cluster # 11291

These datas are free for academic use only, please contact me for any other use.

Schistosoma mansoni
cluster # 11291 cluster # 11291 Sequences # 48 consensus # 5

see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :

consensus_11291#0 length = 1202 sequences # 10
consensus_11291#1 length = 752 sequences # 5

consensus_11291#2 length = 560 sequences # 27
consensus_11291#3 length = 424 sequences # 1
consensus_11291#4 length = 386 sequences # 5

consensusID : consensus_11291#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 10
consensus length = 1202
fasta sequence

                              [ATGTCATGAAAATGCGAAATGCAATGAATACGGTAAATGTCAGTGTCTTGATGGTTATTCAGGAGATGGATATTATGAATGCCAGAAAAGTTCACAAGAGTTATGCGCTGGTGTTCAGTGTCATCGTTTCGGTCAATGTTATGAAAATCGATGCTACTGCAGTCATGGATATGTCGGGGATGGGGTTAACTTTTGTGACGCACGTGCAAACGATCCATGTGATGGCGTCCGTTGTGCTGCTAATGGACGTTGCCAGGATGGTCGATGTGTATGTGATCCTGGTTATACAGGAGATGGTTACAATGAATGTCGAGAAGCTGAGGGTGTGAATTTATGTGGTAATGTACAATGTCATCAATATGCTACATGTGATAGAGGACAATGTCGTTGTGTTACTGGTTATGATGGTGATGGTTATTCAGATTGTCGACCAGTTACAGAGGATAAGTGCTCACG-AGTGAGATGTCATCCAGAT-GCTCAATGTACTGATGGTTATTGCCGCTGTTTGGATGGATATGAAGGAGATGGCTACCAGATGTGTAATATAATACCTGGAGCAACTTCAGCAGATTGTGGTAATTGCAATGGTATACCTTTTAAAGAACTAGCTCAGTGTGTTGGTGGACGATGTATTTGTGCTCGTGGATTTATTGAAGTCCAGCCAGGTGTCTGTATGGAATGTGTGCNAGATAATTGTCATCAGGATGCTGTCTGTCGACCGGNATGAAAGATTTAATGGCGCTTATTCGTGTCATTGTAAAGCTGGTTTCACTGGAGATGGAGTATCTGTTTGCAAGCCTGAAAGTGTAGGTAGAGAAGATGCCACATCATCACACACCATTGATCCTACATGCGGTGGAGGCTGTAGGACACGAAATGCGGAGTGTGATCGATATACTGGGACGTGTAAATGTCGATCAGGTTATGATGGAGATGGAGAGAGAGGTTGCTACTGGAATTGTAAGCTGTGTCATTCGAGTGCAATTTGTGATCGTGAAAACGAAAGATGCATTTGTCCATCTGGTTATCGTGGAGATGGACAAACATTTTGTGAACGAATTCCAGTTAGACAAGATTCTATTAAAGTTCGAATAATGGGAGAGGGAGAAGTAATGCATATTACAGATATATCTCATCCACTTGAATTAAGATGTTTCGTGACTGGGAGCGATCAGTCATATTCTGGCCAGTGGATTAAACCA]

[+] EMBL CD064988             [ATGTCATGAAAATGCGAAATGCAATGAATACGGTAAATGTCAGTGTCTTGATGGTTATTCAGGAGATGGATATTATGAATGCCAGAAAAGTTCACAAGAGTTATGCGCTGGTGTTCAGTGTCATCGTTTCGGTCAATGTTATGAAAATCGATGCTACTGCAGTCATGGATATGTCGGGGATGGGGTTAACTTTTGTGACGCACGTGCAAACGATCCATGTGATGGCGTCCGTTGTGCTGCTAATGGACGTTGCCAGGATGGTCGATGTGTATGTGATCCTGGTTATACAGGAGATGGTTACAATGAATGTCGAGAAGCTGAGGGTGTGAATTTATGTGGTAATGTACAATGTCATCAATATGCTACATGTGATAGAGGACAATGTCGTTGTGTTACTGGTTATGATGGTGATGGTTATTCAGATTGTCGACCAGTTACAGAGGATAAGTGCTCACG AGTGAGATGTCATCCAGAT GCTCAATGTACTGATGGTTAT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  ]
[+] EMBL CD064953             [ATGTCATGAAAATGCGAAATGCAATGAATACGGTGACTGTCAGTGTCTTGATGGTTATTCAGGAGATGGATATTATGAATGCCAGAAAAGTTCACAAGAGTTATGCGCTGGTGTTCAGTGTCATCGTTTCGGTCAATGTTATGAAAATCGATGCTACTGCAGTCATGGATATGTCGGGGATGGGGTTAACTTTTGTGACTCACGTGCAAACGATCCATGTGATGGCGTCCGTTGTGCTGCTAATGGACGTTGCCAGGATGGTCGATGTGTATGTGATCCTGGTTATACAGGAGATGGTTACAATGAATGTCGAGAAGCTGAGGGTGTGAATTTATGTGGTAATGTACAATGTCATCAATATGCTACATGTGATAGAGGACAATGTCGTTGTGTTACTGGTTATGATGGTGATGGTTATTCAGATTGTCGACCAGTTACAGAGGATAAGTGCTCACG AGTGAGATGTCATCCAGAT GCTCAATGT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              ]
[+] EMBL CD065083             [ATGTCATGAAAATGCGAAATGCAATGAATACGGTAAATGTCAGTGTCTTGATGGTTATTCAGGAGATGGATATTATGAATGCCAGAAAAGTTCACAAGAGTTATGCGCTGGTGATCAGTGTCATCGTTTCGGTCAATGTTATGAAAATCGATGCTACTGCAGGCATGGATACGTCGGGGATGG                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             ]
[+] EMBL CD064987             [ATGTCATGAAAATGCGAAATGCAATGAATACGGTAAATGTCAGTGTCTTGATGGTTATTCGGGAGATGGATATTATGAATGCCAGAAAAGTTCACAAGAGTTATGCGCTGGTGTTCAGTGTCATCGTTTCGGTCAATGTTATGAAAATCGATGCTACTGCAGTCATGGATATGTCGGGGATGGGGTTAACTTTTGTGACGCACGTGCAAACGATCCATGTGATGGCGTCCGTTGTGCTGCTAATGGACGTTGCCAGGATGGTCGATGTGTATGTGATCCTGGTTATACAGGAGATGGTTACAATGAATGTCGAGAAGCTGAGGGTGTGAATTTATGTGGTAATGTACAATGTCATCAATATGCTACATGTGATAGAGGACAATGTCGTTGTGTTACTGGTTATGATGGT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           ]
[+] EMBL CD065047             [ATGTCATGAAAATGCGAAATGCAATGAATACGGTAAATGTCAGTGTCTTGATGGTTATTCAGGAGATGGATATTATGAATGCCAGAAAAGTTCACAAGAGTTATGCGCTGGCGTTCAGTGTCATCGTTTCGGTCAATGTTATGAAAATCGATGCTACTGCAGTCATGGATATGTCGGGGATGGGGTTAACTTTTGTGACGCACGTGCAAACGATCCATGTGATGGCGTCCGTTGTGCTGCTAATGGACGTTGCCAGGATGGTCGATGTGTATGTGATCCTGGTTATACAGGAGATGGTTACAATGAATGTCGAGAAGCTGAGGGTGTGAATTTATGTGGTAATGTACAATGTCATCAATATGCTACATGTGATAGAGGACAATGTCGCTGTGTTACTG                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      ]
[+] EMBL CD064997             [ATGTCATGAAAATGCGAAATGCAATGAATACGGTAAATGTCAGTGTCTTGATGGTTATTCAGGAGATGGATATTATGAATGCCAGAAAAGTTCACAAGAGTTATGCGCTGGCGTTCAGTGTCATCGTTTCGGTCAATGTTATGAAAATCGATGCTACTGCAGTCATGGATATGTCGGGGATGGGGTTAACTTTTGTGACGCACGTGCAAACGATCCATGTGATGGCGTCCGTTGTGCTGCTAATGGACGTTGCCAGGATGGTCGATGTGTATGTGATCCTGGTTATACAGGAGATGGTTACAATGAATGTCGAGAAGCTGAGGGTGTGAATTTATGTGGTAATGTACAATGTCATCAATATGCTACATGTGATAG                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             ]
[+] EMBL CD065130             [ATGTCATGAAAATGCGAAATGCAATGAATACGGTAAATGTCAGTGTCTTGATGGTTATTCAGGAGATGGATATTATGAATGCCAGAAAAGTTCACAAGAGTTATGCGCTGGTGTTCAGTGTCATCGTTTCGGTCAATGTTATGAAAATCGATGCTACTGCAGTCATGGATATGTCGGGGATGGGGTTAACTTTTGTGACGCACGTGCAAACGATCCATGTGATGGCGTCCGTTGTGCTGCTAATGGACGTTGCCAGGATGGTCGATGTGTATGTGATCCTGGTTATACAGG                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 ]
[+] EMBL CD181745             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          TTTATGTGGTAATGTACAATGTCATCAATATGCTACATGTGATAGAGGACAATGTCGTTGTGTTACTGGTTATGATGGTGATGGTTATTCAGATTGTCGACCAGTTACAGAGGCTCTATG TCGGGCAGAACAATGCCAT CAGTTCGCTAGACGTGTTGAAGGTCGATGCCGCTGTTTGGATGGATATGAAGGAGATGGCTACCAGATGTGTAATATAATACCTGGAGCAACTTCAGCAGATTGTGGTAATTGCAATGGTATACCTTTTAAAGAACTAGCTCAGTGTGTTGGTGGACGATGTATTTGTGCTCGTGGATTTATTGAAGTCCAGCCAGGTGTCTGTATGGAATGTGTGCNAGATAATTGTCATCAGGATGCTGTCTGTCGACCGGNATG                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            ]
[+] EMBL CD155331             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           GAACTAGCTCAGTGTGTTGGTGGACGATGTATTTGTGCTCGTGGATTTATTGAAGTCCAGCCAGGTGTCTGTATGGAATGTGTGCAAGATAATTGTCATCAGGATGCTGTCTGTCGACCGG ATGAAAGATTTAATGGCGCTTATTCGTGTCATTGTAAAGCTGGTTTCACTGGAGATGGAGTATCTGTTTGCAAGCCTGAAAGTGTAGGTAGAGAAGATGCCACATCATCACACACCATTGATCCTACATGCGGTGGAGGCTGTAGGACACGAAATGCGGAGTGTGATCGATATACTGGGACGTGTAAATGTCGATCAGGTTATGATGGAGATGGAGAGAGAGGTTGCTACTGGAATTGTAAGCTGTGTCATTCGAGTGCAATTTGTGATCGTGAAAACGAAAGATGCATTTGTCCATCTGGTTATCGTGGAGATGGACAAACATTTTGTGAACGAATTCCAGTTAGACAAGATTCTATT                                                                                                                        ]
[+] EMBL CD190583             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            GATCCTACATGCGGTGGAGGCTGTTTTATAGAAAAAGCTGGGCGTGATCGATATACTGGGACGTGTAAATGTCGATCAGGTTATGATGGAGATGGAGAGAGAGGTTGCTACTGGAATTGTAAGCTGTGTCATTCGAGTGCAATTTGTGATCGTGAAAACGAAAGATGCATTTGTCCATCTGGTTATCGTGGAGATGGACAAACATTTTGTGAACGAATTCCAGTTAGACAAGATTCTATAAAAGTTCGAATAATGGGAGAGGGAGAAGTAATGCATATTACAGATATATCTCATCCACTTGAATTAAGATGTTTCGTGACTGGGAGCGATCAGTCATATTCTGGCCAGTGGATTAAACCA]




