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Schistosoma mansoni
cluster # 11157 cluster # 11157       Sequences # 36       consensus # 6


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_11157#0 length = 1096 sequences # 4  
consensus_11157#1 length = 859 sequences # 1  
consensus_11157#2 length = 843 sequences # 28  
consensus_11157#3 length = 762 sequences # 1  
consensus_11157#4 length = 391 sequences # 1  
consensus_11157#5 length = 107 sequences # 1  

consensusID : consensus_11157#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 4
consensus length = 1096
fasta sequence
                              [TTCGGCACGAGCNTGAAACTTAGGCATATATACATACCGCTTTTACAGTC-GGCTT-AGCCGCTTCC-AGCTGGTTTAGTTGTTTTCATGATTAGTGCATTTTTTCATGAAATACTTGTTTCGGTCCCATTGAAAATGCTAAGATTCTGGGCCTTCTTTGGTATGCTAAGTCAAGTACCATATGCCTACATAGTTTCACTCTTATTCCCAAATGGTGGTCAAGGTGGTAACTTAGCCGTATGGCTTACGTTAATAATTGGTCAACCATTAGCTATTCTCGCTTATTTCCATGACTATTTCATAACACATTATAATGTTGGTGGAATATAAACAACTACAATCAATAAATCAGTAAATAAGATTTTTTGTTATTTGGTTTTTTTTGATATTCTTTCCTTACTCGTTGTACAGTGAAGACTTATCCATTTAATTAGATATTTACACTCGACTATATCAATGTTGTTTTTTTGACTAGTAATTAATGGGTTGCTCATTTTTAATGTTGACTAGTTTGTCGATTGATAACTGTTAAATTCCTAAAAGTGATTGTCTGGTTATTCATTATCCTATCTATGCCATTCAACTTTCTTGCCTAACTTTCCTTTTTCTTGCTTGTCGTTTCTCCTAGTTCTGGCTATTTTTTATTCTGGTGTACAAATACTATTAAAGCAACGAAAAACTCTTGTCATTAATCTAATTTTTTGCTTCTATTCTTATCATTGTAATTTATTTTCCCTTTCAATTGAATTTTTACTTTTGATGTCATTACAACCATACTGTCGGTACAATGTGTTTAATTGATTCAGTATCTGTGTTAGTGTTAACTATTTATAAATATTATTCTT-A-CACATAAAAGTTTGTGAACAAAAGTTCATATTTTTAGGTTGGATTTATGGCATCAGTGCTTTCAGATACGAAAAATAGAGAAGTAAAAGCGTTTTTCATTCCATTTGGAACTATTTGAAATGCTTGTAAGAACTTTTGTTTTAATTTGAACAGACAGTTTCAGAGTATTTGGGTCCCTAGTCAATGTAGGACATTAAAAAGGAAACTATATTTGTAAAAATTTTCATCGTTTCAAGTTAAAATAAATCCAATG]

[+] EMBL CD081174             [TTCGGCACGAGCNTGAAACTTAGGCATATATACATACCGCTTTTACAGTC GGCTT AGCCGCTTCC AGCTGGTTTAGTTGTTTTCATGATTAGTGCATTTTTTCATGAAATACTTGTTTCGGTCCCATTGAAAATGCTAAGATTCTGGGCCTTCTTTGGTATGCTAAGTCAAGTACCATATGCCTACATAGTTTCACTCTTATTCCCAAATGGTGGTCAAGGTGGTAACTTAGCCGTATGGCTTACGTTAATAATTGGTCAACCATTAGCTATTCTCGCTTATTTCCATGACTATTTCATAACACATTATAATGTTGGTGGAATATAAACAACTACAATCAATAAATCAGTAAATAAGATTTTTTGTTATTTGGTTTTTTTTGATATTCTTTCCTTACTCGTTGTACAGTGAAGACTTATCCATTTAATTAGATATTTACACTCGACTATATCAATGTTGTTTTTTTGACTAGTAATTAATGGGTTGCTCATTTTTAATGTTGACTAGTTTGTCGATTGATAACTGTTAAATTCCTAAAAGTGATTGTCTGGTTATTCATTATCCTATCTATGCCATTCAACTTTCTTGCCTAACTTTCCTTTTTCTTGCTTGTCGTTTCTCCTAGTTCTGGCTATTTTTTATTCTGGTGTACAAATACTATTAAAGCAACGAAAAACTCTTGTCATTAATCTAATTTTTTGCTTCTATTCTTATCATTGTAATTTATTTTCCCTTT AATTGAATTTTTACTTTTGATGTCATTACAACCATACTGTCGGTACAATGTGTTTAATTGATTCAGTATCTGTGTTAGTGTTAACTATTTATAAATATTATTCTT A CACATAAna                                                                                                                                                                                                                                                    ]
[-] EMBL CD074997             [                             ATACATA CGNCTTTACAGTCAGGCTTCAGCCGCTTCCAAGCTGGTTTAGTTGTTTTCATGATTAGTGCATTTTTTCATGAAATACTTGTTTCGGTCCCATTGAAAATGCTAAGATTCTGGGCCTTCTTTGGTATGCTAAGTCAAGTACCATATGCCTACATAGTTTCACTCTTATTCCCAAATGGTGGTCAAGGTGGTAACTTAGCCGTATGGCTTACGTTAATAATTGGTCAACCATTAGCTATTCTCGCTTATTTCCATGACTATTTCATAACACATTATAATGTTGGTGGAATATAAACAACTACAATCAATAAATCAGTAAATAAGATTTTTTGTTATTTGGTTTTTTTTGATATTCTTTCCTTACTCGTTGTACAGTGAAGACTTATCCATTTAATTAGATATTTACACTCGACTATATCAATGTTGTTTTTTTGACTAGTAATTAATGGGTTGCTCATTTTTAATGTTGACTAGTTTGTCGATTGATAACTGTTAAATTCCTAAAAGTGATTGTCTGGTTATTCATTATCCTATCTATGCCATTCAACTTTCTTGCCTAACTTTCCTTTTTCTTGCTTGTCGTTTCTCCTAGTTCTGGCTATTTTTTATTCTGGTGTACAAATACTATTAAAGCAACGAAAAACTCTTGTCATTAATCTAATTTTTTGCTTCTATTCTTATCATTGTAATTTATTTTCCCTTTCAATTGAATTTTTACTTTTGATGTCATTACAACCATACTGTCGGTACAATGTGTTTAATTGAGACAGTATCTGTGTTAGTGTTAACTATTTATAAATATTATTCTA ACCACATAAAAG                                                                                                                                                                                                                                                   ]
[-] EMBL CD074751             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   ATGTTGACTAGTTTGTCGATTGATAACTGTTAAATTCCTAAAAGTGATTGTCTGGTTATTCATTATCCTATCTATGCCATTCAACTTTTTTGCCTAACTTTCCTTTTTCTTGCTTGTCGTTTCTCCTAGTTCTGGCTATTTTTTATTTTGGTGTACAAATACTATTAAAGCAACGAAAAACTCTTGTCATTAATCTAATTTTTTGCTTCTATTCTTATCATTGTAATTTATTTTCCCTTTCAATTGAATTTTTACTTTTGATGTCATTACAACCATACTGTCGGTACAATGTGTTTAATTGATTCAGGATCTGTGTTAGTGTTAACTATTTATAAATATTATTTTTAA CCCATAAAAGTTTGTGAACAAAAGTTCATATTTTTAGGTTGGATTTATGGCATCAGTGCTTTCAGATACGAAAAATAGAGAAGTAAAAGCGTTTTTCATTCCATTTGGAACTATTTGAAATGCTTGTAAGAACTTTTGTTTTAATTTGAACAGACAGTTTCAGAGTATTTGGGTCCCTAGTCAATGTAGGACATTAAAAAGGAAACTATATTTGTAAAAATTTTCATCGTTTCAAGTTAAAATAAATCCAATG]
[-] EMBL CD074752             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               CCTAGTTCTGGCTATTTTTTATTCTGGTGTACAAATACTATTAAAGCAACGAAAAACTCTTGTCATTAATCTAATTTTTTGCTTCTATTCTTATCATTGTAATTTATTTTCCCTTTCAATTGAATTTTTACTTTTGATGTCATTACAACCATACTGTCGGTACAATGTGTTTAATTGATTCAGGATCTGTGTTAGTGTTAACTATTTATAAATATTATTTTTAA CCCATAAAAGTTTGTGAACAAAAGTTCATATTTTTAGGTTGGATTTATGGCATCAGTGCTTTCAGATACGAAAAATAGAGAAGTAAAAGCGTTTTTCATTCCATTTGGAACTATTTGAAATGCTTGTAAGAACTTTTGTTTTAATTCGAACAGACAGTTTCAGAGTATTTGGGTCCCTAGTCAATGTAGGACATTAAAAAGGAAACTATATTTGTAAAAATTTTCATCGTTTCAAGTTAAAATAAATCCAATG]


