These datas are free for academic use only, please contact me for any other use. Schistosoma mansoni see consensus multiple alignment with clustalw Direct access to contigs :
consensusID : consensus_11270#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 4 consensus length = 672 fasta sequence [ACTCAAGGTCGTTGTGCCTGTAGGATGGCAACTTCTATAATCAAGTTGCACACGCTTTCGGGGGCTGGTGATAATGGTTCACCTTGTTACTTACTTCAGGTAGATGAGTTTCACTGTCTTCTTGACTGTGGTTGGTGTGAGAAACTGGATAGTGACTATGTGAAAGAGGTGTCAAAGTGGGCTAAGCATGTTGATGCCGTGCTTCTTAGTCATCAAAGTCTAAGACACCTCGGGTTGCTTCCATATCTTGTTGGGACGTGTGGACTTAACTGTCCGGTGTATGCCACGACTCCTGTTTACAAAATGGGACAAATGTTTATGTATGATTTTTTCCAGTCAAGACATGCTTCTGAGGACTTTAGCCACTACACGTTACATGATGTTGATCTAGCCTTCGATCATGTGCATCAAGTTAAGTATCAGCAAACAATCAGTCTTCATGGTCGTGGCCATGGTTTATGTATAACCCCACTTCCTTCTGGTATGTAACTTGGACAGATAATATTTTCTAACAGGTCACACACTTGGAGGAACAATTTGGAAACTAGTTAAAGAAGACACAAGTATCGTTTACGCTTTGGATTTCAACCATAAAAAGGAGAGACACTTAAATGGAGCTACCTTTGATGCTTGCATACGACCACACTTACTAATTATGGATGGTTCGAACAC] [+] EMBL CD179776 [ACTCAAGGTCGTTGTGCCTGTANGATGGCAACTTCTATAATCAAGTTGCACACGCTTTCGGGGGCTGGTGATAATGGTTCACCTTGTTACTTACTTCAGGTAGATGAGTTTCACTGTCTTCTTGACTGTGGTTGGTGTGAGAAACTGGATAGTGACTATGTGAAAGAGGTGTCAAAGTGGGCTAAGCATGTTGATGCCGTGCTTCTTAGTCATCAAAGTCTAAGACACCTCGGGTTGCTTC ] [+] EMBL CD122654 [ GGTCGTTGTGCCTGTAGGATGGCAACTTCTATAATCAAGTTGCACACGCTTTCGGGGGCTGGTGATAATGGTTCACCTTGTTACTTACTTCAGGTAGATGAGTTTCACTGTCTTCTTGACTGTGGTTGGTGTGAGAAACTGGATAGTGACTATGTGAAAGAGGTGTCAAAGTGGGCTAAGCATGTTGATGCCGTGCTTCTTAGTCATCAAAGTCTAAGACACCTCGGGTTGCTTCCATATCTTGTTGGGACGTGTGGACTTAACTGTCCGGTGTATGCCACGACTCCTGTTTACAAAATGGGACAAATGTTTATGTATGATTTTTTCCAGTCA ] [+] EMBL CD122607 [ GGTCGTTGTGCCTGTAGGATGGCAACTTCTATAATCAAGTTGCACACGCTTTCGGGGGCTGGTGATAATGGTTCACCTTGTTACTTACTTCAGGTAGATGAGTTTCACTGTCTTCTTGACTGTGGTTGGTGTGAGAAACTGGATAGTGACTATGTGAAAGAGGTGTCAAAGTGGGCTAAGCATGTTGATGCCGTGCTTCTTAGTCATCAAAGTCTAAGACACCTCGGGTTGCTTCCATATCTTGTTGGGACGTGTGGACTTAACTGTCCGGTGTATGCCACGACTCCTGTTTACAAAATGGGACAAATGTTTATGTATGATTTTTTCCAGTCA ] [+] EMBL CD179410 [ CTTGTTGGGACGTGTGGACTTAACTGTCCGGTGTATGCCACGACTCCTGTTTACAAAATGGGACAAATGTTTATGTATGATTTTTTCCAGTCAAGACATGCTTCTGAGGACTTTAGCCACTACACGTTACATGATGTTGATCTAGCCTTCGATCATGTGCATCAAGTTAAGTATCAGCAAACAATCAGTCTTCATGGTCGTGGCCATGGTTTATGTATAACCCCACTTCCTTCTGGTATGTAACTTGGACAGATAATATTTTCTAACAGGTCACACACTTGGAGGAACAATTTGGAAACTAGTTAAAGAAGACACAAGTATCGTTTACGCTTTGGATTTCAACCATAAAAAGGAGAGACACTTAAATGGAGCTACCTTTGATGCTTGCATACGACCACACTTACTAATTATGGATGGTTCGAACAC] consensusID : consensus_11270#1 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 40 consensus length = 495 fasta sequence [CTGGATAGTGACTATGTGAAAGAGGTGTCAAAGTGGGCTAAGCATGTTGATGCCGTGCTTCTTAGTCATCAAAGTCTAAGACACCTCGGGTTGCTTCCATATCTTGTTGGGACGTGTGGACTTAACTGTCCGGTGTATGCCACGACTCCTGTTTACAAAATGGGACAAATGTTTATGTATGATTTTTTCCAGTCAAGACATGCTTCTGAGGACTTTAGCCACTACACGTTAGATGATGTTGATCTAGCCTTCGATCATGTGCATCAAGTT-AAGTATCAGCAAACAATCAGTCTTCATGGTCGTGGCCATGGTTTATGTATAACCCCACTTCCTTCTGGTCACACACTTGGAGGAACAATTTGGAAACTAGTTAAAGAAGACACAAGTATCGTTTACGCTTTGGATTTCAACC---------ATAAAAAGGAGAGACACTTAAATGGAGCTACCTTTGATGCTTGCATACGA-CCACACTTACTAATTATGGATGGTTCGAACACC] [-] EMBL