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Schistosoma mansoni
cluster # 11315 cluster # 11315       Sequences # 51       consensus # 3


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_11315#0 length = 1155 sequences # 47  
consensus_11315#1 length = 718 sequences # 3  
consensus_11315#2 length = 462 sequences # 1  

consensusID : consensus_11315#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 47
consensus length = 1155
fasta sequence
                              [NTCGGACGACCCTAGAG-GATCTCCTCATAGGTTCGCAGGGATAACGGCGCGTAACCAATAGTAGGTCGTCGCGCGTGGTTGTCCTGTTAGTCCTTTGTCGGTCGTTTCGTCTCACTATGAACGG-GAAAAGTGGGGCCGGTGATAAAAATCAGTGTTCTCC-TAGTACATCATGTGAGTCTACCACTGAATCGTCAG-ATATGACCTCAAAGGATTACTATTTTGACTCATACGCGCATTTCGGAATTCATGAGGAAATGCTAAAGGATGAAATTAGAACACTCACCTACCGCAGTGCTTTAATTCACAACAAACACCTTGTAAGAGATAAGGTAGTGCTTGATGTA-GGTTGTGGAACCGCCATC-CTCTGTTTGTTTGCAATTAAAG-CCGGGGCCAAGCATGCTATTGGAATTGACTGTTCTAACATTATCGACCGGGCAATGGAAGTCGTCCGAGCTAACAAT-ATGGCGGACCGTATCACTCTGATCAAAGGAAAAGTAGAAGAGGTGGAACTACCTCCAGAATACCCCAAGGTTGACATAGTCATCAGTGAATGGATGGGTTACTG-TCTTTTTTACGAGTCAATGTTGAATACTGTTATTTATGCTAGAGACAAATGGTTGGCACCTGGTGGCATAATTATGCCTGATCGTGCAACTCTGTATGTTTGTGCTATCGAAGATAGACAGTACAAAGAT-GAAAAAATTAATTGGTGGGACAGCGTGTACGGCTTCGACATGAGTTGTATAAGGAAAGTTGCACTTACAGAACCTTTGGTTGATGTTGTTGATCCTAACCAGGTTGTGACTAATTGCTGTTTAGTCAAGGAAGTGGACATGTACACTATCACAGTCCCCGAGTTAACATTCAGTGCACCATTTACACTTACCTGCAAAAGAAATGATTATATTCAAGCCTTGGTTACGTTTTTCAATATAGACTTCACTTCTTGCCATAAACCTACAGGATTTTCAACAGGTCCTGATGAGCGCCGCTACACACATTGGAAACAAACAGTTTTTTATCTTGATAATGGCGATGACGACTGTCT-AACTGTCAAGA-AAGGAGAACAAATTAATGGTGTGATGTCTATTAAACCGAATGAACGAAATAACCGTGATCTTGATATCAACATCAAAGTAGAATTCGAGGGAGAAC]

