cluster # 11297

These datas are free for academic use only, please contact me for any other use.

Schistosoma mansoni
cluster # 11297 cluster # 11297 Sequences # 49 consensus # 3

see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :

consensus_11297#0 length = 2369 sequences # 30

consensus_11297#1 length = 1309 sequences # 18
consensus_11297#2 length = 289 sequences # 1

consensusID : consensus_11297#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 30
consensus length = 2369
fasta sequence

                              [GCTCATCTCGGTCATCCCGATAAATATCTCTTTCAAAGTCAAAAATGGTTATTGGCTGTTGCACACTAAATAATATTTCGGAAGATGCCAAAACGCGAAGCGATGCAAATAAACAGATTGAGAAATTAATTGAAAAGGAGAAAAAGAATTTTAAGTCTACACATAGACTGCTCCTTCTGGGTGCTGGAGAGTCTGGGAAGTCGACCATTGTTAAACAAATGAGGATATTGCACATAGATGGCTTTTCAGAACGAGAAAAAAAGGAAAAGATTGATGCAATCCGAAAAAACCTCCGTGACGCTATTTGTTCGATAGCTGGCGCTATGGGTTCTTTGAAACCACCAGTGAAGCTTGAACTCAGTGAAAACAGAAAGCTAAGGGATTATATACTGGAAACTGCATCTAAACCTGACTTCGACTATCCGCCGGAGTTTTTCACATATTGCGCCAAATTATGGAAGGATGGAGGTATACAGGAAACATTCGAAAGATCAAATGAGTATCAACTAATCGACTGTGCAAAGTATTTCCTTGATAAGGCTTTAGAGGTCGGCGCTCCAAACTACATCCCATCTGAACAGGATATTCTGCGCTGTCGTGTACTAACTTCCGGAATATTTGAAACCAAGTTCAGCGTGGATAAAGTTAATTTCCATATGTTTGACGTCGGCGGGCAGAGGGAAGAGCGCCGAAAGTGGATACAATGCTTTAACGATGTCACTGCCATCATTTTTGTCGCTGCCTGTTCTTCGTACAACATGGTCTTACGAGAAGATCCTAGCCAAAACCGTGTAAAGGAGTCTTTAGAACTTCTTGCTTCCATATGGAACAACAGGTGGTTGCGAAACATATCTGTGATTCTCTTTCTTAACAAGCAAGATTTACTTACGGAGAAGGTTTTAGCTGGCAAGTCCAAGATTGAAGTTTATTTCCCGCATTATGCTACTTACCAAGCTCCAGCTGATACACTAGCAGAGTATCGTCATGAAAACTCAGAAGTTGTACGTGCCCGATTTTTCTTCCGTGATGAATTTC-TTAAAGTAACATCAAATAACAATGGTGGACGTCATTATTGTTATCCTCACTTAACGTGTGCAGTTGATACGGAAAATATCCGACGCGTATTCAATGATTGTCGTGATATCATTCAGCGAATGCACCTGCGGCAGTATGAATTACTCTAGGAACACTTTTTGTAGGCCCCAAATCTGATTTTTGTTCTTCCATAGTATTTTTTGAGGGTATACTGTTTTAAACCCCCAACGCTTGTGAATACCATCTCATAATTAATTATGACTAATGTTATCCAGTGCATCGAATCTAGTTGAATATTTTACTCCCTTTATGAACCTACCTATCTATGCTAAATTGCATTTGAAGACCAAGCACTGCAAAACAGACTCACAGGTTTGAAGATTTAGATGTCTTTTTAAAAATGTCAAACGGGATGCAAACAATATCACGTTTTCAAAATCATATTTGTAATACACCATCTCAGATATTCGTATATTTATCTGAATCTCTAACTTATCGATTAAATTTTAATTTTTCAATCCTTTTATTTTAATAATGTCACCATTACTGCTTTATTTCTTTTGGTATTCTTAAGTTTTGAAAGCATACTCTTCTGCCGAATTCACTGTTGATCAGAATTTTTTTAACTGCCTCTGTTTGGATGTCTATACGCTCGTTATTCCTTCCACCTCTGTCTTAGTTTTATCACCGTAATATGCGATTGTAATGTATTTCGATCGGTAAATATGCTCGTGTTTGCAAATTTGTTAAGTTGACGTGCCAATGTGT-TAACTTCCCTTGGACGCGTACACAATAATATTTCATAATGAGTAGTATCCAGTTTCACATGTTTGATTAAGAAATATCGTAAGCAAGTTATATGCAAACATATGACTTGATCATATATTTCGAATTGTAAACTTGTTTTGTTTTCAGTGAATAACTCCTGTCTTTCTTCCTAGTTTCAATTCTTAGCAGTGAAACACGCTACCATGTAGTTTTGCTATCCCGAAATTTCCCCTCTCTCTGATTTGCCTAAGTTCTGTGTTTTTTGAATTTATATTACTTGTTTTCCGGTTTATTTAACTTAAATGAATGCCTCATGTTCTTGGGTTTTTATTCTTAACTGTAGAACACACAACGCTGTTGTATTCAAAATCCCGTCCACTAATGAACTTTGTGTTCACGTTGTGATAGCTTTCTCTACTGAAAGTGGACGGGATACTGCTTTTCTTTTTATTCCGTTTGAGTGGTTAGATATTCCTCCCTCACTCCTGTTCTCTTGTACAGCCACACTTTCATGTACCTGGCTAGATTTACTCATAATATTGACTTCGTTTTTTAGCTTGTTAGTG]

