|
These datas are free for academic use only, please contact me for any other use. Schistosoma mansoni see consensus multiple alignment with clustalw Direct access to contigs :
consensusID : consensus_11230#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 2 consensus length = 1025 fasta sequence
[AATATGTATATTTATATTATCCACTGAATAGCTGAAAGCTATTTTGTGTTTATTATACTAAAACGAATTCGACCATGAATGATACAACGTATAGCCAGTTCATTAGAAAAAACCCCATAGTATTTGAATGGATACGTGTTAATATCACCAACAATCAAGTGTTCTTATATTATATTAATCAATATTTACTCAGTCTAATAAACAATAAACTGAGGAAAATTAATATCCTGAAATATCAAAATTGACAATCAAAACTGCGAAATCATATGTATTTCCTGATGAGTGACTTCATTATTTCAGATGTATAGAAGTACCTTGAAATTATAAATACAGACGAATTAATAAGTTCTCATACAGTGATATTTAATTTCAAGTATATTGAGTACTTTACTACCTATTCAGGCTCCAAAGGATAATAAATATAATGATGAACGTGAGCGTTCTTATAATGCGTTACACACGAAAACAAGTTTTAAAAAAAGGTGGGTGATAGTCACCATTGAGAAAGAAAAAATAATGACCTACGAAGAAGAAATTATTACAATAAGAGCGATTGTTATGAATAAATAAGTAATGAAATAATCGAAACAATTATTTGATGAATCGGCCAAAAAGACTGGACATAAATGGAATGAATAGACATTCCCTCATTCGAACGGGAATACATTAATATTGAAGTTGGGAAAAGTTTAGAATGTGCATATACTAACATATTCAGAGAAAAACCACAAACAATTGTCAACCATATTATTACAATAATGATATATGAAACATGTTTTAACCGTTGATCAATGAACGGTTTTTTTACGCAACATAGTAATTTTTACCACAATTTTAAAATTATTTTTGGAGAGGCTGCTCTCGTTGAGTATCTTATTGAGAGAAGAGGCGCTTATGCGCAATTATCATAGTTGGAATTTCGGCGTAGATTAACTTAAACAGGAGCCGCACTGTCGGTAAGTAAAATCATAGTATAACGCAACGTCGTAACGTTTGTGTACCAAAATAATTCTTTAAAGTGGTCG]
[+] EMBL CD075424 [AATATGTATATTTATATTATCCACTGAATAGCTGAAAGCTATTTTGTGTTTATTATACTAAAACGAATTCGACCATGAATGATACAACGTATAGCCAGTTCATTAGAAAAAACCCCATAGTATTTGAATGGATACGTGTTAATATCACCAACAATCAAGTGTTCTTATATTATATTAATCAATATTTACTCAGTCTAATAAACAATAAACTGAGGAAAATTAATATCCTGAAATATCAAAATTGACAATCAAAACTGCGAAATCATATGTATTTCCTGATGAGTGACTTCATTATTTCAGATGTATAGAAGTACCTTGAAATTATAAATACAGACGAATTAATAAGTTCTCATACAGTGATATTTAATTTCAAGTATATTGAGTACTTTACTACCTATTCAGGCTCCAAAGGATAATAAATATAATGATGAACGTGAGCGTTCTTATAATGCGTTACACACGAAAACAAGTTTTAAAAAAAGGTGGGTGATAGTCACCATTGAGAAAGAAAAAATAATGACCTACGAAGAAGAAATTATTACAATAAGAGCGATTGTTATGAATAAATAAGTAATGAAATAATCGAAACAATTATTTGATGAATCGGCCAAAAAGACTGGACATAAATGGAATGAATAGACAT ]
[+] EMBL AI882647 [ GAGCGTTCTTATAATGCGTTACACACGAAAACTAGTTTTAAAAAAAGGTGGGTGATAGTCACCATTGAGAAAGAAAAAATAATGACCTACGAAGAAGAAATTATTACAATAAGAGCGATTGTTATGAATAAATAAGTAATGAAATAATCGAAACAATTATTTGATGAATCGGCCAAAAAGACTGGACATAAATGGAATGAATAGACATTCCCTCATTCGAACGGGAATACATTAATATTGAAGTTGGGAAAAGTTTAGAATGTGCATATACTAACATATTCAGAGAAAAACCACAAACAATTGTCAACCATATTATTACAATAATGATATATGAAACATGTTTTAACCGTTGATCAATGAACGGTTTTTTTACGCAACATAGTAATTTTTACCACAATTTTAAAATTATTTTTGGAGAGGCTGCTCTCGTTGAGTATCTTATTGAGAGAAGAGGCGCTTATGCGCAATTATCATAGTTGGAATTTCGGCGTAGATTAACTTAAACAGGAGCCGCACTGTCGGTAAGTAAAATCATAGTATAACGCAACGTCGTAACGTTTGTGTACCAAAATAATTCTTTAAAGTGGTCG]
consensusID : consensus_11230#1 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 4 consensus length = 998 fasta sequence