>consensus_11291#0
ATGTCATGAAAATGCGAAATGCAATGAATACGGTAAATGTCAGTGTCTTGATGGTTATTC
AGGAGATGGATATTATGAATGCCAGAAAAGTTCACAAGAGTTATGCGCTGGTGTTCAGTG
TCATCGTTTCGGTCAATGTTATGAAAATCGATGCTACTGCAGTCATGGATATGTCGGGGA
TGGGGTTAACTTTTGTGACGCACGTGCAAACGATCCATGTGATGGCGTCCGTTGTGCTGC
TAATGGACGTTGCCAGGATGGTCGATGTGTATGTGATCCTGGTTATACAGGAGATGGTTA
CAATGAATGTCGAGAAGCTGAGGGTGTGAATTTATGTGGTAATGTACAATGTCATCAATA
TGCTACATGTGATAGAGGACAATGTCGTTGTGTTACTGGTTATGATGGTGATGGTTATTC
AGATTGTCGACCAGTTACAGAGGATAAGTGCTCACGAGTGAGATGTCATCCAGATGCTCA
ATGTACTGATGGTTATTGCCGCTGTTTGGATGGATATGAAGGAGATGGCTACCAGATGTG
TAATATAATACCTGGAGCAACTTCAGCAGATTGTGGTAATTGCAATGGTATACCTTTTAA
AGAACTAGCTCAGTGTGTTGGTGGACGATGTATTTGTGCTCGTGGATTTATTGAAGTCCA
GCCAGGTGTCTGTATGGAATGTGTGCNAGATAATTGTCATCAGGATGCTGTCTGTCGACC
GGNATGAAAGATTTAATGGCGCTTATTCGTGTCATTGTAAAGCTGGTTTCACTGGAGATG
GAGTATCTGTTTGCAAGCCTGAAAGTGTAGGTAGAGAAGATGCCACATCATCACACACCA
TTGATCCTACATGCGGTGGAGGCTGTAGGACACGAAATGCGGAGTGTGATCGATATACTG
GGACGTGTAAATGTCGATCAGGTTATGATGGAGATGGAGAGAGAGGTTGCTACTGGAATT
GTAAGCTGTGTCATTCGAGTGCAATTTGTGATCGTGAAAACGAAAGATGCATTTGTCCAT
CTGGTTATCGTGGAGATGGACAAACATTTTGTGAACGAATTCCAGTTAGACAAGATTCTA
TTAAAGTTCGAATAATGGGAGAGGGAGAAGTAATGCATATTACAGATATATCTCATCCAC
TTGAATTAAGATGTTTCGTGACTGGGAGCGATCAGTCATATTCTGGCCAGTGGATTAAAC
CA

consensusID : consensus_11291#1
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 5
consensus length = 752
fasta sequence

                              [GAGACCCAGTTGTCAAATGTTATGAAGAAAGAGAGTTATGCGCTGGTGTTCAGTGTCATCGTTTCGGTCAATGTTATGAAAATCGATGCTACTGCAGTCATGGATATGTCGGGGATGGGGTTAACTTTTGTGACGCACGTGCAAACGATCCATGTGATGGCGTCCGTTGTGCTGCTAATGGACGTTGCCAGGATGGTCGATGTGTATGTGATCCTGGTTATACAGGAGATGGTTACAATGAATGTCGAGAAGCTGAGGGTGTGAATTTATGTGGTAATGTACAATGTCATCAATATGCTACATGTGATAGAGGACAATGTCGTTGTGTTACTGGTTATGATGGTGATGGTTATTCAGATTGTCGACCAGTTACAGAGGATAAGTGCTCACGAGTGAGATGTCATCCAGATGCTCAATGTACTGATGGTTATTGTTTCTGTCCCTCTGGTTTCGAAGGAGACGGATATTACGAGTGTAAACGAATCACTCAAGATCGCTGTGCGAATGTTCGGTGTCATGAAAATGCTAAATGTGACGACGGGTATTGTCGTTGTAAAGAAGATTTTGAGGGCGATGGCTACAGTGAGTGTAGACGTAAAAGTGAAGATCCATGTGCCCGTATTCGCTGTCATCCACAAGCTCAGTGTGAGTATGGGTATTGCCGCTGTAAAAATGGTTATAAAGGTGATGGCTATTGGAATTGTCAGGCTATACAAAGTGATCTATGTCGGGCAGAACAATGCCATCAGTTC]

