGAAAATAACCTGATAGATGAAAATTATATGCATGT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              ]
[+] EMBL CD143446             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     CTATTTGTTAATTTTTTTTATTTTTGATATTACTTATTGTTCAGTCTTTT AAACATCATTGATAATTAATTCTGCTCTTTGTAGAATTACAATGAGCACAATTATTGTTCATAATACGTAATAGTTCTTTTCTCTTTTATTAAAAAAAAGAAAGTTGATTTGGACAAATTAAGCAAAAACAAAGCCAAAGGAACTCAAAAGAAAGTTATATGTTTCACAAGTTAAAAACTATACGTTCATGGTGTAAAATCATCGTCATCATCATCATCGTTAACATTAAACAAGTAATGAAAGATGAATAGTTAAACGATAAAGAATGAACAGCACACAAAATATAG                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        ]
[+] EMBL CD143555             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     CTATTTGTTAATTTTTTTTATTTTTGATATTACTTATTGTTCAGTCTTTTAAAACATCATTGATAATTAATTCTGCTCTTTGTAGAATTACAATGAGCACAATTATTGTTCATAATACGTAATAGTTCTTTTCTCTTTTATTAAAAAAAAGAAAGTTGATTTGGACAAATTAAGCAAAAACAAAGCCAAAGGAACTCAAAAGAAAGTTATATGTTTCACAAGTTAAAAACTATACGTTCATGGTGTAAAATCATCGTCATCATCATCATCGTTAACATGAAACAAGTAATGAAAGATGAATAGTTAAATGATAAAGAATGAACAGCACACAAAATATAG                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        ]
[-] EMBL CD143453             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      TATTTGTTAATTTTTTTTATTTTTGATATTACTTATTGTTCAGTCTTTTAAAACATCATTGATAATTAATTCTGCTCTTTGTAGAATTACAATGAGCACAATTATTGTTCATAATACGTAATAGTTCTTTTCTCTTTTATTAAAAAAAAGAAAGTTGATTTGGACAAATTAAGCAAAAACAAAGCCAAAGGAACTCAAAAGAAAGTTATATGTTTCACAAGTTAAAAACTATACGTTCATGGTGTAAAATCATCGTCATCATCATCATCGTTAACATTAAACAAGTAATGAAAGATGAATAGTTAAATGATAAAGAATGAACAGCACACAAAATATAGA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       ]
[+] EMBL CD069168             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          AGAAAGTTGATTGGGACAAATTAAGCAAAAACAAAGCCAAAGGAACTCAAAAGAAAGTCATATGTTTCACAAGTTAAAAACTATACGTTCATGGTGTAAAATCATCGTCATCATCATCATCGATAACATTAAACAAGTAATGAAA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     ]
[-] EMBL CD194551             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   CATATGTTATAGCGTACAAATATATGTTATATTTATATAAAATGGAAGGTGCATACACTAATTCCCTAGACTATAAACTCAATGAAGTGTCTATGATTTTTTTTTTCAGTTTAACCAGTTATGTTCTGTAAGCATATTCCAAAAACTCCTTTATGCATACATACCTTTGTCATTGTCACTTCGAGGATAAAGTAATGACTCAGAAGCTGGACCTTCATTATTCCCTTGTTTAGTGAATACAGTAAGATTACGATCTTCCAAAGCTGTAGTACGTTTGCCTACAACAATATTTCCAAATGCAAGATCACGTGCAACTTCATCAAATGTACGATTTTTAGTTTCTGGCATAAACAGGAAAAAGAAGATCCAGCAAAT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      ]
[+] EMBL CD179093             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             TAATTCCCTAGACTATAAACTCAATGAAGTGTCTATGA TTTTTTTTTCAGTTTAACCAGTTATGTTCTGTAAGCATATTCCAAAAACTCCTTTATGCATACATACCTTTGTCATTGTCACTTCGAGGATAAAGTAATGACTCAGAAGCTGGACCTTCATTATTCCCTTGTTTAGTGAATACAGTAAGATTACGATCTTCCAAAGCTGTAGTACGTTTGCCTACAACAATATTTCCAAATGCAAGATCACGTGCAACTTCATCAAATGTACGATTTTTAGTTTCTGGCATAAACAGGAAAAAGAAGATCCAGCAAATCACAACGACCACAAGGAAGGGCAAA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             ]
[+] EMBL CD162916             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  GTAAGCATATTCCAAAAACTCCTTTATGCATACATACCTTTGTCATTGTCACTTCGAGGATAAAGTAATGACTCAGAAGCTGGACCTTCATTATTCCCTTGTTTAGTGAATACAGTAAGATTACGATCTTCCAAAGCTGTAGTACGTTTGCCTACAACAATATTTCCAAATGCAAGATCACGTGCAACTTCATCAAATGTACGATTTTTAGTTTCTGGCATAAACAGGAAAAAGAAGATCCAGCAAATCACAACGACCACAAGGAAGGGCAAAAATGAATAACCACCGATGTTTTTCTGTATAACAGGATAACTAC                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  ]
[-] EMBL CD078445             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  CGTNTGCCTACAACAATATTTCCAAATGCAAGATCACGTGCAACTTCATCAAATGTACGATTNTTAGTTTCTGGCATAAACAGGAAAAAGAAGATCCAGCAAATCACAACGACCACAAGGAAGGGCAAAAATGAATAACCACCGATGTTTTTCTGTATAACAGGATAACTACACAATACAATTAGATTGGATAACCATTGAATTGATTGACTCAGTGAATAAGCTGCAGCACGTGGACCTTGTCTAAATATTTCTGATACAATTAATGCAGGAACTGGACCCAAGCCAAGTGCAAAACTGCATATATAAATTAATATCAAAATGATCGATATTATACCCATAGCATTTTTCGTACTTTGCGGACCGGAATCTGCCAAATTAACAAATATCGTAAGTAATAACAAGGATAAAGCTAATGATACTGTAGGCCATAATAATAATGTACGACGTCCAGCACGTTCGATTAGTGGGAGAGAGACAACAGTTACGATAACATTAAGAACTCCAATAGCAAAGACACAATATTGTAAGTACACATCAGGAATACCAGCTAATTCTAGCATAAGAGATGAGTATGTTATAACCGCATTAAT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             ]