[+] EMBL SMGPROTEI            [GCTCATCTCGGTCATCCCGATAAATATCTCTTTCAAAGTCAAAAATGGTTATTGGCTGTTGCACACTAAATAATATTTCGGAAGATGCCAAAACGCGAAGCGATGCAAATAAACAGATTGAGAAATTAATTGAAAAGGAGAAAAAGAATTTTAAGTCTACACATAGACTGCTCCTTCTGGGTGCTGGAGAGTCTGGGAAGTCGACCATTGTTAAACAAATGAGGATATTGCACATAGATGGCTTTTCAGAACGAGAAAAAAAGGAAAAGATTGATGCAATCCGAAAAAACCTCCGTGACGCTATTTGTTCGATAGCTGGCGCTATGGGTTCTTTGAAACCACCAGTGAAGCTTGAACTCAGTGAAAACAGAAAGCTAAGGGATTATATACTGGAAACTGCATCTAAACCTGACTTCGACTATCCGCCGGAGTTTTTCACATATTGCGCCAAATTATGGAAGGATGGAGGTATACAGGAAACATTCGAAAGATCAAATGAGTATCAACTAATCGACTGTGCAAAGTATTTCCTTGATAAGGCTTTAGAGGTCGGCGCTCCAAACTACATCCCATCTGAACAGGATATTCTGCGCTGTCGTGTACTAACTTCCGGAATATTTGAAACCAAGTTCAGCGTGGATAAAGTTAATTTCCATATGTTTGACGTCGGCGGGCAGAGGGAAGAGCGCCGAAAGTGGATACAATGCTTTAACGATGTCACTGCCATCATTTTTGTCGCTGCCTGTTCTTCGTACAACATGGTCTTACGAGAAGATCCTAGCCAAAACCGTGTAAAGGAGTCTTTAGAACTTCTTGCTTCCATATGGAACAACAGGTGGTTGCGAAACATATCTGTGATTCTCTTTCTTAACAAGCAAGATTTACTTACGGAGAAGGTTTTAGCTGGCAAGTCCAAGATTGAAGTTTATTTCCCGCATTATGCTACTTACCAAGCTCCAGCTGATACACTAGCAGAGTATCGTCATGAAAACTCAGAAGTTGTACGTGCCCGATTTTTCTTCCGTGATGAATTTC TTAAAGTAACATCAAATAACAATGGTGGACGTCATTATTGTTATCCTCACTTAACGTGTGCAGTTGATACGGAAAATATCCGACGCGTATTCAATGATTGTCGTGATATCATTCAGCGAATGCACCTGCGGCAGTATGAATTACTCTAGGAACACTTTTTGTAGGCCCCAAATCTGATTTTTGTTCTTCCATAGTATTTTTTGAGGGTATACTGTTTTAAACCCCCAACGCTTGTGAATACCATCTCATAATTAATTATGACTAATGTTATCCAGTGCATCGAATCTAGTTGAATATTTTACTCCCTTTATGAACCTACCTATCTATGCTAAATTGCATTTGAAGACCAAGCACTGCAAAACAGACTCACAGGTTTGAAGATTTAGATGTCTTTTTAAAAATGTCAAACGGGATGCAAACAATATCACGTTTTCAAAATCATA TTGTAATACACCATCTCAGATATTCGTATATTTATCTGAATCTCTAACTTATCGATTAAATTTTAATTTTTCAATCCTTTTATTTTAATAATGTCACCATTACTGCTTTATTTCTTTTGGTATTCTTAAGTTTTGAAAGCATACTCTTCTGCCGAATTCACTGTTGATCAGAATTTTTTTAACTGCCTCTGTTTGGATGTCTATACGCTCGTTATTCCTTCCACCTCTGTCTTAGTTTTATCACCGTAATATGCGATTGTAATGTATTTCGATCGGTAAATATGCTCGTGTTTGCAAATTTGTTAAGTTGACGTGCCAATGTGT TAACTTCCCTTGGACGCGTACACAATAATATTTCATAATGAGTAGTATCCAGTTTCACATGTTTGATTAAGAAATA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          ]
[+] EMBL CD188338             [                                                                                                                                                                                           AGAGTCTGGGAAGTCGACCATTGTTAAACAAATGAGGATATTGCACATAGATGGCTTTTCAGAACGAGAAAAAAAGGAAAAGATTGATGCAATCCGAAAAAACCTCCGTGACGCTATTTGTTCGATAGCTGGCGCTATGGGTTCTTTGAAACCACCAGTGAAGCTTGAACTCAGTGAAAACAGAAAGCTAAGGGATTATATACTGGAAACTGCATCTAAACCTGACTTCGACTATCCGCCGGAGTTTTTCACATATTGCGCCAAATTATGGAAGGATGGAGGTATACAGGAAACATTCGAAAGATCAAATGAGTATCAACTAATCGACTGTGCAAAGTATTTCCTTGATAAGGCTTTAGAGGTCGGCGCTCCAAACTACATCCCATCTGAACAGGATATTCTGCGCTGTCGTGTACTAACTTCCGGA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             ]
[+] EMBL CD067108             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    CGAAAGATCAAATGAGTATCAACTAATCGACTGTGCAAAGTATTTCCTTGATAAGGCTTTAGAGGTCGGCGCTCCAAACCACATCCCATCTGAACAGGATATTCTGCGCTGTCGTGTACTAACTTCCGGAATATTTGAAACCAAGTTCAGCGTGGATAAAGTTAATTTCCATATGTTTGATGTCGGCGGGCACAGGGAAGAGCGCCGAAAGTGGATACAATGCTTTAACGATGTCACTGCCATCATTTTTGTCGCTGCCTGTTCTTCGTACAACATGGTCTTACGAGAAGATCCTAGCCAAAACCGTGTAAAGGAGTCTTTAGAACTTCTTGCTTCCATA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           ]
[+] EMBL CD067461             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       gAGATCAAATGAGTATCAACTAATCGACTGTGCAAAGTATTTCCTTGATAAGGCTTTAGAGGTCGGCGCTCCAAACTACATCCCATCTGAACAGGATATTCTGCGCTGTCGTGTACTAACTTCCGGAATATTTGAAACCAAGTTCAGCGTGGATAAAGTTAATTTCCATATGTTTGACG                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         ]
[-] EMBL CD192731             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          ATCAAATGAGTATCAACTAATCGACTGTGCAA   ATTTCCTTGATAAGGCTTTAGAGGTCGGCGCTCCAAACTACATCCCATCTGAACAGGATATTCTGCGCTGTCGTGTACTAACTTCCGGAATATTTGAAACCAAGTTCAGCGTGGATAAAGTTAATTTCCATATGTTTGACGTCGGCGGGCAGAGGGAAGAGCGCCGAAAGTGGATACAA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   ]
[+] EMBL CD182254             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       ACGATGTCACTGCCATCATTTTTGTCGCTGCCTGTTCTTCGTACAACATGGTCTTACGAGAAGATCCTAGCCAAAACCGTGTAAAGGAGTCTTTAGAACTTCTTGCTTCCATATGGAACAACAGGTGGTTGCGAAACATATCTGTGATTCTCTTTCTTAACAAGCAAGATTTACTTACGGAGAAGGTTTTAGCTGGCAAGTCCAAGATTGAAGTTTATTTCCCGCATTATGCTACTTACCAAGCTCCAGCTGATACACTAGCAGAGTATCGTCACGAAAACTCA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                ]
[-] EMBL CD182244             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        CGATGTCACTGCCATCATTTTTGTCGCTGCCTGTTCTTCGTACAACATGGTCTTACGAGAAGATCCTAGCCAAAACCGTGTAAAGGAGTCTTTAGAACTTCTTGCTTCCATATGGAACAACAGGTGGTTGCGAAACATATCTGTGATTCTCTTTCTTAACAAGCAAGATTTACTTACGGAGAAGGTTTTAGCTGGCAAGTCCAAGATTGAAGTTTATTTCCCGCATTATGCTACTTACCAAGCTCCAGCTGATACACTAGCAGAGTATCGTCATGAAAACTCAG                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               ]
[-] EMBL CD182295             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        CGATGTCACTGCCATCATNTTTGTCGCTGCCTGTTCTTCGTACAACATGGTCTTACGAGAAGATCCTAGCCAAAACCGTGTAAAGGAGTCTTTAGAACTTCTTGCTTCCATATGGAACAACAGGTGGTTGCGAAACGTATCTGTGATTCTCTTTCTTAACAAGCAAGATTTACTTACGGAGAAGGTTTTAGCTGGCAAGTCCAAGATTGAAGTTTATTTCCCGCATTATGCTACTTACCAAGCTCCAGCTGATACACTAGCAGAGTATCGTCATGAAAACTCAG                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               ]
[+] EMBL CD118952             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   ATACACTAGCAGAGTATCGTCATGAAAACTCAGAAGTTGTACGTGCCCGATTTTTCTTCCGTGATGAATTTC TTAAAGTAACATCAAATAACAATGGTGGACGTCATTATTGTTATCCTCACTTAACGTGTGCAGTTGATACGGAAAATATCCGACGCGTATTCAATGATTGTCGTGATATCATTCAGCGAATGCACCTGCGGCAGTATGAATTACTCTAGGAACACTTTTTGTAGGCCCCAAATCTGATTTTTGTTCTTCCATAGTATTTTTTGAGGGTATACTGTTTTAAACCCCCAACGCTTGTGAATACCATCTCATAATTAATTATGACTAATGTTATCCAGTGCATCGAATCTAGTTGAATATTTTACTCCCTTTATGAACCTACCTATCTATGCTAAATTGCATTTGAAGACCAAGCACTGCAAAACAGACTCACAGGTT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                ]
[+] EMBL CD065326             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    atagtaggtAGAGTATCGTCATGAAAACTCAGAAGTTGTACGTGCCCGATTTTTCTTCCGTGATGAATTTCGTTAAAGTAACATCAAATAACAATGGTGGACGTCATTATTGTTATCCTCACTTAACGTGTGCAGTTGATACGGAAAATATCCGACGCGTATTCCATGATTGTCGTGATATCATTCAGCGAATGCACCTACGGAAGTATGAATTACTCTAGGAACACTTTTTGTAGGCCCCAAATCTGATTTTTGTCCTTCCATAGTATCTATTGAGGGTATACTGTTATAAACCCCCAACGCTTGTAAATACCATCTCATAATTGATTATGACTAATGTTATCCAGTGCATCGAATCTAGTTGAATATTTTACT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        ]
[+] EMBL CD192379             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   TTGTGAATACCATCTCATAATTAATTATGACTAATGTTATCCAGTGCATCGAATCTAGTTGAATATTTTACTCCCTTTATGAACCTACCTATCTATGCTAAATTGCATTTGAAGACCAAGCACTGCAAAACAGACTCACAGGTTTGAAGATTTAGATGTCTTTTTAAAAATGTCAAACGGGATGCAAACAATATCACGTTTTCAAAATCATATTTGTAATACACCATCTCAGATATTCGTATATTTATCTGAATCTCTAACTTATCGATTAAATTTTAATTTTTCAATCCTTTTATTTTAATAATGTCACCATTACTGCTTTATTTCTTTTGGTATTCTTAAGTTTTGAAAGCATACTCTTCTGCCGAATTCACTGTTGATCAGAATTTTTTTAACTG                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  ]
[+] EMBL CD192451             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   TTGTGGATACCATCTCATAATTAATTATGACTAATGTCATCCAGTGCATCGAATCTAGTTGAATATTTTACTCCCTTTATGAACCTACCTATCTATGCTAAATTGCATTTGAAGACCAAGCACTGCAAAACAGACTCACAGGTTTGAAGATTTAGATGTCTTTTTAAAAATGTCAAACGGGATGCAAACAATATCACGTTTTCAAAATCATATTTGTAATACACCATCTCAGATATTCGCATATTTATCTGAATCTCTAACTTATCGATTAAATTTTAATTTTTCAATCCTTTTATTTTAATAATGTCACCATTACTGCTTTATTTCTTTTGGTATTCTTAAGTTTTGAAAGCATACTCTTCTGCCGAATTCACTGTTGATCAGAATTTTTTTAA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     ]
[+] EMBL CD192437             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   TTGTGGATACCATCTCATAATTAATTATGACTAATGTCATCCAGTGCATCGAATCTAGTTGAATATTTTACTCCCTTTATGAACCTACCTATCTATGCTAAATTGCATTTGAAGACCAAGCACTGCAAAACAGACTCACAGGTTTGAAGATTTAGATGTCTTTTTAAAAATGTCAAACGGGATGCAAACAATATCACGTTTTCAAAATCATATTTGTAATACACCATCTCAGATATTCGCATATTTATCTGAATCTCTAACTTATCGATTAAATTTTAATTTTTCAATCCTTTTATTTTAATAATGTCACCATTACTGCTTTATTTCTTTTGGTATTCTTAAGTTTTGAAAGCATACTCTTCTGCCGAATTCACTGTTGATCAGAATTTTTTTAA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     ]