[+] EMBL CD180879             [GAGACCCAGTTGTCAAATGTTATGAAGAAAGAGAGTTATGCGCTGGTGTTCAGTGTCATCGTTTCGGTCAATGTTATGAAAATCGATGCTACTGCAGTCATGGATATGTCGGGGATGGGGTTAACTTTTGTGACGCACGTGCAAACGATCCATGTGATGGCGTCCGTTGTGCTGCTAATGGACGTTGCCAGGATGGTCGATGTGTATGTGATCCTGGTTATACAGGAGATGGTTACAATGAATGTCGAGAAGCTGAGGGTGTGAATTTATGTGGTAATGTACAATGTCATCAATATGCTACATGTGATAGAGGACAACGT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                ]
[+] EMBL CD181120             [GAGACCCAGTTGTCAAATGTTATGAAGAAAGAGAGTTATGCGCTGGTGTTCAGTGTCATCGTTTCGGTCAATGTTATGAAAATCGATGCTACTGCAGTCATGGATATGTCGGGGATGGGGTTAACTTTTGTGACGCACGTGCAAACGATCCATGTGATGGCGTCCGTTGTGCTGCTAATGGACGTTGCCAGGATGGTCGATGTGTATGTGATCCTGGTTATACAGGAGATGGTTACAATGAATGTCGAGAAGCTGAGGGTGTGAATTTATGTGGTAATGTACAATGTCATCAATATGCTACATGTGATAGAGGACAATGT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                ]
[+] EMBL CD180791             [GAGACCCAGTTGTCAAATGTTATGAAGAAAGAGAGTTATGCGCTGGTGTTCAGTGTCATCGTTTCGGTCAATGTTATGAAAATCGATGCTACTGCAGTCATGGATATGTCGGGGATGGGGTTAACTTTTGTGACGCACGTGCAAACGATCCATGTGATGGCGTCCGTTGTGCTGCTAATGGACGTTGCCAGGATGGTCGATGTGTATGTGATCCTGGTTATACAGGAGATGGTTACAATGAATGTCGAGAAGCTGAGGGTGTGAATTTATGTGGTAATGTACAATGTCATCAATATGCTACATGTGATAGAGGACAATGT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                ]
[+] EMBL CD067586             [                                                                                                                        TTAACTTTTGTGACGCACGTGCAAACGATCCATGTGATGGCGTCCGTTGTGCTGCTAATGGACGTTGCCAGGATGGTCGATGTGTATGTGGTCCTGGTTATACAGGAGATGGTTACAATGAATGTCGAGAAGCTGAGGGTGTGAATTTATGTGGTAATGTACAATGTCATCAATATGCTACATGTGATAGAGGACAATGTCGTTGTGTTACTGGTTATGATGGTGATGGTTATTCAGATTGTCGACCAGTTACAGAGGATAAGTGCTCACGAGTGAGATGTCATCCAGATGCTCAATGTACTGATGGTTATTGTTTCTGTCCCTCTGGTTTCGAAGGAGACGGATATTACGAGTGTAAACGAATCACTCAAGATCGCTGTGCGAATGTTCGGTGTCATGAAAATGCTAAATGTGACGACGGGTATTGTCGTT                                                                                                                                                                                                        ]
[+] EMBL CD064896             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     GGTGATGGTTATTCAGATTGTCGACCAGTTACAGAGGATAAGTGCTCACGAGTGAGATGTCATCCAGATGCTCAATGTACTGATGGTTATTGTTTCTGTCCCTCTGGTTTCGAAGGAGACGGATATTACGAGTGTAAACGAATCACTCAAGATCGCTGTGCGACTGTACGGTGTCATGAGGGTGCTAAATGTGACGACGGGTATAGTCGTTGTAAAGAAGATTTTGAGGGCGATGGCTACAGTGAGTGTAGACGTAAAAGTGAAGATCCATGTGCCCGTATTCGCTGTCATCCACAAGCTCAGTGTGAGTATGGGTATTGCCGCTGTAAAAATGGTTATAAAGGTGATGGCTATTGGAATTGTCAGGCTATACAAAGTGATCTATGTCGGGCAGAACAATGCCATCAGTTC]




>consensus_11291#1
GAGACCCAGTTGTCAAATGTTATGAAGAAAGAGAGTTATGCGCTGGTGTTCAGTGTCATC
GTTTCGGTCAATGTTATGAAAATCGATGCTACTGCAGTCATGGATATGTCGGGGATGGGG
TTAACTTTTGTGACGCACGTGCAAACGATCCATGTGATGGCGTCCGTTGTGCTGCTAATG
GACGTTGCCAGGATGGTCGATGTGTATGTGATCCTGGTTATACAGGAGATGGTTACAATG
AATGTCGAGAAGCTGAGGGTGTGAATTTATGTGGTAATGTACAATGTCATCAATATGCTA
CATGTGATAGAGGACAATGTCGTTGTGTTACTGGTTATGATGGTGATGGTTATTCAGATT
GTCGACCAGTTACAGAGGATAAGTGCTCACGAGTGAGATGTCATCCAGATGCTCAATGTA
CTGATGGTTATTGTTTCTGTCCCTCTGGTTTCGAAGGAGACGGATATTACGAGTGTAAAC
GAATCACTCAAGATCGCTGTGCGAATGTTCGGTGTCATGAAAATGCTAAATGTGACGACG
GGTATTGTCGTTGTAAAGAAGATTTTGAGGGCGATGGCTACAGTGAGTGTAGACGTAAAA
GTGAAGATCCATGTGCCCGTATTCGCTGTCATCCACAAGCTCAGTGTGAGTATGGGTATT
GCCGCTGTAAAAATGGTTATAAAGGTGATGGCTATTGGAATTGTCAGGCTATACAAAGTG
ATCTATGTCGGGCAGAACAATGCCATCAGTTC

consensusID : consensus_11291#2
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 27
consensus length = 560
fasta sequence

                              [CGCGCATCACCTCGTATAAGTCGTGGTGTTAGCTGTGCGTACCCCATATATAGTATGTCTA-TAGTAGATGATGAAGAATTTGCAACCGGAGATTCTGGGGCTTCAAAAACACTACCGAAACA-GTGTAGTGCTCTGA-GAAAAGGCGGACATGTCGTTATGAAAGATCGTCCTTGTAAAA-TCGTGGAAATGTCTACGTCAAAGACCGGGAAAC-ATGGCTCTGCTAAAGTGCACTT-AGTTGGGATCGATATATTC-ACTGGTAAGAAATATGAAGAGAATCGCACATCATCAC-ACACTATGGATGTGCCTGTCATCACAAGTAAAGATTACCAACTGGTGGATATCAAAGACGGGTTTTTGTCACTAATGGGCGAAGATTTAA-ATATGTTC-GAAG-ATATTCCCGTTCCGGACAATGAAGTTGGAAGGGAATTACAGGAAAAATGGAATTCAAGGGGGGAATCGGATAATATGATCGTCACTATATTATCTGCTATGGAC-AAAAGCAA-CACTAAAA-TTC-TAC-TCCTCNAAA--ANTAACGAATCAGTGTAGTGCTCTGAGAAAGGCG]