[+] EMBL CD066478             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                AATACAATTAGATTGGATAACCATTGAATTGATTGACTCAGTGAATAAGCTGCAGCACGTGGACCTTGTCTAAATATTTCTGATACAATTAATGCAGGAACTGGACCCAAGCCAAGTGCAAAACTGCATATATAAATTAATATCAAAATGATCGATATTATACCCATAGCATTTTTCGTACTTTGCGGACCGGAATCTGCCAAATTAACAAATATCGTAAGTAATAACAAGGATAAAGCTAATGATACTGTAGGCCATAATAATAATGTACGACGTCCAGCACGTTCGATTAGTGGGAGAGAGACAACAGTTACGATAACATTAAGAACTCCAATAGCAAAGACACAATATTGTAAGTACACATCAGGAATACCAGCTAATTCTAGCATAAGAGATGAGTATGTTATAACC                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     ]
[-] EMBL CD194479             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               ATATATAAATTAATATCAAAATGATCGATATTATACCCATAGCATTTTTCGTACTTTGCGGACCGGAATCTGCCAAATTAACAAATATCGTAAGTAATAACAAGGATAAAGCTAATGATACTGTAGGCCATAATAATAATGTACGACGTCCAGCACGTTCGATTAGTGGGAGAGAGACAACAGTTACGATAACATTAAGAACTCCAATAGCAAAGACACAATATTGTAAGTACACATCAGGAATACCAGCTAATTCTAGCATAAGAGATGAGTATGTTATAACCGCATTAATTCCAGATAATTGTTGTAAAACTTGTATTAAACAAGCAATAAGCACTGGCATTCGAAGATCTCTTTGTGTAAATAATTGTGTAAATTTAAAAACTGGTTGATTTTTTGCAACTTCAATTTCCTCACGT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              ]
[-] EMBL CD068304             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                ATTAAGAACTCCTATAGCAAAGACACAATATTGTAAGTACACATCAGGAATACCAGCTAATTCTAGCATAAGAGATGAGTATGTTATAACCGCATTAATTCCAGATAATTGTTGTAAAACTTGTATTAAACAAGCAATAAGCACTGGCATTCGAAGATCTCTTTGTGTAAATAATTGTGTAAATTTAAAAACTGGTTGATTTTTTGCAACTTCAATTTCCTCACGTAATTCACCAATAAATGTATCGACATTTTCTGTAACATTTAATTGCAAAAATGCTTTACGTGCCTCAGCTTCTTTATGTTTTTTCATGTATAAAAATCGTGGACTTTCAGGACAAAACGGTAAAGTAACCAATGAT ATAGCTGCTGGAACGGCACCCAAAGCAACAGCAAGTGGCCATAGATTTAGTGTATTCAACAGAAATGTAAATGTAATGAAATACGAGAAAGCAATACCAACAGTTACAGCTAACTGATGACAAGCACCAATACCTCCACATAGgataca                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 ]
[+] EMBL CD168078             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       GCTAATTCTAGCATAAGAGATGAGTATGTTATAACCGCATTAATTCCAGATAATTGTTGTAAAACTTGTATTAAACAAGCAATAAGCACTGGCATTCGAAGATCTCTTTGTGTAAATAATTGTGTAAATTTAAAAACTGGTTGATTTTTTGCAACTTCAATTTCCTCACGTAATTCACCAATAAATGTATCGACATTTTCTTTAACATTTAATTGCAAAAATGCTTTACGTGCCTCAGCTTCTTTATGTTTTTTCATGTATAAAAATCGTGGACTTTCAGGACAAAACGGTAAAGTAACCAATGAT ATAGCTGCTGGAACGGCACCCAAAGCAACAGCAAGTGGCCATAGATTTAGTGTATTCAACAGAAATGTAAATGTAATGAAATACGAGAAAGCAATACCAACAGTTACAGCTAACTGATGACAAGCACCAATACCACCACGTAGATCACGTGGTGCCACTTCAGTTAAATAAAGTGAAGCTATGCCAATTGTAATGCCGCTATTAATACCAATAACAAAACGACCAACATATAATAACGCAGGTTGTTTGACAAGAACACAAGGACCAACAATTACACCGCCGATAACGCCAATAACATTATTGAGTATTAAACCATTCCGTCGACCAAGTCCA                                                                                                                                                                                                                                                                         ]
[-] EMBL CD167777             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    TAAGAGATGAGTATGTTATACCCGCATTAATTCCAGATAATTGTTGTAAAACTTGTATTAAACAAGCAATAAGCACTGGCATTCGAAGATCTCTTTGTGTAAATAATTGTGTAAATTTAAAAACTGATTGATTTTTTGCAACTTCAATTTCCTCACGTAATTCACCAATAAATGTATCGACATTTTCTTTAACATTTAATTGCAAAAATGCTTTACGTGCCTCAGCTTCTTTATGTTTTTTCATGTATAAAAATCGTGGACTTTCAGGACAAAACGGTAAAGTAACCAATGGT ATAGCTGCTGGAACGGCACCCAAAGCAACAGCAAGTGGCCATAGATTTAGTGTATTCAACAGAAATGTAAATGTAATGAAATACGAGAAAGCAATACCAACAGTTACAGCTAACTGATGACAAGCACCAATACCACCACGTAGATCACGTGGTGCCACTTCAGTTAAATAAAGTGAAGCTATGCCAATTGTAATGCCGCTATTAATACCAATAACAAAACGACCAACATATAATAACGCAGGTTGTTTGACAAGAACACAAGGACCAACAATTACACCGCCGATAATGCCAATAACATTATTGAGTATTAAACCATTCCGTCG                                                                                                                                                                                                                                                                                   ]
