|
These datas are free for academic use only, please contact me for any other use. Schistosoma mansoni see consensus multiple alignment with clustalw Direct access to contigs :
consensusID : consensus_11052#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 27 consensus length = 1763 fasta sequence
[GTAGTCTAAATATTGGCAAAATGATAGTCTCCGTTGGCTTAGTGTCATTAATTCTTGCTGTAGTGAATGCCAGAATTGATTGTGGAAGCAGTGTGAAACTTGAAGTTGACTTTGATAACGTCCATTCGCATGGAATATCTTATAGAAAAGCAACCGTCAAGAAAACTAACCCAGTAAATTTAGTTTTTAATGTGATTGGTGAACGAAGGCCGATAGAAATCGAATCAATTGATTGGACGTACAATAATGTATCAATCAATATTGGTGACAATGATATTCAAGATATATATTATTCAACTGAGAAAACTAGCTCTGGTCTCACTGTTACATTGCATATCAAAGTGCCAACCTCCCGTGTTGCTGGGACCTGGATTCTTACAATAAATGCAAAGGATAATTCTAAACATGTTGGTTTTTGTTATGTTTCGTGTCAACCTGTAATTCGCTCGAGATTTGGGGCTGTTCGTGGTCACGAAGGCAATCCACTATCTGTTCTCTGTGAAGTTGATGGTTTCCCAGAGCCAAATCAGGTTG-TTTGGAAACGTGTAGTTGAAAATGAAGCTGATCCAACTCAAAGCCGACTAGTTCCTGTACGCAATACTGTGTTCAAACCTCATGAGAGCACTAAAGATGCCATCATGGAATGGAATGATGCTTCAGATTCTAC-TGGATTTTATCTGTGCACAGCAACATCACCATTAGGATCAGACAGTTTATTGTTCGAAGTTCGTATTAAAAGCAAATTGGCTCCTTTGTGGCCTTTCATTGGAATTATAGCTGAATTGGTGGTACTTGGTATTATAATATTGATCTATGAACGTACTCAAGCTAAACGTCGTCGTGAAGAAGAACGGACTACATTGTTAAAGCAAAATCCAACAAGTGATCGATGTTAAACAAATACGCTAATTGCTTGTGACTGAATAATCGTATCTGCGTTTGTTCACCTCATACCCTATTTTGTGGTATTCAGCGTCAGTAATAGTCTCATTTCAGTATTGTTTTCTCTTTCAGCAATAAAACTTATTTGTTTGTTTGTTTGTTTGCTTTATATATATCTCTTCCTTATCAAATGGCATGTATTTGTGTATGTGTGTGTGTGTATGCAAGTATAGAAGCGCTCACGTTTGTATCTATGCCGTTTTTTTGGCATTGTTACTTAAGTATTCTCACATTTAGATTAGCAAGAGTATTAGCGCATTTGTACACCAACTGCTATGATTAATAAT--ATAATAAAGGACATGAATATTTGCTTTTATTTTCATATATCACTTGATTTCATATTCTGGCTAACACTTACAGTAAAAAGGCCTTGTACTCTTCTTATTCTATGCTTACTATTTTATCCTTAATTATAATCATTACTGCCGTTTTCTGTTCTACATTACTTATTTCTATGTTTACATTAAAACCTCTTTATCCATTGTGTTTTAATGATCATTTACACTTCCCTAGCAACAAAAAGGAACTATGGTTTGTATGTGTTGAATATAGTTAACATTTGAATACTACACATATAAATCTCCATAGGTGTCATGGGGGTATACACCTTATGTAATCATCCATGTTTGTTTGTTTGTTTGTTTTTATTATCGAGTTACATCATTATTTTACCCTTTAAATGTACAATTTTAATTTGCATCTTTATTATTATTATCTGCTCTAATATTTCATCCATTGTGACTGATCCTCCTTTAGAAGGATCTTCCTGATTCTCCTTTAGAATAGCTTTATTTTACAATTTGAATGATAAATAAATTATA]
[+] EMBL AI977159 [GTAGTCTAAATATTGGCAAAATGATAGTCTCCGTTGGCTTAGTGTCATTAATTCTTGCTGTAGTGAATGCCAGAATTGATTGTGGAAGCAGTGTGAAACTTGAAGTTGACTTTGATAACGTCCATTCGCATGGAATATCTTATAGAAAAGCAACCGTCAAGAAAACTAACCCAGTAAATTTAGTTTTTAATGTGATTGGTGAACGAAGGCCGATAGAAATCGAATCAATTGATTGGACGTACAATAATGTATCAATCAATATTGGTGACAATGATATTCAAGATATATATTATTCAACTGAGAAAACTAGCTCTGGTCTCACTGTTACATTGCATATCAAAGTGCCAACCTCCCGTGTTGCTGGGACCTGGATTCTTACAATAAATGCAAAGGATAATTCTAAACATGTTGGTTTTTGTTATGTTTCGTGTCAACCTGTAATTCGCTCGAGATTTGGGGCTGTTCGTGGTCACGAAGGCAATCCACTATCTGTTCTCTGTGAAGTTGATGGTTTCCCAGAGCCAAATCAGGTTGTTTTGGAAACGTGTAGT ]
[+] EMBL AW017178 [GTAGTCTAAATATTGGCAAAATGATAGTCTCCGTTGGCTTAGTGTCATTAATTCTTGCTGTAGTGAATGCCAGAATTGATTGTGGAAGCAGTGTGAAACTTGAAGTTGACTTTGATAACGTCCATTCGCATGGAATATCTTATAGAAAAGCAACCGTCAAGAAAACTAACCCAGTAAATTTAGTTTTTAATGTGATTGGTGAACGAAGGCCGATAGAAATCGAATCAATTGATTGGACGTACAATAATGTATCAATCAATATTGGTGACAATGATATTCAAGATATATATTATTCAACTGAGAAAACTAGCTCTGGTCTCACTGTTACATTGCATATCAAAGTGCCAACCTCCCGTGTTGCTGGGACCTGGATTCTTACAATAAATGCAAAGGATAATTCTAAACATGTTGGTTTTTGTTATGTTTCGTGTCAACCTGTAATTCGCTCGAGATTTGGGGCTGTTCGTGGTCACGAAGGCAATCCACTATCTGTTCTCTGTGAAGTTGATGGTTTCCCAGAGCCAAATCAAGTTG TTTGGAAACGTGTAGTTGAAAATGAAGCTGATCCAACTCAAAGCCGACTAGTTCCTGTACGCAATACTGTGTTCAAACCTCATGAGAGCACTAAAGATGCCTTCATGGAATGG ]
