cluster # 11052

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Schistosoma mansoni
cluster # 11052 cluster # 11052 Sequences # 30 consensus # 3

see consensus multiple alignment with clustalw

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consensus_11052#0 length = 1763 sequences # 27

consensus_11052#1 length = 737 sequences # 2
consensus_11052#2 length = 337 sequences # 1

consensusID : consensus_11052#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 27
consensus length = 1763
fasta sequence

                              [GTAGTCTAAATATTGGCAAAATGATAGTCTCCGTTGGCTTAGTGTCATTAATTCTTGCTGTAGTGAATGCCAGAATTGATTGTGGAAGCAGTGTGAAACTTGAAGTTGACTTTGATAACGTCCATTCGCATGGAATATCTTATAGAAAAGCAACCGTCAAGAAAACTAACCCAGTAAATTTAGTTTTTAATGTGATTGGTGAACGAAGGCCGATAGAAATCGAATCAATTGATTGGACGTACAATAATGTATCAATCAATATTGGTGACAATGATATTCAAGATATATATTATTCAACTGAGAAAACTAGCTCTGGTCTCACTGTTACATTGCATATCAAAGTGCCAACCTCCCGTGTTGCTGGGACCTGGATTCTTACAATAAATGCAAAGGATAATTCTAAACATGTTGGTTTTTGTTATGTTTCGTGTCAACCTGTAATTCGCTCGAGATTTGGGGCTGTTCGTGGTCACGAAGGCAATCCACTATCTGTTCTCTGTGAAGTTGATGGTTTCCCAGAGCCAAATCAGGTTG-TTTGGAAACGTGTAGTTGAAAATGAAGCTGATCCAACTCAAAGCCGACTAGTTCCTGTACGCAATACTGTGTTCAAACCTCATGAGAGCACTAAAGATGCCATCATGGAATGGAATGATGCTTCAGATTCTAC-TGGATTTTATCTGTGCACAGCAACATCACCATTAGGATCAGACAGTTTATTGTTCGAAGTTCGTATTAAAAGCAAATTGGCTCCTTTGTGGCCTTTCATTGGAATTATAGCTGAATTGGTGGTACTTGGTATTATAATATTGATCTATGAACGTACTCAAGCTAAACGTCGTCGTGAAGAAGAACGGACTACATTGTTAAAGCAAAATCCAACAAGTGATCGATGTTAAACAAATACGCTAATTGCTTGTGACTGAATAATCGTATCTGCGTTTGTTCACCTCATACCCTATTTTGTGGTATTCAGCGTCAGTAATAGTCTCATTTCAGTATTGTTTTCTCTTTCAGCAATAAAACTTATTTGTTTGTTTGTTTGTTTGCTTTATATATATCTCTTCCTTATCAAATGGCATGTATTTGTGTATGTGTGTGTGTGTATGCAAGTATAGAAGCGCTCACGTTTGTATCTATGCCGTTTTTTTGGCATTGTTACTTAAGTATTCTCACATTTAGATTAGCAAGAGTATTAGCGCATTTGTACACCAACTGCTATGATTAATAAT--ATAATAAAGGACATGAATATTTGCTTTTATTTTCATATATCACTTGATTTCATATTCTGGCTAACACTTACAGTAAAAAGGCCTTGTACTCTTCTTATTCTATGCTTACTATTTTATCCTTAATTATAATCATTACTGCCGTTTTCTGTTCTACATTACTTATTTCTATGTTTACATTAAAACCTCTTTATCCATTGTGTTTTAATGATCATTTACACTTCCCTAGCAACAAAAAGGAACTATGGTTTGTATGTGTTGAATATAGTTAACATTTGAATACTACACATATAAATCTCCATAGGTGTCATGGGGGTATACACCTTATGTAATCATCCATGTTTGTTTGTTTGTTTGTTTTTATTATCGAGTTACATCATTATTTTACCCTTTAAATGTACAATTTTAATTTGCATCTTTATTATTATTATCTGCTCTAATATTTCATCCATTGTGACTGATCCTCCTTTAGAAGGATCTTCCTGATTCTCCTTTAGAATAGCTTTATTTTACAATTTGAATGATAAATAAATTATA]