[+] EMBL CD166635             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          ccatAATGT TCGACATTTTCTTTAACATTTAATTGCAAAAATGCTTTACGTGCCTCGGCTTCTTTATGTTTTTTCATGTATAAAAATCGTGGACTTTCAGGACAAAACGGTAAAGTAACCAATGAT ATAGCTGCTGGAACGGCACCCAAAGCAACAGCAAGTGGCCATAGATTTAGTGTATTCAACAGAAATGTAAATGTAATGAAATACGGGAAAGCAATACCAACAGTTACAGCTAACTGATGACAAGCACCAATACCACCACGTAGATCACGTGGTGCCACTTCAGTTAAATAAAGTGAAGCTATGCCAATTGTAATGCCGCTATTAATACCAATAACAAAACGACCAACATATAATAACGCAGGTTGTTTGACAAGAACACAAGGACCAACAATTACACCACCGATAATGCCAATAACATTATTGAGTATTAAACCATTCCGTCGACCAAGTCCATCAGCAANCCAA                                                                                                                                                                                                                                                             ]
[-] EMBL CD180598             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           TCAGGACAAAACGGTAAAGTAACCAATGAT ATAGCTGCTGGAACGGCACCCAAAGCAACAGCAAGTGGCCATAGATTTAGTGTATTCAACAGAAATGTAAATGTAATGAAATACGAGAAAGCAATACCAACAGTTACAGCTAACTGATGACAAGCACCAATACCACCACGTAGATCACGTGGTGCCACTTCAGTTAAATAAAGTGAAGCTATGCCAATTGTAATGCCGCTATTAATACCAATAACAAAACGACCAACATATAATAACGCAGGTTGTTTGACAAGAACACAAGGACCAACAATTACACCGCCGATAATGCCAATAACATTATTGAGTATTA                                                                                                                                                                                                                                                                                                ]
[-] EMBL CD066367             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       GGTAAAGTACCCAAATATAAAAGCGGGGGGAAGGGCACCCAAAGCAACAGCAAGGGGCCATAGATTTAGTGTATCCACCAAAAATGTAAATGTATTGAAATACAAGAAAGCAAT CCACCAGTTACAGGTAACTGAAGACAAGCACCAATCCCACCACGTAGATCACGTGGTGCCACTTCAGTTAAATAAAGTGAAGCTATGCCAATTGTAATGCCGCTATTAATACCAATAACAAAACGACCAACATATAATAACGCAGGTTGTTTGACAAGAACACAAGGACCAACAATTACACCACCGATAATGCCAATAACATTATTGAGTATTAAACCATTCCGTCGACCGAGTCCATCAGCAACCCAACCACAACTGAATGCTCCTATTGCAGCGGCAACTACAAATATTGTACTGACATGAGTGTAGAAGAAGCTTGAATCTAATTCTGGAGTATTTGGAACAACTGTCTCATTGAAATATATTTCAATA TTCCTTCTTGG AGATTTCAAAA CGCCAAGATTGTATCCGATTAGAAATGATGATCCAACACATGTTATAAGTACAGTTAAGAC                                            ]
[+] EMBL CD067407             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          AAAGTAACCAATGAT ATAGCTGCTGGAACGGCACCCAAAGCAACAGCAAGTGGCCATAGATTTAGTGTATTCAACAGAAATGTAAATGTAATGAAATACGAGAAAGCAATACCAACAGTTACAGCTAACTGATGACAAGCACCAATACCATCACGTAGATCACGTGGTGCCACTTCAGTTAAATAAAGTGAAGCTATGCCAATTGTAATGCCGCTATTAATACCAATAACAAAACGACCAACATATAATAACGCAGGTTGTTTGACAAGAACACAAGGACCAACAATTACACCGCCGATAATGCCAATAACATCATTGAGTATTAAACCATTCCGTCGACCAAGTCCATCAGCAACCCCACCACAACTGAATGCTCCTATTGCAACGGCAACTACAAATATTGTACTGACGTGAGTGTAAAAGAAGCTTGAATCTAATTCTGGAGTATTTGGAACAACTGTCTCATTGAAATATATTTCAATATTTCCTTCTTGGTAGA ATCAAAACCCCCAAAAATGTATCCCATTAAAAATTAAGATCCAACACATGGTATTAGTACCGTTTA ACA                                           ]
[-] EMBL CD067299             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   ACGTAGATCACGTGGTGCCACTTCAGTTAAATAAAGTGAAGCTATGCCAATTGTAATGCCGCTATTAATACCAATAACAAAACGACCAACATATAATAACGCAGGTTGTTTGACAAGAACACAAGGACCAACAATTACACCGCCGATAATGCCAATAACATCATTGAGTATTAAACCATTCCGTCGACCAAGTCCATCAGCAACCCCACCACAACTGAATGCTCCTATTGCAGCGGCAACTACAAATATTGTACTGACGTGAGTGTAGAAGAAGCTTGAATCTAATTCTGGAGTATTTGGAACAACTGTCTCATTGAAATATATTTCAATA TTCCTTCTTGGTAGA TTCAAAA CGCCAAGATTGTATCCGATTAGAAATGATGATCCAACACATGTTATAAGTACAGTTAAGAC                                            ]




