cluster # 11122

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Schistosoma mansoni
cluster # 11122 cluster # 11122 Sequences # 35 consensus # 2

see consensus multiple alignment with clustalw

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consensus_11122#0 length = 2142 sequences # 33

consensus_11122#1 length = 732 sequences # 2

consensusID : consensus_11122#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 33
consensus length = 2142
fasta sequence

                              [CGTTTGCGCCACTGGTCTTGGACTTTTGGAGGCATTTAGTCGGTCGGATTTTTGCAGATGGAGTCAAGGAAGGTCTCTTTGAGTGCTAATGCTTTGATTGGAGGCAAATGGAGACTTGTACGAAAAATCGGCGGTGGTTCATTCGGTGATATATATCTTGGACAAAATATGTTAACTGGGGATGAAGTTGCAATTAAATTAGAGCCTGTGACTGCCCGACATCCTCAACTGCTTTACGAGAGCCGAGTTTATCGAGTTTTACAAAACTCATCAGGAGTGCCACGGGTTTATTGGTTCGGACCTGATGGTGTAAGTAATCGTTACAAAGCCATGGTTATGGATTTACTCGGTCCAAGTCTTGAAGACTTATTTACTTTTTGTGGACGTAGATTTTCAGCAAAAACGGTGTTAACTCTAGCGGAACAGATGTTGTGGCGCATCGAATGTGTTCATTATAGAGGTCTTATTCATAGGGACATCAAGCCTGACAACTTCTTGATGGGGATCGGTCCACACTGCAACAGAGTGTTCATTGTAGATTTTGGATTAGCCAAAAGATTCAGAGATCATAGAACGAAATGCCACATTCCATATAGGGATGATAAGAATTTAACAGGTACAGCACGTTATGCTAGCATAAATGCGCATGCTGGTATCGAGCAATCTAGACGTGATGATATTGAATCTCTTGGATATGTTTTTATGTATTTTCTCAGAGGACACCTTCCGTGGCAAGGACTAAAGGCAAATACTAAAAAGCAAAAGTACGAACGTATATATGAGAAGAAACTAGCTACGTCACCTGAAGCCCTATGTAAAGGTTATCCTGTAGAATTCGAAAAATATTTGCATTTCGCTCGTGGTCTAGCTTTTGACAGCCTTCCGGACT-ATGTATTTTTAAGAGGAATTTTCCGCCGTTTGTTTCAAAGCCTCAATTTTGTTCTCGACTATGTTTATGACTGGGCACTTCTGGGTACAAATTCGTCTAATACTAGTCAGTCAATAATGAATGCTAATCCAGAGTGTGAAGATAATGCGAATCAGCATCAAAATAATGCAGAATGTCAGGGAATCGATAGCACAGTGGGGGCAGCTCAATGTGCGCTCC-CAGCACCTCAAGTATATGGAAATCATAACCATCA-TAATATACCTGTTCAGCA-GCCTCAGCAAGTGCTTCCACATG-CA-CACAGCCGTGAAGGAGTTCAGCAATCAA-CATTTCATTCCCAATTTGTTAATCA-GTCTGGAAATTC-A-GGCACCC-AA-A-CAAATGCGTATAATGCTCC-TGGCACAAGTGTAGAGTATGGTATGCGTTGTATGCCCACAGAAATGCGCCGTTAATTCCTTCAGGATTATAAATGAATTCTACCACTTTCAGTTCATCGCGCGTGGAGATAATAAACCCCATGCTGTCAATTTAATTTCTGCCATCACTAATTGGATGTTCAACTTGTTTACTCACTGAC-AATTAACACCGTTATTTACTTGTGAATAATATTTAGATTCCCACAATGTTCTCATGCGCTTTCTCTACCTCTCATCTTCACTCAATGCTTTATTAAATTAATTTCATTTGGGTACTCACTACACTTGTACTCAATACCATTACGTTTATGTGAAATTAACATGCTCAAACAGAGCACCATCTTCCATTGTTAACTTGGTTGACTGTACTTAG-TTGTATTCCGGTGTCCNCCTGNAACAGGCTGTCTTGCGCTTCATTGTTTTATTGGTATATTAAATGAAGTTTAGTGCGTAATCTTTTGTTCATACAGTTTCGTGCTGCAGAACAATATCAAGCAAATTCTTGTAGTGAGCAGTTTTCAATATTACTCAGGTACTTCAGAACTGTCAATCGAATTGCTTGCAGTATTATAATTGCCACTTAATATCTCTTTTGTTCGATCATTTTTGTTATACACAATGCTGATGGCTATTTATGTGGTGGTACACCCGTTCGAGTAGAAATCCTAGACACTCAAGGAATTAAATTATCAACACGATATGTGACACCCAAATGAAATGACTTAATTTATCCTGGAATTGGACATTTGTCACACAATATTATATCAAAGTAGTCGTGCAATCTGTTCCCTGTGCGATATGTTTCTTTGTTTTAATGTGTACTTCAAATGGCTCTGAATAATT]