[+] EMBL AI977159             [GTAGTCTAAATATTGGCAAAATGATAGTCTCCGTTGGCTTAGTGTCATTAATTCTTGCTGTAGTGAATGCCAGAATTGATTGTGGAAGCAGTGTGAAACTTGAAGTTGACTTTGATAACGTCCATTCGCATGGAATATCTTATAGAAAAGCAACCGTCAAGAAAACTAACCCAGTAAATTTAGTTTTTAATGTGATTGGTGAACGAAGGCCGATAGAAATCGAATCAATTGATTGGACGTACAATAATGTATCAATCAATATTGGTGACAATGATATTCAAGATATATATTATTCAACTGAGAAAACTAGCTCTGGTCTCACTGTTACATTGCATATCAAAGTGCCAACCTCCCGTGTTGCTGGGACCTGGATTCTTACAATAAATGCAAAGGATAATTCTAAACATGTTGGTTTTTGTTATGTTTCGTGTCAACCTGTAATTCGCTCGAGATTTGGGGCTGTTCGTGGTCACGAAGGCAATCCACTATCTGTTCTCTGTGAAGTTGATGGTTTCCCAGAGCCAAATCAGGTTGTTTTGGAAACGTGTAGT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                ]
[+] EMBL AW017178             [GTAGTCTAAATATTGGCAAAATGATAGTCTCCGTTGGCTTAGTGTCATTAATTCTTGCTGTAGTGAATGCCAGAATTGATTGTGGAAGCAGTGTGAAACTTGAAGTTGACTTTGATAACGTCCATTCGCATGGAATATCTTATAGAAAAGCAACCGTCAAGAAAACTAACCCAGTAAATTTAGTTTTTAATGTGATTGGTGAACGAAGGCCGATAGAAATCGAATCAATTGATTGGACGTACAATAATGTATCAATCAATATTGGTGACAATGATATTCAAGATATATATTATTCAACTGAGAAAACTAGCTCTGGTCTCACTGTTACATTGCATATCAAAGTGCCAACCTCCCGTGTTGCTGGGACCTGGATTCTTACAATAAATGCAAAGGATAATTCTAAACATGTTGGTTTTTGTTATGTTTCGTGTCAACCTGTAATTCGCTCGAGATTTGGGGCTGTTCGTGGTCACGAAGGCAATCCACTATCTGTTCTCTGTGAAGTTGATGGTTTCCCAGAGCCAAATCAAGTTG TTTGGAAACGTGTAGTTGAAAATGAAGCTGATCCAACTCAAAGCCGACTAGTTCCTGTACGCAATACTGTGTTCAAACCTCATGAGAGCACTAAAGATGCCTTCATGGAATGG                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               ]
[+] EMBL AI976914             [                                                       TGCTGTAGTGAATGCCAGAATTGATTGTGGAAGCAGTGTGAAACTTGAAGTTGACTTTGATAACGTCCATTCGCATGGAATATCTTATAGAAAAGCAACCGTCAAGAAAACTAACCCAGTAAATTTAGTTTTTAATGTGATTGGTGAACGAAGGCCGATAGAAATCGAATCAATTGATTGGACGTACAATAATGTATCAATCAATATTGGTGACAATGATATTCAAGATATATATTATTCAACTGAGAAAACTAGCTCTGGTCTCACTGTTACATTGCATATCAAAGTGCCAACCTCCCGTGTTGCTGGGACCTGGATTCTTACAATAAATGCAAAGGATAATTCTAAACATGTTGGTTTTTGTTATGTTTCGTGTCAACCTGTAATTCGCTCGAGATTTGGGGCTGTTCGTGGTCACGAACGCAATCCACTATCTGTTCTCTGTGAAGTTGA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           ]
[+] EMBL AI977432             [                                                               TGAATGCCAGAATTGATTGTGGAAGCAGTGTGAAACTTGAAGTTGACTTTGATAACGTCCATTCGCATGGAATATCTTATAGAAAAGCAACCGTCAAGAAAACTAACCCAGTAAATTTAGTTTTTAATGTGATTGGTGAACGAAGGCCGATAGAAATCGAATCAATTGATTGGACGTACAATAATGTATCAATCAATATTGGTGACAATGATATTCAAGATATATATTATTCAACTGAGAAAACTAGCTCTGGTCTCACTGTTACATTGCATATCAAAGTGCCAACCTCCCGTGTTGCTGGGACCTGGATTCTTACAATAAATGCAAAGGATAATTCTAAACATGTTGGTTTTTGTTATGTTTCGTGTCAACCTGTAATTCGCTCGAGATTTGGGGCTGTTCGTGGTCACGAAGGCAATCCACTATCTGTTCTCTGTGAAGTTGATGGTTTCCCAGAGCCAAATCA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      ]
[+] EMBL CD194953             [                                                                                                       AGTTGACTTTGATAACGTCCATTCGCATGGAATATCTTATAGAAAAGCAACCGTCAAGAAAACTAACCCAGTAAATTTAGTTTTTAATGTGATTGGTGAACGAAGGCCGATAGAAATCGAATCAATTGATTGGACGTACAATAATGTATCAATCAATATTGGTGACAATGATATTCAAGATATATATTATTCAACTGAGAAAACTAGCTCTGGTCTCACTGTTACATTGCATATCAAAGTGCCAACCTCCCGTGTTGCTGGGACCTGGATTCTTACAATAAATGCAAAGGATAATTCTAAACATGTTGGTTTTTGTTATGTTTCGTGTCAACCTGTGATTCGCTCGAGATTTGGGGCTGTTCGTGGTCACGAAGGCAATCCACTATCTGTTCTCTGTGAAGTTGATGGTTTCCCAGAGCCAAATCAGGTTG TTTGGAAACGTGTAGTTGAAAATGA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       ]
[+] EMBL CD195706             [                                                                                                                                                                                                                                            ACGTACAATAATGTATCAATCAATATTGGTGACAATGATATTCAAGATATATATTATTCAACTGAGAAAACTAGCTCTGGTCTCACTGTTACATTGCATATCAAAGTGCCAACCTCCCGTGTTGCTGGGACCTGGATTCTTACAATAAATGCAAAGGATAATTCTAAACATGTTGGTTTTTGTTATGTTTCGTGTCAACCTGTAATTCGCTCGAGATTTGGGGCTGTTCGTGGTCACGAAGGC ATCCACTATCTGTT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         ]
[+] EMBL CD118690             [                                                                                                                                                                                                                                                                                               TATTATTCAACTGAGAAAACTAGCTCTGGTCTCACTGTTACATTGCATATCAAAGTGCCAACCTCCCGTGTTGCTGGGACCTGGATTCTTACAGTAAATGCAAAGGATAATTCTAAACATGTTGGTTTTTGTTATGTTTCGTGTCAACCTGTAATTCGCTCGAGATTTGGGGCTGTTCGTGGTCACGAAGGCAATCCACTATCTGTTCTCTGTGAAGTTGATGGTTTCCCAGAGCCAAATCAGGTTG TTTGGAAACGTGTAGTTGAAAATGAAGCTGATCCAACTCAAAGCCGACTAGTTCCTGTACGCAATACTGTGTTCAAACCTCATGAGAGCACTAAAGATGCCATCATGGAATGGAATGATGCTTCAGATTCTAC TGGATTTTATCTGTGCACAGCAACATCACCATTAGGATCAGACAGTTTATT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       ]
[-] EMBL CD118541             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                ATTATTCAACTGAGAAAACTAGCTCTGGTCTCACTGTTACATTGCATATCAAAGTGCCAACCTCCCGTGTTGCTGGGACCTGGATTCTTACAATAAATGCAAAGGATAATTCTAAACATGTTGGTTTTTGTTATGTTTCGTGTCAACCTGTAATTCGCTCGAGATTTGGGGCTGTTCGTGGTCACGAAGGCAATCCACTATCTGTTCTCTGTGAAGTTGATGGTTTCCCAGAGCCAAATCAGGTTG TTTGGAAACGTGTAGTTGAAAATGAAGCTGATCCAACTCAAAGCTGACTAGTTCCTGTACGCAATACTGTGTTCAAACCTCATGAGAGCACTAAAGATGCCATCATGGAATGGAATGATGCTTCAGATTCTAC TGGATTTTATCTGTGCACAGCAACATCACCATTAGGATCAGACAGTTTATTG                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      ]
[+] EMBL SM132                [                                                                                                                                                                                                                                                                                                           GAG AAACTAGCTCTGGTCTCACTGTTACATTGCATATCAAAGTGCCAACCTCCCGTGTTGCTGGGACCTGGATTCTTACAATAAATGCAAAGGATAATTCTAAACATGTTGGTTTTTGTTATGTTTCGTGTCAACCTGTAATTCGCTCGAGATTTGGGGCTGTTCGTGGTCACGGAGGCAATCCACTATCTGTTCTCTGTGAAGTTGATGGTTTCCCAGAGCCAAATCAGGTTG TTTGGAAACGTGTAGTTGAAAATGAGGCTGANCCAACTCAAAGCCGACTAGTTCCTGTACGCAATACTGTGTTCAAACCTCATGAG                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          ]
[+] EMBL CD147920             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    GTTGCTGGGACCTGGATTCTTACAATAAATGCAAAGGATAATTCTAAACATGTTGGTTTTTGTTATGTTTCGTGTCAACCTGTAATTCGCTCGAGATTTGGGGCTGTTCGTGGTCACGAAGGCAATCCACTATCTGTTCTCTGTGAAGTTGATGGTTTCCCAGAGCCAAATCAGGTTG TTTGGAAACGTGTAGTTGAAAATGAAGCTGATCCAACTCAAAGCCGACTAGTTCCTGTACGCAATACTGTGTTCAAACCTCATGAGAGCACTAAAGATGCCATCATGGAATGGAATGATGCTTCAGATTCTAC TGGATTTTATCTGTGCACAGCAACATCACCATTAGGATCAGACAGTTTATTGTTCGAAGTTCGTATTAAAAGCAAATT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            ]
[+] EMBL CD135738             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          CAATAAATGCAAAGGATAATTCTAAACATGTTGGTTTTTGTTATGTTTCGTGTCAACCTGTAATTCGCTCGAGATTTGGGGCTGTTCGTGGTCACGAAGGCAATCCACTATCTGTTCTCTGTGAAGTTGATGGTTTCCCAGAGCCAAATCAGGTTG TTTGGAAACGTGTAGTTGAAAATGAAGCTGATCCAACTCATAGCCGACTAGTTCCTGTACGCAATACTGTGTTCAAACCTCATGAGAGCACTAAAGATGCCATCATGGAATGGAATGATGCTTCAGATTCTAC                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           ]
[-] EMBL CD115983             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           AATAAATGCAAAGGATAATTCTAAACATGTTGGTTTTTGTTATGTTTCGTGTCAACCTGTAATTCGCTCGAGATTTGGGGCTGTTCGTGGTCACGAAGGCAATCCACTATCTGTTCTCTGTGAAGTTGATGGTTTCCCAGAGCCAAATCAGGTTG TTTGGAAACGTGTAGTTGAGAATGAAGCTGATCCAACTCAAAGCCGACTAGTTCCTGTACGCAATACTGTGTTCAAACCTCATGAGAGCACTAAAGATGCCATCATGGAATGGAATGATGCTTCAGATTCTAC TG                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        ]
[-] EMBL CD178094             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                GTGTAGTTGAAAATGAAGCTGATCCAACTCAAAGCCGACTAGTTCCTGTACGCAATACTGTGTTCAAACCTCATGAGAGCACTAAAGATGCCATCATGGAATGGAATGATGCTTCAGATTCTAC TGGATTTTATCTGTGCACAGCAACATCACCATTAGGATCAGACAGTTTATTGTTCGAAGTTCGTATTAAAAGCAAATTGGCTCCTTTGTGGCCTTTCATTGGAATTATAGCTGAATTGGTGGTACTTGGTATTATAATATTGATCTATGAACGTACTCAAGCTAAACGTCGTCGTGAAGAAGAACGGACTACATTGTTAAAGCAAAATCCAACAAGTGATCGATGTTAAACAAATACGCTAATTGCTTGTGACTGAATAATCGTATCTGCGTTTGTTCACCTCATACCCTATTTTGTGGTATTCAGCGTCAGTAATAGTCTCATTTCAGTATTGTTTTCTCTTTCAGCAATAAAACTTATTTGTTTGTTTGTTTGTTTGCTTT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           ]
[+] EMBL CD069687             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               AAGCCGACTAGTTCCTGTACGCAATACTGTGTTCAAACCTCATGAGAGCACTAAAGATGCCATCATGGAATGGAATGATGCTTCAGATTCTAC TGGATTTTATCTGTGCACAGCAACATCACCATTAGGATCAGACAGTTTATTGTTCGAAGTTCGTATTAAAAGCAAATTGGCTCCTTTGTGGCCTTTCATTGGAATTATAGCTGAATTGGTGGTACTTGGTATTATAATATTGATCTATGAACGTACTCAAGCTAAACGTCGTCGTGAAGAAGAACGGACTACATTGTTAAAGCAAAATCCAACAAGTGATCGATGTTAAACAAATACGCTAATTGCTTGTGACTGAATAATCGTATCTGCGTTTGTTCACCTCATACCCTATTTTGTG                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                ]