[+] EMBL CD060774             [NTCGGACGACCCTAGAG GATCTCCTCATAGGTTCGCAGGGATAACGGCGCGTAACCAATAGTAGGTCGTCGCGCGTGGTTGTCCTGTTAGTCCTTTGTCGGTCGTTTCGTCTCACTATGAACGG GAAAAGTGGGGCCGGTGATAAAAATCAGTGTTCTCC TAGTACATCATGTGAGTCTACCACTGAATCGTCAG ATATGACCTCAAAGGATTACTATTTTGACTCATACGCGCATTTCGGAATTCATGAGGAAATGCTAAAGGATGAAATTAGAACACTCACCTACCGCAGTGCTTTAATTCACAACAAACACCTTGTAAGAGATAAGGTAGTGCTTGATGTA GGTTGTGGAACCGCCATC CTCTGTTTGTTTGCAATTAAAG CCGGGGCCAAGCATGCTATTGGAATTGACTGTTCTAACATTATCGACCGGGCAATGGAAGTCGTCCGAGCTAACAAT ATGGCGGACCGTATCACTCTGATCAAAGGAAAAGTAGAAGAGGTGGAACTACCTCCAGAATACCCCAAGGTTGACATAGTCATCAGTGAATGGATGGGTTACTG TCTTTTTTACGAGTCAAT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               ]
[+] EMBL CD060819             [  cagnCGACTCTAGAGTGATCCCCTCATAGGTTCGCAGGGATAACGGCGCGTAACCAATAGTAGGTCGTCGCGCGTGGTTGTCCTGTTAGTCCTTTGTCGGTCGTTTCGTCTCACTATGAACGG GAAAAGTGGGGCCGGTGATAAAAATCAGTGTTCTCC TAGTACATCATGTGAGTCTACCACTGAATCGTCAG ATATGACCTCAAAGGATTACTATTTTGACTCATACGCGCATTTCGGAATTCATGAGGAAATGCTAAAGGATGAAATTAGAACACTCACCTACCGCAGTGCTTTAATTCACAACAAACACCTTGTAAGAGATAAGGTAGTGCTTGATGTA GGTTGTGGAACCGCCATC CTCTGTTTGTTTGCAATTAAAG CCGGGGCCAAGCATGCTATTGGAATTGACTGTTCTAACATTATCGACCGGGCAATGGAAGTCGTCCGAGCTAACAAT ATGGCGGACCGTATCACTCTGATCAAAGGAAA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          ]
[+] EMBL CD113301             [                                              GGCGCGTAACCAATAGTAGGTCGTCGCGCGTGGTTGTCCTGTTAGTCCTTTGTCGGTCGTTTCGTCTCACTATGAACGG G AAAGTGGGGCCGGTGATAAAAATCAGTGTTCTCC TAGTACATCATGTGAGTCTACCACTGAATCGTCAG ATATGACCTCAAAGGATTACTATTTTGACTCATACGCGCATTTCGGAATTCATGAGGAAATGCTAAAGGATGAAATTAGAACACTCACCTACCGCAGTGCTTTAATTCACAACAAACACCTTGTAAGAGATAAGGTAGTGCTTGATGTA GGTTGTGGAACCGCCATC CTCTGTTTGTTTGCAATTAAAG CCGGGGCCAAGCATGCTATTGGAATTGACTGTTCTAACATTATCGACCGGGCAATGGAAGTCGTCCGAGCTAACAAT ATGGCGGACCGTATCACTCTGATCAAAGGAAAAGTAGAAGAGGTGGAACTACCTCCAGAATACCCCAAGGTTGACATAGTCATCAGTGAATGGATGGGTTACTG TCTTTTTTACGAGTCAATGTTGAATACTGTTATTTATGCTAGAGACAAATGGTTGGCACCTGGTGGCATAATTATGCCTGATCGTGCAACTCTGTA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 ]
[+] EMBL CD113341             [                                              GGCGCGTAACCAATAGTAGGTCGTCGCGCGTGGTTGTCCTGTTAGTCCTTTGTCGGTCGTTTCGTCTCACTATGAACGG GAAAAGTGGGGCCGGTGATAAAAATCAGTGTTCTCC TAGTACATCATGTGAGTCTACCACTGAATCGTCAG ATATGACCTCAAAGGATTACTATTTTGACTCATACGCGCATTTCGGAATTCATGAGGAAATGCTAAAGGATGAAATTAGAACACTCACCTACCGCAGTGCTTTAATTCACAACAAACACCTTGTAAGAGATAAGGTAGTGCTTGATGTA GGTTGTGGAACCGCCATC CTCTGTTTGTTTGCAATTAAAG CCGGGGCCAAGCATGCTATTGGAATTGACTGTTCTAACATTATCGACCGGGCAATGGAAGTCGTCCGAGCTAACAAT ATGGCGGACCGTATCACTCTGATCAAAGGAAAAGTAGAAGAGGTGGAACTACCTCCAGAATACCCCAAGGTTGACATAGTCATCAGTGAATGGATGGGTTACTG TCTTTTTTACGAGTCAATGTTGAATACTGTTATTTATGCTAGAGACAAATGGTTGGCACCTGGTGGCATAATTATGCCTGATC                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              ]
[+] EMBL CD147986             [                                              GGCGCGTAACCAATAGTAGGTCGTCGCGCGTGGTTGTCCTGTTAGTCCTTTGTCGGTCGTTTCGTCTCACTATGAACGG GAAAAGTGGGGCCGGTGATAAAAATCAGTGTTCTCC TAGTACATCATGTGAGTCTACCACTGAATCGTCAG ATATGACCTCAAAGGATTACTATTTTGACTCATACGCGCATTTCGGAATTCATGAGGAAATGCTAAAGGATGAAATTAGAACACTCACCTACCGCAGTGCTTTAATTCACAACAAACACCTTGTAAGAGATAAGGTAGTGCTTGATGTA GGTTGTGGAACCGCCATCACTCTGTTTGTCTGCAATTAAAG CCGGGGCCAAGCATGCTATTGGAATTGACTGTTCTAACATTATCGACCGGGCAATGGAAGTCGTCCGAGCTAACAAT ATGGCGGACCGTATCACTCTGATCACAGGAAAAGTAGAAGAGGTGGAACTACCT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    ]
[+] EMBL CD161344             [                                              GGCGCGTAACCAATAGTAGGTCGTCGCGCGTGGTTGTCCTGTTAGTCCTTTGTCGGTCGTTTCGTCTCACTATGAACGG GAAAAGTGGGGCCGGTGATAAAAATCAGTGTTCTCC TAGTACATCATGTGAGTCTACCACTGAATCGTCAG ATATGACCTCAAAGGATTACTATTTTGACTCATACGCGCATTTCGGAATTCATGAGGAAATGCTAAAGGATGAAATTAGAACACTCACCTACCGCAGTGCTTTAATTCACAACAAACACCTTGTAAGAGATAAGGTAGTGCTTGATGTA GGTTGTGGAACCGCCATC CTCTGTTTGTTTGCAATTAAAG CCGGGGCCAAGCATGCTATTGGAATTGACTGTT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       ]
[+] EMBL CD161215             [                                              GGCGCGTAACCAATAGTAAGTCGTCGCGCGTGGTTGTCCTGTTAGTCCTTTGTCGGTCGTTTCGTCTCACTATGAACGG GAAAAGTGGGGCCGGTGATAAAAATCAGTGTTCTCC TAGTACATCATGTGAGTCTACCACTGAATCGTCAG ATATGACCTCAAAGGATTACTATTTTGACTCATACGCGCATTTCGGAATTCATGAGGAAATGCTAAAGGATGAAATTAGAACACTCACCTACCGCAGTGCTTTAATTCACAACAAACACCTTGTAAGAGATAAGGTAGTGCTTGATGTA GGTTGTGGAACCGCCATC CCCTGTTTGTTTGCAATTAAAG CCGGGGCCAAGCATGCTATTGGAATTGACTGTT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       ]
[+] EMBL CD161081             [                                              GGCGCGTAACCAATAGTAGGTCGTCGCGCGTGGTTGTCCTGTTAGTCCTTTGTCGGTCGTTTCGTCTCACTATGAACGG GAAAAGTGGGGCCGGTGATAAAAATCAGTGTTCTCC TAGTACATCATGTGAGTCTACCACTGAATCGTCAG ATATGACCTCAAAGGATTACTATTTTGACTCATACGCGCATTTCGGAATTCATGAGGAAATGCTAAAGGATGAAATTAGAACACTCACCTACCGCAGTGCTTTAATTCACAACAAACACCTTGTAAGAGATAAGGTAGTGCTTGATGTA GGTTGTGGAACCGCCATC CCCTGTTTGTTTGCAATTAAAG CCGGGGCCAAGCATGCTATTGGAATTGACTGTT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       ]
[-] EMBL CD122857             [                                               GCGCGTAACCAATAGTAGGTCGTCGCGCGTGGTTGTCCTGTTAGTCCTTTGTCGGTCGTTTCGTCTCACTATGAACGG GAAAAGTGGGGCCGGTGATAAAAATCAGTGTTCTCC TAGTACATCATGTGAGTCTACCACTGAATCGTCAG ATATGACCTCAAAGGATTACTATTTTGACTCATACGCGCATTTCGGAATTCATGAGGAAATGCTAAAGGATGAAATTAGAACACTCACCTACCGCAGTGCTTTAATTCACAACAAACACCTTGTAAGAGATAAGGTAGTACTTGATGTA GGTTGTGGAACCGCCATC CTCTGTTTGTTTGCAATTAAAG CCGGGGCCAAGCATGCTATTGGAATTGACTGTTC                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      ]
[-] EMBL CD179454             [                                               GCGCGTAACCAATAGTAGGTCGTCGCGCGTGGTTGTCCTGTTAGTCCTTTGTCGGTCGTTTCGTCTCACTATGAACGG GAAAAGTGGGGCCGGTGATAAAAATCAGTGTTCTCC TAGTACATCATGTGAGTCTACCACTGAATCGTCAG ATATGACCTCAAAGGATTACTATTTTGACTCATACGCGCATTTCGGAATTCATGAGGAAATGCTAAAGGATGAAATTAGAACACTCACCTACCGCAGTGCTTTAATTCACAACAAACACCTTGTAAGAGATAAGGTAGTGCTTGATGTA GGTTGTGGAACCGCCATC CTCTGTTTGTTTGCAATTAAAG CCGGGGCCAAGCATGCTATTGGAATTGACTGTTC                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      ]
[+] EMBL CD179511             [                                                 GCGTAACCAATAGTAGGTCGTCGCGCGTGGTTGTCCTGTTAGTCCTTTGTCGGTCGTTTCGTCTCACTATGAACGG GAAAAGTGGGGCCGGTGATAAAAATCAGTGTTCTCC TAGTACATCATGTGAGTCTACCACTGAATCGTCAG ATATGACCTCAAAGGATTACTATTTTGACTCATACGCGCATTTCGGAATTCATGAGGAAATGCTAAAGGATGAAATTAGAACACTCACCTACCGCAGTGCTTTAATTCACAACAAACACCTTGTAAGAGATAAGGTAGTGCTTGATGTA GGTTGTGGAACCGCCATC CTCTGTTTGTTTGCAATTAAAG CCGGGGCCAAGCATGCTATTGGAATTGACTGTT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       ]
[-] EMBL CD188329             [                                                  CGTAACCAATAGTAGGTCGTCGCGCGTGGTTGTCCTGTTAGTCCTTTGTCGGTCGTTTCGTCTCACTATGAACGG GAAAAGGGGGGCCGGTGATAAAAATCAGTGTTCTCC TAGTACATCATGTGAGTCTACCACTGAATCGTCAG ATATGACCTCAAAGGATTACTATTTTGACTCATACGCGCATTTCGGAATTCATGAGGAAATGCTAAAGGATGAAATTAGAACACTCACCTACCGCAGTGCTTTAATTCACAACAAACACCTTGTAAGAGATAAGGTAGTGCTTGATGTA GGTTGTGGAACCGCCATC CTCTGTTTGTTTGCAATTAAAGACCGGGGCCAAGCATGCTATTGGAATTGACTGTTCTAACATTATCGACCGGGCAATGGAAGTCGTCCGAGCTAACAAT ATGGCGGACCGTATCACTCTGATCAAAGGAAAAGAAGAAGAGGTGGAACTACCTC                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   ]
[-] EMBL CD189087             [                                                   GTAACCAATAGTAGGTCGTCGCGCGTGGTTGTCCTGTTAGTCCTTTGTCGGTCGTTTCGTCTCACTATGAACGG GAAAAGTGGGGCCGGTGATAAAAATCAGTGTTCTCC TAGTACATCATGTGAGTCTACCACTGAATCGTCAG ATATGACCTCAAAGGATTACTATTTTGACTCATACGCGCATTTCGGAATTCATGAGGAAATGCTAAAGGATGAAATTAGAACACTCACCTACCGCAGTGCTTTAATTCACAACAAACACCCTGTAAGAGATAAGGTAGTGCTTGATGTA GGTTGTGGAACCGCCATC CTCTGTTTGTTTGCAATTAAAG CCGGGGCCAAGCATGCTATTGGAATTGACTGTTCTAACA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 ]
[+] EMBL CD125644             [                                                                                        TAGTCCTTTGTCGGTCGATTCGTCTCACTATGAACGG GAAAAGTGGGGCCGGCGATAAAAATCAGTGTTCTCC TAGTACATCATGTGAGTCTACCACTGAATCGTCAG ATATGACCTCAAAGGATTACTATTTTGACTCATACGCGCATTTCGGAATTCATGAGGAAATGCTAAAGGATGAGATTAGAACACTCACCTACCGCAGTGCTTTAATTCACAACAAACACCT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               ]
[+] EMBL CD125645             [                                                                                        TAGTCCTTTGTCGGCCGCTTCGTCTCACTATGAACGGCCAAAAGTGGGGGCGGCGATAGAAATCAGCGTTCTCCATAGTACATCATGTGAGTCTACCACTGAGACGCCGG ATATGACCTCAAAGGATTACTATTTTGACTCATACGCGCATTTCGGAATTCATGAGGAAATGCTAGAGGATGAAATTAGAACACTCACCTACCGCAGTGCTTTAATTCACAACAAACACCTTGTAAGAGATAAGGTAGTGCTTGATGTA GGTTGTGGAACCGCCATC CTCTGTTTGTTTGCAATTAAAG CCCGGGCCAAGCATGCTATTGGAATTGACTGTTCTAACATTATCGNACGGGCAATGGAAGTCGTCCGAGCTAACAATGATGGCGGACCGTATCACTCTGATCAAAGGAAAAGTAGAAGAGGTGGAACTACt                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     ]
[+] EMBL CD114383             [                                                                                                                                       acagaGTGGTAAAAATCAGTGTTCTCC TAGTACATCATGTGAGTCTACCACTGAATCGTCAG ATATGACCTCAAAGGATTACTATTTTGACTCATACGCGCATTTCGGAATTCATGAGGAAATGCTATAGGATGAAATTAGAACACTCACCTACCGCAGTGCTTTAATTCACAACAAACACCTTGTAAGAGATAAGGTAGTGCTTGATGTA GGTTGTGGAACCGCCATC CTCTGTTTGTTTGCAATTACAG CCGGGGCCAAGCATGCTATTGGAATTGACTGTCCTAACATTATCGACCGGGCAATGGAAGTCGTCCGATCTTTCAAT A                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         ]
[+] EMBL CD114564             [                                                                                                                                                           GTTCTCC TAGTACATCATGTGAGTCTACCACTGAATCGTCAG ATATGACCTCAAAGGATTACTATTCTGACTCATACGCGCATTTCGGAATTCATGAGGAAATGCTAAAGGATGAAATTAGAACACTCACCTACCGCAGTGCTTTTATTCACAACAAACACCTTGTAAGAGATAAGGTAGTGCTTGATGTA CGTTGTGGAACCGCCATC CTCTGTTTGTTTGCAATTAAAG CC GGGCC TGCATGCTATTGGAATTGACTG TCT ACATTATCGACCGGGCAATGGAAGTCGTCCGAGCTAACAAT A                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         ]
[+] EMBL CD114512             [                                                                                                                                                           GTTCTCC TAGTACATCATGTGAGTCTACCACTGAATCGTCAG ATATGACCTCAAAGGATTACTATTTTGACTCATACGCGCATTTCGGAATTCATGAGGAAATGCTTATGGATGAAATTAGAACACTCACCTACCGCAGTGCTTTAATTCACAACAAACACCTTGTAAGAGATAAGGTAGTGCTTGATGTA GGTTGTGGAACCGCCATC CTCTGTTTGTTTGCAATTAAAG CCGGGGCCAAGCATGCTATTGGAATTGACTGTTCTAACATTATCGACCGGGCAATGGAAGTCGTCCGAGCTAACAAT A                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         ]
[+] EMBL CD114497             [                                                                                                                                                           GTTCTTC TAGTACATCATGTGAGTCTACCACTGAATCGTCAG ATATGACCTCAAAGGATTACTATTTTGACTCATACGCGCATTTCGGAATTCATGAGGAAATGCTAAAGGATGAAATTAGAACACTCACCTACCGCAGTGCTTTAATTCACAACAAACACCTTGTAAGAGATAAGGTAGTGCTCGATGTA GGTTGTGGAACCGCCATC CTCTGTTTGTTTGCAATTAAAG CCGGGGCCAAGCATGCTATTGGAATTGACTGTTCTAACATTATCGACCGGGCAATGGAAGTCGTCCGAGCTAACAAT A                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         ]
[+] EMBL CD114419             [                                                                                                                                                           GTTCTCC TAGTACATCATGTGAGTCTACCACTGAATCGTCAG ATATGACCTCAAAGGATTACTATTTTGACTCATACGCGCATTTCGGAATTCATGAGGAAATGCTATTTGATGAAATTAGAACACTCACCTACCGCAGTGCTTTAATTCACAACAAACACCTTGTAAGAGATAAGGTAGTGCTTGATGTA GGTTGTGGAACCGCCATC CTCTGTTTGTTTGCAATTAAAG CCGGGGCCAAGCATGCTATTGGAACTGACTGTTCTAACATTATCGACCGGGCAATGGAAGTCGTCCGAGCTAACAAT A                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         ]
[+] EMBL CD114522             [                                                                                                                                                           GTTCTCC TAGTACATCATGTGAGTCTACCACTGAATCGTCAG ATATGACCTCAAAGGATTACTATTTTGACTCATACGCGCATTTCGGAATTCATGAGGAAATGCTAAAGGATGAAATTAGAACACTCACCTACCGCAGTGCTTTAATTCACAACAAACACCTTGTAAGAGATAAGGTAGTGCTTGATGTA GGTTGTGGAACCGCCATC CTCTGTTTGTTTGCAATTAAAG CCGGGGCCAAGCATGCTATTGGAATTGACTGTTCTAACATTATCGACCGGGCAATGGAAGTCGTCCGAGCTAACAAT A                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         ]
[+] EMBL CD114554             [                                                                                                                                                           GTTCTCC TAGTACATCATGTGAGTCTACCACTGAATCGTCAG ATATGACCTCAAAGGATTACTATTTTGACTCATACGCGCATTTCGGAATTCATGAGGAAATGCTAAAGGATGAAATTAGAACACTCACCTACCGCAGTGCTTTAATTCACAACAAACACCTTGTAAGAGATAAGGTAGTGCTTGATGTA GGTTGTGGAACCGCCATC CTCTGTTTGTTTGCAATTAAAG CCGGGGCCAAGCATGCTATTGGAATTGACTGTTCTAACATTATCGACCGGGCAAAGGAAGTCGTCCGAGCTAACAAT A                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         ]
[-] EMBL CD114559             [                                                                                                                                                            TTCTCC TAGTACATCATGTGAGTCTACCACTGAATCGTCAG ATATGACCTCAAAGGATTACTATTTTGACCCATACGCGCATTTCGGAATTCATGAGGAAATGCTAAAGGATGAAATTAGAACACTCACCTACCGCAGTGCTTTAATTCACAACAAACACCTTGTAAGAGATAAGGTAGTGCTTGATGTA GGTTGTGGAACCGCCATC CTCTGTTTGTTTGCAATTAAAG CCGGGGCCAAGCATGCTATTGGAATTGACTGTTCTAACATTATCGACCGGGCAATGGAAGTCGTCCGAGCTAACAAT AT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        ]
[-] EMBL CD114560             [                                                                                                                                                            TTCTCC TAGTACATCATGTGAGTCTACCACTGAATCGTCAG ATATGACCTCAAAGGATTACTATTTTGACTCATACGCGCATTTCGGAATTCATGAGGAAATGCTAACGGATGAAATTAGAACACTCACCTACCGCAGTGCTTTAATTCACGACAAACACCTTGTAAGAGATAAGGTAGTGCTTGATGTA GGTTGTGGAACCGCCATC CTCTGTTTGTTTGCAATTAAAG CCGGGGCCAAGCATGCTATTGGAATTGACTGTTCTAACATTATCGACCGGGCAATGGAAGTCGTCCGAGCTAACAAT AT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        ]
[-] EMBL CD152831             [                                                                                                                                                                 C TAGTACATCATGTGAGTCTACCACTGAATCGTCAG ATATGACCTCAAAGGATTACTATTTTGACTCATACGCGCATTTCGGAATTCATGAGGAAATGTTAAAGGATGAAATTAGAACACTCACCTACCGCAGTGCTTTAATTCACAACAAACACCTTGTAAGAGATAAGGTAGTGCTTGATGTA GGTTGTGGAACCGCCATC CTCTGTTTGTTTGCAATTAAAG CCGGGGCCAAGCATGCTATTGGAATTGACTGTTCTAACATTATCGACCGGGCAATGGAAGTCGTCCGAGCTAACAAT ATGGCGG                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   ]
[-] EMBL CD124361             [                                                                                                                                                                                gggacgACCACTGAATCGTCAG ATATGACCTCAAAGGATTACTATTTTGACTCATACGCGCATTTCGGAATTCATGAGGAAATGCTAAAGGATGAAATTAGAACACTCACCTACCGCAGTGCTTTAATTCACAACAAACACCTTGTAAGAGATAAGGTAGTGCTTGATGTA GGTTGTGGAACCGCCATC CTCTGTTTGTTTGCAATTAAAG CCGGGGCCAAGCATGCTATTGGAATTGACTGTTCTAACATTATCGTCCct                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      ]
[-] EMBL CD114402             [                                                                                                                                                                                                   CAGAATATGACCTCAAAGGATTAATATTTTGAATCATACGCGCATTTCGGAATTCATGAGGAAATGATAAAGGATGGAATTAGGACACTCACCTACCGCAGTGCTTTAATTCCCAACAAACACCTTGTAGGNGCTAAGGTAGTGCTTGATGTA GGTTGTGGAACAAACATC CTCTGTTTGTTAGCAATTAAAG CCAGGGCCAAGCATGCTATTGGAATTGNCTGTTCTAACATTATCGACCGGGCAATGGAAGTCGTCCGAGCTAACAAT AT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        ]
[+] EMBL CD165552             [                                                                                                                                                                                                                                                                                            CACCTACCGCAGTGCTTTAATTCACAACAAACACCTTGTAAGAGATAAGGTAGTGCTTGATGTA GGTTGTGGAACCGCCATC CTCTGTTTGTTTGCAA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               ]
[-] EMBL CD113420             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                               ATTCACAACAAACACCTTGTAAGAGATAAGGTAGTGCTTGATGTA GGTTGTGGAACCGCCATC ATCTGTTTGTTTGCAATTAAAG CCGGGGCCAAGCATGCTATTGGAATTGACTGTTCTAACATTATCGACCGGGCAATGGAAGTCGTCCGAGCTAACAAT ATGGCGGACCGTATCACTCTGATCAAAGGAAAAGTAGAAGAGGTGGAACTACCTCCAGAATACCCCAAGGTTGACATAGTCATCAGTGAATGGATGGGTTACTG TCTTTTTTACGAGTCAATGTTGAATACTGTTATTTATGCTAGAGACAAATGGTTGGCACCTGGTGGCATAATTATGCCTGATCGTGCAACTCTGTATGTTTGTGCTATCGAAGATAGACAGTACAAAGAT GAAAAAATTAATTGGTGGGACAGCGTGTACGGCTTCGACATGAGTTGTATAAGGAAAGTTGCACTTACAGGACCTTTGGTTGATGTTGTTGATCCTAACCAGGTTGTGACTAATTGCTGTTTAGTCAAGGAAGTGGACATGTACACTATCACAGTCCCCGAGTTAACATTCAGTGCACCATT                                                                                                                                                                                                                                                                                        ]
[-] EMBL CD140006             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         AACANCCTGTAGNAGATAAGGTAGTGC TGATGTAGGGTTGTGGAACCGCCATC CTCTGTTTGTTTGCAATTAAAG CCGGGGCCAAGCATGCTATTGGAATTGACTGTTCTAACATTATCGACCGGGCAATGGAAGTCGTCCGAGCTAACAAT ATGGCGGACCGTATCACTCTGATCAAAGGAAAAGTAGAAGAGGTGGAACTACCTCCAGAATACCCCAAGGTTGACATAGTCATCAGTGAATGGATGGGTTACTG TCTTTTTTACGAGTCAATGTTGAATACTGTTATTTATGCTAGAGACAGATGGTTGGCACCTGGTGGCATAATTATGCCTGATCGTGCAACTCTGTATGTTTGTGCTATCGAAGATAGACA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         ]
[+] EMBL CD155452             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             CCTTGTAAGAGATAAGGTAGTGCTTGATGTA GGTTGTGGAACCGCCATC CTCTGTTTGTTTGCAATTAAAG CCGGGGCCAAGCATGCTATTGGAATTGACTGTTCTAACATTATCGACCGAGCAATGGAAGTCGTCCGAGCTAACAAT ATGGCGGACCGTATCACTCTGATCAAAGGAAAAGTAGAAGAGGTGGAACTACCTCCAGAATACCCCAAGGTTGACATAGTCATCAGTGAATGGATGGGTTACTG TCTTTTTTACGAGTCAATGTTGAATACTGTTATTTATGCTAGAGACAAATGGTTGGCACCTGGTGGCATAATTATGCCTGATCGTGCAACTCTGTATGTTTGTGCTATCGAAGATAGACAGT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       ]
[-] EMBL CD113276             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               TTGTAAGAGATAAGGTAGTGCTTGATGTA GGTTGTGGAACCGCCATC CTCTGTTTGTTTGCAATTAAAG CCGGGGCCAAGCATGCTATTGGAATTGACTGTTCTAACATTATCGACCGGGCAATGGAAGTCGTCCGAGCTAACAAT ATGGCGGACCGTATCACTCTGATCAAAGGAAAGGTAGAAGAGGTGGAACTACCTCCAGAATACCCCAAGGTTGACATAGTCATCAGTGAATGGATGGGTTACTG TCTTTTTTACGAGTCAATGTTGAATACTGTTATTTATGCTAGAGACAAATGGTTGGCACCTGGTGGCATAATTATGCCTGATCGTGCAACTCTGTATGTTTGTGCTATCGAAGATAGACAGTACAAAGAT GAAAAAATTAATTGGTGGGACAGCGTGTACGGCTTCGACATGAGTTGTATAAGGAAAGTTGCACTTACAGAACCTTTGGTTGATGTTGTTGATCCTAACCAGGTTGTGACTAATTGCTGTTTAGTCAAGGAAGTGGACATGTACACTATCACAGTCCCCGAGTTAACATTCAGTGCACCATT                                                                                                                                                                                                                                                                                        ]
[+] EMBL CD148194             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              C CTCTGTTTGTTTGCAATTAAAG CCGGGGCCAAGCATGCTATTGGAATTGACTGTTCTAACATTATCGACCGGGCAATGGAAGTCGTCCGAGCTAACAAT ATGGCGGACCGTATCACTCTGATCAAAGGAAAAGTAGAAGAGGTGGAACTATCT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    ]
[-] EMBL CD113355             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 GACTGTTCTAACATTATCGACCGGGCAATGGTAGTCGTCCGAGCTAACAAT ATGGCGGACCGTATCACTCTGATCAAAGGAAAAGTAGAAGAGGTGGAACTACCTCCAGAATACCCCAAGGTTGACATAGTCATCAGTGAATGGATGGGTTACTG TCTTTTTTACGAGTCAATGTTGAATACTGTTATTTATGCTAGAGACAAATGGTTGGCACCTGGTGGCATAATTATGCCTGATCGTGCAACTATGTATGTTTGTGCTATCGAAGATAGACAGTACAAAGAT GAAAAAATTAATTGGTGGGACAGCGTGTACGGCTTCGACATGAGTTGTATAAGGAAAGTTGCACTTACAGAACCTTTGGTTGATGTTGTTGATCCTAGCCAGAAAATGAATAATTGCTGTTTAGTCAAGGAAGTGAACATGTGCACTATCACAGTCCCCGAGTTAACATTCAGTGCACCATT                                                                                                                                                                                                                                                                                        ]
[+] EMBL CD123602             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      TGGCGGACCGTATCACTCTGATCAAAGGAAAAGTAGAAGAGGTGGAACTACCTCCAGAATACCCCAAGGTTGACATAGTCATCAGTGAATGGATGGGTTACTG TCTTTTTTACGAGTCAATGTTGAATACTGTTATTTATGCTAGAGACAAATGGTTGGCACCTGGTGGCATAATTATGCCTGATCGTGCAACTCTGTATGTTTGTGCTATCGAAGATAGACAGTACAAAGAT GAAAAAATTAATTGGTGGGACAGCGTGTACGGCTTCGACATGAGTTGTATAAGGAAAGTTGCACTTACAGAACCTTTGGTTGATGTTGTTGATCCTAACCAGGTTGTGACTAATTGCTGTTTAGTCAAGGAAGTGGACATGTACACTATCACAGTCCCCGAGTTAACATTCAGTGCACCATTT                                                                                                                                                                                                                                                                                       ]
[+] EMBL CD123574             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      TGGCGGACCGTATCACTCTGATCAAAGGAAAAGTAGAAGAGGTGGAACTACCTCCAGAATACCCCAAGGTTGACATAGTCATCAGTGAATGGATGGGTTACTG TCTTTTTTACGAGTCAATGTTGAATACTGTTATTTATGCTAGAGACAAATGGTTGGCACCTGGTGGCATAATTATGCCTGATCGTGCAACTCTGTATGTTTGTGCTATCGAAGATAGACAGTACAAAGAT GAAAAAATTAATTGGTGGGACAGCGTGTACGGCTTCGACACGAGTTGTATAAGGAAAGTTGCACTTACAGAACCTTTGGTTGATGTTGTTGATCCTAACCAGGTTGTGACTAATTGCTGTTTAGTCAAGGAAGTGGACATGTACACTATCACAGTCCCCGAGTTAACATTCAGTGCACCATTT                                                                                                                                                                                                                                                                                       ]
[+] EMBL CD127873             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    tCTCTGCTCAAAGTAAAAGTAGAAGAGGTGGAACTACCTCCATAATACCCCAAGGTTGACATAGTCATCATTGAATGGATGGGTTACTG TCTTTTTTACGAGTCAATGTTGAATACTGTTATTTATGCTATAGACAAATGGTTGGCACCTGGTGGCATAATTATGCCTGATCGTGCAACTCTGTATGTTTGTGCTATCGAAGATAGACAGTACAAAGATAAAAAAAATTAATTGGTGGGACAGCGTGTACGGCTTCGACATGAGTTGTATAAGGAAAGTTGCACTTACAGAACCTTTGGTTGATGTTGTTGATCCTAACCAGGTTGTGACTAATTGCTGTTTAGTCAAGGAAGTGGACATGTACACTATCACAGTCCCCGAGTTAACATTCAGTGCACCATTTACACTTACCTGCAAAAGAAATGATTATATTCAAGCCTTGGTTACGTTTTTCAATATAGACTTCACTT                                                                                                                                                                                                                    ]
[-] EMBL CD155941             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              AAGGAAAAGTAGAAGAGGTGGAACTACCTCCAGAATACCCCAAGGTTGACATAGTCATCAGTGAATGGATGGGTTACTG TCTTTTTTACGAGTCAATGTTGAATACTGTTATTTATGCTAGAGACAAATGGTTGGCACCTGGTGGCATAATTATGCCTGATCGTGCAACTCTGTATGTTTGTGCTATCGAAGATAGACAGTACAAAGAT GAAAAAATTAATTGGTGGGACAGCGTGTACGGCTTCGACATGAGTTGTATAAGGAAAGTTGCACTTACAGAACCTTTGGTTGATGTTGTTGATCCTAACCAGGTTGTGACTAATTGCTGTTTAGTCAAGGAAGTGGACATGTACACTATCACAGTCCCCGAGTTAACATTCAGTGCACCATTTACACTTACCTGCAAAAGAAATGATTATATTCAAGCCTTGGTTACGTTTTTCAATATAGACTTCACTTCTTGCCATAAACCTACAGGATTTTCAACAGGTCCTGATGAGCGCCGCTACACACATTGGAAACAAACAGTTTTTTATCTTGATAATGGCGATGACGACTGTCT AACTGTCAAGA AAGGAGAACAAATTAATGGTGTGATGTCTATTAAACCGAATGAACGAAATAACCGTGATCTTGATATC                            ]
[-] EMBL CD113428             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                GGAAAAGTAGAAGAGGTGGAACTACCTCCAGAATACCCCAAGGTTGACATAGTCATCAGTGAATGGATGGGTTACTGTTCTTTTTTACGAGTCAATGTTGAATACTGTTATTTATGCTAGAGACAAATGGTTGGCACCTGGTGGCATAATTATGCCTGATCGTGCAACTCTGTATGTTTGTGCTATCGAAGATAGACAGTACAAAGAT GAAAAAATTAATTGGTGGGACAGCGTGTACGGCTTCGACATGAGTTGTATAAGGAAAGTTGCACTTACAGAACCTTTGGTTGATGTTGTTGATCCTAACCAGGTTGTGACTAATTGCTGTTTAGTCAAGGAAGTGGACATGTACACTATCACAGTCCCCGAGTTAACATTCAGTGCACCATT                                                                                                                                                                                                                                                                                        ]
[-] EMBL CD151598             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    CCAAAGGTTGACATAGTCATCAGTGAATGGATGGGTTACTG TCTTTTTTACGAGTCAATGTTGAATACTGTTATTTATGCTAGAGACATATGGTTGGCACCTGGTGGCATAATTATGCCTGATCGTGCAACTCTGTATGTTTGTGCTATCGAAGATAGACAGTACAAAGAT GAAAAAATTAATTGGTGGGACAGCGTGTACGGCTTCGACATGAGTTGTATAAGGAAAGTTGCACTTACAGAACCTTTGGTTGATGTTGTTGATCCTAACCAGGTTGTGACTAATTGCTGTTTAGTCAAGGAAGTGGACATGTACACTATCACAGTCCCCGAGTTAACATTCAGTGCACCATTTACACTTACCTGCAAAAGAAATGATTATATTCAAGCCTTGGTTACGTTTTTCAATATAGACTTCACTTCTTGCCATAAACCTACAGGATTTTCAACAGGTCCTGATGAGCGCCGCTACACACATTGGAAACAAACAGTTTTTTATCTTGATAATGGCGATGACG                                                                                                                    ]
[+] EMBL CD198087             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            TGACATAGTCATCAGTGAATGGATGGGTTACTG TCTTTCTTACGAGTCAATGTTGAATACTGTTATTTATGCTAGAGACAAATGGTTGGCACCTGGTGGCATAATTATGCCTGATCGTGCAACTCTGTATGTTTGTGCTATCGAAGATAGACAGTACAAAGAT GAAAAAATTAATTGGTGGGACAGCGTGTACGGCTTCGACATGAGTTGTATAAGGAAAGTTGCACTTACAGAACCTTTGGTTGATGTTGTTGATCCTAACCAGGTTGTGACTAATTGCTGTTTAGTCAAGGAAGTGGACATGTACACTATCACAGTCCCCGAGTTAACATTCAGTGCACCATTTACACTTACCTGCAAAAGAAATGATTATATTCAAGCCTTGGTTACGTTTTTCAATATAGACTTCACTTCTTGCCATAAACCTACAGGATTTTCAACAG                                                                                                                                                                                      ]
[+] EMBL CD198170             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            TGACATAGTCATCAGTGAATGGGTGGGTTACTG TCTTTTTTACGAGTCAATGTTGAATACTGTTATTTATGCTAGAGACAAATGGTTGGCACCTGGTGGCATAATTATGCCTGATCGTGCAACTCTGTATGTTTGTGCTATCGAAGATAGACAGTACAAAGAT GAAAAAATTAATTGGTGGGACAGCGTGTACGGCTTCGACATGAGTTGTATAAGGAAAGTTGCACTTACAGAACCTTTGGTTGATGTTGTTGATCCTAACCAGGTTGTGACTAATTGCTGTTTAGTCAAGGAAGTGGACATGTACACTATCACAGTCCCCGAGTTAACATTCAGTGCACCATTTACACTTACCTGCAAAAGAAATGATTATATTCAAGCCTTGGTTACGTTTTTCAATATAGACTTCACTTCTTGCCATAAACCTACAGGATTTTCAACAG                                                                                                                                                                                      ]
[-] EMBL CD111979             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             GACATAGTCATCAGTGAATGGATGGGTTACTG TCTTTTTTACGAGTCAATGTTGAATACTGTTACTTATGCTAGAGACAAATGGTTGGCACCTGGTGGCATAATTATGCCTGATCGTGCAACTCTGTATGTTTGTGCTATCGAAGATAGACAGTACAAAGAT GAAAAAATTAATTGGTGGGACAGCGTGTACGGCTTCGACATGAGTTGTATAAGGAAAGTTGCACTTACAGAACCTTTGGTTGATGTTGTTGATCCTAACCAGGTTGTGACTAATTGCTGTTTAGTCAAGGAAGTGGACATGTACACTATCACAGTCCCCGAGTTAACATTCAGTGCACCATTTACACTTACCTGCAAAAGAAATGATTATATTCAAGCCTTGGTTACGTTTTTCAATATAGACTTCACTTCTTGCCATAAACCTACAGGATTTTCAACA                                                                                                                                                                                       ]
[-] EMBL CD193379             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      TACTGTTATGTATGCTAGAGACAAATGGTTGGCACCTGGTGGCATAATTATGCCTGATCGTGCAACTCTGTATGTTTGTGCTATCGAAGATAGACAGTACAAAGAT GAAAAAATTAATTGGTGGGACAGCGTGTACGGCTTCGACATGAGTTGTATAAGGAAAGTTGCACTTACAGAACCTTTGGTTGATGTTGTTGATCCTAACCAGGTTGTGACTAATTGCTGTTTAGTCAAGGAAGTGGACATGTACACTATCACAGTCCCCGAGTTAACATTCAGTG                                                                                                                                                                                                                                                                                               ]
[-] EMBL CD116971             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              ATGGTTGGCACCTGGTGGCATAATTATGCCTGATCGTGCAACTCTGTATGTTTGTGCTATCGAAGATAGACAGTACAAAGAT GAAAAAATTAATTGGTGGGACAGCGTGTACGGCTTCGACATGAGTTGTATAAGGAAAGTTGCACTTACAGAACCTTTGGTTGATGTTGTTGATCCTAACCAGGTTGTGACCAATTGCTGTTTAGTCAAGGAAGTGGACATGTACACTATCACAGTCCCCGAGTTAACATTCAGTGCACCATTTACACTTACCTGCAAAAGAAATGATTATATTCAAGCCTTGGTTACGTTTTTCAATATAGACTTCACTTC                                                                                                                                                                                                                   ]
[+] EMBL AI976366             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            GTGGCATAATTATGCCTGATCGTGCAACTCTGTATGTTTGTGCTATCGAAGATAGACAGTACAAAGAT GAAAAAATTAATTGGTGGGACAGCGTGTACGGCTTCGACATGAGTTGTATAAGGAAAGTTGCACTTACAGAACCTTTGGTTGATGTTGTTGATCCTAACCAGGTTGTGACTAATTGCTGTTTAGTCAAGGAAGTGGACATGTACACTATCACAGTCCCCGAGTTAACATTCAGTGCACCATTTACACTTACCTGCAAAAGAAATGATTATATTCAAGCCTTGGTTACGTTTTTCAATATAGACTTCACTTCTTGCCATAAACCTACAGGATTTTCAACAGGTCCTGATGAGCGCCGCTACACACATTGGAAACAAACAGTTTTTTATCTTGATAATGGCGATGACGACTGTCT AACTGTCAAGA AAGGAGAACAAATTAATGGTGTGATGTCTATTAAACCGAATGAACGAAATAACCGTGATCTTGATATCAACATCAAAGTAGAATTCGAGGGAGAAC]
[+] EMBL CD136579             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          TGTACGGCTTCGACATGAGTTGTATAAGGAAAGTTGCACTTACAGAACCTTTGGTTGATGTTGTTGATCCTAACCAGGTTGTGACTAATTGCTGTTTAGTCAAGGAAGTGGACATGTACACTATCACAGTCCCCGAGTTAACATTCAGTGCACCATTTACACTTACCTGCAAAAGAAATGATTATATTCAAGCCTTGGTTACGGTTCTCAATATAGACTTCACTTCTTGCCATAAACCTACAGGATTTTCATCAGGTCCTGATGAGCGCCGCTACACACATTGGAAACAAACAGTTTTTTATCTTGATAATGGCGATGACGACTGTCTAAACTG CCAGANANNGAGAca                                                                                       ]