[+] EMBL CD201500             [CGTTTGCGCCACTGGTCTTGGACTTTTGGAGGCATTTAGTCGGTCGGATTTTTGCAGATGGAGTCAAGGAAGGTCTCTTTGAGTGCTAATGCTTTGATTGGAGGCAAATGGAGACTTGTACGAAAAATCGGCGGTGGTTCATTCGGTGATATATATCTTGGACAAAATATGTTAACTGGGGATGAAGTTGCAATTAAATTAGAGCCTGTGACTGCCCGACATCCTCAACTGCTTTACGAGAGCCGAGTTTATCGAGTTTTACAAAACTCATCAGGAGTGCCACGGGTTTATTGGTTCGGACCTGATGGTGTAAGTAATCGTTACAAAGCCATGGTTATGGATTTACTCGGTCCAAGTCTTGAAGACTTATTTACTTTTTGTGGACGTAGATTTTCAGCAAAAACGGTGTTAACTCTAGCGGAACAGATGTTGTGGCGCATCGAATGTGTTCATTATAGAGGTCTTATTCATAGGGACATCAAGCCTGACAACTTCTTGATGGGGATCGGTCCACACTGNCACAGAGTGTTCATTGTAGATTTTGGATT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          ]
[+] EMBL CD186112             [                             AGGCATTTAGTCGGTCGGATTTTTGCAGATGGAGTCAAGGAAGGTCTCTTTGAGTGCTAATGCTTTGATTGGAGGCAAATGGAGACTTGTACGAAAAATCGGCGGTGGTTCATTCGGTGATATATATCTTGGACAAAATATGTTAACTGGGGATGAAGTTGCAATTAAATTAGAGCCTGTGACTGCCCGACATCCTCAACTGCTTTACGAGAGCCGAGTTTATCGAGTTTTACAAAACTCATCAGGAGTGCCACGGGTTTATTGGTTCGGACCTGATGGTGTAAGTAATCGTTACAAAGCCATGGTTATGGATTTACTCGGTCCAAGTCTTGAAGACTTATTTACTTTTTGTGGACGTAGATTTTCAGCAAAAACGGTGTTAACTCTAGCGGAACAGATGTTGTGGCGCATCGAATGTGTTCATTATAGAGGTCTTATTCATAGGGACATCAAGCCTGACAACTTCTTGATGGGGATCG                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  ]
[+] EMBL CD080491             [                          gaggGGCATTTAGTCGGTCGGATTTTTGCAGATGGAGTCAAGGAAGGTCTCTTTGAGTGCTAATGCTTTGATTGGAGGCAAATGGAGACTTGTACGAAAAATCGGCGGTGGTTCATTCGGTGATATATATCTTGGACAAAATATGTTAACTGGGGATGAAGTTGCAATTAAATTAGAGCCTGTGACTGCCCGACATCCTCAACTGCTTTACGAGAGCCGAGTTTATCGAGTTTTACAAAACTCATCAGGAGTGCCACGGGTTTATTGGTTCGGACCTGATGGTGTAAGTAATCGTTACAAAGCCATGGTTATGGATTTACTCGGTCCAAGTCTTGAAGACTTATTTACTTTTTGTGGACGTAGATTTTCAGCAAAAACGGTGTTAACTCTAGCGGAACAGATGTTGTGGCGCATCGAATGTGTTCATTATAGAGGTCTTATTCATAGGGACATCAAGCCTGACAACTTCTTGATGGGGATCGGTCCACACTGCAACAGAGTGTTCATTGTAGATTTTGGATTAGCCAAAAGATTCAGAGATCATAGAACGAAATGCCACATTCCATATAGGGATGATAAGAA TTAACAGGTACAGCACGTTATGCTAGCATANATGCGCATGCTGGTATCGAGCA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        ]
[+] EMBL CD118719             [                                                                                                                                                                                                                                     TGCTTTACGAGAGCCGAGTTTATCGAGTTTTACAAAACTCATCAGGAGTGCCACGGGTTTATTGGTTCGGACCTGATGGTGTAAGTAATCGTTACAAAGCCATGGTTATGGATTTACTCGGTCCAAGCCTTGAAGACTTATTTACTTTTTGTGGACGTAGATTTTCAGCAAAAACGGTGTTAACTCTAGCGGAACAGATGTTGTGGCGCATCGAATGTGTTCATTATAGAGGTCTTATTCATAGGGACATCAAGCCTGACGACTTCTTGATGGGGATCGGTCCACACTGCAACAGAGTGTTCATTGTAGATTTTGGATTAGCCAAAAGATTCAGAGATCATAGAACGAAATGCCACATTCCATATAGGGATGATAAGAATTTAACAGGTACAGCACGTTATGCTAGCATAAATGCGCATGCTGGTATCGAGCAATCTAGACGTGATGATATTGAATCTCTTGGATATGTTTTTATGTATTTTCTCAGAGGACACCTTCCGTGGCAAGGACTAAAGGCAAATACTAAAAAGCAAAAGTACGAACGTATATATGAGAAGAAACTAGCTACGTCACCTGAAGCCCTATGTAAAGGTTATCCTGTAG                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              ]
[+] EMBL CD097333             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                   TGGTTCGGACCTGATGGTGTAAGTAATCGTTACAAAGCCATGGTTATGGATTTACTCGGTCCAAGTCTTGAAGACTTATTTACTTTTTGTGGACGTAGATTTTCAGCAAAAACGGTGTTAACTCTAGCGGAACAGATGTTGTGGCGCATCGAATGTGTTCATTATAGAGGTCTTATTCATAGGGACATCAAGCCTGACAACTTCTTGATGGGGATCGGTCCACACTGCAACAGAGTGTTCATTGTAGATTTTGGATTAGCCAAAAGATTCAGAGATCATAGAACGAAATGCCACATTCCATATAGGGATGATAAGAATTTAACAGGTACAGCACGTTATGCTAGCATAAATGCGCATGCTGGTATCGAGCAATCTAGACGTGATGATATTGAATCTCTTGGATATGTTTTTATGTATTTTCTCAGAGGACACCTTCCGTGGCAAGGACTAAAGGCAAATACTAAAAAGCAAAAGTACGAACGTATATATGAGAAGAAACTAGCTACGTCACCTGAAGCCCTATG                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               ]
[+] EMBL CD164044             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             ACGAAATGCCACATTCCATATAGGGATGATAAGAATTTAACAGGTACAGCACGTTATGCTAGCATAAATGCGCATGCTGGTATCGAGCAATCTAGACGTGATGATGTTGAATCTCTTGGATATGTTTTTATGTATTTTCTCAGAGGACACCTTCCGTGGCAAGGACTAAAGGCAAATACTAAAAAGCAAAAGTACGAACGTATATATGAGAAGAAACTAGCTACGTCACCTGAAGCCCTATGTAAAGGTTATCCTGTAGAATTCGAAAAATATTTGCATTTCGCTCGTGGTCTAGCTTTTGACAACCTTCCGGACT ATGTATTTTTAAGAGGAATTTTCCGCCGTTTGTTTCAAAGCCTCAATTTTGTTCTCGACTATGTTTATGACTGGGCACTTCTGGGTACAAATTCG                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     ]
[-] EMBL CD164066             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              CGAAATGCCACATTCCATATAGGGATGATAAGAATATAACAGGTACAGCACGTTATGCTAGCATAAATGCGCATGCTGGTATCGAGCAATCTAGACGTGATGATATTGAATCTCTTGGATATGTTTTTATGTATTTTCTCAGAGGACACCTTCCGTGGCAAGGACTAAAGGCAAATACTAAAAAGCAAAAGTACGAACGTATATATGAGAAGAAACTAGCTACGTCACCTGAAGCCCTATGTAAAGGTTATCCTGTAGAATTCGAAAAATATTTGCATTTCGCTCGTGGTCTAGCTTTTGACAGCCTTCCGGACT ATGTATTTTTAAGAGGAATTTTCCGCCGTTTGTTTCAAAGCCTCAATTTTGTTCTCGACTATGTTTATGACTGGGCACTTCTGGGTACAAATTCGT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    ]
[-] EMBL CD112628             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         AGCATAAATGCGCATGCTGTTATCGAGCAATCTAGACGTGATGATATTGAATCTCTTGGATATGTTTTTATGTATTTTCTCAGAGGACACCTTCCGTGGCAAGGACTAAAGGCAAATACTAAAAAGCAAAAGTACGAACGTATATATGAGAAGAAACTAGCTACGTCACCTGAAGCCCTATGTAAAGGTTATCCTGTAGAATTCGAAAAATATTTGCATTTCGCTCGTGGTCTAGCTTTTGACAGCCTTCCGGACT ATGTATTTTTAAGAGGAATTTTCCGCCGTTTGTTTCAAAGCCTCAATTTTGTTCTCGACTATGTTTATGACTGGGCACTTCTGGGTACAAATTCGTCTAATACTAGTCAGTCAATAATGAATGCTAATCCAGAGTGTGAAGATAATGCGAATCAGCATCAAAATAATGCAGAATGTCAGG                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                ]
[-] EMBL CD178198             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 TGCGCATGCTGGCATCGAGCAATCTAGACGTGATGATATTGAATCTCTTGGATATGTTTGGAGGTATTTTCTCAGAGGACACCTTCCGTGGCAAGGACTAAAGGCAAATACTAAAAAGCAAAAGTACGAACGTATATATGAGAAGAAACTAGCTACGTCACCTGAAGCCCTATGTAAAGGTTATCCTGTAGAATTCGAAAAATATTTGCATTTCGCTCGTGGTCTAGC                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         ]
[-] EMBL CD163958             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               ACACCTTCCGTGGCAAGGACTAAAGGCAAATACTAAAAAGCAAAAGTACGAACGTATATATGAGAAGAAACTAGCTACGTCACCTGAAGCCCTATGTAAAGGTTATCCTGTAGAATTCGAAAAATATTTGCATTTCGCTCGTGGTCTAGCTTTTGACAGCCTTCCGGACTNATGTATTTTTAAGAGGAATTTTCCGCCGTTTGTTTCAAAGCCTCAATTTTGTACTCGACTATGTTTATGACTGGGCACTTCTGGGTACAAATTCGT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    ]
[-] EMBL CD073766             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        T ATGTATTTTTAAGAGGAATTTTCCGCCGTTTGTTTCAAAGCCTCAATTTTGTTCTCGACTATGTTTATGACTGGGCACTTCTGGGTACAAATTCGTCTAATACTAGTCAGTCAATAATGAATGCTAATCCAGAGTGTGAAGATAATGCGAATCAGCATCAAAATAATGCAGAATGTCAGGGAATCGATAGCACAGTGGGGGCAGCTCAATGTGCGCTCC CAGCACCTCAAGTATATGGAAATCATAACCATCA TAATATACCTGTTCAGCA GCCTCAGCAAGTGCTTCCACATG CA CACAGCCGTGAAGGAGTTCAGCAATCAA CATTTCATTCCCAATTTGTTAATCA GTCTGGAAATTC A GGCACCC AA A CAAATGCGTATAATGCTCC TGGCACAAGTGTAGAGTATGGTATGCGTTGTATGCCCACAGAAATGCGCCGTTAATTCCTTCAGGATTATAAATGAATTTTACCACTTTCAGTTCATCGCGCGTGGAGATAATAAACCCCATGCTGTCAATTTAATTTCTGCCATCACTAATTGGATGTTCAACTTGTTTACTCACTGAC AATTAGCACCGTTATTTACTTGTAAATAATATTTA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        ]
[+] EMBL CD123228             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          TTGTTCTCGACTATGTTTATGACTGGGCACTTCTGGGTACAAATTCGTCTAATACTAGTCAGTCAATAATGAATGCTAATCCAGAGTGTGAAGATAATGCGAATCAGCATCAAAATAATGCAGAATGTCAGGGAATCGATAGCACAGTGGGGGCAGCTCAATGTGCGCTCC CAGCACCTCAAGTATATGGAAATCATAACCATCA TAATATACCTGTTCAGCA GCCTCAGCAAGTGCTTCCACATG                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           ]
[+] EMBL CD083494             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   TGCTAATCCAGAGTGTGAAGAT ATGCGAATCAGCATCAAAATAATGCAGAATGTCAGGGAATCGATAGCACAGTGGGGGCAGCTCAATGTGCGCTCC CAGCACCTCAAGTATATGGAAATCATAACCATCA TAATATACCTGTTCAGCA GCCTCAGCAAGTGCTTCCACATG CA CACAGCCGTGAAGGAGTTCAGCAATCAA CATTTCATTCCCAATTTGTTAATCA GTCTGGAAATTC A GGCACCC AA A CAAATGCGTATAATGCTCC TGGCACAAGTGTAGAGTATGGTATGCGTTGTATGCCCACAGAAATGCGCCGTTAATTCCTTCAGGATTATAAATGAATTCTACCAC TTCAGTTCATCGCGCGTGGAGATAATAAACCCCATGCTGTCAATTTAATTTCTGCCATCACTAATTGGATGTTCAACTT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          ]
[+] EMBL CD061837             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           cGGGAATCGATAGCACAGTGGGGGCAGCTCAATGTGCGCTCCGCAGCACCTCAAGTATATGGAAATCATAACCATCAGTAATATACCTGTTCAGCA GCCTCAGCAAGTGCTTCCACATG CA CACAGCCGTGAAGGAGTTCAGCAATCAAGCATTTCATTCCCAATTTGTTACTCA GTCTGGAAATTC A GGCACCC AA A CAAATGCGTATAATGCTCCGTGGCACAAGTGTAGAGTATGGTATGCGTTGTATGCCCACAGACATGCGCCGTTGATTCCTTCAGGATTATAAATGAATTCTACCACTTTCAGTTCATCGCGCGTGGAGATAATAAACCCCATGCTGTCAATTGAATTTCTGCCATCACTAATTGGA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    ]
[+] EMBL CD061853             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            GTGGGGGCAGCTCAATGTGCGCTCC CAGCACCTCAAGTATATGGAAATCATAACCATCA TAATATACCTGTTCAGCA GCCTCAGCAAGTGCTTCCACATG CA CACAGCCGTGAAGGAGTTCAGCAATCAA CATTTCATTCCCAATTTGTTAATCA GTCTGGAAATTC A GGCACCC AA A CAAATGCGTATAATGCTCC TGGCACAAGTGTAGAGTATGGTATGCGTTGTATGCCCACAGAAATGCGCCGTTAATTCCTTCAGGATTATAAATGAATTCTACCACTTTCAGTTCATCGCGCGTGGAGATAATAAACCCCATGCTGTCAATTTAATTTCTGCCATCACTAATTGGATGTTCAACTTGTTTACTCACTGAC AATTAACACCGTTATTTACTTGTGA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  ]
[+] EMBL CD061731             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           gtTGGAGGCAGATCAATGTGCGCTCC CAGCACCTCAAGTATATGGAAATCATAACCATCA TAATATACCTGTTCAGCAGGCCTCAGCAAGTGCTTCCACATGACATCACAGACGTGAAGGAGTACAGCAATCAA GATTTCATTCCCAATTAGTTAATCACGTCTGGAAATTCTAGGGCACCCGAAGATCAAATGCGTATAATGCTCC TGGCACAAGTGTAGAGTATGGTATGCGTTGTATGCCCACAGAAATGCGCCGTTAATTCCTTCAGGATTATAAATGAATTCTACCACTTTCAGTTCATCGCGCGTGGAGATAATAAACCCCATGCTGTCAATTTAATTTCTGCCATCACTAATTGGATGTTCAACTTGTTTACTCACTGAC AATTAACACCGTTATTTACTTGTGA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  ]