[-] EMBL CD192392             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   TTGTGAATACCATCTCATAATTAATTATGACTAATGTTATCCAGTGCATCGAATCTAGTTGAATATTTTACTCCCTTTATGAACCTACCTATCTATGCTAAATTGCATTTGAAGACCAAGCACTGCAAAACAGTCTCACAGGTTTGAAGATTTAGATGTCTTTTTAAAAATGTCAAACGGGATGCAAACAATATCACGTTTTCAAAATCATATTTGTAATACACCATCTCAGATATTCGTATATTTATCTGAATCTCTAACTTATCGATTAAATTTTAATTTTTCAATCCTTTTATTTTAATAATGTCACCATTACTGCTTTATTTCTTTTGGTATTCTTAAGTTTTGAAAGCATACTCTTCTGCCGAATTCACTGTTGATCAGAATTTTTTTAACTGC                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 ]
[-] EMBL CD192895             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    TGTGAATACCATCTCATAATTAATTATGACTAATGTTATCCAGTGCATCGAATCTAGTTGAATATTTTACTCCCTTTATGAACCTACCTATCTATGCTAAATTGCATTTGAAGACCAAGCACTGCAAAACAGACTCACAGGTTTGAAGATTTAGATGTCTTTTTAAAAATGTCAAACGGGATGCAAACAATATCACGTTTTCAAAATCATATTTGTAATACACCATCTCAGATATTCGTATATTTATCTGAATCTCTAACTTATCGATTAAATTTTAATTTTTCAATCCTTTTATTTTAATAATGTCACCATTACTGCTTTATTTCTTTTGGTATTCTTAAGTTTTGAAAGCATACTCTTCTGCCGAATTCACTGTTGATCAGAATTTTTTTAACTGC                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 ]
[+] EMBL CD179220             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          TACCATCTCATAATTAATTATGACTAATGTCATCCAGTGCATCGAATCTAGTTGAATATTTTACTCCCTTTATGAACCTACCTATCTATGCTAAATTGCATTTGAAGACCAAGCACTGCAAAACAGACTCACAGGTTTGAAGATATAGATGTCTTTTTAAAAATGTCAAACGGGATGCAAACAATATCACGTTTTCAAAATCATATTTGTAATACACCATCTCAGATATTCGTATATTTATCTGAATCTCTAACTTATCGACTAAATTTTAATTTTTCAATCCTTTTATTTTAATAATGTCACCATTACTGCTTTATTTCTTTTGGTATTCTTAAGTTTTGAAAGCATACTCTTCTGCCGAATTCACTGTTGATCAGAATTTTTTTAACTGCCTCTGTTTGGATGTCTATAC                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             ]
[-] EMBL CD178562             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 AAAACAGACTCACAGGTTTGAAGATTTAGATGTCTTTTTAAAAATGTCAAACGGGATGCAAACAATATCACGTTTTCAAAATCATATTTGTAATACACCATCTCAGATATTCGTATATTTATCTGAATCTCTAACTTATCGATTAAATTTTAATTTTTCAATCCTTTTATTTTAATAATGTCACCATTACTGCTTTATTTCTTTTGGTATTCTTAAGTTTTGAAAGCATACTCTTCTGCCGAATTCACTGTTGATCAGAATTTTTTTAACTGCCTCTGTTTGGATGTCTATACG                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            ]
[+] EMBL CD061111             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    ACAGACTCACAGGTTTGAAGATTTAGATGTCTTTTTAAAAATGTCAAACGGGATGCAAACAATATCACGTTTTCAAAATCATATTTGTAATACACCATCTCAGATATTCGTATATTTATCTGAATCACTAACTTATCGATTAAATTTTAATTTTTCAATCCTTTTATTTTAATAATGTCACCATTACTGCTTTATTTCTTTTGGTATTCTTAAGTTTTGAAAGCATACT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          ]
[-] EMBL CD091336             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              ATGTCTTTTT AAAATGTCAAACGGGATGCAAACAATATCACGTTTTCAGAATCATATTTGTAATACACCATCTCAGATATTCGTATATTTATCTGAATCTCTAACTTATCGATTAAATTTTAATTTTTCAATCCTTTTATTTTAATAATGTCACCATTACTGCTTTATTTCTTTTGGTATTCTTAAGTTTTGAAAGCATACTCTTCTGCCGAATTCACTGTTGATCAGAATTTTTTTAACTGCCTCTGTTTGGATGTCTATACG                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            ]
[-] EMBL CD192215             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                AATCATATTTGTAATACACCATCTCAGATATTCGTATATTTATCTGAATCTCTAACTTATCGATTAAATTTTAATTTTTCAATCCTTTTATTTTAATAATGTCACCATTACTGCTTTATTTCTTTTGGTATTCTTAAGTTTTGAAAGCATACTCTTCTGCCGAATTCACTGTTGATCAGAATTTTTTTAACTGC                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 ]
[-] EMBL CD091370             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   TTATATCTTTTGGTATTCTTAAGTTTTGAAAGCATACTCTTCTGCCCGATTCACTGTTGATCAGAATTTTTTTAACTGCCTCTGTTTGGATGTCTATACG                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            ]
[-] EMBL CD066695             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     TGTTTGGATGTCTATACGCTCGTTATTCCTTCCACCTCTGTCTTAGTTTAATCACCGTAATATGCGATTGTAATGTATTTCGATCGGTAAATATGCTCGTGTTTGCAAATTTGTTAAGTTGACGTGCCAATGTGT TAACTTCCCTTGGACGCGTACACAATAATATTTCATAATGAGTAGTATCCAGTTTCACATGTTTGATTAAGGAATATCGTAAGCAAGTTATATGCAAACATATGACTTGATCATATATTTCGAATTGTAAACTTGTTTTGTTTTCAGTGAATAACTCCTGTCTTTCTTCCTAGTTTCAATTCTTAGCAGTGAAACACGCTACCATGTA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      ]
[-] EMBL CD189826             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          GTTATCCNTTCCACCTCTGTCTTAGTTTTATCACCGTAATATGCGATTGTAATGTATTTCGATCGGTAAATATGCTCGTGTTTGCAAATTTGTTAAGTTGACGTGCCAATGTGT TAACTTCCCTTGGACGCGTACACAATAATATTTCATAATGAGTAGTATCCAGTTTCACATGTTTGATTAAGAAATATCGTAAGCAAGTTATATGCAAACATATGACTTGATCATATATTTCGAATTGTAAACTTGTTTTGTTTTCAGTGAATAACTCCTGTCTTTCTTCCTAGTTTCAATTCTTAGCAGTGAAACACGCTACCATGTAGTTTTGCTATCCCGAAATTTCCCCTCTCTCTGATTTGCCTAAGTTCTGTGTTTTTTGAATTTATATTACTTGTTTTCCGGTTTATTTAACTTAAATGAATGCCTCATGTTCTTGGGTTTTTATTCTTAACTGTAGAACACACAACGCTGTTGTATTCAAAATCCCGTCCACTAATGAACTTTGTGTTCACGTTGTGATAGCTTTCTCTACTGAAAGTGGACGGGATACTGCTTTTCTTTTTATTCCGTTTGAGTGGTTAGATATTCCTCCCTCACTCCTGTTCTCTTGTACAGCCACAC                                                           ]
[-] EMBL CD087098             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             TCTTAGTTTTATCACCGTAATATGCGATTGTAATGTATTTCGATCGGTAAATATGCTCGTGTTTGCAAATTTGTTAAGTTGACGTGCCAATGTGT TAACTTCCCTTGGACGCGTACACAATAATATTTCATAATGAGTAGTATCCAGTTTCACATGTTTGATTAAGAAATATCGTAAGCAAGTTATATGCAAACATATGACTTGATCATATATTTCGAATTGTCAACTTGTTTTGTTTTCAGTGAATAACTCCTGTCTTTCTTCATAGTTTCAATTGTTAGCAGTGAACCACGCTACCATGTAGATTTGCTATCCCGGAATTTCCCCTCTCTC                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        ]
[-] EMBL CD067356             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                TATTTCGATCGGTAAATATGCTCGTGTTTGCAAATTTGTTAAGTTGACGTGCCAATGTGT TAACTTCCATTGGACGCGTACACAATAATATTTCATAATGAGTAGTATCCAGTTTCACATGTTTGATTAAGAAATATCGTAAGCAAGTTATAGGCAAACATATGACTTGATCATATATagc                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             ]
[+] EMBL CD077852             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     CGAGGGGGAAATATGCTCGTGATTGCAAATTTGTTAAGTTGACGTGCCAATGTGTGTAACTTCCCTTGGACGCGTACACAATAATATTTCATAATGAGTAGTATCCAGTTTCACATGTTTGATTAAGAAATATCGTAAGCAAGTTATATGCAAACATATGACTTGATCATATATTTCGAATTGTAAACTTGTTTTGTTTTCAGTGAATAACTCCTGTCTTTCTTCCTAGTTTCAATTC                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                ]
[-] EMBL CD067396             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        GGACGCGTACACAATAATATTTCATAATGAGTAGTATCCAGTTTCACATGTTTGATTAAGAAATATCGTAAGCAAGTTATATGCAAACATATGACTTGATCATATATTTCGAATTGTAAACTTGTTTTGTTTTCAGTGAATAACTCCTGTCTTTCTTCCTAGTTTCAATTCTTAGCAGTGAAACACGCTACCATGTAGTT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   ]
[-] EMBL CD158642             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                TTCTTAGCAGTGAAACACGCTACCATGTAGTTTTGCTATCCCGAAATTTCCCCTCTCTCTGATTTGCCTAAGTTCTGTGTTTTTTGAATTTATATTACTTGTTTTCCGGTTTATTTAACTTAAATGAATGCCTCATGTTCTTGGGTTTTTATTCTTAACTGTAGAACACACAACGCTGTTGTATTCAAAATCCCGTCCACTAATGAACTTTGTGTTCACGTTGTGATAGCTTTCTCTACTGAAAGTGGACGGGATACTGCTTTTCTTTTTATTCCGTTTGAGTGGTTAGATATTCCTCCCTCACTCCTGT                                                                             ]
[-] EMBL CD158681             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                TTCTTAGCAGTGAAACACGCTACCATGTAGTTTTGCTATCCCGAAATTTCCCCTCTCTCTGATTTGCCTAAGTTCTGTGTTTTTTGAATTTATATTACTTGTTTTCCGGTTTATTTAACTTAAATGAATGCCTCATGTTCTTGGGTTTTTATTCTTAACTGTAGAACACACAACGCTGTTGTATTCAAAATCCCGTCCACTAATGAACTTTGTGTTCACGTTGTGATAGCTTTCTCTACTGAAAGTGGACGGGATACTGCTTTTCTTTTTATTCCGTTTGAGTGGTTAGATATTCCTCCCTCACTCCTGT                                                                             ]
[+] EMBL CD192221             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    GTGGACCGGATACTGCTTTTCTTTTTATTCCGTTTGAGTGGTTAGATATTCCTCCCTCACTCCTGTTCTC TGTACAGCCACACTTTCATGTACCTGGCTAGATTTACTCATAATATTGACTTCGTTTTTTAGCTTGTTAGTG]




