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consensusID : consensus_11307#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 42 consensus length = 1172 fasta sequence 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TATGTATATCATCATGGAATCCTAAAATTTTATATTTCATTTCTAGCGCT TGT TTCATTTTTTTTACTCGCATTTCGGTCCTGTCTTAATGGTGTTTTTTAGATTCAGGTTGTTTTTCATCACTTGATAATTCACAATATATTGTCATTG ] consensusID : consensus_11307#1 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 4 consensus length = 639 fasta sequence [CGGCACGAGGGGGCGGGCAGNGTTTGAAAACGCACTGACTTATTTACCTTGCCTTTTCTTACCGTTCCTGCGTCGACTCATCTATGCATCATGTCTCGTCCGCCATCCAACTTTTCTTGGGTTTCGAAATCTGTAGCCGGGTTCGCCTTTCCACGAGAAAAATGTGAGCTAGGATATCTAGTAGACAACGCCGGACTAACTCATATAATCACTTTGTGTCATGAAGTTCCTCAGTACATTTCGGATTTCACGTCAGTTAAACATTATCACTTACCCGTCGAAGATTTAACTTCTGCAAGCTTACCTGTTATTCAGAAAGCAATGGAAATTATCA-AACAAGCTGAAACAAATAATGAAAAAGTTGGAGTTCATTGTCAACTGGGTAGAGGTCGTGCAGGAACAATTTTAGCGTGTTATCTTGCCTACAAGAACAATCTTGATGCCGATCAAGCCATCATGGAATTGCGTCGACTTAGGCCGAAATCAATTGACGATGATCAGGAAGAAGCTGTGAGACGATATGTGAAATCAATCAAACAGTAATGACGTAAATTGGTTGAAGAAAACATGTTACTCATGC-AATAAATTGTAATTTAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAA] [+] EMBL CD077561 [CGGCACGAGGGGGCGGGCAGNGTTTGAAAACGCACTGACTTATTTACCTTGCCTTTTCTTACCGTTCCTGCGTCGACTCATCTATGCATCATGTCTCGTCCGCCATCCAACTTTTCTTGGGTTTCGAAATCTGTAGCCGGGTTCGCCTTTCCACGAGAAAAATGTGAGCTAGGATATCTAGTAGACAACGCCGGACTAACTCATATAATCACTTTGTGTCATGAAGTTCCTCAGTACATTTCGGATTTCACGTCAGTTAAACATTATCACTTACCCGTCGAAGATTTAACTTCTGCAAGCTTACCTGTTATTCAGAAAGCAATGGANATTATCANNAC AGCTGAAn ] [+] EMBL CD080621 [ GCGGGCAGGGTTTGAAAACGCACTGACTTATTTACCTTGCCTTTTCTTACCGTTCCTGCGTCGACTCATCTATGCATCATGTCTCGTCCGCCATCCAACTTTTCTTGGGTTTCGAAATCTGTAGCCGGGTTCGCCTTTCCACGAGAAAAATGTGAGCTAGGATATCTAGTAGACAACGCCGGACTAACTCATATAATCACTTTGTGTCATGAAGTTCCTCAGTACATTTCGGATTTCACGT TTAAACATTATCACTTACCCGTCGAAGATTTAACTTCTGCAAGCTTACCTGTTATTCAGAAAGCAATGGAAATTATCA AACAAGCTGAAACAAATAATGAAAAAGTTGGAGTTCATTGTCAACTGGGTAGAGGTCGTGCAGGAACAATTTTAGCGTGTTATCTTGCCTACAAGAACAATCTTGATGCCGATCAAGCCATCATGGAATTGCGTCGACTTAGGCCGAAATCAATTGACGATGATCAGGAAGAAGCTGTGAGACGATATGTGAAATCAATCAAACAGTAATGACGTAAATTGGTTGAAGAAAACATGTTACTCATGC AATAA ] [-] EMBL AI395637 [ CTTACCTGTTATTCGGAAAGCAATGGAAATTATCA AACAAGCTGAAACAAATAATGAAAAAGTTGGAGTTCATTGTCAACTGGGTAGAGGTCGTGCAGGAACAATTTTAGCGTGTTATCTTGCCTACAAAAACAATCTTGATGCCGATCAAGCCATCATGGAATTGCGTCGACTTAGGCCGAAATCAATTGACGATGATCAGGAAGAAGCTGTGAGACGATATGTGAAATCAATCAAACAGTAATGACGTAAATTGGTTGAAGAAAACATGTTACTCATGC AATAAATTGTAATTTAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAA] [-] EMBL CD074531 [ GGCCGAAATCAATTGTCGATGATCAGGAAGAAGCTGTGGGACGATATGTGAAGTCAATCAAACAGTAATGACGTAAATTGGTTGAAGAAAACATGTTACTCATGCGAATAAA ] consensusID : consensus_11307#2 