[+] EMBL CD123566             [CGCGCATCACCTCGTATAAGTCGTGGTGTTAGCTGTGCGTACCCCATATATAGTATGTCTA TAGTAGATGATGAAGAATTTGCAACCGGAGATTCTGGGGCTTCAAAAACACTACCGAAACA GTGTAGTGCTCTGA GAAAAGGCGGACATGTCGTTATGAAAGATCGTCCTTGTAAAA TCGTGGAAATGTCTACGTCAAAGACCGGGAAAC ATGGCTCTGCTAAAGTGCACTT AGTTGGGATCGATATATTC ACTGGTAAGAAATATGAAGAGAATCGCACATCATCAC ACACTATGGATGTGCCTGTCATCACAAGTAAAGATTACCAACTGGTGGATACCAAAGACGGGTTTTTG                                                                                                                                                                                                                     ]
[+] EMBL CD201544             [ GCGCATCACCTCGTATAAGTCGTGGTGTTAGCTGTGCGTACCCCATATATAGTATGTCTA TAGTAGATGATGAAGAATTTGCAACCGGAGATTCTGGGGCTTCAAAAACACTACCGAAACA GTGTAGTGCTCTGA GAAAAGGCGGACATGTCGTTATGAAAGATCGTCCTTGTAAAA TCGTGGAAATGTCTACGTCAAAGACCGGGAAAC ATGGCTCTGCTAAAGTGCACTT AGTTGGGATCGATATATTC ACTGGTAAGAAATATGAAGAGAATCGCACATCATCAC ACACTATGGATGTGCCTGTCATCACAAGTAAAGATTACCAACTGGTGGATATCAAAGACGGGTTTTTGTCACTAATGGGCGAAGATTTAA ATATGTTC GAAG ATATTCCCGTTCCGGACAATGAAGTTGGAAGGGAATTACAGGA                                                                                                                                     ]
[-] EMBL CD144955             [  CGCATCACCTCGTATAAGTCGTGGTGTTAGCTGTGCGTACCCAATATATAGTATGTCTA TAGTAGATGATGAAGAATTTGCAACCGGAGATTCTGGGGCTTCAAAAACACTACCGAAACA GTGTAGTGCTCTGA GAAAAGGCGGACATGTCGTTATGAAAGATCGTCCTTGTAAAA TCGTGGAAATGTCTACGTCAAAGACCGGGAAAC ATGGCTCTGCTAAAGTGCACTT AGTTGGGATCGATATATTC ACTGGTAAGAAATATGAAGAGAATCGCACATCATCAC ACACTATGGATGTGCCTGTCATCACAAGTAAAGATTACCAACTGGTGGATATCAAAGACGGGTTTTTGTCACTAATGGGCGAAGATTTAA ATATGTTC GAAG ATATTCCCGTTCCGGACAATGAAGTTGGAAGGGAATTACAGGAA                                                                                                                                    ]
[+] EMBL AW499464             [                  AGTCGTGGTGTTAGCTGTGCGTACCCCATATATAGTATGTCTA TAGTAGATGATGAAGAATTTGCAACCGGAGATTCTGGGGCTTCAAAAACACTACCGAAACATGT TANTGCTCTGANNAAAAGGCGGACATGTCGTTATGAAAGATCGTCCTTGTAAAA TCGTGGAAATGTCTACGTCAAAGACCGGGAAAC ATGGCTCTGCTAAAGTGCACTT AGTTGGGATCGATATATTC ACTGGTAAGAAATATGAAGAGAA CGCACATCATCAC ACACTATGGATGTGCCTGTCATCACAAGTAAAGATTACCAACTGGTGGATATCAAAGACGGGTTTTTGTCACTAATGGGCGAAGA TTAA ATATGTTC GAAG ATA TCCCGTTCCGGACAATGAA TTGGAAGGGAATTACAGGAAAAATGGAA TCNAGGGGGG ATCGGATAATATGA CCTC CTATATTA CTGCTATGGAC AAAAGCAA CACTAAAA TTC TAC TCCTCNAAA  ANTAACGAAT                        ]
[+] EMBL CD133943             [                                                    GTATGTCTA TAGTAGATGATGAAGAATTTGCAACCGGAGATTCTGGGGCTTCAAAAACACTACCGAAACA GTGTAGTGCTCTGA GAAAAGGCGGACATGTCGTTATGAAAGATCGTCCTTGTAAAA TCGTGGAAATGTCTACGTCAAAGACCGGGAAAC ATGGCTCTGCTAAAGTGCACTT AGTTGGGATCGATATATTC ACTGGTATGAAATATGAAGAGAATCGCACATCATCAC ACACTATGGATGTGCCTGTCATCACAAGTAAAGATTACCAACTGGTGGATATCAAAGACGGGTTTTTGTCACTAATGGGCGAAGATTTAA ATATGTTC GAAG ATATTCCCGTTCCGGACAATGAAGTTGGAAGGGAATTACAGGAAAAATGGAATTCAAGGGGGGAATCGGATAATATGATCGTCACTATATTATCTGCT                                                                              ]
[-] EMBL CD144973             [                                                        GTCTA TAGTAGATGATGAAGAATTTGCAACCGGAGATTCTGGGGCTTCAAAAACACTACCGAAACA GTGTAGTGCTCTGA GAAAAGGCGGACATGTCGTTATGAAAGATCGTCCTTGTAAAA TCGTGGAAATGTCTACGTCAAAGACCGGGAAAC ATGGCTCTGCTAAAGTGCACTT AGTTGGGATCGATATATTC ACTGGTAAGAAATATGAAGAGAATCGCACATCATCAC ACACTATGGATGTGCCTGTCATCACAAGTAAAGATTACCAACTGGTGGATATCAAAGACGGGTTTTTGTCACTAATGGGCGAAGATTTAA ATATGTTC GAAG ATATTCCCGTTCCGGACAATGAAGTTGGAAGGGAATTACAGGAA                                                                                                                                    ]
[+] EMBL CD137404             [                                                         TCTA TAGTAGATGATGAAGAATTTGCAACCGGAGATTCTGGGGCTTCAAAAACACTACCGAAACA GTGTAGTGCTCTGA GAAAAGGCGGACATGTCGTTATGAAAGATCGTCCTTGTAAAA TCGTGGAAATGTCTACGTCAAAGACCGGGAAAC ATGGCTCTGCTAAAGTGCACTT AGTTGGGATCGATATATTC ACTGGTAAGAAATATGAAGAGAATCGCACATCATCAC ACACTATGGATGTGCCTGTCATCACAAGTAAAGATTACCAACTGGTGGATATCAAAGACGGGTTTTTGTCACTAATGGGCGAAGATTTAA ATATGTTC GAAG ATATTCCCGTTCCGGACAATGAAGTTGGAAGGGAATTACAGGAAAAATGGAATTCAAGGGGGGAATCGGATAATATGATCGTCACTA                                                                                         ]
[+] EMBL CD137388             [                                                         TCTA TAGTAGATGATGAAGAATTTGCAACCGGAGATTCTGGGGCTTCAAAAACACTACCGAAACA GTGTAGTGCTCTGA GAAAAGGCGGACATGTCGTTATGAAAGATCGTCCTTGTAAAA TCGTGGAAATGTCTACGTCAAAGACCGGGAAAC ATGGCTCTGCTAAAGTGCACTT AGTTGGGATCGATATATTC ACTGGTAAGAAATATGAAGAGAATCGCACATCATCAC ACACTATGGATGTGCCTGTCATCACAAGTAAAGATTACCAACTGGTGGATATCAAAGACGGGTTTTTGTCACTAATGGGCGAAGATTTAA ATATGTTC GAAG ATATTCCCGTTCCGGACAATGAAGTTGGAAGGGAATTACAGGAAAAATGGAATTCAAGGGGGGAATCGGATAATATGATCGTCACTA                                                                                         ]
[+] EMBL CD137353             [                                                         TCTA TAGTAGATGATGAAGAATTTGCAACCGGAGATTCTGGGGCTTCAAAAACACTACCGAAACA GTGTAGTGCTCTGA GAAAAGGCGGACATGTCGTTATGAAAGATCGTCCTTGTAAAA TCGTGGAAATGTCTACGTCAAAGACCGGGAAAC ATGGCTCTGCTAAAGTGCACTT AGTTGGGATCGATATATTC ACTGGTAAGAAATATGAAGAGAATCGCACATCATCAC ACACTATGGATGTGCCTGTCATCACAAGTAAAGATTACCAACTGGTGGATATCAAAGACGGGTTTTTGTCACTAATGGGCGAAGATTTAA ATATGTTC GAAG ATATTCCCGTTCCGGACAATGAAGTTGGAAGGGAATTACAGGAAAAATGGAATTCAAGGGGGGAATCGGATAATATGATCGTCACTA                                                                                         ]
[+] EMBL CD137330             [                                                         TCTA TAGTAGATGATGAAGAATTTGCAACCGGAGATTCTGGGGCTTCAAAAACACTACCGAAACA GTGTAGTGCTCTGA GAAAAGGCGGACATGTCGTTATGAAAGATCGTCCTTGTAAAA TCGTGGAAATGTCTACGTCAAAGACCGGGAAAC ATGGCTCTGCTAAAGTGCACTT AGTTGGGATCGATATATTC ACTGGTAAGAAATATGAAGAGAATCGCACATCATCAC ACACTATGGATGTGCCTGTCATCACAAGTAAAGATTACCAACTGGTGGATATCAAAGACGGGTTTTTGTCACTAATGGGCGAAGATTTAA ATATGTTC GAAG ATATTCCCGTTCCGGACAATGAAGTTGGAAGGGAATTACAGGAAAAATGGAATTCAAGGGGGGAATCGGATAATATGATCGTCACTA                                                                                         ]
[+] EMBL CD137394             [                                                         TCTA TAGTAGATGATGAAGAATTTGCAACCGGAGATTCTGGGGCTTCAAAAACACTACCGAAACA GTGTAGTGCTCTGA GAAAAGGCGGACATGTCGTTATGAAAGATCGTCCTTGTAAAA TCGTGGAAATGTCTACGTCAAAGACCGGGAAAC ATGGCTCTGCTAAAGTGCACTT AGTTGGGATCGATATATTC ACTGGTAAGAAATATGAAGAGAATCGCACATCATCAC ACACTATGGATGTGCCTGTCATCACAAGTAAAGATTACCAACTGGTGGATATCAAAGACGGGTTTTTGTCACTAATGGGCGAAGATTTAA ATATGTTC GAAG ATATTCCCGTTCCGGACAATGAAGTTGGAAGGGAATTACAGGAAAAATGGAATTCAAGGGGGGAATCGGATAATATGATCGTCACTA                                                                                         ]
[+] EMBL CD137484             [                                                         TCTA TAGTAGATGATGAAGAATTTGCAACCGGAGATTCTGGGGCTTCAAAAACACTACCGAAACA GTGTAGTGCTCTGA GAAAAGGCGGACATGTCGTTATGAAAGATCGTCCTTGTAAAA TCGTGGAAATGTCTACGTCAAAGACCGGGAAAC ATGGCTCTGCTAAAGTGCACTT AGTTGGGATCGATATATTC ACTGGTAAGAAATATGAAGAGAATCGCACATCATCAC ACACTATGGATGTGCCTGTCATCACAAGTAAAGATTACCAACTGGTGGATATCAAAGACGGGTTTTTGTCACTAATGGGCGAAGATTTAA ATATGTTC GAAG ATATTCCCGTTCCGGACAATGAAGTTGGAAGGGAATTACAGGAAAAATGGAATTCAAGGGGGGAATCGGATAATATGATCGTCACTATATTATCTGCTATGGACGANAGGCAAGCACTAAAAGTTCGTACTTCTTCAAAAACACTACCGAAACAGTGTAGTGCTCTGAGAAAGGCG]
[+] EMBL CD137439             [                                                         TCTA TAGTAGATGATGAAGAATTTGCAACCGGAGATTCTGGGGCTTCAAAAACACTACCGAAACA GTGTAGTGCTCTGA GAAAAGGCGGACATGTCGTTATGAAAGATCGTCCTTGTAAAA TCGTGGAAATGTCTACGTCAAAGACCGGGAAAC ATGGCTCTGCTAAAGTGCACTT AGTTGGGATCGATATATTC ACTGGTAAGAAATATGAAGAGAATCGCACATCATCAC ACACTATGGATGTGCCTGTCATCACAAGTAAAGATTACCAACTGGTGGATATCAAAGACGGGTTTTTGTCACTAATGGGCGAAGATTTAA ATATGTTC GAAG ATATTCCCGTTCCGGACAATGAAGTTGGAAGGGAATTACAGGAAAAATGGAATTCAAGGGGGGAATCGGATAATATGATCGTCACTA                                                                                         ]
[+] EMBL CD171460             [                                                          CTACTAGTAGATGATGAAGAATTTGCAACCGGAGATTCTGGGGCTTCAAAAACACTACCGAAACA GTGTAGTGCTCTGA GAAAAGGCGGACATGTCGTTATGAAAGATCGTCCTTGTAAAA TCGTGGAAATGTCTACGTCAAAGACCGGGAAACAATGGCTCTGCTAAAGTGCACTTAAGTTGGGATCGATATATTCAACTGGTAA AAAAATGAAGAGAATCGCACAATATCACAACACTATGGATGTGCCTGTCATCACAAGTAAAGAATACCAACTGGTGGATATAAAAGAACGGTTTTTGTCACTAATGGGCAAAGAATTAA ATATG TC  AAGAATA TCCNGTncn                                                                                                                                                                   ]
