These datas are free for academic use only, please contact me for any other use. Schistosoma mansoni see consensus multiple alignment with clustalw Direct access to contigs :
consensusID : consensus_11163#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 4 consensus length = 634 fasta sequence [AGTTGCTTGTATGAGTAGTAGTCTGTTAGCTTTATTAATAGTAGCATTTTTTTTTACTTTAATCATAGGATCTATAACATTTTATGTTTTAGGATTTAGATTTTCATTAGATCACTATATTAGACTTAAGG-AGTGGTATAGTAGATTTG-AGTGCGGGTTTCTGAGGCATGGTTACAAAGAGAATTTTTTTAGGTTTTCTTACTTAAATTTATTAGTATTATTTGTAGTATTCGATTTGGAAGTTTCTTTATTGCTAAAAGTCGTATTTGATGGGATTTGGTTTTATACATATTGATGTTATTTCTTTTTTTTCTTTTTTGTTTTTTTTTGTTATTTGATAGAGGTAGGTTTTGGGTATATAAAGTGGATGTAGTATTTGTTTTAAGTGGAGATAGTAATCTTTGAGTTCTTATTAAAACACCTTCTCCACCGTTGACTGGATCAATAGAGAAAATATGCACAAGACCGTCTAGGCCAGCGACAATTAATCGTGGTTGATTTTGATAATAAACAAGAGCGGCCACTTTCCTTTGCCCCGGTGACAATTGCATAAGACTACCTTGAGGAACTGAAGGTGTCGAACCAACATAATTAAGATTAACCAACTCTCCGGTTGGAGTCATGGTCACAGGAC] [-] EMBL CD162772 [AGTTGCTTGTATGAGTAGTAGTCTGTTAGCTTTATTAATAGTAGCATTTTTTTTTACTTTAATCATAGGATCTATAACATTTTATGTTTTAGGATTTAGATTTTCATTAGATCACTATATTAGACTTAAGG AGTGGTATAGTAGATTTG AGTGCGGGTTTCTGAGGCATGGTTACAAAGAGAATTTTTTTAGGTTTTCTTACTTAAATTTATTAGTATTATTTGTAGTATTCGATTTGGAAGTTTCTTTATTGCTAAAAGTCGTATTTGATGGGATTTGGTTTTATACATATTGATGTTATTTCTTTTTTTTCTTTTTTGTTTTTTTTTGTTATTTGATAGAGGTAGGTTTTGGGTATATAAAGTGGATGTAGTATTTGTTGAAAGTGGAGATAGTAATCTTTGAGTTCTTATTAAAACACCTTCTCCACCGTTGACTGGATCAATAGAGAAAATATGCACAAGACCGTCTAGGCCAGCGACAATTAATCGTGGTTGATTTTGATAATAAACAAGAGCGGCCACTTTCCTTTGCCCCGGTGACAATTGCATAAGACTACCTTGAGGAACTGAAGGTGTCGAACCAACATAATTAAGATTAACCAACTCTCCGGTTGGAGTCATGGTCACAGGAC] [+] EMBL AA629477 [ TTAGCTTTATTAATAGTAGCATTTTTTTTTACTTTAATCATAGGATCTATAACATTTTATGTTTTAGGATTTAAATTTTCATTANATCACTATATTANACTTAAGGAATTGGTATATTANATTTGAAGTGCGGGTTTCTGAGGCATGGTTACAAANANAATTTTTTTAGGTTTTCTTACTTAAATTTATTAGTATTATTTGTNTTATTCGATTTGGAAGTTTCTTTATTGCTAAAAGTCGTATTTGATGGGATTTGGTTTTATACATATTGATGTTATTTCTTTTTTTNCTTTTNNGTTTTTTNTNGTTATTTGANAAAAGTAGGTTTTGGGTATAT AANTGGA ] [-] EMBL AW146516 [ gaTTTCATTAGATCACTATATTAGACTTAAGG AGTGGTATAGTAGATTTG AGTGCGGGTTTCTGAGGCATTGTTACAAAGAGAATTTTTTTAGG TTTCTTACTTAAATTTATTAGTATTATTTGTAGTACTCGATTTGGAAGTTTCTTTATTGCTAAAAGTCGTATTTGATGGGATTTGGTTTTATACATATTGATGTTA TTCTTTTTTATCTTTTTTGTTTTTTTTTGTTATTTGATAGAGGTAGGTTTTGGGTATATAAAGTGGATGTAGTATTTGTTTT ] [-] EMBL AW497764 [ AAAGTCGTATTTGATGGGA TTGGTTTTATACATATTGATGGTATTCCTTTTTTT TTTTTGGTTTTTTTTTGTTATTTGATAGAGGTAGGTTTTGGGTATATAAAGTGGATGTAGTATTTGTTTTg ] consensusID : consensus_11163#1 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 29 consensus length = 578 fasta sequence [TGTTTTCATCTTTTAAACCACCAGCAACAACTGATGCGAATGTATTGACCTTACCAGTTGTAACAACGCCTGGATTACTGCCACTGGATAAATTGACAGTTGTAGCAACAGACGCTGGTAATGCATAAACACCTGGTTGTTGCGGCCCGCCAGTTCGAATACAATTGACATTTTTAGATGCATTACCATCTCCGGTAAAAATATTAGTATTACTGTTAGTAATATTAGATGCTGGGAGAGAGTTTGAATCGTACGGTGAATTAGGATTCATTGCTACAGATGATATACTAGTTGGCTGATTATTTGTTGAAAGTGGAGATAGTAATCTTTGAGTTCTTATTAAAACACCTTCTCCACCGTTGACTGGATCAATAGAGAAAATATGCACAAGACCGTCTAGGCCAGCGACAATTAATCGTGGTTGATTTTGATAATAAACAAGAGCGGCCACTTTCCTTTGCCCCGGTGACAATTGCATAAGACTACCTTGAGGAATTGAAGGTGTCGAACCAACATAATTAAGATTAACCAACTCTCCGGTTGGAGTCATGGTCACAGGACTACCACTGCCTGNTGGA] [+] EMBL CD163053 [TGTTTTCATCTTTTAAACCACCAGCAACAACTGATGCGAATGTATTGACCTTACCAGTTGTAGCAACGCCTGGATTACTGCCACTGGATAAATTGACAGTTGTAGCAACAGACGCTGGTAATGCATAAACACCTGGTTGTTGCGGCCCGCCAGTTCGAATACAATTGACATTTTTAGATGCATTACCATCTCCGGTAAAAATATTAGTATTACTGTTAGTAATATTAGATGCTGGGAGAGAGTTTGAATCGTACGGTGAATTAGGATTCATTGCTACAGATGATATACTAGTTGGCTGATTATTTGTTGAAAGTGGAGATAGTAATCTTTGAGTTCTTATTAAAACACCTTCTCCACCGTTGACTGGATCAATAGAGAAAATATGCACAAGACCGTCTAGGCCAGCGACAATTAATCGTGGTTGATTTTGATAATAAACAAGAGCGGCCACTTTCCTTTGCCCCGGTGACAATTGCATAAGACTACCTTGAGGAATTGAAGGTGTCGAACCAACATAATTAAGATTAACCAACTCTCCGGTTGGAGTCATGGTCACAGGA ] [-] EMBL CD181027 [ gTTTCATC TTTAAACCACCAGCAACAACTGATGCGAATGTATTGACCTTACCAGTTGTAACAACGCCTGGATTACTGCCACTGGATAAATTGACAGTTGTAGCAACAGACGCTGGTAATGCATAAACACCTGGTTGTTGCGGCCCGCCAGTTCGAATACAATTGACATTTTTAGATGCATTACCATCTCCGGTAAAAATATTAGTATTACTGTTAGTAATATTAGATGCTGGGAGAGAGTTTGAATCGTACGGTGAATTAGGATTCATTGCTACAGATGATATACTAGTTGGCTGATTATTTGTTGAAAGTGGAGATATTAATCTTTGAGTTCTTATTAAAACACCTTCTCCACCGTTGACTGGATCAATAGAGAAAATATGCACAAGACCGTCTAGGCCAGCGACAATTAATCGTGGTTGATTTTGATAATAAACAAGAGCGGCCACTTTCCTTTGCCCCGGTGACAATTGCATAAGACTACCTTGAGGAATTGAAGGTGTCGAACCAACATAATTAAGATTAACCAACTCTCCGGTTGGAGTCATGGTCACAGGAC ] [+] EMBL CD180663 [ ATGCGAATGTATTGACCTTACCAGTTGTAACAACGCCTGGATTACTGCCACTGGATAAATTGACAGTTGTAGCAACAGACGCTGGTAATGCATAAACACCTGGTTGTTGCGGCCCGCCAGTTCGAATACAATTGACATTTTTAGATGCATTACCATCTCCGGTAAAAATATTAGTATTACTGTTAGTAATATTAGATGCTGGGAGAGAGTTTGAATCGTACGGTGAATTAGGATTCATTGCTACAGATGATATACTAGTTGGCTGATTATTTGTTGAAAGTGGAGATAGTAATCTTTGAGTTCTTATTAAAACACCTTCTCCACCGTTGACTGGATCAATAGAGAAAATATGCACAAGACCGTCTAGGCCAGCGACAATTAATCGTGGTTGATTTTGATAATAAACAAGAGCGGCCACTTTCCTTTGCCCCGGTGACAATTGCATAAGACTACCTTGAGGAATTGAAGGTGTCGAACCAACATAATTAAGATTAACCAACTCTCCGGTTGGAGTCATGGTCACAGGACTACCACTGCCTGNTGG ] [+] EMBL CD162894 [ ATGCGAATGTATTGACCTTACCAGTTGTAACAACGCCTGGATTACTGCCACTGGATAAATTGACAGTTGTAGCAACAGACGCTGGTAATGCATAAACACCTGGTTGTTGCGGCCCGCCAGTTCGAATACAATTGACATTTTTAGATGCATTACCATCTCCGGTAAAAATATTAGTATTACTGTTAGTAATATTAGATGCTGGGAGAGAGTTTGAATCGTACGGTGAATTAGGATTCATTGCTACAGATGATATACTAGTTGGCTGATTATTTGTTGAAAGTGGAGATAGTAATCTTTGAGTTCTTATTAAAACACCTTCTCCACCGTTGACTGGATCAATAGAGAAAATATGCACAAGACCGTCTAGGCCAGCGACAATTAATCGTGGTTGATTTTGATAATAAACAAGAGCGGCCACTATCCTTTGCCCCGGTGACAATTGCATAAGACTACCTTGAGGAATTGAAGGTGTCGAACCAACATAATTAAGATTAACCAACTCTCCGGTTGGAGTCATGGTCACAGGA ] [+] EMBL CD180660 [ ATGCGAATGTATTGACCTTACCAGTTGTAACAACGCCTGGATTACTGCCACTGGATAAATTGACAGTTGTAGCAACAGACGCTGGTAATGCATAAACACCTGGTTGTTGCGGCCCGCCAGTTCGAATACAATTGACATTTTTAGATGCATTACCATCTCCAGTAAAAATATTAGTATTACTGTTAGTAATATTAGATGCTGGGAGAGAGTTTGAATCGTACGGTGAATTAGGATTCATTGCTACAGATGATATACTAGTTGGCTGATTATTTGTTGAAAGTGGAGATAGTAATCTTTGAGTTCTTATTAAAACACCTTCTCCACCGTTGACTGGATCAATAGAGAAAATATGCACAAGACCGTCTAGGCCAGCGACAATTAATCGTGGTTGATTTTGATAATAAACAAGAGCGGCCACTTTCCTTTGCCCCGGTGACAATTGCATAAGACTACCTTGAGGAATTGAAGGTGTCGAACCAACATAATTAAGATTAACCAACTCTCCGGTTGGAGTCATGGTCACAGGA ] [+] EMBL CD162979 [ ATGCGAATGTATTGACCTTACCAGTTGTAACAACGCCTGGATTACTGCCACTGGATAAATTGACAGTTGTAGCAACAGACGCTGGTAATGCATAAACAACTGGTTGTTGCGGCCCGCCAGTTCGAATACAATTGACATTTTTAGATGCATTACCATCTCCGGTAAAAATATTAGTATTACTGTTAGTAATATTAGATGCTGGGAGAGAGTTTGAATCGTACGGTGAATTAGGATTCATTGCTACAGATGATATACTAGTTGGCTGATTATTTGTTGAAAGTGGAGATAGTAATCTTTGAGTTCTTATTAAAACACCTTCTCCACCGTTGACTGGATCAATAGAGAAAATATGCACAAGACCGTCTAGGCCAGCGACAATTAATCGTGGTTGATTTTGATAATAAACAAGAGCGGCCACTTTCCTTTGCCCCGGTGACAATTGCATAAGACTACCTTGAGGAATTGAAGGTGTCGAACCAACATAATTAAGATTAACCAACTCTCCGGTTGGAGTCATGGTCACAGGA ] [+] EMBL CD180696 [ ATGCGAATGTATTGACCTTACCAGTTGTAACAACGCCTGGATTACTGCCACTGGATAAATTGACAGTTGTAGCAACAGACGCTGGTAATGCATAAACACCTGGTTGTTGCGGCCCGCCAGTTCGAATACAATTGACATTTTTAGATGCATTACCATCTCCGGTAAAAATATTAGTATTACTGTTAGTAATATTAGATGCTGGGAGAGAGTTTGAATCGTACGGTGAATTAGGATTCATTGCTACAGATGATATACTAGTTGGCTGATTATTTGTTGAAAGTGGAGATAGTAATCTTTGAGTTCTTATTAAAACACCTTCTCCACCGTTGACTGGATCAATAGAGAAAATATGCACAAGACCGTCTAGGCCAGCGACAATTAATCGTGGTTGATTNTGATAATANACAAGAGCGGNCACT ] [-] EMBL CD180699 [ TGCGAATGTATTGACCTTACCAGTTGTAACAACGCCTGGATTACTGCCACTGGATAAATTGACAGTTGTAGCAACAGACGCTGGTAATGCATAAACACCTGGTTGTTGCGGCCCGCCAGTTCGAATACAATTGACATTTTTAGATGCATTACCATCTCCGGTAAAAATATTAGTATTACTGTTAGTAATATTAGATGCTGGGAGAGAGTTTGAATCGTACGGTGAATTAGGATTCATTGCTAGAGATGATATACTAGTTGGCTGATTATTTGTTGAAAGTGGAGATAGTAATCTTTGAGTTCTTATTAAAACACCTTCTCCACCGTTGACTGGATCAATAGAGAAAATATGCACAAGACCGTCTAGGCCAGCGACAATTAATCGTGGTTGATTTTGATAATAAACAAGAGCGGCCACTTTCCTTTACCCCGGTGACAATTGCATAAGACTACCTTGAGGAATTGAAGGTGTCGAACCAACATAATTAAGATTAACCAACTCTCCGGTTGGAGTCATGGTCACAGGAC ] [-] EMBL CD180931 [ TGCGAATGTATTGACCTTACCAGTTGTAACAACGCCTGGATTACTGCCACTGGATAAATTGACAGTTGTAGCAACAGACGCTGGTAATGCATAAACACCTGGTTGTTGCGGCCCGCCAGTTCGAATACAATTGACATTTTTAGATGCATTACCATCTCCGGTAAAAATATTAGTATTACTGTTAGTAATATTAGATGCTGGGAGAGAGTTTGAATCGTACGGTGAATTAGGATTCATTGCTACAGATGATATACTAGTTGGCTGATTATTTGTTGAAAGTGGAGATAGTAATCTTTGAGTTCTTATTAAAACACCTTCTCCACCGTTGACTGGATCAATAGAGAAAATATGCACAAGACCGTCTAGGCCAGCGACAATTAATCGTGGTTGATTTTGATAATAAACAAGAGCGGCCACTTTCCTTTGCCCCGGTGACAATTGCATAAGACTACCTTGAGGAATTGAAGGTGTCGAACCAACATAATTAAGATTAACCAACTCTCCGGTTGGAGTCATGGTCACAGGAC ] [-] EMBL CD162973 [ TGCGAATGTATTGACCTTACCAGTTGTAACAACGCCTGGATTACTGCCACTGGATAAATTGACAGTTGTAGCAACAGACGCTGGTAATGCATAAACACCTGGTTGTTGCGGCCCGCCAGTTCGAATACAATTGACATTTTTAGATGCATTACCATCTCCGGTAAAAATATTAGTATTACTGTTAGTAATATTAGATGCTGGGAGAGAGTTTGAATCGTACGGTGAATTAGGATTCATTGCTACAGATGATATACTAGTTGGCTGATTATTTGTTGAAAGTGGAGATAGTAATCTTTGAGTTCTTATTAAAACACCTTCTCCACCGTTGACTGGATCAATAGAGAAAATATGCACAAGACCGTCTAGGCCAGCGACAATTAATCGTGGTTGATTTTGATAATAAACAAGAGCGGCCACTTTCCTTTGCCCCGGTGACAATTGCATAAGACTACCTTGAGGAATTGAAGGTGTCGAACCAACATAATTAAGATTAACCAACTCTCCGGTTGGAGTCATGGTCACAGGAC ] [+] EMBL CD162997 [ CGCCTGGATTACTGCCACTGGATAAATTGACAGTTGTAGCAACAGACGCTGGTAATGCATAAACACCTGGTTGTTGCGGCCCGCCAGTTCGAATACAATTGACATTTTTAGATGCATTACCATCTCCGGTAAAAATATTAGTATTACTGTTAGTAATATTAGATGCTGGGAGAGAGTTTGAATCGTACGGTGAATTAGGATTCATTGCTACAGATGATATACTAGTTGGCTGATTATTTGTTGAAAGTGGAGATAGTAATCTTTGAGTTCTTATTAAAACACCTTCTCCACCGTTGACTGGATCAATAGAGAAAATATGCACAAGACCGTCTAGGCCAGCGACAATTAATCGTGGTTGATTTTGATAATAAACAAGAGCGGCCACTTTCCTTTGCCCCGGTGACAATTGCATAAGACTACCTTGAGGAATTGAAGGTGTCGAACCAACATAATTAAGATTAACCAACTCTCCGGTTGGAGTCATGGTCACAGGA ] [+] EMBL CD142990 [ CGCCTGGATTACTGCCACTGGATAAATTGACAGTTGTAGCAACAGACGCTGGTAATGCATAAACACCTGGTTGTTGCGGCCCGCCAGTTCGAATACAATTGACATTTTTAGATGCATTACCATCTCCGGTAAAAATATTAGTATTACTGTTAGTAATATTAGATGCTGGGAGAGAGTTTGAATCGTACGGTGAATTAGGATTCATTGCTACAGATGATATACTAGTTGGCTGATTATTTGTTGAAAGTGGAGATAGTAATCTTTGAGTTCTTATTAAAACACCTTCTCCACCGTTGACTGGATCAATAGAGAAAATATGCACAAGACCGTCTAGGCCAGCG ] [+] EMBL CD180814 [ CGCCTGGATTACTGCCACTGGATAAATTGACAGTTGTAGCAACAGACGCTGGTAATGCATAAACACCTGGTTGTTGCGGCCCGCCAGTTCGAATACAATTGACATTTTTAGATGCATTACCATCTCCGGTAAAAATATTAGTATTACTGTTAGTAATATTAGATGCTGGGAGAGAGTTTGAATCGTACGGTGAATTAGGATTCATTGCTACAGATGATATACTAGTTGGCTGATTATTTGTTGAAAGTGGAGATAGTAATCTTTGAGTTCTTATTAAAACACCTTCTCCACCGTTGACTGGATCAATAGAGAAAATATGCACAAGACCGTCTAGGCCAGCGACAATTAATCGTGGTTGATTTTGATAATAAACAAGAGCGGCCACTTTCCTTTGCCCCGGTGACAATTGCATAAGACTACCTTGAGGAATTGAAGGTGTCGAACCAACATAATTAAGATTAACCAACTCTCCGGTTGGAGTCATGGTCACAGGA ] [+] EMBL CD143245 [ CGCCTGGATTACTGCCACTGGATAAATTGACAGTTGTAGCAACAGACGCTGGTAATGCATAAACACCTGGTTGTTGCGGCCCGCCAGTTCGAATACAATTGACATTTTTAGATGCATTACCATCTCCGGTAAAAATATTAGTATTACTGTTAGTAATATTAGATGCTGGGAGAGAGTTTGAATCGTACGGTGAATTAGGATTCATTGCTACAGATGATATACTAGTTGGCTGATTATTTGTTGAAAGTGGAGATAGTCATCTTTGAGTTCTTATT AAACACCTTCTCCACCGTTGACTGCATCAATAGAGAAAATATGC ] [+] EMBL CD180825 [ CGCCTGGATTACTGCCACTGGATAAATTGACAGTTGTAGCAACAGACGCTGGTAATGCATAAACACCTGGTTGTTGCGGCCCGCCAGTTCGAATACAATTGACATTTTTAGATGCATTACCATCTCCGGTAAAAATATTAGTATTACTGTTAGTAATATTAGATGCTGGGAGAGAGTTTGAATCGTACGGTGAATTAGGATTCATTGCTACAGATGATATACTAGTTGGCTGATTATTTGTTGAAAGTGGAGATAGTAATCTTTGAGTTCTTATTAAAACACCTTCTCCACCGTTGACTGGATCAATAGAGAAAATATGCACAAGACCGTCTAGGCCAGCGACAATTAATCGTGGTTGATTTTGATAATAAACAAGAGCGGCCACTTTCCTTTGCCCCGGTGACAATTGCATAAGACTACCTTGAGGAATTGAAGGTGTCGAACCAACATAATTAAGATTAACCAACTCTCCGGTTGGAGTCATGGTCACAGGA ] [-] EMBL CD162898 [ GCCTGGATTACTGCCACTGGATAAATTGACAGTTGTAGCAACAGACGCTGGTAATGCATAAACACCTGGTTGTTGCGGCCCGCCAGTTCGAATACAATTGACATTTTTAGATGCATTACCATCTCCGGTAAAAATATTAGTATTACTGTTAGTAATATTAGATGCTGGGAGAGAGTTTGAATCGTACGGTGAATTAGGATTCATTGCTACAGATGATATACTAGTTGGCTGATTATTTGTTGAAAGTGGAGATAGTAATCTTTGAGTTCTTATTAAAACACCTTCTCCACCGTTGACTGGATCAATAGAGAAAATATGCACAAGACCGTCTAGGCCAGCGACAATTAATCGTGGTTGATTTTGATAATAAACAAGAGCGGCCACTTTCCTTTGCCCCGGTGACAATTGCATAAGACTACCTTGAGGAATTGAAGGTGTCGAACCAACATAATTAAGATTAACCAACTCTCCGGTTGGAGTCATGGTCACAGGAC ] [-] EMBL CD180758 [ GCCTGGATTACTGCCACTGGATAAATTGACAGTTGTAGCAACAGACGCTGGTAATGCATAAACACCTGGTTGTTGCGGCCCGCCAGTTCGAATACAATTGACATTTTTAGATGCATTACCATCTCCGGTAAAAATATTAGTATTACTGTTAGTAATATTAGATGCTGGGAGAGAGTTTGAATCGTACGGTGAATTAGGATTCATTGCTACAGATGATATACTAGTTGGCTGATTATTTGTTGAAAGTGGAGATAGTAATCTTTGAGTTCTTATTAAAACACCTTCTCCACCGTTGACTGGATCAATAGAGAAAATATGCACAAGACCGTCTAGGCCAGCGACAATTAATCGTGGTTGATTTTGATAATAAACAAGAGCGGCCACTTTCCTTTGCCCCGGTGACAATTGCATAAGACTACCTTGAGGAATTGAAGGTGTCGAACCAACATAATTAAGATTAACCAACTCTCCGGTTGGAGTCATGGTCACAGGAC ] [+] EMBL CD180680 [ AATTGACATTTTTAGATGCATTACCATCTCCGGTAAAAATATTAGTATTACTGTTAGTAATATTAGATGCTGGGAGAGAGTTTGAATCGTACGGTGAATTAGGATTCATTGCTACAGATGATATACTAGTTGGCTGATTATTTGTTGAAAGTGGAGATAGTAATCTTTGAGTTCTTATTAAAACACCTTCTCCACCGTTGACTGGATCAATAGAGAAAATATGCACAAGACCGTCTAGGCCAGCGACAATTAATCGTGGTTGATTTTGATAATAAACAAGAGCGGCCACTTTCCTTTGCCCCGGTGACAATTGCATAAGACTACCTTGAGGAATTGAAGGTGTCGAACCAACATAATTAAGATTAACCAACTCTCCGGTTGGAGTCATGGTCACAGGA ] [+] EMBL CD162840 [ AATTGACATTTTTAGATGCATTACCATCTCCGGTAAAAATATTAGTATTACTGTTAGTAATATTAGATGCTGGGAGAGAGTTTGAATCGTACGGTGAATTAGGATTCATTGCTACAGATGATATACTAGTTGGCTGATTATTTGTTGAAAGTGGAGATAGTAATCTTTGAGTTCTTATTAAAACACCTTCTCCACCGTTGACTGGATCAATAGAGAAAATATGCACAAGACCGTCTAGGCCAGCGACAATTAATCGTGGTTGATTTTGATAATAAACAAGAGCGGCCACTTTCCTTTGCCCCGGTGACAATTGCATAAGACTACCTTGAGGAATTGAAGGTGTCGAACCAACATAATTAAGATTAACCAACTCTCCGGTTGGAGTCATGGTCACAGGA ] [+] EMBL CD162714 [ AATTGACATTTTTAGATGCATTACCATCTCCGGTAAAAATATTAGTATTACTGTTAGTAATATTAGATGCTGGGAGAGAGTTTGAATCGTACGGTGAATTAGGATTCATTGCTACAGATGATATACTAGTTGGCTGATTATTTGTTGAAAGTGGAGATAGTAATCTTTGAGTTCTTATTAAAACACCTTCTCCACCGTTGACTGGATCAATAGAGAAAATATGCACAAGACCGTCTAGGCCAGCGACAATTAATCGTGGTTGATTTTGATAATAAACAAGAGCGGCCACTTTCCTTTGCCCCGGTGACAATTGCATAAGACTACCTTGAGGAATTGAAGGTGTCGAACCAACATAATTAAGATTAACCAACTCTCCGGTTGGAGTCATGGTCACAGGA ] [-] EMBL CD162960 [ ATTGACATTNTTAGATGCATTACCATCTCCGGTAAAAATATTAGTATTACTGTTAGTAATATTAGATGCTGGGAGAGAGTNTGAATCGTACGGTGAATTAGGATTCATTGCTACAGATGATATACTAGTTGGCTGATTATTTGTTGAAAGTGGAGATAGTAATCTTTGAGTTCTTATTAAAACACCTTCTCCACCGTTGACTGGATCAATAGAGAAAATATGCACAAGACCGTCTAGGCCAGCGACAATTAATCGTGGTTGATTTTGATAATAAACAAGAGCGGCTACTTTCCTTTGCCCCGGTGACAATTGCATAAGACTACCTTGAGGAATTGAAGGTGTCGAACCAACATAATTAAGATTAACCAACTCTCCGGTTGGAGTCATGGTCACAGGAC ] [-] EMBL CD162722 [ ATTGACATTTTTAGATGCATTACCATCTCCGGCAAAAATATTAGTATTACTGTTAGTAATATTAGATGCTGGGAGAGAGTTTGAATCGTACGGTGAATTAGGATTCATTGCTACAGATGATATACTAGTTGGCTGATTATTTGTTGAAAGTGGAGATAGTAATCTTTGAGTTCTTATTAAAACACCTTCTCCACCGTTGACTGGATCAATAGAGAAAATATGCACAAGACCGTCTAGGCCAGCGACAATTAATCGTGGTTGATTTTGATAATAAACAAGAGCGGCCACTTTCCTTTGCCCCGGTGACAATTGCATAAGACTACCTTGAGGAATTGAAGGTGTCGAACCAACATAATTAAGATTAACCAACTCTCCGGTTGGAGTCATGGTCACAGGAC ] [-] EMBL CD162811 [ ATTGACATTTTTAGATGCATTACCATCTCCGGCAAAAATATTAGTATTACTGTTAGTAATATTAGATGCTGGGAGAGAGTTTGAATCGTACGGTGAATTAGGATTCATTGCTACAGATGATATACTAGTTGGCTGATTATTTGTTGAAAGTGGAGATAGTAATCTTTGAGTTCTTATTAAAACACCTTCTCCACCGTTGACTGGATCAATAGAGAAAATATGCACAAGACCGTCTAGGCCAGCGACAATTAATCGTGGTTGATTTTGATAATAAACAAGAGCGGCCACTTTCCTTTGCCCCGGTGACAATTGCATAAGACTACCTTGAGGAATTGAAGGTGTCGAACCAACATAATTAAGATTAACCAACTCTCCGGTTGGAGTCATGGTCACAGGAC ] [-] EMBL CD162924 [ ATTGACATTTTTAGATGCATTACCATCTCCGGTAAAAATATTAGTATTACTGTTAGTAATATTAGATGCTGGGAGAGAGTTTGAATCGTACGGTGAATTAGGATTCATTGCTACAGATGATATACTAGTTGGCTGATTATTTGTTGAAAGTGGAGATAGTAATCTTTGAGTTCTTATTAAAACACCTTCTCCACCGTTGACTGGATCAATAGAGAAAATATGCACAAGACCGTCTAGGCCAGCGACAATTAATCGTGGTTGATTTTGATAATAAACAAGAGCGGCCACTTTCCTTTGCCCCGGTGACAATTGCATAAGACTACCTTGAGGAATTGAAGGTGTCGAACCAACATAATTAAGATTAACCAACTCTCCGGTTGGAGTCATGGTCACAGGAC ] [-] EMBL CD162933 [ ATTGACATTTTTAGATGCATTACCATCTCCGGTAAAAATATTAGTATTACTGTTAGTAATATTAGATGCTGGGAGAGAGTTTGAATCGTACGGTGAATTAGGATTCATTGCTACAGATGATATACTAGTTGGCTGATTATTTGTTGAAAGTGGAGATAGTAATCTTTGAGTTCTTATTAAAACACCTTCTCCACCGTTGACTGGATCAATAGAGAAAATATGCACAAGACCGTCTAGGCCAGCGACAATTAATCGTGGTTGATTTTGATAATAAACAAGAGCGGCCACTTTCCTTTGCCCCGGTGACAATTGCATAAGACTACCTTGAGGAATTGAAGGTGTCGAACCAACATAATTAAGATTAACCAACTCTCCGGTTGGAGTCATGGTCACAGGAC ] [-] EMBL CD180649 [ ATTGACATTTTTAGATGCATTACCATCTCCGGTAAGAATATTAGTATTACTGTTAGTAATATTAGATGCTGGGAGAGAGTTTGAATCGTACGGTGAATTAGGATTCATTGCTACAGATGATATACTAGTTGGCTGATTATTTGTTGAAAGTGGAGATAGTAATCTTTGAGTTCTTATTAAAACACCTTCTCCACCGTTGACTGGATCAATAGAGAAAATATGCACAAGACCGTCTAGGCCAGCGACAATTAATCGTGGTTGATTTTGATAATAAACAAGAGCGGCCACTTTCCTTTGCCCCGGTGACAATTGCATAAGACTACCTTGAGGAATTGAAGGTGTCGAACCAACATAATTAAGATTAATCAACTCTCCGGTTGGAGTCATGGTCACAGGACTACCACTGCCTGGTGGA] [-] EMBL CD180645 [ ATTGACATTTTTAGATGCATTACCATCTCCGGTAAAAATATTAGTATTACTGTTAGTAATATTAGATGCTGGGAGAGAGTTTGAATCGTACGGTGAATTAGGATTCATTGCTACAGATGATATACTAGTTGGCTGATTATTTGTTGAAAGTGGAGATAGTAATCTTTGAGTTCTTATTAAAACACCTTCTCCACCGTTGACTGGATCAATAGAGAAAATATGCACAAGACCGTCTAGGCCAGCGACAATTAATCGTGGTTGATTTTGATAATAAACAAGAGCGGCCACTTTCCTTTGCCCCGGTGACAATTGCATAAGACTACCTTGAGGAATTGAAGGTGTCGAACCAACATAATTAAGATTAACCAACTCTCCGGTTGGAGTCATGGTCACAGGAC ] [-] EMBL CD180668 [ ATTGACATTTTTAGATGCATTACCATCTCCGGTAAAAATATTAGTATTACTGTTAGTAATATTAGATGCTGGGAGAGAGTTTGAATCGTACGGTGAATTAGGATTCATTGCTACAGATGATATACTAGTTGGCTGATTATTTGTTGAAAGTGGAGATAGTAATCTTTGAGTTCTTATTAAAACACCTTCTCCACCGTTGACTGGATCAATAGAGAAAATATGCACAAGACCGTCTAGGCCAGCGACAATTAATCGTGGTTGATTTTGATAATAAACAAGAGCGGCCACTTTCCTTTGCCCCGGTGACAATTGCA ] [-] EMBL CD181076 [ CCGGTGACAATTGCATAAGACTACTTTGAGGAATTGAAGGTGTCGAACCAACATAATTAAGATTAACCAACTCTCCGGTTGGAGTCATGGTCACAGGAC ] consensusID : consensus_11163#2 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 1 consensus length = 346 fasta sequence [TGTCGAGTATATTGCGACCTGTCGGATATAAAGTTGCTTGTATGAGTAGTAGTCTGTTAGCTTTATTAATAGTAGCATTTTTTTTTACTTTAATCATAGGATCTATAACATTTTATGTTTTAGGATTTAGATTTTCATTAGATCACTATATTAGACTTAAGGAGTGGTATAGTAGATTTGAGTGCGGGTTTCTGAGGCATGGTTACAAAGAGAATTTTTTTAGGTTTTCTAACTAAATTTATGAGTATAATTTGTAGTATCCGATTGGGAAGTTCCTTATTGGCTAAAGTCGTATTTGATGGGATTGGTTTTACACTAATGGAGGTAACCCCTCTGTGCCCTTTTG] [+] EMBL AW087123 [TGTCGAGTATATTGCGACCTGTCGGATATAAAGTTGCTTGTATGAGTAGTAGTCTGTTAGCTTTATTAATAGTAGCATTTTTTTTTACTTTAATCATAGGATCTATAACATTTTATGTTTTAGGATTTAGATTTTCATTAGATCACTATATTAGACTTAAGGAGTGGTATAGTAGATTTGAGTGCGGGTTTCTGAGGCATGGTTACAAAGAGAATTTTTTTAGGTTTTCTAACTAAATTTATGAGTATAATTTGTAGTATCCGATTGGGAAGTTCCTTATTGGCTAAAGTCGTATTTGATGGGATTGGTTTTACACTAATGGAGGTAACCCCTCTGTGCCCTTTTG] consensusID : consensus_11163#3 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 1 consensus length = 324 fasta sequence [CTTTATTAATAGTAGCATTTTTTTTTACTTTAATCATAGGATCTATAACATTTTATGTTTTAGGATTTAGATTTTCATTAGATCACTATATTAGACTTAAGGAGTGGTATAGTAGATTTGAGTGCGGGTTTCTGAGGCATGGTTACAAAGAGAATTTTTTTAGGTTTCCTTACTTAAATTTATTAGTATATATTGTGTAGTATCGCGATTTTGGAAGTCCTTATGCAAGTCTATTGAGGATGGTAAACATATGATGTATTCTTTCTCTCTGTGTGTTTTTGTGTATAGATAGAGTAGTGTGGTATATAAGTGGATGTAGTATTG] [+] EMBL SMAA25553 [CTTTATTAATAGTAGCATTTTTTTTTACTTTAATCATAGGATCTATAACATTTTATGTTTTAGGATTTAGATTTTCATTAGATCACTATATTAGACTTAAGGAGTGGTATAGTAGATTTGAGTGCGGGTTTCTGAGGCATGGTTACAAAGAGAATTTTTTTAGGTTTCCTTACTTAAATTTATTAGTATATATTGTGTAGTATCGCGATTTTGGAAGTCCTTATGCAAGTCTATTGAGGATGGTAAACATATGATGTATTCTTTCTCTCTGTGTGTTTTTGTGTATAGATAGAGTAGTGTGGTATATAAGTGGATGTAGTATTG] consensusID : consensus_11163#4 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 1 consensus length = 306 fasta sequence [ACATAGGACCTAAAACCACTTTATGTTTTAGGATTTAGATTTTCATTAGATCACTATATTAGACTTAAGGAGTGGTATAGTAGATTTGAGTGCGGGTCTCTGAGGCATGGTTACAAAGAGAATGCTTTTAGGCGTCTGACCTGAAAGTTATTAGTATCATTTGTAGTATTCGATTTGGAAGTTTCTCTATTGCTAAAAGTCGTATTTGATGGATTTGGCTTATACATATTGATGTATCTCTCTTTCTCTGTTTGTTTTTTTTGTATTGATAGAGGTAGGTTTGGTATATAAGTGATGAGTATTGTT] [-] EMBL SMAA25552 [ACATAGGACCTAAAACCACTTTATGTTTTAGGATTTAGATTTTCATTAGATCACTATATTAGACTTAAGGAGTGGTATAGTAGATTTGAGTGCGGGTCTCTGAGGCATGGTTACAAAGAGAATGCTTTTAGGCGTCTGACCTGAAAGTTATTAGTATCATTTGTAGTATTCGATTTGGAAGTTTCTCTATTGCTAAAAGTCGTATTTGATGGATTTGGCTTATACATATTGATGTATCTCTCTTTCTCTGTTTGTTTTTTTTGTATTGATAGAGGTAGGTTTGGTATATAAGTGATGAGTATTGTT] consensusID : consensus_11163#5 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 1 consensus length = 204 fasta sequence [ATTTTTTAGGTTTCCTACCTATAAATTTTTAGTATAATTGTTAGTATTCGATTTGAAGTTTCTTTATTGCTAAAAGTCGTATTTGATGGGATTTGGTTTTATACATATTGATGTTATTTCTTTATTTTCTTTATCGTTTTATTTTAGTTATTTGATAGAGGTCGGTTTTGGGTATATAAAGTGGATGTAGTATTTGTTTTGAGT] [-] EMBL BE431253 [ATTTTTTAGGTTTCCTACCTATAAATTTTTAGTATAATTGTTAGTATTCGATTTGAAGTTTCTTTATTGCTAAAAGTCGTATTTGATGGGATTTGGTTTTATACATATTGATGTTATTTCTTTATTTTCTTTATCGTTTTATTTTAGTTATTTGATAGAGGTCGGTTTTGGGTATATAAAGTGGATGTAGTATTTGTTTTGAGT] consensus multiple alignement with clustalw CLUSTAL W (1.82) multiple sequence alignment consensus_11163#3 ------------------------------------------------------------ consensus_11163#4 ------------------------------------------------------------ consensus_11163#2 ------------------------------------------------------------ consensus_11163#5 ------------------------------------------------------------ consensus_11163#0 ------------------------------------------------------------ consensus_11163#1 TGTTTTCATCTTTTAAACCACCAGCAACAACTGATGCGAATGTATTGACCTTACCAGTTG 60 consensus_11163#3 ------------------------------------------------------------ consensus_11163#4 ------------------------------------------------------------ consensus_11163#2 ---------------------------------------------------TGTCGAGTA 9 consensus_11163#5 ------------------------------------------------------------ consensus_11163#0 ------------------------------------------------------------ consensus_11163#1 TAACAACGCCTGGATTACTGCCACTGGATAAATTGACAGTTGTAGCAACAGACGCTGGTA 120 consensus_11163#3 ---------------------------------------------------CTTTATTAA 9 consensus_11163#4 ------------------------------------------------------------ consensus_11163#2 TATTGCGACCTGTCGGATATAAAGTTGCTTGTATGAGTAGTAGTCTGTTAGCTTTATTAA 69 consensus_11163#5 ------------------------------------------------------------ consensus_11163#0 ----------------------AGTTGCTTGTATGAGTAGTAGTCTGTTAGCTTTATTAA 38 consensus_11163#1 ATGCATAAACACCTGGTTGTTGCGGCCCGCCAGTTCGAATACAATTGACATTTTTAGATG 180 consensus_11163#3 TAGTAGCATTTTTTTTTACTTTAATCATAGGATCTATAAC-ATTTTATGTTTTAGGATTT 68 consensus_11163#4 ------------------------ACATAGGACCTAAAACCACTTTATGTTTTAGGATTT 36 consensus_11163#2 TAGTAGCATTTTTTTTTACTTTAATCATAGGATCTATAAC-ATTTTATGTTTTAGGATTT 128 consensus_11163#5 ------------------------------------------------------------ consensus_11163#0 TAGTAGCATTTTTTTTTACTTTAATCATAGGATCTATAAC-ATTTTATGTTTTAGGATTT 97 consensus_11163#1 CATTACCATCTCCGGTAAAAATATTAGTATTACTGTTAGTAATATTAGATGCTGGGAG-- 238 consensus_11163#3 AGATTTTCATTAGATCACTATATTAGACTTAAGGAGTG-GTATAGTAGATTTGAGTGCGG 127 consensus_11163#4 AGATTTTCATTAGATCACTATATTAGACTTAAGGAGTG-GTATAGTAGATTTGAGTGCGG 95 consensus_11163#2 AGATTTTCATTAGATCACTATATTAGACTTAAGGAGTG-GTATAGTAGATTTGAGTGCGG 187 consensus_11163#5 ------------------------------------------------------------ consensus_11163#0 AGATTTTCATTAGATCACTATATTAGACTTAAGGAGTG-GTATAGTAGATTTGAGTGCGG 156 consensus_11163#1 AGAGTTTGAATCGTACGGTGAATTAGGATTCATTGCTACAGATGATATACTAGTTGGCTG 298 consensus_11163#3 GTTTCTGAGGCATGGTTACAAAGAGAATTTTTTTAGGTTTCCTTACTTAAATTTATTAGT 187 consensus_11163#4 GTCTCTGAGGCATGGTTACAAAGAGAATGCTTTTAGGCGTCTGACCTGAAAGTTATTAGT 155 consensus_11163#2 GTTTCTGAGGCATGGTTACAAAGAGAATTTTTTTAGGTTTTCTAACT-AAATTTATGAGT 246 consensus_11163#5 ---------------------------ATTTTTTAGGTTTCCTACCTATAAATTTTTAGT 33 consensus_11163#0 GTTTCTGAGGCATGGTTACAAAGAGAATTTTTTTAGGTTTTCTTACTTAAATTTATTAGT 216 consensus_11163#1 ATTATTTGTTGAAAGTGGAGATAGTAATCTTTGAGTTCTTATTAAAACACCTTCTCCACC 358 ** * * * consensus_11163#3 ATATATTGTGT-AGTATCGCGATTTTG---GAAGTCCTTA-------TGCAAGTC----- 231 consensus_11163#4 AT-CATT-TGT-AGTATT-CGATTTGG---AAGTTTCTCTATTGC--TAAAAGTCGTATT 206 consensus_11163#2 AT--AATTTGT-AGTATC-CGATTGGG---AAGTTCCTTATTGGC--TA-AAGTCGTATT 296 consensus_11163#5 AT--AATTGTT-AGTATT-CGATTT-G---AAGTTTCTTTATTGC--TAAAAGTCGTATT 83 consensus_11163#0 AT--TATTTGT-AGTATT-CGATTTGG---AAGTTTCTTTATTGC--TAAAAGTCGTATT 267 