>consensus_11005#0
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CGCACACATATTAAACCAAATAAGTTTGTATGCATTTGACAAGCATCTTTTTTTCTAAAA
AATACAAATAAACTATTCATTACTGTCGGGCTGTTTGTTTGTGTTTTCCTGTGTTATATA
AACAATGTCGTCATCATCACAGGAATTCATTGAAAGAAACGAAGCATTTGAAATAAAGAA
AGAAAAATTCAGGACAATGAACAAAAGTAGTATTAGTAGTAGTAATGGGGATATGAAATT
ATTCGATGCAACCAGTTGACAAGATCTTATGAAAAATATGAATTAGATGACAATAATGAT
AGTAATAATAATAATACAGATAGTAATAATAATAATAATTTAAGGATTATACAGCAATTT
GTGCGGTGAAGAGATAAAGGAACAGTAATTCAATTCATGAATATAATTTTAAAAAATTGG
TCATCATAATCATGTTAGTTATAACAATAATAATTTTTCATTTTAGAGATCAAAGTTTAC
ATTCAAAGCTTATTGAATAAGTAAAGTCACCAGGTAAAATATTAAAAAAAAAGTAACAAG
AAACAGAACAGCATTTAGTAACTTAGGTTACATAATGTAAGTAAATTTGTGGGGGTGTGT
GTATGTTCTCTATTTGTTAATTTTTTTTATTTTTGATATTACTTATTGTTCAGTCTTTTA
AAACATCATTGATAATTAATTCTGCTCTTTGTAGAATTACAATGAGCACAATTATTGTTC
ATAATACGTAATAGTTCTTTTCTCTTTTATTAAAAAAAAGAAAGTTGATTTGGACAAATT
AAGCAAAAACAAAGCCAAAGGAACTCAAAAGAAAGTTATATGTTTCACAAGTTAAAAACT
ATACGTTCTGGTGTAAAATCATCGTCATCATCATCATCGTTAACATTAAACAAGTAATGA
AAGATGAATAGTTAAATGATAAAGAATGAACAGCACACAAAATATAGATATTGATAAACA
CATAGTAATCATAACAACATAAGACAAAAAAGGATCGTCATTGTGTTTGCATGACAACAT
TGATTTAAAATAATGAAAATAACCTGATGATGAAAATTATATGCATGTTTCATACATTAT
ATAATGAAGTGAAATTATACACATATGTTATAGCGTACATATATATGTTATATTTATATA
AAATGGAAGGTGCATACACTAATTCCCTAGACTATAAACTCAATGAAGTGTCTATGATTT
TTTTTTCAGTTTAACCAGTTATGTTCTGTAAGCATATTCCAAAAACTCCTTTATGCATAC
ATACCTTTGTCATTGTCACTTCGAGGATAAAGTAATGACTCAGAAGCTGGACCTTCATTA
TTCCCTTGTTTAGTGAATACAGTAAGATTACGATCTTCCAAAGCTGTAGTACGTTTGCCT
ACAACAATATTTCCAAATGCAAGATCACGTGCAACTTCATCAAATGTACGATTTTTAGTT
TCTGGCATAAACAGGAAAAAGAAGATCCAGCAAATCACAACGACCACAAGGAAGGGCAAA
AATGAATAACCACCGATGTTTTTCTGTATAACAGGATAACTACACAATACAATTAGATTG
GATAACCATTGAATTGATTGACTCAGTGAATAAGCTGCAGCACGTGGACCTTGTCTAAAT
ATTTCTGATACAATTAATGCAGGAACTGGACCCAAGCCAAGTGCAAAACTGCATATATAA
ATTAATATCAAAATGATCGATATTATACCCATAGCATTTTTCGTACTTTGCGGACCGGAA
TCTGCCAAATTAACAAATATCGTAAGTAATAACAAGGATAAAGCTAATGATACTGTAGGC
CATAATAATAATGTACGACGTCCAGCACGTTCGATTAGTGGGAGAGAGACAACAGTTACG
ATAACATTAAGAACTCCAATAGCAAAGACACAATATTGTAAGTACACATCAGGAATACCA
GCTAATTCTAGCATAAGAGATGAGTATGTTATAACCGCATTAATTCCAGATAATTGTTGT
AAAACTTGTATTAAACAAGCAATAAGCACTGGCATTCGAAGATCTCTTTGTGTAAATAAT
TGTGTAAATTTAAAAACTGGTTGATTTTTTGCAACTTCAATTTCCTCACGTAATTCACCA
ATAAATGTATCGACATTTTCTTTAACATTTAATTGCAAAAATGCTTTACGTGCCTCAGCT
TCTTTATGTTTTTTCATGTATAAAAATCGTGGACTTTCAGGACAAAACGGTAAAGTAACC
AATGATATAGCTGCTGGAACGGCACCCAAAGCAACAGCAAGTGGCCATAGATTTAGTGTA
TTCAACAGAAATGTAAATGTAATGAAATACGAGAAAGCAATACCAACAGTTACAGCTAAC
TGATGACAAGCACCAATACCACCACGTAGATCACGTGGTGCCACTTCAGTTAAATAAAGT
GAAGCTATGCCAATTGTAATGCCGCTATTAATACCAATAACAAAACGACCAACATATAAT
AACGCAGGTTGTTTGACAAGAACACAAGGACCAACAATTACACCGCCGATAATGCCAATA
ACATTATTGAGTATTAAACCATTCCGTCGACCAAGTCCATCAGCAACCCAACCACAACTG
AATGCTCCTATTGCAGCGGCAACTACAAATATTGTACTGACATGAGTGTAGAAGAAGCTT
GAATCTAATTCTGGAGTATTTGGAACAACTGTCTCATTGAAATATATTTCAATATTCCTT
CTTGGTAGATTCAAAACGCCAAGATTGTATCCGATTAGAAATGATGATCCAACACATGTT
ATAAGTACAGTTAAGACAAGTTTCCCTGTGATACCGTTATTTGAAGCTACTCCCATCTTC
T