[+] EMBL AI976914 [ TGCTGTAGTGAATGCCAGAATTGATTGTGGAAGCAGTGTGAAACTTGAAGTTGACTTTGATAACGTCCATTCGCATGGAATATCTTATAGAAAAGCAACCGTCAAGAAAACTAACCCAGTAAATTTAGTTTTTAATGTGATTGGTGAACGAAGGCCGATAGAAATCGAATCAATTGATTGGACGTACAATAATGTATCAATCAATATTGGTGACAATGATATTCAAGATATATATTATTCAACTGAGAAAACTAGCTCTGGTCTCACTGTTACATTGCATATCAAAGTGCCAACCTCCCGTGTTGCTGGGACCTGGATTCTTACAATAAATGCAAAGGATAATTCTAAACATGTTGGTTTTTGTTATGTTTCGTGTCAACCTGTAATTCGCTCGAGATTTGGGGCTGTTCGTGGTCACGAACGCAATCCACTATCTGTTCTCTGTGAAGTTGA ]
[+] EMBL AI977432 [ TGAATGCCAGAATTGATTGTGGAAGCAGTGTGAAACTTGAAGTTGACTTTGATAACGTCCATTCGCATGGAATATCTTATAGAAAAGCAACCGTCAAGAAAACTAACCCAGTAAATTTAGTTTTTAATGTGATTGGTGAACGAAGGCCGATAGAAATCGAATCAATTGATTGGACGTACAATAATGTATCAATCAATATTGGTGACAATGATATTCAAGATATATATTATTCAACTGAGAAAACTAGCTCTGGTCTCACTGTTACATTGCATATCAAAGTGCCAACCTCCCGTGTTGCTGGGACCTGGATTCTTACAATAAATGCAAAGGATAATTCTAAACATGTTGGTTTTTGTTATGTTTCGTGTCAACCTGTAATTCGCTCGAGATTTGGGGCTGTTCGTGGTCACGAAGGCAATCCACTATCTGTTCTCTGTGAAGTTGATGGTTTCCCAGAGCCAAATCA ]
[+] EMBL CD194953 [ AGTTGACTTTGATAACGTCCATTCGCATGGAATATCTTATAGAAAAGCAACCGTCAAGAAAACTAACCCAGTAAATTTAGTTTTTAATGTGATTGGTGAACGAAGGCCGATAGAAATCGAATCAATTGATTGGACGTACAATAATGTATCAATCAATATTGGTGACAATGATATTCAAGATATATATTATTCAACTGAGAAAACTAGCTCTGGTCTCACTGTTACATTGCATATCAAAGTGCCAACCTCCCGTGTTGCTGGGACCTGGATTCTTACAATAAATGCAAAGGATAATTCTAAACATGTTGGTTTTTGTTATGTTTCGTGTCAACCTGTGATTCGCTCGAGATTTGGGGCTGTTCGTGGTCACGAAGGCAATCCACTATCTGTTCTCTGTGAAGTTGATGGTTTCCCAGAGCCAAATCAGGTTG TTTGGAAACGTGTAGTTGAAAATGA ]
[+] EMBL CD195706 [ ACGTACAATAATGTATCAATCAATATTGGTGACAATGATATTCAAGATATATATTATTCAACTGAGAAAACTAGCTCTGGTCTCACTGTTACATTGCATATCAAAGTGCCAACCTCCCGTGTTGCTGGGACCTGGATTCTTACAATAAATGCAAAGGATAATTCTAAACATGTTGGTTTTTGTTATGTTTCGTGTCAACCTGTAATTCGCTCGAGATTTGGGGCTGTTCGTGGTCACGAAGGC ATCCACTATCTGTT ]
[+] EMBL CD118690 [ TATTATTCAACTGAGAAAACTAGCTCTGGTCTCACTGTTACATTGCATATCAAAGTGCCAACCTCCCGTGTTGCTGGGACCTGGATTCTTACAGTAAATGCAAAGGATAATTCTAAACATGTTGGTTTTTGTTATGTTTCGTGTCAACCTGTAATTCGCTCGAGATTTGGGGCTGTTCGTGGTCACGAAGGCAATCCACTATCTGTTCTCTGTGAAGTTGATGGTTTCCCAGAGCCAAATCAGGTTG TTTGGAAACGTGTAGTTGAAAATGAAGCTGATCCAACTCAAAGCCGACTAGTTCCTGTACGCAATACTGTGTTCAAACCTCATGAGAGCACTAAAGATGCCATCATGGAATGGAATGATGCTTCAGATTCTAC TGGATTTTATCTGTGCACAGCAACATCACCATTAGGATCAGACAGTTTATT ]
[-] EMBL CD118541 [ ATTATTCAACTGAGAAAACTAGCTCTGGTCTCACTGTTACATTGCATATCAAAGTGCCAACCTCCCGTGTTGCTGGGACCTGGATTCTTACAATAAATGCAAAGGATAATTCTAAACATGTTGGTTTTTGTTATGTTTCGTGTCAACCTGTAATTCGCTCGAGATTTGGGGCTGTTCGTGGTCACGAAGGCAATCCACTATCTGTTCTCTGTGAAGTTGATGGTTTCCCAGAGCCAAATCAGGTTG TTTGGAAACGTGTAGTTGAAAATGAAGCTGATCCAACTCAAAGCTGACTAGTTCCTGTACGCAATACTGTGTTCAAACCTCATGAGAGCACTAAAGATGCCATCATGGAATGGAATGATGCTTCAGATTCTAC TGGATTTTATCTGTGCACAGCAACATCACCATTAGGATCAGACAGTTTATTG ]
[+] EMBL SM132 [ GAG AAACTAGCTCTGGTCTCACTGTTACATTGCATATCAAAGTGCCAACCTCCCGTGTTGCTGGGACCTGGATTCTTACAATAAATGCAAAGGATAATTCTAAACATGTTGGTTTTTGTTATGTTTCGTGTCAACCTGTAATTCGCTCGAGATTTGGGGCTGTTCGTGGTCACGGAGGCAATCCACTATCTGTTCTCTGTGAAGTTGATGGTTTCCCAGAGCCAAATCAGGTTG TTTGGAAACGTGTAGTTGAAAATGAGGCTGANCCAACTCAAAGCCGACTAGTTCCTGTACGCAATACTGTGTTCAAACCTCATGAG ]