>consensus_11297#0
GCTCATCTCGGTCATCCCGATAAATATCTCTTTCAAAGTCAAAAATGGTTATTGGCTGTT
GCACACTAAATAATATTTCGGAAGATGCCAAAACGCGAAGCGATGCAAATAAACAGATTG
AGAAATTAATTGAAAAGGAGAAAAAGAATTTTAAGTCTACACATAGACTGCTCCTTCTGG
GTGCTGGAGAGTCTGGGAAGTCGACCATTGTTAAACAAATGAGGATATTGCACATAGATG
GCTTTTCAGAACGAGAAAAAAAGGAAAAGATTGATGCAATCCGAAAAAACCTCCGTGACG
CTATTTGTTCGATAGCTGGCGCTATGGGTTCTTTGAAACCACCAGTGAAGCTTGAACTCA
GTGAAAACAGAAAGCTAAGGGATTATATACTGGAAACTGCATCTAAACCTGACTTCGACT
ATCCGCCGGAGTTTTTCACATATTGCGCCAAATTATGGAAGGATGGAGGTATACAGGAAA
CATTCGAAAGATCAAATGAGTATCAACTAATCGACTGTGCAAAGTATTTCCTTGATAAGG
CTTTAGAGGTCGGCGCTCCAAACTACATCCCATCTGAACAGGATATTCTGCGCTGTCGTG
TACTAACTTCCGGAATATTTGAAACCAAGTTCAGCGTGGATAAAGTTAATTTCCATATGT
TTGACGTCGGCGGGCAGAGGGAAGAGCGCCGAAAGTGGATACAATGCTTTAACGATGTCA
CTGCCATCATTTTTGTCGCTGCCTGTTCTTCGTACAACATGGTCTTACGAGAAGATCCTA
GCCAAAACCGTGTAAAGGAGTCTTTAGAACTTCTTGCTTCCATATGGAACAACAGGTGGT
TGCGAAACATATCTGTGATTCTCTTTCTTAACAAGCAAGATTTACTTACGGAGAAGGTTT
TAGCTGGCAAGTCCAAGATTGAAGTTTATTTCCCGCATTATGCTACTTACCAAGCTCCAG
CTGATACACTAGCAGAGTATCGTCATGAAAACTCAGAAGTTGTACGTGCCCGATTTTTCT
TCCGTGATGAATTTCTTAAAGTAACATCAAATAACAATGGTGGACGTCATTATTGTTATC
CTCACTTAACGTGTGCAGTTGATACGGAAAATATCCGACGCGTATTCAATGATTGTCGTG
ATATCATTCAGCGAATGCACCTGCGGCAGTATGAATTACTCTAGGAACACTTTTTGTAGG
CCCCAAATCTGATTTTTGTTCTTCCATAGTATTTTTTGAGGGTATACTGTTTTAAACCCC
CAACGCTTGTGAATACCATCTCATAATTAATTATGACTAATGTTATCCAGTGCATCGAAT
CTAGTTGAATATTTTACTCCCTTTATGAACCTACCTATCTATGCTAAATTGCATTTGAAG
ACCAAGCACTGCAAAACAGACTCACAGGTTTGAAGATTTAGATGTCTTTTTAAAAATGTC
AAACGGGATGCAAACAATATCACGTTTTCAAAATCATATTTGTAATACACCATCTCAGAT
ATTCGTATATTTATCTGAATCTCTAACTTATCGATTAAATTTTAATTTTTCAATCCTTTT
ATTTTAATAATGTCACCATTACTGCTTTATTTCTTTTGGTATTCTTAAGTTTTGAAAGCA
TACTCTTCTGCCGAATTCACTGTTGATCAGAATTTTTTTAACTGCCTCTGTTTGGATGTC
TATACGCTCGTTATTCCTTCCACCTCTGTCTTAGTTTTATCACCGTAATATGCGATTGTA
ATGTATTTCGATCGGTAAATATGCTCGTGTTTGCAAATTTGTTAAGTTGACGTGCCAATG
TGTTAACTTCCCTTGGACGCGTACACAATAATATTTCATAATGAGTAGTATCCAGTTTCA
CATGTTTGATTAAGAAATATCGTAAGCAAGTTATATGCAAACATATGACTTGATCATATA
TTTCGAATTGTAAACTTGTTTTGTTTTCAGTGAATAACTCCTGTCTTTCTTCCTAGTTTC
AATTCTTAGCAGTGAAACACGCTACCATGTAGTTTTGCTATCCCGAAATTTCCCCTCTCT
CTGATTTGCCTAAGTTCTGTGTTTTTTGAATTTATATTACTTGTTTTCCGGTTTATTTAA
CTTAAATGAATGCCTCATGTTCTTGGGTTTTTATTCTTAACTGTAGAACACACAACGCTG
TTGTATTCAAAATCCCGTCCACTAATGAACTTTGTGTTCACGTTGTGATAGCTTTCTCTA
CTGAAAGTGGACGGGATACTGCTTTTCTTTTTATTCCGTTTGAGTGGTTAGATATTCCTC
CCTCACTCCTGTTCTCTTGTACAGCCACACTTTCATGTACCTGGCTAGATTTACTCATAA
TATTGACTTCGTTTTTTAGCTTGTTAGTG