[ATATGTATATTTATATTATCCACTGAATAGCTGAAAGCTATTTTGTGTTTATTATACTAAACGGAATTCGACCATGAATGATACAACGTATAGCCAGTTCATTAGAAAAAACCCCATAGTATTGAATGGATACGTGTTAATATCACCAACAATCAAGTGTTCNTATATATATTTAATCAATATTTACTCAGTCTAATAAACAATAAACTGAGGAAAATTAATATCCTGAAATATCAAAATTGACAATCAAAACTGCGAAATCATATGTATTTCCTGATGAGTGACTTCATTATTTCAGATGTATAGAAGTACCTTGAAATTATAAATACAGACGAATTAATAAGTTCTCATACAGTGATATTTAATTTCAAGTATATTGAGTACTTTACTACCTATTCAGGCTCCAAAGGATAATAAATATAATGATGAACGTGAGCGTTCTTATAATGCGTTACACACGAAAACAAGTTTTAAAAAAAGGTGGGTGATAGTCACCATTGAGAAAGAAAAAATAATGACCTACGAAGAAGAAATTATTACAATAAGAGCGATTGTTATGAATAAATAAGTAATGAAATAATCGAAACAATTATTTGATGAATCGGCCAAAAAGACTGGACATAAATGGAATGAATAGACATTCCCTCATTCGAACGGGAATACATTAATATTGAAGTTGGGAAAAGTTTAGAATGTGCATATACTAACATATTCAGAGAAAAAACCACAAACAAATGTCAACCATATTATTACAATAATGATATATGAAACATGTTTTAACCGTTGATCAATGAACGGTTTGTTTACGCTACATAGTAATTTTTACTACAAATTTTAAAAATTAATTATTGAAGAAGGCTGCATCTCTGTTGAGTACTCTTTAATTGTAGAGGAAGAGGCGCCTTATGCAGCCAATTATC-AATAGTTGGAAATTTCGGCAGATAGATTAAACTTTAAAACAGG-AAACCAGCACAGTCGGCCTCGGCCGAATATGGCTC]
[-] EMBL CD081601 [ATATGTATATTTATATTATCCACTGAATAGCTGAAAGCTATTTTGTGTTTATTATACTAAACGGAATTCGACCATGAATGATACAACGTATAGCCAGTTCATTAGAAAAAACCCCATAGTATTGAATGGATACGTGTTAATATCACCAACAATCAAGTGTTCNTATATATATTTAATCAATATTTACTCAGTCTAATAAACAATAAACTGAGGAAAATTAATATCCTGAAATATCAAAATTGACAATCAAAACTGCGAAATCATATGTATTTCCTGATGAGTGACTTCATTATTTCAGATGTATAGAAGTACCTTGAAATTATAAATACAGACGAATTAATAAGTTCTCATACAGTGATATTTAATTTCAAGTATATTGAGTACTTTACTACCTATTCAGGCTCCAAAGGATAATAAATATAATGATGAACGTGAGCGTTCTTATAATGCGTTACACACGAAAACAAGTTTTAAAAAAAGGTGGGTGATAGTCACCATTGAGAAAGAAAAAATAATGACCTACGAAGAAGAAATTATTACAATAAGAGCGATTGTTATGAATAAATAAGTAATGAAATAATCGAAACAATTATTTGATGAATCGGCCAAAAAGACTGGACATAAATGGAATGAATAGACATTCCCTCATTCGAACGGGAATACATTAATATTGAAGTTGGGAAAAGTTTAGAATGTGCATATACTAACATATTCAGAGAAAAAACCACAAACAAATGTCAACCATATTATTACAATAATGATATATGAAACATGTTTTAACCGTTGATCAATGAACGGTTTGTTTACGCTACATAGTAATTTTTACTACAAATTTTAAAAATTAATTATTGAAGAAGGCTGCATCTCTGTTGAGTACTCTTTAATTGTAGAGGAAGAGGCGCCTTATGCAGCCAATTATC AATAGTTGGAAATTTCGGCAGATAGATTAAACTTTAAAACAGG AAACCAGCACAGTCGGCCTCGGCCGAATATGGCTC]
[+] EMBL CD142351 [ TCCCTCATTCGAACGGGAATACATTAATATTGAAGTTGGGAAAAGTTTAGAATGTGCATATACTAACATATTCAGAGAAAAAACCACAAACAAATGTCAACCATATTATTACAATAATGATATATGAAACATGTTTTAACCGTTGATCAATGAACGGTTTGTTTACGCTACATAGTAATTTTTACTACAAATTTTAAAAATTAATTATTGAAGAAGGCTGCATCTCTGTTGAGTACTCTTTAATTGTAGAGGAAGAGGCGCCTTATGCAGCCAATTATCAAATAG TGGAAATTTCGGCAGATAGATTAAACTTTAAAACAGGAAAACCAG ]
[+] EMBL CD142338 [ TCCCTCATTCGAACGGGAATACATTAATATTGAAGTTGGGAAAAGTTTAGAATGTGCATATACTAACATATTCAGAGAAAAAACCACAAACAAATGTCAACCATATTATTACAGTAATGATATATGAAACATGTTTTAACCGTTGATCAATGAACGGTTTGTTTACGCTACATAGTAATTTTTACTACAAATTTTAAAAATTAATTATTGAAGAAGGCTGCATCTCTGTTGAGTACTCTTTAATTGTAGAGNGAGAGGCGCCTTATGCAGCCAATTATN CATAGTTGGAAATTTTCGCAGAT ]
[+] EMBL CD142415 [ TCCCTCATTCGAACGGCAATACATTAAGATTGAAATTGGGAAAAGTTTAGAATGTGCATATACTAAAATATTCAGAGAAAAAACCACAAACAAATGTCAACCATATTATTACAATAATGATATATGAAACATGTTTTAACCGTTGATCAATAAACGCTTCGTTTACGCTACATAGCAA ]
consensusID : consensus_11230#2 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 34 consensus length = 497 fasta sequence
[AAAAGACTGGACATAAATGGAATGAATAGACATTCCCTCATTCGAACGGGAATACATTAATATTGAAGTTGGGAA-AAGTTTAGAATGTGCATATACTAACATATTCAGAGAAAAAACCACAAACAAATGTCAACCATATTATTACAATAATGA-TATATGAAACATGTTTTAACCGTTGATC-AATGAACGGTTTGTTTACGCTACATAGTAATTTTTACTACAAATTTTAAAAATTAATTATTGAAGAAGGCTGCATCTCTGTTGAGTACTCTTT-AATTGTAGAGGAAGAGGCGCCTTATGCAGCCAATTATCAATAGTTGGAAATTTCGGCAGATAGATTAAACTTTAAAACAGGAAACCAGCACATGTCGG-TTAAAGTAAAAAT-CATATAAGTAATAAACAGACAACAGTCTGATAACAAGTTTAGTGTATCACAATAAA-TTAAAATCATTTTAAAAAGATGGTCCGTTTGTTTGATAATACATTTGTGGGCCAGT]