[-] EMBL CD061866             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             TGGGGNCAGCTCAATGTGCGCTCC CAGCACCTCAAGTATATGGAAATCATAACCATCA TAATATACCTGTTCAGCA GCCTCAGCAAGTGCTTCCACATG CA CACAGCCGTGAAGGAGTTCAGCAATCAA CATTTCATTCCCAATTTGTTAATCA GTCTGGAAATTC A GGCACCC AA A CAAATGCGTATAATGCTCC TGGCACAAGTGTAGAGTATGGTATGCGTTGTATGCCCACAGAAATGCGCCGTTAATTCCTTCAGGATTATAAATGAATTCTACCACTTTCAGTTCATCGCGCGTGGAGATAATAAACCCCATGCTGTCAATTTAATTTCTGCCATCACTAATTGGATGTTCAACTTGTTTACTCACTGACGAATTAACACCGTTATTTACTTGTGAA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 ]
[-] EMBL CD062528             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             TGGGGTCAGCTCAATGTGCGCTCC CAGCACCTCAAGTATATGGAAATCATAACCATCA TAATATACCTGTTCAGCA GCCTCAGCAAGTGCTTCCACATG CA CACAGCCGTGAAGGAGTTCAGCAATCAA CATTTCATTCCCAATTTGTTAATCA GTCTGGAAATTC A GGCACCC AA A CAAATGCGTATAATGCTCC TGGCACAAGTGTAGAGTATGGTATGCGTTGTATGCCCACAGAAATGCGCCGTTAATTCCTTCAGGATTATAAATGAATTCTACCACTTTCAGTTCATCGCGCGTGGAGATAATAAACCCCATGCTGTCAATTTAATTTCTGCCATCACTAATTGGATGTTCAACTTGTTTACTCACTGAC AATTAACACCGTTA TTACTTGCG  TAATAT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           ]
[-] EMBL CD061935             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             TGGGGGCAGCTCAATGTGCGCTCC CAGCACCTCAAGTATATGGAAATCATAACCATCA TAATATACCTGTTCAGCA GCCTCAGCAAGTGCTTCCACATG CA CACAGCCGTGAAGGAGTTCAGCAATCAA CATTTCATTCCCAATTTGTTAATCA GTCTGGAAATTC A GGCACCC AA A CAAATGCGTATAATGCTCC TGGCACAAGTGTAGAGTATGGTATGCGTTGTATGCCCACAGAAATGCGCCGTTAATTCCTTCAGGATTATAAATGAATTCTACCACTTTCAGTTCATCGCGCGTGGAGATAATAAACCCCATGCTGTCAATTTAATTTCTGCCATCACTAATTGGATGTTCAACTTGTTTACTCACTGAC AATTAACACCGTTATTTACTTGTGAATAATATTTAGATTCCCg                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                ]
[-] EMBL CD061967             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  GCAGCTCAATGTGCGCTCC CAGCACCTCAAGTATATGGAAATCATAACCATCA TAATATACCTGTTCAGCA GCCTCAGCAAGTGCTTCCACATG CA CACAGCCGTGAAGGAGTTCAGCAATCAA CATTTCATTCCCAATTTGTTAATCA GTCTGGAAATTC A GGCACCC AA A CAAATGCGTATAATGCTCC TGGCACAAGTGTAGAGTATGGTATGCGTTGTATGCCCACAGAAACGCGCCGTTAATTCCTTCAGGATTATAAATGAATTCTACCACTTTCAGTTCATCGCGCGTGGAGATAATAAACCCCATGCTGTCAATTTAATTTCTGCCATCACTAATTGGATGTTCAACTTG TTACTCACTGAC  AGTAACACCGT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               ]
[+] EMBL CD141240             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  TATATGGAAATCATAACCATCA TAATATACCTGTTCAGCA GCCTCAGCAAGTGCTTCCACATG CA CACAGCCGTGAAGGAGTTCAGCAATCAA CATTTCATTCCCAATTTGTTAATCA GTCTGGAAACTC A GGCACCC AA A CAAATGCGTACAATGCTCC TGGCACAAGTGTAGAGTATGGTATGCGTTGTATGCCCACAGAAATGCGCCGTTAATTCCTTCAGGATTATAAATGAATTCTACCACTTTCAGATCATCGCGCGAGGAGATAATAAACCCCATGCTGTCAATTTAATTTCTGCCATCACTAATTGGATGTTCAGCTTGTct                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      ]
[+] EMBL CD144891             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                AACCATCA TAATATACCTGTTCAGCA GCCTCAGCAAGTGCTTCCACATG CA CACAGCCGTGAAGGAGTTCAGCAATCAA CATTTCATTCCCAATTTGTTAATCA GTCTGGAAATTC A GGCACCC AA A CAAATGCGTATAATGCTCC TGGCACAAGTGTAGAGTATGGTATGCGTTGTATGCCCACAGAAATGCGCCGTTAATTCCTTCAGGATTATAAATGAATTCTACCACTTTCAGTTCATCGCGCGTGGAGATAATAAACCCCATGCTGTCAATTTAATTTCTGCCATCACTAATTGGATGTTCAACTTGTTTACTCACTGAC CATTAACACCGTTTTTTACTTGTGAATAATATTTAGATTCCCA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                ]
[-] EMBL CD201219             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 ACCATCA TAATATACCTGTTCAGCA GCCTCAGCAAGTGCTTCCACATG CA CACAGCCGTGAAGGAGTTCAGCAATCAA CATTTCATTCCCAATTTGTTAATCA GTCTGGAAATTC A GGCACCC AA A CAAATGCGTATAATGCTCC TGGCACAAGTGTAGAGTATGGTATGCGTTGTATGCCCACAGAAATGCGCCGTTAATTCCTTCAGGATTATAAATGAATTCTACCACTTTCAGTTCATCGCGCGTGGAGATAATAAACCCCATGCTGTCAATTTAATTTCTGCCATCACTAATTGGATGTTCAACTTGTTTACTCACTGAC AATTAACACCGTTATTTACTTGTGAATAATATTTAGATTCCCACAATGTTCTC                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      ]
[-] EMBL CD201221             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 ACCATCA TAATATACCTGTTCAGCA GCCTCAGCAAGTGCTTCCACATG CA CACAGCCGTGAAGGAGTTCAGCAATCAA CATTTCATTCCCAATTTGTTAATCA GTCTGGAAATTC A GGCACCC AA A CAAATGCGTATAATGCTCC TGGCACAAGTGTAGAGTATGGTATGCGTTGTATGCCCACAGAAATGCGCCGTTAATTCCTTCAGGATTATAAATGAATTCTACCACTTTCAGTTCATCGCGCGTGGAGATAATAAACCCCATGCTGTCAATTTAATTTCTGCCATCACTAATTGGATGTTCAACTTGTTTACTCACTGAC AATTAACACCGTTATTTACTTGTGAATAATATTTAGACTCCCACAATGTTCTC                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      ]
[+] EMBL CD194494             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  G CA CACAGCCGTGAAGGAGTTCAGCAATCAA CATTTCATTCCCAATTTGTTAATCA GTCTGGAAATTC A GGCACCC AA A CAAATGCGTATAATGCTCC TGGCACAAGTGTAGAGTATGGTATGCGTTGTATGCCCACAGAAATGCGCCGTTAATTCCTTCAGGATTATAAATGAATTCTACCACTTTCAGTTCATCGCGCGTGGAGATAATAAACCCCATGCTGTCAATTTAATTTCTGCCATCACTAATTGGATGTTCAACTTGTTTACTCACTGAC AATTAACACCGTTATTTACTTGTGAATAATATTTAGATTCCCACAATGTTCTCATGCGCTTTCTCTACCTCTCATCTTCACTCAATGCTTTATTAAATTAATTTCATTTGG                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            ]
[+] EMBL CD114831             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       CACAGCCGTGAAGGAGTTCAGCAATCAA CATTTCATTCCCAATTTGTTAATCA GTCTGGAAATTC A GGCACCC AA A CAAATGCGTATAATGCTCC TGGCACAAGTGTAGAGTATGGTATGCGTTGTATGCCCACAGAAATGCGCCGTTAATTCCTTCAGGATTATAAATGAATTCTACCACTTTCAGTTCATCGCGCGTGGAGATAATAAACCCCATGCTGTCAATTTAATTTCTGCCATCACTAATTGGATGTTCAACTTGTTTACTCACTGAC AATTAACACCGTTATTTACTTGTGAATAATATTTAGATTCCCA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                ]
[+] EMBL CD201250             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       CACAGCCGTGAAGGAGTTCAGCAATCAA CATTTCATTCCCAATTTGTTAATCA GTCTGGAAATTC A GGCACCC AA A CAAATGCGTATAATGCTCC TGGCACAAGTGTAGAGTATGGTATGCGTTGTATGCCCACAGAAATGCGCCGTTGATTCCTTCAGGATTATAAATGAATTCTACCACTTTCAGTTCATCGCGCGTGGAGATAATAAACCCCATGCTGTCAATTTAATTTCTGCCACCACTAATTGGATGTTCAACTTGTTTACTCACTGAC AATTAACACCGTTATTTACTTGTGAATAATATTTAGATTCCCA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                ]
[-] EMBL CD139117             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      GTTCAGCAATCAA CATTTCATTCCCAATTTGTTAATCA GTCTGGAAATTC A GGCACCC AA A CAAATGCGTATAATGCTCC TGGCACAAGTGTAGAGTATGGTATGCGTTGTATGCCCACAGAAATGCGCCGTTAATTCCTTCAGGATTATAAATGAATTCTACCACTTTCAGTTCATCGCGCGTGGAGATAATAAACCCCATGCTGTCAATTTAATTTCTGCCATCACTAATTGGATGTTCAACTTGTTTACTCACTGAC AATTAACACCGTTATTTACTTGTGAATAATATTTAGATTCCCACAATGTTCTCATGCGCTTTCTCTACCTCTCATCTTCACTCAATGCTTTATTAAATTAATTTCATTTGGGTACTCACTACACTTGTACTCAATACCATTACGTTTATGTGAAATTAACATGCTCAAACAGAGCACCATCTTCCATTGTTAACTTGGTTGACTGTGGTTAG TTGTAT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                ]
[-] EMBL CD139100             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      A A CAAATGCGTACAATGCTCC TGGCACAAGTGTAGAGTATGGTATGCGTTGTATGCCCACAGAAATGCGCCGTTAATTCCTTCAGGATTATAAATGAATTCTACCACTTTCAGTTCATCGCGCGTGGAGATAATAAACCCCATGCTGTCAATTTAATTTCTGCCATCACTAATTGGATGTTCAACTTGTTTACTCACTGAC AATTAACACCGTTATTTACTTGTGAATAATATTTAGATTCCCACAATGTTCTCATGCGCTTTCTCTACCTCTCATCTTCACTCAATGCTTTATTAAATTAATTTCATTTGGGTACTCACTACACTTGTACTCAATACCATTACGTTTATGTGAAATTAACATGCTCAAACAGAGCACCATCTTCCATTGTTAACTTGGTTGACTGTGGGAAGATTGTAT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                ]
[-] EMBL CD139212             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          TCC TGGCACAAGTGTAGAGTATGGTATGCGTTGTATGCCCACAGAAATGCGCCGTTAATTCCTTCAGGATTATAAATGAATTCTACCACTTTCAGTTCATCGCGCGTGGAGATAATAAACCCCATGCTGTCAATTTAATTTCTGCCATCACTAATTGGATGTTCAACTTGTTTACTCACTGAC AATTAACACCGTTATTTACTTGTGAATAATATTTAGATTCCCACAATGTTCTCATGCGCTTTCTCTACCTCTCATCTTCACTCAATGCTTTATTAAATTAATTTCATTTGGGTACTCACTACACTTGTACTCAATACCATTACGTTTATGTGAAATTAACATGCTCGAACAGAGCACCATCTTCCATTGTTAACTTGGTTGACTGTACTTAG TTGTAT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                ]
[-] EMBL CD194364             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  TAATTCCTTCAGGATTATAAATGAATTCTGCCACTTTCAGTTCATCGCGCGTGGAGATAATAAACCCCATGCTGTCAATTTAATTTCTGCCATCACTAATTGGATGTTCAACTTGTTTACTCACTGAC AATTAACACCGTTATTTACTTGTGAATAATATTTAGATTCCCACAATGTTCTCATGCGCTTTCTCTACCTCTCATCTTCACTCAATGCTTTATTAAATTAATTTCATTTGGGTACTCACTACACTTGTACTCAATACCATTACGTTTATGTGAAATTAACATGCTCAAACAGAGCACCATCTTCCATTGTTAACTTGGTTGACTGTACTTAG TTGTAT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                ]
[-] EMBL CD194347             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              cTTCTCTACCTCTCATCTTCACCCAAAGCTTTATTAAATTAATTTCATTTGGGTACTCACTACACTTGTACTCAATACCATTACGTTTATGTGAAATTAACATGCTCAAACAGAGCACCATCTTCCATTGTTAACTTGGTTGNCTGTACTTAG TTGTA TCCGGTGTCCNCCTGN                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                ]
[-] EMBL CD074403             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             TCTTCACTCAATGCTTTATTAAATTAATTTCATTTGGGTACTCACTACACTTGTACTCAATACCATTACGTTTATGTGAAATTAACATGCTCAAACAGAGCACCATCTTCCATTGTTAACTTGGTTGACTGTACTTAG TTGTATTCCGGTGTCCACTTTAAACAGGCTGTCTTGCGCTTCATTGTTTTATTGGTATATTAAATGAAGTTTAGTGCGTAATCTTTTGTTCATACAGTTTCGTGCTGCAGAACAATATCAAGCAAATTCTTGTAGTGAGCAGTTTTCAATATTACTCAGGTACTTCAGAACTGTCAATCGAATTGCTTGCAGTATTATAATTGCCACTTAATATCTCTTTTGTTCGATCATTTTTGTTATACACAATGCTGATGGCTATTTATGTGGTGGTACACCCGTTCGAGTAGAAATCCTAGACACTCAAGGAATTAAATTATCAACACGATATGTGACACCCAAATGAAATGACTTAATTTATCCTGGAATTGGACATTTGTCACACAATATTATATCAAAGTAGTCGTGCAATCTGTTCCCTGTGCGATATGTTTCTTTGTTTTAATGTGTACTTCAAATGGCTCTGAATAATT]