>consensus_11157#0 TTCGGCACGAGCNTGAAACTTAGGCATATATACATACCGCTTTTACAGTCGGCTTAGCCG CTTCCAGCTGGTTTAGTTGTTTTCATGATTAGTGCATTTTTTCATGAAATACTTGTTTCG GTCCCATTGAAAATGCTAAGATTCTGGGCCTTCTTTGGTATGCTAAGTCAAGTACCATAT GCCTACATAGTTTCACTCTTATTCCCAAATGGTGGTCAAGGTGGTAACTTAGCCGTATGG CTTACGTTAATAATTGGTCAACCATTAGCTATTCTCGCTTATTTCCATGACTATTTCATA ACACATTATAATGTTGGTGGAATATAAACAACTACAATCAATAAATCAGTAAATAAGATT TTTTGTTATTTGGTTTTTTTTGATATTCTTTCCTTACTCGTTGTACAGTGAAGACTTATC CATTTAATTAGATATTTACACTCGACTATATCAATGTTGTTTTTTTGACTAGTAATTAAT GGGTTGCTCATTTTTAATGTTGACTAGTTTGTCGATTGATAACTGTTAAATTCCTAAAAG TGATTGTCTGGTTATTCATTATCCTATCTATGCCATTCAACTTTCTTGCCTAACTTTCCT TTTTCTTGCTTGTCGTTTCTCCTAGTTCTGGCTATTTTTTATTCTGGTGTACAAATACTA TTAAAGCAACGAAAAACTCTTGTCATTAATCTAATTTTTTGCTTCTATTCTTATCATTGT AATTTATTTTCCCTTTCAATTGAATTTTTACTTTTGATGTCATTACAACCATACTGTCGG TACAATGTGTTTAATTGATTCAGTATCTGTGTTAGTGTTAACTATTTATAAATATTATTC TTACACATAAAAGTTTGTGAACAAAAGTTCATATTTTTAGGTTGGATTTATGGCATCAGT GCTTTCAGATACGAAAAATAGAGAAGTAAAAGCGTTTTTCATTCCATTTGGAACTATTTG AAATGCTTGTAAGAACTTTTGTTTTAATTTGAACAGACAGTTTCAGAGTATTTGGGTCCC TAGTCAATGTAGGACATTAAAAAGGAAACTATATTTGTAAAAATTTTCATCGTTTCAAGT TAAAATAAATCCAATG



consensusID : consensus_11157#1
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NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
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fasta sequence
                              [CTTCTTTGGTATGCTAAGTCAAGTACCATATGCCTACATAGTTTCACTCTTATTCCCAAATGGTGGTCAAGGTGGTAACTTAGCCGTATGGCTTACGTTAATAATTGGTCAACCATTAGCTATTCTCGCTTATTTCCATGACTATTTCATAACACATNNNNNGGTTGGTGGAATATAAACAACTACAATCAATAAATCAGTAAATAAGATTTTTTGTTATTTGGTTTTTTTTTGATATTCTTTCCTTACTCGTTGTACAGTGAAGACTTATCCATTTAATTAGATATTTACACTCGACTATATCAATGTTNNNNNNNNNNNNNNNNAATTAATGGGTTGCTCATTTTTAATGTTGACTAGTTTGTCGATTGATAACTGTTAAATTCCTAAAAGTGATTGTCTGGTTATTCATTATCCTATCTATGCCATTCAACTTTCTTGCCTAACTTTCCTTTTTCTTGCTTGTCGTTTCTCAAATACTATTAAAGCAACGAAAAACTCTTGTCATTAATCTAATTTTTTGCTTCTATTCTTATCATTGTAATTTATTTTCCCTTTCAATTGAATTTTTACTTTTGATGTCATTACAACCATACTGTCGGTACAATGTGTTTAATTGATTCAGTATCTGTGTTAGTGTTAACTATAGTCATATTTCTAGGTTGGATTATGGCATCAGTGCTTCAGATACGAAAATAGAGAAGTAAAGCGTTTTTCATTCCATTGGGAACTATTTGAAATGGCTTGTAGAACTTTTGTCTTAATNCGAACAGACGTTTCAGAGTATTTGGGTCCTAGTCATGGTGGACATTAAAAGGAACTATTTTGTAAAATTTTCTCGTTTCAGTTAATAATCCAT]

[+] EMBL CD080919             [CTTCTTTGGTATGCTAAGTCAAGTACCATATGCCTACATAGTTTCACTCTTATTCCCAAATGGTGGTCAAGGTGGTAACTTAGCCGTATGGCTTACGTTAATAATTGGTCAACCATTAGCTATTCTCGCTTATTTCCATGACTATTTCATAACACATNNNNNGGTTGGTGGAATATAAACAACTACAATCAATAAATCAGTAAATAAGATTTTTTGTTATTTGGTTTTTTTTTGATATTCTTTCCTTACTCGTTGTACAGTGAAGACTTATCCATTTAATTAGATATTTACACTCGACTATATCAATGTTNNNNNNNNNNNNNNNNAATTAATGGGTTGCTCATTTTTAATGTTGACTAGTTTGTCGATTGATAACTGTTAAATTCCTAAAAGTGATTGTCTGGTTATTCATTATCCTATCTATGCCATTCAACTTTCTTGCCTAACTTTCCTTTTTCTTGCTTGTCGTTTCTCAAATACTATTAAAGCAACGAAAAACTCTTGTCATTAATCTAATTTTTTGCTTCTATTCTTATCATTGTAATTTATTTTCCCTTTCAATTGAATTTTTACTTTTGATGTCATTACAACCATACTGTCGGTACAATGTGTTTAATTGATTCAGTATCTGTGTTAGTGTTAACTATAGTCATATTTCTAGGTTGGATTATGGCATCAGTGCTTCAGATACGAAAATAGAGAAGTAAAGCGTTTTTCATTCCATTGGGAACTATTTGAAATGGCTTGTAGAACTTTTGTCTTAATNCGAACAGACGTTTCAGAGTATTTGGGTCCTAGTCATGGTGGACATTAAAAGGAACTATTTTGTAAAATTTTCTCGTTTCAGTTAATAATCCAT]