[+] EMBL CD171208             [                                                           TA TAGTAGATGATGAAGAATTTGCAACCGGAGATTCTGGGGCTTCAAAAACACTACCGAAACA GTGTAGTGCTCTGA GAAAAGGCGGACATGTCGTTATGAAAGATCGTCCTTGTAAAA TCGTGGAAATGTCTACGTCAAAGACCGGGAAAC ATGGCTCTGCTAAAGTGCACTT AGTTGGGATCGATATATTC ACTGGTAAGAAATATGAAGAGAATCGCACATCATCAC ACACTATGGATGTGCCTGTCATCACAAGTAAAGATTACCAACTGGTGGATATCAAAGACGGGTTTTTGTCACTAATGGGCGAAGATTTAA ATATGTTC GAAG ATATTCCnngtncng                                                                                                                                                                 ]
[+] EMBL CD171431             [                                                           TA TAGTAGATGATGAAGAATTTGCAACCGGAGATTCTGGGGCTTCAAAAACACTACCGAAACA GTGTAGTGCTCTGA GAAAAGGCGGACATGTCGTTATGAAAGATCGTCCTTGTAAAA TCGTGGAAATGTCTACGTCAAAGACCGGGAAAC ATGGCTCTGCTAAAGTGCTCTT AGTTGGGATCGATATATTC ACTGGTAAGAAATATGAAGAGAATCGCACATCATCAC ACACTATGGATGTGCCTGTCATCACAAGTAAAGATTACCAACTGGTGGATATCAAAGACGGGTTTTTGTCACTAATGGGCGAAGATTT A ATATGTTC G AG ATATTCCNGTTCC                                                                                                                                                                   ]
[+] EMBL CD133737             [                                                                                           GATTCTGGGGCTTCAAAAACACTACCGAAACA GTGTAGTGCTCTGA GAAAAGGCGGACATGTCGTTATGAAAGATCGTCCTTGTAAAA TCGTGGAAATGTCTACGTCAAAGACCGGGAAAC ATGGCTCTGCTAAAGTGCACTT AGTTGGGATCGATATATTC ACTGGTAAGAAATATGAAGAGAATCGCACATCATCAC ACACTATGGATGTGCCTGTCATCACAAGTAAAGATTACCAACTGGTGGATATCAAAGACGGGTTTTTGTCACTAATGGGCGAAGATTTAA ATATGTTC GAAG ATATTCCCGTTCCGGACAATGAAGTTGGAAGG                                                                                                                                                ]
[+] EMBL CD133991             [                                                                                                  GGGCTTCAAAAACACTACCGAAACA GTGTAGTGCTCTGA GAAAAGGCGGACATGTCGTTATGAAAGATCGTCCTTGTAAAA TCGTGGAAATGTCTACGTCAAAGACCGGGAAAC ATGGCTCTGCTAAAGTGCACTT AGTTGGGATCGATATATTC ACTGGTAAGAAATATGAAGAGAATCGCACATCATCAC ACACTATGGATGTGCCTGTCATCACAAGTAAAGATTACCAACTGGTGGATATCAAAGACGGGTTTTTGTCACTAATGGGCGAAGATTTAA ATATGTTC GAAG ATATTCCCGTTCCGGACAATGAAGTTGGAAGGGAATTACAGGAAAAATGGA                                                                                                                             ]
[-] EMBL CD060634             [                                                                                                           agACACTACCGAAACA GTGTAGTGCTCTGA GAAAAGGCGTACATGTCGTTATGAAAGATCGTCCTTGTAAAA TCGTGGAAATGTCTACGTCAAAGACCGGGAAAC ATGGCTCTGCTAAAGTGCACTT AGTTGGGATCGATATATTC ACTGGTAAGAAATATGAAGAGAATCGCACATCATCAC ACACTATGGATGTGCCTGTCATCACAAGTAAAGATTACCAACTGGTGGATATCAAAGACGGGTTTTGGTCACTAATGGGCGAAGATTTAA ATATGTTC GAAG ATATTCCCGTTCCGGAC ATGAAGTTGGAAGGG                                                                                                                                               ]
[+] EMBL CD131340             [                                                                                                                                                  CGGACATGTCGTTATGAAAGATCGTCCTTGTAAAG TCGTGGAAATGTCTACGTCAAAGACCGGGAAAC ATGGCTCTGCTAAAGTGCACTT AGTTGGGATCGATATATTC ACTGGTAAGAAATATGAAGAGAATCGCACATCATCAC ACACTATGGATGTGCCTGTCATCACAAGTAAAGATTACCAACTGGTGGATATCAAAGACGGGTTTTTGTCACTAATGGGCGAAGATTTAA ATATGTTC GAAG ATATTCCCGTTCCGGACAATGAAGTTGGAAGG                                                                                                                                                ]
[+] EMBL CD180493             [                                                                                                                                                   GGACATGTCGTTATGAAAGATCGTCCTTGTAAAACTCGTGGACGTGTCTACGTCAAAGACCGGGAAAC ATGGCTCTGCTAAAGTGCACTT AGTTGGGATCGATATATTC ACTGGTAAGAAATATGAAGAGAATCGCACATCATCAC ACACTATGGATGTGCCTGTCATCACAAGTACAGATTACCAACTGGTGGATATCAAAGACGGGTTTCTGTCACTAATGGGCGAAGATTTAAGATATGTTCTGAAG ATATTCCCGTTCCGGACAATGAAGTTGGAAGGGAATTACAGGAACAATG                                                                                                                               ]
[+] EMBL CD065706             [                                                                                                                                                    GACAT TCGTTATGAAAGATCGTCCTTGTAAAA TCGTGGAAATGTCTACGTCAAAGACCGGGAAAC ATGGCTCTGCTAAAGTGCACTT AGTTGGGATCGATATATTC ACTGGTAAGAAATATGAAGAGAATCGCACATCATCAC ACACTATGGATGTGCCTGTCATCACAAGTAAAGATTACCAACTGGTGGATATCAAAGACGGGTTTTTGTCACTAATGGGCGAAGATTTAA ATATGTTC GAAG ATATTCCCGTTCCGGACAATGAAGTTGGAAGGGAATTACAGGAAAAATGGAATTCAAGGGGGGAATCGGATAATATGATCGTCACTATATTATCTGCTATGGAC GAAAG                                                                  ]
[+] EMBL CD159249             [                                                                                                                                                                       TCGTCCTTGTAAAA TCGTGGAAATGTCTACGTCAAAGACCGGGAAAC ATGGCTCTGCTAAAGTGCACTT AGTTGGGATCGATATATTC ACTGGTAAGAAATATGAAGAGAATCGCACATCATCAC ACACTATGGATGTGCCTGTCATCACAAGTAAAGATTACCAACTGGTGGATATCAAAGACGGGTTTTTGTCACTAATGGGCGAAGATTTAA ATATGTTC GAAG ATATTCCCGTTCCGGACAATGAAGTTGGAAGGGAATTACAGGAAAAATGGAATTCAAGGGGGGAATCGGATAATATGATCGTCACTATATTATCTGCTAT                                                                            ]
[+] EMBL CD199950             [                                                                                                                                                                                      TCGTGGAAATGTCTACGTCAAAGACCGGGAAAC ATGGCTCTGCTAAAGTGCACTT AGTTGGGATCGATATATTC ACTGGTAAGAAATATGAAGAGAATCGCACATCATCAC ACACTATGGATGTGCCTGTCATCACAAGTAAAGATTACCAACTGGT                                                                                                                                                                                                                                           ]
[-] EMBL BG932305             [                                                                                                                                                                                          GGAAATGTCTACGTCAAAGACCGGGAAAC ATGGCTCTGCTAAAGTGCACTT AGTTGGGATCGATATATTC ACTGGTAAGAAATATGAAGAGAATCGCACATCATCAC ACACTATGGATGTGCCTGTCATCACAAGTAAAGATTACCAACTGGTGGATATCAAAGACGGGTTTTTGTCACTAATGGGCGAAGATTTAA ATATGTTC GAAG ATATTCCCGTTCCGGACAATGAAGTTGGAAGGGAATTACA                                                                                                                                        ]
[+] EMBL CD146078             [                                                                                                                                                                                                                 GGAAAC ATGGCTCTGCTAAAGTGCACTT AGTTGGGATCGATATATTC ACTGGTAAGAAATATGAAGAGAATCGCACATCATCAC ACACTATGGATGTGCCTGTCATCACAAGTAAAGATTACCAACTGGTGGATATCAAAGACGGGTTTTTGTCACTAATGGGCGAAGATTTAA ATATGTTC GAAG ATATTCCCGTTCCGGACAATGAAGTTGGAAGGGAATTACAGGAAAAATGGAATTCAAGGGGGGAATCGGATAATATGATCGTCACTATATTATCTGCTATGGA                                                                         ]
[+] EMBL CD146076             [                                                                                                                                                                                                                                                    GGATCGATATATTC ACTGGTAAGAAATATGAAGAGAATCGCACATCATCAC ACACTATGGATGTGCCTGTCATCACAAGTAAAGATTACCAACTGGTGGATATCAAAGACGGGTTTTTGTCACTAATGGGCGAAGATTTAA ATATGTTC GAAG ATATTCCCGTTCCGGACAATGAAGTTGGAAGGGAATTACAGGAAAAATGGAATTCAAGGGGGGAATCGGATAATATGATCGTCACTATATTATCTGCTATGGA                                                                         ]




