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consensusID : consensus_11214#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 17 consensus length = 1272 fasta sequence
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[TTCGGCACGAGGATTGGATTGGTGAGTTCATTCAAAAGAAAGGGTGTGAATGGGGCGTAACCACTAAACGTAAGCGACGGATCGGTTGGTTAGATACAGTGGTTATACGATATGCACATATTATCAATGACTTTAACGCCCTGGCTTTGACGAAGATTGACGTGTTGGATGACCTGGAAGAGGTGAAAATAGCTAAAGCGTACATTGATCCAGAAACTGGACGTGAACTTGACAGCTTTCCATCTGACTCTTCTGTCCTTAATCATGTAGTTGTTGTTTATGAAACTCTTCCTGGATGGAAAACGTCTACTCATGGTTGTCGTGTTTATGAGGAACTACCAACTGCTGCCAAAGTTTTTGTAGAAACAGTTGAGAAGTTGCTTAATATACCTATACGTTGGATTGGAACAGGCGCTTCTCGGGACTCCATTATAATTAGATCCGTTTAATACCAGAATTTTAAAACTGTAAAATATTTAACTTTCGTAGATTCAACTTCATTAAATAAATTAGGCCTAGAATCTTTATGTGTCCCCATTTCTATAACATAAACCCACTTTTTCCATAAAGATGATCTTACTTTTGTCCGTTATACTTGACTGTATTACATTCACCACGTCAACCTAGTTTGATCACGTTGTCTGATTTAATTTTAA--T--TCAGA---CC--TATCAT-AAGA-TA-TA-CATTTATTTAATTATCCTTTAAATCAGGTGATCAGT]
[+] EMBL CD079728 [TTCGGCACGAGGATTGGATTGGTGAGTTCATTCAAAAGAAAGGGTGTGAATGGGGCGTAACCACTAAACGTAAGCGACGGATCGGTTGGTTAGATACAGTGGTTATACGATATGCACATATTATCAATGACTTTAACGCCCTGGCTTTGACGAAGATTGACGTGTTGGATGACCTGGAAGAGGTGAAAATAGCTAAAGCGTACATTGATCCAGAAACTGGACGTGAACTTGACAGCTTTCCATCTGACTCTTCTGTCCTTAATCATGTAGTTGTTGTTTATGAAACTCTTCCTGGATGGAAAACGTCTACTCATGGTTGTCGTGTTTATGAGGAACTACCAACTGCTGCCAAAGTTTTTGTAGAAACAGTTGAGAAGTTGCTTAATATACCTATACGTTGGATTGGAACAGGCGCTTCTCGGGACTCCATTATAATTAGATCCGTTTAATACCAGAATTTTAAAACTGTAAAATATTTAACTTTCGTAGATTCAACTTCATTAAATAAATTAGGCCTAGAATCTTTATGTGTCCCCATTTCTATAACATAAACCCACTTTTTCCATAAAGATGATCTTACTTTTGTCCGTTATACTTGACTGTATTACATTCACCACGTCAACCTAGTTTGATCACGTTGTCTGATTTAATTTTAA TTNTCAGA tt t ]
[+] EMBL CD083122 [ GCGACGGATCGGTTGGTTAGATACAGTGGTTATACGATATGCACATATTATCAATGACTTTAACGCCCTGGCTTTGACGAAGATTGACGTGTTGGATGACCTGGAAGAGGTGAAAATAGCTAAAGCGTACATTGATCCAGAAACTGGACGTGAACTTGACAGCTTTCCATCTGACTCTTCTGTCCTTAATCATGTAGTTGTTGTTTATGAAACTCTTCCTGGATGGAAAACGTCTACTCATGGTTGTCGTGTTTATGAGGAACTACCAACTGCTGCCAAAGTTTTTGTAGAAACAGTTGAGAAGTTGCTTAATATACCTATACGTTGGATTGGAACAGGCGCTTCTCGGGACTCCATTATAATTAGATCCGTTTAATACCAGAATTTTAAAACTGTAAAATATTTAACTTTCGTAGATTCAACTTCATTAAATAAATTAGGCCTAGAATCTTTATGTGTCCCCATTTCTATAACATAAACCCACTTTTTCCATAAAGATGATCTTACTTTTGTCCGTTATACTTGACTGTATTACATTCACCACGTCAACCTAGTTTGATCACGTTGTCTGATT ]
[+] EMBL CD078516 [ TGACCCGTTGGATGACCTGGAAGAGGTGAAAATAGCTAAAGCGTACATTGATCCAGAAACTGGACGTGAACTTGACAGCTTTCCATCTGACTCTTCTGTCCTTAATCATGTAGTTGTTGTTTATGAAACTCTTCCTGGATGGAAAACGTCTACTCATGGTTGTCGTGTTTATGAGGAACTACCAACTGCTGCCAAAGTTTTTGTAGAAACAGTTGAGAAGTTGCTTAATATACCTATACGTTGGATTGGAACAGGCGCTTCTCGGGACTCCATTATAATTAGATCCGTTTAATACCAGAATTTTAAAACTGTAAAATATTTAACTTTCGTAGATTCAACTTCATTAAATAAATTAGGCCTAGAATCTTTATGTGTCCCCATTTCTATAACATAAACCCACTTTTTCCATAAAGATGATCTTACTTTTGTCCGTTATACTTGACTGTATTACATTCACCACGTCAACCTAGTTTGATCACGTTGT ]
[+] EMBL CD152549 [ CCTTAATCATGTAGGGGTTGTTTATGAAACTCTTCCTGGATGGAAAACGTCTACTCATGGTTGTCGTGTTTATGAGGAACTACCAACTGCTGCCAAAGTTTTTGTAGAAACAGTTGAGAAGTTGCTTAATATACCTATACGTTGGATTGGAACAGGCGCTTCTCGGGACTCCATTATAATTAGATCCGTTTAATACCAGAATTTTAAAACTGTAAAATATTTAACTTTCGTAGATTCGACTTCATTAAATAAATTAGGCCTAGAATCTTTATGTGTCCCCATTTCTATAACATAAACCCACTTTTTCCATAAAGATGATCTTACTTTTGTCCGTTATACTTGACTGTATTACATTCACCACGTCAACCTAGTTTGATCACGTTGTCTGATTTA ]