>consensus_11315#0 NTCGGACGACCCTAGAGGATCTCCTCATAGGTTCGCAGGGATAACGGCGCGTAACCAATA GTAGGTCGTCGCGCGTGGTTGTCCTGTTAGTCCTTTGTCGGTCGTTTCGTCTCACTATGA ACGGGAAAAGTGGGGCCGGTGATAAAAATCAGTGTTCTCCTAGTACATCATGTGAGTCTA CCACTGAATCGTCAGATATGACCTCAAAGGATTACTATTTTGACTCATACGCGCATTTCG GAATTCATGAGGAAATGCTAAAGGATGAAATTAGAACACTCACCTACCGCAGTGCTTTAA TTCACAACAAACACCTTGTAAGAGATAAGGTAGTGCTTGATGTAGGTTGTGGAACCGCCA TCCTCTGTTTGTTTGCAATTAAAGCCGGGGCCAAGCATGCTATTGGAATTGACTGTTCTA ACATTATCGACCGGGCAATGGAAGTCGTCCGAGCTAACAATATGGCGGACCGTATCACTC TGATCAAAGGAAAAGTAGAAGAGGTGGAACTACCTCCAGAATACCCCAAGGTTGACATAG TCATCAGTGAATGGATGGGTTACTGTCTTTTTTACGAGTCAATGTTGAATACTGTTATTT ATGCTAGAGACAAATGGTTGGCACCTGGTGGCATAATTATGCCTGATCGTGCAACTCTGT ATGTTTGTGCTATCGAAGATAGACAGTACAAAGATGAAAAAATTAATTGGTGGGACAGCG TGTACGGCTTCGACATGAGTTGTATAAGGAAAGTTGCACTTACAGAACCTTTGGTTGATG TTGTTGATCCTAACCAGGTTGTGACTAATTGCTGTTTAGTCAAGGAAGTGGACATGTACA CTATCACAGTCCCCGAGTTAACATTCAGTGCACCATTTACACTTACCTGCAAAAGAAATG ATTATATTCAAGCCTTGGTTACGTTTTTCAATATAGACTTCACTTCTTGCCATAAACCTA CAGGATTTTCAACAGGTCCTGATGAGCGCCGCTACACACATTGGAAACAAACAGTTTTTT ATCTTGATAATGGCGATGACGACTGTCTAACTGTCAAGAAAGGAGAACAAATTAATGGTG TGATGTCTATTAAACCGAATGAACGAAATAACCGTGATCTTGATATCAACATCAAAGTAG AATTCGAGGGAGAAC