consensusID : consensus_11297#1
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 18
consensus length = 1309
fasta sequence

                              [TTACTGAGGATGCAGATGAATGCCAAGACTGATGAGACTCTCGATTCAACAAGGAACATGGTTCGTTTGTGTGATGAGAGTACAAAAGTGGGTGCTCAGACACTGGGAAAGCTGGAGTCCCAAGGCCAACAACTAAGAGGGATCGATTCGGATATGGATAATATTCGTGAAGATCTACACGAAGCACAGCGTGAC-CTTGATGAGATCGATAAATGTTGTGGTTTATGCGTTTTACCATGGAGAAAAGTCAAACCGGATACGAAAACACCAAAATATCCAACGAGTGGGAATGGTTATCAAACTGGAACTAATAATAATTATCAAGTTAACTCTTATCAGCCACAGTCAGGATTCCAAATCCAGCAAAACCAACAAAAGAGTGGGCCTTTTATCACCAGAATCACTAATGACGCTCGTGAAGATGAAATGGAACAGAATTTACAACAAGTTTCAGGAATGGTATCGCAACTTCATTCTATGGCTACTGATATGAATCAAGAGATAACAACACACAATCAGATTCTTGATCGAATCGACCAAAAAGCGCAGTATAATCAGTCACAATTGGAGTTCGCTCAAAAGAAAGCTGATAAAATTTTAGGACAATCATGGAAACC-GGACAACAAA-AGTAACAATATTTTACCATCTAGTACAACTCTCACAGCCGCAAAAATGATGATGAAATAATGATACTGATAAAAATAATAATGAACTTAATGATAATGTGAATCTCCATCTGTGCCTTTTGTTTTTTTTCTTTGCAGCAAAATCTGCTGAGCATCCTTTCACATAAATGCACCTATACGTTTTCATTTTCTATGTATTTATCCGTTATTGTTTCTTCTCTTAAGTTGACCTACTTTTCAGTGCCTTTGAAGCTGGGCCCGTCATTTGTTTTGTGTTGGTTTCCACTTTTTGGGGTTTTGATACCGTGATTATTCTTCACTGTTTATTGACTTCTCTGTTTATTATCCAAAGAATCATTTGTTTGTTACATTTTCTATCTATGTCTCTTACAACTACTGACAACACATTTCACCATAATCCCCCCCCCC---AAAAAAATTTGTAATTTTCTTTAAGTGCCTTGTCAACAATACCTTTTTATTTCTATATATTCAAATGAGTTACACAGATGATATTTTCTGCATGTGTTTTTTTTGGTGCATGATTTTGGTTTATTTTTGGAATTTTTTTGTATTTGTTCCTTTTTTTTCTTTTAAT-TGAGTAGAAAATATTTCATTGTCTTGTAACCATCCATAAATAAATAATACCATACTCTTGATTCTGTTAAATATGTCTCGTGTGTGTG]