>consensus_11122#0
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GAGTCAAGGAAGGTCTCTTTGAGTGCTAATGCTTTGATTGGAGGCAAATGGAGACTTGTA
CGAAAAATCGGCGGTGGTTCATTCGGTGATATATATCTTGGACAAAATATGTTAACTGGG
GATGAAGTTGCAATTAAATTAGAGCCTGTGACTGCCCGACATCCTCAACTGCTTTACGAG
AGCCGAGTTTATCGAGTTTTACAAAACTCATCAGGAGTGCCACGGGTTTATTGGTTCGGA
CCTGATGGTGTAAGTAATCGTTACAAAGCCATGGTTATGGATTTACTCGGTCCAAGTCTT
GAAGACTTATTTACTTTTTGTGGACGTAGATTTTCAGCAAAAACGGTGTTAACTCTAGCG
GAACAGATGTTGTGGCGCATCGAATGTGTTCATTATAGAGGTCTTATTCATAGGGACATC
AAGCCTGACAACTTCTTGATGGGGATCGGTCCACACTGCAACAGAGTGTTCATTGTAGAT
TTTGGATTAGCCAAAAGATTCAGAGATCATAGAACGAAATGCCACATTCCATATAGGGAT
GATAAGAATTTAACAGGTACAGCACGTTATGCTAGCATAAATGCGCATGCTGGTATCGAG
CAATCTAGACGTGATGATATTGAATCTCTTGGATATGTTTTTATGTATTTTCTCAGAGGA
CACCTTCCGTGGCAAGGACTAAAGGCAAATACTAAAAAGCAAAAGTACGAACGTATATAT
GAGAAGAAACTAGCTACGTCACCTGAAGCCCTATGTAAAGGTTATCCTGTAGAATTCGAA
AAATATTTGCATTTCGCTCGTGGTCTAGCTTTTGACAGCCTTCCGGACTATGTATTTTTA
AGAGGAATTTTCCGCCGTTTGTTTCAAAGCCTCAATTTTGTTCTCGACTATGTTTATGAC
TGGGCACTTCTGGGTACAAATTCGTCTAATACTAGTCAGTCAATAATGAATGCTAATCCA
GAGTGTGAAGATAATGCGAATCAGCATCAAAATAATGCAGAATGTCAGGGAATCGATAGC
ACAGTGGGGGCAGCTCAATGTGCGCTCCCAGCACCTCAAGTATATGGAAATCATAACCAT
CATAATATACCTGTTCAGCAGCCTCAGCAAGTGCTTCCACATGCACACAGCCGTGAAGGA
GTTCAGCAATCAACATTTCATTCCCAATTTGTTAATCAGTCTGGAAATTCAGGCACCCAA
ACAAATGCGTATAATGCTCCTGGCACAAGTGTAGAGTATGGTATGCGTTGTATGCCCACA
GAAATGCGCCGTTAATTCCTTCAGGATTATAAATGAATTCTACCACTTTCAGTTCATCGC
GCGTGGAGATAATAAACCCCATGCTGTCAATTTAATTTCTGCCATCACTAATTGGATGTT
CAACTTGTTTACTCACTGACAATTAACACCGTTATTTACTTGTGAATAATATTTAGATTC
CCACAATGTTCTCATGCGCTTTCTCTACCTCTCATCTTCACTCAATGCTTTATTAAATTA
ATTTCATTTGGGTACTCACTACACTTGTACTCAATACCATTACGTTTATGTGAAATTAAC
ATGCTCAAACAGAGCACCATCTTCCATTGTTAACTTGGTTGACTGTACTTAGTTGTATTC
CGGTGTCCNCCTGNAACAGGCTGTCTTGCGCTTCATTGTTTTATTGGTATATTAAATGAA
GTTTAGTGCGTAATCTTTTGTTCATACAGTTTCGTGCTGCAGAACAATATCAAGCAAATT
CTTGTAGTGAGCAGTTTTCAATATTACTCAGGTACTTCAGAACTGTCAATCGAATTGCTT
GCAGTATTATAATTGCCACTTAATATCTCTTTTGTTCGATCATTTTTGTTATACACAATG
CTGATGGCTATTTATGTGGTGGTACACCCGTTCGAGTAGAAATCCTAGACACTCAAGGAA
TTAAATTATCAACACGATATGTGACACCCAAATGAAATGACTTAATTTATCCTGGAATTG
GACATTTGTCACACAATATTATATCAAAGTAGTCGTGCAATCTGTTCCCTGTGCGATATG
TTTCTTTGTTTTAATGTGTACTTCAAATGGCTCTGAATAATT