>consensus_11291#2
CGCGCATCACCTCGTATAAGTCGTGGTGTTAGCTGTGCGTACCCCATATATAGTATGTCT
ATAGTAGATGATGAAGAATTTGCAACCGGAGATTCTGGGGCTTCAAAAACACTACCGAAA
CAGTGTAGTGCTCTGAGAAAAGGCGGACATGTCGTTATGAAAGATCGTCCTTGTAAAATC
GTGGAAATGTCTACGTCAAAGACCGGGAAACATGGCTCTGCTAAAGTGCACTTAGTTGGG
ATCGATATATTCACTGGTAAGAAATATGAAGAGAATCGCACATCATCACACACTATGGAT
GTGCCTGTCATCACAAGTAAAGATTACCAACTGGTGGATATCAAAGACGGGTTTTTGTCA
CTAATGGGCGAAGATTTAAATATGTTCGAAGATATTCCCGTTCCGGACAATGAAGTTGGA
AGGGAATTACAGGAAAAATGGAATTCAAGGGGGGAATCGGATAATATGATCGTCACTATA
TTATCTGCTATGGACAAAAGCAACACTAAAATTCTACTCCTCNAAAANTAACGAATCAGT
GTAGTGCTCTGAGAAAGGCG

consensusID : consensus_11291#3
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 1
consensus length = 424
fasta sequence

                              [TGGTGTTAGCTGTGCGTACCCCATATATAGTATGTCTATAGTAGATGATGAAGAATTTGCAACCGGAGATTCTGGGGCTTCAAAAACACTACCGAAACAGTGTAGTGCTCTGAGAAAAGGCGGACATGTCGTTATGAAAGATCGTCCTTGTAAAATCGTGGAAATGTCTACGTCAAAGACCGGGAAACATGGCTCTGCTAAAGTGCACTTAGTTGGGATCGATATATTCACTGGTAAGAAATATGAAGAGAATCGCACATCATCACACACTATGGATGTGCCTGTCATCACAAGTAAAGATTACCAACTGGAGATGGAGTATCTGTTTGCAAGCCTGAAAGTGTAGGTAGAGAAGATGCCACATCATCACACACCATTGATCCTACATGCGGTGGAGGCTGTAGGACACGAAATGCGGAGTGTG]

[-] EMBL CD180928             [TGGTGTTAGCTGTGCGTACCCCATATATAGTATGTCTATAGTAGATGATGAAGAATTTGCAACCGGAGATTCTGGGGCTTCAAAAACACTACCGAAACAGTGTAGTGCTCTGAGAAAAGGCGGACATGTCGTTATGAAAGATCGTCCTTGTAAAATCGTGGAAATGTCTACGTCAAAGACCGGGAAACATGGCTCTGCTAAAGTGCACTTAGTTGGGATCGATATATTCACTGGTAAGAAATATGAAGAGAATCGCACATCATCACACACTATGGATGTGCCTGTCATCACAAGTAAAGATTACCAACTGGAGATGGAGTATCTGTTTGCAAGCCTGAAAGTGTAGGTAGAGAAGATGCCACATCATCACACACCATTGATCCTACATGCGGTGGAGGCTGTAGGACACGAAATGCGGAGTGTG]




>consensus_11291#3
TGGTGTTAGCTGTGCGTACCCCATATATAGTATGTCTATAGTAGATGATGAAGAATTTGC
AACCGGAGATTCTGGGGCTTCAAAAACACTACCGAAACAGTGTAGTGCTCTGAGAAAAGG
CGGACATGTCGTTATGAAAGATCGTCCTTGTAAAATCGTGGAAATGTCTACGTCAAAGAC
CGGGAAACATGGCTCTGCTAAAGTGCACTTAGTTGGGATCGATATATTCACTGGTAAGAA
ATATGAAGAGAATCGCACATCATCACACACTATGGATGTGCCTGTCATCACAAGTAAAGA
TTACCAACTGGAGATGGAGTATCTGTTTGCAAGCCTGAAAGTGTAGGTAGAGAAGATGCC
ACATCATCACACACCATTGATCCTACATGCGGTGGAGGCTGTAGGACACGAAATGCGGAG
TGTG

consensusID : consensus_11291#4
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 5
consensus length = 386
fasta sequence