[-] EMBL CD113767 [ TTTATGAGGAACTACCAACTGCTGCCAAATTTTTTGTAGAAACAGTTGAGAAGTTGCTTAATATACCTATACGTTGGATTGGAACAGGCGCTTCTCGGGACTCCATTATAATTAGATCCGTTTAATACCAGAATTTTAAAACTGTAAAATATTTAACTTTCGTAGATTCAACTTCATTAAATAAATTAGGCCTAGAATCTTTATGTGTCCCCATTTCTATAACATAAACCCACTTGTTCCATAAAGATGATCTTACTTTTGTCCGTTATACTTGACTGTATTACGTTCACCACTTCAACCTAGTTTGAACACGCTGTCTGATTTAATTTTAATTT TCAGATTTCCTTTATCATAAAGATTATTATCATTTATTTAATTATCCTTTAAATCAGGTGATCAGT]
[-] EMBL CD113786 [ TAATTAGATCCGTTTAATACCAGAATTTTAAATCTGTAAAATATTTAACTTTCGTAGATTCAACTTCATTAAATAAATTAGGCCTAGAATCTTTATGTGTCCCCATTTCTATAACATAAACCCACTTGTTCCATAAAGATGATCTTACTTTTGTCCGTTATACTTG ]
[+] EMBL AA938788 [ GTTATACTTGACTGTATTACATTCACCACGTCAACCTAGTTTGATCACGTTGTCTGATTTAATTTTAA T TCAGA CC TAACAT AAGA TA TA CATATAata ]
consensus multiple alignement with clustalw CLUSTAL W (1.82) multiple sequence alignment
consensus_11214#0 ATATCCACAGCTTGGGATTAACGATCAAGACTCATTGCAGCCCCTGAGACCTTATCGACT 60
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consensus_11214#0 CTTTCTCCTTCTCGTGTTGGTCGTGTATATGGTGTTATCAAAGCTTATACAACACGTGTA 300
consensus_11214#3 ------------------------------------------------------------
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consensus_11214#2 ------------------------------------------------------------
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** * ** *** * **** * * * ** * * *** * *
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* * * * * * * * ** ** * * * * ** * * ******
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** ** * * ** * * * * * * * *** * * ** *** *
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* * * * ** * * ** * * * ** * * * * * * * **
consensus_11214#0 AATACCAGAATTTTAAAA--CTGTAAAATATTTAACTTTCGTAGATTCAACTTCATTAAA 824
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consensus_11214#1 CACAGCAAAATACAAAGAACTCGTAAAATATGTTAAAAGAAGATATCCAAAGCTTGGGAT 621
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* * ** *** ** * ********* * * * ** *** *
consensus_11214#0 TAAATTAGGCCTAGAATCTTTATGTGTCCCCATTTCTATAACATAAACCCACTTTTTCCA 884
consensus_11214#3 TAAATTAGGCCTAGAATCTTTATGTGTCCCCATTTCTATAACATAAACCCACTTTTTCCA 565
consensus_11214#1 TAACGTTGA---AGAATCATTGGAG----CAACTGAGAACTTATCGACAGAAGTTGTC-- 672
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*** * * ****** ** * * * * ** ** * ** **
consensus_11214#0 TAAAGATGATCTTACTTTTGTCCGTTATACTTGACTGTATTACATTCACCACGTCAACCT 944
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consensus_11214#2 -GGGGATGGTGTGTGATTCGGTCATACTGATTAATAAGCTTGTGAAAAGTAAG-CAGGCA 453
**** * * ** * * * * ** * ** * * * ** *
consensus_11214#0 AGTTTGATCACGTTGTCTGATTTAATTTTAATTTTCAGATTTCCTTTATCATAAAGATTA 1004
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* * * * * ** * * *
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* *
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| Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) | ||||