[+] EMBL CD198643 [AAAAGACTGGACATAAATGGAATGAATAGACATTCCCTCATTCGAACGGGAATACATTAATATTGAAGTTGGGAA AAGTTTAGAATGTGCATATACTAACATATTCAGAGAAAAAACCACAAACAAATGTCAACCATATTATTACAATAATGA TATATGAAACATGTTTTAACCGTTGATC AATGAACGGTTTGTTTACGCTACATAGTAATTTTTACTACAAATTTTAAAAATTAATTATTGAAGAAGGCTGCATCTCTGTTGAGTACTCTTT AATTGTAGAGGAAGAGGCGCCTTATGCAGCCAATTATCAATAGTTGGAAATTTCGGCAGATAGATTAAACTTTAAAACAGGAAACCAGCACATGTCGG TTAAAGTAAAAAT CATATAAGTAATAAACAGACAACAGTCTGATAACAAGTTTAGTGTATCACAATAAA TTAAAATCATTTTAAAA ]
[+] EMBL CD142412 [ TCCCTCATTCGAACGAAAGTACATCAATATTGAAG TGGGAAGCAGGTTAGAATGTGCCTATACTAACATATGCAGAGAAAAATCCACACACAAATGTCAACCATATGATTACTATAATGAGTATATGAAACATGTTTTAACCGGTGATC AATGAACGGTTTGTTTACGCTACATAGTAATTTTTACTACAAATTTTAGAAATTAATTATTGAAGAAGGCTGCATCTCTGTTGAGTACTCTTG TATTGTAGAGGAAGAGGCGCCTTATGCAGCCAATTATCAATAGTTGGAAATTTCGGCAGATAGATTAAACTTTAAAACAGGAAACCAGCACATGTCGGNTTAAAG ]
[+] EMBL CD142474 [ TCCCTCATTCGAACGGGAATACATTAATATTGAAATTGGGAA AAGTTTAGAATGTGCATATACTAACATATTCAGAGAAAAATCCACAAACAAATGTCAACCATATTATTACAATAATGA TATATGAAACATGTTTTAACCGTTGATC AATGAACGGTTTGTTTACGCTACATAGTAATTTTTACTACAAATTTTAAAAATTAATTATTGAAGAAGGCTGCATCTCTGTTGAGTACTCTTT AATTGTAGAGGAAGAGGCGCCTTATGCAGCCAATTATCAATAGTTGGAAATTTCGGCAGATAGATTAAACTTT AAACAGNGAA CAGCACATGTCGN GTAAAG ]
[+] EMBL CD198638 [ TCCCTCATTCGAACGGGAATACATTAATATTGAAGTTGGGAA AAGTTTAGAATGTGCATATACTAACATATTCAGAGAAAAAACCACAAACAAATGTCAACCATATTATTACAATAATGA TATATGAAACATGTTTTAACCGTTGATC AATGAACGGTTTGTTTACGCTACATAGTAATTTTTACTACAAATTTTAAAAATTAATTATTGAAGAAGGCTGCATCTCTGTTGAGTACTCTTT AATTGTAGAGGAAGAGGCGCCTTATGCAGCCAATTATCAATAGTTGGAAATTTCGGCAGATAGATTAAACTTTAAAACAGGAAACCAGCACATGTCGG TTAAAGTAAAAAT CATATAAGTAATAAACAGACAACAGTCTGATAACAAGTTTAGTGTATCACAATAAA TTAAAATCATTTTAAAAAGATGGTCCGTTTGTTTGATACTACA ]
[+] EMBL CD142372 [ TCCCTCATTCGAACGGGAATACATTAATATTGAAATTGGGAA AAGGTTAGAATGTGCATATACTAAAATATTCAGAGAAAAAACCACAAACAAATGTCAACCATATTATTACAATAATGA TATATGAAACATGTTTTAACCGTTGATC AATGAACGGCTTGTTTACGCTACATAGTAATTTTTACTACAAATTTTAAAAATTAATTATTGAAGAAGGCTGCATCTCTGTTGAGTACTCTTT AATTGTAGAGGAAGAGGCGCCTTATGCAGCCAATTATCAATAGTTGGAAATTTCGGCAGATAGATTAAACTTTAAAACAGGAAACCAGCACATGTCGG TTAA ]
[+] EMBL CD198648 [ TCCCTCATTCGAACGGGAATACATTAATATTGAAGTTGGGAA AAGTTTAGAATGTGCATATACTAACATATTCAGAGAAAAAACCACAAACAAATGTCAACCATATTATTACAATAATGA TATATGAAACATGTTTTAACCGTTGATC AATGAACGGTTTGTTTACGCTACATAGTAATTTTTACTACAAATTTTAAAAATTAATTATTGAAGAAGGCTGCATCTCTGTTGAGTACTCTTT AATTGTAGAGGAAGAGGCGCCTTATGCAGCCAATTATCAATAGTTGGAGATTTCGGCAGATAGATTAAACTTTAAAACAGGAAACCAGCACATGTCGG TTAAAGTAAAAAT CATATAAGTAATAAACAGACAACAGTCTGATAACAAGTTTAGTGTATCACAATAAA TTAAAATCATTTTAAAAAGATGGTCCGTTTGTTTG ]
[+] EMBL CD198667 [ TCCCTCATTCGAACGGGAATACATTAATATTGAAGTTGGGAA AAGTTTAGAATGTGCATATACTAACATATTCAGAGAAAAAACCACAAACAAATGTCAACCATATTATTACAATAATGA TATATGAAACATGTTTTAACCGTTGATC AATGAACGGTTTGTTTACGCTACATAGTAATTTTTACTACAAATTTTAAAAACTAATTATTGAAGAAGGCTGCATCTCTGTTGAGTACTCTTT AATTGTAGAGGAAGAGGCGCCTTATGCAGCCAATTATCAATAGTTGGAAATTTCGGCAGATAGATTAAACTTTAAAACAGGAAACCAGCACATGTCGG TTAAAGTAAAAAT CATATAAGTAATAAACAGACAACAGTCTGATAACAAGTTTAGTGTATCACAATAAA TTAAAATCATTTTAAAAAGATGGTCCGTTTGTTT ]
[+] EMBL CD198666 [ TCCCTCATTCGAACGGGAATACATTAATATTGAAGTTGGGAA AAGTTTAGAATGTGCATATACTAACATATTCAGAGAAAAAACCACAAACAAATGTCAACCATATTATTACAATAATGA TATATGAAACATGTTTTAACCGTTGATC AATGAACGGTTTGTTTACGCTACATAGTAATTTTTACTACAAATTTTAAAAATTAATTATTGAAGAAGGCTGCATCTCTGTTGAGTACTCTTT AATTGTAGAGGAAGAGGCGCCTTATGCAGCCAATTATCAATAGTTGGAAATTTCGGCAGATAGGTTAAACTTTAAAACAGGAAACCAGCACATGTCGG TTAAAGTAAAAAT CATATAAGTAATAAACAGACAACAGTCTGATAACAAGTTTAGTGTATCACAATAAA TTAAAATCATTTTAAAAAGATGGTCCGTTTGTT ]