consensusID : consensus_11122#1
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 2
consensus length = 732
fasta sequence

                              [CTCCAGGCCAAAAATTCGGCACGAGGAGTCGGTCGGATTTTTGCAGATGGAGTCAAGGAAGGTCTCTTTGAGTGCTAATGCTTTGATTGGAGGCAAATGGAGACTTGTACGAAAAATCGGCGGTGGTTCATTCGGTGATATATATCTTGGACAAAATATGTTAACTGGGGATGAAGTTGCAATTAAATTAGAGCCTGTGACTGCCCGACATCCTCAACTGCTTTACGAGAGCCGAGTTTATCGAGTTTTACAAAACTCATCAGGAGTGCCACGGGTTTATTGGTTCGGACCTGATGGTGTAAGTAATCGTTACAAAGCCATGGTTATGGATTTACTCGGTCCAAGTCTTGAAGACTTATTTACTTTTTGTGGACGTAGATTTTCAGCAAAAACGGTGTTAACTCTAGCGGAACAGATGTTGTGGCGCATCGAATGTGTTCATTATAGAGGTCTTATTCATAGGGACATCAAGCCTGACAACTTCTTGATGGGGATCGGTCCACAC-TGCAACAGAGTGTTCATTGTAGATTTTGGATTAGCCAAAAGATTCAGAGATCATAGAACGAAATGCCACATTCCATATAGGGATGATAAGAATTTAACAGGTACAGCACGTTATGCTAGCATAAATGCGCATGCTGGTATCGAGCAATCTAGACGTGATGATATTGAATCTCTTGGATATGTTNNTATGTATTTTCTCAGAGGACACCTTCCGTGGNCAGGNNACTA]