consensusID : consensus_11315#1
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Sequences nbr = 3
consensus length = 718
fasta sequence
                              [TTGTATAAGGAAAGTTGCACTTACAGAACCTTTGGTTGATGTTGTTGATCCTAACCAGGTTGTGACTAATTGCTGTTTAGTCAAGGAAGTGGACATGTACACTATCACAGTCCCCGAGTTAACATTCAGTGCACCATTTACACTTACCTGCAAAAGAAATGATTATATTCAAGCCTTGGTTACGTTTTTCAATATAGACTTCACTTCTTGCCATAAACCTACAGGATTTTCAACAGGTCCTGATGAGCGCCGCTACACACATTGGAAACAAACAGTTTTTTATCTTGATAATGGCGATGACGACTGTCTAACTGTCAAGAAAGGAGAACAAATTAATGGTGTGATGTCTATTAAACCGAATGAACGAAATAACGTGAGTTGATTTAATTTTAGCTTCTAATTGTTAAAGCCATTCTGCTGAATCCCGTAATATTGTACTTACATCAAACACTGCATCACACTTGCATATTTTTCAACACCATTAGGAAATAGTGAACAGATTTATTCAGCATTATCGATCATAGTATAATTTCTGAAGGTTCCTTAATCAGAGTAAGTTTCTGGATTTTCTTACTAATTAAGTTTTAAGCTCTAATTCAGTGTGCTTATGAAGTCTGATTTACTGCCGACAAGAAATGGTTTGAAGCANTACTGTACTGAAGATACTTTTCAACGTGTTATACTGAAATACTTTACTGCATGTCTCGGCAGTTCAAAA]