[+] EMBL CD147920 [ GTTGCTGGGACCTGGATTCTTACAATAAATGCAAAGGATAATTCTAAACATGTTGGTTTTTGTTATGTTTCGTGTCAACCTGTAATTCGCTCGAGATTTGGGGCTGTTCGTGGTCACGAAGGCAATCCACTATCTGTTCTCTGTGAAGTTGATGGTTTCCCAGAGCCAAATCAGGTTG TTTGGAAACGTGTAGTTGAAAATGAAGCTGATCCAACTCAAAGCCGACTAGTTCCTGTACGCAATACTGTGTTCAAACCTCATGAGAGCACTAAAGATGCCATCATGGAATGGAATGATGCTTCAGATTCTAC TGGATTTTATCTGTGCACAGCAACATCACCATTAGGATCAGACAGTTTATTGTTCGAAGTTCGTATTAAAAGCAAATT ]
[+] EMBL CD135738 [ CAATAAATGCAAAGGATAATTCTAAACATGTTGGTTTTTGTTATGTTTCGTGTCAACCTGTAATTCGCTCGAGATTTGGGGCTGTTCGTGGTCACGAAGGCAATCCACTATCTGTTCTCTGTGAAGTTGATGGTTTCCCAGAGCCAAATCAGGTTG TTTGGAAACGTGTAGTTGAAAATGAAGCTGATCCAACTCATAGCCGACTAGTTCCTGTACGCAATACTGTGTTCAAACCTCATGAGAGCACTAAAGATGCCATCATGGAATGGAATGATGCTTCAGATTCTAC ]
[-] EMBL CD115983 [ AATAAATGCAAAGGATAATTCTAAACATGTTGGTTTTTGTTATGTTTCGTGTCAACCTGTAATTCGCTCGAGATTTGGGGCTGTTCGTGGTCACGAAGGCAATCCACTATCTGTTCTCTGTGAAGTTGATGGTTTCCCAGAGCCAAATCAGGTTG TTTGGAAACGTGTAGTTGAGAATGAAGCTGATCCAACTCAAAGCCGACTAGTTCCTGTACGCAATACTGTGTTCAAACCTCATGAGAGCACTAAAGATGCCATCATGGAATGGAATGATGCTTCAGATTCTAC TG ]
[-] EMBL CD178094 [ GTGTAGTTGAAAATGAAGCTGATCCAACTCAAAGCCGACTAGTTCCTGTACGCAATACTGTGTTCAAACCTCATGAGAGCACTAAAGATGCCATCATGGAATGGAATGATGCTTCAGATTCTAC TGGATTTTATCTGTGCACAGCAACATCACCATTAGGATCAGACAGTTTATTGTTCGAAGTTCGTATTAAAAGCAAATTGGCTCCTTTGTGGCCTTTCATTGGAATTATAGCTGAATTGGTGGTACTTGGTATTATAATATTGATCTATGAACGTACTCAAGCTAAACGTCGTCGTGAAGAAGAACGGACTACATTGTTAAAGCAAAATCCAACAAGTGATCGATGTTAAACAAATACGCTAATTGCTTGTGACTGAATAATCGTATCTGCGTTTGTTCACCTCATACCCTATTTTGTGGTATTCAGCGTCAGTAATAGTCTCATTTCAGTATTGTTTTCTCTTTCAGCAATAAAACTTATTTGTTTGTTTGTTTGTTTGCTTT ]
[+] EMBL CD069687 [ AAGCCGACTAGTTCCTGTACGCAATACTGTGTTCAAACCTCATGAGAGCACTAAAGATGCCATCATGGAATGGAATGATGCTTCAGATTCTAC TGGATTTTATCTGTGCACAGCAACATCACCATTAGGATCAGACAGTTTATTGTTCGAAGTTCGTATTAAAAGCAAATTGGCTCCTTTGTGGCCTTTCATTGGAATTATAGCTGAATTGGTGGTACTTGGTATTATAATATTGATCTATGAACGTACTCAAGCTAAACGTCGTCGTGAAGAAGAACGGACTACATTGTTAAAGCAAAATCCAACAAGTGATCGATGTTAAACAAATACGCTAATTGCTTGTGACTGAATAATCGTATCTGCGTTTGTTCACCTCATACCCTATTTTGTG ]
[-] EMBL CD069697 [ AGCCGACTAGTTCCTGTACGCAATACTGTGTTCAAACCTCATGAGAGCACTAAAGATGCCATCATGGAATGGAATGATGCTTCAGATTCTAC TGGATTTTATCTGTGCACAGCAACATCACCATTAGGATCAGACAGTTTATTGTTCGAAGTTCGTATTAAAAGCAAATTGGCTCCTTTGTGGCCTTTCATTGGAATTATAGCTGAATTGGTGGTACTTGGTATTATAATATTGATCTATGAACGTACTCAAGCTAAACGTCGTCGTGAAGAAGAACGGACTACATTGTTAAAGCAAAATCCAACAAGTGATCGATGTTAAACAAATACGCTAATTGCTTGTGACTGAATAATCGTATCTGCGTTTGTTCACCTCATACCCTATTTTGTGG ]
[-] EMBL CD069675 [ AGCCGACTAGTTCCTGTACGCAATACTGTGTTCAAACCTCATGAGAGCACTAAAGATGCCATCATGGAATGGAATGATGCTTCAGATTCTAC TGGATTTTATCTGTGCACAGCAACATCACCATTAGGATCAGACAGTTTATTGTTCGAAGTTCGTATTAAAAGCAAATTGGCTCCTTTGTGGCCTTTCATTGGAATTATAGCTGAATTGGTGGTACTTGGTATTATAATATTGATCTATGAACGTACTCAAGCTAAACGTCGTCGTGAAGAAAAACGGACTACATTGTTAAAGCAAAATCCAACAAGTGATCGATGTTAAACAAATACGCTAATTGCTTGTGACTGAATAATCGTATCTGCGTTTGTTCACCTCATACCCTATT ]
[+] EMBL CD069406 [ tAATGGAATGATGCTTCAGATTCTACGTGGATTTTATCTGTGCACAGCAACATCACCATTAGGATCAGACAGTTTATTGTTCGAAGTTCGTATTAAAGGCAAATTGGCTCCTTTGTGGCCTTTCATTGGAATTATAGCTGAATTGGTGGTACTTGGTATTATAATATTGATCTATGAACGTACTCAAGCTAAACGTCGTCGTGAAGAAGAACGGACTACATTGTTAAAGCAAAATCCAACAAGTGATCGATGTTAAACAAATACGCTAATTGCTTGTGACTGAATAATCGTATCTGCGTTTGTTCACCTCATACCCTATTTGGTGGTATTCAGCGTCAGTAATGGTCTCATTTCAGTATTGTTTTCTCTTTCAGCAATAAAACTTATTTGTATGTTAGTAAGTAGGCTTTATATATATCTCTTCCTT ]