>consensus_11157#1 CTTCTTTGGTATGCTAAGTCAAGTACCATATGCCTACATAGTTTCACTCTTATTCCCAAA TGGTGGTCAAGGTGGTAACTTAGCCGTATGGCTTACGTTAATAATTGGTCAACCATTAGC TATTCTCGCTTATTTCCATGACTATTTCATAACACATNNNNNGGTTGGTGGAATATAAAC AACTACAATCAATAAATCAGTAAATAAGATTTTTTGTTATTTGGTTTTTTTTTGATATTC TTTCCTTACTCGTTGTACAGTGAAGACTTATCCATTTAATTAGATATTTACACTCGACTA TATCAATGTTNNNNNNNNNNNNNNNNAATTAATGGGTTGCTCATTTTTAATGTTGACTAG TTTGTCGATTGATAACTGTTAAATTCCTAAAAGTGATTGTCTGGTTATTCATTATCCTAT CTATGCCATTCAACTTTCTTGCCTAACTTTCCTTTTTCTTGCTTGTCGTTTCTCAAATAC TATTAAAGCAACGAAAAACTCTTGTCATTAATCTAATTTTTTGCTTCTATTCTTATCATT GTAATTTATTTTCCCTTTCAATTGAATTTTTACTTTTGATGTCATTACAACCATACTGTC GGTACAATGTGTTTAATTGATTCAGTATCTGTGTTAGTGTTAACTATAGTCATATTTCTA GGTTGGATTATGGCATCAGTGCTTCAGATACGAAAATAGAGAAGTAAAGCGTTTTTCATT CCATTGGGAACTATTTGAAATGGCTTGTAGAACTTTTGTCTTAATNCGAACAGACGTTTC AGAGTATTTGGGTCCTAGTCATGGTGGACATTAAAAGGAACTATTTTGTAAAATTTTCTC GTTTCAGTTAATAATCCAT



consensusID : consensus_11157#2
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
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                              [GCCAGTATNTCGGCACGAGGGGTTTAAGCCCGCGTCACATTCCGATTATTCGGCACGGTGGCGATGTTGAACCATTCGTTGTATCCTGAAAACTATCGACAGATAGGTGAAAGTTTCGTAATGGAGTACTACGATACAATGCAGCGAGATAGAAGTTCTCTCAAACTGTTTTATCACAATCAAGCAAGGATGACATATGAAGGTGATGTGTTAGAAGGTCAAGATAAAATCGGTGAAAAATTCCTTTCACTTCCTGCTAACAAAATTCAAGTGGGTATAACTAATGTTGATGTTCATCCGAACGAAAATTCTGTCCTTATTTTTGTCTGTGGACAAGTACAGTGTGATGAAGACCAGGTACTACCGTTTTGCGAAGTGTTTTT-CC-TTCGCAAATTCAACAATTGTTTCCTCATCACTGATTCTATGTTTCGTTTGGGTTTGCATAATTTCTAACATGATTTTTATTATAACACGTATTCAACTATCCTAATACTTGTTACATTTGCATGTGCTTGTTAATC-ATTGGTGTCCTGTTGCAGCAGAAAATTGATCTCTTGGATAAACTATGTTGCAAGCATATATTTATTGTACTATGATGTTTGTAAACAATAACTTTCTATCTACTTCTTATTACTTATGTCATGCAAACTTACTCGAATACAGAAACACATGCGATTAGATTTTGCTTCATTTGGTCCAAAATTTACTACTTACACACTATGATGTGCTTTTCATCAATCACAGCAGCAAAAGCAAGCTGACNCACAGTAGATGCTTTGATCCTATCATGTTCTCGTTCTCTCAGTGGATCTCCGCATTATTTTTAATCCTATTGTTATAATA]