[+] EMBL CD079497             [CTCCAGGCCAAAAATTCGGCACGAGGAGTCGGTCGGATTTTTGCAGATGGAGTCAAGGAAGGTCTCTTTGAGTGCTAATGCTTTGATTGGAGGCAAATGGAGACTTGTACGAAAAATCGGCGGTGGTTCATTCGGTGATATATATCTTGGACAAAATATGTTAACTGGGGATGAAGTTGCAATTAAATTAGAGCCTGTGACTGCCCGACATCCTCAACTGCTTTACGAGAGCCGAGTTTATCGAGTTTTACAAAACTCATCAGGAGTGCCACGGGTTTATTGGTTCGGACCTGATGGTGTAAGTAATCGTTACAAAGCCATGGTTATGGATTTACTCGGTCCAAGTCTTGAAGACTTATTTACTTTTTGTGGACGTAGATTTTCAGCAAAAACGGTGTTAACTCTAGCGGAACAGATGTTGTGGCGCATCGAATGTGTTCATTATAGAGGTCTTATTCATAGGGACATCAAGCCTGACAACTTCTTGATGGGGATCGGTCCACAC TGCAACAGAGTGTTCATTGTAGATTTTGGATTAGCCAAAAGATTCAGAGATCATAGAACGAAATGCCACATTCCATATAGGGATGATAAGAATTTAACAGGTACAGCACGTTATGCTAGCATAAATGCGCATGCTGGTATCGAGCAATCTAGACGTGATGATATTGAATCTCTTGGATATGTTNNTATGTATTTTCTCAGAGGACACCTTCCGTGGNCAGGNNACTA]
[+] EMBL CD159429             [                             CGGTCGGATTTTTGCAGATGGAGTCAAGGAAGGTCTCTTTGAGTGCTAATGCTTTGATTGGAGGCAAATGGAGACTTGTACGAAAAATCGGCGGTGGTTCATTCGGTGATATATATCTTGGACAAAATATGTTAACTGGGGATGAAGTTGCAATTAAATTAGAGCCTGTGACTGCCCGACATCCTCAACTGCTTTACGAGAGCCGAGTTTATCGAGTTTTACAAAACTCATCAGGAGTGCCACGGGTTTATTGGTTCGGACCTGATGGTGTAAGTAATCGTTACAAAGCCATGGTTATGGATTTACTCGGTCCAAGTCTTGAAGACTTATTTACTTTTTGTGGACGTAGATTTTCAGCAAAAACGGTGTTAACTCTAGCGGAACAGATGTTGTGGCGCATCGAATGTGTTCATTATAGAGGTCTTATTCATAGGGACATCAGGCCTGACAACTTCTTGATGGGGATCGGTCCACACTTGC ACAGAGTGTTCATTGTAGATTTTGG                                                                                                                                                                                                      ]