CD122762 [CTGGATAGTGACTATGTGAAAGAGGTGTCAAAGTGGGCTAAGCATGTTGATGCCGTGCTTCTTAGTCATCAAAGTCTAAGACACCTCGGGTTGCTTCCATATCTTGTTGGGACGTGTGGACTTAACTGTCCGGTGTATGCCACGACTCCTGTTTACAAAATGGGACAAATGTTTATGTATGATTTTTTCCAGTCAAGACATGCTTCTGAGGACTTTAGCCACTACACGTTAGATGATGTTGATCTAGCCTTCGATCATGTGCATCAAGTT AAGTATCAGCAAACAATCAGTCTTCATGGTCGTGGCCATGGTTTATGTATAACCCCACTTCCTTCTGGTCACACACTTGGAGGAACAA TTGGAAACTAGTTAAAGAAGACACAAGTATCGTTTACGCTTTGGATTTCAACCCGAGGGCGAATTAAAAGGAGAG ] [-] EMBL CD123107 [CTGGATAGTGACTATGTGAAAGAGGTGTCAAAGTGGGCTAAGCATGTTGATGCCGTGCTTCTTAGTCATCAAAGTCTAAGACACCTCGGGTTGCTTCCATATCTTGTTGGGACGTGTGGACTTAACTGTCCGGTGTATGCCACGACTCCTGTTTACAAAATGGGACAAATGTTTATGTATGATTTTTTCCAGTCAAGACATGCTTCTGAGGACTTTAGCCACTACACGTTAGATGATGTTGATCTAGCCTTCGATCATGTGCATCAAGTT AAGTATCAGCAAACAATCAGTCTTCATGGTCGTGGCCATGGTTTATGTATAACCCCACTTCCTTCTGGTCACACACTTGGAGGAACAATTTGGAAACTAGTTAAAGAAGACACAAGTATCGTTTACGC ] [-] EMBL CD160990 [ ATCTTGTTGGGACGTGTGGACTTAACTGTCCGGTGTATGCCACGACTCCTGTTTACAAAATGGGACAAATGTTTATGTATGATTTTTTCCAGTCAAGACATGCTTATGAGGACTTTAGCCACTACACGTTAGATGATGTTGATCTAGCCTTCGATCATGTGCATCAAGTT AAGTATCAGCAAACAATCAGTCTTCATGGTCGTGGCCATGGTTTATGTATAACCCCACTTCATTCTGGTCACACACTTGGAGGAACAATTTGGGAACTAGTTAAAGAAGACACAAGCATCGTTTACGCTTTGGATTTCAACC ATAAAAAGGAGAGACACTTAAATGGAGCTACCTTTGATGCTTGCATACGAGCCACACTTAATAATTATGGATGGTTCGAACACC] [+] EMBL CD160928 [ CTTGTTGGGATGTGTGGACTTAACTGTCCGGTGTATGCCACGACTCCTGTTTACAAAATGGGACAAATGTTTATGTATGATTTTTTCCAGTCGAGACATGCTTCTGAGGACTTTAGCCACTACACGTTAGATGATGTTGATCTAGCCTTCGATCATGTGCATCAAGTT AAGTATCAGCAAACAATCAGTCTTCATGGTCGTGGCCATGGTTTATGTATAACCCCACTTCCTTCTGGTCACACACTTGGAGGAACAATTTGGAAACTAGTTAAAGAAGACACAAGTATCGTTTACGCTTTGGATTTCAACC ATAAAAAGGAGAGACACTTAAATGGAGCTACCTTTGATGCTTGCATACGA CCACACTTACTAATTATGGATGGTTCGAACAC ] [+] EMBL CD160997 [ CTTGTTGGGACGTGTGGACTTAACTGTCCGATGTATGCCACGACTCCTGTTTACAAAATGGGACAAATGTTTATGTATGATTTTTTCCAGTCAAGACATGCTTCTGAGGACTTTAGCCACTACACGTTAGATGATGTTGATCTAGCCTTCGATCATGTGCATCAAGTT AAGTATCAGCAAACAATCAGTCTTCATGGCCGTGGCCATGGTTTATGTATAACCCCACTTCCTTCTGGTCACACACTTGGAGGAACAATTTGGAAACTAGTTAAAGAGGACACAAGTATCGTTTACG ] [+] EMBL CD179399 [ CTTGTTGGGACGTGTGGACTTAACTGTCCGGTGTATGCCACGACTCCTGTTTACAAAATGGGACAAATGTTTATGTATGATTTTTTCCAGTCAAGACATGCTTCTGAGGACTNTAGCCACTACACGTTAGATGATGTTGATCTAGCCTTCGATCATGTGCATCAAGTTAAAGTATCAGCAAc ] [+] EMBL CD160932 [ CTTGTTGGGACGTGTGGACTTAACTGTCCGGTGTATGCCACGACTCCTGTTTACAAAATGGGACAAATGTTTATGTATGATTTTTTCCAGTCAAGACATGCTTCTGAGGACTTTAGCCACTTCACGTTAGATGATGTTGATCTAGCCTTCGATCATGTGCATCAAGTT AAGTATCAGCAAACAATCAGTCTTCATGGTCGTGGCCATGGTTTATGTATAACCCCACTTCCTTCTGGTCACACACTTGGAGGAACAATTTGGAAACTAGTTAAAGAAGACACAAGTATCGTTTACGCTTTGGATTTCAACC ATAAAAAGGAGAGACACTTAAATGGAGCTACCTTTGATGCTTGCATACGA CCACACTTACTAATTATGGATGGTTCGAACAC ] [+] EMBL CD179354 [ CTTGTTGGGACGTGTGGACTTAACTGTCCGGTGTATGCCACGACTCCTGTTTACAAAATGGGACAAATGTTTATGTATGATTTTTTCTAGTCAAGACATGCTTCTGAGGACTTTAGCCACTACACGTTAGATGATGTTGATCTAGCCTTCGATCATGTGCATCAAGTT