[+] EMBL CD081617             [GCCAGTATNTCGGCACGAGGGGTTTAAGCCCGCGTCACATTCCGATTATTCGGCACGGTGGCGATGTTGAACCATTCGTTGTATCCTGAAAACTATCGACAGATAGGTGAAAGTTTCGTAATGGAGTACTACGATACAATGCAGCGAGATAGAAGTTCTCTCAAACTGTTTTATCACAATCAAGCAAGGATGACATATGAAGGTGATGTGTTAGAAGGTCAAGATAAAATCGGTGAAAAATTCCTTTCACTTCCTGCTAACAAAATTCAAGTGGGTATAACTAATGTTGATGTTCATCCGAACGAAAATTCTGTCCTTATTTTTGTCTGTGGACAAGTACAGTGTGATGAAGACCAGGTACTACCGTTTTGCGAAGTGTTTTT CC TTCGCAAATTCAACAATTGTTTCCTCATCACTGATTCTATGTTTCGTTTGGGTTTGCATAATTTCTAACATGATTTTTATTATAACACGTATTCAACTATCCTAATACT  TTACATTTGCATGTGCTTGTTAATC ATTGGTGTCCTGTTGCAGCAGAAAATTGATCTCTTGGATAAACTATGTTGCAAGCATATATTTATTGTACTATGATGTTTGTAAACAATAACTTTCTATCTACTTCTTATTACTTATGTCATGCAAACTTACTCGAATACAGAAACACATGCGATTAGATTTTGCTTCATTTGGTCCAAAATTTACTACTTACACACTATGATGTGCTTTTCATCAATCACAGCAGCAAAAGCAAGCTGACNCACAGTAGATGCTTTGATCCTATCATGTTCTCGTTCTCTCAGTGGATCTCCGCATTATTTTTAATCCTATTGTTATAATA]
[+] EMBL CD156635             [                             CCGCGTCACATTCCGATTATCCGGCACGGTGGCGATGTTGAACCATTCGTTGTATCCTGAAAACTATCGACAGATAGGTGAAAGTTTCGTAATGGAGTACTACGATACAATGCAGCGAGATAGAAGTTCTCTCAAACTGTTTTATCACAATCAAGCAAGGATGACATATGAAGGTGATGTGTTACAAGGTCAAGATAAAATCGGTGAAAAATTCCTTTCACTTCCTGCTAACAAAATTCAAGTGGGTATAACTAATGTCGATGTTCATCCGAACGAAAATTCTGCCCTTATTTTTGTCTGTGGACAAGTA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           ]
[+] EMBL CD193898             [                             CCGCGTCACATTCCGATTATTCGGCACGGTGGCGATGTTGAACCATTCGTTGTATCCTGAAAACTATCGACAGATAGGTGAAAGTTTCGTAATGGAGTACTACG                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         ]
[+] EMBL CD136630             [                                            ATTATTCGGCACGGTGGCGATGTTGAACCATTCGTTGTATCCTGAAAACTATCGACAGATAGGTGAAAGTTTCGTAATGGAGTACTACGATACAATGCAGCGAGATAGAAGTTCTCTCAAACTGTTTTATCACGATCAAGCAAGGATGACATATGAAGGTGATGTGTTAGAAGGTCAAGATAAAATCGGTGAAAAATTCCTTTCACTTCCTGCTAACAAAATTCAAGTGGGTATAACTAATGTTGATGTTCATCCGAACGAAAATTCTGTCCTTATTTTTGTCTGTGGACAAGTACAGTGTGATGAAGACCAGGTACTACCGTTTTGCGAAGTGTTTTT CCTTTCGC AATTCNACAATTGTTTCCTCATCACTGATTCTATGTTTCGTTT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          ]
[+] EMBL CD096521             [                                                TTCGGCACGGTGGCGATGTTGAACCATTCGTTGTATCCTGAAAACTATCGACAGATAGGTGAAAGTTTCGTAATGGAGTACTACGATACAATGCAGCGAGATAGAAGTTCTCTCAAACTGTTTTATCACAATCAAGCAAGGATGACATATGAAGGTGATGTGTTAGAAGGTCAAGATAAAATCGGTGAAAAATTCCTTTCACTTCCTGCTAACAAAATTCAAGTGGGTATAACTAATGTTGATGTTCATCCGAACGAAAATTCTGTCCTTATTTTTGTCTGTGGACAAGTACAGTGTGATGAAGACCAGGTACTACCGTTTTGCGAAGTGTTTTT CC TTCGCAAATTCAACAATTGTTTCCTCATCACTGATTCTATGTTTCGTTTGGGTTTGCATAATTTCTAACATGATTTTTATTATAACACGTATTCAACTATCCTAATACTTGTTACATTTGCATGTGCTTGTTAATC ATTGGTGTCCTGTTGCAGCAGAAAATTGATCTCTTGGATAAACTATGTTGNCAGCATATATTTATTGTANCATGATGTTTGTNAACAATAACTTTCTATCTACTTCTTATTACTTATGTCATGCANACTTACTCGAATA                                                                                                                                                                                       ]
[+] EMBL CD079066             [                                                  CGGCACGGTGGCGATGTTGAACCATTCGTTGTATCCTGAAAACTATCGACAGATAGGTGAAAGTTTCGTAATGGAGTACTACGATACAATGCAGCGAGATAGAAGTTCTCTCAAACTGTTTTATCACAATCAAGCAAGGATGACATATGAAGGTGATGTGTTAGAAGGTCAAGATAAAATCGGTGAAAAATTCCTTTCACTTCCTGCTAACAAAATTCAAGTGGGTATAACTAATGTTGATGTTCATCCGAACGAAAATTCTGTCCTTATTTTTGTCTGTGGACAAGTACAGTGTGATGAAGACCAGGTACTACCGTTTTGCGAAGTGTTTTT CC TTCGCAAATTCAACAATTGTTTCCTCATCACTGATTCTATGTTTCGTTTGGGTTTGCATAATTTCTAACATGATTTTTATTATAACACGTATTCAACTATCCTAATACTTGTTACATTTGCATGTGCTTGTTAATC ATTGGTGTCCTGTTGCAGCAGAAAATTGATCTCTTGGATAAACTATGTTGCAAGCATATATTTATTGTACTATGATGTTTGTAAACAATAA                                                                                                                                                                                                                                       ]
[-] EMBL CD073521             [                                                   GGCACGGTGGCGATGTTGAACCATTCGTTGTATCCTGAAAACTATCGACAGATAGGTGAAAGTTTCGTAATGGAGTACTACGATACAATGCAGCGAGATAGAAGTTCTCTCAAACTGTTTTATCACAATCAAGCAAGGATGACATATGAAGGTGATGTGTTAGAAGGTCAAGATAAAATCGGTGAAAAATTCCTTTCACTTCCTGCTAACAAAATTCAAGTGGGTATAACTAATGTTGATGTTCATCCGAACGAAAATTCTGTCCTTATTTTTGTCTGTGGACAAGTACAGTGTGATGAAGACCAGGTACTACCGTTTTGCGAAGTGTTTTT CC TTCGCAAATTCAACAATTGTTTCCTCATCACTGATTCTATGTTTCGTTTGGGTTTGCATAATTTCTAACATGATTTTTATTATAACACGTATTCAACTATCCTAATACTTGTTACATTTGCATGTGCTTGTTAATC ATTGGTGTCCTGTTGCAGCAGAAAATTGATCTCTTGGATAAACTATGTTGCAAGCATATATTTATTGTACTATGATGTTTGTAAACAATAAC                                                                                                                                                                                                                                      ]
[-] EMBL CD194015             [                                                                                          AACTATCGACAGATAGGTGAAAGTTTCGTAATGGAGTACTACGATACAATGCAGCGAGATAGAAGTTCTCTCAAACTGTTTTATCACAATCAAGCAAGGATGACATATGAAGGTGATGTGTTAGAAGGTCAAGATAAAATCGGTGAAAAATTCCTTTCACTTCCTGCTAACAAAATTCAAGTGGGTATAACTAATGTTGATGTTCATCCGAACGAAAATTCTGTCCTTATTTTTGTCTGTGGACAAGTACAGTGTGATGAAGACCAGGTACTACCGTTTTGCGAAGTGTTTTT CC TTCGCAAATTCAACAATCGTTTCCTCATCACTGATTCTATGTTTCGTTTGGGTTTGCATAATTTCTAACATGATTTTT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             ]
[+] EMBL CD136448             [                                                                                             TATCGACAGATAGGTGAAAGTTTCGTAATGGAGTACTACGATACAATGCAGCGAGATAGAAGTTCTCTCAAACTGTTTTATCACAATCAAGCAAGGATGACATATGAAGGTGATGTGTTAGAAGGTCAAGATAAAATCGGNGAAAAATTCCTTTCACTTCCTGCTAA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          ]
[+] EMBL CD194033             [                                                                                                                                                     TAGAAGTTCTCTCAAACTGTTTTATCACAATCAAGCAAGGATGACATATGAAGGTGATGTGTTAGAAGGTCAAGATAAAATCGGTGAAAAATTCCTTTCACTTCCTGCTAACAAAATTCAAGTGGGTATAACTAATGTTGATGTTCATCCGAACGAAAATTCTGTCCTTATTTTTGTCTGTGGACAAGTACAGTGTGATGAAGACCAGGTACTACCGTTTTGCGAAGTGTTTTT CC TTCGCAAATTCAACAATTGTTTCCTCATCACTGATTCTATGTTTCGTTTGNGTTTGCATAATTTCTAACATGATTTT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              ]
[-] EMBL CD196405             [                                                                                                                                                                                                                                                   taTTCAGTTCCTGGTAACAAAATTCAAGTGGGTATAACTAATGTTGATGTTCATCCGAACGAAAATTCTGTCCTTATTTTTGTCTGTGGACAAGTACAGTGTGATGAAGACCAGGTACTACCGTTTTGCGAAGTGTTTTT CC TTCGCAAATTCAACAATTGTTTCCTCATCACTTATTCTATGTTTCGTTTGGGTTTGCATAATTTCTAACATGATTTTTATTATAACACGTATTCAACTATCCTAATACTTGTTACATTTGCATGTGCTTGTTAATC ATTGGTGTCCTGTTGCAGCAG                                                                                                                                                                                                                                                                                                             ]
[+] EMBL CD140593             [                                                                                                                                                                                                                                                                                          AATGTTGATGTTCATCCGAACGAAAATTCTGTCCTTATTTTTGTCTGTGGACAAGTACAGTGTGATGAAGACCAGGTACTACCGTTTTGCGAAGTGTTTTT CC TTCGCAAATTCAACAATTGTTTCCTCATCACTGATTCTATGTTTCGTTTGGGTTTGCATAATTTCTAACATGATTTTTATTATAACACGTATTCAACTATCCTAATACTTGTTACATTTGCATGTGCTTGTTAATC ATTGGTGTCCTGTTGCAGCA                                                                                                                                                                                                                                                                                                              ]
[+] EMBL CD140654             [                                                                                                                                                                                                                                                                                          AATGTTGATGTTCATCCGAACGAAAATTCTGTCCTTATTTTTGTCTGTGGACAAGTACAGTGTGATGAAGACCAGGTACTACCGTTTTGCGAAGTGTTTTT CC TTCGCAAATTCAACAATTGTTTCCTCATCACTGATTCTATGTTTCGTTTGGGTTTGCATAATTTCTAACATGATTTTTATTATAACACGTATTCAACTATCCTAATACTTGTTACATTTGCATGTGCTTGTTAATC ATTGGTGTCCTGTTGCAGCA                                                                                                                                                                                                                                                                                                              ]
[+] EMBL CD140662             [                                                                                                                                                                                                                                                                                          AATGTTGATGTTCATCCGAACGAAAATTCTGTCCTTATTTTTGTCTGTGGACAAGTACAGTGTGATGAAGACCAGGTACTACCGTTTTGCGAAGTGTTTTT CC TTCGCAAATTCAACAATTGTTTCCTCATCACTGATTCTATGTTTCGTTTGGGTTTGCATAATTTCTAACATGATTTTTATTATAACACGTATTCAACTATCCTAATACTTGTTACATTTGCATGTGCTTGTTAATC ATTGGTGTCCTGTTGCAGCA                                                                                                                                                                                                                                                                                                              ]
[+] EMBL CD140672             [                                                                                                                                                                                                                                                                                          AATGTTGATGTTCATCCGAACGAAAATTCTGTCCTTATTTTTGTCTGTGGACAAGTACAGTGTGATGAAGACCAGGTACTACCGTTTTGCGAAGTGTTTTT CC TTCGCAAATTCAACAATTGTTTCCTCATCACTGATTCTATGTTTCGTTTGGGTTTGCATAATTTCTAACATGATTTTTATTATAACACGTATTCAACTATCCTAATACTTGTTACATTTGCATGTGCTTGTTAATC ATTGGTGTCCTGTTGCAGCA                                                                                                                                                                                                                                                                                                              ]
[+] EMBL CD196905             [                                                                                                                                                                                                                                                                                          AATGTTGATGTTCATCCGAACGAAAATTCTGTCCTTATTTTTGTCTGTGGACAAGTACAGTGTGATGAAGACCAGGTACTACCGTTTTGCGAAGTGTTTTT CC TTCGCAAATTCAACAATTGTTTCCTCATCACTGATTCTATGTTTCGTTTGGGTTTGCATAATTTCTAACATGATTTTTATTATAACACGTATTCAACTATCCTAATACTTGTTACATTTGCATGTGCTTGTTAATC ATTGGTGTCCTGTTGCAGCA                                                                                                                                                                                                                                                                                                              ]
[+] EMBL CD197017             [                                                                                                                                                                                                                                                                                          AATGTTGATGTTCATCCGAACGAAAATTCTGTCCTTATTTTTGTCTGTGGACAAGTACAGTGTGATGAAGACCAGGTACTACCGTTTTGCGAAGTGTTTTT CC TTCGCAAATTCAACAATTGTTTCCTCATCACTGATTCTATGTTTCGTTTGGGTTTGCATAATTTCTAACATGATTTTTATTATAACACGTATTCAACTATCCTAATACTTGTTACATTTGCATGTGCTTGTTAATC ATTGGTGTCCTGTTGCAGCA                                                                                                                                                                                                                                                                                                              ]
[+] EMBL CD197222             [                                                                                                                                                                                                                                                                                          AATGTTGATGTTCATCCGAACGAAAATTCTGTCCTTATTTTTGTCTGTGGACAAGTACAGTGTGATGAAGACCAGGTACTACCGTTTTGCGAAGTGTTTTT CC TTCGCAAATTCAACAATTGTTTCCTCATCACTGATTCTATGTTTCGTTTGGGTTTGCATAATTTCTAACATGATTTTTATTATAACACGTATTCAACTATCCTAATACTTGTTACATTTGCATGTGCTTGTTAATC ATTGGTGTCCTGTTGCAGCA                                                                                                                                                                                                                                                                                                              ]
[+] EMBL CD140663             [                                                                                                                                                                                                                                                                                          AATGTTGATGTTCATCCGAACGAAAATTCTGTCCTTATTTTTGTCTGTGGACAAGTACAGTGTAATGAAGACCAGGTACTACCGTTTTGCGAAGTGTTTTT CC TTCGCAAATTCAACAATTGTTTCCTCACCACTGATTCTATGTTTCGTTTGGGTTTGCATAATTTCTAACATGATTTTTATTATAACACGTATTCAACTATCCTAATACTTGTTACATTTGCATGTGCTTGTTAATC ATTGGTGTCCTGTTGCAGCA                                                                                                                                                                                                                                                                                                              ]
[+] EMBL CD196952             [                                                                                                                                                                                                                                                                                          AATGTTGATGTTCATCCGAACGAAAATTCTGTCCTTATTTTTGTCTGTGGACAAGTACAGTGTGATGAAGACCAGGTACTACCGTTTTGCGAAGTGTTTTT CC TTCGCAAATTCAACAATTGTTTCCTCATCACTGATTCTGTGTTTCGTTTGGGTTTGCATAATTTCTAACATGATTTTTATTATAACACGTATTCAACTATCCTAATACTTGTTACATTTGCATATGCTTGTTAATC ATTGGTGTCCTGTTGCAGCA                                                                                                                                                                                                                                                                                                              ]
[-] EMBL CD140664             [                                                                                                                                                                                                                                                                                           ATGTTGATGTTCATCCGAACGAAAATTCTGTCCTTATTTTTGTCCGTGGACAAGTACAGTGTGATGAAGACCAGGTACTACCGTTTTGCGAAGTGTTTCT CC TTCGCAAATTCAACAATTGTTTCCTCATCACTGATTCTATGTTTCGTTTGGGTTTGCATAATTTCTAACATGATTTTTATAATAACACGTATTCAACTATCCTAATACTTGTTAAATTTGCATGTGCTTGTTAATCAATTGGTGTCCAGATGCAGCAG                                                                                                                                                                                                                                                                                                             ]
[-] EMBL CD140539             [                                                                                                                                                                                                                                                                                           ATGTTGATGTTCATCCGAACGAAAATTCTGTCCTTATTTTTGTCTGTGGACAAGTACAGTGTGATGAAGACCAGGTACTACCGTTTTGCGAAGTGTTTTT CC TTCGCAAATTCAACAATTGTTTCCTCATCACTGATTCTATGTTTCGTTTGGGTTTGCATAATTTCTAACATGATTTTTATTATAACACGTATTCAACTATCCTAATACTTGTTACATTTGCATGTGCTTGTTAATC ATTGGTGTCCTGTTGCGGCAG                                                                                                                                                                                                                                                                                                             ]
[-] EMBL CD140583             [                                                                                                                                                                                                                                                                                           ATGTTGATGTTCATCCGAACGAAAATTCTGTCCTTATTTTTGTCTGTGGACAAGTACAGTGTGATGAAGACCAGGTACTACCGTTTTGCGAAGTGTTTTT CC TTCGCAAATTCAACAATTGTTTCCTCATCACTGATTCTATGTTTCGTTTGGGTTTGCATAATTTCTAACATGATTTTTATTATAACACGTATTCAACTATCCTAATACTTGTTACATTTGCATGCGCTTGTTAATC ATTGGTGTCCTGTTGCAGCAG                                                                                                                                                                                                                                                                                                             ]
[-] EMBL CD196965             [                                                                                                                                                                                                                                                                                           ATGTTGATGTTCATCCGAACGAAAATTCTGTCCTTATTTTTGTCTGTGGACAAGTACAGTGTGATGAAGACCAGGTACTACCGTTTTGCGAAGTGTTTTT CC TTCGCAAATTCAACAATTGTTTCCTCATCACTGATTCTATGTTTCGTTTGGGTTTGCATAATTTCTAACATGATTTTTATTATAACACGTATTCAACTATCCTAATACTTGTTACATTTGCATGTGCTTGTTAATC ATTGGTGTCCTGTTGCAGCAG                                                                                                                                                                                                                                                                                                             ]
[-] EMBL CD140615             [                                                                                                                                                                                                                                                                                           ATGTTGATGTTCATCCGAACGAAAATTCTGTCCTTATTTTTGTCTGTGGACAAGTACAGTGTGATGAAGACCAGGTACTACCGTTTTGCGAAGTGTTTTT CC TTCGCAAATTCAACAATTGTTTCCTCATCACTGATTCTATGTTTCGTTTGGGTTTGCATAATTTCTAACATGATTTTTATTATAACACGTATTCAACTATCCTAATACTTGTTACATTTGCATGTGCTTGTTAATC ATTGGTGTCCTGTTGCAGCAG                                                                                                                                                                                                                                                                                                             ]
[-] EMBL CD140542             [                                                                                                                                                                                                                                                                                           ATGTTGATGTTCATCCGAACGAANATTCTGTCCTTATTTTTGTCTGTGGACAAGTACAGTGTGATGAAGACCAGGTACTACCGTTTTGCGAAGTGTTTTT CC TTCGCAAATTCAACAATTGTTTCCTCATCACTGATTCTATGTTTCGTTTGGGTTTGCATAATTTCTAACATGA TTTTATTATAACACGTATTCAACTATCCTAATACTTGTTACATTTGCATGTGCTTGTTAATC ATTGGTGTCCTGTTGCAGCAG                                                                                                                                                                                                                                                                                                             ]
[+] EMBL CD154676             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         GATGAAGACCAGGTACTACCGTTTTGCGAAGTGTTTTT CC TTCGCAAATTCAACAATTGTTTCCTCATCACTGATTCTATGTTTCGTTTGGGTTTGCATAATTTCTAACATGATTTTTATTATAACACGTATTCAACTATCCTAATACTTGTTACATTTGCATGTGCTTGTTAATC ATTGGTGTCCTGTTGCAGCAGAAAATTGATCTCTTGGATAAACTATGTTGCAAGCATATATTTATTGTACTATGATGTTTGTAAACAATAACTTTCTATCTACTT                                                                                                                                                                                                                         ]
[-] EMBL AA559555             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           TGNAGACCAGGTACTACCGTTTTGCGAAGTGTTTTTCCC TTCGCAAATTCAACAATTGTTTCCTCATCACTGATTCTATGTTTCGTTTGGGTTTGCATAATTTCTAACATGATTTTTATTATAACACGTATTCAACTATCCTAATACTTGTTACATTTGCATGTGCTTGTTAATC ATTGGTGTCCNGTTGCAGCAGNAAATTGATCTNTTGGATAAACTATGTTGCAAGCATATATTTATTGTACTATGATGTTTGTAAACAATAACTTTCTATCTACTTCTTATTACTTATGTtc                                                                                                                                                                                                         ]