[+] EMBL CD082916 [ TGATGCTTCAGATTCTAC TGGATTTTATCTGTGCACAGCAACATCACCATTAGGATCAGACAGTTTATTGTTCGAAGTTCGTATTAAAAGCAAATTGGCTCCTTTGTGGCCTTTCATTGGAATTATAGCTGAATTGGTGGTACTTGGTATTATAATATTGATCTATGAACGTACTCAAGCTAAACGTCGTCGTGAAGAAGAACGGACTACATTGTTAAAGCAAAATCCAACAAGTGATCGATGTTAAACAAATACGCTAATTGCTTGTGACTGAATAATCGTATCTGCGTTTGTTCACCTCATACCCTATTTTGTGGTATTTAGCGTCAGTAATAGTCTCATTTCAGTATTGTTTTCTCTTTCAGCAATAAAACTTATTTGTTTGTTTGTTTGTTTGCTTTATATATATCTCTTCCTTATCAAATGGCATGTATTTGTGTATGTGTGTGTGTGTATGCAAGTATAGAAGCGCTCACGTTTGTATCTATGCCGTTTTTTTGGCATTGTTACTTAAGTATTCTCACATTTAGATTAGCAAGAGTATTAGCGCATTTGTACACCAACTGCTATGATTAATAATNNAT ATAAgg ]
[-] EMBL CD192288 [ TCAGACAGTTTATTGTTCGAAGTTCGTATTAAAAGCAAATTGGCTCCTTTGTGGCCTTTCATTGGGATTATAGCTGAATTGGTGGTACTTGGTATTATAATATTGATCTATGAACGTACTCAAGCTAAACGTCGTCGTGAAGAAGAACGGACTACATTGTTAAAGCAAAATCCAA ]
[+] EMBL CD080655 [ TCGAAGTTCGTATTAAAAGCAAATTGGCTCCTTTGTGGCCTTTCATTGGAATTATAGCTGAATTGGTGGTACTTGGTATTATAATATTGATCTATGAACGTACTCAAGCTAAACGTCGTCGTGAAGAAGAACGGACTACATTGTTAAAGCAAAATCCAACAAGTGATCGATGTTAAACAAATACGCTAATTGCTTGTGACTGAATAATCGTATCTGCGTTTGTTCACCTCATACCCTATTTTGTGGTATTCAGCGTCAGTAATAGTCTCATTTCAGTATTGTTTTCTCTTTCAGCAATAAAACTTATTTGTTTGTTTGTTTGTTTGCTTTATATATATCTCTTCCTTATCAAATGGCATGTATTTGTGTATGTGTGTGTGTGTATGCAAGTATAGAAGCGCTCACGTTTGTATCTATGCCGTTTTTTTGGCATTGTTACTTAAGTATTCTCACATTTAGATTAGCAAGAGTATTAGCGCATTTGTACACCAACTGCTATGATTAATAAT ATAATAAAGGACATGAATATTTGCTTTTATTTTCATATATCACTTGATTTCATATTCTGGCTAACACTTACAGTAAAAAGGCCTTGTACTCTTCTTATTCTATGCTTACTATTTTATCCTTAATTATAATCATTACTGCCGTTNTCTGTTCTACATTACTTATTTCTATGTTTACATTAAAACCTCTn ]
[-] EMBL CD186199 [ tATATTGATCTATGAACGTACTCAAGCTAAACGTCGTCGT AAGAAGAACGGACTACA TGTTAAAGCAAAATCCAACAAGTGATCGATGTTAAACAAATACGCTAATTGCTTGTGACTGAATAATCGTATCTGCGTTTGTTCACCTCATACCCTATTNTGTGGTATTCAGCGTCAGTAATAGTCTCATTTCAGTATTGTTTTCTCTTTCAGCAATAAAACTTATTTGTTTGTTTGTTTGTTTGCTTTATATATATCTCTTCCTTATCAAATGGCATGTATTTGTGTATGTGTGTGTGTGTATGCAAGTATAGAAGCGCTCACGTTTGTATCTATGCCGTTTTTTTGGCATTGTTACTTAAGTATTCTCACATTTAGATTAGCAGGAGTATTAGCGCATTTGTACACCAACTGCTATGATTAATAAT ATAATAAAGGACATGAATATTTGCTTTTATTTTCATATATCACTTGATTTCATATTCTGGCTAACACTTACAGTAAAAAGGCCTTGTACTCTTCTTATTCTATGCTTA ]
[-] EMBL CD075147 [ GCTTTATA ATATCTCTTCCTANTCAAATGGCATGTATTTGTGTATGTGTGTGTGTGTATGCAAGTATAGAAGCGCTCACGTTTGTATCTATGCCGTTTTTTTGGCATTGTTACTTAAGTATTCTCACATTTAGATTAGCAAGAGTATTAGCGCATTTGTACACCAACTGCTATGATTAATAAT ATAATAAAGGACATGAATATTTGCTTTTATTTTCATATATCACTTGATTTCATATTCTGGCTAACACTTACAGTAAAAAGGCCTTGTACTCTTCTTATTCTATGCTTACTATTTTATCCTTAATTATAATCATTACTGCCGTTTTCTGTTCTACATTACTTATTTCTATGTTTACATTAAAACCTCTTTATCCATTGTGTTTTAATGATCATTTACACTTCCCTAGCAACAAAAAGGAACTATGGTTTGTATGTGTTGAATATAGTTAACATTTGAATACTACACATATAAATCTCCATAGGTGTCATGGGGGTATACACCTTATGTAATCATCCATGTTTGTTTGTTTGTTTGTTTTTATTATCGAGTTACATCATTATTTTACCCTTTAAATGTAa ]
[-] EMBL CD074571 [ CAAGTATAGAAGCGCTCACGTTTGTATCTATGCCGTTTTTTTGGCATTGTTACTTAAGTATTCTCACATTTAGATTAGCAAGAGTATTAGCGCATTTGTACACCAACTGCTATGATTAATAAT ATAATAAAGGACATGAATATTTGCTTTTATTTTCATATATCACTTGATTTCATATTCTGGCTAACACTTACAGTAAAAAGGCCTTGTACTCTTCTTATTCTATGCTTACTATTTTATCCTTAATTATAATCATTACTGCCGTTTTCTGTTCTACATTACTTATTTCTATGTTTACATTAAAACCTCTTTATCCATTGTGTTTTAATGATCATTTACACTTCCCTAGCAACAAAAAGGAACTATGGTTTGTATGTGTTGAATATAGTTAACATTTGAATACTACACATATAAATCTCCATAGGTGTCATGGGGGTATACACCTTATGTAATCATCCATGTTTGTTTGTTTGTTTGTTTTTATTATCGAGTTACATCATTATTTTACCCTTTAAATGTACAATTTTAATTTGCATCTTTATTATTATTATCTGCTCTAATATTTCATCCATTGTGACTGATCCTCCTTTAGAAGGATCTTCCTGATTCTCCTTTAGAATAGGTTTATTTTACAATTTGAAAAATAAATAAATTATA]