AAGTATCAGCAAACAATCAGTCTTCATGGTCGTGGCCATGGTTTATGTATAACCCCACTTCCTTCTGGTCACACACTTGGAGGAACAATTTGGAAACTAGTTAAAGAAGACACAAGTATCGTTTACGCTTTGGATTTCAACC ATAAAAAGGAGAGACACTTAAATGGAGCTACCTTTGATGCTTGCATACGA CCACACTTACTAATTATGGATGGTTCGAACAC ] [+] EMBL CD161172 [ CTTGTTGGGACGTGTGGACTTAACTGTCCGGTGTATGCCACGACTCCTGTTTACAAAATGGGACAAATGTTTATGTATGATTTTTTCCAGTCAAGACATGCTTCTGAGGACTTTAGCCACTACACGTTAGATGATGTTGATCTAGCCTTCGATCATGTGCATCAAGTT AAGTATCAGCAAACAATCAGTCTTCATGGTCGTGGCCATGGTTTATGTGTAACCCCACTTCCTTCTGGTCACACACTTGGAGGAACAATTTGGAAACTAGTTAAAGAAGACACAAGTATCGTTTACGCTTTGGATTTCAACC ATAAAAAGGAGAGACACTTAAATGGAGCTACCTTTGATGCTTGCATACGA CCACACTTACTAATTATGGATGGTTCGAACAC ] [+] EMBL CD161269 [ CTTGTTGGGACGTGTGGACTTAACTGTCCGGTGTATGCCACGACTCCTGTTTACAAAATGGGACAAATGTTTATGTATGATTTTTTCCAGTCAAGACATGCTTCTGAGGACTTTAGCCACTACACGTTAGATGATGTTGATCTAGCCTTCGATCACGTGCATCAAGTT AAGTATCAGCAAACAATCAGTCTTCATGGTCGTGGCCATGGTTTATGTATAACCCCACTTCCTTCTGGTCACACACTTGGAGGAACAATTTGGAAACTAGTTAAAGAAGACACAAGTATCGTTTACGCTTTGGATTTCAACC ATAAAAAGGAGAGACACTTAAATGGAGCTACCTTTGATGCTTGCATACGA CCACACTTACTAATTATGGATGGTTCGAACAC ] [+] EMBL CD122805 [ CTTGTTGGGACGTGTGGACTTAACTGTCCGGTGTATGCCACGACTCCTGTTTACAAAATGGGACAAATGTTTATGTATGATTTTTTCCAGTCAAGACATGCATCTGAGGACTTTAGCCACTACACGTTAGATGACGTTGATCTAGCCTTCGATCATGTGCATCAAGTT AAGTATCAGCAAACAATCAGTCTTCATGGTCGTGGCCATGGTTTATGTATAACCCCACTTCCTTCTGGTCACACACTTGGAGGAACAATTTGGAAACTAGTTAAAGAAGACACAAGTATCGTTTACGCTTTGGATTTCAACC ATAAAAAGGAGAGACACTTAAATGGAGCTACCTTTGATGCTTGCATACGA CCACACTTACTAATTATGGATGGTTCGAACAC ] [+] EMBL CD161424 [ CTTGTTGGGACGTGTGGACTTAACTGTCCGGTGTATGCCACGACTCCTGTTTACAAAATGGGACAAATGTTTATGTATGATTTTTTCCAGTCAAGACATGCTTCTGAGGACTTTAGCCACTACACGTTAGATGATGTTGATCTAGCCTTCGATCATGTGCATCAAGTT AAGTATCAGCAAACAATCAGTCTTCATGGTCGTGGCCATGGTTTATGTATGACCCCACTTCCTTCTGGTCACACACTTGGAGGAACAATTTGGAAACTAGTTAAAGAAGACACAAGTATCGTTTACGCTTTGGATTTCAACC ATAAAAAGGAGAGACACTTAAATGGAGCTACCTTTGATGCTTGCATACGA CCACACTTACTAATTATGGATGGTTCGAACAC ] [+] EMBL CD122812 [ CTTGTTGGGACGTGTGGACTTAACTGTCCGGTGTATGCCACGACTCCTGTTTACAAAATGGGACAAATGTTTATGTATGATTTTTTCCAGTCAAGACATGCTTCTGAGGACTTTAGCCACTACACGTTAGATGATGTTGATCTAGCCTTCGATCATGTGCATCAAGTT AAGTATCAGCAAACAATCAGTCTTCATGGTCGTGGCCATGGTTTATGTATAACCCCACTTCCTTCTGGTCACACACTTGGAGGAACAATTTGGAAACTAGTTAAAGAAGACACAAGTATCGTTTACGCTTTGGATTTCAACC ATAAAAAGGAGAGACACTTAAATGGAGCTACCTTTGATGCTTGCATACGA CCACACTTACTAATTATGGATGGTTCGAACAC ] [+] EMBL CD122822 [ CTTGTTGGGACGTGTGGACTTAACTGTCCGGTGTATGCCACGACTCCTGTTTACAAAATGGGACAAATGTTTATGTATGATTTTTTCCAGTCAAGACATGCTTCTGAGGACTTTAGCCACTACACGTTAGATGATGTTGATCTAGCCTTCGATCATGTGCATCAAGTT AAGTATCAGCAAACAATCAGTCTTCATGGTCGTGGCCATGGTTTATGTATAACCCCACTTCCTTCTGGTCACACACTTGGAGGAACAATTTGGAAACTAGTTAAAGAAGACACAAGTATCGTTTACGCTTTGGATTTCAACC ATAAAAAGGAGAGACACTTAAATGGAGCTACCTTTGATGCTTGCATACGA CCACACTTACTAATTATGGATGGTTCGAACAC ] [+] EMBL CD161225 [ CTTGTTGGGACGTGTGGACTTAACTGTCCGGTGTATGCCACGACTCCTGTTTACAAAATGGGACAAATGTTTATGTATGATTTTTTCCAGTCAAGACATGCTTCTGAGGACTTTAGCCACTACACGTTAGATGATGTTGATCTAGCCTTCGATCATGTGCATCAAGTT