>consensus_11157#2 GCCAGTATNTCGGCACGAGGGGTTTAAGCCCGCGTCACATTCCGATTATTCGGCACGGTG GCGATGTTGAACCATTCGTTGTATCCTGAAAACTATCGACAGATAGGTGAAAGTTTCGTA ATGGAGTACTACGATACAATGCAGCGAGATAGAAGTTCTCTCAAACTGTTTTATCACAAT CAAGCAAGGATGACATATGAAGGTGATGTGTTAGAAGGTCAAGATAAAATCGGTGAAAAA TTCCTTTCACTTCCTGCTAACAAAATTCAAGTGGGTATAACTAATGTTGATGTTCATCCG AACGAAAATTCTGTCCTTATTTTTGTCTGTGGACAAGTACAGTGTGATGAAGACCAGGTA CTACCGTTTTGCGAAGTGTTTTTCCTTCGCAAATTCAACAATTGTTTCCTCATCACTGAT TCTATGTTTCGTTTGGGTTTGCATAATTTCTAACATGATTTTTATTATAACACGTATTCA ACTATCCTAATACTTGTTACATTTGCATGTGCTTGTTAATCATTGGTGTCCTGTTGCAGC AGAAAATTGATCTCTTGGATAAACTATGTTGCAAGCATATATTTATTGTACTATGATGTT TGTAAACAATAACTTTCTATCTACTTCTTATTACTTATGTCATGCAAACTTACTCGAATA CAGAAACACATGCGATTAGATTTTGCTTCATTTGGTCCAAAATTTACTACTTACACACTA TGATGTGCTTTTCATCAATCACAGCAGCAAAAGCAAGCTGACNCACAGTAGATGCTTTGA TCCTATCATGTTCTCGTTCTCTCAGTGGATCTCCGCATTATTTTTAATCCTATTGTTATA ATA