[-] EMBL CD077021 [ TATTCTCACATTTAGATTAGCAAGAGTATTAGCGCATTTGTACACCAACTGCTATGATTAATAAT ATAATAAAGGACATGAATATTTGCTTTTATTTTCATATATCACTTGATTTCATATTCTGGCTAACACTCACAGTAAAAAGGCCTTGTACTCTTCTTATTCTATGCTTACTATTTTATCCTTAATTATAATCATTACTGCCGTTTTCTGTTATACATTACTTATTTCTATGTTTACATTAAAACCTCTTCATCCATTGTGTTTTAATGATCATTTACACTTCCCTAGCAACAAAAAGGAACTATGGTTTGTATGTGTTGAATATAGTTAACATTTGAATACTACACATATAAATCTCCATAGGTGTCATGGGGGTATACACCTTATGTAATCATCCATGTTTGTTTGTTTGTTTGTTTTTATTATCGAGTTACATCATTATTTTACCCTTTAAATGTACAATTTTAATTTGCATCTTTATTATTATTATCTGCTCTAATATTTCATCCATTGTGACTGATCCTCCTTTAGAAGGATCTTCCTGATTCTCCTTTAGAATAGCTTTATTTTACAATTTGAATGATAAATGAATTATA]
[-] EMBL CD076499 [ GATTAGCAAGAGTATTAGCGCATTTGTACACCAACTGCTATGATTAATAAT ATAATAAAGGACATGAATATTTGCTTTTATTTTCATATATCACTTGATTTCATATTCTGGCTAACACTTACAGTAAAAAGGCCTTGTACTCTTCTTATTCTATGCTTACTATTTTATCCTTAATTATAATCATTACTGCCGTTTTCTGTTCTACATTACTTATTTCTATGTTTACATTAAAACCTCTTTATCCATTGTGTTTTAATGATCATTTACACTTCCCTAGCAACAAAAAGGAACTATGGTTTGTATGTGTTGAATATAGTTAACATTTGAATACTACACATATAAATCTCCATAGGTGTCATGGGGGTATACCCCTTATGTAATCATCCATGTTTGTTTGTTTGTTTGTTTTTATTATCGAGTTACATCATTATTTTACCCTTTAAATGTACAATTTTAATTTGCATCTTTATTATTATTATCTGCTCTAATATTTCATCCATTGTGACTGATCCTCCTTTAGAAGGATCTTCCTGATTCTCCTTTAGAATAGCTTTATTTTACAATTTGAATGATAAATAAATTATA]
[-] EMBL SMAA25665 [ TGC TTTA TNTCATATATCACTTGA TTCATA TCTGGCTAACAC TACAGTAAAAAGGCCTTGTAC CCNCCTATCCTATGCCTACTAGTTTATCCTTAATTATAATCATTACTGCCGTTTTCTGTRCTACATTACTTATTCCTATGTTTACATTAAAACCTCTTTATCCATTGTGTTTTAATGATCATTTACACTTCCCTAGCAACAAAAAGGAACTATGGTTTGTATGTGTTGAATATAGTTAACATTTGAATACTACACATATAAATCNCCATAGGTGTCATGGGGGTATACACCTTATGTAATCATCCATGTTTGTTTGTTTGTTTGTTTTTATTATCGAGTTACATCATTATTTTACCCTTTAAATGTACAATTTTAATTTGCATCTTTATTATTATTATCTGCTCTAATATTTCATCCATTGTGACTGATCCTCCTTTAGAAGGATCTTCCTGATTCTCCTTTAGAATAGCTTTATTTTACAATTTGAATGATAAATAAATTATA]
[+] EMBL AI444545 [ TGTACTCTTCTTATTCTATGCTTACTATTTTATCCTTAATTATAATCATTACTGCCGTTTTCTGTTCTACATTACTTATTTCTATGTTTACATTAAAACCTCTTTATCCATTGTGTTTTAATGATCATTTACACTTCCCTAGCAACAAAAAGGAACTATGGTTTGTATGTGTTGAATATAGTTAACATTTGAATACTACACATATAAATCTCCATAGGTGTCATGGGGGTATACACCTTATGTAATCATCCATGTTTGTTTGTTTGTTTGTTTTTATTATCGAGTTACATCATTATTTTACCCTTTAAATGTACAATTTTAATTTGCATCTTTATTATTATTATCTGCGCTAATATTTCATCCATTGTGACTGATCCTCCTTTAGAGGGATCTTCCTGATTCTCCTTTAGAATAGCTTTATTTTACAATTTGGATGAT AATAAAT ]
consensusID : consensus_11052#1 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 2 consensus length = 737 fasta sequence
[GGCACGAGGAAAATACGCTAATTGCTTGTGACTGAATAATCGTTTCTGCGTTTGTTCACCTCATACCCTATTTTGTGGTATTCAGCGTCAGTAATAGTCTCATTTCAGTATTGTTTTCTCTTTCAGCAATAAAACTTATTTGTTTGTTTGTTTGTTTGCTTTATATATATCTCTTCCTTATCAAATGGCATGTATTTGTGTATGTGTGTGTGTGTATGCAAGTATAGAAGCGCTCACGTTTGTATCTATGCCGTTTTTTTGGCATTGTTACTTAAGTATTCTCACATTTAGATTAGCAAGAGTATTAGCGCATTTGTACACCAACTGCTATGATTAATAATATAATAAAGGACATGAATATTTGCTTTTATTTTCATATATCACTTGATTTCATATTCTGGCTAACACTTACAGTAAAAAGGCCTTGTACTCTTCTTATTCTATGCTTACTATTTTATCCTTAATTATAATCATTACTGCCGTTTTCTGTTCTACATTACTTATTTCTATGTTTACATTAAAACCTCTTTATCCATTGTGTTTTAATGATCATTTACACTTCCCTAGCAACAAAAAGGAACTATGGTTTGTATGTGTTGAATATAGTTAACATTTGAATACTACACATATAAATCTCCATAGGTGTCATGGGGGTATACACCTTATGTAATCATCCATGCTTGTTNGTTTGTTTGTTTTTATTATCGAGTTACATCATTATTTTACCCTTTAAATGT]