consensusID : consensus_11005#1
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 5
consensus length = 572
fasta sequence

                              [GCCCGGTACCCTGGTTTTGGTGGAAATCACGACAAAACGGTAAAGTAACCAATGATATAGCTGCTGGAACGGCACCCAAAGCAACAGCAAGTGGCCATAGATTTAGTGTATTCAACAGAAATGTAAATGTAATGAAATACGAGAAAGCAATACCAACAGTTACAGCTAACTGATGACAAGCACCAATACCACCACGTAGATCACGTGGTGCCACTTCAGTTAAATAAAGTGAAGCTATGCCAATTGTAATGCCGCTATTAATACCAATAACAAAACGACCAACATATAATAACGCAGGTTGTTTGACAAGAACACAAGGACCAACAATTACACCGCCGATAATGCCAATAACATTATTGAGTATTAAACCATTCCGTCGACCAAGTCCATCAGCAACCCAACCACAACTGAATGCTCCTATTGCAGCGGCAACTACAAATATTGTACTGACATGAGTGTAGAAGAAGCTCGAATCTAATTCTGGAGTATTTGGAACAACTGTCTCATTGAAATATATTTCAATATTCCTTCTTGGTAGATTCAAAACGCCAAGATTGTATCCGATTAGAAAT]

[+] EMBL CD168256             [GCCCGGTACCCTGGTTTTGGTGGAAATCACGACAAAACGGTAAAGTAACCAATGATATAGCTGCTGGAACGGCACCCAAAGCAACAGCAAGTGGCCATAGATTTAGTGTATTCAACAGAAATGTAAATGTAATGAAATACGAGAAAGCAATACCAACAGTTACAGCTAACTGATGACAAGCACCAATACCACCACGTAGATCACGTGGTGCCACTTCAGTTAAATAAAGTGAAGCTATGCCAATTGTAATGCCGCTATTAATACCAATAACAAAACGACCAACATATAATAACGCAGGTTGTTTGACAAGAACACAAGGACCAACAATTACACCGCCGATAATGCCAATAACATTATTGAGTATTAAACCATTCCGTCGACCAAGTCCATCAGCAACCCAACCACAACTGAATGCTCCTATTGCAGCGGCAACTACAAATATTGTACTGACATGAGTGTAGAAGAAGCTCGAATCTAATTCTGGAGTATTTGGAACAACTGTCTCATTGAAATATATTTCAATATTCCTTCTTGGTAGATTCAAAACGCCAAGATTGTATCCGATTAGAAAT]
[+] EMBL CD060068             [                                                                  ggggggttCCTATAGCAACAGCAAGTGGCCATAAATTTAGTGTATTCAACAGAAATGTAAATGTAATGAAATACGAGAAAGCAATACCAACAGTTACA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        ]
[+] EMBL CD071321             [                                                                                           TGGCCATAGATTTAGTGTATTCAACAGAAATGTAAATGTAATGAAATACGAGAAAGCAATACCAACAGTTACAGCTAACTGATGACAAGCACCAATACCACCACGTAGATCACGTGGTGCCACTTCAGTTAAATAAAGTGAAGCTATGCCAATTGTAATGCCGCTATTAATACCAATAACAAAACGACCAACATATAATAACGCAGGTTGTTTGACAAGAACACAAGGACCAACAATTACACCACCGATAATGCCAATAACATTATTGAGTATTANACCATTCCGTCGACCAAGTCCATCAGCAACCCAACCACAACTGAATGCTCCTATTGCAGCGGCAACTACNAATATTGT                                                                                                                               ]
[-] EMBL CD064358             [                                                                                                                    AGAAATGTAAATGTAATGAAATACGAGAAAGCAATACCAACAGTTACAGCTAACTGATGACAAGCACCAATACCACCACGTAGATCACGTGGTGCCACTTCAGTTAAATAAAGTGAAGCTATGCCAATTGTAATGCCGCTATTAATACCAATAACAAAACGACCAACATATAATAACGCAGGTTGTTTGACAAGAACACAAGGACCAACAATTACACCGCCGATAATGCCAATAACATTATTGAGTATTAAACCATTCCGTCGACCAAGTCCATC GCAACCC                                                                                                                                                                             ]
[-] EMBL CD166863             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                     GCAGGTTGTTTGACAAGAACACAAGGACCAACAATTACACCACCGATAATGCCAATAACATTATTGAGTAT   ACCATTCCGTCGACCAAGTCCATCAGCAACCC ACCACA                                                                                                                                                                      ]