[+] EMBL CD115848             [TTGTATAAGGAAAGTTGCACTTACAGAACCTTTGGTTGATGTTGTTGATCCTAACCAGGTTGTGACTAATTGCTGTTTAGTCAAGGAAGTGGACATGTACACTATCACAGTCCCCGAGTTAACATTCAGTGCACCATTTACACTTACCTGCAAAAGAAATGATTATATTCAAGCCTTGGTTACGTTTTTCAATATAGACTTCACTTCTTGCCATAAACCTACAGGATTTTCAACAGGTCCTGATGAGCGCCGCTACACACATTGGAAACAAACAGTTTTTTATCTTGATAATGGCGATGACGACTGTCTAACTGTCAAGAAAGGAGAACAAATTAATGGTGTGATGTCTATTAAACCGAATGAACGAAATAACGTGAGTTGATTTAATTTTAGCTTCTAATTGTTAAAGCCATTCTGCTGAATCCCGTAATATTGTACTTACATCAAACACTGCATCACACTTGCATATTTTTCAACACCATTAGGAAATAGTGAACAGATTTATTCAGCATTATCGATCATAGTATAATTTCTGAAGGTTCCTTAATCAGAGTAAGTTTCTGGATTTTCTTACTAATTAAGTTTTAAGCTCTAATTCAGTGTGCTTATGAAGTCTGATTTACTGCCGACAAGAAATGGTTTGAAGCANTACTGTACTGAAG                                                        ]
[+] EMBL CD192897             [                                                                                                                         ACATTCAGTGCACCATTTACACTTACCTGCAAAAGAAATGATTATATTCAAGCCTTGGTTACGTTTTTCAATATAGACTTCACTTCTTGCTATAAACCTACAGGATTTTCAACAGGTCCTGATGAGCGCCGCTACACACATTGGAAACAAACAGTTTTTTATCTTGATAATGGCGATGACGACTGTCTAACTGTCAAGAAAGGAGAACAAA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  ]
[+] EMBL CD092442             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             CCTTAATCAGAGTAAGTTTCTGGATTTTCTTACTAATTAAGTTTTAAGCTCTAATTCAGTGTGCTTATGAAGTCTGATTTACTGCCGACAAGAAAGGGTTTGAAGCAATAATGTACTGAAGATACTTTTCAACGTGTTATACTGAAATACTTTACTGCATGTCTCGGCAGTTCAAAA]