AAGTATCAGCAAACAATCAGTCTTCATGGTCGTGGCCATGGTTTATGTATAACCCCACTTCCTTCTGGTCACACACTTGGAGGAACAATTTGGAAACTAGTTAAAGAAGACACAAGTATCGTTTACG ] [+] EMBL CD161311 [ CTTGTTGGGACGTGTGGACTTAACTGTCCGGTGTATGCCACGACTCCTGTTTACAAAATGGGACAAATGTTTATGTATGATTTTTTCCAGTCAAGACATGCTTCTGAGGACTTTAGCCACTACACGTTAGATGATGTTGATCTAGCCTTCGATCATGTGCATCAAGTT AAGTATCAGCAAACAATCAGTCTTCATGGTCGTGGCCATGGTTTATGTATAACCCCACTTCCTTCTGGTCACACACTTGGAGGAACAATTTGGAAACTAGTTAAAGAAGACACAAGTATCGTTTACG ] [-] EMBL CD161122 [ TTGTTGGGACGTGTGGACTTAACTGTCCGGTGTATGCCACGACTCCTGTTTACAAAATGGGACAAATGTTTATGTATGATTTTTTCCAGTCAAGACGTGCCTCTGAGGACTTTAGCCACTACACGTTAGATGATGTTGATCTAGCCTTCGATCATGTGCATCAAGTT AAGTATCAGCAAACAATCAGTCTTCATGGTCGTGGCCATGGTTTATGTATAACCCCACTTCCTTCTGGTCACACACTTGGAGGAACAATTTGGAAACTAGTTAAAGAAGACACAAGTATCGTTTACGCTTTGGATTTCAACC ATAAAAAGGAGAGACACTTAAATGGAGCTACCTTTGATGCTTGCATACGA CCACACTTACTAATTATGGATGGTTCGAACACC] [-] EMBL CD122925 [ TTGTTGGGACGTGTGGACTTAACTGTCCGGTGTATGCCACGACTCCTGCTTACAAAATGGGACAAATGTTTATGTATGATTTTTTCCAGTCAAGACATGCTTCTGAGGACTTTAGCCACTACACGTTAGATGATGTTGATCTAGCCTTCGATCATGTGCATCAAGTT AAGTATCAGCAAACAATCAGTCTTCATGGTCGTGGCCATGGTTTATGTATAACCCCACTTCCTTCTGGTCACACACTTGGAGGAACAATTTGGAAACTAGTTAAAGAAGACACAAGTATCGTTTACGCTTTGGATTTCAACC ATAAAAAGGAGAGACACTTAAATGGAGCTACCTTTGATGCTTGCATACGA CCACACTTACTAATTATGGATGGTTCGAACACC] [-] EMBL CD123009 [ TTGTTGGGACGTGTGGACTTAACTGTCCGGTGTATGCCACGACTCCTGCTTACAAAATGGGACAAATGTTTATGTATGATTTTTTCCAGTCAAGACATGCTTCTGAGGACTTTAGCCACTACACGTTAGATGATGTTGATCTAGCCTTCGATCATGTGCATCAAGTT AAGTATCAGCAAACAATCAGTCTTCATGGTCGTGGCCATGGTTTATGTATAACCCCACTTCCTTCTGGTCACACACTTGGAGGAACAATTTGGAAACTAGTTAAAGAAGACACAAGTATCGTTTACGCTTTGGATTTCAACC ATAAAAAGGAGAGACACTTAAATGGAGCTACCTTTGATGCTTGCATGCGA CCACACTTACTAATTATGGATGGTTCGAACACC] [-] EMBL CD179501 [ TTGTTGGGACGTGTGGACTTAACTGTCCGGTATATGCCACGACTCCTGTTTACAAAATGGGACAAATGTTTATGTATGATTTTTTCCAGTCAAGACATGCTTCTGAGGACTTTAGCCACTACACGTTAGATGATGTTGATCTAGCCTTCGATCATGTGCATCAAGTT AAGTATCAGCAAACAATCAGTCTTCATGGTCGTGGCCATGGTTTATGTATAACCCCACTTCCTTCTGGTCACACACTTGGAGGAACAATTTGGAAACTAGTTAAAGAAGACACAAGTATCGTTTACGCTTTGGATTTCAACC ATAAAAAGGAGAGACACTTAAATGGAGCTACCTTTGATGCTTGCATACGA CCACACTTACTAATTATGGATGGTTCGAACACC] [-] EMBL CD179518 [ TTGTTGGGACGTGTGGACTTAACTGTCCGGTGTATGCCACGACTCCTGTTTACGAAATGGGACAAATGTTTATGTATGATTTTTTCCAGTCAAGACATGCTTCTGAGGACTTTAGCCACTACACGTTAGATGATGTTGATCTAGCCTTCGATCATGTGCATCAAGTT AAGTATCAGCAAACAATCAGTCTTCATGGTCGTGGCCATGGTTTATGTATAACCCCACTTCCTTCTGGTCACACACTTGGAGGAACAATTTGGAAACTAGTTAAAGAAGACACAAGTATCGTTTACGCTTTGGATTTCAACC ATAAAAAGGAGAGACACTTAAATGGAGCTACCTTTGATGCTTGCATACGA CCACACTTACTAATTATGGATGGTTCGAACACC] [-] EMBL CD122807 [ TTGTTGGGACGTGTGGACTTAACTGTCCGGTGTATGCCACGACTCCTGTTTACAAAATGGGACAAATGTTTATGTATGATTTTTTCCAGTCAAGACATGCTTCTGAGGACTTTAGCCACTACACGTTAGATGATGTTGATCTAGCCTTCGATCATGTGCATCAAGTT AAGTATCAGCAAACAATCAGTCTTCATGGTCGTGGCCATGGTTTATGTATAACCCCACTTCCTTCTGGTCACACACTTGGAGGAACAATTTGGAAACTAGTTAAAGAAGACACAAGTATCGTTTACGCTTTGGATTTCAACC