[+] EMBL CD081315 [GGCACGAGGAAAATACGCTAATTGCTTGTGACTGAATAATCGTTTCTGCGTTTGTTCACCTCATACCCTATTTTGTGGTATTCAGCGTCAGTAATAGTCTCATTTCAGTATTGTTTTCTCTTTCAGCAATAAAACTTATTTGTTTGTTTGTTTGTTTGCTTTATATATATCTCTTCCTTATCAAATGGCATGTATTTGTGTATGTGTGTGTGTGTATGCAAGTATAGAAGCGCTCACGTTTGTATCTATGCCGTTTTTTTGGCATTGTTACTTAAGTATTCTCACATTTAGATTAGCAAGAGTATTAGCGCATTTGTACACCAACTGCTATGATTAATAATATAATAAAGGACATGAATATTTGCTTTTATTTTCATATATCACTTGATTTCATATTCTGGCTAACACTTACAGTAAAAAGGCCTTGTACTCTTCTTATTCTATGCTTACTATTTTATCCTTAATTATAATCATTACTGCCGTTTTCTGTTCTACATTACTTATTTCTATGTTTACATTAAAACCTCTTTATCCATTGTGTTTTAATGATCATTTACACTTCCCTAGCAACAAAAAGGAACTATGGTTTGTATGTGTTGAATATAGTTAACATTTGAATACTACACATATAAATCTCCATAGGTGTCATGGGGGTATACACCTTATGTAATCATCCATGCTTGTTNGTTTGTTTGTTTTTATTATCGAGTTACATCATTATTTTACCCTTTAAATGT]
[+] EMBL BE505098 [ TCCCTAGCAACAAAAAGGAACTATGGTTTGTATGTGTTGAATATAGTTAACATTTGAATACTACACATATAAATCTCCATAGGTGTCATGGGGGTATANACCTTATGTA ]
consensusID : consensus_11052#2 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 1 consensus length = 337 fasta sequence
[GTTAGAGACTTAGAATAATATGCTTTAAGATTGTTTGCAATGGCGTAGGTGCATCTGTTCTTTGTCTTCCCCCGAGATTCTGAGATTTCATATTCTGGCTAACACTTACAGTAAAAAGGCCTTGTACTCTTCTTATTCTATGCTTACTATTTTATCCTTAATTATAATCATTACTGCCGTTTTCTGTTCTACATTACTTATTTCTATGTTTACATTAAAACCTCTTTATCCATTGTGTTTTAATGATCATTTACACTTCCCTAGCAACAAAAAGGAACTATGGTTTGTATGTGTTGAATATAGTTAACATTTGAATACTACACATATAAATCTCCAT]
[+] EMBL CD202894 [GTTAGAGACTTAGAATAATATGCTTTAAGATTGTTTGCAATGGCGTAGGTGCATCTGTTCTTTGTCTTCCCCCGAGATTCTGAGATTTCATATTCTGGCTAACACTTACAGTAAAAAGGCCTTGTACTCTTCTTATTCTATGCTTACTATTTTATCCTTAATTATAATCATTACTGCCGTTTTCTGTTCTACATTACTTATTTCTATGTTTACATTAAAACCTCTTTATCCATTGTGTTTTAATGATCATTTACACTTCCCTAGCAACAAAAAGGAACTATGGTTTGTATGTGTTGAATATAGTTAACATTTGAATACTACACATATAAATCTCCAT]
consensus multiple alignement with clustalw CLUSTAL W (1.82) multiple sequence alignment
consensus_11052#0 GTAGTCTAAATATTGGCAAAATGATAGTCTCCGTTGGCTTAGTGTCATTAATTCTTGCTG 60
consensus_11052#1 ------------------------------------------------------------
consensus_11052#2 ------------------------------------------------------------
consensus_11052#0 TAGTGAATGCCAGAATTGATTGTGGAAGCAGTGTGAAACTTGAAGTTGACTTTGATAACG 120
consensus_11052#1 ------------------------------------------------------------
consensus_11052#2 ------------------------------------------------------------
consensus_11052#0 TCCATTCGCATGGAATATCTTATAGAAAAGCAACCGTCAAGAAAACTAACCCAGTAAATT 180
consensus_11052#1 ------------------------------------------------------------
consensus_11052#2 ------------------------------------------------------------
consensus_11052#0 TAGTTTTTAATGTGATTGGTGAACGAAGGCCGATAGAAATCGAATCAATTGATTGGACGT 240
consensus_11052#1 ------------------------------------------------------------
consensus_11052#2 ------------------------------------------------------------
consensus_11052#0 ACAATAATGTATCAATCAATATTGGTGACAATGATATTCAAGATATATATTATTCAACTG 300
consensus_11052#1 ------------------------------------------------------------
consensus_11052#2 ------------------------------------------------------------