>consensus_11315#1 TTGTATAAGGAAAGTTGCACTTACAGAACCTTTGGTTGATGTTGTTGATCCTAACCAGGT TGTGACTAATTGCTGTTTAGTCAAGGAAGTGGACATGTACACTATCACAGTCCCCGAGTT AACATTCAGTGCACCATTTACACTTACCTGCAAAAGAAATGATTATATTCAAGCCTTGGT TACGTTTTTCAATATAGACTTCACTTCTTGCCATAAACCTACAGGATTTTCAACAGGTCC TGATGAGCGCCGCTACACACATTGGAAACAAACAGTTTTTTATCTTGATAATGGCGATGA CGACTGTCTAACTGTCAAGAAAGGAGAACAAATTAATGGTGTGATGTCTATTAAACCGAA TGAACGAAATAACGTGAGTTGATTTAATTTTAGCTTCTAATTGTTAAAGCCATTCTGCTG AATCCCGTAATATTGTACTTACATCAAACACTGCATCACACTTGCATATTTTTCAACACC ATTAGGAAATAGTGAACAGATTTATTCAGCATTATCGATCATAGTATAATTTCTGAAGGT TCCTTAATCAGAGTAAGTTTCTGGATTTTCTTACTAATTAAGTTTTAAGCTCTAATTCAG TGTGCTTATGAAGTCTGATTTACTGCCGACAAGAAATGGTTTGAAGCANTACTGTACTGA AGATACTTTTCAACGTGTTATACTGAAATACTTTACTGCATGTCTCGGCAGTTCAAAA