[+] EMBL CD198633 [ TCCCTCATTCGAACGGGAATACATTAATATTGAAGTTGGGAA AAGTTTAGAATGTGCATATACTAACATATTCAGAGAAAAAACCACAAACAAATGTCAACCATATTATTACAATAATGA TATATGAAACATGTTTTAACCGTTGATC AATGAACGGTTTGTTTACGCTACATAGTAATTTTTACTACAAATTTTAAAAATTAATTATTGAAGAAGGCTGCATCTCTGTTGAGTACTCTTT AATTGTAGAGGAAGAGGCGCCTTATGCAGCCAATTATCAATAGTTGGAAATTTCGGCAGATAGATTAAACTTTAAAACAGGAAACCAGCACATGTCGG TTAAAGTAAAAAT CATATAAGTAATAAACAGACAACAGTCTGATAACAAGTTTAGTGTATCACAATAAA TTAAAATCATTTTAAAAAGATGGTCCGTT ]
[+] EMBL CD198459 [ TCCCTCATTCGAACGGGAATACATTAATATTGAAGTTGGGAA AAGTTTAGAATGTGCATATACTAACATATTCAGAGAAAAAACCACAAACAAATGTCAACCATATTATTACAATAATGA TATATGAAACATGTTTTAACCGTTGATC AATGAACGGTTTGTTTACGCTACATAGTAATTTTTACTACAAATTTTAAAAATTAATTATTGAAGAAGGCTGCATCTCTGTTGAGTACTCTTT AATTGTAGAGGAAGAGGCGCCTTATGCAGCCAATTATCAATAGTTGGAAATTTCGGCAGATAGATTAAACTTTAAAACAGGAAACCAGCACATGTCGG TTAAAGTAAAAAT CATATAAGTAATAAACAGACAACAGTCTGATAACAAGTTTAGTGTATCACAATAAA TTAAAATCATTTTAAAAAGATGGTCC ]
[+] EMBL CD142379 [ TCCCTCATTCGAACGGGAATACATTAATATTGAAATTGGGAA AAGTTTAGAATGTGCATATACTAAAATATTCAGAGAAAAAACCACAAACAAATGTCAACCATATTATTACAATAATGA TATATGAAACATGTTTTAACCGTTGATC AATGAACGGTTTGTTTACGCTACATAGTAATTTTTACTACAAATTTTAAAAATTAATTATTGAAGAAGGCTGCATCTCTGTTGAGTACTCTTT AATTGTAGAGGAAGAGGCGCCTTATGCAGCCAATTATCAATAGTTGGAAATTTCGGCAGATAGATTAAACTTTNAAACAGGAAACCAGCACATGTCGG NTAA ]
[+] EMBL CD142386 [ TCCCTCATTCGAACGGGAATACATTAATATTGAAATTGGGAA AAGTTTAGAATGTGCATATACTAACATATTCAGAGAAAAAACCACAAACAAATGTCAACCATATTATTACAATAATGA TATATGAAACATGTTTTAACCGTTGATC AATGAACGGTTTGTTTACGCTACATAGTAATTTTTACTACAAATTTTAAAAATTAATTATTGAAGAAGGCTGCATCTCTGTTGAGTACTCTTT AATTGTAGAGGAAGAGGCGCCTTATGCAGCCAATTATCAATAGTTGGAAATTTCGGCAGATAGATTANACTTTANAACAGGAAACCAGCACATGTCGG Tnn ]
[+] EMBL CD142462 [ TCCCTCATTCGAACGGGAATACATTAATATTGAAATTGGGAA AAGTTTAGAATGTGCATATACTAACATATTCAGAGAAAAAACCACAAACAAATGTCAACCATATTATTACAATAATGA TATATGAAACATGTTTTAACCGTTGATC AATGAACGGTCTGTTTACGCTACATAGTAATTTTTACTACAAATTTTAAAAATTAATTATTGAAGAAGGCTGCATCTCTGTTGAGTACTCTTT AATTGTAGAGGAAGAGGCGCCTTATGCAGCCAATTATCAATAGTTGGAAATTTCGGCAGATAGATTAAACTNTANAACAGGAAACCAGCACATGTCGGn ]
[+] EMBL CD198594 [ TCCCTCATTCGAACGGGAATACATTAATATTGAAGTTGGGAA AAGTTTAGAATGTGCATATACTAACATATTCAGAGAAAAAACCACAAACAAATGTCAACCATATTATTACAATAATGA TATATGAAACATGTTTTAACCGTTGATC AATGAACGGTTTGTTTACGCTACATAGTAATTTTTACTACAAATTTTAAAAATTAATTATTGAAGAAGGCTGCATCTCTGTTGAGTACTCTTT AATTGTAGAGGAAGAGGCGCCTTATGCAGCCAATTATCAATAGTTGGAAATTTCGGCAGATAGATTAAACTTTAAAACAGGAAACCAGCACATGTCGG TTAAAGTAAAAAT CATATAAGTAATAAACAGACAACAGTCTGATAACAAGTTTAGTGTATCACAATAAA TTAAAATCATTTTAA ]
[+] EMBL CD198661 [ TCCCTCATTCGAACGGGAATACATTAATATTGAAGTTGGGAA AAGTTTAGAATGTGCATATACTAACATATTCAGAGAAAAAACCACAAACAAATGTCAACCATATTATTACAATAATGA TATATGAAACATGTTTTAACCGTTGATC AATGAACGGTTTGTTTACGCTACATAGTAATTTTTACTACAAATTTTAAAAATTAATTATTGAAGAAGGCTGCATCTCTGTTGAGTACTCTTT AATTGTAGAGGAAGAGGCGCCTTATGCAGCCAATTATCAATAGTTGGAAATTTCGGCAGATAGATTAAACTTTAAAACAGGAAACCAGCACATGTCGG TTAAAGTAAAAAT CATATAAGTAATAAACAGACAACAGTCTGATAACAAGTTTAGTGTATCACAATAAA TTAAAATCATTT ]