[-] EMBL CD069697             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                AGCCGACTAGTTCCTGTACGCAATACTGTGTTCAAACCTCATGAGAGCACTAAAGATGCCATCATGGAATGGAATGATGCTTCAGATTCTAC TGGATTTTATCTGTGCACAGCAACATCACCATTAGGATCAGACAGTTTATTGTTCGAAGTTCGTATTAAAAGCAAATTGGCTCCTTTGTGGCCTTTCATTGGAATTATAGCTGAATTGGTGGTACTTGGTATTATAATATTGATCTATGAACGTACTCAAGCTAAACGTCGTCGTGAAGAAGAACGGACTACATTGTTAAAGCAAAATCCAACAAGTGATCGATGTTAAACAAATACGCTAATTGCTTGTGACTGAATAATCGTATCTGCGTTTGTTCACCTCATACCCTATTTTGTGG                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               ]
[-] EMBL CD069675             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                AGCCGACTAGTTCCTGTACGCAATACTGTGTTCAAACCTCATGAGAGCACTAAAGATGCCATCATGGAATGGAATGATGCTTCAGATTCTAC TGGATTTTATCTGTGCACAGCAACATCACCATTAGGATCAGACAGTTTATTGTTCGAAGTTCGTATTAAAAGCAAATTGGCTCCTTTGTGGCCTTTCATTGGAATTATAGCTGAATTGGTGGTACTTGGTATTATAATATTGATCTATGAACGTACTCAAGCTAAACGTCGTCGTGAAGAAAAACGGACTACATTGTTAAAGCAAAATCCAACAAGTGATCGATGTTAAACAAATACGCTAATTGCTTGTGACTGAATAATCGTATCTGCGTTTGTTCACCTCATACCCTATT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     ]
[+] EMBL CD069406             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  tAATGGAATGATGCTTCAGATTCTACGTGGATTTTATCTGTGCACAGCAACATCACCATTAGGATCAGACAGTTTATTGTTCGAAGTTCGTATTAAAGGCAAATTGGCTCCTTTGTGGCCTTTCATTGGAATTATAGCTGAATTGGTGGTACTTGGTATTATAATATTGATCTATGAACGTACTCAAGCTAAACGTCGTCGTGAAGAAGAACGGACTACATTGTTAAAGCAAAATCCAACAAGTGATCGATGTTAAACAAATACGCTAATTGCTTGTGACTGAATAATCGTATCTGCGTTTGTTCACCTCATACCCTATTTGGTGGTATTCAGCGTCAGTAATGGTCTCATTTCAGTATTGTTTTCTCTTTCAGCAATAAAACTTATTTGTATGTTAGTAAGTAGGCTTTATATATATCTCTTCCTT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          ]
[+] EMBL CD082916             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          TGATGCTTCAGATTCTAC TGGATTTTATCTGTGCACAGCAACATCACCATTAGGATCAGACAGTTTATTGTTCGAAGTTCGTATTAAAAGCAAATTGGCTCCTTTGTGGCCTTTCATTGGAATTATAGCTGAATTGGTGGTACTTGGTATTATAATATTGATCTATGAACGTACTCAAGCTAAACGTCGTCGTGAAGAAGAACGGACTACATTGTTAAAGCAAAATCCAACAAGTGATCGATGTTAAACAAATACGCTAATTGCTTGTGACTGAATAATCGTATCTGCGTTTGTTCACCTCATACCCTATTTTGTGGTATTTAGCGTCAGTAATAGTCTCATTTCAGTATTGTTTTCTCTTTCAGCAATAAAACTTATTTGTTTGTTTGTTTGTTTGCTTTATATATATCTCTTCCTTATCAAATGGCATGTATTTGTGTATGTGTGTGTGTGTATGCAAGTATAGAAGCGCTCACGTTTGTATCTATGCCGTTTTTTTGGCATTGTTACTTAAGTATTCTCACATTTAGATTAGCAAGAGTATTAGCGCATTTGTACACCAACTGCTATGATTAATAATNNAT ATAAgg                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             ]
[-] EMBL CD192288             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  TCAGACAGTTTATTGTTCGAAGTTCGTATTAAAAGCAAATTGGCTCCTTTGTGGCCTTTCATTGGGATTATAGCTGAATTGGTGGTACTTGGTATTATAATATTGATCTATGAACGTACTCAAGCTAAACGTCGTCGTGAAGAAGAACGGACTACATTGTTAAAGCAAAATCCAA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      ]
[+] EMBL CD080655             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  TCGAAGTTCGTATTAAAAGCAAATTGGCTCCTTTGTGGCCTTTCATTGGAATTATAGCTGAATTGGTGGTACTTGGTATTATAATATTGATCTATGAACGTACTCAAGCTAAACGTCGTCGTGAAGAAGAACGGACTACATTGTTAAAGCAAAATCCAACAAGTGATCGATGTTAAACAAATACGCTAATTGCTTGTGACTGAATAATCGTATCTGCGTTTGTTCACCTCATACCCTATTTTGTGGTATTCAGCGTCAGTAATAGTCTCATTTCAGTATTGTTTTCTCTTTCAGCAATAAAACTTATTTGTTTGTTTGTTTGTTTGCTTTATATATATCTCTTCCTTATCAAATGGCATGTATTTGTGTATGTGTGTGTGTGTATGCAAGTATAGAAGCGCTCACGTTTGTATCTATGCCGTTTTTTTGGCATTGTTACTTAAGTATTCTCACATTTAGATTAGCAAGAGTATTAGCGCATTTGTACACCAACTGCTATGATTAATAAT  ATAATAAAGGACATGAATATTTGCTTTTATTTTCATATATCACTTGATTTCATATTCTGGCTAACACTTACAGTAAAAAGGCCTTGTACTCTTCTTATTCTATGCTTACTATTTTATCCTTAATTATAATCATTACTGCCGTTNTCTGTTCTACATTACTTATTTCTATGTTTACATTAAAACCTCTn                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          ]
[-] EMBL CD186199             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    tATATTGATCTATGAACGTACTCAAGCTAAACGTCGTCGT AAGAAGAACGGACTACA TGTTAAAGCAAAATCCAACAAGTGATCGATGTTAAACAAATACGCTAATTGCTTGTGACTGAATAATCGTATCTGCGTTTGTTCACCTCATACCCTATTNTGTGGTATTCAGCGTCAGTAATAGTCTCATTTCAGTATTGTTTTCTCTTTCAGCAATAAAACTTATTTGTTTGTTTGTTTGTTTGCTTTATATATATCTCTTCCTTATCAAATGGCATGTATTTGTGTATGTGTGTGTGTGTATGCAAGTATAGAAGCGCTCACGTTTGTATCTATGCCGTTTTTTTGGCATTGTTACTTAAGTATTCTCACATTTAGATTAGCAGGAGTATTAGCGCATTTGTACACCAACTGCTATGATTAATAAT  ATAATAAAGGACATGAATATTTGCTTTTATTTTCATATATCACTTGATTTCATATTCTGGCTAACACTTACAGTAAAAAGGCCTTGTACTCTTCTTATTCTATGCTTA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          ]
[-] EMBL CD075147             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       GCTTTATA ATATCTCTTCCTANTCAAATGGCATGTATTTGTGTATGTGTGTGTGTGTATGCAAGTATAGAAGCGCTCACGTTTGTATCTATGCCGTTTTTTTGGCATTGTTACTTAAGTATTCTCACATTTAGATTAGCAAGAGTATTAGCGCATTTGTACACCAACTGCTATGATTAATAAT  ATAATAAAGGACATGAATATTTGCTTTTATTTTCATATATCACTTGATTTCATATTCTGGCTAACACTTACAGTAAAAAGGCCTTGTACTCTTCTTATTCTATGCTTACTATTTTATCCTTAATTATAATCATTACTGCCGTTTTCTGTTCTACATTACTTATTTCTATGTTTACATTAAAACCTCTTTATCCATTGTGTTTTAATGATCATTTACACTTCCCTAGCAACAAAAAGGAACTATGGTTTGTATGTGTTGAATATAGTTAACATTTGAATACTACACATATAAATCTCCATAGGTGTCATGGGGGTATACACCTTATGTAATCATCCATGTTTGTTTGTTTGTTTGTTTTTATTATCGAGTTACATCATTATTTTACCCTTTAAATGTAa                                                                                                                                        ]
[-] EMBL CD074571             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    CAAGTATAGAAGCGCTCACGTTTGTATCTATGCCGTTTTTTTGGCATTGTTACTTAAGTATTCTCACATTTAGATTAGCAAGAGTATTAGCGCATTTGTACACCAACTGCTATGATTAATAAT  ATAATAAAGGACATGAATATTTGCTTTTATTTTCATATATCACTTGATTTCATATTCTGGCTAACACTTACAGTAAAAAGGCCTTGTACTCTTCTTATTCTATGCTTACTATTTTATCCTTAATTATAATCATTACTGCCGTTTTCTGTTCTACATTACTTATTTCTATGTTTACATTAAAACCTCTTTATCCATTGTGTTTTAATGATCATTTACACTTCCCTAGCAACAAAAAGGAACTATGGTTTGTATGTGTTGAATATAGTTAACATTTGAATACTACACATATAAATCTCCATAGGTGTCATGGGGGTATACACCTTATGTAATCATCCATGTTTGTTTGTTTGTTTGTTTTTATTATCGAGTTACATCATTATTTTACCCTTTAAATGTACAATTTTAATTTGCATCTTTATTATTATTATCTGCTCTAATATTTCATCCATTGTGACTGATCCTCCTTTAGAAGGATCTTCCTGATTCTCCTTTAGAATAGGTTTATTTTACAATTTGAAAAATAAATAAATTATA]
[-] EMBL CD077021             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              TATTCTCACATTTAGATTAGCAAGAGTATTAGCGCATTTGTACACCAACTGCTATGATTAATAAT  ATAATAAAGGACATGAATATTTGCTTTTATTTTCATATATCACTTGATTTCATATTCTGGCTAACACTCACAGTAAAAAGGCCTTGTACTCTTCTTATTCTATGCTTACTATTTTATCCTTAATTATAATCATTACTGCCGTTTTCTGTTATACATTACTTATTTCTATGTTTACATTAAAACCTCTTCATCCATTGTGTTTTAATGATCATTTACACTTCCCTAGCAACAAAAAGGAACTATGGTTTGTATGTGTTGAATATAGTTAACATTTGAATACTACACATATAAATCTCCATAGGTGTCATGGGGGTATACACCTTATGTAATCATCCATGTTTGTTTGTTTGTTTGTTTTTATTATCGAGTTACATCATTATTTTACCCTTTAAATGTACAATTTTAATTTGCATCTTTATTATTATTATCTGCTCTAATATTTCATCCATTGTGACTGATCCTCCTTTAGAAGGATCTTCCTGATTCTCCTTTAGAATAGCTTTATTTTACAATTTGAATGATAAATGAATTATA]
[-] EMBL CD076499             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            GATTAGCAAGAGTATTAGCGCATTTGTACACCAACTGCTATGATTAATAAT  ATAATAAAGGACATGAATATTTGCTTTTATTTTCATATATCACTTGATTTCATATTCTGGCTAACACTTACAGTAAAAAGGCCTTGTACTCTTCTTATTCTATGCTTACTATTTTATCCTTAATTATAATCATTACTGCCGTTTTCTGTTCTACATTACTTATTTCTATGTTTACATTAAAACCTCTTTATCCATTGTGTTTTAATGATCATTTACACTTCCCTAGCAACAAAAAGGAACTATGGTTTGTATGTGTTGAATATAGTTAACATTTGAATACTACACATATAAATCTCCATAGGTGTCATGGGGGTATACCCCTTATGTAATCATCCATGTTTGTTTGTTTGTTTGTTTTTATTATCGAGTTACATCATTATTTTACCCTTTAAATGTACAATTTTAATTTGCATCTTTATTATTATTATCTGCTCTAATATTTCATCCATTGTGACTGATCCTCCTTTAGAAGGATCTTCCTGATTCTCCTTTAGAATAGCTTTATTTTACAATTTGAATGATAAATAAATTATA]
[-] EMBL SMAA25665            [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      TGC TTTA TNTCATATATCACTTGA TTCATA TCTGGCTAACAC TACAGTAAAAAGGCCTTGTAC CCNCCTATCCTATGCCTACTAGTTTATCCTTAATTATAATCATTACTGCCGTTTTCTGTRCTACATTACTTATTCCTATGTTTACATTAAAACCTCTTTATCCATTGTGTTTTAATGATCATTTACACTTCCCTAGCAACAAAAAGGAACTATGGTTTGTATGTGTTGAATATAGTTAACATTTGAATACTACACATATAAATCNCCATAGGTGTCATGGGGGTATACACCTTATGTAATCATCCATGTTTGTTTGTTTGTTTGTTTTTATTATCGAGTTACATCATTATTTTACCCTTTAAATGTACAATTTTAATTTGCATCTTTATTATTATTATCTGCTCTAATATTTCATCCATTGTGACTGATCCTCCTTTAGAAGGATCTTCCTGATTCTCCTTTAGAATAGCTTTATTTTACAATTTGAATGATAAATAAATTATA]
[+] EMBL AI444545             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     TGTACTCTTCTTATTCTATGCTTACTATTTTATCCTTAATTATAATCATTACTGCCGTTTTCTGTTCTACATTACTTATTTCTATGTTTACATTAAAACCTCTTTATCCATTGTGTTTTAATGATCATTTACACTTCCCTAGCAACAAAAAGGAACTATGGTTTGTATGTGTTGAATATAGTTAACATTTGAATACTACACATATAAATCTCCATAGGTGTCATGGGGGTATACACCTTATGTAATCATCCATGTTTGTTTGTTTGTTTGTTTTTATTATCGAGTTACATCATTATTTTACCCTTTAAATGTACAATTTTAATTTGCATCTTTATTATTATTATCTGCGCTAATATTTCATCCATTGTGACTGATCCTCCTTTAGAGGGATCTTCCTGATTCTCCTTTAGAATAGCTTTATTTTACAATTTGGATGAT AATAAAT    ]