consensusID : consensus_11315#2
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Sequences nbr = 1
consensus length = 462
fasta sequence
                              [TTAGTCCCTTGTCGGTCGTTTCGTCTCCCTATGACCGGAAAAGTGGGGCCGGTGATATAATCCAGTGTCTCCTAAGTACATCATGTGAGTCTACCACTGAATCGTCAGATATGACCTCAAAGGATTATTATTTTGACTCATACGCGCATTTCGGAATTCATGAGGAAATGCTAAAGGATGAAATTAGAACACTCACCTACCGCAGTGCTTTAATTCACAACAAACACCTTGTAAGAGATAAGGTAGTGCTTGATGTAGGTTGTGGAACCGCCATCCTCCTGTTTGTTTGCAATTAAAGCCGGGGCCAAGCATGCTATTGGAGTAATTGTGTTTCTGGTTCATATTAGTTTTAGATTGACTGTTCTAACATTATCGACCGGGCAATGGAAGTCGTCCGAGCTAACAATATGGCGGACCGTATCACTCTGATCAAAGGAAAAGTAGAAGAGGTGGAACTACCTC]

[-] EMBL CD125590             [TTAGTCCCTTGTCGGTCGTTTCGTCTCCCTATGACCGGAAAAGTGGGGCCGGTGATATAATCCAGTGTCTCCTAAGTACATCATGTGAGTCTACCACTGAATCGTCAGATATGACCTCAAAGGATTATTATTTTGACTCATACGCGCATTTCGGAATTCATGAGGAAATGCTAAAGGATGAAATTAGAACACTCACCTACCGCAGTGCTTTAATTCACAACAAACACCTTGTAAGAGATAAGGTAGTGCTTGATGTAGGTTGTGGAACCGCCATCCTCCTGTTTGTTTGCAATTAAAGCCGGGGCCAAGCATGCTATTGGAGTAATTGTGTTTCTGGTTCATATTAGTTTTAGATTGACTGTTCTAACATTATCGACCGGGCAATGGAAGTCGTCCGAGCTAACAATATGGCGGACCGTATCACTCTGATCAAAGGAAAAGTAGAAGAGGTGGAACTACCTC]


>consensus_11315#2 TTAGTCCCTTGTCGGTCGTTTCGTCTCCCTATGACCGGAAAAGTGGGGCCGGTGATATAA TCCAGTGTCTCCTAAGTACATCATGTGAGTCTACCACTGAATCGTCAGATATGACCTCAA AGGATTATTATTTTGACTCATACGCGCATTTCGGAATTCATGAGGAAATGCTAAAGGATG AAATTAGAACACTCACCTACCGCAGTGCTTTAATTCACAACAAACACCTTGTAAGAGATA AGGTAGTGCTTGATGTAGGTTGTGGAACCGCCATCCTCCTGTTTGTTTGCAATTAAAGCC GGGGCCAAGCATGCTATTGGAGTAATTGTGTTTCTGGTTCATATTAGTTTTAGATTGACT GTTCTAACATTATCGACCGGGCAATGGAAGTCGTCCGAGCTAACAATATGGCGGACCGTA TCACTCTGATCAAAGGAAAAGTAGAAGAGGTGGAACTACCTC



consensus multiple alignement with clustalw

CLUSTAL W (1.82) multiple sequence alignment


consensus_11315#0      NTCGGACGACCCTAGAGGATCTCCTCATAGGTTCGCAGGGATAACGGCGCGTAACCAATA 60
consensus_11315#2      ------------------------------------------------------------
consensus_11315#1      ------------------------------------------TTGTATAAGGAAAGTTGC 18
                                                                                   