consensusID : consensus_11157#3
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 1
consensus length = 762
fasta sequence
                              [NNNNNNNNNNNNNNNAGCCGTATGGCTTACGTTAATAATTGGTCAACCATTAGCTATTCTCGCTTATTTCCATGACTATTTCATAACACATTATAATGTTGGTGGAATATAAACAACTACAATCAATAAATCAGTAAATAAGATTTTTTGTTATTTGGTTTTTTTTTGATANNNNNNNNTTACTCGTTGTACAGTGAAGACTTATCCATTTAATTAGATATTTACACTCGACTATATCAATGTTGTTTTTCTGACTAGTAATTAATGGGTTGCTCATTTTTAATGTTGACTAGTTTGTCGATTGATAACTGTTAAATTCCTAAANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCTATGCCATTCAACTTTCTTGCCTAACTTTCCTTTTTCTTGCTTGTCGTTTCTCCTAGTTCTGGCTATTTTTTATTCTGGTGTACAAATACTATTAAAGCAACGAAAAACTCTTGTCATTAATCTAATTTTTTGCTTCTATTCTTATCATTGTAATTTATTTTCCCTACTGTCGGTACAATGTGTTTAATTGATTCAGTATCTGTGTTAGTGTTAACTATTTATAAATATTATTCTTAACACATANAGTTTGTGAACAAAATTCATATTTCTAGGTTGGATTATGGCATCAGTGCTTTCAGATACGAAAATAGAGAAGTAAAGCGTTTTTCATTCATTTGGAACTATTGAAATGCTGTAGAACTTTGTCTTAATTCGACAGACAGTATTATCGTTCAGTTAAATAATCA]

[+] EMBL CD080918             [NNNNNNNNNNNNNNNAGCCGTATGGCTTACGTTAATAATTGGTCAACCATTAGCTATTCTCGCTTATTTCCATGACTATTTCATAACACATTATAATGTTGGTGGAATATAAACAACTACAATCAATAAATCAGTAAATAAGATTTTTTGTTATTTGGTTTTTTTTTGATANNNNNNNNTTACTCGTTGTACAGTGAAGACTTATCCATTTAATTAGATATTTACACTCGACTATATCAATGTTGTTTTTCTGACTAGTAATTAATGGGTTGCTCATTTTTAATGTTGACTAGTTTGTCGATTGATAACTGTTAAATTCCTAAANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCTATGCCATTCAACTTTCTTGCCTAACTTTCCTTTTTCTTGCTTGTCGTTTCTCCTAGTTCTGGCTATTTTTTATTCTGGTGTACAAATACTATTAAAGCAACGAAAAACTCTTGTCATTAATCTAATTTTTTGCTTCTATTCTTATCATTGTAATTTATTTTCCCTACTGTCGGTACAATGTGTTTAATTGATTCAGTATCTGTGTTAGTGTTAACTATTTATAAATATTATTCTTAACACATANAGTTTGTGAACAAAATTCATATTTCTAGGTTGGATTATGGCATCAGTGCTTTCAGATACGAAAATAGAGAAGTAAAGCGTTTTTCATTCATTTGGAACTATTGAAATGCTGTAGAACTTTGTCTTAATTCGACAGACAGTATTATCGTTCAGTTAAATAATCA]


>consensus_11157#3 NNNNNNNNNNNNNNNAGCCGTATGGCTTACGTTAATAATTGGTCAACCATTAGCTATTCT CGCTTATTTCCATGACTATTTCATAACACATTATAATGTTGGTGGAATATAAACAACTAC AATCAATAAATCAGTAAATAAGATTTTTTGTTATTTGGTTTTTTTTTGATANNNNNNNNT TACTCGTTGTACAGTGAAGACTTATCCATTTAATTAGATATTTACACTCGACTATATCAA TGTTGTTTTTCTGACTAGTAATTAATGGGTTGCTCATTTTTAATGTTGACTAGTTTGTCG ATTGATAACTGTTAAATTCCTAAANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCTATGCC ATTCAACTTTCTTGCCTAACTTTCCTTTTTCTTGCTTGTCGTTTCTCCTAGTTCTGGCTA TTTTTTATTCTGGTGTACAAATACTATTAAAGCAACGAAAAACTCTTGTCATTAATCTAA TTTTTTGCTTCTATTCTTATCATTGTAATTTATTTTCCCTACTGTCGGTACAATGTGTTT AATTGATTCAGTATCTGTGTTAGTGTTAACTATTTATAAATATTATTCTTAACACATANA GTTTGTGAACAAAATTCATATTTCTAGGTTGGATTATGGCATCAGTGCTTTCAGATACGA AAATAGAGAAGTAAAGCGTTTTTCATTCATTTGGAACTATTGAAATGCTGTAGAACTTTG TCTTAATTCGACAGACAGTATTATCGTTCAGTTAAATAATCA



consensusID : consensus_11157#4
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 1
consensus length = 391
fasta sequence
                              [AACAACTACAATCAATAAATCAGTAAATAAGATTTTTTGTTATTTGGTTTTTTTTGATATTCTTTCCTTACTCGTTGTACAGTGAAGACTTATCCATTTAATTAGATATTTACACTCGACTATATCAATGTTGTTTTTCTGACTAGTAATTAATGGGTTGCTCATTTTTAATGTTGACTAGTTTGTCGATTGATAACTGTTAAATTCCTAAAAGTGATTGTCTGGTTATTCATTATCCTATCTATGCCATCCAACTTTCTTGCCTAACTTTCCTTTTTCTTGCTTGTCGTTTCTCCTAGTTCTGGCTATTTTTTATTCTGGTCTTCATCACACTGTACTTGTCCACAGACAAAAATAAGGACAGAATTTTCGTTCGGATGAACATCAACAT]