>consensus_11052#0
GTAGTCTAAATATTGGCAAAATGATAGTCTCCGTTGGCTTAGTGTCATTAATTCTTGCTG
TAGTGAATGCCAGAATTGATTGTGGAAGCAGTGTGAAACTTGAAGTTGACTTTGATAACG
TCCATTCGCATGGAATATCTTATAGAAAAGCAACCGTCAAGAAAACTAACCCAGTAAATT
TAGTTTTTAATGTGATTGGTGAACGAAGGCCGATAGAAATCGAATCAATTGATTGGACGT
ACAATAATGTATCAATCAATATTGGTGACAATGATATTCAAGATATATATTATTCAACTG
AGAAAACTAGCTCTGGTCTCACTGTTACATTGCATATCAAAGTGCCAACCTCCCGTGTTG
CTGGGACCTGGATTCTTACAATAAATGCAAAGGATAATTCTAAACATGTTGGTTTTTGTT
ATGTTTCGTGTCAACCTGTAATTCGCTCGAGATTTGGGGCTGTTCGTGGTCACGAAGGCA
ATCCACTATCTGTTCTCTGTGAAGTTGATGGTTTCCCAGAGCCAAATCAGGTTGTTTGGA
AACGTGTAGTTGAAAATGAAGCTGATCCAACTCAAAGCCGACTAGTTCCTGTACGCAATA
CTGTGTTCAAACCTCATGAGAGCACTAAAGATGCCATCATGGAATGGAATGATGCTTCAG
ATTCTACTGGATTTTATCTGTGCACAGCAACATCACCATTAGGATCAGACAGTTTATTGT
TCGAAGTTCGTATTAAAAGCAAATTGGCTCCTTTGTGGCCTTTCATTGGAATTATAGCTG
AATTGGTGGTACTTGGTATTATAATATTGATCTATGAACGTACTCAAGCTAAACGTCGTC
GTGAAGAAGAACGGACTACATTGTTAAAGCAAAATCCAACAAGTGATCGATGTTAAACAA
ATACGCTAATTGCTTGTGACTGAATAATCGTATCTGCGTTTGTTCACCTCATACCCTATT
TTGTGGTATTCAGCGTCAGTAATAGTCTCATTTCAGTATTGTTTTCTCTTTCAGCAATAA
AACTTATTTGTTTGTTTGTTTGTTTGCTTTATATATATCTCTTCCTTATCAAATGGCATG
TATTTGTGTATGTGTGTGTGTGTATGCAAGTATAGAAGCGCTCACGTTTGTATCTATGCC
GTTTTTTTGGCATTGTTACTTAAGTATTCTCACATTTAGATTAGCAAGAGTATTAGCGCA
TTTGTACACCAACTGCTATGATTAATAATATAATAAAGGACATGAATATTTGCTTTTATT
TTCATATATCACTTGATTTCATATTCTGGCTAACACTTACAGTAAAAAGGCCTTGTACTC
TTCTTATTCTATGCTTACTATTTTATCCTTAATTATAATCATTACTGCCGTTTTCTGTTC
TACATTACTTATTTCTATGTTTACATTAAAACCTCTTTATCCATTGTGTTTTAATGATCA
TTTACACTTCCCTAGCAACAAAAAGGAACTATGGTTTGTATGTGTTGAATATAGTTAACA
TTTGAATACTACACATATAAATCTCCATAGGTGTCATGGGGGTATACACCTTATGTAATC
ATCCATGTTTGTTTGTTTGTTTGTTTTTATTATCGAGTTACATCATTATTTTACCCTTTA
AATGTACAATTTTAATTTGCATCTTTATTATTATTATCTGCTCTAATATTTCATCCATTG
TGACTGATCCTCCTTTAGAAGGATCTTCCTGATTCTCCTTTAGAATAGCTTTATTTTACA
ATTTGAATGATAAATAAATTATA