consensus_11052#0 AGAAAACTAGCTCTGGTCTCACTGTTACATTGCATATCAAAGTGCCAACCTCCCGTGTTG 360
consensus_11052#1 ------------------------------------------------------------
consensus_11052#2 ------------------------------------------------------------
consensus_11052#0 CTGGGACCTGGATTCTTACAATAAATGCAAAGGATAATTCTAAACATGTTGGTTTTTGTT 420
consensus_11052#1 ------------------------------------------------------------
consensus_11052#2 ------------------------------------------------------------
consensus_11052#0 ATGTTTCGTGTCAACCTGTAATTCGCTCGAGATTTGGGGCTGTTCGTGGTCACGAAGGCA 480
consensus_11052#1 ------------------------------------------------------------
consensus_11052#2 ------------------------------------------------------------
consensus_11052#0 ATCCACTATCTGTTCTCTGTGAAGTTGATGGTTTCCCAGAGCCAAATCAGGTTGTTTGGA 540
consensus_11052#1 ------------------------------------------------------------
consensus_11052#2 ------------------------------------------------------------
consensus_11052#0 AACGTGTAGTTGAAAATGAAGCTGATCCAACTCAAAGCCGACTAGTTCCTGTACGCAATA 600
consensus_11052#1 ------------------------------------------------------------
consensus_11052#2 ------------------------------------------------------------
consensus_11052#0 CTGTGTTCAAACCTCATGAGAGCACTAAAGATGCCATCATGGAATGGAATGATGCTTCAG 660
consensus_11052#1 ------------------------------------------------------------
consensus_11052#2 ------------------------------------------------------------
consensus_11052#0 ATTCTACTGGATTTTATCTGTGCACAGCAACATCACCATTAGGATCAGACAGTTTATTGT 720
consensus_11052#1 ------------------------------------------------------------
consensus_11052#2 ------------------------------------------------------------
consensus_11052#0 TCGAAGTTCGTATTAAAAGCAAATTGGCTCCTTTGTGGCCTTTCATTGGAATTATAGCTG 780
consensus_11052#1 ------------------------------------------------------------
consensus_11052#2 ------------------------------------------------------------
consensus_11052#0 AATTGGTGGTACTTGGTATTATAATATTGATCTATGAACGTACTCAAGCTAAACGTCGTC 840
consensus_11052#1 ------------------------------------------------------------
consensus_11052#2 ------------------------------------------------------------
consensus_11052#0 GTGAAGAAGAACGGACTACATTGTTAAAGCAAAATCCAACAAGTGATCGATGTTAAACAA 900
consensus_11052#1 ------------------------------------------------GGCACGAGGAAA 12
consensus_11052#2 ------------------------------------------------------------
consensus_11052#0 ATACGCTAATTGCTTGTGACTGAATAATCGTATCTGCGTTTGTTCACCTCATACCCTATT 960
consensus_11052#1 ATACGCTAATTGCTTGTGACTGAATAATCGTTTCTGCGTTTGTTCACCTCATACCCTATT 72
consensus_11052#2 ------------------------------------------------------------
consensus_11052#0 TTGTGGTATTCAGCGTCAGTAATAGTCTCATTTCAGTATTGTTTTCTCTTTCAGCAATAA 1020
consensus_11052#1 TTGTGGTATTCAGCGTCAGTAATAGTCTCATTTCAGTATTGTTTTCTCTTTCAGCAATAA 132
consensus_11052#2 ------------------------------------------------------------
consensus_11052#0 AACTTATTTGTTTGTTTGTTTGTTTGCTTTATATATATCTCTTCCTTATCAAATGGCATG 1080
consensus_11052#1 AACTTATTTGTTTGTTTGTTTGTTTGCTTTATATATATCTCTTCCTTATCAAATGGCATG 192
consensus_11052#2 ------------------------------------------------------------
consensus_11052#0 TATTTGTGTATGTGTGTGTGTGTATGCAAGTATAGAAGCGCTCACGTTTGTATCTATGCC 1140