                              [GATATATTCACTGGTAAGAAATATGAAGAGAATCGCACATCATCACACACTATGGATGTGCCTGTCATCACAAGTAAAGATTACCAACTGGTGGATATCAAAGACGGGTTTTTGTCACTAATGGGCGAAGATTTAAATATGTTCGAAGATATTCCCGTTCCGGACAATGAAGTTGGAAGGGAATTACAGGAAAAATGGAATTCAAGGGGGGAATCGGATAATATGATCGTCACTATATTATCTGCTATGGACGAAAGGCAAGCACTAAAAGTTCGTACTTCTTCAGAAAAGTAAACAGAATCCAATTTGAATAAAATTTCACACGACACTAAGTAAAAATTTTTATTATGTTTGAGAAAAATATATTTCTAGTGTTATATGAAAAA]

[+] EMBL CD137975             [GATATATTCACTGGTAAGAAATATGAAGAGAATCGCACATCATCACACACTATGGATGTGCCTGTCATCACAAGTAAAGATTACCAACTGGTGGATATCAAAGACGGGTTTTTGTCACTAATGGGCGAAGATTTAAATATGTTCGAAGATATTCCCGTTCCGGACAATGAAGTTGGAAGGGAATTACAGGAAAAATGGAATTCAAGGGGGGAATCGGATAATATGATCGTCACTATATTATCTGCTATGGACGAAAGGCAAGCACTAAAAGTTCGTACTTCTTCAGAAAAGTAAACAGAATCCAATTTGAATAAAATTT                                                                   ]
[+] EMBL CD148621             [   ATATTCACTGGTAAGAAATATGAAGAGAATCGCACATCATCACACACTATGGATGTGCCTGTCATCACAAGTAAAGATTACCAACTGGTGGATATCAAAGACGGGTTTTTGTCACTAATGGGCGAAGATTTAAATATGTTCGAAGATATTCCCGTTCCGGACAATGAAGTTGGAAGGGAATTACAGGAAAAATGGAATTCAAGGGGGGAATCGGATAATATGATCGTCACTATATT                                                                                                                                                   ]
[+] EMBL CD146085             [                    ATATGAAGAGAATCGCACATCATCACACACTATGGATGTGCCTGTCATCACAAGTAAAGATTACCAACTGGTGGATATCAAAGACGGGTTTTTGTCACTAATGGGCGAAGATTTAAATATGTTCGAAGATATTCCCGTTCCGGACAATGAAGTTGGAAGGGAATTACAGGAAAAATGGAATTCAAGGGGGGAATCGGATAATATGATCGTCACTATATTATCTGCTATGGA                                                                                                                                       ]
[+] EMBL CD137332             [                                                ACTATGGATGTGCCTGTCATCACAAGTAAAGATTACCAACTGGTGGATATCAAAGACGGGTTTTTGTCACTAATGGGCGAAGATTTAAATATGTTCGAAGATATTCCCGTTCCGGACAATGAAGTTGGAAGGGAATTACAGGAAAAATGGAATTCAAGGGGGGAATCGGATAATATGATCGTCACTA                                                                                                                                                       ]
[+] EMBL SM050                [                                                                                                                                                                                                                                                           CGAAAGGCAAGCACTAAAAGTTCGTACTTCTTCAGAAAAGTAAACAGAATCCAATTTGAATAAAATTTCACACGACACTAAGTAAAAATTTTTATTATGTTTGAGAAAAATATATTTCTAGTGTTATATGAAAAA]




>consensus_11291#4
GATATATTCACTGGTAAGAAATATGAAGAGAATCGCACATCATCACACACTATGGATGTG
CCTGTCATCACAAGTAAAGATTACCAACTGGTGGATATCAAAGACGGGTTTTTGTCACTA
ATGGGCGAAGATTTAAATATGTTCGAAGATATTCCCGTTCCGGACAATGAAGTTGGAAGG
GAATTACAGGAAAAATGGAATTCAAGGGGGGAATCGGATAATATGATCGTCACTATATTA
TCTGCTATGGACGAAAGGCAAGCACTAAAAGTTCGTACTTCTTCAGAAAAGTAAACAGAA
TCCAATTTGAATAAAATTTCACACGACACTAAGTAAAAATTTTTATTATGTTTGAGAAAA
ATATATTTCTAGTGTTATATGAAAAA

consensus multiple alignement with clustalw

CLUSTAL W (1.82) multiple sequence alignment


consensus_11291#2      ----------------------CGCGCATCACCTCGTATAAGTCGTGGTGTTAGCTGTGC 38
consensus_11291#4      ------------------------------------------------------------
consensus_11291#3      ---------------------------------------------TGGTGTTAGCTGTGC 15
consensus_11291#0      ATGTCATGAAAATGCGAAATGCAATGAATACGGTAAATGTCAGTGTCTTGATGGTTATTC 60
consensus_11291#1      ------------------------------------------------------------
                                                                                   

consensus_11291#2      GTACCCCATATATAGTATGTCTATAGTAGATGATGAAGAATTTGCAACCGGAGATTCTGG 98
consensus_11291#4      ------------------------------------------------------------
consensus_11291#3      GTACCCCATATATAGTATGTCTATAGTAGATGATGAAGAATTTGCAACCGGAGATTCTGG 75
consensus_11291#0      AGGAGATGGATATTATGAATGCCAGAAAAGTTCACAAGAGTTATGCGCTGGTGTTCAGTG 120
consensus_11291#1      --GAGACCCAGTTGTCAAATGTTATGAAGA---AAGAGAGTTATGCGCTGGTGTTCAGTG 55
                                                                                   

consensus_11291#2      GGCTTCAAAAACACTACCGAAACAGTGTAGTGCTCTGAGAAAAGGCGGACATGTCGTTAT 158
consensus_11291#4      ------------------------------------------------------------
consensus_11291#3      GGCTTCAAAAACACTACCGAAACAGTGTAGTGCTCTGAGAAAAGGCGGACATGTCGTTAT 135
consensus_11291#0      TCATCGTTTCGGTCAATGTTATGAAAATCGATGCTACTGCAGTCATGGATATGTCGGGGA 180
consensus_11291#1      TCATCGTTTCGGTCAATGTTATGAAAATCGATGCTACTGCAGTCATGGATATGTCGGGGA 115
                                                                                   

consensus_11291#2      GAAAGATCGTCCTTGTAAAATCGTGGAAATGTCTACGTCAAAGACCGGGAAACATGGCTC 218
consensus_11291#4      ------------------------------------------------------------
consensus_11291#3      GAAAGATCGTCCTTGTAAAATCGTGGAAATGTCTACGTCAAAGACCGGGAAACATGGCTC 195
consensus_11291#0      TGGGGTTAACTTTTGTGACGCACGTGCAAACGATCCATGTGATGGCGTCCGTTGTGCTGC 240
consensus_11291#1      TGGGGTTAACTTTTGTGACGCACGTGCAAACGATCCATGTGATGGCGTCCGTTGTGCTGC 175
                                                                                   

consensus_11291#2      TGCTAAAGTGCACTTAGTTGGGATCGATATATTCA---CTGGTAAGAAATATGAAGAGAA 275
consensus_11291#4      -------------------------GATATATTCA---CTGGTAAGAAATATGAAGAGAA 32
consensus_11291#3      TGCTAAAGTGCACTTAGTTGGGATCGATATATTCA---CTGGTAAGAAATATGAAGAGAA 252
consensus_11291#0      TAATGGACGTTGCCAGGATGGTCGATGTGTATGTGATCCTGGTTATACAGGAGATGGTTA 300
consensus_11291#1      TAATGGACGTTGCCAGGATGGTCGATGTGTATGTGATCCTGGTTATACAGGAGATGGTTA 235
                                                  * ***      ***** * * *   ** *   *