consensusID : consensus_11052#1
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 2
consensus length = 737
fasta sequence

                              [GGCACGAGGAAAATACGCTAATTGCTTGTGACTGAATAATCGTTTCTGCGTTTGTTCACCTCATACCCTATTTTGTGGTATTCAGCGTCAGTAATAGTCTCATTTCAGTATTGTTTTCTCTTTCAGCAATAAAACTTATTTGTTTGTTTGTTTGTTTGCTTTATATATATCTCTTCCTTATCAAATGGCATGTATTTGTGTATGTGTGTGTGTGTATGCAAGTATAGAAGCGCTCACGTTTGTATCTATGCCGTTTTTTTGGCATTGTTACTTAAGTATTCTCACATTTAGATTAGCAAGAGTATTAGCGCATTTGTACACCAACTGCTATGATTAATAATATAATAAAGGACATGAATATTTGCTTTTATTTTCATATATCACTTGATTTCATATTCTGGCTAACACTTACAGTAAAAAGGCCTTGTACTCTTCTTATTCTATGCTTACTATTTTATCCTTAATTATAATCATTACTGCCGTTTTCTGTTCTACATTACTTATTTCTATGTTTACATTAAAACCTCTTTATCCATTGTGTTTTAATGATCATTTACACTTCCCTAGCAACAAAAAGGAACTATGGTTTGTATGTGTTGAATATAGTTAACATTTGAATACTACACATATAAATCTCCATAGGTGTCATGGGGGTATACACCTTATGTAATCATCCATGCTTGTTNGTTTGTTTGTTTTTATTATCGAGTTACATCATTATTTTACCCTTTAAATGT]