consensus_11052#1 TATTTGTGTATGTGTGTGTGTGTATGCAAGTATAGAAGCGCTCACGTTTGTATCTATGCC 252
consensus_11052#2 ------------------------------------------------------------
consensus_11052#0 GTTTTTTTGGCATTGTTACTTAAGTATTCTCACATTTAGATTAGCAAGAGTATTAGCGCA 1200
consensus_11052#1 GTTTTTTTGGCATTGTTACTTAAGTATTCTCACATTTAGATTAGCAAGAGTATTAGCGCA 312
consensus_11052#2 ---------------------------------------------------GTTAGAGAC 9
**** *
consensus_11052#0 TTTGTACACCAACTGCTATGATTAATAATATAATAAAGGACATGAATATTTGCTTTTATT 1260
consensus_11052#1 TTTGTACACCAACTGCTATGATTAATAATATAATAAAGGACATGAATATTTGCTTTTATT 372
consensus_11052#2 TTAGAATAATATGCTTTAAGATTGTT--TGCAATGGCGTAGGTGCATCTGTTCTTTGTCT 67
** * * * * ** **** * * *** * * ** ** * * **** *
consensus_11052#0 TTCAT--ATATCACTTGATTTCATATTCTGGCTAACACTTACAGTAAAAAGGCCTTGTAC 1318
consensus_11052#1 TTCAT--ATATCACTTGATTTCATATTCTGGCTAACACTTACAGTAAAAAGGCCTTGTAC 430
consensus_11052#2 TCCCCCGAGATTCTGAGATTTCATATTCTGGCTAACACTTACAGTAAAAAGGCCTTGTAC 127
* * * ** ********************************************
consensus_11052#0 TCTTCTTATTCTATGCTTACTATTTTATCCTTAATTATAATCATTACTGCCGTTTTCTGT 1378
consensus_11052#1 TCTTCTTATTCTATGCTTACTATTTTATCCTTAATTATAATCATTACTGCCGTTTTCTGT 490
consensus_11052#2 TCTTCTTATTCTATGCTTACTATTTTATCCTTAATTATAATCATTACTGCCGTTTTCTGT 187
************************************************************
consensus_11052#0 TCTACATTACTTATTTCTATGTTTACATTAAAACCTCTTTATCCATTGTGTTTTAATGAT 1438
consensus_11052#1 TCTACATTACTTATTTCTATGTTTACATTAAAACCTCTTTATCCATTGTGTTTTAATGAT 550
consensus_11052#2 TCTACATTACTTATTTCTATGTTTACATTAAAACCTCTTTATCCATTGTGTTTTAATGAT 247
************************************************************
consensus_11052#0 CATTTACACTTCCCTAGCAACAAAAAGGAACTATGGTTTGTATGTGTTGAATATAGTTAA 1498
consensus_11052#1 CATTTACACTTCCCTAGCAACAAAAAGGAACTATGGTTTGTATGTGTTGAATATAGTTAA 610
consensus_11052#2 CATTTACACTTCCCTAGCAACAAAAAGGAACTATGGTTTGTATGTGTTGAATATAGTTAA 307
************************************************************
consensus_11052#0 CATTTGAATACTACACATATAAATCTCCATAGGTGTCATGGGGGTATACACCTTATGTAA 1558
consensus_11052#1 CATTTGAATACTACACATATAAATCTCCATAGGTGTCATGGGGGTATACACCTTATGTAA 670
consensus_11052#2 CATTTGAATACTACACATATAAATCTCCAT------------------------------ 337
******************************
consensus_11052#0 TCATCCATGTTTGTTTGTTTGTTTGTTTTTATTATCGAGTTACATCATTATTTTACCCTT 1618
consensus_11052#1 TCATCCATGCTTGTTNGTTTGTTTGTTTTTATTATCGAGTTACATCATTATTTTACCCTT 730
consensus_11052#2 ------------------------------------------------------------
consensus_11052#0 TAAATGTACAATTTTAATTTGCATCTTTATTATTATTATCTGCTCTAATATTTCATCCAT 1678
consensus_11052#1 TAAATGT----------------------------------------------------- 737
consensus_11052#2 ------------------------------------------------------------
consensus_11052#0 TGTGACTGATCCTCCTTTAGAAGGATCTTCCTGATTCTCCTTTAGAATAGCTTTATTTTA 1738
consensus_11052#1 ------------------------------------------------------------
consensus_11052#2 ------------------------------------------------------------
consensus_11052#0 CAATTTGAATGATAAATAAATTATA 1763
consensus_11052#1 -------------------------
consensus_11052#2 -------------------------
|
| Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) | ||||