ATAAAAAGGAGAGACACTTAAATGGAGCTACCTTTGATGCTTGCATACGA CCACACTTACTAATTATGGATGGTTCGAACACC] [-] EMBL CD122837 [ TTGTTGGGACGTGTGGACTTAACTGTCCGGTGTATGCCACGACTCCTGTTTACAAAATGGGACAAATGTTTATGTATGATTTTTTCCAGTCAAGACATGCTTCTGAGGACTTTAGCCACTACACGTTAGATGATGTTGATCTAGCCTTCGATCATGTGCATCAAGTT AAGTATCAGCAAACAATCAGTCTTCATGGTCGTGGCCATGGTTTATGTATAACCCCACTTCCTTCTGGTCACACACTTGGAGGAACAATTTGGAAACTAGTTAAAGAAGACACAAGTATCGTTTACGCTTTGGATTTCAACC ATAAAAAGGAGAGACACTTAAATGGAGCTACCTTTGATGCTTGCATACGA CCACACTTACTAATTATGGATGGTTCGAACACC] [-] EMBL CD122942 [ TTGTTGGGACGTGTGGACTTAACTGTCCGGTGTATGCCACGACTCCTGTTTACAAAATGGGACAAATGTTTATGTATGATTTTTTCCAGTCAAGACATGCTTCTGAGGACTTTAGCCACTACACGTTAGATGATGTTGATCTAGCCTTCGATCATGTGCATCAAGTT AAGTATCAGCAAACAATCAGTCTTCATGGTCGTGGCCATGGTTTATGTATAACCCCACTTCCTTCTGGTCACACACTTGGAGGAACAATTTGGAAACTAGTTAAAGAAGACACAAGTATCGTTTACGCTTTGGATTTCAACC ATAAAAAGGAGAGACACTTAAATGGAGCTACCTTTGATGCTTGCATACGA CCACACTTACTAATTATGGATGGTTCGAACACC] [-] EMBL CD123114 [ TTGTTGGGACGTGTGGACTTAACTGTCCGGTGTATGCCACGACTCCTGTTTACAAAATGGGACAAATGTTTATGTATGATTTTTTCCAGTCAAGACATGCTTCTGAGGACTTTAGCCACTACACGTTAGATGATGTCGATCTAGCCTTCGATCATGTGCATCAAGTT AAGTATCAGCAAACAATCAGTCTTCATGGTCGTGGCCATGGTTTATGTATAACCCCACTTCCTTCTGGTCACACACTTGGAGGAACAATTTGGAAACTAGTTAAAGAAGACACAAGTATCGTTTACGCTTTGGATTTCAACC ATAAAAAGGAGAGACACTTAAATGGAGCTACCTTTGATGCTTGCATACGA CCACACTTACTAATTATGGATGGTTCGAACACC] [-] EMBL CD123159 [ TTGTTGGGACGTGTGGACTTAACTGTCCGGTGTATGCCACGACTCCTGTTTACAAAATGGGACAAATGTTTATGTATGATTTTTTCCAGTCAAGACATGCTTCTGAGGACTTTAGCCACTACACGTTAGATGATGTTGATCTAGCCTTCGATCATGTGCATCAGGTT AAGTATCAGCAAACAATCAGTCTTCATGGTCGTGGCCATGGTTTATGTATAACCCCACTTCCTTCTGGTCACACACTTGGAGGAACAATTTGGAAACTAGTTAAAGAAGACACAAGTATCGTTTACGCTTTGGATTTCAACC ATAAAAAGGAGAGACACTTAAATGGAGCTACCTTTGATGCTTGCATACGA CCACACTTACTAATTATGGATGGTTCGAACACC] [-] EMBL CD161397 [ TTGTTGGGACGTGTGGACTTAACTGTCCGGTGTATGCCACGACTCCTGTTTACAAAATGGGACAAATGTTTATGTATGATTTTTTCCAGTCAAGACATGCTTCTGAGGACTTTAGCCACTACACGTTAGATGATGTTGATCTAGCCTTCGATCTTGTGCATCAAGTT AAGTATCAGCAAACAATCAGTCTTCATGGTCGTGGCCATGGTTTATGTATAACCCCACTTCCTTCTGGTCACACACTTGGAGGAACAATTTGGAAACTAGTTAAAGAAGACACAAGTATCGTTTACGCTTTGGATTTCAACC ATAAAAAGGAGAGACACATAAATGGAGCTACCTTTGATGCTTGCATACGA CCACACTTACTAATTATGGATGGTTCGAACACC] [-] EMBL CD161208 [ TTGTTGGGACGTGTGGACTTAACTGTCCGGTGTATGCCACGACTCCTGTTTACAAAATGGGACAAATGTTTATGTATGATTTTTTCCAGTCAAGACATGCTTCTGAGGACTTTAGCCACTACACGTTAGATGATGTTGATCTAGCCTTCGATCATGTGCGTCAAGTT AAGTATCAGCAAACAATCAGTCTTCATGGTCGTGGCCATGGTTTATGTATAACCCCACTTCCTTCTGGTCACACACTTGGAGGAACAATTTGGAAACTAGTTAAAGAAGACACAAGTATCGTTTACGCTTTGGATTTCAACC ATAAAAAGGAGAGACACTTAAATGGAGCTACCTTTGATGCTTGCATACGA CCACACTTACTAATTATGGATGGTTCGAACACC] [-] EMBL CD179373 [ TTGTTGGGACGTGTGGACTTAACTGTCCGGTGTATGCCACGACTCCTGTTTACAAAATGGGACAAATGTTTATGTATGATTTTTTCCAGTCAAGACATGCTTCTGAGGACTTTAGCCACTACACGTTAGATGATGTTGATCTAGCCTTCGATCATGTGCATCAAGTT AAGTATCAGCAAACAATCAGTCTTCATGGTCGTGGCCATGGTTTATGTATAACCCCACTTCCTTCTGGTCACACACTTGGAGGAACAATTTGGAAACTAGTTAAAGAAGATACAAGTATCGTTTACGCTTTGGATTTCAACC