[+] EMBL CD081315             [GGCACGAGGAAAATACGCTAATTGCTTGTGACTGAATAATCGTTTCTGCGTTTGTTCACCTCATACCCTATTTTGTGGTATTCAGCGTCAGTAATAGTCTCATTTCAGTATTGTTTTCTCTTTCAGCAATAAAACTTATTTGTTTGTTTGTTTGTTTGCTTTATATATATCTCTTCCTTATCAAATGGCATGTATTTGTGTATGTGTGTGTGTGTATGCAAGTATAGAAGCGCTCACGTTTGTATCTATGCCGTTTTTTTGGCATTGTTACTTAAGTATTCTCACATTTAGATTAGCAAGAGTATTAGCGCATTTGTACACCAACTGCTATGATTAATAATATAATAAAGGACATGAATATTTGCTTTTATTTTCATATATCACTTGATTTCATATTCTGGCTAACACTTACAGTAAAAAGGCCTTGTACTCTTCTTATTCTATGCTTACTATTTTATCCTTAATTATAATCATTACTGCCGTTTTCTGTTCTACATTACTTATTTCTATGTTTACATTAAAACCTCTTTATCCATTGTGTTTTAATGATCATTTACACTTCCCTAGCAACAAAAAGGAACTATGGTTTGTATGTGTTGAATATAGTTAACATTTGAATACTACACATATAAATCTCCATAGGTGTCATGGGGGTATACACCTTATGTAATCATCCATGCTTGTTNGTTTGTTTGTTTTTATTATCGAGTTACATCATTATTTTACCCTTTAAATGT]
[+] EMBL BE505098             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                TCCCTAGCAACAAAAAGGAACTATGGTTTGTATGTGTTGAATATAGTTAACATTTGAATACTACACATATAAATCTCCATAGGTGTCATGGGGGTATANACCTTATGTA                                                                    ]




>consensus_11052#1
GGCACGAGGAAAATACGCTAATTGCTTGTGACTGAATAATCGTTTCTGCGTTTGTTCACC
TCATACCCTATTTTGTGGTATTCAGCGTCAGTAATAGTCTCATTTCAGTATTGTTTTCTC
TTTCAGCAATAAAACTTATTTGTTTGTTTGTTTGTTTGCTTTATATATATCTCTTCCTTA
TCAAATGGCATGTATTTGTGTATGTGTGTGTGTGTATGCAAGTATAGAAGCGCTCACGTT
TGTATCTATGCCGTTTTTTTGGCATTGTTACTTAAGTATTCTCACATTTAGATTAGCAAG
AGTATTAGCGCATTTGTACACCAACTGCTATGATTAATAATATAATAAAGGACATGAATA
TTTGCTTTTATTTTCATATATCACTTGATTTCATATTCTGGCTAACACTTACAGTAAAAA
GGCCTTGTACTCTTCTTATTCTATGCTTACTATTTTATCCTTAATTATAATCATTACTGC
CGTTTTCTGTTCTACATTACTTATTTCTATGTTTACATTAAAACCTCTTTATCCATTGTG
TTTTAATGATCATTTACACTTCCCTAGCAACAAAAAGGAACTATGGTTTGTATGTGTTGA
ATATAGTTAACATTTGAATACTACACATATAAATCTCCATAGGTGTCATGGGGGTATACA
CCTTATGTAATCATCCATGCTTGTTNGTTTGTTTGTTTTTATTATCGAGTTACATCATTA
TTTTACCCTTTAAATGT

consensusID : consensus_11052#2
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 1
consensus length = 337
fasta sequence