consensus_11163#1 GTTGACTGGATCAATAGAGAAAATATGCACAAGACCGTCTAGGCCAGCGACAATTAATCG 418 * * * * ** * * * * * * * consensus_11163#3 TATTGAGGAT-GG---TAAACATAT-GATGTAT-TCTTTC--TCTCTGTG-TGTTTTTGT 282 consensus_11163#4 TGATGGATTT-GGCT-TATACATATTGATGTATCTCTCTT--TCTCTGTT-TGTTTTTTT 261 consensus_11163#2 TGATGGGATT-GGTTTTACACTAATGGAGGTAA-----CC--CCTCTGTG-CCCTTTTG- 346 consensus_11163#5 TGATGGGATTTGGTTTTATACATATTGATGTTATTTCTTTATTTTCTTTA-TCGTTTTAT 142 consensus_11163#0 TGATGGGATTTGGTTTTATACATATTGATGTTATTTCTTTTTTTTCTTTT-TTGTTTTTT 326 consensus_11163#1 TGGTTGATTTTGATAATAAACAAGAGCGGCCACTTTCCTTTGCCCCGGTGACAATTGCAT 478 * * * * ** ** * * ** consensus_11163#3 -GTA-----TAGATAGAG---TAGTGTGGTATATA---AGTGGATGTAGTATTG------ 324 consensus_11163#4 TGTA-----TTGATAGAG-GTAGGTTTGGTATATA---AGTG-ATG-AGTATTGTT---- 306 consensus_11163#2 ------------------------------------------------------------ consensus_11163#5 TTTAGTTATTTGATAGAG-GTCGGTTTTGGGTATATAAAGTGGATGTAGTATTTGTTTTG 201 consensus_11163#0 TTTG-TTATTTGATAGAG-GTAGGTTTTGGGTATATAAAGTGGATGTAGTATTTGTTTTA 384 consensus_11163#1 AAGACTACCTTGAGGAATTGAAGGTGTCGAACCAACATAATTAAGATTAACCAACTCTCC 538 consensus_11163#3 ------------------------------------------------------------ consensus_11163#4 ------------------------------------------------------------ consensus_11163#2 ------------------------------------------------------------ consensus_11163#5 AGT--------------------------------------------------------- 204 consensus_11163#0 AGTGGAGATAGTAATCTTTGAGTTCTTATTAAAACACCTTCTCCACCGTTGACTGGATCA 444 consensus_11163#1 GGTTGGAGTCATGGTCACAGGACTACCACTGCCTGNTGGA-------------------- 578 consensus_11163#3 ------------------------------------------------------------ consensus_11163#4 ------------------------------------------------------------ consensus_11163#2 ------------------------------------------------------------ consensus_11163#5 ------------------------------------------------------------ consensus_11163#0 ATAGAGAAAATATGCACAAGACCGTCTAGGCCAGCGACAATTAATCGTGGTTGATTTTGA 504 consensus_11163#1 ------------------------------------------------------------ consensus_11163#3 ------------------------------------------------------------ consensus_11163#4 ------------------------------------------------------------ consensus_11163#2 ------------------------------------------------------------ consensus_11163#5 ------------------------------------------------------------ consensus_11163#0 TAATAAACAAGAGCGGCCACTTTCCTTTGCCCCGGTGACAATTGCATAAGACTACCTTGA 564 consensus_11163#1 ------------------------------------------------------------ consensus_11163#3 ------------------------------------------------------------ consensus_11163#4 ------------------------------------------------------------ consensus_11163#2 ------------------------------------------------------------ consensus_11163#5 ------------------------------------------------------------ consensus_11163#0 GGAACTGAAGGTGTCGAACCAACATAATTAAGATTAACCAACTCTCCGGTTGGAGTCATG 624 consensus_11163#1 ------------------------------------------------------------ consensus_11163#3 ---------- consensus_11163#4 ---------- consensus_11163#2 ---------- consensus_11163#5 ---------- consensus_11163#0 GTCACAGGAC 634 consensus_11163#1 ---------- |
Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) | ||||