>consensus_11005#1
GCCCGGTACCCTGGTTTTGGTGGAAATCACGACAAAACGGTAAAGTAACCAATGATATAG
CTGCTGGAACGGCACCCAAAGCAACAGCAAGTGGCCATAGATTTAGTGTATTCAACAGAA
ATGTAAATGTAATGAAATACGAGAAAGCAATACCAACAGTTACAGCTAACTGATGACAAG
CACCAATACCACCACGTAGATCACGTGGTGCCACTTCAGTTAAATAAAGTGAAGCTATGC
CAATTGTAATGCCGCTATTAATACCAATAACAAAACGACCAACATATAATAACGCAGGTT
GTTTGACAAGAACACAAGGACCAACAATTACACCGCCGATAATGCCAATAACATTATTGA
GTATTAAACCATTCCGTCGACCAAGTCCATCAGCAACCCAACCACAACTGAATGCTCCTA
TTGCAGCGGCAACTACAAATATTGTACTGACATGAGTGTAGAAGAAGCTCGAATCTAATT
CTGGAGTATTTGGAACAACTGTCTCATTGAAATATATTTCAATATTCCTTCTTGGTAGAT
TCAAAACGCCAAGATTGTATCCGATTAGAAAT

consensus multiple alignement with clustalw

CLUSTAL W (1.82) multiple sequence alignment


consensus_11005#0      AATTTTACTTTAAGAATCTGAAATTGATTACAGAAGCACGTATCATTTGAAAAACAAAAC 60
consensus_11005#1      ------------------------------------------------------------
                                                                                   

consensus_11005#0      CGCACACATATTAAACCAAATAAGTTTGTATGCATTTGACAAGCATCTTTTTTTCTAAAA 120
consensus_11005#1      ------------------------------------------------------------
                                                                                   

consensus_11005#0      AATACAAATAAACTATTCATTACTGTCGGGCTGTTTGTTTGTGTTTTCCTGTGTTATATA 180
consensus_11005#1      ------------------------------------------------------------
                                                                                   

consensus_11005#0      AACAATGTCGTCATCATCACAGGAATTCATTGAAAGAAACGAAGCATTTGAAATAAAGAA 240
consensus_11005#1      ------------------------------------------------------------
                                                                                   

consensus_11005#0      AGAAAAATTCAGGACAATGAACAAAAGTAGTATTAGTAGTAGTAATGGGGATATGAAATT 300
consensus_11005#1      ------------------------------------------------------------
                                                                                   

consensus_11005#0      ATTCGATGCAACCAGTTGACAAGATCTTATGAAAAATATGAATTAGATGACAATAATGAT 360
consensus_11005#1      ------------------------------------------------------------
                                                                                   

consensus_11005#0      AGTAATAATAATAATACAGATAGTAATAATAATAATAATTTAAGGATTATACAGCAATTT 420
consensus_11005#1      ------------------------------------------------------------
                                                                                   

consensus_11005#0      GTGCGGTGAAGAGATAAAGGAACAGTAATTCAATTCATGAATATAATTTTAAAAAATTGG 480
consensus_11005#1      ------------------------------------------------------------
                                                                                   