                              [GTTAGAGACTTAGAATAATATGCTTTAAGATTGTTTGCAATGGCGTAGGTGCATCTGTTCTTTGTCTTCCCCCGAGATTCTGAGATTTCATATTCTGGCTAACACTTACAGTAAAAAGGCCTTGTACTCTTCTTATTCTATGCTTACTATTTTATCCTTAATTATAATCATTACTGCCGTTTTCTGTTCTACATTACTTATTTCTATGTTTACATTAAAACCTCTTTATCCATTGTGTTTTAATGATCATTTACACTTCCCTAGCAACAAAAAGGAACTATGGTTTGTATGTGTTGAATATAGTTAACATTTGAATACTACACATATAAATCTCCAT]

[+] EMBL CD202894             [GTTAGAGACTTAGAATAATATGCTTTAAGATTGTTTGCAATGGCGTAGGTGCATCTGTTCTTTGTCTTCCCCCGAGATTCTGAGATTTCATATTCTGGCTAACACTTACAGTAAAAAGGCCTTGTACTCTTCTTATTCTATGCTTACTATTTTATCCTTAATTATAATCATTACTGCCGTTTTCTGTTCTACATTACTTATTTCTATGTTTACATTAAAACCTCTTTATCCATTGTGTTTTAATGATCATTTACACTTCCCTAGCAACAAAAAGGAACTATGGTTTGTATGTGTTGAATATAGTTAACATTTGAATACTACACATATAAATCTCCAT]




>consensus_11052#2
GTTAGAGACTTAGAATAATATGCTTTAAGATTGTTTGCAATGGCGTAGGTGCATCTGTTC
TTTGTCTTCCCCCGAGATTCTGAGATTTCATATTCTGGCTAACACTTACAGTAAAAAGGC
CTTGTACTCTTCTTATTCTATGCTTACTATTTTATCCTTAATTATAATCATTACTGCCGT
TTTCTGTTCTACATTACTTATTTCTATGTTTACATTAAAACCTCTTTATCCATTGTGTTT
TAATGATCATTTACACTTCCCTAGCAACAAAAAGGAACTATGGTTTGTATGTGTTGAATA
TAGTTAACATTTGAATACTACACATATAAATCTCCAT

consensus multiple alignement with clustalw

CLUSTAL W (1.82) multiple sequence alignment


consensus_11052#0      GTAGTCTAAATATTGGCAAAATGATAGTCTCCGTTGGCTTAGTGTCATTAATTCTTGCTG 60
consensus_11052#1      ------------------------------------------------------------
consensus_11052#2      ------------------------------------------------------------
                                                                                   

consensus_11052#0      TAGTGAATGCCAGAATTGATTGTGGAAGCAGTGTGAAACTTGAAGTTGACTTTGATAACG 120
consensus_11052#1      ------------------------------------------------------------
consensus_11052#2      ------------------------------------------------------------
                                                                                   

consensus_11052#0      TCCATTCGCATGGAATATCTTATAGAAAAGCAACCGTCAAGAAAACTAACCCAGTAAATT 180
consensus_11052#1      ------------------------------------------------------------
consensus_11052#2      ------------------------------------------------------------
                                                                                   

consensus_11052#0      TAGTTTTTAATGTGATTGGTGAACGAAGGCCGATAGAAATCGAATCAATTGATTGGACGT 240
consensus_11052#1      ------------------------------------------------------------
consensus_11052#2      ------------------------------------------------------------
                                                                                   

consensus_11052#0      ACAATAATGTATCAATCAATATTGGTGACAATGATATTCAAGATATATATTATTCAACTG 300
consensus_11052#1      ------------------------------------------------------------
consensus_11052#2      ------------------------------------------------------------
                                                                                   

consensus_11052#0      AGAAAACTAGCTCTGGTCTCACTGTTACATTGCATATCAAAGTGCCAACCTCCCGTGTTG 360
consensus_11052#1      ------------------------------------------------------------
consensus_11052#2      ------------------------------------------------------------
                                                                                   

consensus_11052#0      CTGGGACCTGGATTCTTACAATAAATGCAAAGGATAATTCTAAACATGTTGGTTTTTGTT 420
consensus_11052#1      ------------------------------------------------------------
consensus_11052#2      ------------------------------------------------------------
                                                                                   

consensus_11052#0      ATGTTTCGTGTCAACCTGTAATTCGCTCGAGATTTGGGGCTGTTCGTGGTCACGAAGGCA 480
consensus_11052#1      ------------------------------------------------------------
consensus_11052#2      ------------------------------------------------------------
                                                                                   

consensus_11052#0      ATCCACTATCTGTTCTCTGTGAAGTTGATGGTTTCCCAGAGCCAAATCAGGTTGTTTGGA 540
consensus_11052#1      ------------------------------------------------------------
consensus_11052#2      ------------------------------------------------------------
                                                                                   

consensus_11052#0      AACGTGTAGTTGAAAATGAAGCTGATCCAACTCAAAGCCGACTAGTTCCTGTACGCAATA 600
consensus_11052#1      ------------------------------------------------------------
consensus_11052#2      ------------------------------------------------------------
                                                                                   

consensus_11052#0      CTGTGTTCAAACCTCATGAGAGCACTAAAGATGCCATCATGGAATGGAATGATGCTTCAG 660
consensus_11052#1      ------------------------------------------------------------
consensus_11052#2      ------------------------------------------------------------
                                                                                   

consensus_11052#0      ATTCTACTGGATTTTATCTGTGCACAGCAACATCACCATTAGGATCAGACAGTTTATTGT 720
consensus_11052#1      ------------------------------------------------------------
consensus_11052#2      ------------------------------------------------------------
                                                                                   

consensus_11052#0      TCGAAGTTCGTATTAAAAGCAAATTGGCTCCTTTGTGGCCTTTCATTGGAATTATAGCTG 780
consensus_11052#1      ------------------------------------------------------------
consensus_11052#2      ------------------------------------------------------------
                                                                                   