[+] EMBL CD123669             [TTACTGAGGATGCAGATGAATGCCAAGACTGATGAGACTCTCGATTCAACAAGGAACATGGTTCGTTTGTGTGATGAGAGTACAAAAGTGGGTGCTCAGACACTGGGAAAGCTGGAGTCCCAAGGCCAACAACTAAGAGGGATCGATTCGGATATGGATAATATTCGTGAAGATCTACACGAAGCACAGCGTGAC CTTGATGAGATC                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    ]
[+] EMBL CD180229             [      AGGATGCAGATGAATGCCAAGACTGATGAGACTCTCGATTCAACAAGGAACATGGTTCGTTTGTGTGATGAGAGTACAAAAGTGGGTGCTCAGACACTGGGAAAGCTGGAGTCCCAAGGCCAACAACTAAGAGGGATCGATTCGGATATGGATAATATTCGTGAAGATCTACACGAAGCACAGCGTGAC CTTGATGAGATCGATAAATGTTGTGGTTTATGCGTTTTACCATGGAGAAAAGTCAAACCGGATACGAAAACACCAAAATATCCAACGAGTGGGAATGGTTATCAAACTGGAACTAATAATAATTATCAAGTTAACTCTTATCAGCCACAGTCAGGATTCCAAATCCAGCAAAACCAACAAAAGAGTGGGCCTTTTATCACCAGAATCACTAATGACGCTCGTGAAGATGAAATGGAACAGAATTTACAACAAGTTTCAGGAATGGTATCGCAACTTCATTCTATGGCTACTGATATGAATCAAGAGATAACAACACACAATCAGATTCTTGATCGAATCGACCAAAAAGCGCAGTATAATCAGTCACAATTGGAGTTCGCTCAAAAGAAAGCTGATAAAATTTTAGGACAATCATGGAAACC GGACAACAAA AGTAACAATATTTTA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               ]
[+] EMBL CD180259             [      AGGATGCAGATGAATGCCAAGACTGATGAGACTCTCGATTCAACAAGGAACATGGTTCGTTTGTGTGATGAGAGTACAAAAGTGGGTGCTCAGACACTGGGAAAGCTGGAGTCCCAAGGCCAACAACTAAGAGGGATCGATTCGGATATGGATAATATTCGTGAAGATCTACACGAAGCACAGCGTGAC CTTGATGAGATCGATAAATGTTGTGGTTTATGCGTTTTACCATGGAGAAAAGTCAAACCGGATACGAAAACACCAAAATATCCAACGAGTGGGAATGGTTATCAAACTGGAACTAATAATAATTATCAAGTTAACTCTTATCAGCCACAGTCAGGATTCCAAATCCAGCAAAACCAACAAAAGAGTGGGCCTTTTATCACCAGAATCACTAATGACGCTCGTGAAGATGAAATGGAACAGAATTTACAACAAGTTTCAGGAATGGTATCGCAACTTCATTCTATGGCTACTGATATGAATCAAGAGATAACAACACACAATCAGATTCTTGATCGAATCGACCAAAAAGCGCAGTATAATCAGTCACAATTGGAGTTCGCTCAAAAGAAAGCTGATAAAATTTTAGGACAATCATGGAAACC GGACAAC AA AGTAACAATATTTTA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               ]
[+] EMBL CD180185             [      AGGATGCACATGAGTGCCAAGACTGATGAGACTCTCGATTCAACAAGGAACATGGTTCGTTTGTGTGATGAGAGTACAAAAGTGGGTGCTCAGACACTGGGAAAGCTGGAGTCCCAAGGCCAACAACTAAGAGGGATCGATTCGGATATGGATAATATTCGTGAAGATCTACACGAAGCACAGCGTGAC CTTGATGAGATCGATAAATGTTGAGGTTTATGCGTTTTACCATGGAGAAAAGTCAAACCGGATACGAAAACACCAAAATATCCAACGAG                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       ]
[-] EMBL CD186825             [                TGAATGCCAAGACTGATGAGACTCTCGATTCAACAAGGAACATGGTTCGTTTGTGTGATGAGAGTACAAAAGTGGGTGCTCAGACACTGGGAAAGCTGGAGTCCCAAGGCCAACAACTAAGAGGGATCGATTCGGATATGGATAATATTCGTGAAGATCTACACGAAGCACAGCGTGAC CTTGATGAGATCGATAAATGTTGTGGTTTATGCGTTTTACCATGGAGAAAAGTCAAACCGGATACGAAAACACCAAAATATCCAACGAGTGGGAATGGTTATCAAACTGGAACTAATAATAATTATCAAGTTAACTCTTATC                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  ]
[+] EMBL CD096067             [                   ATGCCAAGACTGATGAGACTCTCGATTCAACAAGGAACATGGTTCGTTTGTGTGATGAGAGTACAAAAGTGGGTGCTCAGACACTGGGAAAGCTGGAGTCCCAAGGCCAACAACTAAGAGGGATCGATTCGGATATGGATAATATTCGTGAAGATCTACACGAAGCACAGCGTGAC CTTGATGAGATCGATAAATGTTGTGGTTTATGCGTTTTACCATGGAGAAAAGTCAAACCGGATACGAAAACACCAAAATATCCAACGAGTGGGAATGGTTATCAAACTGGAACTAATAATAATTATCAAGTTAACTCTTATCAGCCACAGTCAGGATTCCAAATCCAGCAAAACCAACAAAAGAGTGGGCCTTTTATCACCAGAATCACTAATGACGCTCGTGAAGATGAAATGGAACAGAATTTACAACAAGTTTCAGGAATGGTATCGCAACTTCATTCTATGGCTACTGATATGAATCAAGAGATAACANCACACAATCAGATTCTTGGTCGAATCGACCAAAAAGCGCAGTATAATCAGTCACAATTGGAGTTCGCTCAAAAG                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             ]
[+] EMBL CD195392             [                                                                                          GGTGCTCAGACACTGGGAAAGCTGGAGTCCCAAGGCCAACAACTAAGAGGGATCGATTCGGATATGGATAATATTCGTGAAGATCTACACGAAGCACAGCGTGAC CTTGATGAGATCGATAAATGTTGTGGTTTATGCGTTTTACCATGGAGAAAAGTCAAACCGGATACGAAAACACCAAAATATCCAACGAGTGGGAATGGTTATCAAACTGGAACTAATAATAATTATCAAGTTAACTCTTATCAGCCACAGTCAGGATTCCAAATCCAGCAAAACCAACAAAAGAGTGGGCCTTTTATCACCAGAATCACTAATGACGCTCGTGAAGATGAAATGGAACAGAATTTACAACAAGTTTCGGGAATGGTATCGCAACTTCACTCTATGGCTACTGATATGAATCAAGAGATAACAACACACAATCAGATTCTTGATCGAATCGACCAAAAAGCGCAGTATAATCAGTCACAATTGGAGTTCGCTCANAAGAAAGCTGATAAAATTTTAGGACAATCATGGAAACCGGGAC ACAAANNGT AC ATATTTTACC                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             ]
[+] EMBL CD062687             [                                                                                                                                              TCGATTCGGATATGGATAATATTCGTGAAGATCTACACGAAGCACAGTTTGTCTCTTGATGAGATCGATAAATGTTGTGGGGTATGCGTTTTACCATGGAGAAAAGTCAAACCGGATACGAAAACACCAAAATATCCAACGAGTGGGAATGGTTATCAAACTGGAACTAATAATAATTATCAAGTTAACTCTTATCAG                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                ]
[+] EMBL CD062649             [                                                                                                                                                                                                                                                  GAAAAGTTAAACCGGATACGAAAACTCCAAAATATCCAACGAGTGGGAATGGTTATCAAACTGGAACTAATAATAATTATCAAGTTAACTCTTATCAG                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                ]
[+] EMBL CD200527             [                                                                                                                                                                                                                                                        TCAAACCGGATACGAAAACACCAAAATATCCAACGAGTGGGAATGGTTATCAAACTGGAACTAATAATAATTATCAAGTTAACTCTTATCAGCCACAGTCAGGATTCCAAATCCAGCAAAACCAACAAAAGAGTGGGCCTTTTATCACCAGAATCACTAATGACGCTCGTGAAGATGAAATGGAACAGAATTTACA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        ]
[+] EMBL CD127441             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             ggTCAAGAGATAAC TCTCACAATCAGATTCTTGATCGAATCCACCAAAAAGCGCAGTATAATCAGTCACAATTGGAGTTCGCTCAAAAGAAAGCTGATAAAATTTTAGGACAATCATGGAAACC GGACAACAAA AGTAACAATATTTTACCATCTAGTACAACTCTCACAGCCGCAAAAATGATGATGAAATAATGATACTGATAAAAATAATAATGAACTTAATGATAATGTGAATCTCCATCTGTGCCTTTTGTTTTTTTTCTTTGCAGCAAAATCTGCTGAGCATCCTTTCACATAAATGCACCTATACGTTTTCATTTTCTATGTATTTATCCGTTATTGTTTCTTCTCTTAAGTTGACCTACTTTTCAGTGCCTTTGAAGCTGGGCCCGTCATTTGTTTTGTGTTGGTTTCCACTTTTTGGGGTTTTGATACCGTGATTATTCTTCACTGTTTATTGACTTCTCTGTTTATTATCCAAAGAATCATTTGTTTGTTACATTTTCTATCTA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  ]
[-] EMBL CD152617             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      ATAACAACACACAATCAGATTCTTGATCGAATCGACCAAAAAGCGCAGTATAATCAGTCACAATTGGAGTTCGCTCAAAAGAAAGCTGATAAAATTTTAGGACAATCATGGAAACC GGACAACAAA AGTAACAATATTTTACCATCTAGTACAACTCTCACAGCCGCAAAAATGATGATGAAATAATGATAGTGATAAAAATAATAATGAACTTAATGATAATGTGAATCTCCATCTGTGCCTTTTGTTTTTTTTCTTTGCAGCAAAATCTGCTGAGCATCCTTTCACATAAATGCACCTATACGTTTTCATTTTCTATGTATTTATCCGTTATTGTTTCTTCTCTTAAGTTGACCTACTTTTCAGTGCCTTTGAAGCTGGGCCCGTCATTTGTTTTGTGTTGGTTTCCACTTTTTGGGGTTTTGATACCGTGATTATTCTTCACTGTT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           ]
[+] EMBL AI976352             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 CAAAAGAAAGCTGATAAAATTTTAGGACAATCATGGAAACC GGACAACAGA AGTAACAATATTTTACCATCTAGTACAACTCTCACAGCCGCAAAAATGATGATGAAATAATGATACTGATAAAAATAATAATGAACTTAATGATAATGTGAATCTCCATCTGTGCCTTTTGATTTTTTTCTTTGCAGCAAAATCTGCTGAGCATCCTTTCACATAAATGCACCTATACGTTTTCATTTTCTATGTATTTATCCGTTATTGATTCTTCTATTAAGTTGACCTACTTTTCAGTGCCTTTGAAGCTGGGCCCGTCATTTGTTTTGTGTTGGTTTCCACTTTTTGGGGTTTTGATACCGCGATTATTCTTCACTGCTTATTGACTTCTCTGTTCATTATCCAAAGAATCATGTGTTTGTTACATTATGTATCTATGTCTCTTACAACTAC                                                                                                                                                                                                                                                                                                  ]
[-] EMBL CD152622             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    A AGTAACAATATTTTACCATCTAGTACAACTCTCACAGCCGCAAAAATGATGATGAAATAATGATACTGATAAAAATAATAATGAACTTAATGATAATGTGAATCTCCATCTGTGCCTTTTGTTTTTTTTCTTTGCAGCAAAATCTGCTGAGCATCCTTTCACATAAATGCACCTATACGTTTTCATTTTCTATGTATTTATCCGTTATTGTTTCTTCTCTTAAGTTGACCTACTTTTCAGTGCCTTTGAAGCTGGGCCCGTCATTTGTTTTGTGTTGGTTTCCACTTTTTGGGGTTTTGATACCGTGATTATTCTTCACTGTT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           ]
[+] EMBL CD200729             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               TGTTTTGTGTTGGTTTCCACTTTTTGGGGTTTTGATACCGTGATTATTCTTCACTGTTTGTTGACTCCTCTGTTTATTATCCAAAGAATCATTTGTTTGTTACATTTTCTATCTATGTCTCTTACAACTACTGACAACACATTTCACCATAATCCCCCCCCCCCCAAAAAAAATTTGTAATTTTCTTTAAGTGCCTTGTCAACAATACCTTTTTATTTCTATATATTCAAATGAGTTACACAGATGATATTTTCTGCATGTGTTTTTTTTGGTGCATGATTTTGGTTTATTTTTGGAATTTTTTTGTATTTGTCCCTTTTTTT                                                                                                  ]
[-] EMBL CD200601             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                GTTTTGTGTTGGTTTCCACTTTTTGGGGTTTTGATACCGTGATTATTCTTCACTGTTTATTGACTTCTCTGTTTATTATCCAAAGAATCATTTGTTTGTTACATTTTCTATCTATGTCTCTTACAACTACTGACAACACATTTCACCATAATCCCCCCCCCC   AAAAAAATTTGTAATTTTCTTTAAGTGCCTTGTCAACAATACCTTTTTATTTCTATATATTCAAATGAGTTACACAGATGATATTTTCTGCATGTGTTTTTTTTGGTGCATGATTTTGGTTTATTTTTGTAATTTTTTTGTATTTGTTCCTTTTTTTTCTTTTAAT TGAGTAGAAAATATTTCATTGTCTTGTAACTATCCATAAATAAATAATACCATACTCTTGATTCTGTTAAATATGTCTCGTGTGTG  ]
[-] EMBL CD071696             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                taATTTGTTCCTTTTTTTTCTTTTAAT TGAGTAGAAAATATTTCATTGTCTTGTAACCATCCATAAATAAATAATACCATACTCTTGACTCTGTTAAATATGTCTCGTGTGTGTG]
[-] EMBL CD071653             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         CCTTTTTNTTC TTTAATNNGAGTAGAAAATATTTCATTGTCTTGTAACCATCCATAAATAAATAATACCATACTCTTGATTCTGTTAAATATGTCTCGTGTGTGTG]