>consensus_11122#1
CTCCAGGCCAAAAATTCGGCACGAGGAGTCGGTCGGATTTTTGCAGATGGAGTCAAGGAA
GGTCTCTTTGAGTGCTAATGCTTTGATTGGAGGCAAATGGAGACTTGTACGAAAAATCGG
CGGTGGTTCATTCGGTGATATATATCTTGGACAAAATATGTTAACTGGGGATGAAGTTGC
AATTAAATTAGAGCCTGTGACTGCCCGACATCCTCAACTGCTTTACGAGAGCCGAGTTTA
TCGAGTTTTACAAAACTCATCAGGAGTGCCACGGGTTTATTGGTTCGGACCTGATGGTGT
AAGTAATCGTTACAAAGCCATGGTTATGGATTTACTCGGTCCAAGTCTTGAAGACTTATT
TACTTTTTGTGGACGTAGATTTTCAGCAAAAACGGTGTTAACTCTAGCGGAACAGATGTT
GTGGCGCATCGAATGTGTTCATTATAGAGGTCTTATTCATAGGGACATCAAGCCTGACAA
CTTCTTGATGGGGATCGGTCCACACTGCAACAGAGTGTTCATTGTAGATTTTGGATTAGC
CAAAAGATTCAGAGATCATAGAACGAAATGCCACATTCCATATAGGGATGATAAGAATTT
AACAGGTACAGCACGTTATGCTAGCATAAATGCGCATGCTGGTATCGAGCAATCTAGACG
TGATGATATTGAATCTCTTGGATATGTTNNTATGTATTTTCTCAGAGGACACCTTCCGTG
GNCAGGNNACTA

consensus multiple alignement with clustalw

CLUSTAL W (1.82) multiple sequence alignment


consensus_11122#0      CGTTTGCGCCACTGGTCTTGGACTTTTGGAGGCATTTAGTCGGTCGGATTTTTGCAGATG 60
consensus_11122#1      ---------CTCCAGGCCAAAAATTC--GGCACGAGGAGTCGGTCGGATTTTTGCAGATG 49
                                * *  * *    * **   *   *    ***********************

consensus_11122#0      GAGTCAAGGAAGGTCTCTTTGAGTGCTAATGCTTTGATTGGAGGCAAATGGAGACTTGTA 120
consensus_11122#1      GAGTCAAGGAAGGTCTCTTTGAGTGCTAATGCTTTGATTGGAGGCAAATGGAGACTTGTA 109
                       ************************************************************

consensus_11122#0      CGAAAAATCGGCGGTGGTTCATTCGGTGATATATATCTTGGACAAAATATGTTAACTGGG 180
consensus_11122#1      CGAAAAATCGGCGGTGGTTCATTCGGTGATATATATCTTGGACAAAATATGTTAACTGGG 169
                       ************************************************************

consensus_11122#0      GATGAAGTTGCAATTAAATTAGAGCCTGTGACTGCCCGACATCCTCAACTGCTTTACGAG 240
consensus_11122#1      GATGAAGTTGCAATTAAATTAGAGCCTGTGACTGCCCGACATCCTCAACTGCTTTACGAG 229
                       ************************************************************

consensus_11122#0      AGCCGAGTTTATCGAGTTTTACAAAACTCATCAGGAGTGCCACGGGTTTATTGGTTCGGA 300
consensus_11122#1      AGCCGAGTTTATCGAGTTTTACAAAACTCATCAGGAGTGCCACGGGTTTATTGGTTCGGA 289
                       ************************************************************

consensus_11122#0      CCTGATGGTGTAAGTAATCGTTACAAAGCCATGGTTATGGATTTACTCGGTCCAAGTCTT 360
consensus_11122#1      CCTGATGGTGTAAGTAATCGTTACAAAGCCATGGTTATGGATTTACTCGGTCCAAGTCTT 349
                       ************************************************************

consensus_11122#0      GAAGACTTATTTACTTTTTGTGGACGTAGATTTTCAGCAAAAACGGTGTTAACTCTAGCG 420
consensus_11122#1      GAAGACTTATTTACTTTTTGTGGACGTAGATTTTCAGCAAAAACGGTGTTAACTCTAGCG 409
                       ************************************************************

consensus_11122#0      GAACAGATGTTGTGGCGCATCGAATGTGTTCATTATAGAGGTCTTATTCATAGGGACATC 480
consensus_11122#1      GAACAGATGTTGTGGCGCATCGAATGTGTTCATTATAGAGGTCTTATTCATAGGGACATC 469
                       ************************************************************

