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consensusID : consensus_11214#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 17 consensus length = 1272 fasta sequence 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NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 7 consensus length = 714 fasta sequence [TTCGGCACGAGGATTGGATTGGTGAGTTCATTCAAAAGAAAGGGTGTGAATGGGGCGTAACCACTAAACGTAAGCGACGGATCGGTTGGTTAGATACAGTGGTTATACGATATGCACATATTATCAATGACTTTAACGCCCTGGCTTTGACGAAGATTGACGTGTTGGATGACCTGGAAGAGGTGAAAATAGCTAAAGCGTACATTGATCCAGAAACTGGACGTGAACTTGACAGCTTTCCATCTGACTCTTCTGTCCTTAATCATGTAGTTGTTGTTTATGAAACTCTTCCTGGATGGAAAACGTCTACTCATGGTTGTCGTGTTTATGAGGAACTACCAACTGCTGCCAAAGTTTTTGTAGAAACAGTTGAGAAGTTGCTTAATATACCTATACGTTGGATTGGAACAGGCGCTTCTCGGGACTCCATTATAATTAGATCCGTTTAATACCAGAATTTTAAAACTGTAAAATATTTAACTTTCGTAGATTCAACTTCATTAAATAAATTAGGCCTAGAATCTTTATGTGTCCCCATTTCTATAACATAAACCCACTTTTTCCATAAAGATGATCTTACTTTTGTCCGTTATACTTGACTGTATTACATTCACCACGTCAACCTAGTTTGATCACGTTGTCTGATTTAATTTTAA--T--TCAGA---CC--TATCAT-AAGA-TA-TA-CATTTATTTAATTATCCTTTAAATCAGGTGATCAGT] [+] EMBL CD079728 [TTCGGCACGAGGATTGGATTGGTGAGTTCATTCAAAAGAAAGGGTGTGAATGGGGCGTAACCACTAAACGTAAGCGACGGATCGGTTGGTTAGATACAGTGGTTATACGATATGCACATATTATCAATGACTTTAACGCCCTGGCTTTGACGAAGATTGACGTGTTGGATGACCTGGAAGAGGTGAAAATAGCTAAAGCGTACATTGATCCAGAAACTGGACGTGAACTTGACAGCTTTCCATCTGACTCTTCTGTCCTTAATCATGTAGTTGTTGTTTATGAAACTCTTCCTGGATGGAAAACGTCTACTCATGGTTGTCGTGTTTATGAGGAACTACCAACTGCTGCCAAAGTTTTTGTAGAAACAGTTGAGAAGTTGCTTAATATACCTATACGTTGGATTGGAACAGGCGCTTCTCGGGACTCCATTATAATTAGATCCGTTTAATACCAGAATTTTAAAACTGTAAAATATTTAACTTTCGTAGATTCAACTTCATTAAATAAATTAGGCCTAGAATCTTTATGTGTCCCCATTTCTATAACATAAACCCACTTTTTCCATAAAGATGATCTTACTTTTGTCCGTTATACTTGACTGTATTACATTCACCACGTCAACCTAGTTTGATCACGTTGTCTGATTTAATTTTAA TTNTCAGA tt t ] [+] EMBL CD083122 [ GCGACGGATCGGTTGGTTAGATACAGTGGTTATACGATATGCACATATTATCAATGACTTTAACGCCCTGGCTTTGACGAAGATTGACGTGTTGGATGACCTGGAAGAGGTGAAAATAGCTAAAGCGTACATTGATCCAGAAACTGGACGTGAACTTGACAGCTTTCCATCTGACTCTTCTGTCCTTAATCATGTAGTTGTTGTTTATGAAACTCTTCCTGGATGGAAAACGTCTACTCATGGTTGTCGTGTTTATGAGGAACTACCAACTGCTGCCAAAGTTTTTGTAGAAACAGTTGAGAAGTTGCTTAATATACCTATACGTTGGATTGGAACAGGCGCTTCTCGGGACTCCATTATAATTAGATCCGTTTAATACCAGAATTTTAAAACTGTAAAATATTTAACTTTCGTAGATTCAACTTCATTAAATAAATTAGGCCTAGAATCTTTATGTGTCCCCATTTCTATAACATAAACCCACTTTTTCCATAAAGATGATCTTACTTTTGTCCGTTATACTTGACTGTATTACATTCACCACGTCAACCTAGTTTGATCACGTTGTCTGATT ] [+] EMBL CD078516 [ TGACCCGTTGGATGACCTGGAAGAGGTGAAAATAGCTAAAGCGTACATTGATCCAGAAACTGGACGTGAACTTGACAGCTTTCCATCTGACTCTTCTGTCCTTAATCATGTAGTTGTTGTTTATGAAACTCTTCCTGGATGGAAAACGTCTACTCATGGTTGTCGTGTTTATGAGGAACTACCAACTGCTGCCAAAGTTTTTGTAGAAACAGTTGAGAAGTTGCTTAATATACCTATACGTTGGATTGGAACAGGCGCTTCTCGGGACTCCATTATAATTAGATCCGTTTAATACCAGAATTTTAAAACTGTAAAATATTTAACTTTCGTAGATTCAACTTCATTAAATAAATTAGGCCTAGAATCTTTATGTGTCCCCATTTCTATAACATAAACCCACTTTTTCCATAAAGATGATCTTACTTTTGTCCGTTATACTTGACTGTATTACATTCACCACGTCAACCTAGTTTGATCACGTTGT ] [+] EMBL CD152549 [ CCTTAATCATGTAGGGGTTGTTTATGAAACTCTTCCTGGATGGAAAACGTCTACTCATGGTTGTCGTGTTTATGAGGAACTACCAACTGCTGCCAAAGTTTTTGTAGAAACAGTTGAGAAGTTGCTTAATATACCTATACGTTGGATTGGAACAGGCGCTTCTCGGGACTCCATTATAATTAGATCCGTTTAATACCAGAATTTTAAAACTGTAAAATATTTAACTTTCGTAGATTCGACTTCATTAAATAAATTAGGCCTAGAATCTTTATGTGTCCCCATTTCTATAACATAAACCCACTTTTTCCATAAAGATGATCTTACTTTTGTCCGTTATACTTGACTGTATTACATTCACCACGTCAACCTAGTTTGATCACGTTGTCTGATTTA ] [-] EMBL CD113767 [ TTTATGAGGAACTACCAACTGCTGCCAAATTTTTTGTAGAAACAGTTGAGAAGTTGCTTAATATACCTATACGTTGGATTGGAACAGGCGCTTCTCGGGACTCCATTATAATTAGATCCGTTTAATACCAGAATTTTAAAACTGTAAAATATTTAACTTTCGTAGATTCAACTTCATTAAATAAATTAGGCCTAGAATCTTTATGTGTCCCCATTTCTATAACATAAACCCACTTGTTCCATAAAGATGATCTTACTTTTGTCCGTTATACTTGACTGTATTACGTTCACCACTTCAACCTAGTTTGAACACGCTGTCTGATTTAATTTTAATTT TCAGATTTCCTTTATCATAAAGATTATTATCATTTATTTAATTATCCTTTAAATCAGGTGATCAGT] [-] EMBL CD113786 [ TAATTAGATCCGTTTAATACCAGAATTTTAAATCTGTAAAATATTTAACTTTCGTAGATTCAACTTCATTAAATAAATTAGGCCTAGAATCTTTATGTGTCCCCATTTCTATAACATAAACCCACTTGTTCCATAAAGATGATCTTACTTTTGTCCGTTATACTTG ] [+] EMBL AA938788 [ GTTATACTTGACTGTATTACATTCACCACGTCAACCTAGTTTGATCACGTTGTCTGATTTAATTTTAA T TCAGA CC TAACAT AAGA TA TA CATATAata ] consensus multiple alignement with clustalw CLUSTAL W (1.82) multiple sequence alignment
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** * ** *** * **** * * * ** * * *** * *
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** * * ** ** ** ** *** ** * * * * * *
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* * * * * * * * ** ** * * * * ** * * ******
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** ** * * ** * * * * * * * *** * * ** *** *
consensus_11214#0 GTTGGA------TTGGAACAGGC-GCTTCTCGGGACTCCATTATAA--TTAGATCCGTTT 766
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* * * * ** * * ** * * * ** * * * * * * * **
consensus_11214#0 AATACCAGAATTTTAAAA--CTGTAAAATATTTAACTTTCGTAGATTCAACTTCATTAAA 824
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* * ** *** ** * ********* * * * ** *** *
consensus_11214#0 TAAATTAGGCCTAGAATCTTTATGTGTCCCCATTTCTATAACATAAACCCACTTTTTCCA 884
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*** * * ****** ** * * * * ** ** * ** **
consensus_11214#0 TAAAGATGATCTTACTTTTGTCCGTTATACTTGACTGTATTACATTCACCACGTCAACCT 944
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consensus_11214#2 -GGGGATGGTGTGTGATTCGGTCATACTGATTAATAAGCTTGTGAAAAGTAAG-CAGGCA 453
**** * * ** * * * * ** * ** * * * ** *
consensus_11214#0 AGTTTGATCACGTTGTCTGATTTAATTTTAATTTTCAGATTTCCTTTATCATAAAGATTA 1004
consensus_11214#3 AGTTTGATCACGTTGTCTGATTTAATTTTAAT--TCAGA-----CCTATCATAAGATATA 678
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* * * * * ** * * *
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* *
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consensus_11214#3 ------------------------------------------------------------
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consensus_11214#3 --------------------------------
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consensus_11214#2 ACGATATGCACATATTATCAATGACTTT---- 777
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| Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) | ||||