consensus_11315#0      GTAGGTCGTCGCGCGTGGTTGTCCTGTTAGTCCTTTGTCGGTCGTTTCGTCTCACTATG- 119
consensus_11315#2      --------------------------TTAGTCCCTTGTCGGTCGTTTCGTCTCCCTATG- 33
consensus_11315#1      ACTTACAGAACCTTTGGTTGATGTTGTTGATCCTAACCAGGTTGTGACTAATTGCTGTTT 78
                                                 **  ***      *** **  *   *  ** *  

consensus_11315#0      AACGGGAAAAGTGG----GGCCGGTGATAAAAATC---AGTGTTCTCCTAGTACATCATG 172
consensus_11315#2      A-CCGGAAAAGTGG----GGCCGGTGATATAATCC---AGTGTCTCCTAAGTACATCATG 85
consensus_11315#1      AGTCAAGGAAGTGGACATGTACACTATCACAGTCCCCGAGTTAACATTCAGTGCACCATT 138
                       *       ******    *  *  *   * *   *   ***        *** ** *** 

consensus_11315#0      TGAGTCTACCACTGAATCGTCAGATATGACCTCAAAGGATTACTATTTTGACTCATACGC 232
consensus_11315#2      TGAGTCTACCACTGAATCGTCAGATATGACCTCAAAGGATTATTATTTTGACTCATACGC 145
consensus_11315#1      TACACTTACCTGCAAA-----AGAAATGATTATATTCAAGCCTTGGTTACGTTTTTCAAT 193
                       *     ****    **     *** ****    *    *    *  **    *  *    

consensus_11315#0      GCATTTCGGAATTCATGAGGAAATGCTAAAGGATGAAATTAGAACACTCACCTACCGCAG 292
consensus_11315#2      GCATTTCGGAATTCATGAGGAAATGCTAAAGGATGAAATTAGAACACTCACCTACCGCAG 205
consensus_11315#1      ATAGACTTCACTTCTTGCCATAAACCTACAGGATTTTCAACAGGTCCTGATGAGCGCCGC 253
                         *      * *** **    **  *** *****            ** *    *  *  

consensus_11315#0      TGCTTTAATTCACAACAAACACCTTGTAAGA--GATAA-GGTAGTGCTTGATGTA-GGTT 348
consensus_11315#2      TGCTTTAATTCACAACAAACACCTTGTAAGA--GATAA-GGTAGTGCTTGATGTA-GGTT 261
consensus_11315#1      TACACACATTGGAAACAAACAGTTTTTTATCTTGATAATGGCGATGACGACTGTCTAACT 313
                       * *    ***   ********  ** * *    ***** **   **     ***     *

consensus_11315#0      GT------GGAACCGCCATCCTC-TGTTTGTTTGCAATTAAAGCCG--GGGCCAAGCA-T 398
consensus_11315#2      GT------GGAACCGCCATCCTCCTGTTTGTTTGCAATTAAAGCCG--GGGCCAAGCA-T 312
consensus_11315#1      GTCAAGAAAGGAGAACAAATTAATGGTGTGATGTCTATTAAACCGAATGAACGAAATAAC 373
                       **       * *   * *       ** ** *  * ****** *    *  * **  *  

consensus_11315#0      GCTATTGGA----------------------------------ATTGACTGTTCTAACAT 424
consensus_11315#2      GCTATTGGAGTAATTGT--GTTTCTGGTTCATATTAGTTTTAGATTGACTGTTCTAACAT 370
consensus_11315#1      GTGAGTTGATTTAATTTTAGCTTCTAATTGTTAAAGCCATTCTGCTGAATCCCGTAATAT 433
                       *  * * **                                    *** *    *** **

consensus_11315#0      TATCG----ACCGGGCAATGGAAGTCGTCCGAGC------TAACA--------ATATGGC 466
consensus_11315#2      TATCG----ACCGGGCAATGGAAGTCGTCCGAGC------TAACA--------ATATGGC 412
consensus_11315#1      TGTACTTACATCAAACACTGCATCACACTTGCATATTTTTCAACACCATTAGGAAATAGT 493
                       * *      * *   ** ** *   *    *          ****        * ** * 

consensus_11315#0      GGACCGTATCACTCTGATCAAAGGA--AAAGTAGAAGAGGTGGAACTACCTCCAGAATAC 524
consensus_11315#2      GGACCGTATCACTCTGATCAAAGGA--AAAGTAGAAGAGGTGGAACTACCTC-------- 462
consensus_11315#1      GAACAGATTTATTCAGCATTATCGATCATAGTATAATTTCTGAAGGTTCCTTAATCAGAG 553
                       * ** *  * * ** *    *  **  * **** **    ** *  * ***         

consensus_11315#0      CCCAAGGTTGACATAGTCATCAGTGAATGGATGGGTTACTGTCTTTTTTACGAGTCAATG 584
consensus_11315#2      ------------------------------------------------------------
consensus_11315#1      TAAGTTTCTGGATTTTCTTACTAATTAAGTTTTAAGCTCTAATTCAGTGTGCTTATGAAG 613
                                                                                   

consensus_11315#0      TTGAATACTGTTATTTATGCTAGAGACAAATGGTTGGCACCTGGTGGCATAATTATGCCT 644
consensus_11315#2      ------------------------------------------------------------
consensus_11315#1      TCTGATTTACTGCCGACAAGAAATGGTTTGAAGCANTACTGTACTGAAGATACTTTTCAA 673
                                                                                   

consensus_11315#0      GATCGTGCAACTCTGTATGTTTGTGCTATCGAAGATAGACAGTACAAAGATGAAAAAATT 704
consensus_11315#2      ------------------------------------------------------------
consensus_11315#1      CGTGTTATACTGAAATACTTTACTGCATGTCTCGGCAGTTCAAAA--------------- 718
                                                                                   

consensus_11315#0      AATTGGTGGGACAGCGTGTACGGCTTCGACATGAGTTGTATAAGGAAAGTTGCACTTACA 764
consensus_11315#2      ------------------------------------------------------------
consensus_11315#1      ------------------------------------------------------------
                                                                                   

consensus_11315#0      GAACCTTTGGTTGATGTTGTTGATCCTAACCAGGTTGTGACTAATTGCTGTTTAGTCAAG 824
consensus_11315#2      ------------------------------------------------------------
consensus_11315#1      ------------------------------------------------------------
                                                                                   

consensus_11315#0      GAAGTGGACATGTACACTATCACAGTCCCCGAGTTAACATTCAGTGCACCATTTACACTT 884
consensus_11315#2      ------------------------------------------------------------
consensus_11315#1      ------------------------------------------------------------
                                                                                   

consensus_11315#0      ACCTGCAAAAGAAATGATTATATTCAAGCCTTGGTTACGTTTTTCAATATAGACTTCACT 944
consensus_11315#2      ------------------------------------------------------------
consensus_11315#1      ------------------------------------------------------------
                                                                                   

consensus_11315#0      TCTTGCCATAAACCTACAGGATTTTCAACAGGTCCTGATGAGCGCCGCTACACACATTGG 1004
consensus_11315#2      ------------------------------------------------------------
consensus_11315#1      ------------------------------------------------------------
                                                                                   

consensus_11315#0      AAACAAACAGTTTTTTATCTTGATAATGGCGATGACGACTGTCTAACTGTCAAGAAAGGA 1064
consensus_11315#2      ------------------------------------------------------------
consensus_11315#1      ------------------------------------------------------------
                                                                                   

consensus_11315#0      GAACAAATTAATGGTGTGATGTCTATTAAACCGAATGAACGAAATAACCGTGATCTTGAT 1124
consensus_11315#2      ------------------------------------------------------------
consensus_11315#1      ------------------------------------------------------------
                                                                                   

consensus_11315#0      ATCAACATCAAAGTAGAATTCGAGGGAGAAC 1155
consensus_11315#2      -------------------------------
consensus_11315#1      -------------------------------
                                                      




Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)