cluster # 1136

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Schistosoma mansoni
cluster # 1136 cluster # 1136 Sequences # 2 consensus # 1

see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :

consensus_1136#0 length = 966 sequences # 2

consensusID : consensus_1136#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 2
consensus length = 966
fasta sequence

                              [AAATTATTTAATAGAAAGTCCAATGTCAAAATGTAACAATAAACAAAAATACACATGTATAAATATGTATATATAATTAGACTCGTATACTTTCTCAGACCCTTTTCAAAATGGAACAGAATCATCAGAACATTTTGATAGTCAAATCAAAAATAATATTCAAGCCACAGTCCACTGGTGCCATGGGATTGGTATGGCCTAATCACTTTGAGGGTTCAAAGAATTCCATTCAGGAGAGCGTTGGGATAATGACAACGTCCTTTTCGGGAGACCCAGGGAGGGAAGACGGACAATGGCTGGCTTTGTACGGTGTGCTTGTTCTTAGCACCGGTAGCCACTACTGTCTAGGGGCGCCTCCCCTGCCAGGGCTCTCGGTTACTTAAATTTAGGCTGTGTGAGTTTGTCTCAGACTTCTCAGACTCAAAGCTCTCGGGGGATTGCTCTGTGACTTTTTCCTTCTGCAGGCGGAGGGACAAACAGTGGTTTGGGATGCCATTGTGGTACTCTGATTTGCGCAAGAGTAGTGGCTGTTCAAGTGGGTATCCAACACACCAAGAGTTACCCATGGCCACACTTAGTGCAGAGAGGAAATTACCTTTGTACTGATTTACGTATCGCTGTTTTAAAATTGTGCCCTTTTCTTCTATGTCTATTACTATAGAAGTGAATGGATGTATGCTATAACGGATTATTGTACAGGAGGCTGCGCCTCACAAAGGTTTTGGGGTAGTAGTCACGTGGGATGGAAACAGGTCCATGTGCAGGCAGCATACCTCTCTCCATGTTCCCAGGTCCACCCGAGCTGATTTTTTAGGTGCTCAGAAAGGCAAAACTAGGTTGAGGTTGATTGTTTCCCTAGTAGCTTTCCCTTGAACTAAGGCAATCTTCCTAAATAACCGCCAATACCTGTGGGAGGAGCCTTTGACACCTGGCGTGGAGGCAGCTTGACTGTGTCTTGCCAGCGAG]

[+] EMBL CD076028             [AAATTATTTAATAGAAAGTCCAATGTCAAAATGTAACAATAAACAAAAATACACATGTATAAATATGTATATATAATTAGACTCGTATACTTTCTCAGACCCTTTTCAAAATGGAACAGAATCATCAGAACATTTTGATAGTCAAATCAAAAATAATATTCAAGCCACAGTCCACTGGTGCCATGGGATTGGTATGGCCTAATCACTTTGAGGGTTCAAAGAATTCCATTCAGGAGAGCGTTGGGATAATGACAACGTCCTTTTCGGGAGACCCAGGGAGGGAAGACGGACAATGGCTGGCTTTGTACGGTGTGCTTGTTCTTAGCACCGGTAGCCACTACTGTCTAGGGGCGCCTCCCCTGCCAGGGCTCTCGGTTACTTAAATTTAGGCTGTGTGAGTTTGTCTCAGACTTCTCAGACTCAAAGCTCTCGGGGGATTGCTCTGTGACTTTTTCCTTCTGCAGGCGGAGGGACAAACAGTGGTTTGGGATGCCATTGTGGTACTCTGATTTGCGCAAGAGTAGTGGCTGTTCAAGTGGGTATCCAACACACCAAGAGTTACCCAT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                ]
[-] EMBL CD082429             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  tTCTCAGACTTCTCAGACTCANAGCTCTCGGGGGATTGCTCTGTGACTTTTTCCTTCTGCAGGCGGAGGGACAAACAGTGGTTTGGGATGCCATTGTGGTACTCTGATTTGCGCAAGAGTAGTGGCTGTTCAAGTGGGTATCCAACACACCAAGAGTTACCCATGGCCACACTTAGTGCAGAGAGGAAATTACCTTTGTACTGATTTACGTATCGCTGTTTTAAAATTGTGCCCTTTTCTTCTATGTCTATTACTATAGAAGTGAATGGATGTATGCTATAACGGATTATTGTACAGGAGGCTGCGCCTCACAAAGGTTTTGGGGTAGTAGTCACGTGGGATGGAAACAGGTCCATGTGCAGGCAGCATACCTCTCTCCATGTTCCCAGGTCCACCCGAGCTGATTTTTTAGGTGCTCAGAAAGGCAAAACTAGGTTGAGGTTGATTGTTTCCCTAGTAGCTTTCCCTTGAACTAAGGCAATCTTCCTAAATAACCGCCAATACCTGTGGGAGGAGCCTTTGACACCTGGCGTGGAGGCAGCTTGACTGTGTCTTGCCAGCGAG]




>consensus_1136#0
AAATTATTTAATAGAAAGTCCAATGTCAAAATGTAACAATAAACAAAAATACACATGTAT
AAATATGTATATATAATTAGACTCGTATACTTTCTCAGACCCTTTTCAAAATGGAACAGA
ATCATCAGAACATTTTGATAGTCAAATCAAAAATAATATTCAAGCCACAGTCCACTGGTG
CCATGGGATTGGTATGGCCTAATCACTTTGAGGGTTCAAAGAATTCCATTCAGGAGAGCG
TTGGGATAATGACAACGTCCTTTTCGGGAGACCCAGGGAGGGAAGACGGACAATGGCTGG
CTTTGTACGGTGTGCTTGTTCTTAGCACCGGTAGCCACTACTGTCTAGGGGCGCCTCCCC
TGCCAGGGCTCTCGGTTACTTAAATTTAGGCTGTGTGAGTTTGTCTCAGACTTCTCAGAC
TCAAAGCTCTCGGGGGATTGCTCTGTGACTTTTTCCTTCTGCAGGCGGAGGGACAAACAG
TGGTTTGGGATGCCATTGTGGTACTCTGATTTGCGCAAGAGTAGTGGCTGTTCAAGTGGG
TATCCAACACACCAAGAGTTACCCATGGCCACACTTAGTGCAGAGAGGAAATTACCTTTG
TACTGATTTACGTATCGCTGTTTTAAAATTGTGCCCTTTTCTTCTATGTCTATTACTATA
GAAGTGAATGGATGTATGCTATAACGGATTATTGTACAGGAGGCTGCGCCTCACAAAGGT
TTTGGGGTAGTAGTCACGTGGGATGGAAACAGGTCCATGTGCAGGCAGCATACCTCTCTC
CATGTTCCCAGGTCCACCCGAGCTGATTTTTTAGGTGCTCAGAAAGGCAAAACTAGGTTG
AGGTTGATTGTTTCCCTAGTAGCTTTCCCTTGAACTAAGGCAATCTTCCTAAATAACCGC
CAATACCTGTGGGAGGAGCCTTTGACACCTGGCGTGGAGGCAGCTTGACTGTGTCTTGCC
AGCGAG

clustalw multiple alignements is not computed in this case