[-] EMBL CD140485             [AACAACTACAATCAATAAATCAGTAAATAAGATTTTTTGTTATTTGGTTTTTTTTGATATTCTTTCCTTACTCGTTGTACAGTGAAGACTTATCCATTTAATTAGATATTTACACTCGACTATATCAATGTTGTTTTTCTGACTAGTAATTAATGGGTTGCTCATTTTTAATGTTGACTAGTTTGTCGATTGATAACTGTTAAATTCCTAAAAGTGATTGTCTGGTTATTCATTATCCTATCTATGCCATCCAACTTTCTTGCCTAACTTTCCTTTTTCTTGCTTGTCGTTTCTCCTAGTTCTGGCTATTTTTTATTCTGGTCTTCATCACACTGTACTTGTCCACAGACAAAAATAAGGACAGAATTTTCGTTCGGATGAACATCAACAT]


>consensus_11157#4 AACAACTACAATCAATAAATCAGTAAATAAGATTTTTTGTTATTTGGTTTTTTTTGATAT TCTTTCCTTACTCGTTGTACAGTGAAGACTTATCCATTTAATTAGATATTTACACTCGAC TATATCAATGTTGTTTTTCTGACTAGTAATTAATGGGTTGCTCATTTTTAATGTTGACTA GTTTGTCGATTGATAACTGTTAAATTCCTAAAAGTGATTGTCTGGTTATTCATTATCCTA TCTATGCCATCCAACTTTCTTGCCTAACTTTCCTTTTTCTTGCTTGTCGTTTCTCCTAGT TCTGGCTATTTTTTATTCTGGTCTTCATCACACTGTACTTGTCCACAGACAAAAATAAGG ACAGAATTTTCGTTCGGATGAACATCAACAT



consensusID : consensus_11157#5
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 1
consensus length = 107
fasta sequence
                              [GAGTTTGCATGACATAAGTAATAAGTAAGTAGATAGAAAGTTATTGTTTACAAACNTCATANTACNNTAAATATATGCTTGCAACATAGTTCATCCCANAGATCAAT]

[+] EMBL AA559452             [GAGTTTGCATGACATAAGTAATAAGTAAGTAGATAGAAAGTTATTGTTTACAAACNTCATANTACNNTAAATATATGCTTGCAACATAGTTCATCCCANAGATCAAT]


>consensus_11157#5 GAGTTTGCATGACATAAGTAATAAGTAAGTAGATAGAAAGTTATTGTTTACAAACNTCAT ANTACNNTAAATATATGCTTGCAACATAGTTCATCCCANAGATCAAT



consensus multiple alignement with clustalw

CLUSTAL W (1.82) multiple sequence alignment


consensus_11157#0      TTCGGCACGAGCNTGAAACTTAGGCATATATACATACCGCTTTTACAGTCGGCTTAGCCG 60
consensus_11157#1      ------------------------------------------------------------
consensus_11157#3      ------------------------------------------------------------
consensus_11157#4      ------------------------------------------------------------
consensus_11157#5      ------------------------------------------------------------
consensus_11157#2      ------------------------------------------------------------
                                                                                   

consensus_11157#0      CTTCCAGCTGGTTTAGTTGTTTTCATGATTAGTGCATTTTTTCATGAAATACTTGTTTCG 120
consensus_11157#1      ------------------------------------------------------------
consensus_11157#3      ------------------------------------------------------------
consensus_11157#4      ------------------------------------------------------------
consensus_11157#5      ------------------------------------------------------------
consensus_11157#2      ------------------------------------------------------------
                                                                                   

consensus_11157#0      GTCCCATTGAAAATGCTAAGATTCTGGGCCTTCTTTGGTATGCTAAGTCAAGTACCATAT 180
consensus_11157#1      -----------------------------CTTCTTTGGTATGCTAAGTCAAGTACCATAT 31
consensus_11157#3      ------------------------------------------------------------
consensus_11157#4      ------------------------------------------------------------
consensus_11157#5      ------------------------------------------------------------
consensus_11157#2      ------------------------------------------------------------
                                                                                   

consensus_11157#0      GCCTACATAGTTTCACTCTTATTCCCAAATGGTGGTCAAGGTGGTAACTTAGCCGTATGG 240
consensus_11157#1      GCCTACATAGTTTCACTCTTATTCCCAAATGGTGGTCAAGGTGGTAACTTAGCCGTATGG 91
consensus_11157#3      -----------------------------------NNNNNNNNNNNNNNNAGCCGTATGG 25
consensus_11157#4      ------------------------------------------------------------
consensus_11157#5      ------------------------------------------------------------
consensus_11157#2      ---------------------------------------GCCAGTATNTCGGCACGAGGG 21
                                                                                   

consensus_11157#0      CTTACGTTAATAATTGGTCAACCATTAGCTATTCTCGCTTATTTCCATGACTATTTCATA 300
consensus_11157#1      CTTACGTTAATAATTGGTCAACCATTAGCTATTCTCGCTTATTTCCATGACTATTTCATA 151
consensus_11157#3      CTTACGTTAATAATTGGTCAACCATTAGCTATTCTCGCTTATTTCCATGACTATTTCATA 85
consensus_11157#4      ------------------------------------------------------------
consensus_11157#5      ------------------------------------------------------------
consensus_11157#2      GTTTAAGCCCGCGTCACATTCCGATTATTCGGCACGGTGGCGATGTTGAACCATTCGTTG 81
                                                                                   

consensus_11157#0      ACACATTATAATGTTGGTGGAATATAAACAACTACAATCAATAAATCAGTAAATAAGATT 360
consensus_11157#1      ACACATNNNNNGGTTGGTGGAATATAAACAACTACAATCAATAAATCAGTAAATAAGATT 211
consensus_11157#3      ACACATTATAATGTTGGTGGAATATAAACAACTACAATCAATAAATCAGTAAATAAGATT 145
consensus_11157#4      --------------------------AACAACTACAATCAATAAATCAGTAAATAAGATT 34
consensus_11157#5      ------------------------------------------------------------
consensus_11157#2      TATCCTGAAAACTATCGACAGATAGGTGAAAGTTTCGTAATGGAGTACTACGATACAATG 141
                                                                                   

consensus_11157#0      TTTTGTTATTTGGTTTTTTTT-GATATTCTTTCCTTACTCGTTGTACAGTGA-AGACTTA 418
consensus_11157#1      TTTTGTTATTTGGTTTTTTTTTGATATTCTTTCCTTACTCGTTGTACAGTGA-AGACTTA 270
consensus_11157#3      TTTTGTTATTTGGTTTTTTTTTGATANNNNNNNNTTACTCGTTGTACAGTGA-AGACTTA 204
consensus_11157#4      TTTTGTTATTTGGTTTTTTTT-GATATTCTTTCCTTACTCGTTGTACAGTGA-AGACTTA 92
consensus_11157#5      ------------------------------------------------------------
consensus_11157#2      CAGCGAGATAGAAGTTCTCTCAAACTGTTTTATCACAATCAAGCAAGGATGACATATGAA 201
                                                                                   

consensus_11157#0      TCCATTTAATTAGATATTTACACTCGACTATATCAA--------TGTTGTTTTTTTGACT 470
consensus_11157#1      TCCATTTAATTAGATATTTACACTCGACTATATCAA--------TGTTNNNNNNNNNNNN 322
consensus_11157#3      TCCATTTAATTAGATATTTACACTCGACTATATCAA--------TGTTGTTTTTCTGACT 256
consensus_11157#4      TCCATTTAATTAGATATTTACACTCGACTATATCAA--------TGTTGTTTTTCTGACT 144
consensus_11157#5      ---------------------------------GAG--------TTTGCATGACATAAGT 19
consensus_11157#2      GGTGATGTGTTAGAAGGTCAAGATAAAATCGGTGAAAAATTCCTTTCACTTCCTGCTAAC 261
                                                         *         *               

