cluster # 1134

These datas are free for academic use only, please contact me for any other use.

Schistosoma mansoni
cluster # 1134 cluster # 1134 Sequences # 2 consensus # 1

see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :

consensus_1134#0 length = 697 sequences # 2

consensusID : consensus_1134#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 2
consensus length = 697
fasta sequence

                              [ATGAATTTATGATTGTTCAATAAACTCGTATATCATCACACACATAAATCTCAGAATGTGGTAAAATTTCAGAACAGCTTTTCGGTAACTACACTCTCCACTAGACTTGACCTAATCACCATGTTAACAATAGAAAAATGTTCAATAAAATAAAGTTCTATTGTCGTTTATCAAAATATAAAGACGAATAAAACGGCTCAAAAAAAATACGTTCATGATTCTCCTCATGAATCATTATTAATGTATGAATATGAAAAATAAATTAGCCACTAATTTAATTAAGATGAATAAAATACTCAACAGAAAAGATTAAGCGGAGGAGAGTTGATACTAAAAAAGTTTGTATAAAATAATG-CAT-CAAACC--AAATTAA-TTAAA-CCGAATAAACAGAG-CAGAATTATATCAAAAAGATTTTATCAATTGTGCAAAGTTTTCCAAACGAAAAAACTGAGTTTTTCAATGAAATTAGTGGCTACCAGAGCTAGTGTTGACGTTTTGAAAAATAAATTCTGTATTTCACTACCTGAATCAATTAATCGGCGCATTGAAGATGGATTGGTTGGATCACCAACAGCTCGAAAAACTGCGCGAAATTGAAAATCCTTATATTTATTGTTGTTTATTTCCATATGATATCTTTGGGTTGCTTTCGAATTGTTCTCACCGGCATCAATACAACAACCACTATTACTAGTACTA]

[+] EMBL CD076026             [ATGAATTTATGATTGTTCAATAAACTCGTATATCATCACACACATAAATCTCAGAATGTGGTAAAATTTCAGAACAGCTTTTCGGTAACTACACTCTCCACTAGACTTGACCTAATCACCATGTTAACAATAGAAAAATGTTCAATAAAATAAAGTTCTATTGTCGTTTATCAAAATATAAAGACGAATAAAACGGCTCAAAAAAAATACGTTCATGATTCTCCTCATGAATCATTATTAATGTATGAATATGAAAAATAAATTAGCCACTAATTTAATTAAGATGAATAAAATACTCAACAGAAAAGATTAAGCGGAGGAGAGTTGATACTAAAAAAGTTTGTATAAAATAATG CAT CAAACC  AAATTAA TTAAA CCGAATAAACAGAG CAGAATTATATCAAAAAGATTTTATCAATTGTGCAAAGTTTTCCAAACGAAAAAACTGAGTTTTTCAATGAAATTAGTGGCTACCAGAGCTAGTGTTGACGTTTTGAAAAATAAATTCTGTATTTCACTACCTGAATCAATTAATCGGCGCATTGAAGATGGATTGGTTGGATCACCAACAGCTCGAAAAACTGCGCGAAAT                                                                                                         ]
[-] EMBL AI740387             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                ATGCCATCCAAACCCAAAATTAATTTAAACCCGAATAAACAGAGCCAGAATTATTTCAAAAAGATTTTATCAATTGTGCAAAGTTTTCCAAACGAAAAAACTGAGTTTTTCAATGAAATTAGTGGCTACCAGAGCTAGTGTTGACGTTTTGAAAAATAAATTCTGTATTTCACTACCTGAATCAATTAATCGGCGCATTGAAGATGGATTGGTTGGATCACCAACAGCTCGAAAAACTGCGCGAAATTGAAAATCCTTATATTTATTGTTGTTTATTTCCATATGATATCTTTGGGTTGCTTTCGAATTGTTCTCACCGGCATCAATACAACAACCACTATTACTAGTACTA]




>consensus_1134#0
ATGAATTTATGATTGTTCAATAAACTCGTATATCATCACACACATAAATCTCAGAATGTG
GTAAAATTTCAGAACAGCTTTTCGGTAACTACACTCTCCACTAGACTTGACCTAATCACC
ATGTTAACAATAGAAAAATGTTCAATAAAATAAAGTTCTATTGTCGTTTATCAAAATATA
AAGACGAATAAAACGGCTCAAAAAAAATACGTTCATGATTCTCCTCATGAATCATTATTA
ATGTATGAATATGAAAAATAAATTAGCCACTAATTTAATTAAGATGAATAAAATACTCAA
CAGAAAAGATTAAGCGGAGGAGAGTTGATACTAAAAAAGTTTGTATAAAATAATGCATCA
AACCAAATTAATTAAACCGAATAAACAGAGCAGAATTATATCAAAAAGATTTTATCAATT
GTGCAAAGTTTTCCAAACGAAAAAACTGAGTTTTTCAATGAAATTAGTGGCTACCAGAGC
TAGTGTTGACGTTTTGAAAAATAAATTCTGTATTTCACTACCTGAATCAATTAATCGGCG
CATTGAAGATGGATTGGTTGGATCACCAACAGCTCGAAAAACTGCGCGAAATTGAAAATC
CTTATATTTATTGTTGTTTATTTCCATATGATATCTTTGGGTTGCTTTCGAATTGTTCTC
ACCGGCATCAATACAACAACCACTATTACTAGTACTA

clustalw multiple alignements is not computed in this case