[+] EMBL CD198485 [ TCCCTCATTCGAACGGGAATACATTAATATTGAAGTTGGGAA AAGTTTAGAATGTGCATATACTAACATATTCAGAGAAAAAACCACAAACAAATGTCAACCATATTATTACAATAATGA TATATGAAACATGTTTTAACCGTTGATC AATGAACGGTTTGTTTACGCTACATAGTAATTTTTACTACAAATTTTAAAAATTAATTATTGAAGAAGGCTGCATCTCTGTTGAGTACTCTTT AATTGTAGAGGAAGAGGCGCCTTATGCAGCCAATTATCAATAGTTGGAAATTTCGGCAGATAGATTAAACTTTAAAACAGGAAACCAGCACATGTCGG TTAAAGTAAAAAT CATATAAGTAATAAACAGACAACAGTCTGATAACAAGTTTAGTGTATCACAATAAACTTAAA ]
[+] EMBL CD198631 [ TCCCTCATTCGAACGGGAATACATTAATATTGAAGTTGGGAA AAGTTTAGAATGTGCATATACTAACATATTCAGAGAAAAAACCACAAACAAATGTCAACCATATTATTACAATAATGA TATATGAAACATGTTTTAACCGTTGATC AATGAACGGTTTGTTTACGCTACATAGTAATTTTTACTACAAATTTTAAAAATTAATTATTGAAGAAGGCTGCATCTCTGTTGAGTACTCTTT AATTGTAGAGGAAGAGGCGCCTTATGCAGCCAATTATCAATAGTTGGAAATTTCGGCAGATAGATTAAACTTTAAAACAGGAAACCAGCACATGTCGG TTAAAGTAAAAAT CATATAAGTAATAAACAGACAACAGTCTGATAACAAGTTTAGTGTATCACAATAAA TTAAAAT ]
[+] EMBL CD198664 [ TCCCTCATTCGAACGGGAGTACATTAATATTGAAGTTGGGAA AAGTTTAGAATGTGCATATACTAACATATTCAGAGAAAAAACCACAAACAAATGTCAACCATATTATTACAATAATGA TATATGAAACATGTTTTAACCGTTGATC AATGAACGGTTTGTTTACGCTACATAGTAATTTTTACTACAAATTTTAAAAATTAATTATTGAAGAAGGCTGCATCTCTGTTGAGTACTCTCT AATTGTAGAGGAAGAGGCGCCTTATGCAGCCAATTATCAATAGTTGGAAATTTCGGCAGATAGATTAAACTTTAAAACAGGAAACCAGCACATGTCGG TTAAAGTAAAAAT CATATAAGTAATAAACAGACAACAGTCTGATAACAAGTTTAGTGTATCACAATAAA T ]
[+] EMBL CD198622 [ TCCCTCATTCGAACGGGAATACATTAATATTGAAGTTGGGAA AAGTTTAGAATGTGCATATACTAACATATTCAGAGAAAAAACCACAAACAAATGTCAACCATATTATTACAATAATGA TATATGAAACATGTTTTAACCGTTGATC AATGAACGGTTTGTTTACGCTACATAGTAATTTTTACTACAAATTTTAAAAATTAATTATTGAAGAAGGCTGCATCTCTGTTGAGTACTCTTTAAATTGTAGAGGAAGAGGCGCCTTATGCAGCCAATTATCAATAGTTGGAAATTTCGGCAGATAGATTAAACTTTAAAACAGGAAACCAGCACATGTCGG TTAAAGTAAAAATCCATATAAGTAATAAACAGACAAC ]
[+] EMBL CD142356 [ TCCCTCATTCGAACGGGAATACATTAATATTGAAATTGGGAA AAGTTTAGAATGTGCATATACTAACATATTCAGAGAAAAAACCACAAACAAATGTCAGCCATATTATTACAATAATGA TATATGAAACATGTTTTAACCGTTGATC AATGAACGGTTTGTTTACGCTACATAGTAATTTTTACTACAAATTTTAAAAATTAATTATTGAAGAAGGCTGCATCTCTGTTGAGTACTCTTT AATTGTAGAGGAAGAGGCGCCTTATGCAGCCAATTATCAATAGTTGGAAATTTCGGCAGATAGATTANACTTTAAAACAGGAAACCAGCACATGTCGG TTAAAGTAAAA ]
[-] EMBL CD198644 [ CGAACGGGAATACATTAATATTGAAGTTGGGAA AAGTTTAGGATGTGCATATACTAACATATTCAGAGAAAAAACCACAAACAAATGTCAACCATATTATTACAATAATGA TATATGAAACATGTTTTAACCGTTGATC AATGAACGGTTTGTTTACGCTACATAGTAATTTCTACTACAAATTTTAAAAATTAATTATTGAAGAAGGCTGCATCTCTGTTGAGTACTCTTT AATTGTAGAGGAAGAGGCGCCTTATGCAGCCAATTATCAATAGTTGGAAATTTCGGCAGATAGATTAAACTTTAAAACAGGAAACCAGCACGTGTCGG TTAAAGTAAAAAT CATATAAGTAATAAACAGACAACAGTCTGATAACAAGTTTAGTGTATCACAATAAA TTAAAATCATTTTAAAAAGATGGTCCGTTTGTTTGATAATACATTTGTGGGCCAGT]
[-] EMBL CD198672 [ GAACGGGAATACATGAATATTGAAGTTGGGAA AAGTTTAGAATGTGCATATACTAACATATTCAGAGAAAAAACCACAAACAAATGTCAACCAAATTATTACAATAATGA TATATGAAACATGTTTTAACCGTTGATC AGTGAACGGTTTGTTTACGCTACATAGTAATTTTTACTACAAATTTTAAAAATTAATTATTGAAGAAGGCTGCATCTCTGTTGAGTACTCTTT AATTGTAGAGGAAGAGGCGCCTTATGCAGCCAATTATCAATAGTTGGAAATTTCGGCAGATAGATTAAACTTTAAAACAGGAAACCAGCACATGTCGG TTAAAGTAAAAAT CATATAAGTAATAAACAGACAACAGTCTGATAACAAGTTTAGTGTATCACAATAAA TTAATATCATTTTAAAAAGATGGTCCGTTTGTTTGATAATACATTTGTGGGCCAGT]