consensus_11052#0      AATTGGTGGTACTTGGTATTATAATATTGATCTATGAACGTACTCAAGCTAAACGTCGTC 840
consensus_11052#1      ------------------------------------------------------------
consensus_11052#2      ------------------------------------------------------------
                                                                                   

consensus_11052#0      GTGAAGAAGAACGGACTACATTGTTAAAGCAAAATCCAACAAGTGATCGATGTTAAACAA 900
consensus_11052#1      ------------------------------------------------GGCACGAGGAAA 12
consensus_11052#2      ------------------------------------------------------------
                                                                                   

consensus_11052#0      ATACGCTAATTGCTTGTGACTGAATAATCGTATCTGCGTTTGTTCACCTCATACCCTATT 960
consensus_11052#1      ATACGCTAATTGCTTGTGACTGAATAATCGTTTCTGCGTTTGTTCACCTCATACCCTATT 72
consensus_11052#2      ------------------------------------------------------------
                                                                                   

consensus_11052#0      TTGTGGTATTCAGCGTCAGTAATAGTCTCATTTCAGTATTGTTTTCTCTTTCAGCAATAA 1020
consensus_11052#1      TTGTGGTATTCAGCGTCAGTAATAGTCTCATTTCAGTATTGTTTTCTCTTTCAGCAATAA 132
consensus_11052#2      ------------------------------------------------------------
                                                                                   

consensus_11052#0      AACTTATTTGTTTGTTTGTTTGTTTGCTTTATATATATCTCTTCCTTATCAAATGGCATG 1080
consensus_11052#1      AACTTATTTGTTTGTTTGTTTGTTTGCTTTATATATATCTCTTCCTTATCAAATGGCATG 192
consensus_11052#2      ------------------------------------------------------------
                                                                                   

consensus_11052#0      TATTTGTGTATGTGTGTGTGTGTATGCAAGTATAGAAGCGCTCACGTTTGTATCTATGCC 1140
consensus_11052#1      TATTTGTGTATGTGTGTGTGTGTATGCAAGTATAGAAGCGCTCACGTTTGTATCTATGCC 252
consensus_11052#2      ------------------------------------------------------------
                                                                                   

consensus_11052#0      GTTTTTTTGGCATTGTTACTTAAGTATTCTCACATTTAGATTAGCAAGAGTATTAGCGCA 1200
consensus_11052#1      GTTTTTTTGGCATTGTTACTTAAGTATTCTCACATTTAGATTAGCAAGAGTATTAGCGCA 312
consensus_11052#2      ---------------------------------------------------GTTAGAGAC 9
                                                                           **** *  

consensus_11052#0      TTTGTACACCAACTGCTATGATTAATAATATAATAAAGGACATGAATATTTGCTTTTATT 1260
consensus_11052#1      TTTGTACACCAACTGCTATGATTAATAATATAATAAAGGACATGAATATTTGCTTTTATT 372
consensus_11052#2      TTAGAATAATATGCTTTAAGATTGTT--TGCAATGGCGTAGGTGCATCTGTTCTTTGTCT 67
                       ** * * *  *     ** ****  *  *  ***   * *  ** ** * * ****   *

consensus_11052#0      TTCAT--ATATCACTTGATTTCATATTCTGGCTAACACTTACAGTAAAAAGGCCTTGTAC 1318
consensus_11052#1      TTCAT--ATATCACTTGATTTCATATTCTGGCTAACACTTACAGTAAAAAGGCCTTGTAC 430
consensus_11052#2      TCCCCCGAGATTCTGAGATTTCATATTCTGGCTAACACTTACAGTAAAAAGGCCTTGTAC 127
                       * *    * **     ********************************************

consensus_11052#0      TCTTCTTATTCTATGCTTACTATTTTATCCTTAATTATAATCATTACTGCCGTTTTCTGT 1378
consensus_11052#1      TCTTCTTATTCTATGCTTACTATTTTATCCTTAATTATAATCATTACTGCCGTTTTCTGT 490
consensus_11052#2      TCTTCTTATTCTATGCTTACTATTTTATCCTTAATTATAATCATTACTGCCGTTTTCTGT 187
                       ************************************************************

consensus_11052#0      TCTACATTACTTATTTCTATGTTTACATTAAAACCTCTTTATCCATTGTGTTTTAATGAT 1438
consensus_11052#1      TCTACATTACTTATTTCTATGTTTACATTAAAACCTCTTTATCCATTGTGTTTTAATGAT 550
consensus_11052#2      TCTACATTACTTATTTCTATGTTTACATTAAAACCTCTTTATCCATTGTGTTTTAATGAT 247
                       ************************************************************

consensus_11052#0      CATTTACACTTCCCTAGCAACAAAAAGGAACTATGGTTTGTATGTGTTGAATATAGTTAA 1498
consensus_11052#1      CATTTACACTTCCCTAGCAACAAAAAGGAACTATGGTTTGTATGTGTTGAATATAGTTAA 610
consensus_11052#2      CATTTACACTTCCCTAGCAACAAAAAGGAACTATGGTTTGTATGTGTTGAATATAGTTAA 307
                       ************************************************************

consensus_11052#0      CATTTGAATACTACACATATAAATCTCCATAGGTGTCATGGGGGTATACACCTTATGTAA 1558
consensus_11052#1      CATTTGAATACTACACATATAAATCTCCATAGGTGTCATGGGGGTATACACCTTATGTAA 670
consensus_11052#2      CATTTGAATACTACACATATAAATCTCCAT------------------------------ 337
                       ******************************                              

consensus_11052#0      TCATCCATGTTTGTTTGTTTGTTTGTTTTTATTATCGAGTTACATCATTATTTTACCCTT 1618
consensus_11052#1      TCATCCATGCTTGTTNGTTTGTTTGTTTTTATTATCGAGTTACATCATTATTTTACCCTT 730
consensus_11052#2      ------------------------------------------------------------
                                                                                   

consensus_11052#0      TAAATGTACAATTTTAATTTGCATCTTTATTATTATTATCTGCTCTAATATTTCATCCAT 1678
consensus_11052#1      TAAATGT----------------------------------------------------- 737
consensus_11052#2      ------------------------------------------------------------
                                                                                   

consensus_11052#0      TGTGACTGATCCTCCTTTAGAAGGATCTTCCTGATTCTCCTTTAGAATAGCTTTATTTTA 1738
consensus_11052#1      ------------------------------------------------------------
consensus_11052#2      ------------------------------------------------------------
                                                                                   

consensus_11052#0      CAATTTGAATGATAAATAAATTATA 1763
consensus_11052#1      -------------------------
consensus_11052#2      -------------------------