consensus_11005#0      TCATCATAATCATGTTAGTTATAACAATAATAATTTTTCATTTTAGAGATCAAAGTTTAC 540
consensus_11005#1      ------------------------------------------------------------
                                                                                   

consensus_11005#0      ATTCAAAGCTTATTGAATAAGTAAAGTCACCAGGTAAAATATTAAAAAAAAAGTAACAAG 600
consensus_11005#1      ------------------------------------------------------------
                                                                                   

consensus_11005#0      AAACAGAACAGCATTTAGTAACTTAGGTTACATAATGTAAGTAAATTTGTGGGGGTGTGT 660
consensus_11005#1      ------------------------------------------------------------
                                                                                   

consensus_11005#0      GTATGTTCTCTATTTGTTAATTTTTTTTATTTTTGATATTACTTATTGTTCAGTCTTTTA 720
consensus_11005#1      ------------------------------------------------------------
                                                                                   

consensus_11005#0      AAACATCATTGATAATTAATTCTGCTCTTTGTAGAATTACAATGAGCACAATTATTGTTC 780
consensus_11005#1      ------------------------------------------------------------
                                                                                   

consensus_11005#0      ATAATACGTAATAGTTCTTTTCTCTTTTATTAAAAAAAAGAAAGTTGATTTGGACAAATT 840
consensus_11005#1      ------------------------------------------------------------
                                                                                   

consensus_11005#0      AAGCAAAAACAAAGCCAAAGGAACTCAAAAGAAAGTTATATGTTTCACAAGTTAAAAACT 900
consensus_11005#1      ------------------------------------------------------------
                                                                                   

consensus_11005#0      ATACGTTCTGGTGTAAAATCATCGTCATCATCATCATCGTTAACATTAAACAAGTAATGA 960
consensus_11005#1      ------------------------------------------------------------
                                                                                   

consensus_11005#0      AAGATGAATAGTTAAATGATAAAGAATGAACAGCACACAAAATATAGATATTGATAAACA 1020
consensus_11005#1      ------------------------------------------------------------
                                                                                   

consensus_11005#0      CATAGTAATCATAACAACATAAGACAAAAAAGGATCGTCATTGTGTTTGCATGACAACAT 1080
consensus_11005#1      ------------------------------------------------------------
                                                                                   

consensus_11005#0      TGATTTAAAATAATGAAAATAACCTGATGATGAAAATTATATGCATGTTTCATACATTAT 1140
consensus_11005#1      ------------------------------------------------------------
                                                                                   

consensus_11005#0      ATAATGAAGTGAAATTATACACATATGTTATAGCGTACATATATATGTTATATTTATATA 1200
consensus_11005#1      ------------------------------------------------------------
                                                                                   

consensus_11005#0      AAATGGAAGGTGCATACACTAATTCCCTAGACTATAAACTCAATGAAGTGTCTATGATTT 1260
consensus_11005#1      ------------------------------------------------------------
                                                                                   

consensus_11005#0      TTTTTTCAGTTTAACCAGTTATGTTCTGTAAGCATATTCCAAAAACTCCTTTATGCATAC 1320
consensus_11005#1      ------------------------------------------------------------
                                                                                   

consensus_11005#0      ATACCTTTGTCATTGTCACTTCGAGGATAAAGTAATGACTCAGAAGCTGGACCTTCATTA 1380
consensus_11005#1      ------------------------------------------------------------
                                                                                   

consensus_11005#0      TTCCCTTGTTTAGTGAATACAGTAAGATTACGATCTTCCAAAGCTGTAGTACGTTTGCCT 1440
consensus_11005#1      ------------------------------------------------------------
                                                                                   

consensus_11005#0      ACAACAATATTTCCAAATGCAAGATCACGTGCAACTTCATCAAATGTACGATTTTTAGTT 1500
consensus_11005#1      ------------------------------------------------------------
                                                                                   

consensus_11005#0      TCTGGCATAAACAGGAAAAAGAAGATCCAGCAAATCACAACGACCACAAGGAAGGGCAAA 1560
consensus_11005#1      ------------------------------------------------------------
                                                                                   

consensus_11005#0      AATGAATAACCACCGATGTTTTTCTGTATAACAGGATAACTACACAATACAATTAGATTG 1620
consensus_11005#1      ------------------------------------------------------------
                                                                                   

consensus_11005#0      GATAACCATTGAATTGATTGACTCAGTGAATAAGCTGCAGCACGTGGACCTTGTCTAAAT 1680
consensus_11005#1      ------------------------------------------------------------
                                                                                   

consensus_11005#0      ATTTCTGATACAATTAATGCAGGAACTGGACCCAAGCCAAGTGCAAAACTGCATATATAA 1740
consensus_11005#1      ------------------------------------------------------------
                                                                                   

consensus_11005#0      ATTAATATCAAAATGATCGATATTATACCCATAGCATTTTTCGTACTTTGCGGACCGGAA 1800
consensus_11005#1      ------------------------------------------------------------
                                                                                   