ATAAAAAGGAGAGACACTTAAATGGAGCTACCTTTGATGCTTGCATACGA CCACACTTACTAATTATGGATGGTTCGAACACC] [-] EMBL CD179374 [ TTGTTGGGACGTGTGGACTTAACTGTCCGGTGTATGCCACGACTCCTGTTTACAAAATGGGACAAATGTTTATGTATGATTTTTTCCAGTCAAGACATGCTTCTGAGGACTTTAGCCACTACACGTTAGATGATGTTGATCTAGCCTTCGATCATGTGCATCAAGTT AAGTATCAGCAAACAATCAGTCTTCATGGTCGTGGCCATGGTTTATGTATAACCCCACTTCCTTCTGGTCACACACTTGGAGGAACAATTTGGAAACTAGTTAAAGAAGACACAAGTATCGTTTACGCTTTGGATTTCAACC ATAAAAAGGAGAGACACTTAAATGGAGCTACCTTTGATGCTTGCATACGA CCACACTTACTAATTATGGATGGTTCGAACACC] [-] EMBL CD179489 [ TTGTTGGGACGTGTGGACTTAACTGTCCGGTGTATGCCACGACTCCTGTTTACAAAATGGGACAAATGTTTATGTATGATTTTTTCCAGTCAAGACATGCTTCTGAGGACTTTAGCCACTACACGTTAGATGATGTTGATCTAGCCTTCGATCATGTGCATCAAGTT AAGTATCAGCAAACAATCAGTCTTCATGGTCGTGGCCATGGTTTATGTATAACCCCACTTCCTTCTGGTCACACACTTGGAGGAACAATTTGGAAACTAGTTAAAGAAGACACAAGTATCGTTTACGCTTTGGATTTCAACC ATAAAAAGGAGAGACACTTAAATGGAGCTACCTTTGATGCTTGCATACGA CCACACTTACTAATTATGGATGGTTCGAACACC] [-] EMBL CD179531 [ TTGTTGGGACGTGTGGACTTAACTGTCCGGTGTATGCCACGACTCCTGTTTACAAAATGGGACAAATGTTTATGTATGATTTTTTCCAGTCAAGACATGCTTCTGAGGACTTTAGCCACTACACGTTAGGTGATGTTGATCTAGCCTTCGATCATGTGCATCAAGTT AAGTATCAGCAAACAATCAGTCTTCATGGTCGTGGCCATGGTTTATGTATAACCCCACTTCCTTCTGGTCACACACTTGGAGGAACAATTTGGAAACTAGTTAAAGAAGACACAAGTATCGTTTACGCTTTGGATTTCAACC ATAAAAAGGAGAGACACTTAAATGGAGCTACCTTTGATGCTTGCATACGA CCACACTTACTAATTATGGATGGTTCGAACACC] [-] EMBL CD161321 [ TTGTTGGGACGTGTGGACTTAACTGTCCGGTGTATGCCACGACTCCTGTTTACAAAATGGGACAAATGTTTATGTATGATTTTTTCCAGTCAAGACATGCTTCTGAGGACTTTAGCCACTACACGTTAGATGATGTTGATCTAGCCTTCGATCATGTGCATCAAGTT AAGTATCAGCAAACAATCAGTCTTCATGGTCGTGGCCATGGTTTATGTATAACCCCACTTCCTTCTGGTCACACACTTGGAGGAACAATTTGGAAATTAGTTAAAGAAGACACAAGTATCGTTTACGCTTTGGATTTCAACC ATAAAAAGGAGAGACACTTAAATGGAGCTACCTTTGATGCTTGCATACGA CCACACTTACTAATTATGGATGGTTCGAACAC ] [-] EMBL CD161228 [ TTGTTGGGACGTGTGGACTTAACTGTCCGGTGTATGCCACGACTCCTGTTTACAAAATGGGACAAATGTTTATGTATGATTTTTTCCAGTCAAGACATGCTTCTGAGGACTTTAGCCACTACACGTTAGATGATGTTGATCTAGCCTTCGATCATGTGCATCAAGTT AAGTATCAGCAAACAATCAGTCTTCATGGTCGTGGCCATGGTTTATGTATAACCCCACTTCCTTCTGGTCACACACTTGGAGGAACAATTTGGAAACTAGTTAAAGAAGACACAAGTATCGTTTACGCTTTGGATTTCAACC ATAAAAAGGAGAGACACTTAAATGGAGCTACCTTTGATGCTTGCATACGA CCACACTTACTAATTATGGATGGTTCGAACACC] [-] EMBL CD161275 [ TTGTTGGGACGTGTGGACTTAACTGTCCGGTGTATGCCACGACTCCTGTTTACAAAATGGGACAAATGTTTATGTATGATTTTTTCCAGTCAAGACATGCTTCTGAGGACTTTAGCCACTACACGTTAGATGATGTTGATCTAGCCTTCGATCATGTGCATCAAGTT AAGTATCAGCAAACAATCAGTCTTCATGGTCGTGGCCATGGTTTATGTATAACCCCACTTCCTTCTGGTCACACACTTGGAGGAACAATTTGGAAACTAGTTAAAGAAGATACAAGTATCGTTTACGC ] [-] EMBL CD161229 [ TTGTTGGGACGTGTGGACTTAACTGTCCGGTGTATGCCACGACTCCTGTTTACAAAATGGGACAAATGTTTATGTATGATTTTTTCCAGTCAAGACATGCTTCTGAGGACTTTAGCCACTACACGTTAGATGATGTTGATCTAGCCTTCGATCATGTGCATCAAGTT AAGTATCAGCAAACAATCAGTCTTCATGGTCGTGGCCATGGTTTATGTATAACCCCACTTCCTTCTGGTCACACACTTGGAGGAACAATTTGGAAACTAGTTAAAGAAGACACAAGTATCGTTTACGCTTTGGATTTCAACC ATAAAAAGGAGAGACACTTAAATGGAGCTACCTTTGATGCTTGCATACGA