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 5 consensus length = 537 fasta sequence [AAGGTTCGCAGGGCACACAACCCGCGCTGGTTACGGATATCTACGATTCCTAAGCGTACCGTTATGCTTTTGCTCGATATGCGTTCTACACTGTTATGTTTCATTTTATGTATATCTAGTTCTGTCGTGCTTGCTAGAAAAGAAATCAATGAACTTGCCACAGCTAAACCTAGTACTTTTAATGTAGATGGTTGCTTGTTATTATCAGCTATCATGAAGATTCACATATCAAAATCAGACCCTGTTAAACAATCAGAATCGGTGTTTACAACATACATCAATTCAACAAATGCTAAAAGCATCAATTCCAGCGGCGAATGCATGAATTCCACCAGCAGAGAATACAACCTCTTAAACTTGTGTTGGAAGCCGAATGGTTCTGAGGGCAATTGGAATATATCATTTAATTTCTCTGAGACCTATCCTGGTTATTATGGTTTGACTAGCGTATACTTATTGTACTGGCTGGATAAATTGGGTCCACATAATGCTTCTACGGATAAATCACTTTTTTCTTGTGCTATTGGTACATCATTT] [+] EMBL CD060769 [AAGGTTCGCAGGGCACACAACCCGCGCTGGTTACGGATATCTACGATTCCTAAGCGTACCGTTATGCTTTTGCTCGATATGCGTTGTACACTGTTATGTTTCATTTTATGTATATCTAGTTCTGTCGTGCTTGCTAGAAAAGAAATCAATGAACTTGCCACAGCTAAACCTAGTACTTTTAATGTAGATGGTTGCTTGTTATTATCAGCTATCATGAAGATTCACATATCAAAATCAGACCCTGTTAAACAATCAGAATCGGTGTTTACAACATACATCAATTCAACAAATGCTAAAAGCATCAATTCCAGCGGCGAATGCATGAATTCCACCAGCAGAGAATACAACCTCTTAAACTTGTGTTGGAGGCCGAATGGTTCTGAGGGCAATTGGAATATATCATTTAATTTCTCTGAGACCTATCCTGGTTATTATGGTTTGACTAGCGTATACTTATTGTACTGGCTGGATAAATTGGGTCCACATAATGCTTCTACGGATAAATCACTTTTTTCTTGTGCTATTGGTACATCATTT] [+] EMBL BF936356 [ TATCTACGATTCCTAAGCGTACCGTTATGCTTTTGCTCGATATGCGTTCTACACTGTTATGTTTCATTTTATGTATATCTAGTTCTGTCGTGCTTGCTAGAAAAGAAATCAATGAACTTGCCACAGCTAAACCTAGTACTTTTAATGTAGATGGTTGCTTGTTATTATCAGCTATCATGAAGATTCACATATCAAAATCAGACCCTGTTAAACAATCAGAATCGGTGTTTACAACATACATCAATTCAACAAATGCTAAAAGCATCAATTCCAGCGGCGAATGCATGAATTCCACCAGCAGAGAATACAACCTCTTAAACTTGTGTTGGAAGCCGAATGGTTCTGAGGGCAATTGGAATATATCATTTAATTTCTCTGAGACCTATCCTGGTTATTATGGTTTGACTAG ] [+] EMBL AW017064 [ TATCTACGATTCCTAAGCGTACCGTTATGCTTTTGCTCGATATGCGTTCTACACTGTTATGTTTCATTTTATGTATATCTAGTTCTGTCGTGCTTGCTAGAAAAGAAATCAATGAACTTGCCACAGCTAAACCTAGTACTTTTAATGTAGATGGTTGCTTGTTATTATCAGCTATCATGAAGATTCACATATCAAAATCAGACCCTGTTAAACAATCAGAATCGGTGTTTACAACATACATCAATTCAACAAATGCTAAAAGCATCAATTCCAGCGGCGAATGCATGAATTCCACCAGCAGAGAATACAACCTCTTAAACTTGTGTTGGAAGCCGAATGGTTCTGAGGGCAATTGGAATATATCA ] [-] EMBL CD061000 [ CTCGATATGCGTTATACACTGTTATGTTTCATTTTATGTATATCTAGTTCTGTCGTGCTTGCTAGAAAAGAAATCAATGAACTTGCCACAGCTAAACCTAGTACTTTTAATGTAGATGGTTGCTTGTTATTATCAGCTATCATGAAGATTCACATATCAAAATCAGACCCTGTTAAACAATCAGAATCGGTGTTTACAACATACATCAATTCAACAAATGCTAAAAGCATCAATTCCAGCGGCGAATGCATGAATTCCACCAGCAGAGAATACAACCTCTTAAACTTGTGTTGGAAGCCGAATGGTTCTGAGGGCAATTGGAATATATCA ] [+] EMBL AI067046 [ TGAAGATTCACATATCAAAATCAGACCCTGTTAAACAATCAGAATCGGTGTTTACAACATACATCAATTCAACAAATGCTAAAAGCATCAATTCCAGCGGCGAATGCATGAATTCCACCAGCAGAGAATACAACCTCa ] consensus multiple alignement with clustalw CLUSTAL W (1.82) multiple sequence alignment
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| Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) | ||||