consensus_11005#0      TCTGCCAAATTAACAAATATCGTAAGTAATAACAAGGATAAAGCTAATGATACTGTAGGC 1860
consensus_11005#1      ------------------------------------------------------------
                                                                                   

consensus_11005#0      CATAATAATAATGTACGACGTCCAGCACGTTCGATTAGTGGGAGAGAGACAACAGTTACG 1920
consensus_11005#1      ------------------------------------------------------------
                                                                                   

consensus_11005#0      ATAACATTAAGAACTCCAATAGCAAAGACACAATATTGTAAGTACACATCAGGAATACCA 1980
consensus_11005#1      ------------------------------------------------------------
                                                                                   

consensus_11005#0      GCTAATTCTAGCATAAGAGATGAGTATGTTATAACCGCATTAATTCCAGATAATTGTTGT 2040
consensus_11005#1      ------------------------------------------------------------
                                                                                   

consensus_11005#0      AAAACTTGTATTAAACAAGCAATAAGCACTGGCATTCGAAGATCTCTTTGTGTAAATAAT 2100
consensus_11005#1      ------------------------------------------------------------
                                                                                   

consensus_11005#0      TGTGTAAATTTAAAAACTGGTTGATTTTTTGCAACTTCAATTTCCTCACGTAATTCACCA 2160
consensus_11005#1      ------------------------------------------------------------
                                                                                   

consensus_11005#0      ATAAATGTATCGACATTTTCTTTAACATTTAATTGCAAAAATGCTTTACGTGCCTCAGCT 2220
consensus_11005#1      ------------------------------------------------------------
                                                                                   

consensus_11005#0      TCTTTATGTTTTTTCATGTATAAAAATCGTGGACTTTCAGGACAAAACGGTAAAGTAACC 2280
consensus_11005#1      ----------GCCCGGTACCCTGGTTTTGGTGGAAATCACGACAAAACGGTAAAGTAACC 50
                                       *         * *  *    *** ********************

consensus_11005#0      AATGATATAGCTGCTGGAACGGCACCCAAAGCAACAGCAAGTGGCCATAGATTTAGTGTA 2340
consensus_11005#1      AATGATATAGCTGCTGGAACGGCACCCAAAGCAACAGCAAGTGGCCATAGATTTAGTGTA 110
                       ************************************************************

consensus_11005#0      TTCAACAGAAATGTAAATGTAATGAAATACGAGAAAGCAATACCAACAGTTACAGCTAAC 2400
consensus_11005#1      TTCAACAGAAATGTAAATGTAATGAAATACGAGAAAGCAATACCAACAGTTACAGCTAAC 170
                       ************************************************************

consensus_11005#0      TGATGACAAGCACCAATACCACCACGTAGATCACGTGGTGCCACTTCAGTTAAATAAAGT 2460
consensus_11005#1      TGATGACAAGCACCAATACCACCACGTAGATCACGTGGTGCCACTTCAGTTAAATAAAGT 230
                       ************************************************************

consensus_11005#0      GAAGCTATGCCAATTGTAATGCCGCTATTAATACCAATAACAAAACGACCAACATATAAT 2520
consensus_11005#1      GAAGCTATGCCAATTGTAATGCCGCTATTAATACCAATAACAAAACGACCAACATATAAT 290
                       ************************************************************

consensus_11005#0      AACGCAGGTTGTTTGACAAGAACACAAGGACCAACAATTACACCGCCGATAATGCCAATA 2580
consensus_11005#1      AACGCAGGTTGTTTGACAAGAACACAAGGACCAACAATTACACCGCCGATAATGCCAATA 350
                       ************************************************************

consensus_11005#0      ACATTATTGAGTATTAAACCATTCCGTCGACCAAGTCCATCAGCAACCCAACCACAACTG 2640
consensus_11005#1      ACATTATTGAGTATTAAACCATTCCGTCGACCAAGTCCATCAGCAACCCAACCACAACTG 410
                       ************************************************************

consensus_11005#0      AATGCTCCTATTGCAGCGGCAACTACAAATATTGTACTGACATGAGTGTAGAAGAAGCTT 2700
consensus_11005#1      AATGCTCCTATTGCAGCGGCAACTACAAATATTGTACTGACATGAGTGTAGAAGAAGCTC 470
                       *********************************************************** 

consensus_11005#0      GAATCTAATTCTGGAGTATTTGGAACAACTGTCTCATTGAAATATATTTCAATATTCCTT 2760
consensus_11005#1      GAATCTAATTCTGGAGTATTTGGAACAACTGTCTCATTGAAATATATTTCAATATTCCTT 530
                       ************************************************************

consensus_11005#0      CTTGGTAGATTCAAAACGCCAAGATTGTATCCGATTAGAAATGATGATCCAACACATGTT 2820
consensus_11005#1      CTTGGTAGATTCAAAACGCCAAGATTGTATCCGATTAGAAAT------------------ 572
                       ******************************************                  

consensus_11005#0      ATAAGTACAGTTAAGACAAGTTTCCCTGTGATACCGTTATTTGAAGCTACTCCCATCTTC 2880
consensus_11005#1      ------------------------------------------------------------
                                                                                   

consensus_11005#0      T 2881
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