CCACACTTACTAATTATGGATGGTTCGAACACC] [-] EMBL CD160981 [ TTGTTGGGACGTGTGGACTTAACTGTCCGGTGTATGCCACGACTCCTGTTTACAAAATGGGACAAATGTTTATGTATGATTTTTTCCAGTCAAGACATGCTTCTGAGGACTTTAGCCACTACACGTTAGATGATGTTGATCTAGCCTTCGATCATGTGCATCAAGTT AAGTATCAGCAAACAATCAGTCTTCATGGTCGTGGCCATGGTTTATGTATAACCCCACTTCCTTCTGGTCACACACTTGGAGGAACAATTTGGAAACTAGTTAAAGAAGACACAAGCATCGTTTACGCTTTGGATTTCAACC ATAAAAAGGAGAGACACTTAAATGGAGCTACCTTTGATGCTTGCATACGA CCACACTTACTAATTATGGATGGTTCGAACACC] [-] EMBL CD179364 [ TTGTTGGGACGTGTGGACTTAACTGTCCGGCGTATGCCACGGCTCCTGTTTACAAAATGGGACAAATGTTTATGTATGATTTTTTCCAGTCAAGACATGCTTCTGAGGACTTTAGCCACTACACGTTAGATGATGTTGATCTAGCCTTCGATCATGTGCATCAAGTT AAGTATCAGCAAACAATCAGTCTTCATGGTCGTGGCCATGGTTTATGTATAACCCCACTTCCTTCTGGTCACGCACTTGGAGGAACAATTTGGAAACTAGTTAAAGAAGACACAAGTATCGTTTACGC ] [-] EMBL CD160920 [ TTGTTGGGACGTGTGGACTTAACTGTCCGGTGTATGCCACGACTCCTGTTTACAAAATGGGACAAATGTTTATGTATGATTTTTTCCAGTCAAGACATGCTTCTGAGGACTTTAGCCACTACACG TAGATGATGTTGATCTAGCCTTCGATCATGTGCATCAAGTT AAGTATCAGCAAACAATCAGTCTTCATGGTCGTGGCCATGGTTTATGTATAACCCCACTTCCTTCTGGTCACACACTTGGAGGAACAATTTGGAAACTAGTTAAAGAAGACACAAGTATCGTTTACGC ] [-] EMBL CD161355 [ TTGTTGGGACGTGTGGACTTAACTGTCCGGTGTATGCCACGACTCCTGTTTACAAAATGGGACAAATGTTTATGTATGATTTTTTCCAGTCAAGACATGCTTCTGAGGACTTTAGCCACTACACGTTAGATGATGTTGATCTAGCCTTCGATCATGTGCATCAAGTT AAGTATCAGCAAACAATCAGTCTTCATGGTCGTGGCCATGGTTTATGTATAACCCCACTTCCTTCTGGTCACACACTTGGAGGAACAATTTGGAAACTAGTTAAAGAAGACACAAGTATCGTTTACGCTTTGGATTTCAACC ATAAAAAGGAGAGACACTTAAATGGAGCTACCTTTGATGCTTGCATACGA CCACACTTACTAATTATGGATGGTTCGAACACC] consensusID : consensus_11270#2 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 1 consensus length = 395 fasta sequence [TNNNGTGGGAACGTGTGGACTTAACTGTCGGGTGTATGCCACGACTCCTGTTTACANAATGGGACAAATGTTTATGTATGATTTTTCCAGTCAAGACACGCTTTTGAGGACTTTAGCCACTACACGTTAGATGATGTTGATATAGCCTTCGATCATGCGCCNCAAAATTTAGGTTATGAGTAAAACCAAACATCGTTTATGTTGGGGGGGGCTGGTATGTAAACCCCCTTCCTTCTGGTCGCACACTTGGAGGAACCACAATGTAAACTAGTAAAGAAAGCACNCCAGTATGTTACGCTTTGGATTTCAACCATAAAAAGGAGAGGCACTTAAATGGAGCTACCTTTGATGCTTGCATACGACCACACTTACTAATTATGGATGGTTCGAACACC] [-] EMBL CD161192 [TNNNGTGGGAACGTGTGGACTTAACTGTCGGGTGTATGCCACGACTCCTGTTTACANAATGGGACAAATGTTTATGTATGATTTTTCCAGTCAAGACACGCTTTTGAGGACTTTAGCCACTACACGTTAGATGATGTTGATATAGCCTTCGATCATGCGCCNCAAAATTTAGGTTATGAGTAAAACCAAACATCGTTTATGTTGGGGGGGGCTGGTATGTAAACCCCCTTCCTTCTGGTCGCACACTTGGAGGAACCACAATGTAAACTAGTAAAGAAAGCACNCCAGTATGTTACGCTTTGGATTTCAACCATAAAAAGGAGAGGCACTTAAATGGAGCTACCTTTGATGCTTGCATACGACCACACTTACTAATTATGGATGGTTCGAACACC] consensus multiple alignement with clustalw CLUSTAL W (1.82) multiple sequence alignment consensus_11270#0 ACTCAAGGTCGTTGTGCCTGTAGGATGGCAACTTCTATAATCAAGTTGCACACGCTTTCG 60 consensus_11270#1 ------------------------------------------------------------ consensus_11270#2 ------------------------------------------------------------ consensus_11270#0 GGGGCTGGTGATAATGGTTCACCTTGTTACTTACTTCAGGTAGATGAGTTTCACTGTCTT 120 consensus_11270#1 ------------------------------------------------------------ consensus_11270#2 ------------------------------------------------------------ consensus_11270#0 CTTGACTGTGGTTGGTGTGAGAAACTGGATAGTGACTATGTGAAAGAGGTGTCAAAGTGG 180 consensus_11270#1 ------------------------CTGGATAGTGACTATGTGAAAGAGGTGTCAAAGTGG 36 consensus_11270#2 ------------------------------------------------------------ consensus_11270#0 GCTAAGCATGTTGATGCCGTGCTTCTTAGTCATCAAAGTCTAAGACACCTCGGGTTGCTT 240 consensus_11270#1 GCTAAGCATGTTGATGCCGTGCTTCTTAGTCATCAAAGTCTAAGACACCTCGGGTTGCTT 96 consensus_11270#2 ------------------------------------------------------------ consensus_11270#0 CCATATCTTGTTGGGACGTGTGGACTTAACTGTCCGGTGTATGCCACGACTCCTGTTTAC 300 consensus_11270#1 CCATATCTTGTTGGGACGTGTGGACTTAACTGTCCGGTGTATGCCACGACTCCTGTTTAC 156 consensus_11270#2 -----TNNNGTGGGAACGTGTGGACTTAACTGTCGGGTGTATGCCACGACTCCTGTTTAC 55 * ** ** ******************* ************************* consensus_11270#0 AAAATGGGACAAATGTTTATGTATGATTTTTTCCAGTCAAGACATGCTTCTGAGGACTTT 360 consensus_11270#1 AAAATGGGACAAATGTTTATGTATGATTTTTTCCAGTCAAGACATGCTTCTGAGGACTTT 216 consensus_11270#2 ANAATGGGACAAATGTTTATGTATGATTTTT-CCAGTCAAGACACGCTTTTGAGGACTTT 114 * ***************************** ************ **** ********** consensus_11270#0 AGCCACTACACGTTACATGATGTTGATCTAGCCTTCGATCATGTGCATCAAG--TTAAGT 418 consensus_11270#1 AGCCACTACACGTTAGATGATGTTGATCTAGCCTTCGATCATGTGCATCAAG--TTAAGT 274 consensus_11270#2 AGCCACTACACGTTAGATGATGTTGATATAGCCTTCGATCATGCGCCNCAAAATTTAGGT 174 *************** *********** *************** ** *** *** ** consensus_11270#0 -ATCAGCAAA--CAATCAGTCTTCATGGTCGTGGCCATGGTTTATGTATAACCCCACTTC 475 consensus_11270#1 -ATCAGCAAA--CAATCAGTCTTCATGGTCGTGGCCATGGTTTATGTATAACCCCACTTC 331 consensus_11270#2 TATGAGTAAAACCAAACATCGTTTATGTTGGGGGG---GGCTGGTATGTAAACCCCCTTC 231 ** ** *** *** ** ** *** * * ** ** * * * *** *** **** consensus_11270#0 CTTCTGGTATGTAACTTGGACAGATAATATTTTCTAACAGGTCACACACTTGGAGGAACA 535 consensus_11270#1 CTTCTGGT----------------------------------CACACACTTGGAGGAACA 357 consensus_11270#2 CTTCTGGT----------------------------------CGCACACTTGGAGGAACC 257 ******** * *************** consensus_11270#0 ATT-TGGAAACTAGTTAAAGAAG-ACACAAGTATCGTTTACGCTTTGGATTTCAACCATA 593 consensus_11270#1 ATT-TGGAAACTAGTTAAAGAAG-ACACAAGTATCGTTTACGCTTTGGATTTCAACCATA 415 consensus_11270#2 ACAATGTAAACTAGTAAAGAAAGCACNCCAGTATG--TTACGCTTTGGATTTCAACCATA 315 * ** ******** ** *** ** * ***** *********************** consensus_11270#0 AAAAGGAGAGACACTTAAATGGAGCTACCTTTGATGCTTGCATACGACCACACTTACTAA 653 consensus_11270#1 AAAAGGAGAGACACTTAAATGGAGCTACCTTTGATGCTTGCATACGACCACACTTACTAA 475 consensus_11270#2 AAAAGGAGAGGCACTTAAATGGAGCTACCTTTGATGCTTGCATACGACCACACTTACTAA 375 ********** ************************************************* consensus_11270#0 TTATGGATGGTTCGAACAC- 672 consensus_11270#1 TTATGGATGGTTCGAACACC 495 consensus_11270#2 TTATGGATGGTTCGAACACC 395 ******************* |
Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) | ||||