[-] EMBL CD198625 [ ATACATTAATATTGAAGTTGGGAA AAGTTTGGAATGTGCATATACTAACATATTCAGAGAAAAAACCACAAACAAATGTCAACCATATTATTACAATAATGA TATATGAAACATGTTTTAACCGTTGATC AATGAACGGTTTGTTTACGCTACATAGTAATTTTTACTACAAATTTTAAAAATTAATTATTGAAGAAGGCTGCATCTCTGTTGAGTACTCTTT AATTGTAGAGGAAGAGGCGCCTTATGCAGCCAATTATCAATAGTTGGAAATTTCGGCAGATAGATTAAACTTTAAAACAGGAAACCAGCACATGTCGG TTAAAGTAAAAAT CATATAAGTAATAAACAGACAACAGTCTGATAACAAGTTTAGTGTATCACAATAAA TTAAAATCATTTTAAAAAGATGGTCCGTTTGTTTGATAATACATTTGTGGGCCAGT]
[-] EMBL CD198616 [ GAAGTTGGGAA AAGTTTAGAATGTGCATATACTAACATATTCAGAGAAAAAACCACAAACAAATGTCAACCATATTATTACAATAATGA TATATGAAACATGTTTTAACCGTTGATC AATGAACGGTTTGTTTACGCTACATAGTAATTTTTACTACAAATTTTAAAAATTAATTATTGAAGAAGGCTGCATCTCTGTTGAGTACTCTTT AATTGTAGAGGAAGAGGCGCCTTATGCAGCCAATTATCAATAGTTGGAAATTTCGGCAGATAGATTAAACTTTAAAACAGGAAACCAGCACATGTCGG TTAAAGTAAAAAT CATATAAGTAATAAACAGACAACAGTCTGATAACAAGTCTAGTGTATCACAATAAA TTAAAATCATTTTAAAAAGATGGTCCGTTTGTTTGATAATACATTTGTGGGCCAGT]
[-] EMBL CD198601 [ TTGGGAA AAGTTTAGAATGTGCATATACTAACATATTCAGAGAAAAAACCACAAACAAATGTCAACCATATTATTACAATAATGA TATATGAAACATGTTTTAACCGTTGATC AATGAACGGTTTGTTTACGCTACATAGTAATTTGTACTACAAATTTTAAAAATTAATTATTGAAGAAGGCTGCATCTCTGTTGAGTACTCTTT AATTGTAGAGGAAGAGGCGCCTTATGCAGCCAATTATCAATAGTTGGAAATTTCGGCAGATAGATTAAACTTTAAAACAGGAAACCAGCACATGTCGG TTAAAGTAAAAAT CATATAAGTAATAAACAGACAACAGTCTGATAACAAGTTTAGTGTATCACAATAAA TTAAAATCATTTTAAAAAGATGGTCCGTTTGTTTGATAATACATTTGTGGGCCAGT]
[-] EMBL CD198608 [ GGAA AAGTTTAGAATGTGCATATACTAACATATTCAGAGAAAAAACCACAAACAAATGTCAACCATATTATTACAATAATGA TATATGAAACATGTTTTAACCGTTGATC AATGAACGGTTTGTTTACGCTACATAGTAATTTTTACTACAAATTTTAAAAATTAATTATTGAAGAAGGCTGCATCTCTGTTGAGTACTCTTT AATTGTAGAGGAAGAGGCGCCTTATGCAGCCAATTATCAATAGTTGGAAATTTCGGCAGATAGATTAAACTTTAAAACAGGAAACCAGCACATGTCGG TTAAAGTAAAAAT CATATAAGTAATAAACAGACAACAGTCTGATAACAAGTTTAGTGTATCACAATAAA TTAAAATCATTTTAAAAAGATGGTCCGTTTGTTTGATAATACATTTGTGGGCCAGT]
[-] EMBL CD198655 [ TTAGAATGTGCATATACTAACATATTCAGAGAAAAAACCACAAACAAATGTCAACCATATTATTACAATAATGA TATATGAAACATGTTTTAACCGTTGATC AATGAACGGTTTGTTTACGCTACATAGTAATTTGTACTACAAATTTTAAAAATAAATTATTGAAGAAGGCTGCATCTCTGTTGAGTACTCTTT AATTGTAGAGGAAGAGGCGCCTTATGCAGCCAATTATCAATAGTTGGAAATTTCGGCAGATAGATTAAACTTTAAAACAGGAAACCGGCACATGTCGG TTAAAGTAAAAAT CATATAAGTAATAAACAGACAACAGTCTGATAACAAGTTTAGTGTATCACAATAAA TTAAAATCATTTTAAAAAGATGGTCCGTTTGTTTGATAATACATTTGTGGGCCAGT]
[-] EMBL CD198443 [ TGCATATACTAACATATTCAGAGAAAAAGCCACAAACAAATGACAACAATATTATTACAATAATGA TATGTGAAACATGTTTTAACCGTTGATC AATGAACGGTTTGTTTACGCTACATAGTAATTTTTACTACAAATTTTAAAAATTAATTATTGAAGAAGGCTGCATCTCTGTTGAGTACTCTTT AATTGTAGAGGAAGAGGCGCCTTATGCAGCCAATTATCAATAGTTGGAAATTTCGGCAGATAGATTAAACTTTAAAACAGGAAACCAGCACATGTCGG TTAAAGTAAAAAT CATATAAGTAATAAACAGACAACAGTCTGATAACAAGTTTAGTGTATCACAATAAA TTAAAATCATTTTAAAAAGATGGTCCGTTTGTTTGATAATACATTTGTGGGCCAGT]
[-] EMBL CD198598 [ AACATATTCAGAGAAAAAACCACAAACAAATTTCAACCATATTATTACAATAATGA TATATGAAACATGTTTTAACCGTTGATC AATGAACGGTTTGTTTACGCTACATAGTAATTTTTACTACAAATTTTAAAAATTAATTATTGAAGAAGGCTGCATCTCTGTTGAGTACTCTTT AATTGTAGAGGAAGAGGCGCCTTATGCAGCCAATTATCAATAGTTGGAAATTTCGGCAGATAGATAAAACTTTAAAACAGGAAACCAGCACATGTCGG TTAAAGTAAAAAT CATATAAGTAATAAACAGACAACAGTCTGATAACAAGTTTAGTGTATCACAATAAA TTAAAATCATTTTAAAAAGATGGTCCGTTTGTTTGATAATACATTTGTGGGCCAGT]
[-] EMBL CD142364 [ TGA TATATGAAACATGTTTTAACCG TGATCAAATGAACGGTTTGTTTACGCTACATAGTAATTTTTACTACAAATTTTAAAAATTAATTATTGAAGAAGGCTGCATCTCTGTTGAGTACTCTTT AATTGTAGAGGAAGAGGCGCCTTATGCAGCCAATTATCAATAGTTGGAAATTTCGGCAGATAGATTAAACTTTAAAACAGGAAACCAGCACATGTCGG TTAAAGTAAAAAT CATATAAGTAATAAACAGACAACAGTCTGATAACAAGTTTAGTGTATCACAATAAA TTAAAATCATTTTAAAAAGATGGTCCGTTTGTTTGATAATACATTTGTGGGCCAGT]