consensus_11291#2      TCGCACATCATCACACACTATGGATGTGCCTGT-CATCACAA-GTA-AAGATTACCAACT 332
consensus_11291#4      TCGCACATCATCACACACTATGGATGTGCCTGT-CATCACAA-GTA-AAGATTACCAACT 89
consensus_11291#3      TCGCACATCATCACACACTATGGATGTGCCTGT-CATCACAA-GTA-AAGATTACCAACT 309
consensus_11291#0      CAATGAATGTCGAGAAGCTGAGGGTGTGAATTTATGTGGTAATGTACAATGTCATCAATA 360
consensus_11291#1      CAATGAATGTCGAGAAGCTGAGGGTGTGAATTTATGTGGTAATGTACAATGTCATCAATA 295
                             **    * *  **  ** ****  * *   *   ** *** **  * * ***  

consensus_11291#2      GGTGGATATCAAAGACGGGTTTTTGTCACTAATGGGCGAAGATTTAAATATGTTCGAAGA 392
consensus_11291#4      GGTGGATATCAAAGACGGGTTTTTGTCACTAATGGGCGAAGATTTAAATATGTTCGAAGA 149
consensus_11291#3      GG---AGATGGAGTATCTGTTTGCAAGCCTGA-AAGTGTAGGT--AGAGAAGATGCCACA 363
consensus_11291#0      TGCT-ACATGTGATAGAGGACAATGTCGTTGT--GTTACTGGTT--ATGATGGTGATGGT 415
consensus_11291#1      TGCT-ACATGTGATAGAGGACAATGTCGTTGT--GTTACTGGTT--ATGATGGTGATGGT 350
                        *   * **     *   *          *          * *      * * *      

consensus_11291#2      TATTCCCGTT-CCGGACAATGAAGTTG-GAAGGGAATTACAGGAAAAATGGAATTCAAGG 450
consensus_11291#4      TATTCCCGTT-CCGGACAATGAAGTTG-GAAGGGAATTACAGGAAAAATGGAATTCAAGG 207
consensus_11291#3      TCATCACACA-CCATTGATCCTACATGCGGTGGAGGCTGTAGGACA--CGAAATGCGGAG 420
consensus_11291#0      TATTCAGATTGTCGACCAGTTACAGAGGATAAGTGCTCACGAGTGAGATGTCATCCAGAT 475
consensus_11291#1      TATTCAGATTGTCGACCAGTTACAGAGGATAAGTGCTCACGAGTGAGATGTCATCCAGAT 410
                       *  **       *    *        *     *         *  *   *  ** *    

consensus_11291#2      GGGGAATCGGATAATA-TGATCGTCACTATATTATCTGCTATGGACAAAAG--CAACACT 507
consensus_11291#4      GGGGAATCGGATAATA-TGATCGTCACTATATTATCTGCTATGGACGAAAGGCAAGCACT 266
consensus_11291#3      TGTG-------------------------------------------------------- 424
consensus_11291#0      GCTCAATGTACTGATGGTTATTGCCGCTGTTTGGATGGATATGAAGGAGAT--GGCTACC 533
consensus_11291#1      GCTCAATGTACTGATGGTTATTGTTTCTGTCCCTCTGGTTTCGAAGGAGAC--GGATATT 468
                                                                                   

consensus_11291#2      AAAATTCTACTCCTCNAAAANTAACGAATCAGTGTAGTGCTCTGAGAAAGGCG------- 560
consensus_11291#4      AAAAGTTCGTACTTCTTCAGAAAAGTAAACAGAATCCAATTTGAATAAAATTTCACACGA 326
consensus_11291#3      ------------------------------------------------------------
consensus_11291#0      AGATGTGTAATATAATACCTGGAGCAACTTCAGCAGATTGTGGTAATTGCAATGGTATAC 593
consensus_11291#1      ACGAGTGTAA------AC---GAATCACTCAAGATCGCTGTGCGAAT---------GTTC 510
                                                                                   

consensus_11291#2      ------------------------------------------------------------
consensus_11291#4      CACTAAGTAAAAATTTTTATTATGTTTGAGAAAAATATATTTCTAGTGTTATATGAAAAA 386
consensus_11291#3      ------------------------------------------------------------
consensus_11291#0      CTTTTAAAGAACTAGCTCAGTGTGTTGGTGGACGATGTATTTGTGCTCGTGGATTTATTG 653
consensus_11291#1      GGTGTCATGAAAATGCTAAATGTGACGACGGGTATTGTCGTTGTA---AAGAAGATTTTG 567
                                                                                   

consensus_11291#2      ------------------------------------------------------------
consensus_11291#4      ------------------------------------------------------------
consensus_11291#3      ------------------------------------------------------------
consensus_11291#0      AAGTCCAGCCAGGTGTCTGTATGGAATGTGTGCNAGATAATTGTCATCAGGATGCTGTCT 713
consensus_11291#1      AGGGC------GATGGCTACAGTGAGTGTAGACGTAAAAGTGAAGATCCATGTGCC-CGT 620
                                                                                   

consensus_11291#2      ------------------------------------------------------------
consensus_11291#4      ------------------------------------------------------------
consensus_11291#3      ------------------------------------------------------------
consensus_11291#0      GTCGACCGGNATGAAAGATTTAATGGCGCTTATTCGTGT---CATTGTAAAGCTGGTTTC 770
consensus_11291#1      ATTCGCTGTCATCCACAAGCTCAGTGTGAGTATGGGTATTGCCGCTGTAAAAATGGTTAT 680
                                                                                   

consensus_11291#2      ------------------------------------------------------------
consensus_11291#4      ------------------------------------------------------------
consensus_11291#3      ------------------------------------------------------------
consensus_11291#0      ACTGGAGATGGAGTATCTGTTTGCAAGCCTGAAAGTGTAGGTAGAGAAG-ATGCCACATC 829
consensus_11291#1      AAAGGTGATGG-----CTATT-GGAATTGTCAGGCTATACAAAGTGATCTATGTCGGGCA 734
                                                                                   

consensus_11291#2      ------------------------------------------------------------
consensus_11291#4      ------------------------------------------------------------
consensus_11291#3      ------------------------------------------------------------
consensus_11291#0      ATCACACACCATTGATCCTACATGCGGTGGAGGCTGTAGGACACGAAATGCGGAGTGTGA 889
consensus_11291#1      GAACAATGCCATCAGTTC------------------------------------------ 752
                                                                                   

consensus_11291#2      ------------------------------------------------------------
consensus_11291#4      ------------------------------------------------------------
consensus_11291#3      ------------------------------------------------------------
consensus_11291#0      TCGATATACTGGGACGTGTAAATGTCGATCAGGTTATGATGGAGATGGAGAGAGAGGTTG 949
consensus_11291#1      ------------------------------------------------------------
                                                                                   

consensus_11291#2      ------------------------------------------------------------
consensus_11291#4      ------------------------------------------------------------
consensus_11291#3      ------------------------------------------------------------
consensus_11291#0      CTACTGGAATTGTAAGCTGTGTCATTCGAGTGCAATTTGTGATCGTGAAAACGAAAGATG 1009
consensus_11291#1      ------------------------------------------------------------
                                                                                   

consensus_11291#2      ------------------------------------------------------------
consensus_11291#4      ------------------------------------------------------------
consensus_11291#3      ------------------------------------------------------------
consensus_11291#0      CATTTGTCCATCTGGTTATCGTGGAGATGGACAAACATTTTGTGAACGAATTCCAGTTAG 1069
consensus_11291#1      ------------------------------------------------------------
                                                                                   

consensus_11291#2      ------------------------------------------------------------
consensus_11291#4      ------------------------------------------------------------
consensus_11291#3      ------------------------------------------------------------
consensus_11291#0      ACAAGATTCTATTAAAGTTCGAATAATGGGAGAGGGAGAAGTAATGCATATTACAGATAT 1129
consensus_11291#1      ------------------------------------------------------------
                                                                                   

consensus_11291#2      ------------------------------------------------------------
consensus_11291#4      ------------------------------------------------------------
consensus_11291#3      ------------------------------------------------------------
consensus_11291#0      ATCTCATCCACTTGAATTAAGATGTTTCGTGACTGGGAGCGATCAGTCATATTCTGGCCA 1189
consensus_11291#1      ------------------------------------------------------------
                                                                                   

consensus_11291#2      -------------
consensus_11291#4      -------------
consensus_11291#3      -------------
consensus_11291#0      GTGGATTAAACCA 1202
consensus_11291#1      -------------