>consensus_11297#1
TTACTGAGGATGCAGATGAATGCCAAGACTGATGAGACTCTCGATTCAACAAGGAACATG
GTTCGTTTGTGTGATGAGAGTACAAAAGTGGGTGCTCAGACACTGGGAAAGCTGGAGTCC
CAAGGCCAACAACTAAGAGGGATCGATTCGGATATGGATAATATTCGTGAAGATCTACAC
GAAGCACAGCGTGACCTTGATGAGATCGATAAATGTTGTGGTTTATGCGTTTTACCATGG
AGAAAAGTCAAACCGGATACGAAAACACCAAAATATCCAACGAGTGGGAATGGTTATCAA
ACTGGAACTAATAATAATTATCAAGTTAACTCTTATCAGCCACAGTCAGGATTCCAAATC
CAGCAAAACCAACAAAAGAGTGGGCCTTTTATCACCAGAATCACTAATGACGCTCGTGAA
GATGAAATGGAACAGAATTTACAACAAGTTTCAGGAATGGTATCGCAACTTCATTCTATG
GCTACTGATATGAATCAAGAGATAACAACACACAATCAGATTCTTGATCGAATCGACCAA
AAAGCGCAGTATAATCAGTCACAATTGGAGTTCGCTCAAAAGAAAGCTGATAAAATTTTA
GGACAATCATGGAAACCGGACAACAAAAGTAACAATATTTTACCATCTAGTACAACTCTC
ACAGCCGCAAAAATGATGATGAAATAATGATACTGATAAAAATAATAATGAACTTAATGA
TAATGTGAATCTCCATCTGTGCCTTTTGTTTTTTTTCTTTGCAGCAAAATCTGCTGAGCA
TCCTTTCACATAAATGCACCTATACGTTTTCATTTTCTATGTATTTATCCGTTATTGTTT
CTTCTCTTAAGTTGACCTACTTTTCAGTGCCTTTGAAGCTGGGCCCGTCATTTGTTTTGT
GTTGGTTTCCACTTTTTGGGGTTTTGATACCGTGATTATTCTTCACTGTTTATTGACTTC
TCTGTTTATTATCCAAAGAATCATTTGTTTGTTACATTTTCTATCTATGTCTCTTACAAC
TACTGACAACACATTTCACCATAATCCCCCCCCCCAAAAAAATTTGTAATTTTCTTTAAG
TGCCTTGTCAACAATACCTTTTTATTTCTATATATTCAAATGAGTTACACAGATGATATT
TTCTGCATGTGTTTTTTTTGGTGCATGATTTTGGTTTATTTTTGGAATTTTTTTGTATTT
GTTCCTTTTTTTTCTTTTAATTGAGTAGAAAATATTTCATTGTCTTGTAACCATCCATAA
ATAAATAATACCATACTCTTGATTCTGTTAAATATGTCTCGTGTGTGTG

consensusID : consensus_11297#2
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 1
consensus length = 289
fasta sequence

                              [TCACAAGCGTTGGGGGTTTAAAACAGTATACCCTCTAAAAAATACTATGGAAGAACAAAAATCAGATTCTTGATCGAATCGATCAAAAAGCGCAGTATAATCAGTCACAATTGGAGTTCGCTCAAAAGAAAGCTGATAAAATTTTAGGACAATCATGGAAACCGGACAACAAAAGTAACAATATTTTACCATCTAGTACAACTCTCACAGCCGCAAAAATGATGATGCAATAATGATACTGATAAAAATAATAATGAACTTAATGATAATGAGAATCTCCATCTGTGCC]

[+] EMBL CD065334             [TCACAAGCGTTGGGGGTTTAAAACAGTATACCCTCTAAAAAATACTATGGAAGAACAAAAATCAGATTCTTGATCGAATCGATCAAAAAGCGCAGTATAATCAGTCACAATTGGAGTTCGCTCAAAAGAAAGCTGATAAAATTTTAGGACAATCATGGAAACCGGACAACAAAAGTAACAATATTTTACCATCTAGTACAACTCTCACAGCCGCAAAAATGATGATGCAATAATGATACTGATAAAAATAATAATGAACTTAATGATAATGAGAATCTCCATCTGTGCC]




>consensus_11297#2
TCACAAGCGTTGGGGGTTTAAAACAGTATACCCTCTAAAAAATACTATGGAAGAACAAAA
ATCAGATTCTTGATCGAATCGATCAAAAAGCGCAGTATAATCAGTCACAATTGGAGTTCG
CTCAAAAGAAAGCTGATAAAATTTTAGGACAATCATGGAAACCGGACAACAAAAGTAACA
ATATTTTACCATCTAGTACAACTCTCACAGCCGCAAAAATGATGATGCAATAATGATACT
GATAAAAATAATAATGAACTTAATGATAATGAGAATCTCCATCTGTGCC

consensus multiple alignement with clustalw

CLUSTAL W (1.82) multiple sequence alignment


consensus_11297#1      ------------------------------------------------------------
consensus_11297#2      ------------------------------------------------------------
consensus_11297#0      GCTCATCTCGGTCATCCCGATAAATATCTCTTTCAAAGTCAAAAATGGTTATTGGCTGTT 60
                                                                                   

consensus_11297#1      ------------------------------------------------------------
consensus_11297#2      ------------------------------------------------------------
consensus_11297#0      GCACACTAAATAATATTTCGGAAGATGCCAAAACGCGAAGCGATGCAAATAAACAGATTG 120
                                                                                   

consensus_11297#1      ------------------------------------------------------------
consensus_11297#2      ------------------------------------------------------------
consensus_11297#0      AGAAATTAATTGAAAAGGAGAAAAAGAATTTTAAGTCTACACATAGACTGCTCCTTCTGG 180
                                                                                   

consensus_11297#1      ------------------------------------------------------------
consensus_11297#2      ------------------------------------------------------------
consensus_11297#0      GTGCTGGAGAGTCTGGGAAGTCGACCATTGTTAAACAAATGAGGATATTGCACATAGATG 240
                                                                                   

consensus_11297#1      ------------------------------------------------------------
consensus_11297#2      ------------------------------------------------------------
consensus_11297#0      GCTTTTCAGAACGAGAAAAAAAGGAAAAGATTGATGCAATCCGAAAAAACCTCCGTGACG 300
                                                                                   

consensus_11297#1      ------------------------------------------------------------
consensus_11297#2      ------------------------------------------------------------
consensus_11297#0      CTATTTGTTCGATAGCTGGCGCTATGGGTTCTTTGAAACCACCAGTGAAGCTTGAACTCA 360
                                                                                   

consensus_11297#1      -----------------TTACTGAGGATGCAGATGAATGCCAAGACTGATGAGACTCTCG 43
consensus_11297#2      ------------------------------------------------------------
consensus_11297#0      GTGAAAACAGAAAGCTAAGGGATTATATACTGGAAACTGCATCTAAACCTGACTTCGACT 420
                                                                                   

consensus_11297#1      ATTCAACAAGGAACATGGTTCGTTTGTGTGATGAGAGTACAAAAGTGGGTGCTCAGACAC 103
consensus_11297#2      ------------------------------------------------------------
consensus_11297#0      ATCCGCCGGAGTTTTTCACATATTGCGCCAAATTATGGAAGGATGGAGGTATACAGGAAA 480
                                                                                   

consensus_11297#1      TGGGAAAGCTGGAGTCCCAAGGCCAACAACTAAGAGGGATCGATTCGGATATGGATAATA 163
consensus_11297#2      ------------------------------------------------------------
consensus_11297#0      CATTCGAAAGATCAAATGAGTATCAACTAATCGACTGTGCAAAGTATTTCCTTGATAAGG 540
                                                                                   

consensus_11297#1      TTCGTGAAGATCTACACGAAGCACAGCGTGACCTTGATGAGATCGATAAATGTTGTGGTT 223
consensus_11297#2      ------------------------------------------------------------
consensus_11297#0      CTTTAGAGGTCGGCGCTCCAAACTACATCCCATCTGAACAGGATATTCTGCGCTGTCGTG 600
                                                                                   

consensus_11297#1      TATGCGTTTTACCATGGAGAAAAGTCAAACCGGATACGAAAACACCAAAATATCCAACGA 283
consensus_11297#2      ------------------------------------------------------------
consensus_11297#0      TACTAACTTCCGGAATATTTGAAACCAAGTTCAGCGTGGATAAAGTTAATTTCCATATGT 660
                                                                                   

consensus_11297#1      GTGGGAATGGTTATCAAACTGGAACTAATAATAATTATCAAGTTAACTCTTATCA-GCCA 342
consensus_11297#2      ------------------------------------------------------------
consensus_11297#0      TTGACGTCGGCGGGCAGAGGGAAGAGCGCCGAAAGTGGATACAATGCTTTAACGATGTCA 720
                                                                                   

consensus_11297#1      CAGTCAGGATTCCAAATCCAGCAAAACCAACAAAAGAGTGGGCCTTTTATCACCAGAATC 402
consensus_11297#2      ------------------------------------------------------------
consensus_11297#0      CTGCCATCATTTTTGTCGCTGCCTGTTCTTCGTACAACATGGTCTTACGAGAAGATCCTA 780
                                                                                   

consensus_11297#1      ACTAATGACGCTCGTGAAGATGAAATGGAACAGAATTTACAACAAGTTTCA-GGAATGGT 461
consensus_11297#2      ------------------------------------------------TCA-CAAGCGTT 11
consensus_11297#0      GCCAAAACCGTGTAAAGGAGTCTTTAGAACTTCTTGCTTCCATATGGAACAACAGGTGGT 840
                                                                        **      * *

consensus_11297#1      ATCGCAACTTCATTCT-ATGGCTACTGATATGAATCAAGAGATAACAACACACAATCAGA 520
consensus_11297#2      GGGGGTTTAAAACAGT-ATACCCTCTAAAAAATACTATGGAAGAACAAAA----ATCAGA 66
consensus_11297#0      TGCGAAACATATCTGTGATTCTCTTTCTTAACAAGCAAGATTTACTTACG---GAGAAGG 897
                          *           * **      *   *   *  * *    *   *      *  ** 