[-] EMBL CD142327 [ TGTTANCGCTACATAGTAATTTTTACTACAAATTTTAAAAATTAATTATTGAAGAAGGCTGCATNCCTGTTGGGTACTCTTT AATTGTAGAGGAAGAGGCGCCTTATGCAGCCAATTATCAATAGTTGGAAATTTCGGCAGATAGATTAAACTTTAAAACAGGAATCCAGCACATGCCGG TTAAAGTAAAAAT CATATAAGTAATAAACAGACAACAGTCCGATA ]
[-] EMBL CD142466 [ TACGCTACATAGT ATTTNTACTACAAATTNTAAAAATTAA TATGNAAGAAGGCTGCATCTCTGTTGAGTACTCTTT AATTGTAGAGGAAGAGGCGCCTTATGCAGCCAATTATCAATAGTTGGAAATTTCGGCAGATAGATTAAACTTTAAAACAGGAAACCAGCACATGTCGG TTAAAGTAAAAAT CATATAAGTAATAAACAGACAACAGTCTGATAACAAGTTTAGTGTATCACAATAAA TTAAAATCATTTTAAAAAGATGGTCCGTTTGTTTGATAATACATTTGTGGGCCAGT]
[-] EMBL CD198634 [ AAATTTAAAAAATTAATTATTGAAGAAGGCTGCATCTCTGTTGAGTACTCTTT AATTGTAGAGGAAGAGGCGCCTTATGCAGCCAATTATCAATAGTTGGAAATTTCGGCAGATAGATTAAACTTTAAAACAGGAAACCAGCACATGTCGG TTAAAGTAAAAAT CATATAAGTAATAAACAGACAACAGTCTGATAACAAGTTTAGTGTATCACAATAAA TTAAAATCATTTTAAAAAGATGGTCCGTTTGTTTGATAATACATTTGTGGGCCAGT]
[-] EMBL CD142331 [ TTAAAAAATTAATTATGNAAGAAGGCTGCATCTCTGTTGAGTACTCTTT AATTGTAGTGCGAGAGGCGCCTTATGCAGCCAATTATCAATAGTTGGAAATTTCGGCAGATAGATTAAACTTTAAAACAGGAAACCAGCACATGTCGG TTAAAGTAAAAAT CATATAAGTAATAAACAGACAACAGTCTGATAACAAGTTTAGTGTATCACAATAAA TTAAAATCATTTTAAAAAGATGGTCCGTTTGTTTGATAATACATTTGTGGGCCAGT]
consensus multiple alignement with clustalw CLUSTAL W (1.82) multiple sequence alignment
consensus_11230#0 AATATGTATATTTATATTATCCACTGAATAGCTGAAAGCTATTTTGTGTTTATTATACTA 60
consensus_11230#1 -ATATGTATATTTATATTATCCACTGAATAGCTGAAAGCTATTTTGTGTTTATTATACTA 59
consensus_11230#2 ------------------------------------------------------------
consensus_11230#0 AAACGAATTCGACCATGAATGATACAACGTATAGCCAGTTCATTAGAAAAAACCCCATAG 120
consensus_11230#1 AACGGAATTCGACCATGAATGATACAACGTATAGCCAGTTCATTAGAAAAAACCCCATAG 119
consensus_11230#2 ------------------------------------------------------------
consensus_11230#0 TATTTGAATGGATACGTGTTAATATCACCAACAATCAAGTGTTCTTATATTATATTAATC 180
consensus_11230#1 TATT-GAATGGATACGTGTTAATATCACCAACAATCAAGTGTTCNTATATATATTTAATC 178
consensus_11230#2 ------------------------------------------------------------
consensus_11230#0 AATATTTACTCAGTCTAATAAACAATAAACTGAGGAAAATTAATATCCTGAAATATCAAA 240
consensus_11230#1 AATATTTACTCAGTCTAATAAACAATAAACTGAGGAAAATTAATATCCTGAAATATCAAA 238
consensus_11230#2 ------------------------------------------------------------
consensus_11230#0 ATTGACAATCAAAACTGCGAAATCATATGTATTTCCTGATGAGTGACTTCATTATTTCAG 300
consensus_11230#1 ATTGACAATCAAAACTGCGAAATCATATGTATTTCCTGATGAGTGACTTCATTATTTCAG 298
consensus_11230#2 ------------------------------------------------------------
consensus_11230#0 ATGTATAGAAGTACCTTGAAATTATAAATACAGACGAATTAATAAGTTCTCATACAGTGA 360
consensus_11230#1 ATGTATAGAAGTACCTTGAAATTATAAATACAGACGAATTAATAAGTTCTCATACAGTGA 358
consensus_11230#2 ------------------------------------------------------------
consensus_11230#0 TATTTAATTTCAAGTATATTGAGTACTTTACTACCTATTCAGGCTCCAAAGGATAATAAA 420
consensus_11230#1 TATTTAATTTCAAGTATATTGAGTACTTTACTACCTATTCAGGCTCCAAAGGATAATAAA 418
consensus_11230#2 ------------------------------------------------------------
consensus_11230#0 TATAATGATGAACGTGAGCGTTCTTATAATGCGTTACACACGAAAACAAGTTTTAAAAAA 480