consensus_11157#0      AGTAA-TTAATGGGT-TGCTCATTTTTAATGTTGACTAGTTTGTCGAT-TGATAACTGTT 527
consensus_11157#1      NNNNAATTAATGGGT-TGCTCATTTTTAATGTTGACTAGTTTGTCGAT-TGATAACTGTT 380
consensus_11157#3      AGTAA-TTAATGGGT-TGCTCATTTTTAATGTTGACTAGTTTGTCGAT-TGATAACTGTT 313
consensus_11157#4      AGTAA-TTAATGGGT-TGCTCATTTTTAATGTTGACTAGTTTGTCGAT-TGATAACTGTT 201
consensus_11157#5      AATAAGTAAGTAGAT-AG---AAAGTTATTGTTTACAAACNTCATANTACNNTAAATAT- 74
consensus_11157#2      AAAATTCAAGTGGGTATAACTAATGTTGATGTTCATCCGAACGAAAATTCTGTCCTTATT 321
                               * * * *      *   **  **** *            *    *   * * 

consensus_11157#0      -AAATTCCTA---AAAGTGATTGTCTGGTTATTCAT-TATCCTATCTATGCCATTCAACT 582
consensus_11157#1      -AAATTCCTA---AAAGTGATTGTCTGGTTATTCAT-TATCCTATCTATGCCATTCAACT 435
consensus_11157#3      -AAATTCCTA---AANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN-NNNNNNNNCTATGCCATTCAACT 368
consensus_11157#4      -AAATTCCTA---AAAGTGATTGTCTGGTTATTCAT-TATCCTATCTATGCCATCCAACT 256
consensus_11157#5      -ATGCTTGCA---ACATAGTTCATCCCANAGATCAA-T---------------------- 107
consensus_11157#2      TTTGTCTGTGGACAAGTACAGTGTGATGAAGACCAGGTACTACCGTTTTGCGAAGTGTTT 381
                                    *                                              

consensus_11157#0      TTCTTGCCTAACTTTC-CTTTTTCTTGCTTGTCGTTTCTCCTAGTTCTGGCTATTTTTTA 641
consensus_11157#1      TTCTTGCCTAACTTTC-CTTTTTCTTGCTTGTCGTTTCTC-------------------- 474
consensus_11157#3      TTCTTGCCTAACTTTC-CTTTTTCTTGCTTGTCGTTTCTCCTAGTTCTGGCTATTTTTTA 427
consensus_11157#4      TTCTTGCCTAACTTTC-CTTTTTCTTGCTTGTCGTTTCTCCTAGTTCTGGCTATTTTTTA 315
consensus_11157#5      ------------------------------------------------------------
consensus_11157#2      TTCCTTCGCAAATTCAACAATTGTTTCCTCATCACTGATTCTATGTTTCGTTTGGGTTTG 441
                                                                                   

consensus_11157#0      TTCTGGTGTACAAATACTATTAAAGCAACGAAAAACTCTTGTCATTAATCTAATTTTTTG 701
consensus_11157#1      -----------AAATACTATTAAAGCAACGAAAAACTCTTGTCATTAATCTAATTTTTTG 523
consensus_11157#3      TTCTGGTGTACAAATACTATTAAAGCAACGAAAAACTCTTGTCATTAATCTAATTTTTTG 487
consensus_11157#4      TTCTGGTCT-TCATCACACTGTACTTGTCCACAGACAAAAATAAGGA--CAGAATTTTCG 372
consensus_11157#5      ------------------------------------------------------------
consensus_11157#2      CATAATTTCTAACATGATTTTTATTATAACACGTATTCAACTATCCTAATACTTGTTACA 501
                                                                                   

consensus_11157#0      CTTCTATTCTTATCATTGTAATTTATTTTCCCTTTCAATTGAATTTTTACTTTTGATGTC 761
consensus_11157#1      CTTCTATTCTTATCATTGTAATTTATTTTCCCTTTCAATTGAATTTTTACTTTTGATGTC 583
consensus_11157#3      CTTCTATTCTTATCATTGTAATTTATTTTCCCT--------------------------- 520
consensus_11157#4      TTCGGATGAACATCAACAT----------------------------------------- 391
consensus_11157#5      ------------------------------------------------------------
consensus_11157#2      TTTGCATGTGCTTGTTAATCATTGGTGTCCTGTTGCAGCAGAAAATTGATCTCTTGGATA 561
                                                                                   

consensus_11157#0      ATTACAACCATACTGTCGGTACAATGTGTTTAATTGATTCAGTATCTGTGTTAGTGTTAA 821
consensus_11157#1      ATTACAACCATACTGTCGGTACAATGTGTTTAATTGATTCAGTATCTGTGTTAGTGTTAA 643
consensus_11157#3      -----------ACTGTCGGTACAATGTGTTTAATTGATTCAGTATCTGTGTTAGTGTTAA 569
consensus_11157#4      ------------------------------------------------------------
consensus_11157#5      ------------------------------------------------------------
consensus_11157#2      A-----ACTATGTTGCAAGCATATATTTATTGTACTATGATGTTTGTAAACAATAACTTT 616
                                                                                   

consensus_11157#0      CTATTTATAAATATTATTCTTACACATAAAAGTTTGTGAACAAAAGTTCATATTTTTAGG 881
consensus_11157#1      CTAT-----------------------------------------AGTCATATTTCTAGG 662
consensus_11157#3      CTATTTATAAATATTATTCTTAACACATANAGTTTGTGAACAAA-ATTCATATTTCTAGG 628
consensus_11157#4      ------------------------------------------------------------
consensus_11157#5      ------------------------------------------------------------
consensus_11157#2      CTATCTACTTCTTATTACTTATGTCATGCAAACTTACTCGAATACAGAAACACATGCGAT 676
                                                                                   

consensus_11157#0      TTGGATTTATGGCATCAGTGCTTTCAGATACGAAAAATAGAGAAGTAAAAGCGTTTTTCA 941
consensus_11157#1      TTGGATT-ATGGCATCAGTGCTT-CAGATACGAAAA-TAGAGAAGTAAA-GCGTTTTTCA 718
consensus_11157#3      TTGGATT-ATGGCATCAGTGCTTTCAGATACGAAAA-TAGAGAAGTAAA-GCGTTTTTCA 685
consensus_11157#4      ------------------------------------------------------------
consensus_11157#5      ------------------------------------------------------------
consensus_11157#2      TAGATTTTGCTTCATT--TGGTCCAAAATTTACTACTTACACACTATGATGTGCTTTTCA 734
                                                                                   

consensus_11157#0      TTCCATTTGGAACTATTTGAAATGCTTGTAAGAACTTTTGTTTTAATTTGAACAGACAGT 1001
consensus_11157#1      TTCCATTGGGAACTATTTGAAATGGCTTGTAGAACTTTTGTCTTAATNCGAACAGAC-GT 777
consensus_11157#3      TTC-ATTTGGAACTATT-GAAATG--CTGTAGAACTTT-GTCTTAATTCGA-CAGACAGT 739
consensus_11157#4      ------------------------------------------------------------
consensus_11157#5      ------------------------------------------------------------
consensus_11157#2      TCAATCACAGCAGCAAAAGCAAGCTGACNCACAGTAGATGCTTTGATCCTATCATGTTCT 794
                                                                                   

consensus_11157#0      TTCAGAGTATTTGGGTCCCTAGTCAATGTAGGACATTAAAAAGGAAACTATATTTGTAAA 1061
consensus_11157#1      TTCAGAGTATTTGGGTCC-TAGTCA-TGGTGGACATTAAAAGG--AACTAT-TTTGTAAA 832
consensus_11157#3      ATTATCGT--TCAGTTAAATAATCA----------------------------------- 762
consensus_11157#4      ------------------------------------------------------------
consensus_11157#5      ------------------------------------------------------------
consensus_11157#2      CGTTCTCTCAGTGGATCTCCGCATTATTTTTAATCCTATTGTTATAATA----------- 843
                                                                                   

consensus_11157#0      AATTTTCATCGTTTCAAGTTAAAATAAATCCAATG 1096
consensus_11157#1      A--TTTTCTCGTTTCAGTTAATAATCCAT------ 859
consensus_11157#3      -----------------------------------
consensus_11157#4      -----------------------------------
consensus_11157#5      -----------------------------------
consensus_11157#2      -----------------------------------
                                                          




Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)