consensus_11122#0      AAGCCTGACAACTTCTTGATGGGGATCGGTCCACACTGCAACAGAGTGTTCATTGTAGAT 540
consensus_11122#1      AAGCCTGACAACTTCTTGATGGGGATCGGTCCACACTGCAACAGAGTGTTCATTGTAGAT 529
                       ************************************************************

consensus_11122#0      TTTGGATTAGCCAAAAGATTCAGAGATCATAGAACGAAATGCCACATTCCATATAGGGAT 600
consensus_11122#1      TTTGGATTAGCCAAAAGATTCAGAGATCATAGAACGAAATGCCACATTCCATATAGGGAT 589
                       ************************************************************

consensus_11122#0      GATAAGAATTTAACAGGTACAGCACGTTATGCTAGCATAAATGCGCATGCTGGTATCGAG 660
consensus_11122#1      GATAAGAATTTAACAGGTACAGCACGTTATGCTAGCATAAATGCGCATGCTGGTATCGAG 649
                       ************************************************************

consensus_11122#0      CAATCTAGACGTGATGATATTGAATCTCTTGGATATGTTTTTATGTATTTTCTCAGAGGA 720
consensus_11122#1      CAATCTAGACGTGATGATATTGAATCTCTTGGATATGTTNNTATGTATTTTCTCAGAGGA 709
                       ***************************************  *******************

consensus_11122#0      CACCTTCCGTGGCAAGGACTAAAGGCAAATACTAAAAAGCAAAAGTACGAACGTATATAT 780
consensus_11122#1      CACCTTCCGTGGNCAGGNNACTA------------------------------------- 732
                       ************  ***     *                                     

consensus_11122#0      GAGAAGAAACTAGCTACGTCACCTGAAGCCCTATGTAAAGGTTATCCTGTAGAATTCGAA 840
consensus_11122#1      ------------------------------------------------------------
                                                                                   

consensus_11122#0      AAATATTTGCATTTCGCTCGTGGTCTAGCTTTTGACAGCCTTCCGGACTATGTATTTTTA 900
consensus_11122#1      ------------------------------------------------------------
                                                                                   

consensus_11122#0      AGAGGAATTTTCCGCCGTTTGTTTCAAAGCCTCAATTTTGTTCTCGACTATGTTTATGAC 960
consensus_11122#1      ------------------------------------------------------------
                                                                                   

consensus_11122#0      TGGGCACTTCTGGGTACAAATTCGTCTAATACTAGTCAGTCAATAATGAATGCTAATCCA 1020
consensus_11122#1      ------------------------------------------------------------
                                                                                   

consensus_11122#0      GAGTGTGAAGATAATGCGAATCAGCATCAAAATAATGCAGAATGTCAGGGAATCGATAGC 1080
consensus_11122#1      ------------------------------------------------------------
                                                                                   

consensus_11122#0      ACAGTGGGGGCAGCTCAATGTGCGCTCCCAGCACCTCAAGTATATGGAAATCATAACCAT 1140
consensus_11122#1      ------------------------------------------------------------
                                                                                   

consensus_11122#0      CATAATATACCTGTTCAGCAGCCTCAGCAAGTGCTTCCACATGCACACAGCCGTGAAGGA 1200
consensus_11122#1      ------------------------------------------------------------
                                                                                   

consensus_11122#0      GTTCAGCAATCAACATTTCATTCCCAATTTGTTAATCAGTCTGGAAATTCAGGCACCCAA 1260
consensus_11122#1      ------------------------------------------------------------
                                                                                   

consensus_11122#0      ACAAATGCGTATAATGCTCCTGGCACAAGTGTAGAGTATGGTATGCGTTGTATGCCCACA 1320
consensus_11122#1      ------------------------------------------------------------
                                                                                   

consensus_11122#0      GAAATGCGCCGTTAATTCCTTCAGGATTATAAATGAATTCTACCACTTTCAGTTCATCGC 1380
consensus_11122#1      ------------------------------------------------------------
                                                                                   

consensus_11122#0      GCGTGGAGATAATAAACCCCATGCTGTCAATTTAATTTCTGCCATCACTAATTGGATGTT 1440
consensus_11122#1      ------------------------------------------------------------
                                                                                   

consensus_11122#0      CAACTTGTTTACTCACTGACAATTAACACCGTTATTTACTTGTGAATAATATTTAGATTC 1500
consensus_11122#1      ------------------------------------------------------------
                                                                                   

consensus_11122#0      CCACAATGTTCTCATGCGCTTTCTCTACCTCTCATCTTCACTCAATGCTTTATTAAATTA 1560
consensus_11122#1      ------------------------------------------------------------
                                                                                   

consensus_11122#0      ATTTCATTTGGGTACTCACTACACTTGTACTCAATACCATTACGTTTATGTGAAATTAAC 1620
consensus_11122#1      ------------------------------------------------------------
                                                                                   

consensus_11122#0      ATGCTCAAACAGAGCACCATCTTCCATTGTTAACTTGGTTGACTGTACTTAGTTGTATTC 1680
consensus_11122#1      ------------------------------------------------------------
                                                                                   

consensus_11122#0      CGGTGTCCNCCTGNAACAGGCTGTCTTGCGCTTCATTGTTTTATTGGTATATTAAATGAA 1740
consensus_11122#1      ------------------------------------------------------------
                                                                                   

consensus_11122#0      GTTTAGTGCGTAATCTTTTGTTCATACAGTTTCGTGCTGCAGAACAATATCAAGCAAATT 1800
consensus_11122#1      ------------------------------------------------------------
                                                                                   

consensus_11122#0      CTTGTAGTGAGCAGTTTTCAATATTACTCAGGTACTTCAGAACTGTCAATCGAATTGCTT 1860
consensus_11122#1      ------------------------------------------------------------
                                                                                   

consensus_11122#0      GCAGTATTATAATTGCCACTTAATATCTCTTTTGTTCGATCATTTTTGTTATACACAATG 1920
consensus_11122#1      ------------------------------------------------------------
                                                                                   

consensus_11122#0      CTGATGGCTATTTATGTGGTGGTACACCCGTTCGAGTAGAAATCCTAGACACTCAAGGAA 1980
consensus_11122#1      ------------------------------------------------------------
                                                                                   

consensus_11122#0      TTAAATTATCAACACGATATGTGACACCCAAATGAAATGACTTAATTTATCCTGGAATTG 2040
consensus_11122#1      ------------------------------------------------------------
                                                                                   

consensus_11122#0      GACATTTGTCACACAATATTATATCAAAGTAGTCGTGCAATCTGTTCCCTGTGCGATATG 2100
consensus_11122#1      ------------------------------------------------------------
                                                                                   

consensus_11122#0      TTTCTTTGTTTTAATGTGTACTTCAAATGGCTCTGAATAATT 2142
consensus_11122#1      ------------------------------------------