consensus_11230#1 TATAATGATGAACGTGAGCGTTCTTATAATGCGTTACACACGAAAACAAGTTTTAAAAAA 478
consensus_11230#2 ------------------------------------------------------------
consensus_11230#0 AGGTGGGTGATAGTCACCATTGAGAAAGAAAAAATAATGACCTACGAAGAAGAAATTATT 540
consensus_11230#1 AGGTGGGTGATAGTCACCATTGAGAAAGAAAAAATAATGACCTACGAAGAAGAAATTATT 538
consensus_11230#2 ------------------------------------------------------------
consensus_11230#0 ACAATAAGAGCGATTGTTATGAATAAATAAGTAATGAAATAATCGAAACAATTATTTGAT 600
consensus_11230#1 ACAATAAGAGCGATTGTTATGAATAAATAAGTAATGAAATAATCGAAACAATTATTTGAT 598
consensus_11230#2 ------------------------------------------------------------
consensus_11230#0 GAATCGGCCAAAAAGACTGGACATAAATGGAATGAATAGACATTCCCTCATTCGAACGGG 660
consensus_11230#1 GAATCGGCCAAAAAGACTGGACATAAATGGAATGAATAGACATTCCCTCATTCGAACGGG 658
consensus_11230#2 ----------AAAAGACTGGACATAAATGGAATGAATAGACATTCCCTCATTCGAACGGG 50
**************************************************
consensus_11230#0 AATACATTAATATTGAAGTTGGGAAAAGTTTAGAATGTGCATATACTAACATATTCAGAG 720
consensus_11230#1 AATACATTAATATTGAAGTTGGGAAAAGTTTAGAATGTGCATATACTAACATATTCAGAG 718
consensus_11230#2 AATACATTAATATTGAAGTTGGGAAAAGTTTAGAATGTGCATATACTAACATATTCAGAG 110
************************************************************
consensus_11230#0 AAAAA-CCACAAACAATTGTCAACCATATTATTACAATAATGATATATGAAACATGTTTT 779
consensus_11230#1 AAAAAACCACAAACAAATGTCAACCATATTATTACAATAATGATATATGAAACATGTTTT 778
consensus_11230#2 AAAAAACCACAAACAAATGTCAACCATATTATTACAATAATGATATATGAAACATGTTTT 170
***** ********** *******************************************
consensus_11230#0 AACCGTTGATCAATGAACGGTTTTTTTACGCAACATAGTAATTTTTACCACAA-TTTTAA 838
consensus_11230#1 AACCGTTGATCAATGAACGGTTTGTTTACGCTACATAGTAATTTTTACTACAAATTTTAA 838
consensus_11230#2 AACCGTTGATCAATGAACGGTTTGTTTACGCTACATAGTAATTTTTACTACAAATTTTAA 230
*********************** ******* **************** **** ******
consensus_11230#0 AATT--ATTTTTGGAGA-GGCTGC-TCTC-GTTGAGTATCTTAT-----TGAGAGAAGAG 888
consensus_11230#1 AAATTAATTATTGAAGAAGGCTGCATCTCTGTTGAGTACTCTTTAATTGTAGAGGAAGAG 898
consensus_11230#2 AAATTAATTATTGAAGAAGGCTGCATCTCTGTTGAGTACTCTTTAATTGTAGAGGAAGAG 290
** * *** *** *** ****** **** ******** * * * ******
consensus_11230#0 GCGC-TTATGCG--CAATTATCA-TAGTTGGAA-TTTCGGCG--TAGATTAACTT---AA 938
consensus_11230#1 GCGCCTTATGCAGCCAATTATCAATAGTTGGAAATTTCGGCAGATAGATTAAACTTTAAA 958
consensus_11230#2 GCGCCTTATGCAGCCAATTATCAATAGTTGGAAATTTCGGCAGATAGATTAAACTTTAAA 350
**** ****** ********* ********* ******* ******** * **
consensus_11230#0 ACAGGAGCCGCAC---TGTCGGTAAGTAAAATCATAGTATAACGCA---ACGTCGTAACG 992
consensus_11230#1 ACAGGAAACCAGC---A--CAGTCGGCCTCGGCCGAATATGGCTC--------------- 998
consensus_11230#2 ACAGGAAACCAGCACATGTCGGTTAAAGTAAAAATCATATAAGTAATAAACAGACAACAG 410
****** * * * ** ***
consensus_11230#0 TTTGTGTACCAAAATAATTCTTTAAAGTGGTCG--------------------------- 1025
consensus_11230#1 ------------------------------------------------------------
consensus_11230#2 TCTGATAACAAGTTTAGTGTATCACAATAAATTAAAATCATTTTAAAAAGATGGTCCGTT 470
consensus_11230#0 ---------------------------
consensus_11230#1 ---------------------------
consensus_11230#2 TGTTTGATAATACATTTGTGGGCCAGT 497
|
| Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) | ||||