consensus_11297#1      TTCTTGATCGAATCGACCAAAAAGCGCAGTATAATCAGTCACAATTGGAGTTCGCTCAAA 580
consensus_11297#2      TTCTTGATCGAATCGATCAAAAAGCGCAGTATAATCAGTCACAATTGGAGTTCGCTCAAA 126
consensus_11297#0      TTTTAGCTGGCA--AGTCCAAGATTGAAGT-TTATTTCCCGCATTATGCTACTTACCAAG 954
                       ** * * * * *     * ** *  * *** * **    * ** *  *        *** 

consensus_11297#1      AGAAAGCTGATAAAATTTTAGGACA--ATCATGGAAAC-CGGACAACAAAAGTAACAATA 637
consensus_11297#2      AGAAAGCTGATAAAATTTTAGGACA--ATCATGGAAAC-CGGACAACAAAAGTAACAATA 183
consensus_11297#0      CTCCAGCTGATACACTAGCAGAGTATCGTCATGAAAACTCAGAAGTTGTACGTGCCCGAT 1014
                           ******** * *   **   *   ***** **** * **      * **  *    

consensus_11297#1      TTTTACCATCTAGTACAACTCTCACAGCCGCAA-AAATGATGATGA--AATAATGATACT 694
consensus_11297#2      TTTTACCATCTAGTACAACTCTCACAGCCGCAA-AAATGATGATGC--AATAATGATACT 240
consensus_11297#0      TTTTCTTCCGTGATGAATTTCTTAAAGTAACATCAAATAACAATGGTGGACGTCATTATT 1074
                       ****      *  *  *  *** * **   **  **** *  ***    *      ** *

consensus_11297#1      GATAAAAATAAT-AATGAACTTAAT-GATAATGTGAATCTCCA--------TCTGTGCCT 744
consensus_11297#2      GATAAAAATAAT-AATGAACTTAAT-GATAATGAGAATCTCCA--------TCTGTGCC- 289
consensus_11297#0      GTTATCCTCACTTAACGTGTGCAGTTGATACGGAAAATATCCGACGCGTATTCAATGATT 1134
                       * **     * * ** *     * * ****  *  *** ***         **  **   

consensus_11297#1      TTTGTTTTTTTTCTTTGCAGCAAAATCTGCTGAGCATCCTTTCACATAAATGCACCTATA 804
consensus_11297#2      ------------------------------------------------------------
consensus_11297#0      GTCGTGATATCATTCAGCGAATGCACCTGCGGCAGTATGAATTACTCTAGGAACACTTTT 1194
                                                                                   

consensus_11297#1      CGTTTTCATTTTCTATGTATTTATCCGTTATTGTTTCTTCTCTTAAGTTGACCTACTTTT 864
consensus_11297#2      ------------------------------------------------------------
consensus_11297#0      TGTAGGCCCCAAATCTGATTTTTGTTCTTCCATAGTATTTTTTGAGGGTATACTGTTTTA 1254
                                                                                   

consensus_11297#1      CAGTGCCTTTGAAGCTGGGC-CCGTCATTTGTTTTGTGTTGGTTTCCACTTTTTGGGGTT 923
consensus_11297#2      ------------------------------------------------------------
consensus_11297#0      AACCCCCAACGCTTGTGAATACCATCTCATAATTAATTATGACTAATGTTATCCAGTGCA 1314
                                                                                   

consensus_11297#1      TTGATACCGTGATTATTCTTCACTGTTTATTGACTTCTCTGTTTATTATCCAAAGAATCA 983
consensus_11297#2      ------------------------------------------------------------
consensus_11297#0      TCGAATCTAGTTGAATATTTTACTCCCTTTATGAACCTACCTATCTATGCTAAATTGCAT 1374
                                                                                   

consensus_11297#1      TTTGTTTGTTACATTTTCTATCTATGTCTCTTACAACTACTGACAACACATTTCACCATA 1043
consensus_11297#2      ------------------------------------------------------------
consensus_11297#0      TTGAAGACCAAGCACTGCAAAACAGACTCACAGGTTTGAAGATTTAGATGTCTTTTTAAA 1434
                                                                                   

consensus_11297#1      ATCCCCCCCCCCAAAAAAATTTGTAATTTTCTTTAAGTGCCTTGTCAACAATACCTTTTT 1103
consensus_11297#2      ------------------------------------------------------------
consensus_11297#0      AATGTCAAACGGGATGCAAACAATATCACGTTTTCAAAATCATATTTGTAATACACCATC 1494
                                                                                   

consensus_11297#1      ATTTCTATATATTCAAATGAGTTACACAGATGATATTTTCTGCATGTGTTTTTTTTGGTG 1163
consensus_11297#2      ------------------------------------------------------------
consensus_11297#0      TCAGATATTCGTATATTTATCTGAATC---TCTAACTTATCGATTAAATTTTAATTTTTC 1551
                                                                                   

consensus_11297#1      CATGATTTTGGTTTATTTTTGGAATTTTTTTGTATTTGTTCCTTTTTTTTCTTTTAATTG 1223
consensus_11297#2      ------------------------------------------------------------
consensus_11297#0      AATCCTTTTATTTTAATAATGTCACCATTACTGCTTTATTTCTTTTGGTATTCTTAAGTT 1611
                                                                                   

consensus_11297#1      AGTAGAAAATATTTCATTGTCTTGTAACCATCCATAAATAAATAATACCATACTCTTGAT 1283
consensus_11297#2      ------------------------------------------------------------
consensus_11297#0      TTGAAAGCATACTCTTCTGCCGAATTCACTGTTGATCAGAATTTTTTTAACTGCCTCTGT 1671
                                                                                   

consensus_11297#1      TCTGTTAAATATGTCTCGTGTGTGTG---------------------------------- 1309
consensus_11297#2      ------------------------------------------------------------
consensus_11297#0      TTGGATGTCTATACGCTCGTTATTCCTTCCACCTCTGTCTTAGTTTTATCACCGTAATAT 1731
                                                                                   

consensus_11297#1      ------------------------------------------------------------
consensus_11297#2      ------------------------------------------------------------
consensus_11297#0      GCGATTGTAATGTATTTCGATCGGTAAATATGCTCGTGTTTGCAAATTTGTTAAGTTGAC 1791
                                                                                   

consensus_11297#1      ------------------------------------------------------------
consensus_11297#2      ------------------------------------------------------------
consensus_11297#0      GTGCCAATGTGTTAACTTCCCTTGGACGCGTACACAATAATATTTCATAATGAGTAGTAT 1851
                                                                                   

consensus_11297#1      ------------------------------------------------------------
consensus_11297#2      ------------------------------------------------------------
consensus_11297#0      CCAGTTTCACATGTTTGATTAAGAAATATCGTAAGCAAGTTATATGCAAACATATGACTT 1911
                                                                                   

consensus_11297#1      ------------------------------------------------------------
consensus_11297#2      ------------------------------------------------------------
consensus_11297#0      GATCATATATTTCGAATTGTAAACTTGTTTTGTTTTCAGTGAATAACTCCTGTCTTTCTT 1971
                                                                                   

consensus_11297#1      ------------------------------------------------------------
consensus_11297#2      ------------------------------------------------------------
consensus_11297#0      CCTAGTTTCAATTCTTAGCAGTGAAACACGCTACCATGTAGTTTTGCTATCCCGAAATTT 2031
                                                                                   

consensus_11297#1      ------------------------------------------------------------
consensus_11297#2      ------------------------------------------------------------
consensus_11297#0      CCCCTCTCTCTGATTTGCCTAAGTTCTGTGTTTTTTGAATTTATATTACTTGTTTTCCGG 2091
                                                                                   

consensus_11297#1      ------------------------------------------------------------
consensus_11297#2      ------------------------------------------------------------
consensus_11297#0      TTTATTTAACTTAAATGAATGCCTCATGTTCTTGGGTTTTTATTCTTAACTGTAGAACAC 2151
                                                                                   

consensus_11297#1      ------------------------------------------------------------
consensus_11297#2      ------------------------------------------------------------
consensus_11297#0      ACAACGCTGTTGTATTCAAAATCCCGTCCACTAATGAACTTTGTGTTCACGTTGTGATAG 2211
                                                                                   

consensus_11297#1      ------------------------------------------------------------
consensus_11297#2      ------------------------------------------------------------
consensus_11297#0      CTTTCTCTACTGAAAGTGGACGGGATACTGCTTTTCTTTTTATTCCGTTTGAGTGGTTAG 2271
                                                                                   

consensus_11297#1      ------------------------------------------------------------
consensus_11297#2      ------------------------------------------------------------
consensus_11297#0      ATATTCCTCCCTCACTCCTGTTCTCTTGTACAGCCACACTTTCATGTACCTGGCTAGATT 2331
                                                                                   

consensus_11297#1      --------------------------------------
consensus_11297#2      --------------------------------------
consensus_11297#0      TACTCATAATATTGACTTCGTTTTTTAGCTTGTTAGTG 2369